BIOTECNOLOGÍA I
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DIRECTORIO
2
INDICE PAG
INTRODUCCION……………………………………………………………………….. 4
CRITERIOS DE EVALUACIÓN……………………………………………………… 7
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INTRODUCCION
Resulta evidente que para comprender todas las posibilidades que ofrece la biotecnología es
necesario un profundo conocimiento de las ciencias básicas que se encuentran en ella
implicadas, de todas ellas, la Bioquímica juega un papel central ya que la comprensión de esta
disciplina abre todas las puertas a tan variadas y por momentos inimaginables aplicaciones de la
biotecnología.
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NORMAS DE SEGURIDAD DE LOS LABORATORIOS DE BIOQUIMICA Y
BIOLOGIA MOLECULAR
Estos dispositivos son elementos tales como extintores, lavaojos, ducha de seguridad, mantas
antifuego, salida de emergencia. etc. Infórmate sobre su funcionamiento.
En caso de accidente.
Considerar la seguridad de sus compañeros, por ello el laboratorio es un lugar para trabajar
con seriedad. En caso de cualquier accidente personal o del material de trabajo, notifíquese
inmediatamente al maestro.
Manejo de reactivos
Los reactivos a usarse durante los procesos de extracción y purificación de ácidos nucleicos y
proteínas deben tener grado "biología molecular" para asegurar el éxito del procedimiento. El uso
combinado de reactivos de diferente grado de pureza puede llevar a un fracaso del experimento.
El revelado de geles
La luz ultravioleta (UV) empleada para la visualización de ADN a 385 nm de longitud de onda con
8W de potencia ocasiona graves daños oculares y epiteliales, por lo tanto, el investigador deberá
contar con una lámina de policarbonato transparente ubicada entre la lámpara y el punto de
observación. Además, deberá usar lentes de protección contra rayos UV del mismo material.
Corriente eléctrica
El voltaje utilizado para la electroforesis puede generar quemaduras por descarga eléctrica.
Aunque la mayoría de cámaras de electroforesis han sido diseñadas para evitar el contacto
directo con la electricidad, el operador deberá asegurarse de mantener la fuente poder apogada o
desconectada al momento de manipular el equipo.
El proceso de ebullición de las proteínas en baño maría a 100ºC deberá realizarse con extremo
cuidado para evitar quemaduras. En este sentido, se recomienda utilizar envases de vidrio
resistentes a altas temperaturas (por ejemplo: Pyrex) y gradillas flotantes de polipropileno para
colocar los viales.
Uso de guantes
Se deberá usar guantes de látex mientras se encuentre trabajando con ADN y proteínas. Este
paso ayudará a evitar la degradación de las biomoléculas por acción de las nucleasas o
proteasas presentes en la superficie de las manos. Asimismo, el uso de guantes evitará que el
laboratorista se exponga ante algún posible riesgo de intoxicación por material infeccioso.
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Material biológico
El material biológico debe ser conservado a bajas temperaturas. El ADN genómico y los
productos de amplificación pueden ser almacenados a 4°C, mientras que el ADN plasmídico a -
20°C. Las proteínas deben ser conservadas a -80°C o en su defecto a -20°C. Todas las muestras
biológicas deben ser repartidas en alícuotas y en volúmenes pequeños para evitar etapas de
descongelamiento o congelamiento drásticos que ocasionarían un eventual deterioro de las
moléculas.
Micropipetas
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1. Todos los estudiantes deberán usar bata blanca del laboratorio, guantes, gafas de seguridad y
mascarilla (cuando aplique).
2. Está prohibido fumar, comer, beber o introducir alimentos al laboratorio aún fuera de la hora
de práctica.
4. Colocar los objetos personales en el lugar que te indique tu profesor, esto es para evitar que el
acumulo de cosas en el área de trabajo
7. Por cada práctica que se realice los alumnos tendrán que entregar un reporte por equipo de la
misma, que entregarán cada 8 días.
8. Cada material que se rompa o extravíe, deberá ser repuesto con material nuevo (amparado
con la nota de compra).
9. Todos y cada uno de los alumnos deberán llevar la práctica impresa a la sesión de laboratorio
10. Antes de iniciar la práctica se realizará un examen pre-laboratorio que será calificado en la
misma sesión.
11. Cada equipo deberá responsabilizarse por la limpieza inmediata del material y área de trabajo,
no podrá retirarse ningún miembro del equipo hasta que la zona de trabajo esté
completamente limpia y ordenada
12. Al destapar cualquier frasco de sustancias, tapar de inmediato después de utilizarlo y evitar
cambiar los tapones.
14. Queda estrictamente prohibido sacar cualquier instrumento o equipo del laboratorio.
15. Al final de la práctica entregar todo el material o equipo al maestro, entregar las notas y
practica impresa para firma y calificación y colocar los bancos en su lugar y lavarse las manos
con agua y jabón.
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CRITERIOS DE EVALUACIÓN
Código de conducta
Asistencia a todas las prácticas con uso de bata blanca, y elementos de seguridad
descritos en el apartado correspondiente. Los alumnos que no cumplan con alguna de
estas reglas no podrán realizar la práctica.
Las inasistencias se justifican solamente con la carta expedida por los Directivos de su
Facultad.
CONCLUSIÓN: Concluye con un comentario o idea final que resuma los aspectos más
importantes tanto del tema que se trabajo como de los resultados de la actividad que se
realizó en la práctica, explica con excelente redacción porque se alcanzaron o no los
propósitos de la misma y propone soluciones o alternativas cuando los propósitos no se
alcanzaron
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PROPÓSITO DEL LABORATORIO
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Práctica 1: Principios básicos de laboratorio, uso de micropipetas y cálculos de utilidad en
Bioquímica.
