Lingkungan merupakan tempat makhluk hidup bernaung, tumbuh dan beraktifitas mulai dari makhluk hidup tingkat rendah sampai tingkat tinggi, dari yang bersel tunggal (unisel) sampai kepada yang bersel banyak (multisel). Mikroorganisme merupakan salah satu dari makhluk hidup yang menempati lingkungan dalam segala aktivitasnya walaupun tidak dapat terliha alam bentuk sel tunggalnya tetapi dapat di lihat dalam bentuk koloninya (populasinya) dengan mata telanjang. Mikroorganisme tersebut dapat menmpati berbagai tempat dan media sperti udara, air, tanah, permukaan tubuh, sampai kedalam organ tubuh makhlik hidup dapat di tempat oleh mikroorganisme sepanjang temat-empat tersebut sesuai dengan kebutuhan hidupnya.