2 MUTACIONES ESPONTÁNEAS.
2.4 INVERSIONES
2.5 TRANSLOCACIONES
4 TASA DE MUTACIÓN
6.1.1 RADIACIÓN UV
1 INTRODUCCIÓN A LAS
VARIACIONES HEREDITARIAS NO
ASOCIADAS A TRANSFERENCIA DE
MATERIAL GENÉTICO
Definiciones básicas:
Alelo es cada una de las distintas versiones en que puede presentarse un gen.
Una pareja de conceptos que también conviene incluir aquí es la diferenciación entre
mutaciones espontáneas y mutaciones inducidas:
2 MUTACIONES ESPONTÁNEAS.
Los principales tipos son:
5) Traslocaciones
6) Duplicaciones en tándem
A:T G:C
A:T T:A
G:C C:G
Por lo tanto, los emparejamientos propiciados por las formas tautoméricas serían:
A* : C
C* : A
T* : G
G* : T
constante de equilibrio (k) de tautomerización del par de bases (unos 10-4 - 10-
5);
frecuencia de dNTPs en forma sin. (G sin aparece con frec. de 10-1, A , con 5·10-
2).
Ejemplo: Durante la replicación puede ocurrir que la citosina pase a su forma imino, que se
empareja con la adenina:
Parece ser que en la naturaleza existe una selección natural que propicia
una frecuencia baja, pero no nula, de errores durante la replicación. El significado
biológico es que de esta forma se combina una alta tasa de fidelidad en la replicación, pero
con suficiente flexibilidad (oportunidad de errores) como para generar innovaciones sobre
las que pueda actuar la presión selectiva, lo cual permite evolución.
Puntos calientes de mutación (“hot-spots”): son puntos o zonas dentro del genomio donde
se concentran mutaciones con una frecuencia mayor que la esperada si se distribuyeran al
azar.
Ejemplo: en el gen lacI hay una zona especialmente “caliente” cerca de la base 200,
donde la probabilidad de encontrar mutaciones es muy superior a la del resto de la
secuencia de ADN de ese gen.
CCAGG
GGTCC
es metilada por una metilasa específica (que reconoce precisamente a esas dos citosinas
dentro de esa secuencia), para dar 5-metilcitosina. La 5-metil citosina experimenta
espontáneamente una desaminación oxidativa, que la convierte en timina, de manera que se
produce finalmente una transición: C:G 5-metil-C:G T:G (emparejamiento
anómalo) T:A
1) Si la nueva tripleta (codón) codifica el mismo aa. que la antigua (debido a la sinonimia
o “degeneración” del código genético, que afecta sobre todo a la tercera base del codón)
se origina una mutación neutra, que es “silenciosa” (no hay ningún cambio en el
fenotipo).
ii) En otros casos el nuevo aa. provoca una inestabilidad estructural, que puede
reflejarse en que la proteína sea termosensible o criosensible, o más susceptible
a efectores alostéricos. La proteína termosensible es funcional a temperaturas
moderadas, pero se inactiva a temperaturas relativamente altas, a las cuales la
correspondiente proteína silvestre es activa. La proteína criosensible es
funcional a temperaturas moderadas, pero se inactiva a temperaturas
relativamente bajas, a las cuales la proteína silvestre es activa. La proteína más
susceptible a efectores alostéricos es aquella que se inhibe por efectores de
forma más acusada. En esta categoría entran también las proteínas con actividad
residual.
iii) Por otro lado, podemos encontrar proteínas que pierden su actividad
biológica debido a que la sustitución del aa. provoca la alteración de la
estructura secundaria y terciaria de la proteína: por ejemplo, la aparición por
mutación de una prolina en mitad de una -hélice destruye esta estructura, y
puede originar inactivación de la función.
iv) La alteración del centro activo suele provocar inactivación total o parcial.
NOTA: Aquí se plantea la siguiente pregunta: si la mutación inactiva totalmente
la capacidad funcional de la proteína, ¿cómo podemos reconocer que esa
proteína alterada está presente en la célula? La proteína se puede identificar por
medio de anticuerpos (Ac) obtenidos frente a la proteína silvestre. Si ponemos
en contacto estos Ac con un extracto de las células mutantes, se producirá una
reacción antígeno-anticuerpo. Las proteínas inactivas caracterizadas de esta
manera se suelen denominar como “CRM” iniciales de “cross-reactive material”
(material que da reacción cruzada respecto de la proteína silvestre).