Introducción
Dos o más unidades básicas pueden ser combinadas mediante multiplicación o división para
generar unidades SI derivadas. Algunas de estas unidades poseen nombres particulares en honor
a científicos que contribuyeron al conocimiento de un tema en particular. En el Cuadro 2 se
presentan algunos ejemplos de unidades SI derivadas.
Muchas veces las unidades básicas o derivadas pueden ser muy grandes o muy pequeñas para
representar una cantidad en particular. Para esos casos, el SI admite el uso de una serie de
prefijos que permiten formar múltiplos o submúltiplos decimales de las unidades del SI. Estos
prefijos se muestran en el Cuadro 3.
10
Los prefijos se anteponen directamente al nombre o símbolo de la unidad en cuestión, por
ejemplo nanogramo o ng y no nano-gramo o n-g. Si bien es cierto, el uso del SI es la regla hoy en
día, existen excepciones que la Oficina Internacional de Pesas y Medidas debió adoptar debido a
su uso generalizado. Algunas de estas excepciones de uso en ciencias médicas se muestran en
el Cuadro 4.
Debido a su uso rutinario en la bioquímica experimental, vale la pena mencionar algunas normas
sobre la expresión de concentraciones de sustancias. La concentración de sustancias cuya masa
molecular se conoce, se expresa como cantidad de sustancia (moles o submúltiplos como mmol,
nmol) por litro (l).
Ejemplo: concentración de glucosa en suero humano: 3.6 mmol/l a 6.1 mmol/l. Los términos
concentración molar, molaridad o M, normalidad o N son obsoletos y en su lugar debe usarse el
término “cantidad de sustancia concentración de X” o más comúnmente, “concentración de X”. El
término molal y su símbolo m no deben ser más utilizados y en su lugar se utiliza el término
“cantidad molalidad del soluto X” con las unidades SI mol/kg.
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A continuación se enumeran algunas reglas para la consignación de símbolos y cifras del SI:
Las micropipetas son dispositivos que permiten medir volúmenes pequeños que van desde 1 μl
hasta 1 ml o más. Al igual que las pipetas éstas pueden ser para contener o para verter
volúmenes. Durante el curso utilizaremos micropipetas para verter, ya sea un volumen fijo o un
volumen variable. En las de volumen variable, se puede seleccionar un volumen dentro de un
rango de valores determinado.
La micropipeta más comúnmente usada en los laboratorios de análisis fue introducida por la
compañía Eppendorf y este nombre se adoptó de forma genérica para estos dispositivos, aunque
hoy en día existen una gran cantidad de compañías y modelos similares que funcionan bajo un
mismo principio de pistones para operar.
Por lo tanto, es aconsejable consultar las instrucciones del fabricante sobre el empleo correcto de
cada modelo. Sin embargo, todas ellas utilizan puntas o “tips” descartables plásticos que se
ajustan al extremo de la micropipeta. En estas puntas de plástico es donde se deposita el líquido
a medir.
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Para absorber el líquido, el pistón es presionado hasta una primera posición, el tip es puesto en
contacto con el líquido y luego, lentamente, se permite que el pistón vuelva a su posición original.
Este paso permite el llenado del tip con el volumen correspondiente. El tip de plástico
generalmente no se seca por fuera ya que se considera que su superficie no absorbe líquido. A
continuación se describen las instrucciones específicas para los modelos de micropipetas que se
utilizarán durante el curso.
2. Ajustar el volumen de la pipeta con el tornillo del botón pulsador (Figura 3, A2) o la rueda
de graduación del volumen (Figura 3, B), hasta llegar a 1/3 por encima del valor deseado.
Luego, lentamente, girando el tornillo o la rueda, disminuir el ajuste hasta el valor deseado
prestando atención para no excederlo. Si se excede, es aconsejable repetir el
procedimiento de ajuste. Siempre se debe ajustar el volumen deseado desde un
volumen más alto disminuyendo las indicaciones del indicador.
3. Seleccionar la punta o tip plástico apropiado para la micropipeta: la punta debe ajustarse al
cono de la micropipeta. Al insertar la punta en el cuerpo de la pipeta hay que aplicar una
fuerte presión con movimiento giratorio para asegurar la hermeticidad. Nunca usar la pipeta
con líquidos sin la punta colocada. Es posible que la punta plástica se encuentre en una
caja también plástica que facilita su uso. Si la punta no queda bien ajustada o no está en
caja, deberá ajustarse con la mano sin tocar la superficie que estará en contacto con la
solución a extraer.
6. Lentamente se aspira el líquido al relajar la presión del dedo sobre el botón pulsador. Si
este paso no se realiza con atención, puede entrar aire en la punta y la cantidad de
muestra aspirada no es la adecuada.
8. Dosificación: colocar la parte inferior de la punta contra la pared interior del recipiente
donde se depositará el líquido, con un ángulo entre 10° y 40°.
10. Apretar el botón pulsador hasta el segundo tope para vaciar el resto del líquido.
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11. Manteniendo apretado el botón pulsador en el segundo tope, retirar la pipeta deslizando la
punta por la pared del recipiente. Soltar luego el botón pulsador.
