Anda di halaman 1dari 8

BIOMEDICAL IMPORTANCE Water is the predominant chemical component of living organisms.

Its
unique physical properties, which include the ability to solvate a wide range of organic and inorganic
molecules, derive from water’s dipolar structure and exceptional capacity for forming hydrogen bonds.
The manner in which water interacts with a solvated biomolecule influences the structure of each. An
excellent nucleophile, water is a reactant or product in many metabolic reactions. Water has a slight
propensity to dissociate into hydroxide ions and protons. The acidity of aqueous solutions is generally
reported using the logarithmic pH scale. Bicarbonate and other buffers normally maintain the pH of
extracellular fluid between 7.35 and 7.45. Suspected disturbances of acidbase balance are verified by
measuring the pH of arterial blood and the CO2 content of venous blood. Causes of acidosis (blood pH <
7.35) include diabetic ketosis and lactic acidosis. Alkalosis (pH > 7.45) may, for example, follow vomiting
of acidic gastric contents. Regulation of water balance depends upon hypothalamic mechanisms that
control thirst, on antidiuretic hormone (ADH), on retention or excretion of water by the kidneys, and on
evaporative loss. Nephrogenic diabetes insipidus, which involves the inability to concentrate urine or
adjust to subtle changes in extracellular fluid osmolarity, results from the unresponsiveness of renal
tubular osmoreceptors to ADH.

PENTINGAN BIOMEDIK Air adalah komponen kimia yang dominan dari organisme hidup. Sifat fisiknya
yang unik, yang mencakup kemampuan untuk melarutkan berbagai molekul organik dan anorganik,
berasal dari struktur dipolar air dan kapasitas luar biasa untuk membentuk ikatan hidrogen. Cara air
berinteraksi dengan biomolekul terlarut mempengaruhi struktur masing-masing. Nukleofil yang sangat
baik, air adalah reaktan atau produk dalam banyak reaksi metabolisme. Air memiliki kecenderungan kecil
untuk berdisosiasi menjadi ion dan proton hidroksida. Keasaman larutan berair umumnya dilaporkan
menggunakan skala pH logaritmik. Bikarbonat dan buffer lain biasanya mempertahankan pH cairan
ekstraseluler antara 7,35 dan 7,45. Gangguan yang diduga dari keseimbangan asam-basa diverifikasi
dengan mengukur pH darah arteri dan kandungan CO2 dari darah vena. Penyebab asidosis (pH darah
<7,35) termasuk ketosis diabetikum dan asidosis laktat. Alkalosis (pH> 7,45) dapat, misalnya, mengikuti
muntah isi lambung yang asam. Regulasi keseimbangan air tergantung pada mekanisme hipotalamus
yang mengendalikan rasa haus, pada hormon antidiuretik (ADH), pada retensi atau ekskresi air oleh
ginjal, dan pada kehilangan penguapan. Diabetes insipidus nefrogenik, yang melibatkan
ketidakmampuan untuk berkonsentrasi urin atau menyesuaikan diri dengan perubahan halus dalam
osmolaritas cairan ekstraseluler, hasil dari respon osmoreseptor tubular ginjal yang tidak responsif
terhadap ADH.

WATER IS AN IDEAL BIOLOGIC SOLVENT Water Molecules Form Dipoles A water molecule is an irregular,
slightly skewed tetrahedron with oxygen at its center (Figure 2–1). The two hydrogens and the unshared
electrons of the remaining two sp3-hybridized orbitals occupy the corners of the tetrahedron. The 105-
degree angle between the hydrogens differs slightly from the ideal tetrahedral angle, 109.5 degrees.
Ammonia is also tetrahedral, with a 107degree angle between its hydrogens. Water is a dipole, a
molecule with electrical charge distributed asymmetrically about its structure. The strongly
electronegative

oxygen atom pulls electrons away from the hydrogen nuclei, leaving them with a partial positive charge,
while its two unshared electron pairs constitute a region of local negative charge. Water, a strong dipole,
has a high dielectric constant. As described quantitatively by Coulomb’s law, the strength of interaction F
between oppositely charged particles is inversely proportionate to the dielectric constant ε of the
surrounding medium. The dielectric constant for a vacuum is unity; for hexane it is 1.9; for ethanol it is
24.3; and for water it is 78.5. Water therefore greatly decreases the force of attraction between charged
and polar species relative to water-free environments with lower dielectric constants. Its strong dipole
and high dielectric constant enable water to dissolve large quantities of charged compounds such as
salts.

