Teórico 5 Biología Celular y Molecular

DNA, cromosomas y genoma

Dra. M. Florencia Albertoni Borghese

DNA, cromosomas y genoma
• Estructura
• Genes y Genoma
• Cromosomas eucariontes - Empaquetamiento del
DNA
• Morfología y elementos funcionales de los
cromosomas eucariontes
Estructura

Estructura del
DNA

Antiparalelas
Estructura

Puente de
hidrógeno
Genes y Genoma
Organización de los genes
en un cromosoma humano

Genes
conocidos
Genes
predecibles

5
Empaquetamiento
del DNA Distintos estados de compactación de los cromosomas a lo largo de la
vida de la célula

G1 S G2 M

Cromosomas
interfásicos
Compactado 500 veces Cromosomas Máximo grado
metafásicos de compactación
Empaquetamiento
del DNA

Perlas de collar

Las moléculas de DNA

están altamente
condensadas en los
cromosomas
Empaquetamiento
del DNA NUCLEOSOMA

Unidad básica de la estructura de

la cromatina
Empaquetamiento
del DNA Organización estructural de las histonas del
núcleo de los nucleosomas
Empaquetamiento
del DNA

Ensamblaje de un
octámero de histonas

Chaperonas de las
histonas

Fig 4-26
Empaquetamiento
del DNA
Nucleosomas Fibra de 30 nm
Empaquetamiento
del DNA
Nucleosomas Fibra de 30 nm

Modelo de empaquetamiento en
zig-zag de la fibra de cromatina de
Tetranucleosoma 30 nm
Empaquetamiento
del DNA
Nucleosomas Fibra de 30 nm
Modelo de solenoide con
nucleosomas interalados de la fibra
de cromatina de 30 nm
Empaquetamiento
del DNA ¿Qué es lo que provoca que los
Participación de
nucleosomas se empaqueten
las colas de las
formando fibras de 30 nm?
histonas

H1 → Histona de
enlace
Empaquetamiento
del DNA

Bucles de fibra de 30 nm

Dominio en bucle
(Entre 50.000 y 200.000
pares de nucleótidos)
Empaquetamiento
del DNA
Plegamientos de orden superior de la cromatina
para formar los cromosomas mitóticos

protección
Facilitar la
segregación de
los
cromosomas
Empaquetamiento
 Se detiene la expresión génica
del DNA Condensación
de la FASE M
cromatina  Se realizan modificaciones
específicas de histonas que
ayudan a la reorganización de la
cromatina
Participación de
condensinas
SMC: proteínas de mantenimiento
estructural de los cromosomas

Modelo de compactación
de la cromatina por las
proteínas SMC
DNA, cromosomas y genoma

• Regulación de la estructura de la cromatina

• Evolución de los genomas
Regulación de la estructura de la cromatina

NUCLEOSOMAS

Estructura dinámica

Secuencia accesible a otras

proteínas de unión al DNA
Regulación de la estructura de la cromatina

COMPLEJOS REMODELADORES DE CROMATINA

10 o más
subunidades
Regulación de la estructura de la cromatina

COMPLEJOS REMODELADORES DE CROMATINA

Eliminación del nucleosoma y
cambio de histonas

H2AZ-H2B

El posicionamiento exacto de los nucleosomas a lo largo del DNA

depende de la presencia y la naturaleza de otras proteínas unidas al DNA
Regulación de la estructura de la cromatina

Modificaciones covalentes de las histonas

Reversibles

Catalizadas y Atraen específicamente

eliminadas por determinadas proteínas
hacia la región modificada
enzimas
específicas

Regulan la expresión de Se transmiten a la

genes descendencia
Regulación de la estructura de la cromatina
Herencia genética Herencia epigenética

Modificación
covalente de
histonas
Regulación de la estructura de la cromatina
Herencia genética Herencia epigenética

Modificación
covalente de
histonas

24
Regulación de la estructura de la cromatina
HETEROCROMATINA

Cromatina altamente condensada Altamente resistente

Distintas funciones
(diferentes tipos) a la expresión génica

Genes
inactivos

10 % del genoma (célula mamífero)

Regulación de la estructura de la cromatina
HETEROCROMATINA

Efecto de Si un gen que se expresa (eucromatina) se desplaza a una

posición región de heterocromatina, deja de expresarse.

Ac Ac Me3 Me3 Me3 Me3

El silenciamiento de los genes dentro de la

heterocromatina es mediado por la unión de HP1 a los
sitios de la heterocromatina
Regulación de la estructura de la cromatina
Efecto de variegación de posición en Drosophila

DNA barrera

Efectos de
posición
Regulación de la estructura de la cromatina Modificaciones que pueden sufrir las histonas

Metilación

Acetilación

HDAC: Histone DeAcetilases

HAT: Histone Acetil Transferase

Fosforilación de serinas
Regulación de la estructura de la cromatina Modificaciones que pueden sufrir las histonas

30 primeros aa de las colas K: Lisina; R: Arginina; S: Serina

de histonas
Regulación de la estructura de la cromatina
Modificaciones que pueden sufrir las histonas

El significado de la mayoría
de estas modificaciones aún
se desconoce
Regulación de la estructura de la cromatina

HP1: Proteína
específica de la
heterocromatina

Histona H3K9 MT

Metilación en la
lisina 9 de la H3
Unión a cromodominio
de HP1
Cromodominio

Oligomerización de HP1

Heterocromatina
Regulación de la estructura de la cromatina
Variantes de histonas
Regulación de la estructura de la cromatina

