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Índice
1 Conceptos clave
1.1 Forma
1.2 Tamaño
2 Morfometría Clásica
3 Morfometría geométrica
3.1 Landmarks o marcas
3.1.1 Semi marcas o semilandmarks
3.2 Criterios para la selección de marcas
3.2.1 Homología
3.2.2 Consistencia en la posición relativa
3.2.3 Cobertura adecuada de la forma
3.2.4 Repetitividad
4 Transformaciones
4.1 TPS o gradilla de deformación
5 Superposición Procustes
6 Aplicaciones y Software
6.1 Otras aplicaciones
7 Bibliografía
8 Véase también
9 Referencias
Conceptos clave
El rápido progreso en la morfometría geométrica ha dado como resultado en gran
medida el tener una teoría matemática coherente de la forma, lo que requiere la
articulación de una definición precisa del concepto. Por lo tanto, es importante
entender el concepto subyacente de la forma en la morfometría geométrica, y
también, porque el concepto de tamaño está tan estrechamente relacionado con él
concepto de forma. No podemos comprender plenamente el uno sin la comprensión del
otro y también cómo se relacionan entre sí.
Forma
En la morfometría geométrica, la forma es definida como “toda la información
geométrica que permanece cuando la ubicación, escala y los efectos de rotación se
filtran de un objeto” (Kendall, 1977). En otras palabras la forma se define
técnicamente como todas las características geométricas de un objeto a excepción de
su tamaño, posición y orientación. Esta definición puede parecer abstracta y
complicada, pero en realidad se refiere exactamente al tipo de información que se
utiliza cuando se interpreta una imagen.
Tamaño
El tamaño centroide es la medida del tamaño que es matemáticamente independiente de
la forma. Empíricamente, el tamaño centroide puede correlacionarse con la forma
porque los organismos más grandes tienen configuraciones generalmente distintas a
comparación de los organismos pequeños. El hecho de medir forma y tamaño
separadamente no significa que se pierda alguna información sobre las relaciones
entre ellas. La definición de forma menciona a la escala como uno de los efectos a
removerse para extraer las diferencias en forma entre dos configuraciones. La
implicación de esto es que la escala proporciona una definición de tamaño, que es
independiente de la definición de la forma. Sin embargo uno de los puntos clave
para conocer el tamaño es necesario determinar la ubicación del centro de la forma,
es decir, “el centroide” o centro de gravedad. Luego se calcula la distancia
elevada al cuadrado de cada punto al centroide, esas distancias se suman, y se
obtiene la raíz cuadrada, la cantidad resultante es el tamaño centroide. Esta
variable de tamaño permite calcular el cambio isométrico de todos los puntos de
referencia a partir del centro de la forma.
Morfometría Clásica
La morfometría clásica produce imágenes o descripciones detalladas en donde las
analogías figuran prominentemente (formas parecidas a círculos, elipses,
triángulos, etc.). Los estudios morfométricos clásicos producen comúnmente tablas
de caracteres medidos en escalas continuas que reflejan aspectos de la forma del
organismo. Como resultado, la morfometría ha sido vista cercana a la estadística o
al álgebra más que a la morfología, y en cierto sentido esa percepción es correcta:
la morfometría es una rama del análisis matemático de la forma. Tradicionalmente
los datos morfométricos han incluido medidas de longitud, profundidad y amplitud.
Este tipo de datos contiene relativamente poca información acerca de la forma y
parte de esa información puede ser ambigua. Ese tipo de datos contiene menos
información de lo que parecen sostener porque muchas de las mediciones se
superponen o son redundantes. Varias de las mediciones parten desde un único punto
en un organismo, por lo que sus valores no pueden ser completamente independientes.
Esto significa que cualquier error en la localización de ese punto afecta a todas
estas mediciones, la sobre posición de las mediciones complica el describir
diferencias localizadas de la forma como los cambios en la posición relativa de un
carácter respecto a la posición de otro carácter (Atchley et al, 1976; Corruccini,
1977; Albrecht, 1978). Una limitación de la morfometría tradicional es que las
medidas no transmiten información sobre la estructura geométrica, sino que se trata
usualmente de segmentos lineales. Las mediciones lineales representan
mayoritariamente el tamaño más que la forma. Cada longitud es la magnitud de una
dimensión, una medida del tamaño y no necesariamente incluye información geométrica
de la forma.
Morfometría geométrica
La Morfometría geométrica es una herramienta que permite abstraer la forma de los
organismos mediante el uso de “marcas o puntos”, donde la información sobre el
tamaño, la posición y la orientación se ajustan para obtener la información de la
“forma” en un contexto matemáticamente analizable. El análisis morfométrico por
marcas fue concebido por Bookstein en 1991. Este análisis es el descendiente
intelectual de las gradillas de transformación de D’Arcy Thompson. Aplicar este
tipo de análisis involucra la identificación de marcas homólogas en los organismos
y desenmarañar estadísticamente el cambio en la forma considerando el cambio en el
tamaño.
