Ekosistem yang mana faktor lingkungan eksternalnya didominasi oleh air
sebagai habitat dari berbagai macam organisme air.
Contoh ekosistem air :
Sungai atau ekosistem air tawar ini merupakan ekosistem yang
berada di lingkungan sungai. Disebut sebagai ekosistem air tawar karena air yang berada di sekitar ekosistem ini mempnyai rasa yang tawar dan tidak asin seperti air laut,contoh organisme di ekosistem sungai : ikan,ganggang,plankton,teratai,kangkung,serangga udang,siput dan cacing
Aquarium merupakan suatu ekosistem aquatik buatan yang terbuat
dan bejana atau bak kaca, sehingga kehidupan di dalam air tersebut dapat terlihat jelas dan luar.contoh organisme di ekosistem aquarium : ikan,fitoplankton,zooplankton,mikroba.
Laut disebut juga ekosistem bahari merupakan ekosistem yang
terdapat di perairan laut, terdiri atas ekosistem perairan dalam, ekosistempantai pasir dangkal/bitarol, dan ekosistem pasang surut.