Genotype–

phenotype
correlation and
expansion of
orodental
anomalies in LTBP3-
related disorders
Juliana López
Emmanuel Arias
Cristian Mesa
Autores:
Narin Intarak,Thanakorn Therapanon
,Sermporn Thaweesapphithak,
Kanya Suphapeetiporn,
Thantrira Porntaveetus,
Vorasuk Shotelersuk

Realizado en:
Faculta de odontología de la
universidad de Chulongkorn
Tailandia.

Publicado en:
Springer-Verlag GmbH Germany,
part of Springer Nature 2019

Fecha de publicación:
18 de marzo de 2019
 INTRODUCCIÓN
-LTBP3:  Es un grupo de proteínas extracelulares involucradas en la
regulación en la activación de la proteína TGF-β y la red microfibrilar.

Factor de crecimiento epidérmico(EGF),híbridos,

4 Cys y dominios de la fijación de calcio.
-TGF-β es  el factor de crecimiento beta que es una proteína de la
union extracelular la cual es requerida para el funcionamiento de los
osteoclastos y la biología microfibrilar. 
 MUTACIONES DEL 
LTBG3
Estan asociadas a: 
-Displasia acromicrica (ACMICD)

-Displasia gelofísica (GPHYSD3)

-Anomalías dentales

-Estatura baja (DASS)

 PROPOSITO DEL
ESTUDIO

-Identificar a más pacientes con mutaciones en el gen e identificar sus

características clínicas, lo que puede ayudar a sugerir la correlación
genotipo-fenotipo. 
 GENES

-ACMICD pertenecen al grupo de displasia acromélica de displasias

esqueléticas genéticamente heterogéneas  

-La DASS se caracteriza por estatura baja, braquiolemia y amelogénesis

imperfecta hipoplásica.  
 GENES
-GPHYSD3 muestra rasgos faciales leves sin problemas cardíacos y
respiratorios progresivos. "cara feliz ", consisten en una cara que incluye
mejillas llenas, nariz pequeña, puente nasal ancho y labio superior
delgado con filtro plano, 

-Se observaron con frecuencia oligodoncia, aneuremas y disección de la

aorta torácica y prolapso de la válvula mitral.
 FAMILIA ESTUDIADA
-Una mutación missense heterocigótica se identificó previamente en el 
ACMICD autosómico dominante. 

-Se encontraron dos variantes heterocigotas de novo, punto de pérdida

y empalme del donante en dos pacientes no relacionados con el
GPHYSD3 dominante

-Pero se lograron informar mutaciones de LTBP3 bialélicas en pacientes

con DASS autosómico recesivo
 ESTUDIO
-En el estudio se evidencio la investigacion del fenotipo y el genotipo de
dos pacientes tailandeses no relacionados que estan afectados por el 
ACMICD y DASS

-A estos pacientes se les realizaron examenes de sangre y exoma para

identificar las variantes patogenas de los genes 

-En el análisis se expandio el espectro clínico y mutacional y se propuso

la correlación del genotipo-fenotipo en los trastornos relacionados con
LTBP3.
 MATERIAL Y METODOS

-Sujetos humanos 

-Dos familias tailandesas que fueron estudiadas por defectos genéticos

de displasia esquelética.

-Se realizaron exámenes exhaustivos y de sangre 

 SECUENCIACIÓN COMPLETA DEL
EXOMA (WES) Y BIOINFORMÁTICA.
-El ADN genómico se extrajo de leucocitos de sangre periférica de los pacientes.

-Se utilizo la VariantStudioTM versión 3.0.12 para encontrar las varientes 

-Criterios para evaluar:

1.Puntuación de calidad ≥ 20.

2.Profundidad de lectura ≥ 10.

3.Ubicación en o cerca de las regiones codificantes.

4.<1% de frecuencia de alelos menores en el base de datos de Exome Variant Server, Exome Aggregation
Consortium (ExAC).
 LA SECUENCIACIÓN DE SANGER SE
REALIZÓ PARA CONFIRMAR LAS
MUTACIONES DETECTADAS POR WES.