AIR ADALAH PELARUT BIOLOGIS IDEAL Molekul Air Bentuk Dipol Molekul air adalah tetrahedron yang
tidak beraturan, sedikit miring dengan oksigen di pusatnya (Gambar 2-1). Dua hidrogen dan elektron
yang tidak digunakan bersama dari dua orbital sp3-hibridisasi yang tersisa menempati sudut
tetrahedron. Sudut 105 derajat antara hidrogen sedikit berbeda dari sudut tetrahedral yang ideal, 109,5
derajat. Amonia juga tetrahedral, dengan sudut 107 derajat di antara hidrogennya. Air adalah dipol,
molekul dengan muatan listrik yang didistribusikan secara asimetris tentang strukturnya. Sangat
elektronegatif

atom oksigen menarik elektron menjauh dari inti hidrogen, meninggalkannya dengan muatan positif
parsial, sedangkan dua pasangan elektronnya yang tidak terbagi membentuk wilayah muatan negatif
lokal. Air, dipol yang kuat, memiliki konstanta dielektrik yang tinggi. Sebagaimana dijelaskan secara
kuantitatif oleh hukum Coulomb, kekuatan interaksi F antara partikel bermuatan berlawanan berbanding
terbalik dengan konstanta dielektrik ε dari media sekitarnya. Konstanta dielektrik untuk ruang hampa
adalah kesatuan; untuk hexane itu 1.9; untuk etanol 24,3; dan untuk air 78,5. Air karenanya sangat
mengurangi gaya tarik antara spesies bermuatan dan kutub relatif terhadap lingkungan bebas air dengan
konstanta dielektrik yang lebih rendah. Dipolnya yang kuat dan konstanta dielektriknya yang tinggi
memungkinkan air untuk melarutkan sejumlah besar senyawa bermuatan seperti garam.

Water Molecules Form Hydrogen Bonds An unshielded hydrogen nucleus covalently bound to an
electron-withdrawing oxygen or nitrogen atom can interact with an unshared electron pair on another
oxygen or nitrogen atom to form a hydrogen bond. Since water molecules contain both of these
features, hydrogen bonding favors the self-association of water molecules into ordered arrays (Figure 2–
2). Hydrogen bonding profoundly influences the physical properties of water and accounts for its
exceptionally high viscosity, surface tension, and boiling point. On average, each molecule in liquid water
associates through hydrogen bonds with 3.5 others. These bonds are both relatively weak and transient,
with a half-life of about one microsecond. Rupture of a hydrogen bond in liquid water requires only
about 4.5 kcal/mol, less than 5% of the energy required to rupture a covalent OH bond. Hydrogen
bonding enables water to dissolve many organic biomolecules that contain functional groups which can
participate in hydrogen bonding. The oxygen atoms of aldehydes, ketones, and amides provide pairs of
electrons that can serve as hydrogen acceptors. Alcohols and amines can serve both as hydrogen
acceptors and as donors of unshielded hydrogen atoms for formation of hydrogen bonds (Figure 2–3).

INTERACTION WITH WATER INFLUENCES THE STRUCTURE OF BIOMOLECULES Covalent & Noncovalent
Bonds Stabilize Biologic Molecules The covalent bond is the strongest force that holds molecules
together (Table 2–1). Noncovalent forces, while of lesser magnitude, make significant contributions to
the structure, stability, and functional competence of macromolecules in living cells. These forces, which
can be either attractive or repulsive, involve interactions both within the biomolecule and between it
and the water that forms the principal component of the surrounding environment.

