ABSTRAK

IDENTIFIKASI FRAGMEN D-LOOP DNA MITOKONDRIA MANUSIA

PADA PENDERITA DIABETES MELITUS KOMPLIKASI JANTUNG

Diabetes Melitus (DM) merupakan kelainan metabolisme yang ditandai dengan

peningkatan kadar glukosa darah berhubungan dengan faktor genetik, salah
satunya diduga mempengaruhi urutan DNA mitokondria (mtDNA). Berdasarkan
hal tersebut, dalam penelitian ini dilakukan penentuan profil genetik daerah D-
Loop mtDNA manusia pada penderita diabetes melitus (DM) komplikasi jantung
yang akan dibandingkan dengan penderita diabetes melitus (DM) dan individu
normal. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi fragmen D-Loop akar
rambut dan darah sebagai sumber DNA mitokondria manusia yang dapat
dijadikan sebagai templat amplifikasi fragmen DNA mitokondria manusia.
Tahapan yang dilakukan meliputi lisis terhadap sampel akar rambut dan darah,
amplifikasi fragmen D-Loop dengan menggunakan metode Polimerase Chain
Reaction (PCR) dan deteksi hasil PCR dengan elektroforesis gel agarosa. Pada
penelitian ini akar rambut dan darah dapat dilakukan analisis mtDNA ditandai
dengan terbentuknya pita DNA pada elektroforesis gel agarosa dan di lakukan
amplifikasi PCR terhadap fragmen berukuran 1 kb pada daerah D-Loop mtDNA.
Urutan nukleotida daerah D-Loop mtDNA dianalisis lebih lanjut melalui
sekuensing menggunakan metode dideoksi sanger.

Kata-kata kunci: mtDNA, D-Loop, PCR, diabetes melitus (DM), sekuensing,

dideoksi sanger.

i
 ABSTRACT

IDENTIFICATION OF HUMAN MITOCHONDRIAL D-LOOP DNA

FRAGMENT OF DIABETIC MELLITUS CARDIAC COMPLICATION

Diabetic mellitus (DM) is a metabolic disorder characterized by elevated levels of

blood glucose correlates with genetic factors, among which is the sequence of
mitochondrial DNA (mtDNA). Therefore, the reseacrh aims to investigate the
genetic profile of the D-Loop region of human mtDNA of diabetic mellitus (DM)
cardiac complication will be compared with diabetic mellitus (DM) and normal
individuals. The purpose of this research is to identify D-Loop fragment hair root
and blood as a source DNA mitochondrial that can used for a amplification of
human fragment DNA mitochondrial template. The steps include the lysis to do
the sample of the hair root and blood, amplified D-Loop fragment mtDNA to
utilize Polimerase Chain Reaction (PCR) technique and the result of PCR with
elektroforesis gel agarosa. In this research of hair root and blood can do analyze
mtDNA marker by the fragment measuring 1 kb in the area D-Loop mtDNA. The
D-Loop mtDNA nucleotide sequence was analyzed further through sequencing
using the deoxy sanger method.

Keywords: mtDNA, D-Loop, PCR, diabetic mellitus (DM), sequencing, dideoxy

sanger.

ii
 KATA PENGANTAR

Assalamu’alaikum Wr. Wb.