Una dilución consiste en preparar una solución menos concentrada a partir de una más
concentrada. Esta práctica es muy común en los laboratorios y de ella depende en gran parte el
resultado final analítico que se obtenga. Por lo tanto es imperativo el manejo de este tipo de
cálculos para cualquier persona que trabaje dentro de un laboratorio. Las diluciones generalmente
se expresan como una razón matemática, por ejemplo 1:5 (o 1/5), 1:10 (o 1/10), etc. En el caso
de una dilución 1:5, ésta expresa la cantidad, sea volumen o peso de una sustancia en un
volumen total o final de la forma 1 volumen (o peso) en un volumen (o peso) total de 5 volúmenes.
Nótese que el volumen total o final estará compuesto de 1 volumen de la sustancia a diluir y 4
volúmenes del disolvente. Para calcular la concentración final de una solución diluida, se
multiplica la concentración de la solución original por la dilución expresada como fracción.
V1C1=V2C2
Donde V1 es el volumen de la solución concentrada que se debe añadir para preparar la solución
diluida,
C1 es la concentración de la solución concentrada
V2 es el volumen de la solución diluida
C2 es la concentración de la solución diluida.
Al utilizar esta ecuación debe tomarse en cuenta que tanto las unidades de V 1 y V2 así como las
de C1 y C2 deben ser las mismas, preferiblemente ml y mol/l respectivamente. Ejemplo: prepare
500 ml de una solución de glucosa 5 mol/l a partir de una solución de glucosa a 45 mol/l.
Aplicando la ecuación antes presentada tenemos:
Entonces, para preparar 500 ml de una solución de glucosa 5 mol/l, se requieren 55.56 ml de
glucosa 45 mol/l y llevar a 500 ml con agua. Nótese que la solución original fue diluida 1/9 o en
otras palabras, se utilizó un factor de dilución de 9:
45(1/x)= 5
x= 9
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El factor de dilución representa el número de veces que fue diluida la solución concentrada. Si se
hace no una sino una serie de diluciones, la concentración de la solución final se obtiene al
multiplicar la concentración original por el producto de los factores de dilución. Ejemplo: si la
solución de glucosa a 45 mol/l del ejemplo anterior es primero diluida 1/9 y luego 1/100, la
concentración final de la solución será 45(1/9)(1/100)= 0.05 mol/l, con un factor de dilución de
900.
Las diluciones seriadas son también muy útiles. Estas diluciones son aquellas en las cuales todas
las diluciones hechas a partir de la primera o luego de la primera poseen el mismo factor de
dilución. Ejemplo: para determinar la concentración de proteínas en un suero animal, la muestra
es diluida 1:5 o 1/5 mediante la adición de 0.02 ml de suero a 0.08 ml de solución salina en el
tubo número 1. Los tubos 2 al 8 contienen 0.5 ml de solución salina como diluyente. La dilución
seriada se realiza al transferir 0.5 ml del tubo 1 al tubo 2, mezclar y transferir 0.5 ml del tubo 2 al
tubo 3 y así sucesivamente hasta el tubo 8. La concentración de suero en los tubos 2 al 8 decrece
por un factor de 2, siendo cada dilución: tubo 1: 1/5, tubo 2: 1/10, tubo 3: 1/20, tubo 4: 1/40, tubo
5: 1/80, tubo 6: 1/160, tubo 7: 1/360 y tubo 8: 1/640.
Propósito
1. Que el estudiante se familiarice con la metodología, equipo y forma de trabajo dentro del
laboratorio de Bioquímica.
Procedimiento
1. Colocar 24 horas antes 25 tubos eppendorf por persona a peso constante (en estufa a
100° C durante las 24 hpras).
3. Registrar el peso de cada tubo vacío a peso constante con una sensibilidad de hasta
tres decimales
15
4. Pipetear con la técnica descrita en el apartado de teoría el volumen indicado en la tabla
(5 replicas por volumen)
Cuestionario
5. Calcula el volumen necesario para preparar las siguientes soluciones a partir de las
propuestas
ALUMNO
DOCENTE
REFERENCIAS
Introducción
El agua, el líquido más común de la superficie terrestre, el componente principal en peso de
todos los seres vivos, tiene un número de propiedades destacables. Estas propiedades son
consecuencia de su estructura molecular y son responsables de la "aptitud" del agua para
desempeñar su papel en los sistemas vivos.
La estructura de la molécula de agua está dada por dos átomos de hidrógeno y un átomo de
oxígeno que se mantienen unidos por enlaces covalentes, la geometría molecular corresponde a
un tetraedro deformado originando un efecto dipolar (2 polos) en la molécula (Figura 1 a).
Como una consecuencia del fenómeno anteriormente explicado, forma enlaces -llamados
puentes de hidrógeno- con otras moléculas. Aunque los enlaces individuales son débiles -se
rompen y se vuelven a formar continuamente- la fuerza total de los enlaces que mantienen a las
moléculas juntas es muy grande. Los puentes de hidrógeno determinan muchas de las
extraordinarias propiedades del agua.
Entre ellas están su gran cohesión, su alta tensión superficial y su alto calor específico, de
vaporización y de fusión. Los fenómenos de capilaridad e imbibición están también
relacionados con la presencia de puentes de hidrógeno (Figura 1 b).
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La polaridad de la molécula de agua es, además, responsable de su adhesión a otras sustancias
polares, de ahí, su tendencia al movimiento capilar. También debido a su polaridad el agua es un
buen solvente para iones y moléculas polares. Las moléculas que se disuelven fácilmente en
agua se conocen como hidrofílicas. Las moléculas de agua, a raíz de su polaridad, excluyen
activamente de la solución a las moléculas no polares. Las moléculas excluidas de la solución
acuosa se conocen como hidrofóbicas.
