Locus, definition, dan organism

Locus selalu menempati baris pertama pada tampilan entry, yang menunjukan nama sekuen pada
GenBank, terdiri dari nama sekuen, panjang sekuen (pasang basa/base pairs), molekul, bentuk
molekul, dan tanggal update terakhir. Locus sendiri menunjukan posisi gen yang diidentifikasi.
Disamping locus, definition juga melengkapi informasi yang mendeskripsikan sekuen terkait.
Kolom definition didukung dengan keberadaan kolom organism dimana kolom ini memberikan
informasi terkait organisme pemilik sekuen nukleotida terkait.

Summary

Pada kolom ini, dibeberkan beberapa informasi terkait sekuen nukleotida yang diidentifikasi.
Dari sampel yang digunakan, pada kolom ini diketahui bahwa gen terkait mengkode anggota dari
superfamili globin dan diekspresikan dalam otot rangka dan juga otot jantung. Kode protein
tersebut merupakan haemoprotein yang berperan untuk penyimpanan oksigen intraseluler dan
difusi oksigen transeluler terfasilitasi. Sekurang-kurangnya terdapat tiga varian transkrip
alternatif yang diketahui mengkode protein yang sama.
 Features

Pada kolom features ini diinformasikan mengenai catatan atau keterangan mengenai
ciri/karakter setiap sekuen. Dari data pada kolom ini, didapatkan data sebagai berikut :

CDS 81...545

Exon 1...175

176...398

399...1078
 Origin

Data pada kolom ini berhubungan dengan data yang diberikan pada kolom features, dimana
dilihat dari CDS (81...545) dapat memperkecil luas fokus identifikasi sekuen nukleotida yang
berarti sekuen terletak diantara data nomor 81 hingga 545. Dari penelusuran terhadap origin,
diawali dari baris 121 hingga 541, didapatkan data sebagai berikut :

Promotor, menentukan di mana transkripsi dimulai dan juga menentukan yang

mana dari kedua untai heliks DNA yang digunakan sebagai cetakan, ditemukan berupa
GACA di 141 (pada baris 121).

Start kodon, kodon pertama yang diterjemahkan pada saat translasi atau disebut
juga kodon inisiasi, ditemukan berupa ATG di 154 (pada baris 121).

Stop kodon, merupakan triplet nukleotida dalam RNA yang bertanggung jawab atas
penghentian proses penerjemahan, ditemukan berupa TAG di 543 (pada baris 541).