-La región de codificación de LTBP3 se amplificó mediante cebadores

específicos de LTBP3: 

• LTBP3_1_F: CTT CTCAGATGTGAACGAGTGC 

• LTBP3_2_R: TCC CCTCACCTTCGCACA

-La región del aceptor de sitio de empalme (SSA) de LTBP3 se amplificó
mediante los cebadores específicos de:

• LTBP3: LTBP3_3_F: GAAGCGTCGTTATCTGGGGT 

• LTBP3_4_R: CTGGAGTTGGAGTATGGGCG.
Paciente I CARACTERÍSTICAS
-Hijo hombre de padres no consanguineos 
FENOTIPICAS
-Baja estatura y extremidades cortas

-Escala de Tanner nivel 1e inteligencia normal a los 10 años

-Analisis oral muestra microstomia y apiñamiento. 

-Analisis radiografico muestra multiples dientes impactados y fueron removidos a los 16 años.

-Tiene estenosis aortica

-A los 18 años el paciente tiene poca extension de los hombros y codos y sufre de voz aguda 

-Cuerpo superior de 72.5cm e inferior de 70cm

-Condición cardiaca estable
Paciente II

-Paciente femenina de 24 años con defectos congénitos del corazón.

-Sus padres son consanguineos 

-Presenta baja estatura y escoliosis

-Mide 140 cm

-Examen oral muestra dientes pequeños y amarillos e hipoplasia.

-Examen radiografico muestra esmalte delgado, hueso alveolar irregular que sugieren una amelogenesis
imperfecta.

-Desarrollo intelectual normal

-Sus hermanos no tienen estas caracteristicas dentales

 ANÁLISIS MUTACIÓN
-Paciente 1: Las variantes  que pasaron los criterios de filtrado fueron seleccionados utilizando las listas de
genes asociados con estatura corta.

•Dos Variantes missence pasaron los criterios:  LTBP3 y PLEC(Es una  mutación missense heterocigota.) 

-c.2017G> T (p.Gly673Cys) en el exón 14 del LTBP3 ( NM_001130144.2), mutacion asociada a Displasia

acromícrica.

El p.Gly673Cys fue predicho para ser perjudicial y posiblemnete patogeno,El aminoácido cambió de glicina a
cisteína en la Posición 673 situada dentro de un EGF de unión a calcio.

Causa: La estructura de LTBP3 sugirió que el residuo mutante era más grande, más hidrófobo y menos
flexible que el  original. Se esperaba que la mutación perturbara la union calcio , lo que  produce un ángulo
inusual conformación, y función de la proteína de impacto de la  espina dorsal. 
 ANÁLISIS MUTACIÓN
-Paciente 2:  Las variantes  que pasaron los criterios de filtrado fueron seleccionados utilizandoanálisis de
WES basados en trío.

-Se encontro Una nueva mutación homocigótica del sitio de empalme, c.1721-2A> G, en región del
aceptor de sitio de empalme (SSA) antes del exón 12 de LTBP3.

Esta mutación y las características presentadas por el paciente coinciden con DASS.

•Sus padres eran heterocigotos para la mutación.

 Se esperaba la mutación del sitio de empalme.para alterar el sitio aceptor causando el empalme pre-
mRNA y omisión de exón que podría resultar en un nosense mediado Desintegración del ARNm
 DISCUSIÓN
-En este estudio, identificamos los dos primeros pacientes del este
asiático tener mutaciones LTBP3 fenotípicas y genotípicas en
expansión Espectro de trastornos relacionados con LTBP3.

-Primer probando:tenía características típicas de ACMICD, donde la

densidad de la estructuras dentales no se vio afectada, solo se ve el error
de LTBP3 (mutación missense heterocigota, c.2017G> T
(p.Gly673Cys)en LTBP3 asociado con ACMICD).

Papel causal de LTBP3 para

ACMICD
Patogeno
-Es importante destacar que la mutación se localizó en el dominio de
unión al calcio de tipo EGF, este defecto genera las patologias
previamente nombradas y sus complicaciones.

-La paciente(segundo probando) con DASS fue encontrado para

albergar a los homocigotos mutación del aceptor de sitio de empalme, c.
1721-2A> G, en LTBP3.
causa
cambio de secuencia de "CAG" a "CGG" en el  sitio de empalme
aceptor en el intrón 12 del gen LTBP3  alterara la constitutiva SSA
causando un exón. Resulta en la desintegración del ARNm
y niveles reducidos de proteínas


-El DASS es causado por homocigotos o compuestos.