El agua tiene una ligera tendencia a ionizarse, o sea, a separarse en iones H+ (en realidad iones
hidronio H3O+) y en iones OH-. En el agua pura, el número de iones H+ y el número de iones
OH- es igual a 10-7 mol por litro (M). Una solución que contiene más iones H+ que iones OH-
es ácida; una solución que contiene más iones OH- que iones H+ es básica o alcalina. La escala
de pH refleja la proporción de iones H+ a iones OH- (Figura 2).
Figura 2. Fenómeno de ionización del agua. En el agua pura [H3O+] = [OH-] =10-7 M
Una solución ácida tiene un pH inferior a 7; una solución básica tiene un pH superior a 7. Casi
todas las reacciones químicas de los sistemas vivos tienen lugar en un estrecho intervalo de pH
alrededor de la neutralidad. Los organismos mantienen este estrecho intervalo de pH por
medio de buffers, que son combinaciones de formas de ácidos débiles o bases débiles; dadores y
aceptores de H+.
Propósitos
1. Analizar la importancia que el agua tiene para los seres vivos y explicar los
fundamentos fisicoquímicos que le confieren tal importancia.
Agua destilada
Agua de llave
Aceite de cocina
Hexano
Solución 0.01 M de NaCl
Solución de 0.1 M de NaCl
Solución 0.5 M de NaCl
Solución 1 M de NaCl
Solución 0.01 M de Sacarosa
Solución 0.1 M de Sacarosa
Solución 1 M de sacarosa
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Cuestionario
3. ¿Que tipos de enlace presentan las moléculas de esta práctica y como se relaciona el tipo
de enlace con las observaciones experimentales?
5. Con base a la ecuación del punto anterior calcula cual sería la conductividad de una
solución de NaCl 1.5 M
6. ¿Porque se dice que “lo polar disuelve a lo polar y lo no polar disuelve a lo no polar”?
Fundamenta tu respuesta
9. Si las membranas celulares están constituidas por substancias lipídicas, ¿Puede el agua
atravesar estas membranas? Fundamenta tu respuesta
ALUMNO
DOCENTE
Referencias
Notas al estudiante:
20
Practica 3: Identificación de carbohidratos
Introducción
Los carbohidratos son compuestos de carbono que contienen oxígeno e hidrógeno en relación 2
a 1 con una fórmula general (CH2O)n, aunque el término también se emplea para
compuestos derivados de los carbohidratos que no cumplen esta definición estrictamente.
21
Los monosacáridos pueden unirse entre sí por medio de enlaces glucosídicos que se forman
cuando el grupo hidroxi del carbono 1 reacciona con el OH de otra molécula con la eliminación de
agua. El enlace cetal se llama también enlace glucosídico (Figura 3).
Los polisacáridos también pueden estar formados por dos o más diferentes monosacáridos o
derivados de ellos, como la N-acetilglucosamina, el ácido glucurónico o el ácido N-
acetilmurámico que forman parte, respectivamente, del ácido hialurónico, en la heparina y en la
mureina (Figura 4). Muchos de estos heteropolisacáridos se encuentran asociados a
proteínas formando los proteoglicanos y las glicoproteínas.
Uno de los monosacáridos más abundantes en la naturaleza es la glucosa que se forma en las
plantas y algas a partir de agua y CO2 usando la energía de la luz del sol en el proceso llamado
fotosíntesis. Muchas plantas contienen grandes cantidades de carbohidratos como reservas de
energía, que después sirven de alimento a otros organismos como los animales. Después de su
ingestión, los carbohidratos de las plantas se hidrolizan para formar glucosa a partir de la cual se
forma glucógeno.
En los animales, los carbohidratos almacenados se convierten en glucosa que se transporta a las
células donde se oxida a CO2 y O2 en la respiración celular. La energía liberada es “capturada” y
utilizada para llevar a cabo las actividades metabólicas. En el caso del hombre, más del 60% de
sus requerimientos de energía se obtienen de la oxidación de los carbohidratos. De esta
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manera la energía luminosa del sol se hace accesible al reino animal, que no lleva a cabo el
proceso de fotosíntesis.
Se han desarrollado un gran número de pruebas químicas que se utilizan comúnmente para la
identificación cualitativa de diversos azúcares o grupos de ellos.
La reacción de Molisch es la prueba más general para carbohidratos. Los compuestos que se
deshidratan con ácido sulfúrico para formar furfural o hidroximetilfurfurtal, reaccionan con (α-
naftol) para dar un producto de condensación de color púrpura (Figura 5).
El grupo más numeroso de reacciones generales de los carbohidratos es el constituido por las
que detectan la presencia de materiales relativamente reductores, como son los
monosacáridos y muchos disacáridos.
La adición de una base diluída cataliza el tautomerismo ceto-enol, de forma que aldohexosas en
solución, como la glucosa, resultan en la formación de una mezcla de glucosa, fructosa y manosa:
23
Figura 5. Reaccion de Molisch
Entre las pruebas que identifican azúcares reductores, se encuentra la prueba de Benedict. Esta
prueba se lleva a cabo en condiciones levemente alcalinas y es una prueba muy sensible. La
formación de un precipitado de óxido de cobre es el criterio para que la prueba sea positiva. Esta
prueba no es específica para azúcares, pues los aldehídos en general pueden oxidarse en las
condiciones de la reacción.
