Keanekaragaman tumbuhan bersumber dari adanya sumber variasi.

Sumber variasi
berasal dari evolusi tumbuhan dan klasifikasi. Variasi evolusi tumbuhan yang ada yaitu
variasi perkembangan, variasi yang disebabkan oleh lingkungan, dan variasi genetika yang
memiliki dua sumber yaitu dari mutasi yang terbagi atas mutasi gen dan mutasi kromosom
serta dari rekombinasi dan aliran gen.

Reproduksi pada tumbuhan merupakan penentu rekombinasi yang meliputi

perkawinan silang, perkawinan sendiri atau autogami, pembiakan vegetative untuk tunas-
tunas dan agamospermi atau perkembangbiakan biji tanpa fertilisasi.