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CURSOS PROPEDÉUTICOS PARA EL PROGRAMA DE POSGRADO EN
BIOTECNOLOGÍA DE PLANTAS DEL CINVESTAV CAMPUS GUANAJUATO 2009

El objetivo de los propedéuticos 2009 es: Mejorar los conocimientos básicos de los aspirantes en
las disciplinas necesarias para llegar fortalecidos a los primeros cursos del programa de
posgrado Los estudiantes interesados tendrán la oportunidad de repasar y consolidar sus
conocimientos básicos en las disciplinas principales (química, bioquímica y biología) que se
consideran indispensables para realizar exitosamente los cursos de posgrado del programa de
maestría y doctorado en Cinvestav Irapuato. Esto se hará por medio de cátedra impartida en el
auditorio por diversos profesores.
Adicionalmente, se ofrecerán una serie de actividades introductorias que pretenden que los
aspirantes tomen conciencia y ejerciten algunas aptitudes de razonamiento científico, y al
mismo tiempo mejoren su motivación por la ciencia antes de emprender el posgrado.
Los cursos y actividades propedeuticas no son obligatorias ni seriadas. Ofrecen la alternativa
de apoyar a los estudiantes a repasar aquellas disciplinas básicas, para nivelar y mejorar los
conocimientos de todos los aspirantes provenientes de las distintas carreras de las áreas
química-biológicas y agrícolas.
Dada la amplitud de los temas incluídos, la dinámica de los cursos se basa en que los asistentes
estudien previamente, y a profundidad, cada uno de los temas a tratar, para que el
tiempo en el salón de clases se dedique a aclarar las dudas que puedan quedarles después
de haber consultado libros y apuntes. Por ello, los estudiantes deberán presentarse a las clases
de cada curso que vayan a tomar, habiendo estudiado a fondo al menos el primer tema
incluido en el programa correspondiente.
Estos cursos no fueron diseñados para pasar el examen de admisión. El proceso de admisión es
independiente de los propedéuticos. Es por ello que los estudiantes tendrán que repasar
individualmente los conocimientos de las disciplinas básicas para tener el nivel mínimo
para el examen de admisión, siguiendo la guía de estudio y las referencias que se
proporcionan para tal fin.
Es recomendable que los estudiantes traigan su computadora para que puedan tener acceso a
internet. Parte de la documentación y libros virtuales se darán como archivos electrónicos.
Servicios: Hay una biblioteca y lugares de lectura pero no se pueden prestar los libros afuera de
ella. No hay servicio comercial de fotocopiado en la Unidad. Hay una cafeteria que ofrece
comida y refrigerios.

Para asistir a los cursos propedéuticos, es necesario llenar el formato correspondiente al 2009.

www.ira.cinvestav.mx

Se ofrecerá apoyo económico (beca) a los estudiantes que tomen los cursos, pero en caso de que se exceda el número
previsto, se otorgará en base a su desempeño.

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Calendario de los cursos propedéuticos 2009

Actividades Introductorias (60 horas): Junio 8 a Julio 17, de 9:00 AM a 11:00 AM

Química (20 horas): Junio 8 a Junio 19, de 11:30 AM a 13:30 AM

Bioquímica (30 horas): Junio 22 a Julio 3, de 11:30 AM a 13:30 AM

Biología (20 horas): Julio 6 a Julio 17, de 11:30 AM a 13:30 AM

Horarios y dinámica:
9:00 – 11:00 Actividades (auditorio y otros salones)
11:00 – 11:30 Pausa
11:30 – 13:30 Cátedra de profesores (auditorio)
13:30 – 15:00 Comida
15:00 – 18:00 Tiempo para hacer tareas y dedicarlo al autoestudio para el examen
de admisón

A continuación se presenta el temario de cada curso y al final sitios de internet en los que se
pueden revisar estos temas.