24
La prueba de yodo se basa en que una solución de yodo-yoduro forma complejos coloridos con
los polisacáridos, de diferente color según su estructura química: azul para almidón, rojizo para
glucógeno. La correcta identificación de un azúcar desconocido, tanto en disolución como en una
muestra sólida es un problema que puede ser banal o muy complejo, dependiendo del tipo de
muestra, de su supuesta composición aproximada y de si es una muestra pura o compleja. En
este experimento, se identificarán muestras puras de modo que las dificultades se minimicen.
Propósitos
Procedimiento
Prueba de Molisch
Prueba de Benedict
Prueba de Barfoed
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2. En otro tubo de ensaye, se agrega 1 ml de agua. (este tubo será el blanco)
3. Agregar, a ambos tubos, 1 ml del reactivo de Barfoed y agitar perfectamente
4. Dejar en baño de agua hirviendo por unos minutos.
5. La reacción es positiva si aparece un precipitado rojo-amarillo.
Prueba de Bial
Prueba de Seliwanoff
Prueba de Yodo
Cuestionario
5. Investiga cual es la reacción de enolización que se lleva a cabo en los azúcares como la
glucosa.
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EXAMEN PRELAB DESEMPEÑO FIRMAS FECHA
ALUMNO
DOCENTE
Referencias
Notas al estudiante:
27
Practica 4: Identificación de aminoácidos; Cromatografía de capa delgada
Introducción
El estudio y caracterización de las distintas biomoléculas (azúcares, lípidos, proteínas, ácidos
nucleicos, etc.) requiere en numerosos casos su aislamiento y purificación a partir de mezclas
complejas como son los preparados de cualquier material biológico. Una de las técnicas
bioquímicas más clásicas y utilizadas para dicho fin es la cromatografía. La cromatografía incluye
una amplia gama de técnicas, que se pueden clasificar atendiendo al fundamento físico-químico
en el que se basa la separación (cromatografía de adsorción, de reparto, de cambio iónico, de
filtración molecular, hidrofóbica y de afinidad), o al material sobre el que se lleva a cabo
(cromatografía en papel, capa fina, en columna y de gases).
Todas las técnicas intentan explotar las diferencias físicas, químicas y biológicas de las distintas
biomoléculas para llevar a cabo su separación y aislamiento. Entre dichas propiedades podríamos
citar:
Todas estas propiedades y, por tanto, la separación de diferentes compuestos están influenciadas
por las condiciones del medio de separación, pH, temperatura, fuerza iónica e hidrofobicidad.
De forma general, en las técnicas cromatográficas existe una distribución de las moléculas entre
dos fases, la fase estacionaria o parte del sistema separador que permanece fija en el espacio, y
la fase móvil que circula sobre la fase estacionaria en íntimo contacto con ésta.
Cromatografía de reparto
Para soluciones muy diluidas, deberá aplicarse un volumen suficiente (de hasta varios ml) para
asegurar una cantidad detectable de soluto o solutos de interés. En este caso conviene hacer la
aplicación en pequeños volúmenes fraccionarios, no procediéndose a una nueva adición hasta
haberse secado totalmente la precedente (de lo contrario la superficie de aplicación se haría muy
grande, distando mucho de la situación ideal de concentración de la muestra en un solo punto de
aplicación).
Una vez aplicada y seca la muestra, la placa se introduce en un recipiente cerrado (tanque
cromatográfico) y uno de los extremos (el más próximo a la línea de aplicación) se sumerge en un
disolvente apropiado (fase móvil), cuyo nivel en el fondo del tanque debe quedar por debajo de la
29
línea de aplicación. El solvente se desplaza a través del soporte por capilaridad provocando un
reparto de los solutos entre él y la fase estacionaria de acuerdo con sus solubilidades relativas
(coeficientes de reparto). Una vez que el solvente haya alcanzado un punto próximo al otro
extremo de la placa, ésta se saca del tanque y se seca. Las manchas correspondientes a cada
compuesto, si no son visibles, se pueden revelar mediante técnicas analíticas concretas. Se
determina la posición de cada mancha relativa al frente alcanzado por el solvente, calculándose el
correspondiente valor de Rf.
La detección de los compuestos una vez realizada la cromatografía se puede llevar a cabo en
base a sus propiedades espectroscópicas, fluorimétricas, haciéndolos reaccionar con reactivos
específicos, radioisotópicamente, etc. La identificación de tales compuestos se suele realizar
comparando sus Rf con los de compuestos de referencia (patrones) de naturaleza química
conocida. Alternativamente, los diferentes compuestos, una vez localizada su posición por un
método no destructivo, pueden eluirse de la placa raspando las zonas correspondientes y
extrayendo el polvo obtenido con un solvente adecuado.
Uno de los factores más críticos en este tipo de cromatografías es la elección de la fase móvil,
que, básicamente, suele estar formada por una mezcla de un solvente orgánico con agua y
algunas sustancias adicionales tales cómo ácidos, bases, agentes acomplejantes, etc., cuya
finalidad es aumentar o disminuir la solubilidad de algunos compuestos. Además de en una sola
dirección, la CCD puede también realizarse bidimensionalmente. En este caso sólo se aplica una
única muestra, que se dispone en uno de los vértices de la placa y se eluye dos veces,
normalmente con solventes diferentes, y en direcciones perpendiculares.
La mayor resolución obtenida por CCD se debe a que pueden formarse partículas muy finas
del soporte, por lo que la relación superficie/volumen es muy elevada, proporcionando una gran
área superficial por unidad de longitud. Esto se traduce en que la cantidad de muestra que se
puede aplicar es mayor y la difusión es mucho menor. La ventaja respecto a la cromatografía en
papel es que éste tiene una estructura fibrosa y la capilaridad asociada a las fibras tiende a
aumentar la difusión de las moléculas.