Molekul Air Membentuk Ikatan Hidrogen Nukleus hidrogen tidak terikat yang terikat secara kovalen
dengan oksigen atau atom nitrogen yang dapat menarik elektron dapat berinteraksi dengan pasangan
elektron yang tidak terbagi pada oksigen atau atom nitrogen lain untuk membentuk ikatan hidrogen.
Karena molekul air mengandung kedua fitur ini, ikatan hidrogen mendukung pengikatan diri molekul air
ke dalam susunan yang teratur (Gambar 2–2). Ikatan hidrogen sangat mempengaruhi sifat fisik air dan
menyumbang viskositas yang sangat tinggi, tegangan permukaan, dan titik didih. Rata-rata, setiap
molekul dalam air cair berasosiasi melalui ikatan hidrogen dengan 3,5 molekul lainnya. Ikatan ini relatif
lemah dan sementara, dengan waktu paruh sekitar satu mikrodetik. Pecahnya ikatan hidrogen dalam air
cair hanya membutuhkan sekitar 4,5 kkal / mol, kurang dari 5% energi yang dibutuhkan untuk memutus
ikatan OH kovalen. Ikatan hidrogen memungkinkan air untuk melarutkan banyak biomolekul organik
yang mengandung gugus fungsional yang dapat berpartisipasi dalam ikatan hidrogen. Atom oksigen
aldehida, keton, dan amida menyediakan pasangan elektron yang dapat berfungsi sebagai akseptor
hidrogen. Alkohol dan amina dapat berfungsi baik sebagai akseptor hidrogen dan sebagai donor atom
hidrogen tidak terlindung untuk pembentukan ikatan hidrogen (Gambar 2–3).

INTERAKSI DENGAN AIR MEMPENGARUHI STRUKTUR BIOMOLEKUL. Ikatan Covalent & Noncovalent
Menstabilkan Molekul Biologis Ikatan kovalen adalah kekuatan terkuat yang menyatukan molekul (Tabel
2-1). Gaya nonkovalen, sementara besarnya lebih kecil, memberikan kontribusi signifikan terhadap
struktur, stabilitas, dan kompetensi fungsional makromolekul dalam sel hidup. Kekuatan-kekuatan ini,
yang dapat menarik atau menjijikkan, melibatkan interaksi baik di dalam biomolekul dan di antara itu
dan air yang membentuk komponen utama dari lingkungan sekitarnya.

Biomolecules Fold to Position Polar & Charged Groups on Their Surfaces Most biomolecules are
amphipathic; that is, they possess regions rich in charged or polar functional groups as well as regions
with hydrophobic character. Proteins tend to fold with the R-groups of amino acids with hydrophobic
side chains in the interior. Amino acids with charged or polar amino acid side chains (eg, arginine,
glutamate, serine) generally are present on the surface in contact with water. A similar pattern prevails in
a phospholipid bilayer, where the charged head groups of phosphatidyl serine or phosphatidyl
ethanolamine contact water while their hydrophobic fatty acyl side chains cluster together, excluding
water. This pattern maximizes the opportunities for the formation of energetically favorable charge-
dipole, dipole-dipole, and hydrogen bonding interactions between polar groups on the biomolecule and
water. It also minimizes energetically unfavorable contact between water and hydrophobic groups.

Hydrophobic Interactions Hydrophobic interaction refers to the tendency of nonpolar compounds to self-
associate in an aqueous environment. This self-association is driven neither by mutual attraction nor by
what are sometimes incorrectly referred to as “hydrophobic bonds.” Self-association arises from the
need to minimize energetically unfavorable interactions between nonpolar groups and water.