Landmarks o marcas
Todos los landmarks deben estar representados en cada espécimen estudiado, y deben
representar la misma localidad anatómica en todos ellos. Por esta razón, la
selección de puntos de referencia es crucial en el estudio, y deben cumplir los
siguientes criterios:
Ejemplo de uso de semi marcas en una hoja de Arabidopsis thaliana. Las marcas son
los puntos 1 y 15, el resto son semi-marcas
Representar un organismo únicamente por una configuración de marcas de referencia o
“landmarks” deja de lado algunos aspectos de lo que normalmente puede significarnos
la forma, tales como la curvatura. Las curvaturas son características de un objeto
que permanecen después de filtrar la posición, la escala y los efectos de rotación,
pero no es necesariamente capturada de forma efectiva por las coordenadas de un
conjunto de marcas. Es por eso que bajo esta teoría se ha propuesto el uso de semi-
marcas.
El término semilandmarks fue utilizado por Bookstein (1997) para referirse a una
serie de puntos que se encuentran a lo largo de una curva. Un ejemplo común para el
uso de semilandmarks es para dar seguimiento al contorno curvo entre dos puntos de
referencia lo cual puede informar sobre la inclinación de la curva (es decir, la
amplitud de su desviación de una línea recta), información que no podríamos haber
deducido de las coordenadas de los puntos de referencia. Hay dos maneras para la
selección de semilandmarks en una curva: (A) incrementos de longitud de la curva;
se colocan segmentos lineales continuos de una marca de referencia a otra. (B)
incrementos de un ángulo subtendido por la curva; se colocan segmentos en distintos
ángulos que permitan la cobertura del contorno.
Repetitividad
Otro criterio para seleccionar las marcas es que estas se puedan encontrar
fidedignamente. Si estas son difíciles de localizar incluso en el mismo espécimen
medido varias veces, pueden inducir a mediciones erróneas.
Transformaciones
Las visualizaciones basadas en las rejillas de transformación de D’Arcy Thompson
han jugado un papel especial en la morfometría geométrica. El método fue
originalmente presentado como parte de un argumento a favor de la importancia de
las ideas matemáticas y físicas para el entendimiento de las formas de los animales
(Thompson, 1961; Arthur, 2006). Los diagramas atractivos de Thompson han capturado
la atención de muchos biólogos a través de la mayor parte del siglo XX, y los
esfuerzos para desarrollar un enfoque rigurosamente cuantitativo para la toma de
tales diagramas contribuyeron significativamente al desarrollo de la morfometría
geométrica (Sneath, 1967; Bookstein, 1978, 1989; Rohlf, 1993).
La idea es que los cambios en las formas biológicas pueden ser caracterizados
mediante la examinación de las transformaciones que tienen que ser aplicadas al
espacio de las coordenadas con el fin de cambiar una forma a otra. Para hacer esta
transformación directamente visible, se puede dibujar una gradilla rectangular
Thompson ajustó las líneas de la cuadrícula manualmente, pero ahora esto se puede
hacer computacionalmente, utilizando algún método de interpolación que garantiza
que la relación de las líneas de la gradilla a las posiciones las marcas sea
correcta. Los métodos disponibles se basan en diferentes consideraciones
matemáticos o estadísticos. El método que actualmente es ampliamente usado es el
Thin plate Spine (TPS) o gradilla de transformación. (Bookstein, 1989; Dryden y
Mardia, 1998).
Superposición Procustes
Aplicaciones y Software
Muchos de los estudios sobre la evolución de la forma se han enfocado en
identificar los factores que determina esta dirección. Hasta ahora algunas estudios
se han enfocado en correlaciones entre tamaño y forma (alometría), correlaciones
entre la forma y función (morfología funcional, eco-morfología), comparaciones de
las tendencias evolutivas (estudios de paralelismo y convergencia), y descripciones
cuantitativas del morfo-espacio ocupado (evolución de la diversidad morfológica).
Alometría
Morfología funcional
Heterocronía
Plasticidad fenotípica
Asimetría
Modularidad
Genética cuantitativa
http://life.bio.sunysb.edu/morph/
http://www3.canisius.edu/~sheets/
http://www.morphometrics.org/home/morphmet
http://morfometriageometrica.blogspot.mx/
http://www.flywings.org.uk/
http://www.chitwoodlab.org/
Otras aplicaciones
La aplicación de la morfometría no se limita a usos biológicos. También se puede
aplicar a un terreno en forma de geomorfología.1 También cuenta con una serie de
otras aplicaciones.
Bibliografía
Arthur W., 2006. D’Arcy Thompson and the theory of transformations. Nat. Rev.
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