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TEMARIO DEL CURSO PROPEDÉUTICO DE QUÍMICA ORGÁNICA

20 horas en total
Dos semanas: 2 horas por día.
Fecha: Junio 8 a Junio 19
Horario de Clases: 11:30 AM a 13:30 PM

Coordinador: Dr. Axel Tiessen

Docentes Participantes: Dra Alba Jofre, Dr. John Délano, Dr. Axel Tiessen

I. Introducción al curso
I.1. Presentación de los docentes. Reparto de materiales. Sugerencias de referencias,
bibliografía. Aclaración de dudas.
1. Fundamentos básicos (2 horas). Dr. John Délano
1.1 Tabla Periódica. Grupos elementales. Carbono
1.2 Configuración electrónica. Niveles energéticos y orbitales atómicos
1.3 El enlace covalente. Polaridad de enlaces; principio de electronegatividad
1.5 Efectos inductivos y polaridad de moléculas. Puentes de hidrogeno. Agua
1.6 Fuerzas intermoleculares, punto de ebullición, solubilidad. Agua
1.7 Ácidos y bases, pH, pK, equilibrio químico
2. Estereoquímica (2 horas). Dr. John Délano
2.1 Orbitales híbridos: sp, sp2, sp3. El carbono asimétrico.
2.2 Isomería óptica (Enantiomería). Ejemplos biológicos.
2.3 Configuración Cis-Trans. Sistema de nomenclatura IUPAC
4. Grupos funcionales I (4 horas). Dr. John Délano
3.1 Hidrocarbonos saturados e insaturados: Lipidos C18 y otros ejemplos biológicos.
3.3 Aromaticidad y compuestos fenólicos. Fenol, tirosina y otros ejemplos biológicos.
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3.5 Compuestos heterocíclicos. Bases nitrogenadas, ADN.
4. Grupos funcionales II (8 horas). Dr. Axel Tiessen
4.1 Grupo hidroxilo; Propiedades y reacciones; oxidación-reducción
4.2 Grupo carbonilo; cetonas y aldehídos; tautomería. Reactividad nucleofílica y
reactividad ácida-electrofílica del carbono alfa. Otras reacciones de carbonilos.
4.3 Grupo carboxilo; derivados funcionales de los ácidos carboxílicos (anhídridos, ácidos
grasos, ésteres, etc).
4.4 Grupos amino primarios, secundarios y terciarios.
4.5 Moléculas con grupos funcionales múltiples: Azúcares, Aminoácidos.
4.6 Repaso de reacciones químicas de grupos funcionales usando como ejemplo la
glicólisis
5. Ejercicios prácticos (4 horas). Dra. Alba Jofre
5.1 Cálculos de molaridades, diluciones, normalidades, pH, etc
5.2 Consejos prácticos para preparación de medios y soluciones en el laboratorio.

El presente curso pretende repasar algunos temas básicos de la química orgánica con un enfoque
orientado a los temas de la biología moderna. Sin embargo, no es un reemplazo de los cursos de
Química que regularmente se imparten en la secundaria, preparatoria y licenciatura. Aquellos
estudiantes que se sientan poco preparados en química les recomendamos que antes del curso
propedéutico repasen muy bien todos sus apuntes y libros de química que tengan a la mano o
puedan conseguir en sus bibliotecas.

REFERENCIAS:
El curso usara como base principal el libro de:
 Organic Chemistry and Biochemistry. Connecting Chemistry to your Life. Ed. Blei y
Odian. 2ª edición. Editorial Freeman. New York, USA. ISBN 0-7167-7072-5

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Ese libro no esta todavia en la biblioteca de la unidad, pero a los estudiantes se les dara una copia
escaneada para que puedan estudiar por su cuenta. Los interesados deberan descargar los archivos
y revisar los links que se incluirán en la plataforma Moodle.
Otros libros relevantes que estan disponibles en la biblioteca:
 Química Orgánica, de Morrison y Boyd
 Quimica, de Brown, Lemay, Bursten
 Quimica, de Ander
Consultar la Página web:
http://www.cem.msu.edu/~reusch/VirtualText/intro1.htm#contnt

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Curso propedéutico de Bioquímica 2009
30 horas en total
Dos semanas: hasta 3 horas por día.
Fecha: Junio 22 a Julio 3
Horario de Clases: 11:30 AM a 14:30 PM

Coordinadora: Dra. Magdalena Segura Nieto

Participantes: Magdalena Segura Nieto, Mercedes G. López Pérez, Luis González de la Vara,
Raúl Álvarez Venegas, Francisco Barona Gómez, Alexander de Luna Fors, John Délano Frier.