Código de histonas

Modificaciones covalentes de las

histonas Variantes de las histonas
Regulación de la estructura de la cromatina
Código de histonas

Complejo lector

Reconoce
combinaciones
específicas de marcas
en histonas

Cromodominio Bromodominio

Heterocromatina Eucromatina
Regulación de la estructura de la cromatina

Significados
específicos
conocidos del
código de histona
H3
Regulación de la estructura de la cromatina

Compleo lector-escritor

Difusión de cambios en la
cromatina a lo largo del
cromosoma

Ac Ac Me3 Me3 Me3 Me3

El silenciamiento de los genes dentro de la

heterocromatina es mediado por la unión de HP1 a los
sitios de la heterocromatina
Regulación de la estructura de la cromatina

Complejo
lector - remodelador
Complejo lector - escritor
Complejo RSC de la
levadura de 15
subunidades

Complejo remodelador
de la cromatina
dependiente de ATP

Proteina remodeladora
de la cromatina
deendiente de ATP

Onda expansiva de
condensación de
cromatina
Regulación de la estructura de la cromatina
Algunos mecanismos de
acción de barrera

Bloquean la expansión
de diferentes formas
Proteína barrera
de cromatina

Proteína barrera

Proteína barrera

Figura 4-47 Biología molecular de la célula, quinta edición (© Garland Science 2008 y Ediciones Omega 2010)
Regulación de la estructura de la cromatina
Cromatina centromérica

CENP-A

Secuencia de 125 pb

39
Regulación de la estructura de la cromatina

Formación de un centrómero humano

DNA satélite alfa
(secuencias ricas en A-T)

Los centrómeros de los organismos

complejos no estarían definidos por
una secuencia específica de DNA sino
por un ensamblaje de proteínas

Centrómero de ~ cientos de miles de p.n.

40
Regulación de la estructura de la cromatina

HP1

Organización de la heterocromatina céntrica y

pericéntrica en un cromosoma metafásico humano

Dos tipos de cromatina forman la

heterocromatina centromérica
Regulación de la estructura de la cromatina
Herencia directa de la cromatina centromérica

Se heredan directamente
Regulación de la estructura de la cromatina

Herencia del
empaquetamiento del DNA
en heterocromatina

Acción de complejos
lector - escritor - remodelador
Regulación de la estructura de la cromatina

Existen muchas formas de heterocromatina

Dominios de heterocromatina
(Heterocromatina pericentromérica)

(Polycomb)

Formados por el ensamblaje

cooperativo de proteínas no-histona

Cada uno de estos tipos de

heterocromatina se regula diferente y
cumple un papel distinto en las células
Regulación de la estructura de la cromatina
Patrón de modificación de histonas en
cromosomas politénicos de Drosophila

(A) Dimetilación en K9 (B) Acetilación en K9

Asociada al cromocentro Asociada a los genes

(heterocromatina pericéntrica) activos
Regulación de la estructura de la cromatina
Desplazamiento de cromatina Modificación de la expresión
dentro del núcleo génica
Regulación de la estructura de la cromatina

Las regiones ricas en genes no

presentan DNA cerca de la
envoltura nuclear

Regiones ricas en repeticiones de la secuencia Alu

Regiones sin repeticiones de la secuencia Alu

Regulación de la estructura de la cromatina

La posición de un gen en
el interior del núcleo
cambia cuando éste se
transcribe intensamente
Regulación de la estructura de la cromatina

Inactivación del cromosoma X en mamíferos

Modificaciones

XIST RNA

Ubiquitinización de H2A
Hipoacetilación de H3 y H4

Variante de Histona H2A

Metilación de H3

Figura 7-89 Biología molecular de la célula, quinta edición (© Garland

Science 2008 y Ediciones Omega 2010)
DNA, cromosomas y genoma

• Regulación de la estructura de la cromatina

• Evolución de los genomas
Evolución de los genomas
Evolución de los genomas

Cada uno de los genomas y de los cromosomas de las especies actuales

es resultado de acontecimientos genéticos únicos, ocurridos al azar y
sometido a distintas presiones ejercidas por la selección a lo largo de la
evolución.
 Evolución de los genomas
Evolución del cromosoma 3 humano

Regiones conservadas evolutivamente

Sintenia conservada

Figura 4-18 Biología molecular de la célula, quinta edición (© Garland Science 2008 y Ediciones Omega 2010)
Evolución de los genomas

La evolución depende de la generación de nuevos genes,

Y de la modificación de los ya existentes.

Duplicacion de Tubulina
genes enteros
Globinas
Duplicacion genica
Duplicacion de
Genes homólogos exones Inmunoglobulinas

Divergencia
Evolución de los genomas
Duplicación de genes
y divergencia Ortólogos
Célula
Tubulina α-Tubulina
ancestral
α-Tubulina
Duplicación génica y α-Tubulina
divergencia α-Tubulina
β-Tubulina Ortólogos

Parólogos
α-Tubulina
β-Tubulina
β-Tubulina
β-Tubulina
β-Tubulina
Especie 2
Especie 1
Evolución de los genomas
Duplicación de genes y divergencia

Figura 4-87 Biología molecular de la célula, quinta

edición (© Garland Science 2008 y Ediciones Omega
2010)
Evolución de los genomas
Duplicación de exones

cada exón
codifica un
dominio