Hay una amplia gama de métodos colorimétricos que permiten la determinación cuali- y
cuantitativa de aminoácidos. Aunque son métodos muy generales, algunos de ellos permiten
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discriminar entre diferentes tipos de estos compuestos. Así, hay métodos de determinación de
aminoácidos con el grupo amino libre (método de la ninhidrina), de aminoácidos con núcleos
aromáticos (reacción xantoproteica), de los que poseen un grupo indólico (triptófano; reacción con
el ácido glioxílico), un anillo fenólico (tirosina; reacción de Millon), de aminoácidos azufrados
(cisteina; reacción con nitroprusiato sódico). En todos los métodos, el aminoácido reacciona con
otro compuesto formando derivados coloreados que se pueden determinar cuantitativamente por
espectroscopía visible.
De todos los métodos reseñados, el más general y utilizado es el de la reacción con la ninhidrina.
La ninhidrina (hidrato de tricetohidrindeno) reacciona con aminoácidos que tengan el grupo amino
libre, dando lugar a la formación de amoniaco y anhídrido carbónico, con reducción del reactivo
(ninhidrina) a hidrindantina (Figura 1).
La hidrindantina reacciona a su vez con el amoniaco y otra molécula de ninhidrina para dar un
compuesto de adición doble que presenta una coloración azul-púrpura, con la excepción de la
prolina que da una coloración amarillenta (recordar que en la prolina el grupo amino está
sustituido). El derivado coloreado presenta máximo de absorción en torno a 570 nm.
31
Probetas (100 y 250 ml). Etanol.
Vasos de precipitado (100 y 500 ml). Hidróxido amónico.
Frasco lavador con agua destilada (piseta) Silica gel en polvo
Recipientes de muestras biológicas de 50 ml. Ninhidrina
Papel de filtro.
Capilares para aplicar muestras.
Papel de parafilm..
Pipetas Pasteur de plástico.
Guantes de látex.
Frascos pulverizadores.
Tijeras.
Secadora de pelo.
Caja de portaobjetos (usados)
Agitador de tubos (vórtex)
Cámara cromatográfica
Frasco atomizador
Propósitos
1. Separar diferentes aminoácidos por cromatografía en capa fina sobre gel de sílice.
2. Revelar las corridas de aminoácidos mediante la reacción coloreada con la ninhidrina.
3. Calcular el valor de Rf para cada uno de los aminoácidos.
4. Justificar las diferencias en Rf de los distintos aminoácidos.
5. Identificar la naturaleza de aminoácidos desconocidos.
Procedimiento
Paso primero
Sobre una placa de silicagel de 20 x 20 cm se traza con un lápiz una recta paralela a uno de los
bordes y a una distancia de éste de 2 cm. Sobre esta línea se pone 6 puntos equidistantes entre
si y sobre los bordes.
ADVERTENCIAS: No hay que tocar la parte del silica gel de la placa con las manos, ya que la
contaminaríamos con aminoácidos procedentes de nuestras manos. No utilizar nunca bolígrafo ni
rotulador. No horadar la placa cuando la marques.
Paso segundo
En cada punto (identificados con el nombre de cada uno de los aminoácidos) se aplicarán tres
gotas de la solución de aminoácidos y solución problema (un aminoácido en cada punto y en el
último la solución problema). Se utiliza un capilar para aplicar la muestra gota a gota (hacerlo con
mucho cuidado). Se seca con un secador de pelo después de haber aplicado cada gota. Se
marca con lápiz, y en el extremo opuesto de la placa, algún indicativo del grupo que realiza la
cromatografía.
Paso tercero
Se añade a la cámara cromatográfica eluyente hasta una altura aproximada de 1 cm y sin que
éste alcance la zona de aplicación de las muestras. Se mete la placa en el tanque, se tapa y se
deja desarrollar la cromatografía hasta que el eluyente alcance el borde superior, sin llegar a
sobrepasarlo (2-3 h aproximadamente).
32
ADVERTENCIA: Se opera en la campana extractora de gases, ya que el eluyente es tóxico.
Paso cuarto
Cuestionario
2. Explica la importancia que tiene la polaridad del eluyente con respecto a los compuestos
que se desean separar
ALUMNO
DOCENTE
Referencias
Notas al estudiante:
ANEXO 1: SOLUCIONES
33
1. Soluciones de los distintos aminoácidos (glutamato, glicina, lisina, prolina y
leucina) al 1%
Solución de aminoácido al 1 %
100 ml
Aminoácido 1g
n-Propanol 10 ml
Agua destilada Hasta 100 ml
2. Solución eluyente
Solución de eluyente
200 mL
Etanol 210 mL
Solución de hidróxido amónico 90 mL
Solución de ninhidrina
100 ml
Ninhidrina 0,2 g
Agua destilada Hasta 100 ml
34
Practica 5: Cuantificación de Proteínas I: Elaboración de curva patrón
Introducción
La luz es una forma energética que presenta un comportamiento tanto de partícula como de
onda. En éste último comportamiento, puede ser clasificada de acuerdo a su longitud de onda
dentro del espectro electromagnético (Fig. 1).
La luz con una longitud de onda corta, entre 200 nm y 400 nm se conoce como ultravioleta,
mientras que aquella que posee una longitud de onda más larga, entre 700 nm y 900 nm se
conoce como luz infrarroja cercana.
La luz con longitudes de onda de entre los 400 nm a los 700 nm contempla el rango de luz de
diferentes colores visible al ojo humano. ¿Qué ocurre cuando una radiación electromagnética
atraviesa la materia? Si la radiación tiene energía adecuada con la estructura de la materia,
ésta última podrá absorberla.