Este curso está fundamentado principalmente en el libro: Biochemistry Fifth edition, de JM Berg,
JL Tymoczko y L Stryer. Ed.WH Freeman and Company. Este libro se puede consultar en la
página del NCBI.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?call=bv.View..ShowTOC&rid=stryer.TOC&depth=2
Se recomienda leer cada capítulo antes de la sesión correspondiente (entre paréntesis se indican
los capítulos relacionados con cada tema). Cada profesor podrá recomendar otras lecturas.

I Bioquímica estructural

1. A. Introducción al curso. Presentación de los participantes. 22 de junio

B. Aminoácidos y proteínas (Cap. 3) Dra. Magdalena Segura
Los aminoácidos. Propiedades químicas de los diferentes tipos de aminoácidos. El
enlace peptídico. Secuencia de aminoácidos de las proteínas,
Estructuras primaria, secundaria (motivos), terciaria (dominios), cuaternaria y
complejos multiproteicos.
C. Preguntas y respuestas sobre aminoácidos y proteínas.

2. A. Proteínas: Métodos para su estudio I (Cap.4) Dra. Magdalena Segura. 23 de junio

Métodos preparativos y analíticos más usuales. Principios de cromatografía (exclusión
molecular, intercambio iónico, afinidad), HPLC.
B. Preguntas y respuestas sobre los temas revisados.

3. A. Proteínas: Métodos para su estudio II (Cap.4) Dra. Magdalena Segura 24 de junio

Métodos preparativos y analíticos más usuales. Electroforesis uni y bidimensional.
Usos (proteómica).
B. Preguntas y respuestas.

4. A. Carbohidratos (Cap. 11) Dra. Mercedes López 25 de junio

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Estructura química de los monosacáridos. El enlace glicosídico. Disacáridos: maltosa,
sacarosa, etc. Polisacáridos: almidón, celulosa, fructanos.
B. Preguntas y respuestas.

5. A. Lípidos (Cap. 12) Dr. Luis González de la Vara 26 de junio

Definición. Composición y estructrura de los lípidos de reserva y de los lípidos
formadores de membranas. Esteroles. Terpenos.
B. Preguntas y respuestas sobre lípidos.

6. A. Bases nitrogenadas, nucleótidos y ac. nucleicos y métodos para su estudio (Cap. 5

y Cap. 6) Dr. Raúl Álvarez 29 de junio
Purinas y pirimidinas. Nucleótidos. Estructura del DNA. Diferentes tipos de RNAs y
su estructura.
Técnicas básicas: separación de los diferentes tipos de ácidos nucleicos, purificación,
secuenciación, identificación de secuencias por hibridación.
B. Preguntas y respuestas sobre los temas revisados

7. A. Fundamentos de la acción enzimática (Cap. 8 y Cap. 9) Dr. Luis González de la

Vara 30 de junio
Conceptos fundamentales de enzimología. Principios de cinética enzimática.
Mecanismos de acción enzimática y ejemplos.
B. Preguntas y respuestas sobre los temas revisados

II Metabolismo
8. A. Introducción al metabolismo (Cap. 14) Dr. Francisco Barona 1 de julio
Panorama del metabolismo. Características de las vías metabólicas. Transformaciones
de energía en el metabolismo: Principios termodinámicos.
B. Preguntas y respuestas sobre los temas revisados