Base molecular: Suelen ocurrir en zonas del ADN con secuencias repetitivas. En este tipo
de secuencias, durante la replicación o la recombinación, se pueden producir malos
alineamientos por desplazamiento de una o varias copias de la secuencia repetitiva.
Ejemplo:
GTCCGTCCGTCCGTCC
CAGGCAGGCAGGCACC
Se produce un cambio total en el sentido del mensaje genético, a partir del sitio de la
mutación se sintetiza una proteína inactiva, a menudo truncada (debido a que al cambiar la
pauta de lectura, pueden aparecer tripletas sin sentido).
2.4 INVERSIONES
Cambio de orientación de un segmento de ADN. En muchos casos se deben a
emparejamiento y ulterir recombinación entre secuencias inversamente repetidas en los
extremos del material que sufre la inversión.
2.5 TRANSLOCACIONES
Traslado de un segmento a otro lugar del genomio.
Una vez que ha ocurrido una inserción de una IS o de un Tn, pueden producirse
ulteriores delecciones secundarias de todo o de parte del elemento transponible, y a veces
también delecciones del material genético adyacente (fenómenos de escisión imprecisa del
IS o Tn).
Por otro lado, dadas dos secuencias IS del mismo tipo, situadas a cierta distancia
una de la otra, por fenómenos de recombinación propiciados por dichas IS se pueden
producir:
Otro tipo de mutantes condicionales muy empleados en bacterias son aquellos con
mutaciones sin sentido. Como se recordará, cuando el ribosoma llega al codón sin sentido,
se detiene la traducción ulterior. Sin embargo, si esa bacteria tiene simultáneamente una
segunda mutación de tipo supresor extragénico, a saber, un ARNt mutante adecuado, se
puede restablecer el fenotipo silvestre (al menos parcialmente).
3 CARACTERIZACIÓN DE LAS
MUTACIONES
Para caracterizar genéticamente una mutación (es decir, para conocer qué tipo de
mutación es) se recurre normalmente a pruebas de reversión de cada mutante.
Las mutaciones puntuales pueden revertir o ser suprimidas por una 2ª mutación
(ver más adelante, en este mismo capítulo).
Igual ocurre con algunas mutaciones de desfase de la pauta de lectura.[2]
Las inserciones sólo pueden revertir por una delección exacta del material
insertado.
Las delecciones no pueden revertir.
Por otro lado, las mutaciones generadas por elementos genéticos transponibles
no aumentan su frecuencia por tratamiento con agentes mutagénicos, mientras
que el resto sí lo hacen.
4 TASA DE MUTACIÓN
En una población bacteriana se define la tasa de mutación (T) para un determinado
fenotipo como la probabilidad de que una célula mute a ese fenotipo en un determinado
intervalo de tiempo. Luria y Delbrück (1943) escogieron como intervalo de tiempo unitario
el correspondiente a un ciclo celular (o sea, a una generación), que es el tiempo necesario
para completar una ronda de división celular. Por lo tanto:
NOTA 1: La tasa T de mutación espontánea es constante para cada división celular a distintas tasas de
crecimiento
En la expresión anterior hay que introducir un factor de corrección, ya que en el momento de determinar el
número de células (N), las bacterias se encuentran en distintas etapas del siguiente ciclo celular, de modo que
el promedio real de divisiones es mayor que N en un factor equivalente a 1/ln 2. Resulta, entonces:
A pesar de lo sencillo de esta fórmula, el cálculo en la práctica de la tasa de mutación no es tan fácil como
ésta parece dar a entender. Ello se debe a que el parámetro m mide el número de eventos de mutación en un
lapso de tiempo, que no equivale al número de bacterias mutantes medidas. Por lo tanto, y a pesar de lo fácil
que suele ser cuantificar el número de mutantes, en el experimento, en ese cantidad medida se incluyen los
descendientes de eventos más o menos antiguos de mutación a lo largo de ese experimento. Para calcular m
hay que recurrir a ciertos métodos estadísticos.
Por ejemplo, se puede combinar un experimento de tipo de Luria y Delbrück con la distribución de Poisson.