Puji serta syukur penulis panjatkan ke-Djat Allah SWT, atas segala rahmat dan karunia-
Nya serta izin dan kehendak-Nya, telah memberikan kelancaran dan kesabaran serta kekuatan
lahir dan batin kepada penulis sehingga dapat menyelesaikan skripsi dengan baik. Shalawat
serta salam tercurahkan kepada Nabi Muhammad SAW sebagai pemberi syafa’at kepada
umatnya di akhir zaman.
Alhamdulillah atas ridho-Nya penulis dapat menyelesaikan skripsi berjudul
“IDENTIFIKASI FRAGMEN D-LOOP DNA MITOKONDRIA MANUSIA PADA
PENDERITA DIABETES MELITUS KOMPLIKASI JANTUNG”. Skripsi ini dimaksudkan
untuk memenuhi syarat memperoleh gelar Sarjana Sains pada Jurusan Kimia, Fakultas Sains
dan Teknologi, UIN Sunan Gunung Djati Bandung.
Penulis mengucapkan terima kasih kepada kedua orang tua, bapak Mursid, ibu Siti
Hasanah, dan adik Dina Nurjannah serta Firda Syahira yang tak hentinya memberikan doa,
motivasi, dukungan moril dan materil, serta dukungan dari berbagai pihak dalam penyusunan
skripsi ini diantaranya :
1. Ibu Dr. Tina Dewi Rosahdi, S.Pd., M.Si., selaku pembimbing I yang senantiasa
memberikan pengarahan, bimbingan, masukan dan ilmu nya dalam penyusunan skripsi
ini.
2. Ibu Dr. Rina Budi Satiyarti, M.Si., selaku pembimbing II yang telah memberikan
bimbingan, pengarahan, masukan dan saran dalam penyusunan skripsi ini.
3. Ibu Susi Susianti S.Si., selaku laboran Laboratorium Sentral Universitas Padjajaran yang
telah mendampingi, memberikan saran dan bimbingan selama penelitian.
4. Ibu Dr. Tety Sudiarti, M.Si., selaku Ketua Jurusan Kimia, Fakultas Sains dan Teknologi,
Universitas Islam Negeri Sunan Gunung Djati Bandung.
5. Bapak Dr. H. Opik Taupik Kurahman selaku Dekan Fakultas Sains dan Teknologi UIN
Sunan Gunung Djati Bandung.
6. Bapak dan Ibu dosen di Jurusan Kimia, Fakultas Sains dan Teknologi atas segala ilmu
yang berguna dalam penyusunan skripsi ini.
7. Yohana Permata Sari, Dini Dwi Nurbaeti, Nanda Nurul Aulia Farhani selaku sahabat
sekaligus partner mtDNA yang selalu memberikan doa, dukungan, arahan, serta berjuang
bersama dalam setiap tahap penelitian dan penyusunan skripsi ini.

iii
8. Risna Auliawati, Widi Indrianti, Naila Hidayat, Lilis Maesyarah, Ajeng Syifa Sa’adah
selaku sahabat seperbimbingan Biokimia yang selalu berjuang bersama, memberikan
doa, serta dukungan terhadap penulis dalam penyusunan skripsi ini.
9. Sahabat kosan yang selalu mendoakan dan mensuport penulis dalam penyusunan skripsi
ini.
10. SGM Girls yang telah menjadi teman berbagi cerita, sahabat yang selalu ada saat suka
duka, hingga menjadi keluarga yang selalu memberikan dukungan, mendoakan, dan
memotivasi dalam penyusunan skripsi ini.
11. Teman-teman seperjuangan khususnya Kimia angkatan 2015 atas kebersamaan dan
dukungannya selama penulis menyelesaikan skripsi ini.
12. Kepada semua pihak yang telah membantu penulis selama ini yang tidak dapat
disebutkan namanya satu persatu, semoga semua bantuan yang telah diberikan
mendapatkan balasan dari Allah SWT.
Penulis berharap semoga skripsi ini dapat bermanfaat dan menginspirasi berbagai pihak, para
pembaca dan khususnya pribadi penulis. Akhir kata, penulis mohon maaf jika dalam
penyusunan skripsi ini masih terdapat banyak kesalahan. Oleh karena itu, penulis
berterimakasih kepada semua pihak yang dapat memberikan saran dan kritiknya kepada
penulis. Jazzakumullah Khoiron Katsiron.

Bandung, 15 Dhu’l-Qi’dah 1440 H/ 19 Juli 2019

Sarah Nafisah

iv