9. A. Vías metabólicas principales (Cap. 16 y Cap. 17) Dr. Alexander de Luna 2 de julio
Glicólisis .
El ciclo del ácido cítrico.
B. Preguntas y respuestas sobre los temas revisados

10. A. Fosforilación oxidativa y fotosíntesis (Cap. 18, Cap. 19 y Cap. 20) Dr. John Délano
3 de julio
Absorción de luz. Transporte fotosintético de electrones y protones. Síntesis de ATP
(fotofosforilación
El ciclo de Calvin. Fotosíntesis C3, C4 y CAM.
B. Preguntas y respuestas sobre los temas

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OTROS LIBROS DE CONSULTA:

i. Biochemestry. Donald Voet, Judith G. Voet. 3ra Edición.2004.

Editorial John Wiley and Sons.
ii. Principles of Biochemistry. Lehninger.Michael M. Cox., David L. Nelson . 4a
Edición. Editorial Freeman 2005 .
www.whfreeman.com/lehninger.
iii. Biochemistry Molecular Biology of Plants.Bob B. Buchanan, Whihelm
Gruissem, Russell L. Jones.
2001. Editorial American Society of Plant Physiologist.
3ra Edición.
Aspp.org/biotext

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TEMARIO DEL CURSO PROPEDÉUTICO DE BIOLOGÍA

20 horas en total
Dos semanas: 2 horas por día.
Fecha: Julio 6 al 17
Horario de Clases: 11:30 AM a 13:30 PM

Coordinadora: Dra. Laura Silva

Paricipantes: Dr. Juan Pablo Martínez-Soriano, Dra. Laura Silva, Dra. June Simpson, Dra.
Gabriela Olmedo.

1. Estructura y función celular (4 horas) Dra. Laura Silva Julio 6 y 7

a. Teoría celular
b. Endosimbiosis y comparación entre procariotes y eucariotes
c. Estructura general
i. Formas y tamaños celulares
ii. Membrana celular
iii. Núcleo
iv. Pared celular
v. Citoplasma
d. Componentes celulares: estructura y funciones
i. Núcleo
ii. Vacuolas y vesículas
iii. Retículo endoplasmático
iv. Aparato de Golgi y dictiosoma
v. Lisosomas
vi. Mitocondria
vii. Plástidos
e. Citoesqueleto celular y movilidad celular
f. Ciclo celular
i. Vista general ciclo celular
ii. División celular: Mitosis
iii. División celular meiosis
iv. Citocinesis

2. Sistemática, biodiversidad y evolución (4 horas) Dr. Juan P. Martínez Soriano. Julio 8 y 9

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a. Breve historia de la clasificación sistemática
b. La Teoría de la Evolución en breve
c. Sistema binomial de clasificación
i. Jerarquías taxonómicas
ii. Género y especie
iii. Reglas de nomenclatura
d. Sistema natural de clasificación
i. Filogenia y Taxonomía
ii. Métodos moleculares de clasificación
e. Fundamentos de evolución molecular

3. Biología Vegetal (4 horas) Dra. Larua Silva Julio 10 y 13

a. El estudio de las plantas
b. Plantas vs. animales
c. Estructura típica de las plantas
d. Órganos de las plantas
i. Hojas: Origen, estructura y función
ii. Tallo: Origen, estructura y función
iii. Raíz: Origen, estructura y función
f. Alternancia de generaciones
g. Desarrollo del fruto. Diversidad de frutos y semillas

4. La Herencia (2 horas) Dra. June Simpson Julio 16

a. Conceptos premendelianos de la herencia
b. Mendel y su método científico
c. Cruza monohíbrida

5. Algunas herramientas básicas de Biología Molecular (4 horas) Dra. Gabriela Olmedo Julio
14 y 15

LIBROS RELEVANTES:

Capítulo 5 del libro: Molecular Cell Biology. H. Lodish; D. Baltimore; A. Berk; S. L. Zipursky;
P. Matsudaira; J. E. Darnell. 3a. edición. New York: W. H. Freeman & Co. ; 1996. Pag. 141 a
188. Colocación en la biblioteca: 574.8760 MOL 1996.
Disponible en:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=mcb.TOC

