Orientador: Régis correa O controle genético sobre o metabolismo • Os organismos dependem das reações químicas para crescer e se reproduzir. • Conjunto de reações químicas do organismo e denominado metabolismo. • As reações químicas do nosso corpo são catalisadas por enzimas, que são proteínas. • Além disso a “construção” de um organismo depende das proteínas. • As proteínas são produzidas a partir de informação contida no código genético. Transcrição • Realizada por um complexo enzimático cuja enzima chave é a RNA polimerase. • A síntese de RNA ocorre no sentido 5’=>3’. • O RNA sintetizado será complementar à fita de DNA molde. Diferenças entre eucariontes e procariontes • A transcrição em eucariontes é bem mais complexa que em procariontes. • Nos eucariontes a transcrição ocorre no núcleo, enquanto a tradução ocorre no citoplasma. • Nos procariontes tal separação celular não existe, sendo os dois processos muito bem acoplados no espaço. Diferenças entre DNA E RNA Os diferentes tipos de moléculas de RNA Expressão gênica • O fenótipo de um organismo é uma combinação dos efeitos de todos os seus genes. • Os genes são regiões do DNA que contém informação para produzir as proteinas. • A informação do DNA não é passada diretamente para proteinas. • RNA intermediário (mRNA). Descoberta do mRNA • Experimento de Spiegelman • Experimento de pulso-caça (Elliot Volkin e Lawrence Astrachan) Transcrição em procariontes • RNA polimerase de procariotos é uma holoenzima, ou seja, uma enzima composta por várias subunidades proteicas. • Cerne tetramérico (α2ββ’) • Subunidade σ Estrutura geral de um gene
• Promotor: seqüências específicas do DNA reconhecidas pela
RNA polimerase com o sítio de início da transcrição. Direcionam a transcrição de segmentos adjacentes do DNA (gene) • Região Transcrita da fita molde da qual mRNA é sintetizada • Finalizador: seqüências que sinalizam o produto da RNA polimerase a partir do gene. Promotor • Sítio onde a RNA polimerase se liga e inicia a transcrição. • Genes são regulados similarmente contendo seqüências comuns de DNA (seqüência de consenso) dentro de seus promotores. Iniciação transcricional Bolha de transcrição • RNA polimerase se liga ao promotor. • RNA polimerase separa as fitas de DNA formando a bolha de transcrição. • O RNA começa a ser sintetizado a partir da fita molde de DNA. • Conforme a RNA polimerase anda e transcreve o DNA ela fecha as fitas atrás (5’P)e abre as fitas à frente (3’OH). Alongamento Término de transcrição
• Processo pelo qual o complexo RNA polimerase se
disassocia da extremidade 3’ do gene.
• Seqüências específicas sinalizam a terminação da
síntese de RNA.
• E. coli - duas classes de sinais de terminação:
dependente de ρ (rho) e outro é independente de ρ. Independente de Rho • duas características distintas: região cujo transcrito de RNA possui seqüências autocomplementares, permitindo formação de estruturas grampos. • Outra seria um colar curto de adenilato na fita molde, que é transcrito em uridilatos na extremidade 3´ do RNA. Pausa e disassociação • O grampo possui a função de travar o andamento da transcrição. • 3’ terminal tende a ser rica em AU p/ romper facilmente durante a pausa. Leva a disassociação do complexo RNA polimerase. Dependente de Rho • Rho é uma helicase dependente de ATP. • Se move ao longo do RNA transcrito. • Quando a RNA Polimerase diminui ou pára na sequencia de terminação (grampo), Rho se une a RNA Pol e separa o RNA nascente da bolha de transcrição. Transcrição em eucariotos • Diferente de procariotos que possuem apenas uma RNA polimerase, eucariotos possuem 3 RNA polimerases. • Cada RNA polimerase é responsável por transcrever um determinado grupo de genes. • As RNA polimerases de eucariotos são bem mais complexas que de procariotos. RNA Polimerases eucarióticas Promotor • O promotor de eucariotos contém uma região consenso chamada de TATA Box (TATAAAA). • As RNA polimerases eucarióticas se ligam a esta região do promotor para iniciar a transcrição. • O TATA Box está situado a -30 do gene. Fatores de transcrição • Polimerase I, II, e III não se ligam especificamente aos promotores. • Eles podem interagir com seus promotores via fatores de transcrição . • Fatores de Transcrição reconhecem e iniciam transcrição em seqüências de promotores específicas. Alongamento e término • O alongamento da cadeia de RNA ocorre em um processo similar a procariotos. • O término de transcrição ainda não está bem definido, mas há participação de uma endonuclease. • O RNA é clivado, mas a transcrição continua mesmo depois da clivagem do RNA por mais 1000 a 2000 nucleotídeos até que a síntese pára em uma seqüência de término. Processamento do RNA • Em eucariotos a transcrição e tradução ocorre em compartimentos separados. • Isso permite que o RNA possa ser “maturado” antes que seja traduzido. • O RNA sofre 3 tipos de modificações no núcleo antes de ser endereçado para o citoplasma onde será traduzido. • O RNA antes de ser modificado é chamado de “transcrito primário” ou “hnRNA”. Capeamento do RNA mensageiro • A primeira modificação que ocorre no hnRNA é a adição de um CAP na porção 5’P do RNA mensageiro. • O CAP é um 7-metilguanosina, que é unida ao resíduo terminal 5´do RNA por meio de uma ligação 5´,5´-trifosfato. • A função do CAP é proteger o RNA de degradação por exonucleases, aumentando o tempo de vida do RNA. Poliadenilação • A segunda modificação é a adição de uma cauda Poli(A) na extremidade 3’ do hnRNA. • A cauda Poli(A) é a adição de cerca de 200 nucleotídeos de adenina no final do RNA mensageiro (extremidade 3’). • A função da cauda Poli(A) também é aumentar o tempo de vida do mRNA, porque as exonucleases terão que degradar 200 nucleotídeos antes de começar a degradar o mRNA. éxons e Íntrons • Os genes de eucariotos possuem regiões codificantes e não codificantes. • Essas regiões não codificantes estarão contidas no RNA quando ele for transcrito e precisam ser removidas. • As regiões codificantes do RNA mensageiro são chamadas de éxons, as não codificantes são chamadas de íntrons. Recomposição do RNA (Splicing)
• Mecanismo pelo qual os introns são retirados
do RNA mensageiro.
• São 3 diferentes mecanismos: Recomposição
do precursor de tRNA, recomposição autocatalítica e recomposição do Pre-mRNA. Mecanismos de remoção de íntrons • Recomposição do precursor de tRNA: os introns dos precursores de tRNA são removidos precisamente por uma endonuclease que cliva os introns, uma ligase depois religa os éxons de tRNA. • recomposição autocatalítica: Em alguns rRNA os introns se autoremovem, sem a ação catalítica de nenhuma enzima. • recomposição do Pre-mRNA: Os introns do hnRNA são removidos por particulas complexas envolvendo proteinas e snRNA que são chamadas de spliceossomos. • O processamento de RNA aumenta consideravelmente o tempo de vida do mRNA (10 horas em células de mamíferos e 2-5 minutos em procariotos).