Biomolekul Dilipat ke Posisi Grup Polar & Dibebankan pada Permukaannya Kebanyakan biomolekul
adalah amphipathic; yaitu, mereka memiliki daerah yang kaya dengan gugus fungsi bermuatan atau polar
serta daerah dengan karakter hidrofobik. Protein cenderung melipat dengan gugus-gugus asam amino R
dengan rantai samping hidrofobik di bagian dalam. Asam amino dengan rantai samping asam amino yang
bermuatan atau polar (misalnya arginin, glutamat, serin) umumnya terdapat pada permukaan yang
bersentuhan dengan air. Pola yang sama berlaku dalam lapisan ganda fosfolipid, di mana kelompok
kepala bermuatan fosfatidil serin atau fosfatidil etanolamina kontak air sementara rantai samping asil
hidrofobik hidrofobik mereka berkumpul bersama, tidak termasuk air. Pola ini memaksimalkan peluang
untuk pembentukan interaksi muatan-dipol, dipol-dipol, dan ikatan hidrogen yang menguntungkan
antara kelompok polar pada biomolekul dan air. Ini juga meminimalkan kontak yang tidak
menguntungkan secara energi antara air dan kelompok hidrofobik.
Interaksi Hidrofobik Interaksi hidrofobik mengacu pada kecenderungan senyawa nonpolar untuk
berasosiasi dengan diri sendiri dalam lingkungan berair. Asosiasi-diri ini tidak didorong oleh ketertarikan
timbal balik atau oleh apa yang kadang-kadang salah disebut sebagai "ikatan hidrofobik." Asosiasi-diri
timbul dari kebutuhan untuk meminimalkan interaksi yang tidak menguntungkan secara energetik antara
kelompok nonpolar dan air.

While the hydrogens of nonpolar groups such as the methylene groups of hydrocarbons do not form
hydrogen bonds, they do affect the structure of the water that surrounds them. Water molecules
adjacent to a hydrophobic group are restricted in the number of orientations (degrees of freedom) that
permit them to participate in the maximum number of energetically favorable hydrogen bonds. Maximal
formation of multiple hydrogen bonds can be maintained only by increasing the order of the adjacent
water molecules, with a corresponding decrease in entropy. It follows from the second law of
thermodynamics that the optimal free energy of a hydrocarbon-water mixture is a function of both
maximal enthalpy (from hydrogen bonding) and minimum entropy (maximum degrees of freedom).
Thus, nonpolar molecules tend to form droplets with minimal exposed surface area, reducing the
number of water molecules affected. For the same reason, in the aqueous environment of the living cell
the hydrophobic portions of biopolymers tend to be buried inside the structure of the molecule, or
within a lipid bilayer, minimizing contact with water.

Electrostatic Interactions Interactions between charged groups shape biomolecular structure.


Electrostatic interactions between oppositely charged groups within or between biomolecules are
termed salt bridges. Salt bridges are comparable in strength to hydrogen bonds but act over larger
distances. They thus often facilitate the binding of charged molecules and ions to proteins and nucleic
acids.

Sementara hidrogen dari gugus nonpolar seperti gugus metilen hidrokarbon tidak membentuk ikatan
hidrogen, mereka memengaruhi struktur air yang mengelilinginya. Molekul air yang berdekatan dengan
gugus hidrofobik dibatasi dalam jumlah orientasi (derajat kebebasan) yang memungkinkan mereka untuk
berpartisipasi dalam jumlah maksimum ikatan hidrogen yang menguntungkan secara energetik.
Pembentukan maksimal ikatan hidrogen ganda dapat dipertahankan hanya dengan meningkatkan urutan
molekul air yang berdekatan, dengan penurunan yang sesuai dalam entropi. Ini mengikuti dari hukum
kedua termodinamika bahwa energi bebas optimal dari campuran air-hidrokarbon adalah fungsi dari
entalpi maksimal (dari ikatan hidrogen) dan entropi minimum (derajat kebebasan maksimum). Dengan
demikian, molekul nonpolar cenderung membentuk tetesan dengan luas permukaan minimal,
mengurangi jumlah molekul air yang terpengaruh. Untuk alasan yang sama, dalam lingkungan air sel
hidup, bagian hidrofobik biopolimer cenderung terkubur di dalam struktur molekul, atau di dalam lipid
bilayer, meminimalkan kontak dengan air.