Sequence – Evolution – Function. by Eugene V. Koonin and Michael Y. Galperin

Disponible en :
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http://www.ira.cinvestav.mx:86/mod/resource/view.php?id=398

Capítulo 5 y 8: Griffits, Gelbart, Lewontin y Miller. Modern Genetic Analysis Integrating Genes
and Genomes. 2a Edición, USA 2002.

http://www.biologia.edu.ar/botanica/tema16/16-1.htm

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ACTIVIDADES COMPLEMENTARIAS DEL PROPEDÉUTICO 2009

60 horas en total
Fecha: 8 de junio al 17 de julio
Horario: 9:00 a 11:00 AM

Coordinador: Dr. Jean Philippe Vielle

Participantes: Dr. Jean Philippe Vielle, Dr. Axel Tiessen, Dr. Agustino Martinez, y otros por
designar.

Las actividades complementarias se impartirán durante las 6 semanas del propedeútico, dos horas
por día. Las actividades estarán divididas en 3 partes. El primer bloque estará dividido en tres
submódulos, como se muestra a continuación.

1. Taller de Razonamiento Científico

a. Síntesis y Expresión
b. Imaginación y Expresión
c. Razonamiento Deductivo y Expresión
2. Seminarios por estudiantes
3. Espacio “Ciencia Libre”

1. Taller de Razonamiento Científico (15 sesiones de 2 horas)

Se imparten por módulos que son cada uno dirigidos por un equipo de 2 profesores; o 1 profesor
y 1 a 3 estudiantes avanzados de posgrado o postdoctorado.

1a. Síntesis y Expresión.

8 Sesiones de 2 horas.
Consiste en organizar una análisis de comprensión de artículos científicos en español. Los
artículos no presentan ni el título ni el resumen. El ejercicio consiste en asimilar el artículo,
extraer sus aportaciones esenciales, y proponer tanto un título como un resumen con la asesoría
de los instructores. Cada ejercicio incluye 2 a 3 sesiones de 2 horas.

1b. Imaginación y Expresión.

3 sesiones de 2 horas.
Consiste en definir un problema aplicado y tratar de proponer una idea de solución con base en
conocimientos biológicos y sus aplicaciones biotecnológicas. Ejemplo: “El lirio acuático y su
efecto en los cuerpos de agua dulce de México; imagine una solución biotecnológica”. El tema

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es definido por los instructores. La actividad consiste en presentar el problema, las soluciones que
existen actualmente (si las hay) e invitar a los estudiantes a imaginar, reflexionar y discutir.

1c. Razonamiento Deductivo y Expresión.

4 sesiones de 2 horas.
Consiste en definir un problema científico básico (ej: un problema evolutivo) y ejercitar la
capacidad deductiva de los estudiantes en función de sus implicaciones biológicas. Incluye
discusiones orales y un pequeño ensayo. Tema Propuesto: La Domesticación del Maíz.
Responsables: Jean-Philippe Vielle, Cesar Alvarez.

2. Seminarios: “Los Modelos y las Moléculas de Cinvestav Irapuato” (8 sesiones de 2 horas)

Serie de seminarios dirigidos por estudiantes avanzados o postdocorantes del programa de

posgrado. Los asesores correspondientes participarán en la preparación del semianrio impartido
por el estudiante. El estudiante presentará un cátedra sobre el tema e incitará una discusión con
los estudiantes.

3. Espacio “Ciencia Libre” (7 sesiones de 2 horas)

Presentaciones por investigadores del Cinvestav Irapuato y ponentes invitados, en el que se

presentará un tema científico: una idea, un comentario, una experiencia, un tema de política
científica, un descubrimiento, un error o un acierto, un consejo, un problema, una nueva
tecnología, a los futuros estudiantes. La idea es incitar sus reflexiones y participación o bien
animar un debate. Se trata de estimular su motivación científica al hacerlos partícipes de la
pluralidad de ideas, de temas, de conceptos y hasta de ideologías científicas que prevalecen en la
institución.