La medición de la cantidad de luz absorbida puede ser usada para detectar, identificar
moléculas y medir su concentración en solución. Esta medición se basa en la Ley de Lambert-
Beer o simplemente Ley de Beer.
35
Fig 2. Transmisión de energía radiante a través de una celda de vidrio, donde Io representa la intensidad de la luz incidente e l1 representa la
intensidad de luz transmitida
Conforme la concentración del compuesto en solución aumenta, más luz será absorbida por el
mismo y por lo tanto menos luz será transmitida. El porcentaje de transmitancia (%T) varía de
forma inversa y logarítmica con respecto a la concentración (Fig. 3B). A esta relación se le
llama absorbancia o A. La relación entre absorbancia (A) y Transmitancia (T) es la siguiente:
( )
( )
Para convertir T en %T, tanto el denominador como el numerador deben ser multiplicados por
36
100:
( )
( ) ( )
( ) Ec. (1)
Fig. 3. A) Representación gráfica de la relación que existe entre la absorbancia (A) y la concentración de un analito, según lo establece la ley
de Lambert-Beer. B) Representación grafica de la relación que existe entre la concentración de un analito y el porcentaje de transmitancia
(%T).
El siguiente paso es corroborar bajo qué condiciones se cumple la ley de Beer, es decir
cuál es la longitud de onda apropiada para realizar las mediciones y qué concentraciones son
las adecuadas.
Una vez que se ha realizado este paso se puede entonces determinar la concentración de una
solución midiendo su absorbancia y despejando dicho valor en la ecuación de la recta.
37
La ley de Beer es una relación matemática ideal que contiene ciertas limitaciones. Desviaciones
de la misma, es decir circunstancias en las cuales la relación entre la absorbancia y la
concentración de una muestra no es lineal pueden ocurrir cuando:
Cada uno de los puntos mencionados anteriormente puede evitarse haciendo un uso correcto del
espectrofotómetro como se enseñará en la práctica de laboratorio de hoy, además de una buena
aplicación de la teoría de la ley de Beer en la práctica.
En el caso del punto uno, la mejor forma de evitar esta situación es diluyendo la muestra a
cuantificar. En el caso del punto dos, es necesario tener una buena fuente de energía radiante.
La mayoría de los instrumentos de buena calidad la poseen hoy en día.
Para el punto tres, es necesario corroborar que la cantidad de luz absorbida por el solvente no es
significativa. Para ello, se debe utilizar cada vez que se hace una determinación
espectrofotométrica el blanco reactivo.
El blanco reactivo es una muestra más que contiene todos los componentes utilizados para la
determinación (por ejemplo agua, reactivo, etc) excepto el compuesto a medir (ver sección de
procedimiento). La cantidad de luz transmitida por este blanco no debe ser detectada por el
aparato. Para ello, el espectrofotómetro se ajusta manualmente de forma tal que esta
cantidad de luz no sea medida.
Este procedimiento se conoce comúnmente como “calibración del cero”, es decir, la cantidad de
absorbancia del blanco es reconocida o cuantificada como cero por el aparato. En el caso del
punto cuatro, es necesario asegurarse de que no existan otras fuentes de luz cercanas cuando
se hace la medición.
Para evitar la situación expuesta en el punto cinco, se deben utilizar celdas certificadas, las
cuales son hoy en día fáciles de conseguir a un precio razonable. Por último, para evitar el
aspecto mencionado en el punto seis, es necesario asegurarse de que el compuesto a medir se
encuentre en solución de forma pura o en presencia de otros compuestos que no absorben a la
misma longitud de onda.
Las proteínas son una clase importante e insustituible de macromoléculas celulares presentes en
todos los organismos vivos. En consecuencia, la importancia para medir sus
concentraciones es vital para la biotecnología.
Son las macromoléculas más versátiles de los sistemas vivos y desempeñan funciones cruciales
en prácticamente todos los procesos biológicos. Funcionan como catalizadores, que
transportan y almacenan otras moléculas como el oxígeno, proporcionan apoyo mecánico y
38
protección inmunológica, generan el movimiento, transmiten impulsos nerviosos, y controlan el
crecimiento y diferenciación celular.
Varias propiedades clave de las proteínas les permiten participar en esta tan amplia gama de
funciones:
2. Las proteínas contienen una amplia gama de grupos funcionales. Estos grupos
funcionales incluyen alcoholes, tioles, tioéteres, ácidos carboxílicos, carboxamidas, y
una variedad de grupos de base. Cuando se combinan en varias secuencias, este
conjunto de grupos funcionales determina el amplio espectro de la función de la
proteína. Por ejemplo, la reactividad química asociada con estos grupos es esencial
para el funcionamiento de las enzimas (las proteínas que catalizan reacciones
químicas).
3. Las proteínas pueden interactuar entre sí y con otras macromoléculas biológicas para
formar conjuntos complejos. Estos complejos son las máquinas macro-moleculares
que llevan a cabo la réplica exacta de DNA, la transmisión de señales dentro de las
células, y muchos otros procesos esenciales.
4. Algunas proteínas son muy rígidas, mientras que otras muestran una flexibilidad
limitada, pueden funcionar como elementos estructurales en el citoesqueleto (el
andamiaje interno dentro de las células) o en el tejido conectivo. Las partes de las
proteínas con una flexibilidad limitada puede actuar como bisagras, resortes o
palancas que son cruciales para la función de la proteína.