Interaksi Elektrostatik Interaksi antara kelompok bermuatan membentuk struktur biomolekul. Interaksi
elektrostatik antara kelompok-kelompok yang bermuatan berlawanan di dalam atau di antara biomolekul
disebut jembatan garam. Jembatan garam memiliki kekuatan yang setara dengan ikatan hidrogen tetapi
bertindak pada jarak yang lebih jauh. Dengan demikian mereka sering memfasilitasi pengikatan molekul
dan ion bermuatan pada protein dan asam nukleat.

Van der Waals Forces Van der Waals forces arise from attractions between transient dipoles generated
by the rapid movement of electrons on all neutral atoms. Significantly weaker than hydrogen bonds but
potentially extremely numerous, van der Waals forces decrease as the sixth power of the distance
separating atoms. Thus, they act over very short distances, typically 2–4 Å.

Multiple Forces Stabilize Biomolecules The DNA double helix illustrates the contribution of multiple
forces to the structure of biomolecules. While each individual DNA strand is held together by covalent
bonds, the two strands of the helix are held together exclusively by noncovalent interactions. These
noncovalent interactions include hydrogen bonds between nucleotide bases (Watson-Crick base pairing)
and van der Waals interactions between the stacked purine and pyrimidine bases. The helix presents the
charged phosphate groups and polar ribose sugars of

the backbone to water while burying the relatively hydrophobic nucleotide bases inside. The extended
backbone maximizes the distance between negatively charged backbone phosphates, minimizing
unfavorable electrostatic interactions.

Pasukan Van der Waals Pasukan Van der Waals muncul dari tarikan antara dipol transien yang dihasilkan
oleh pergerakan elektron yang cepat pada semua atom netral. Secara signifikan lebih lemah dari ikatan
hidrogen tetapi berpotensi sangat banyak, gaya van der Waals berkurang sebagai kekuatan keenam jarak
atom yang memisahkan. Dengan demikian, mereka bertindak pada jarak yang sangat pendek, biasanya
2-4 Å.

Multiple Forces Menstabilkan Biomolekul DNA heliks ganda menggambarkan kontribusi berbagai
kekuatan pada struktur biomolekul. Sementara setiap untai DNA individu disatukan oleh ikatan kovalen,
dua untai heliks disatukan secara eksklusif oleh interaksi nonkovalen. Interaksi nonkovalen ini termasuk
ikatan hidrogen antara basa nukleotida (pasangan basa Watson-Crick) dan interaksi van der Waals antara
basa purin dan pirimidin yang ditumpuk. Heliks menyajikan gugus fosfat bermuatan dan gula ribosa polar

tulang punggung ke air sambil mengubur basa nukleotida yang relatif hidrofobik di dalamnya. Tulang
punggung diperpanjang memaksimalkan jarak antara fosfat tulang punggung bermuatan negatif,
meminimalkan interaksi elektrostatik yang tidak menguntungkan.

WATER IS AN EXCELLENT NUCLEOPHILE Metabolic reactions often involve the attack by lone pairs of
electrons on electron-rich molecules termed nucleophiles on electron-poor atoms called electrophiles.
Nucleophiles and electrophiles do not necessarily possess a formal negative or positive charge. Water,
whose two lone pairs of sp3 electrons bear a partial negative charge, is an excellent nucleophile. Other
nucleophiles of biologic importance include the oxygen atoms of phosphates, alcohols, and carboxylic
acids; the sulfur of thiols; the nitrogen of amines; and the imidazole ring of histidine. Common
electrophiles include the carbonyl carbons in amides, esters, aldehydes, and ketones and the phosphorus
atoms of phosphoesters. Nucleophilic attack by water generally results in the cleavage of the amide,
glycoside, or ester bonds that hold biopolymers together. This process is termed hydrolysis. Conversely,
when monomer units are joined together to form biopolymers such as proteins or glycogen, water is a
product, as shown below for the formation of a peptide bond between two amino acids.