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OTRAS REFERENCIAS RECOMENDADAS PARA LOS CURSOS

PROPEDÉUTICOS

 Buchanan, Gruisem & Jones. (2000) Biochemistry and molecular biology of plants.
Amer. Soc. Plant Physiol. USA.
 Donald Voet, J.G. Voet (1995) Biochemistry 2d edición. Wiley & Sons
 Lehninger A, Nelson D, Cox M (1994) Biochemistry Ed 4nd. Worth Publishers, Inc.,
New York
 Nabors Murray W. Pearson (2006) Introduccion a la Botanica. Edición Educación.

LIBROS Y SITIOS DISPONIBLES EN INTERNET:

Interactive Concepts in Biochemistry Rodney Boyer (Wiley)

http://www.wiley.com/legacy/college/boyer/0470003790/index.htm

Biochemistry Berg, Jeremy M.; Tymoczko, John L.; and Stryer, Lubert. New York: W. H.
Freeman and Co. ; c2002
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=stryer.TOC&depth=2

Molecular Cell Biology Lodish, Harvey; Berk, Arnold; Zipursky, S. Lawrence; Matsudaira, Paul;
Baltimore, David; Darnell, James E. New York: W. H. Freeman & Co. ; c1999
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=mcb.TOC

Links a libros online del NCBI

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?CMD=search&DB=books

Departamento de bioquímica, Medicina, UNAM

http://laguna.fmedic.unam.mx/

Aprende bioquímica, facultad de medicina UNAM

http://laguna.fmedic.unam.mx/~leonor/

Material de apoyo a la docencia en bioquimica. Sociedad Mexicana de Bioquímica, A. C.

http://www.smb.org.mx/text/smb_html_docencia.htm

General, Organic and Biochemistry University of Akron

http://ull.chemistry.uakron.edu/genobc/

Concepts in biochemistry
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http://ull.chemistry.uakron.edu/biochem/

Biochemistry concepts
http://hyperphysics.phy-astr.gsu.edu/hbase/organic/biochemcon.html

Chemtutor · Computational Chemistry via the Internet Project · Concepts in Biochemistry

http://www.ziplink.net/users/pik/Chemistry,%20Biochemistry.html

Kimball's Biology Pages

http://users.rcn.com/jkimball.ma.ultranet/BiologyPages/

Electronic Textbook StatSoft

http://www.statsoft.com/textbook/stathome.html

Statistics Solutions, Inc.

http://davidmlane.com/hyperstat/

Google Biostatistical Books OnLine

http://books.google.com.mx/books?q=biostatistical+books+online&ots=DfNMADEgtm&sa=X&
oi=print&ct=title

Biostatistical Genetics and Genetic Epidemiology Autor Robert C. Elston, Jane M. Olson, Lyle
Palmer
http://books.google.com.mx/books?id=HWJzg-
LrnsoC&pg=PR6&ots=4EofcZW0j2&dq=biostatistical+books+online&sig=iKhQrakbiYcFWX
M-JJd7pzhyWZA#PPP1,M1

The Promise of Biotechnology

http://books.google.com.mx/books?id=x7xPyx4nMy8C&pg=PA44&dq=biology+online&as_brr
=1&sig=OkqcH-jDyYCbbGhTmyBa_1szVzg#PPP1,M1

Molecular Biology and Physiology Resources

http://tigger.uic.edu/~dbhale/molbio.html

Pedro's BioMolecular Research Tools

http://www.biophys.uni-duesseldorf.de/BioNet/Pedro/research_tools.html

Sequence – Evolution – Function

by Eugene V. Koonin and Michael Y. Galperin
Disponible en :
http://www.ira.cinvestav.mx:86/mod/resource/view.php?id=398
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