Imaginemos que sembramos 20 tubos independientes con la misma cantidad inicial de bacterias sensibles a la
estreptomicina e incubamos el mismo tiempo en las mismas condiciones, de modo que la N-N0 sea 5.6X108;
imaginemos que en esa prueba de las fluctuaciones en 11 de los 20 tubos no han surgido mutantes resistentes
al antibiótico. De acuerdo con la aproximación de Poisson a la distribución normal, la probabilidad de tener
cero (0) mutaciones en un cultivo sería:
P0 = m0·e-m/0!
P0 = 11/20 = 1·e-m/1
Y por lo tanto, podemos despejar y resolver el valor de m = -ln11/20 = 0.59. Ahora podemos calcular la tasa
de mutación:
T = 0.6·0.59/5.6X108 = 7.3·10-9
NOTA 2: Obsérvese que hemos definido la tasa de mutación respecto de un fenotipo. Esto significa que
aquellos fenotipos que dependan de varios genes tendrán tasas de mutación superiores a las de aquellos que
dependan de un solo gen. Por ejemplo, la tasa de mutación hacia auxotrofía para la histidina o el triptófano
(cuya biosíntesis depende de varios genes) está en torno a 10-7, mientras que la tasa de mutación a resistencia
a estreptomicina (que, como se recordará, depende de la alteración del gen de la proteína ribosómica S12) es
de sólo 10-10 o 10-11.
5 REVERSIBILIDAD DE LAS
MUTACIONES BACTERIANAS
Las variaciones fenotípicas producidas por las mutaciones no-silenciosas son
transmisibles a la descendencia. Es decir, una vez producido el cambio, éste
es permanente, pero no necesariamente irreversible (como ya dijimos, solamente las
grandes delecciones son irreversibles).
1) Reversión (en sentido estricto), que restaura el genotipo original. Esto equivale a
una retromutación (“back-mutation”).
b) El codón sin sentido UAA (“ocre”) puede ser suprimido por una versión mutante de
ARNtGly GAA
b) Mutaciones StrR: tienen afectada la proteína S12 del ribosoma. Hacen que las
mutaciones sin sentido sean menos defectuosas (“leaky” = débiles).
Los supresores han de ser, por fuerza, poco eficientes, como para no hacer que la
célula muera por introducción de demasiados errores en la lectura de los ARNm normales
(es decir, la mayor parte de las veces, los supresores introducen el aminoácido correcto).
Pero por otro lado, han de ser suficientemente eficicientes como para poder introducir
aminoácidos en codones mutantes con la frecuencia adecuada para suprimir la mutación
primaria. Normalmente, los supresores típicos suprimen 5-10% de las veces. Es decir, la
mayoría de las veces se introduce el aa. correcto frente al codón correcto.
6 AGENTES MUTAGÉNICOS E
INDUCCIÓN DE MUTACIONES
Anteriormente comentamos que el medio ambiente no induce mutaciones concretas
(p. ej., el antibiótico no provoca la aparición de los mutantes resistentes). Ahora bien, lo
que sí pueden hacer determinadas condiciones ambientales es elevar la tasa global de
aparición de mutaciones.
50% T-T
40% T-C
10% C-C
Tienen mayor poder de penetración que los rayos UV, pero son de difícil manejo,
por lo que se emplean poco en bacterias. Los rayos X ocasionan daños reparables por el
sistema SOS.
Las radiaciones ionizantes (p. ej., rayos ) provocan labilizaciones en el ADN, que
terminan en roturas en las hebras del ADN (por ataque al enlace fosfodiéster), que
finalmente pueden conducir a delecciones.
3) Agentes alquilantes.
4) Agentes intercalantes, que se introducen en la doble hélice del ADN, entre pares de
bases consecutivas.
Son sustancias con una estructura en anillo similar a las bases naturales de los
ácidos nucleicos, pero con propiedades químicas diferentes. Como ejemplos tenemos:
5-bromouracilo (5-BrU)
2-aminopurina (2AP).
Estas moléculas entran a las células y son convertidas a los correspondientes
“dNTP”, de modo que su estructura les permite ser incorporados durante la replicación del
ADN.
BUceto:ABUenol:G
Todos estos agentes, excepto la NTG, actúan tanto in vivo como in vitro. La NTG
sólo actúa in vivo, ya que su efecto lo ejerce sobre la horquilla de replicación del ADN. La
NTG es uno de los mutágenos más potentes que se conocen, pero es un agente “sucio”, en
el sentido de que genera varias mutaciones en la misma célula. Induce reparación SOS
propensa a error, dando origen a transiciones, transversiones y desfases del marco original
del lectura.
Sin embargo, muchas bacterias poseen un sistema específico para reparar las
lesiones de la O6-alquil-guanina, que funciona de la siguiente manera:
Se introducen entre los pares de bases del ADN, dando origen a pérdida o
ganancia de nucleótidos (o sea, generan mutaciones de cambio de la pauta de lectura del
mensaje genético). Estas sustancias son moléculas planares con 3 o 4 anillos conjugados,
que presentan un cierto parecido con los pares de bases del ADN, pero no se pueden
incorporar covalentemente al esqueleto de éste, sino que se intercalan entre dos pares de
bases consecutivas, con lo que provocan distorsiones de la doble hélice.
Algunos ejemplos:
benzo-a-pireno
aflatoxina-B1
Ames y sus colaboradores desarrollaron, a finales de los años 70, una prueba rápida,
sencilla y económica por la que se pueden ensayar compuestos como posibles
carcinógenos. Su base consiste precisamente en ver si son mutágenos frente a bacterias (es
decir, se comprueba si tras el tratamiento de un cultivo bacteriano con la sustancia en
cuestión, aumenta la tasa de aparición de mutantes.
TEST DE AMES
Usa una serie de cepas his- de Salmonella typhimurium, muy bien caracterizadas a
nivel genético-molecular.
1) Una suspensión de la bacteria se siembra masivamente (unas 108) en placas Petri que
llevan un medio mímino (MM) -por lo tanto, sin aminoácidos- .
3) Las placas se sacan de la estufa (a las 24 h., por ejemplo) y se cuentan las colonias
surgidas en cada placa, comparándolas con las colonias de una placa control que no
llevaba la sustancia. Las colonias habrán surgido por el crecimiento de bacterias que
hayan experimentado reversiones (=retromutaciones). Cada reversión en el alelo
original his-- restituye el fenotipo silvestre His+, y por lo tanto capacita a la bacteria a
crecer y dividirse en el medio mínimo.
En los últimos años esta prueba ha sido modificada para mejorarla o adaptarla a
situaciones especiales. Veamos algunas de estas modificaciones:
Los rasgos culturales de las bacterias son muy fáciles de ver en los cultivos en
placas de Petri, por lo que igualmente es fácil detectar cambios en los aspectos de las
colonias que pudieran deberse a mutaciones. Antes de nada, vamos a describir brevemente
tres tipos de colonias que pueden darse en una misma especie:
cultivo original tratar con mutágeno lavar siembra placas de medio mínimo (MM)+
suplementos nutricionales réplica a MM
Una vez que sabemos que una colonia es un mutante auxotrófico, hay que
determinar qué requerimiento nutricional le hace falta (es decir, qué compuesto o
compuestos no puede sintetizar debido a la mutación). Para ello se realiza una sencilla
prueba en placas de Petri, denominada auxonograma.
tratamiento con el mutágeno
mezcla de bacterias muertas (p. ej., el 90% del cultivo inicial) + bacterias vivas, entre ellas
unos pocos mutantes de diversos tipos
la penicilina mata a los prototrofos, pero los auxotrofos no mueren, porque no crecen
en MM (muerte selectiva de los parentales prototrofos)
recuperar los auxotrofos de las placas de medio rico, y caracterizarlos (hacer auxonograma)
alteración de algún gen que codifica una diana (sitio de unión) del antibiótico;
alteración de algún gen responsable de permeabilidad al antibiótico.
Ambos tipos de mutantes son de muy amplio uso para “marcar” cepas bacterianas
en experimentos de genética (especialmente los que implican algún proceso de
transferencia de material genético desde una estirpe donadora a otra receptora). Estos
marcadores genéticos permiten seleccionar directamente la cepa que los porte añadiendo al
medio de cultivo el correspondiente agente selectivo (antibiótico o fago), que obviamente
mata o inhibe el crecimiento de las cepas sensibles.
Por ejemplo: si quisiéramos aislar mutantes Lac-- de E. coli, sembraríamos en Agar Mac
Conckey. Los mutantes Lac-- dan colonias transparentes, mientras que el fenotipo silvestre
Lac+ da colonias rojas opacas con un precipitado alrededor de sales biliares (recordar el
uso de este medio en las prácticas).