While hydrolysis is a thermodynamically favored reaction, the amide and phosphoester bonds of
polypeptides and oligonucleotides are stable in the aqueous environment of the cell. This seemingly
paradoxic behavior reflects the fact that the thermodynamics governing the equilibrium of a reaction do
not determine the rate at which it will take place. In the cell, protein catalysts called enzymes are used to
accelerate the rate of hydrolytic reactions when needed. Proteases catalyze the hydrolysis of proteins
into their component amino acids, while nucleases catalyze the hydrolysis of the phosphoester bonds in
DNA and RNA. Careful control of the activities of these enzymes is required to ensure that they act only
on appropriate target molecules.

AIR ADALAH NUCLEOPHILE YANG SANGAT BAIK Reaksi metabolik seringkali melibatkan serangan oleh
pasangan elektron bebas pada molekul kaya elektron yang disebut nukleofil pada atom miskin-elektron
yang disebut elektrofil. Nukleofil dan elektrofil tidak harus memiliki muatan formal atau negatif yang
formal. Air, yang memiliki dua pasangan elektron sp3 menanggung muatan negatif parsial, adalah
nukleofil yang sangat baik. Nukleofil lain yang penting secara biologis termasuk atom oksigen fosfat,
alkohol, dan asam karboksilat; belerang tiol; nitrogen amina; dan cincin imidazol histidin. Elektrofil yang
umum termasuk karbon karbonil dalam amida, ester, aldehida, dan keton dan atom fosfor dari
fosfoester. Serangan nukleofilik oleh air umumnya menghasilkan pembelahan ikatan amida, glikosida,
atau ester yang menyatukan biopolimer. Proses ini disebut hidrolisis. Sebaliknya, ketika unit monomer
bergabung bersama untuk membentuk biopolimer seperti protein atau glikogen, air adalah produk,
seperti yang ditunjukkan di bawah ini untuk pembentukan ikatan peptida antara dua asam amino.

Sementara hidrolisis adalah reaksi termodinamik yang disukai, ikatan amida dan fosfoester dari
polipeptida dan oligonukleotida stabil di lingkungan berair sel. Perilaku yang tampaknya paradoks ini
mencerminkan fakta bahwa termodinamika yang mengatur keseimbangan reaksi tidak menentukan laju
terjadinya reaksi tersebut. Di dalam sel, katalis protein yang disebut enzim digunakan untuk
mempercepat laju reaksi hidrolitik saat dibutuhkan. Protease mengkatalisis hidrolisis protein menjadi
asam amino komponennya, sedangkan nukleasi mengkatalisis hidrolisis ikatan fosfoester dalam DNA dan
RNA. Kontrol cermat dari aktivitas enzim ini diperlukan untuk memastikan bahwa mereka hanya
bertindak pada molekul target yang tepat.

Many Metabolic Reactions Involve GroupTransfer In group transfer reactions, a group G is transferred
from a donor D to an acceptor A, forming an acceptor group complex A–G:

The hydrolysis and phosphorolysis of glycogen represent group transfer reactions in which glucosyl
groups are transferred to water or to orthophosphate. The equilibrium constant for the hydrolysis of
covalent bonds strongly favors the formation of split products. The biosynthesis of macromolecules also
involves group transfer reactions in which the thermodynamically unfavored synthesis of covalent bonds
is coupled to favored reactions so that the overall change in free energy favors biopolymer synthesis.
Given the nucleophilic character of water and its high concentration in cells, why are biopolymers such
as proteins and DNA relatively stable? And how can synthesis of biopolymers occur in an apparently
aqueous environment? Central to both questions are the properties of enzymes. In the absence of
enzymic catalysis, even thermodynamically highly favored reactions do not necessarily take place rapidly.
Precise and differential control of enzyme activity and the sequestration of enzymes in specific
organelles determine under what physiologic conditions a given biopolymer will be synthesized or
degraded. Newly synthesized polymers are not immediately hydrolyzed, in part because the active sites
of biosynthetic enzymes sequester substrates in an environment from which water can be excluded.