Fig. 4. Complejo de coordinación tetravalente formado por las proteínas en presencia del reactivo de Biuret.
39
Materiales y equipo Reactivos
Propósitos
Procedimiento
Lectura en el espectrofotómetro
• Leer a 540 nm
Cuestionario
41
EXAMEN PRELAB DESEMPEÑO FIRMAS FECHA
ALUMNO
DOCENTE
Referencias
• Stryer L. Biochemistry. Protein Structure and function. Edit. W.H. Edit. Freeman and
Company, 5a Edición.
• Walker J.M. The Protein Protocols Handbook. The Lowry Method for Protein
Quantitation. Edit. Humana Press 2002.
Notas al estudiante:
42
Practica 6: Cuantificación de Proteínas II; Muestras problema
Introducción
Las proteínas son una clase importante e insustituible de macromoléculas celulares presentes en
todos los organismos vivos. En consecuencia, la importancia para medir sus
concentraciones es vital para la biotecnología.
Son las macromoléculas más versátiles de los sistemas vivos y desempeñan funciones cruciales
en prácticamente todos los procesos biológicos. Funcionan como catalizadores, que
transportan y almacenan otras moléculas como el oxígeno, proporcionan apoyo mecánico y
protección inmunológica, generan el movimiento, transmiten impulsos nerviosos, y controlan el
crecimiento y diferenciación celular.
Varias propiedades clave de las proteínas les permiten participar en esta tan amplia gama de
funciones:
2. Las proteínas contienen una amplia gama de grupos funcionales. Estos grupos
funcionales incluyen alcoholes, tioles, tioéteres, ácidos carboxílicos, carboxamidas, y
una variedad de grupos de base. Cuando se combinan en varias secuencias, este
conjunto de grupos funcionales determina el amplio espectro de la función de la
proteína. Por ejemplo, la reactividad química asociada con estos grupos es esencial
para el funcionamiento de las enzimas (las proteínas que catalizan reacciones
químicas).
3. Las proteínas pueden interactuar entre sí y con otras macromoléculas biológicas para
formar conjuntos complejos. Estos complejos son las máquinas macro-moleculares
que llevan a cabo la réplica exacta de DNA, la transmisión de señales dentro de las
células, y muchos otros procesos esenciales.
4. Algunas proteínas son muy rígidas, mientras que otras muestran una flexibilidad
limitada, éstas pueden funcionar como elementos estructurales en el citoesqueleto o en el
tejido conectivo. Las partes de las proteínas con una flexibilidad limitada pueden
actuar como bisagras, resortes o palancas que son cruciales para la función de la
proteína.
43
Fig. 1. Complejo de coordinación tetravalente formado por las proteínas en presencia del reactivo de Biuret.
Propósitos
Procedimiento
44
Solicitar al instructor realice la punción necesaria para la extracción de sangre total
de un voluntario en el equipo, las muestras se deben recolectar en los tubos con y
sin anticoagulante (rojo y morado).
El día de la práctica
• Lectura en el espectrofotómetro
45
En un tubo para cada muestra, tomar 2 ml de Rectivo de Biuret y mezclarlo con 1 ml de
muestra (plasma, suero o extracto celular) agitar con el vortex y esperar 5 min.
Leer la absorbancia de cada muestra y registrar.
Cuestionario
ALUMNO
DOCENTE
Referencias
• Stryer L. Biochemistry. Protein Structure and function. Edit. W.H. Edit. Freeman and
Company, 5a Edición.
• Walker J.M. The Protein Protocols Handbook. The Lowry Method for Protein
Quantitation. Edit. Humana Press 2002.
Notas al estudiante:
46
Practica 8: Cinética Enzimática
Introducción
La cinética enzimática estudia la velocidad de las reacciones catalizadas por enzimas. Estos
estudios proporcionan información directa acerca del mecanismo de la reacción catalítica y de la
especifidad de la enzima. La velocidad de una reacción catalizada por una enzima puede
medirse con relativa facilidad, ya que en muchos casos no es necesario purificar o aislar la
enzima. La medida se realiza siempre en las condiciones óptimas de pH, temperatura, presencia
de cofactores, etc, y se utilizan concentraciones saturantes de sustrato.
Los estudios sistemáticos del efecto de la concentración del sustrato sobre la actividad
enzimática comenzaron a realizarse a finales del siglo XIX. Ya en 1882 se introdujo el concepto
del complejo enzima-sustrato como intermediario del proceso de catálisis enzimática. En 1913,
Leonor Michaelis y Maud Menten desarrollaron esta teoría y propusieron una ecuación de
velocidad que rige la acción enzimática.
Propósitos
Procedimiento
3. Añadir una barra magnética, colocar el vaso en el agitador e introducir el electrodo del
conductímetro.
48
120
150
180
210
240
Para calcular V (Velocidad inicial de la reacción), representar C frente a t, trazar una tangente en el origen y calcular
su pendiente. Hacer esto para todas las concentraciones y anotar los valores en las casillas correspondientes
Cuestionario
1. ¿Cuáles son los factores que afectan la velocidad de catálisis (reacción) de una enzima?
ALUMNO
DOCENTE
Referencias
• Stryer L. Biochemistry. Protein Structure and function. Edit. W.H. Edit. Freeman and
Company, 5a Edición.
• Walker J.M. The Protein Protocols Handbook. The Lowry Method for Protein
Quantitation. Edit. Humana Press 2002.
Notas al estudiante:
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Nuestra Ciencia comparada con la realidad sigue siendo primitiva e infantil, y
sin embargo, es lo mejor que tenemos.
Albert Einstein
50