Water Molecules Exhibit a Slight but Important Tendency to Dissociate The ability of water to ionize,
while slight, is of central importance for life. Since water can act both as an acid and as a base, its
ionization may be represented as an intermolecular proton transfer that forms a hydronium ion (H3O+)
and a hydroxide ion (OH−):
The transferred proton is actually associated with a cluster of water molecules. Protons exist in solution
not only as H3O+, but also as multimers such as H5O2+ and

H O H O H O OH 2 2 3 ++ += −

D G A A G D −= +−+

H7O3+.

Banyak Reaksi Metabolik Libatkan GroupTransfer Dalam reaksi transfer grup, grup G ditransfer dari donor
D ke akseptor A, membentuk kompleks grup akseptor A – G:

Hidrolisis dan fosforolisis glikogen merupakan reaksi transfer kelompok di mana kelompok glukosil
dipindahkan ke air atau ke ortofosfat. Konstanta kesetimbangan untuk hidrolisis ikatan kovalen sangat
mendukung pembentukan produk split. Biosintesis makromolekul juga melibatkan reaksi transfer
kelompok di mana sintesis ikatan kovalen yang secara termodinamika tidak disukai digabungkan dengan
reaksi yang disukai sehingga perubahan keseluruhan dalam energi bebas mendukung sintesis biopolimer.
Mengingat sifat nukleofilik air dan konsentrasi tinggi dalam sel, mengapa biopolimer seperti protein dan
DNA relatif stabil? Dan bagaimana sintesis biopolimer dapat terjadi di lingkungan yang tampaknya
berair? Inti dari kedua pertanyaan tersebut adalah sifat-sifat enzim. Dengan tidak adanya katalisis enzim,
bahkan reaksi termodinamik yang sangat disukai tidak selalu terjadi dengan cepat. Kontrol yang tepat
dan berbeda dari aktivitas enzim dan sekuestrasi enzim dalam organel spesifik menentukan dalam
kondisi fisiologis apa biopolimer tertentu akan disintesis atau terdegradasi. Polimer yang baru disintesis
tidak segera dihidrolisis, sebagian karena situs aktif substrat enzim biosintetik menyita substrat dalam
lingkungan di mana air dapat dikeluarkan.

Molekul Air Menunjukkan Kecenderungan yang Kecil namun Penting untuk Disosiasi Kemampuan air
untuk mengionisasi, meskipun sedikit, adalah sangat penting bagi kehidupan. Karena air dapat bertindak
baik sebagai asam dan sebagai basa, ionisasi dapat direpresentasikan sebagai transfer proton antar
molekul yang membentuk ion hidronium (H3O +) dan ion hidroksida (OH−):

Proton yang ditransfer sebenarnya terkait dengan sekelompok molekul air. Proton ada dalam solusi tidak
hanya sebagai H3O +, tetapi juga sebagai multimer seperti H5O2 + dan

The proton is nevertheless routinely represented as H+, even though it is in fact highly hydrated. Since
hydronium and hydroxide ions continuously recombine to form water molecules, an individual hydrogen
or oxygen cannot be stated to be present as an ion or as part of a water molecule. At one instant it is an
ion. An instant later it is part of a molecule. Individual ions or molecules are therefore not considered.
We refer instead to the probability that at any instant in time a hydrogen will be present as an ion or as
part of a water molecule. Since 1 g of water contains 3.46 × 1022 molecules, the ionization of water can
be described statistically. To state that the probability that a hydrogen exists as an ion is 0.01 means that
a hydrogen atom has one chance in 100 of being an ion and 99 chances out of 100 of being part of a
water molecule. The actual probability of a hydrogen atom in pure water existing as a hydrogen ion is
approximately 1.8 ×10−9. The probability of its being part of a molecule thus is almost unity. Stated
another way, for every hydrogen ion and hydroxyl ion in pure water there are 1.8 billion or 1.8 × 109
water molecules. Hydrogen ions and hydroxyl ions nevertheless contribute significantly to the properties
of water. For dissociation of water,
where brackets represent molar concentrations (strictly speaking, molar activities) and K is the
dissociation constant. Since one mole (mol) of water weighs 18 g, one liter (L) (1000 g) of water contains
1000 × 18 = 55.56 mol. Pure water thus is 55.56 molar. Since the probability that a hydrogen in pure
water will exist as a hydrogen ion is 1.8 × 10−9, the molar concentration of H+ ions (or of OH− ions) in
pure water is the product of the probability, 1.8 × 10−9, times the molar concentration of water, 55.56
mol/L. The result is 1.0 × 10−7 mol/L. We can now calculate K for water:

The molar concentration of water, 55.56 mol/L, is too great to be significantly affected by dissociation. It
therefore is considered to be essentially constant. This constant may then be incorporated into the
dissociation constant K to provide a useful new constant Kw termed the ion product for water. The
relationship between Kw and K is shown below:

Namun proton secara rutin direpresentasikan sebagai H +, walaupun sebenarnya sangat terhidrasi.
Karena ion hidronium dan hidroksida terus-menerus bergabung kembali membentuk molekul air,
hidrogen atau oksigen individu tidak dapat dinyatakan hadir sebagai ion atau sebagai bagian dari molekul
air. Pada satu saat itu adalah ion. Sesaat kemudian itu adalah bagian dari molekul. Oleh karena itu, ion
atau molekul individu tidak dipertimbangkan. Sebagai gantinya, kami merujuk pada probabilitas bahwa
suatu saat hidrogen akan hadir sebagai ion atau sebagai bagian dari molekul air. Karena 1 g air
mengandung 3,46 × 1022 molekul, ionisasi air dapat dijelaskan secara statistik. Untuk menyatakan
bahwa probabilitas bahwa hidrogen ada sebagai ion adalah 0,01 berarti bahwa atom hidrogen memiliki
satu peluang dalam 100 menjadi ion dan 99 peluang dari 100 menjadi bagian dari molekul air. Peluang
sebenarnya dari atom hidrogen dalam air murni yang ada sebagai ion hidrogen adalah sekitar 1,8 × 10−9.
Dengan demikian, kemungkinannya menjadi bagian dari suatu molekul hampir merupakan satu
kesatuan. Dinyatakan dengan cara lain, untuk setiap ion hidrogen dan ion hidroksil dalam air murni ada
1,8 miliar atau 1,8 × 109 molekul air. Namun, ion hidrogen dan ion hidroksil berkontribusi signifikan
terhadap sifat-sifat air. Untuk disosiasi air,

di mana tanda kurung mewakili konsentrasi molar (tepatnya, aktivitas molar) dan K adalah konstanta
disosiasi. Karena satu mol (mol) air memiliki berat 18 g, satu liter (L) (1000 g) air mengandung 1000 × 18
= 55,56 mol. Air murni dengan demikian adalah 55,56 molar. Karena probabilitas bahwa hidrogen dalam
air murni akan ada sebagai ion hidrogen adalah 1,8 × 10−9, konsentrasi molar dari ion H + (atau ion OH−)
dalam air murni adalah produk dari probabilitas, 1,8 × 10−9 , kali konsentrasi air molar, 55,56 mol / L.
Hasilnya adalah 1,0 × 10−7 mol / L. Kami sekarang dapat menghitung K untuk air:

Konsentrasi air molar, 55,56 mol / L, terlalu besar untuk dipengaruhi secara signifikan oleh disosiasi.
Karena itu dianggap pada dasarnya konstan. Konstanta ini kemudian dapat dimasukkan ke dalam
konstanta disosiasi K untuk memberikan konstanta Kw baru yang bermanfaat yang disebut produk ion
untuk air. Hubungan antara Kw dan K ditunjukkan di bawah ini: