Genetika Mikroba
Disusun oleh :
201667041
UNIVERSITAS PATIMURA
FAKULTAS PERIKANAN DAN ILMU KELAUTAN
JURUSAN TEKNOLOGI HASIL PERIKANAN
PROGRAM STUDI TEKNOLOGI HASIL PERIKANAN
AMBON
2017
DAFTAR ISI
Halaman
BAB I. PENDAHULUAN
2
KATA PENGANTAR
Puji syukur kehadirat Tuhan Yang maha esa atas rahmat dan hidayah-Nya penulis
dalam keadaaan sehat sehingga penulis dapat menyelesaikan makalah ini, yang mana
makalah ini disusun bertujuan untuk memenuhi tugas dalam menempuh pendidikan .
Penulis menyadari bahwa masih banyak kekurangan dan keterbatasan dalam makalah
ini. Oleh karena itu, penulis mengharapkan kritik dan saran yang membangun demi
kesempurnaan makalah selanjutnya. Semoga makalah ini berguna dan bermanfaat untuk kita
semua.
Penulis
3
BAB I
PENDAHULUAN
Setiap makhuk hidup pasti memiliki karakteristik tertentu yang sesuai dengan peran
kehidupannya di dunia. Begitu juga dengan bakteri, memiliki karakteristik tertentu yang
berbeda-beda dari satu jenis dengan jenis yang lainnya. Seperti makhluk hidup lainnya
juga, bakteri berinteraksi dengan lingkungannya yang salah satunya adalah manusia.
Interaksi antara bakteri dan manusia ini dapat bersifat positif maupun negative. Positif
Genetika merupakan suatu cabang ilmu yang dinamis dan berkembang dengan cepat.
adalah suatu segi baru studi genetika yang menjanjikan pada masyarakat baik perkembangan
Kita harus menerangkan bagaimana cara untuk menaklukan semua penyakit menurun dan
kemungkinan terubahnya suatu mikroba yang umum dan tidak berbahaya menjadi
bentuk patogenik.
organisme. Unit keturunan disebut gen yang merupakan suatu segmen DNA yang
tradisional pada genetika telah mengidentifikasikan gen sebagai dasar kontribusi karakter
fenotip atau karakter dari keseluruhan stuktural dan fisiologis dari suatu sel atau
4
organisme, karakter fenotif seperti warna mata pada manusia atau resistensi terhadap
antibiotik pada bakteri, pada umumnya di amati pada tingkat organisme. Dasar kimia
untuk variasi dalam fenotif atau perubahan urutan DNA dalam suatu gen atau dalam
organisasi gen.
Saat ini kita telah mempelajari kemajuan-kemajuan berarti yang dihasilkan dan karya
pasteur mengenai penjelasan biologi tentang peristiwa fermentasi, teori bibit penyakit,
penolakan generatio spontanea pada semua taraf kehidupan. Begitu juga saat Johann
Gregor Mendel melakukan studinya pada pewarisan berbagai sifat pada ercis. Studi inilah
yang mula-mula diterbitkan pada tahun 1865, yang menjadi dasar apa yang sekarang
Penelaahan tentang genetika pertama kali dilakukan oleh seorang ahli botani bangsa
Austria, Gregor Mendel pada tanaman kacang polongnya. Pada tahun 1860-an ia
antara lain terjadi perubahan-perubahan pada warna,bentuk, ukuran, dan sifat-sifat lain
kebakaan. Hukum kebakaan berlaku umum bagi semua bentuk kehidupan. Hukum-
hukum mendel berlaku manusia dan juga organisme percobaan dahulu amat populer
ilmu kebakaan dengan menggunakan bakteri Escherichia coli. Bakteri ini dipilih karena
paling mudah dipelajari pada taraf molekuler sehingga merupakan organisme pilihan bagi
banyak ahli genetika. Hal ini membantu perkembangan bidang genetika mikroba. Jasad
renik yang di pelajari dalam bidang genetika mikroba meliputi bakteri, khamir, kapang,
dan virus.
Genetika mikrobia telah mengungkapkan bahwa gen terdiri dari DNA, suatu
pengamatan yang melekat dasar bagi biologi molekuler. Genetika bakteri mendasari
5
perkembangan rekayasa genetika, suatu teknologi yang bertanggung jawab terhadap
lanjut pengemasan bahan genetik bakteri, penyusun mengangkat judul “Genetika Mikroba”.
1.3 Tujuan
Penulisan makalah ini adalah bertujuan untuk mengetahui arti dari genetika mikroba,
bagaimana proses mutasi dan mutagen, bagaimana mekanisme pemindahan bahan genetik
Dalam penulisan materi genetika mikroba, saya menggunakan media internet untuk
menambah suatu kekurangan dalam penyusunan makalah ini. Semua ini adalah untuk
6
BAB II
ISI
Penelaahan tentang genetika pertama kali dilakukan oleh seorang ahli botani bangsa
Austria, Gregor Mendel pada tanaman kacang polongnya. Pada tahun 1860-an ia
lain terjadi perubahan-perubahan pada warna,bentuk, ukuran, dan siat-sifat lain dari kacang
polong tersebut. Genetika adalah dasar dari ekpresi dari suatu ciri makhluk hidup.
Genetika mikrobia telah mengungkapkan bahwa gen terdiri dari DNA, suatu
pengamatan yang melekat dasar bagi biologi molekuler. Penemuan selanjutnya dari bakteri
sebagai elemen genetika kecil yang mampu melakukan replikasi diri pada bakteri dan ragi.
Pengenalan dari sebuah fragmen potongan DNA kedalam suatu plasmid memungkinkan
fragmen di perbanyak (teramplifikasi). Amplifikasi regio DNA spesifik dapat di capai oleh
enzim bakteri menggunakan polymerase chain reaction (PCR) atau metode amplifikasi
nukleotida berdasar enzim yang lain (misalnya amplifikasi berdasar transkripsi). DNA yang
di masukkan kedalam plasmid dapat di kontrol oleh promoter ekspresi pada bakteri yang
Pada tahun 1953, Frances Crick dan James Watson menemukan model molekul
DNA sebagai suatu struktur heliks beruntai ganda, atau yang lebih dikenal dengan heliks
ganda Watson-Crick.
7
Informasi genetika disimpan sebagai suatu urutan basa pada DNA. Kebanyakan
molekul DNA adalah rantai ganda, dengan basa-basa komplementer (A-T; G-C) berpasangan
menggunakan ikatan hidrogen pada pusat molekul. Sifat komplementer dari basa
memungkinkan satu rantai (rantai cetakan, template) menyediakan informasi untuk salinan
atau ekpresi informasi pada suatu rantai yang lain (rantai penyandi).
Pasangan-pasangan basa tersusun dalam bagian pusat double helix DNA dan
membentuk suatu nukleotida. Setiap nukleotida dibentuk dari tiga bagian yaitu:
1) Sebuah senyawa cincin yang mengandung nitrogen, disebut basa nitrogen. Dapat berupa
2) Sebuah gugusan gula yang memiliki lima karbon (gula pentosa), disebut deoksiribosa.
deoksiribosa-fosfat.
Kromosom bakteri yang terdiri dari DNA mempunyai berat lebih kurang 2-3% dari
berat kering satu sel. Dengan mikroskop elektron, DNA tampak sebagai benang-benang
fibriler yang menempati sebagian besar dari volume sel. Molekul DNA bila diekstraksi dari
8
sel bakteri biasanya mempunyai bentuk yang sirkuler, dengan panjang kira-kira 1 mm. DNA
ini mempunyai berat molekul yang tinggi karena terdiri dari heteropolimer dari
Watson dan Crick, dengan sinar X menemukan bahwa struktur DNA terdiri dari dua
rantai poliribonukleotida yang dihubungkan satu sama lain oleh ikatan hidrogen antara purin
di satu rantai dengan pirimidin di rantai lain, dalam keadaan antiparalel, dan disebut sebagai
struktur double helix. Ikatan hidrogen ini hanya dapat menghubungkan Adenin (6
aminopurin) dengan Timin (2,4 dioksi 5 metil pirimidin) dan antara Guanin (2 amino 6
oksipurin) dengan Sitosin (2 oksi 4 amino pirimidin). Singkatnya pasangan basa pada suatu
sekuens DNA adalah A-T dan S-G. Karena adanya sistem berpasangan demikian, maka
setiap rantai DNA dapat dijadikan cetakan/template untuk membangun rantai DNA yang
komplementer. Waktu terjadinya proses replikasi DNA dalam pembelahan sel, molekul DNA
dari sel anaknya terdiri dari satu rantai DNA yang komplememter tapi dibuat baru, dengan
kata lain, pemindahan materi genetik dari satu generasi ke generasi berikutnya adalah dengan
cara semikonservatif.
Fungsi primer DNA pada hakikatnya adalah sebagai sumber perbekalan informasi
genetik yang dimiliki oleh sel induk. Proses replikasi di kerjakan dengan amat lengkap
sehingga sel anaknya mendapatkan pula informasi genetik yang lengkap, sehingga terjadi
kesetabilan genetik dalam suatu populasi mikroorganisme. Satu benang kromosom biasanya
terdiri dari lima juta pasangan basa dan terbagi atas segmen atau sekuens asam amino tertentu
yang akan membentuk stuktur protein. Protein ini kemudian menjadi enzim-enzim,
komponen membran sel dan struktur sel yang lain yang secara keseluruhan menentukan
9
Mekanisme yang menunjukan bahwa sekuen nukleotida di dalam gen menentukan
1. Suatu enzim amino sel bakteri yang disebut enzim RNA polimerase membentuk satu
rantai oliribonukleotida (= messesnger RNA = mRNA) dari rantai DNA yang ada. Proses ini
diseut transkripsi. Jadi pada transkripsi DNA, terbentuk satu rantai RNA yang komplementer
2. Secara enzimatik asam amino akan teraktifasi dan ditransfer kepada transfer RNA (=
tRNA yang mempunyai daptor basa yang komplementer dengan basa mRNA di satu
ujungnya dan mempunyai asam amino spesifik di ujung lainnya tiga buah basa pada mRNA
di sebut triplet basa yang lazim disebut sebagai kodon untuk suatu asam amino.
3. mRNA dan tRNA bersama-sama menuju kepermukaan ribosom kuman, dan disinilah
rantai polipeptida terbentuk sampai seluruhkodon selesai dibaca menjadi menjadi suatu
sekuen asam amino yang membentuk protein tertentu. Proses ini disebut translasi.
mikrobia seperti bakteri dapat dipertahankan melalui sifat karakteristik yang terus diwariskan
dari generasi selanjutnya. Bakteri banyak diketahui dan diteliti karena mudah
dikembangbiakan dan perkembangbiakan cepat. Selain itu, bakteri memiliki materi genetik
ekstrakromosomal khas yang disebut plasmid yang berbentuk sirkuler. Mikrobia, bakteri
mudah bermutasi sehingga akan muncul varietas-varietas baru dari mikroba dan mikrobia
cenderung memiliki daya hidup yang tinggi (resisten) terhadap cekaman lingkungan dan
kondisi yang tidak menguntungkan. Kemampuan atau daya hidup yang tinggi pada mikrobia
10
2.2. Mutasi dan Mutagen, Mekanisme Mutasi, Tipe Mutan
1. Pengertian Mutasi
DNA mikroba mengandung basa purin dan pirimidin. Urutan keduanya sangat
menentukan ciri tertentu pada mikroba. Urutan ini sangat mudah berubah oleh berbagai
faktor dan apabila terjadi perubahan dalam urutan ini maka akan terjadi perubahan pada
urutan asam amino yang disandi oleh gen. Akibatnya terjadi perubahan fenotif pada
mikroba.Perubahan dalam urutan basa nukleotida ini disebut mutasi (Darkuni, 2001).
Mutasi banyak terjadi pada waktu proses sintesa DNA terutama pada waktu
penempatan basa purin dan pirimidin yang mengalami “kesalahan”. Bila mutasi ini terjadi
pada enzim polymerase yang berhubungan dengan DNA, maka mutasi akan berlangsung
dengan frekuensi yang relatif tinggi. Hal ini dikarenakan tidak ada lagi kemampuan dari
enzim itu untuk bertugas mengatur penempatan basa purin dan pirimidin.
Mutasi juga dapat terjadi karena hilangnya pasangan basa purin atau pirimidin.
Bahkan karena adanya penambahan pasangan basapun dapat juga terjadi mutasi. Sebab
hilangnya atau penambahan tersebut justru akan berakibat terjadi “kesalahan” dalam
Mutasi mudah terjadi pada mikroba terutama karena ciri dan karakter dari mikrobia
tersebut sangat dipengaruhi oleh urutan dari basa purin dan pirimidin di dalam meteri genetik
mikrobia tersebut. Perubahan urutan nukleotida paling sering terjadi karena kesalahan selama
replikasi DNA dan kerusakan DNA, baik kerusakan DNA karena mekanisme delesi atau
insersi pada kerangka DNA tersebut. Perubahan urutan nukleotida akan berdampak pada
fenotip dari sel tersebut. Perubahan fisiologis sel, misalnya adanya beberapa enzim yang
tidak terbentuk pada mutan tertentu, kemudian perubahan morfologi, dan terjadinya resistensi
11
2. Macam-macam Mutasi
Mutasi ini dapat terjadi pada satu tempat/titik pasangan basa.Padatempat atau titik ini
terjadi perubahan pasangan basa. Misalnya terjadi perubahan pada basa timin yang digantikan
oleh basa sitosin, atau basa adenin digantikan oleh guanin. Mutasi ini akan berakibat: (a)
tidak terjadi pembentukan protein, (b) terjadi pembentukan protein akan tetapi tetap terjadi
perubahan atau mutasi yang tidak jelas. Mutasi ini disebut mutasi tidak nyata (silent
mutation) dan (c) terjadi penggantian asam amino. Contoh basa adenin yang digantikan o leh
Mutasi ini terjadi disebabkan oleh hilangnya basa dalam jumlah yang lebih dari satu.
Kehilangan ini akan menyebabkan terjadinya pergeseran dalam hal pembacaan sandi yang
pada akhirnya akan menyebabkan perubahan urutan asam amino. Akibat yang ditimbulkan
oleh mutasi ini dapat menyebabkan protein yang terbentuk tidak berfungsi.
c. Mutasi supresor
Mutasi ini merupakan mutasi yang mengakibatkan mutasi yang terjadi sebelumnya
menjadi “normal” kembali. Pada mutasi ini terjadi “penyusupan” basa lain yang
menyebabkan kembalinya urutan susunan asam amino yang seolah-olah susunan itu seperti
menjadi “normal” kembali. Walau demikian mutasi ini tetap menghasilkan perubahan yang
d. Mutasi spontan
Kontrol genetik mutabilitas beberapa gen yang diketahui dapat disebabkan oleh “mutator
gen” lain. Mutasi spontan dapat dibedakan menjadi 1 mutasi spesifik yang pengaruhnya
12
terbatas pada satu lokus dan 2) mutasi nonspesifik secara simultan mempengaruhi pada beberapa
lokus.
e. Mutasi terinduksi
Mutasi terinduksi dipengaruhi oleh keadaan lingkungan yang tidak normal, misalnya: radiasi
pengion (perubahan valensi senyawa kimia melalui penambahan elektron yang dihasilkan
oleh proton, neutron, atau oleh sinar X. Radiasi nonpengion penambahan tingkat energi atom
mutation adalah mutasi yang terjadi pada sel germ, sedangkan mutasi somatik adalah yang
terjadi pada sel somatik. Akibat mutasi somatik pada hewan dan manusia tidak dapat
diwariskan, namun pada tumbuhan bisa diwariskan melalui reproduksi seksual atau aseksual.
Pada mutasi germinal, akibat mutasi yang dominan segera terekspresi pada turunan.
Sebaliknya, jika mutasi bersifat resesif, maka efek mutasinya tidak terdeteksi karena kondisi
yang heterozigot.
Ada mutasi kromosom dan mutasi gen. Mutasi gen terjadi di lingkup gen. Sedangkan
mutasi kromosom ada di lingkup kromosom. Mutasi gen dapat berupa perubahan urutan
DNA, termasuk substitusi pasangan basa, adisi atau delesi satu atau lebih pasangan basa.
Efek mutasi gen hanya menimpa satu nukleotida. Mutasi titik adalah mutasi yang hanya
13
Macam-macam Mutasi Gen yang Spesifik
a. Mutasi pergantian basa (base pair substitution mutation), merupakan perubahan yang
terjadi pada suatu gen berupa pergantian satu basa oleh pasangan basa lainnya. Misalnya AT
b. Mutasi transisi, pada mutasi ini terjadi pergantian basa purin dengan basa purin lain, basa
pirimidin dengan basa pirimidin lain, basa purin-pirimidin dengan basa purin-pirimidin lain,
basa pirimidin-purin dengan basa pirimidin-purin lain. Misal AT GS, GS AT, TA SG, SG
TA.
c. Mutasi transversi, pada mutasi ini terjadi pergantian basa purin dengan basa pirimidin, basa
pirimidin dengan basa purin, basa purin-pirimidin dengan basa pirimidin-purin, basa
pirimidin-purin dengan basa basa purin-pirimidin. Misal AT TA, GS SG, AT SG, SG TA.
d. Mutasi misens merupakan mutasi yang terjadi karena perubahan suatu pasangan basa
(dalam gen) yang mengakibatkan terjadinya perubahan suatu kode genetika, sehingga asam
amino yang terkait (pada polipeptida) berubah dan fungsi protein juga berubah. Hal itu
menyebabkan individu mutan dapat memperlihatkan karakter berbeda. Namun suatu mutasi
mungkin tidak menimbukan suatu fenotip jika munculnya suatu asam amino pengganti belum
e. Mutasi nonsense merupakan suatu pergantian pasangan basa yang berakibat terjadinya
perubahan suatu kode genetika pengode asam amino menjadai kode kode genetika pengode
terminasi. Misal kode genetika pengode asam amino triptofan (UGG) menjadi UAG.
f. Mutasi netral merupakan pergantian pasangan basa yang terkait terjadinya perubahan suatu
kode genetika yang juga menimbulkan perubahan asam amino terkait, tetapi tidak sampai
mengakibatkan perubahan fungsi protein. Misal kodon AGG yang mengode asam amino lisin
mengalami mutasi menjadi ACG yang mengode asam amino arginin, namun asam amino
arginin secara kimiawi ekivalen dengan asam amino lisin dan sama-sama asam amino dasar
14
sehingga keduanya memiliki sifat-sifat yang cukup mirip. Dengan demikian fungsi protein
tidak berubah.
g. Mutasi diam merupakan tipe mutasi netral yang khusus dimana terjadi pergantian pasangan
asam basa pada gen yang mengakibatkan perubahan satu kodon, namun tidak mengakibatkan
pergantian asam amino yang dikode. Misal kodon AGG termutasi menjadi AGA, namun
h. Mutasi perubahan rangka terjadi karena adisi atau delesi satu atau lebih dari pasangan basa
dalam suatu gen. Adisi dan delesi itu mengubah kerangka percobaan RNAd, sehingga terjadi
Mutagen adalah senyawa kimia atau faktor fisikawi yang dapat menyebabkan mutasi.
Misalnya sinar ultraviolet (UV) merupakan mutagen yang kuat karena sinar UV dapat
menembus sel dan diabsorpsi dengan kuat oleh timin (T) dan sitosin (C). Absorpsi UV oleh
timin dapat menyebabkan terbentuknya dimer timin yang berdekatan sehingga dapat
mengubah DNA yang akan mengganggu proses replikasi. Senyawa kimia yang dapat
menyebabkan mutasi, misalnya HNO2 karena asam ini menimbulkan deaminasi pada basa
nitrogen nukleotida. Asam nitrit dapat mengubah adenin (A) menjadi hipoxantin (HX),
sitosin (C) menjadi urasil (U) dan guanin (G) menjadi xantin (X). (Ristiati, 2000)
Senyawa kimia mutagen yang lain adalah analog basa. Ini adalah senyawa kimia yang
strukturnya cukup menyamai basa DNA yang normal sehingga dapat menggantikannya
selama berlangsungnya replikasi DNA. Meskipun strukturnya mirip, analog basa tidak
mempunyai sifat ikatan hydrogen yang sama seperti basa yang normal. Karena itu dapat
aminopurin adalah analog adenin (A) dan dapat berpasangan dengan timin (T) atau sitosin
(C). 5-Bromourasil adalah analogtimin (T) dan dapat berpasangan dengan adenin (A) atau
15
guanin (G). Selain itu sinar x, sinar γ dan partikel energi tinggi (seperti neutron, partikel
4. Mekanisme Mutasi
Mutasi paling umum terjadi selama replikasi DNA. Beberapa mutasi terjadi sebagai
akibat kerusakan yang ditimbulkan oleh cahaya ultraviolet atau sinar X. Karena unsur-unsur
ini merupakan bagian yang tak terhindarkan dari lingkungan. Tidak satupun mekanisme
tertentu yang dapat diusulkan untuk menerangkan pengaruh mutagenik sinar X. Karena sinar
X dapat menyebabkan pecahnya banyak ikatan kimiawi yang berbeda-beda macamnya, maka
mungkin merusak DNA dengan berbagai cara. Pengaruh utama cahaya UV ialah
bersebelahan, terutama timin. Dimer ini mengacaukan proses replikasi yang normal (Pelczar,
2008).
Penemuan yang paling banyak membuka rahasia mutasi pada tahun-tahun belakangan
ini datang dari penelitian mengenai pengaru hmutagenik berbagai bahan kimia. Ada dua tipe
senyawa kimia yang mutagenik. Yang pertama terdiri dari senyawa-senyawa yang dapat
bereaksi secara kimiawi dengan DNA. Karena kekhususan replikasi DNA bergantung pada
ikatan purin-pirimidin, yang diakibatkan oleh ikatan hidrogen antara gugusan-gugusan amino
dan hidroksil ini dapat menyebabkan mutasi. Asam nitrous, yang dapat membuang gugusan
amino dari purin dan pirimidin, adalah mutagen semacam itu (Pelczar, 2008).
Semua sifat sel-sel hidup dikendalikan oleh gen maka ciri sel yang manapun dapat
berubah karena mutasi. Berbagai ragam mutan bakteri telah diisolasi dan dipelajari secara
16
2. Mutan yang menunjukkan kemampuan fermentasi yang berubah atau meningkatnya atau
3. Mutan yang mempunyai defisiensi akan nutrisi (oksotrofik), yaitu membutuhkan medium
5. Mutan yang memperlihatkan perubahan dalam bentuk koloni atau kemampuan untuk
menghasilkan pigmen.
6. Mutan yang menunjukkan perubahan pada struktur permukaan dan komposisi selnya
(mutan antigenik).
Ada banyak implikasi praktis yang berkaitan dengan terjadinya mutan mikrobia. Hal ini
antibiotik-antibiotik tertentu akibat mutasi. Kenyataan ini sangat penting dalam pengobatan
penyakit, karena antibiotik yang pada mulanyaefektif untuk mengendalikan suatu infeksi bacterial
menjadi kurang atau tidak lagi efektif ketika muncul mutan-mutan yang resisten terhadap
2. Dapat diisolasi mutan biokimiawi yang mampu menghasilkan suatu produk akhir dalam
jumlah besar. Hal ini penting dalam industri. Sebagai contoh, jumlah penisilin yang
dihasilkan dalam produksi komersial meningkat secara dramatis melalui seleksi galur-galur
mutan Penicillium.
tercegahnya mutasi, kalau tidak maka biakan tersebut tidak akan tipikal lagi
17
4. Mutan mikroba telah digunakan secara meluas di dalam penyelidikan berbagai proses
atau rusak pada langkah-langkah enzimatik yang berbeda-beda telah digunakan untuk
Banyak mutan, mungkin sebagian besar dapat balik ke kondisi liar melalui mutasi
balik, yaitu kembalinya sel-sel mutan ke fenotipe asalnya. Akan tetapi, hal ini tidak mesti
disebabkan oleh pembalikan mutasi aslinya secara tepat. Kadang-kadang, pengaruh mutasi
asli dapat ditekan sebagian atau seluruhnya oleh mutasi kedua pada situs yang berbeda pada
kromosom.
mengirimkan informasi genetik (DNA) dari sel donor ke sel resipien. Pertukaran gen antar
bakteri dapat terjadi karena bakteri pada umumnya hidup berkoloni bahkan bercampur
dengan banyak bakteri jenis lain. Pertukaran gen akan menghasilkan rekombinan baru.
Pertukaran gen atau materi genetik secara garis besar dilakukan melalui cara transfer gen dan
transposisi.
Transfer gen merupakan perpindahan materi genetik termasuk plasmid dari sel donor
ke sel resipien. Sedangkan transposisi merupakan pemindahan rantai DNA pendek (hanya
beberapa urutan saja) antara satu plasmid ke plasmid lain, atau dari kromosom ke plasmid
dalam sel tersebut. Transfer gen terjadi melalui beberapa cara yaitu, transformasi, transduksi,
18
Gambar 2 . Tiga tipe mekanisme transfer gen pada bakteri (Snustad, 2012).
a. Transformasi
Kali pertama diamati oleh Frederick Griffith (1928) Fragmen DNA bebas dapat
melewati dinding sel dan kemudian bersatu dalam genom sel tersebut sehingga mengubah
genotipnya. Hal ini biasanya dikerjakan di laboratorium dalam penelitian rekayasa genetika,
tapi dapat pula terjadi secara spontan meskipun dalam frekuensi yang kecil.
sejumlah terbatas informasi DNA dari satu sel ke sel yang lain.DNA tersebut diperoleh dari
sel donor melalui lisis secara alamiah atau dengan cara ekstraksi kimiawi, begitu DNA
diambil oleh sel resipien makaterjadilah rekombinasi. Gejala transformasi ini ditemukan kali
pertama pada Streptococcus pneumonia oleh F. Griffith pada tahun 1928. Pengamatannya
menunjukkan bahwa ada dua macam tipe koloni bakteri tersebut, yaitu koloni halus (tipe S
atau smooth) yang bersifat patogen dan koloni kasar (tipe R atau rough) yang non patogen.
Dalam percobaannya ditemukan jika campuran bakteri tipe S yang telah dimatikan dengan
pemanasan dan sel tipe R hidup disuntikkan pada tikus maka tikus akan mati dan dari
bangkai tikus dapat diisolasi bakteri tipe S yang hidup. Griffith mengatakan bahwa ada
substansi yang berasal dari bakteri tipe S (mati) diambil oleh bakteri tipe R (hidup) sehingga
tipe R ini berubah menjadi tipe S yang patogen. Perubahan dari tipe R ke tipe S ini disebut
transformasi. Pada tahun 1944, Oswald Avery, Macleod, McCarty mengisolasi substansi
19
tersebut dan berhasil mengidentifikasinya sebagai DNA.Percobaan Avery dan kawan-kawan
inilah yang mendemontrasikan untuk pertama kali bahwa bahan genetik adalah DNA
(Gardner, 2000).
Manfaat yang didapat dari transformasi gen pada bakteri yaitu merupakan sarana
penting dalam rekayasa genetika. Selain itu banyak penelitian yang telah menggunakan hasil
transformasi untuk memetakan kromosom bakteri dan sangat bermanfaat untuk penelitian
genetika dalam laboratorium.
b. Konjugasi
Transfer unilateral materi genetik antara bakteri sejenis maupun dengan jenis lain
dapat terjadi melalui proses konjugasi (mating). Hal ini dimungkinkan karena adanya faktor F
yang menentukan adanya pili seks pada virus bakterial tertentu. Kuman yang mempunyai pili
seks disebut kuman F+, dan melalui pilinya materi genetik dari sel donor (F+) termasuk
plasmid DNAnya dapat berpindah ke dalam sel resipien. Jadi gen-gen tertentu yang
membawa sifat resistensi pada obat dapat berpindah dari populasi kuman yang resisten ke
dalam kuman yang sensitif. Dengan cara inilah sebagian besar dari sifat resisten obat tersebar
dalam populasi kuman dan menimbulkan apa yang disebut multidrug resistance.
Konjugasi merupakan pemindahan bahan genetik dari suatu sel bakteri yang bertindak
sebagai donor kepada sel bakteri yang bertindak sebagai resipien. Pada proses konjugasi, sel
donor (jantan) memasukkan sebagian DNA ke dalam sel resipien melalui pili seks yang
dimiliki oleh sel jantan. Setelah DNA donor masuk ke dalam sel resipien, enzim-enzim yang
bekerja pada DNA resipien menggunting dan mengeksisi suatu fragmen DNA resipien.
Kemudian DNA donor dipadukan ke dalam kromosom resipien di tempat DNA yang
tereksisi. Pemindahan ini dikode oleh plasmid. Plasmid adalah unsur genetis ekstra
kromosomal (diluar kromosom) dan dapat melangsungkan replikasi didalam sitoplasma sel
bakteri. Plasmid adalah potongan bundar DNA yang merupakan gen tambahan. Bila unsur
ekstra kromosomal dapat bereplikasi dan terpadu ke dalam kromosom bakteri disebut episom.
Hal ini membedakan episom dari plasmid, karena plasmid tidak terpadu ke dalam kromosom.
Pada bakteri gram negatif misalnya E.coli, konyugasi terjadi dengan cara perlekatan antara
sel donor dengan sel resipien melalui piliseks atau faktor F (faktor kesuburan atau fertility
factor). Pada bakteri gram positif misalnya Streptococcus faecalis, perlekatan antara sel
donor dan resipien tidak melaui pili. Proses konyugasi secara artificial dapat digunakan untuk
memetakan gen pada bakteri (Ristiati, 2000).
20
c. Transduksi
Transduksi merupakan proses pemindahan bahan genetik dari suatu bakteri ke bakteri
lain melalui bakteriofage. Bila bakteriofage menyerang bakteri maka DNA bakteriofage
diijeksikan ke dalam sel bakteri. Saat DNA fage dikemas di dalam pembungkusnya untuk
membentuk bakteri-bakteri fage baru, DNA fage tersebut dapat membawa sebagian dari
DNA bakteri yang telah menjadi inangnya. Selanjutnya, bila fage menginfeksi bakteri
lainnya, maka fage akan memasukkan DNA-nya yang mengandung sebagian dari DNA
bakteri inang sebelumnya. Dengan demikian, fage tidak hanya memasukkan DNA-nya
sendiri ke dalam sel bakteri yang diinfeksinya, tetapi juga memasukkan DNA dari bakteri lain
yang ikut terbawa pada DNA fage. Jadi, secara alami fage memindahkan DNA dari satu sel
bakteri ke bakteri lainnya. Ada dua kemungkinan yang terjadi yaitu sel mengalami lisis atau
Lisis terjadi jika DNA bakteriofage akan mengambil alih fungsi metabolisme
bakteri untuk memproduksi DNA dan protein bakteriofage, kemudian terjadi perakitan
partikel virus dan akhirnya virus yang utuh akan keluar dari sel bakteri ketika sel mengalami
lisis. Sedangkan DNA bakteriofage akan berintegrasi dengan DNA bakteri sehingga
terbentuklah bakteri yang bersifat lisogenik. Bakteri yang bersifat lisogenik dapat
mengalami fase litik, namun belum diketahui penyebab dari fenomena tersebut. Di alam
keadaan demikian, DNA bakteriofage akan melepaskan diri dari DNA bakteri dan mengambil
alih fungsi metabolisme untuk menghasilkan partikel virus yang baru seperti halnya pada
galur bakteri baru, memetakan kromosom bakteri dan untuk banyak percobaan genetis lain.
Transduksi dapat juga terjadi dengan cara DNA dari plasmid masuk ke dalam genom
bakteriofag. Oleh bakteriofag plasmid ditransfer ke populasi bakteri lain. Transduksi biasa
terjadi pada bakteri Gram positif seperti Staphylococcus, tapi diketahui pula terjadi pada
Salmonella.
21
2.4. Reproduksi Bakteri
Bakteri melakukan reproduksi secara vegetatif atau tak kawin, dengan membelah diri.
Pembelahan sel pada bakteri disebut dengan pembelahan biner, yaitu setiap sel membelah
menjadi dua atau disebut juga dengan pembelahan amitosis. Mekanisme-mekanisme yang
berhubungan dengan transfer gen antara bakteri adalah tranformasi, transduksi, dan
konjugasi. Hal ini dapat dikatakan sebagai reproduksi bateri dengan cara seksual.
DNA telanjang masuk ke dalam sel melalui lingkungan sekitarnya. Trnsformasi ini terjadi
ketika sel nonpatogenik hidup mengambil potongan DNA yang kebetulan mengandung alel
untuk patogenesis (gen untuk suatu lapisan sel yang melindungi bakteri dari sistem imun
inang). Alel asing tersebut kemudian dimasukkan ke dalam kromosom bakteri, menggantikan
alel aslinya. Proses ini merupakan rekombinasi genetik pertukaran segmen DNA dengan cara
pidah silang (crossing over). Sel yang ditransformasi ini sekarang memiliki satu kromosom
yang mengandung DNA yang berasal dari dua sel yang berbeda.
Pada transduksi, DNA bakteri dibawa dari satu sel ke sel lain oleh faga. Terdapat dua
bentuk transduksi, yaitu tranduksi umum dan tranduksi khusus. Keduanya dihasilkan dari
penyimpangan pada siklus reproduktif faga. Faga kadangkala membawa gen-gen bakteri dari
satu sel ke sel lainnya. Pada transduksi umum, potongan-potongan yang acak dari kromosom
inang dibungkus di dalam kapsid faga. Sedangkan pada transduksi khusus, profaga keluar
dari kromosom dengan cara yang sedemikian rupa sehingga ia membawa serta gen-gen
bakteri di dekatnya. Pada kedua tipe transduksi ini, DNA yang ditrasfer dapat berkombinasi
22
Pada konjugasi, sel jantan yang mengandung faktor F mentransfer DNA ke sel F-. Sel
F+ hanya mentrasfer plasmid F saja. Konjugasi ini merupakan transfer langsung materi
genetik antara dua sel bakteri yang berhubungan sementara. Transfer DNA adalah transfer
satu arah, yaitu satu sel mendonasi DNA, dan pasangannya menerima gen. Donor DNA,
disebut juga jantan, menggunakan alat yang disebut pili seks untuk menempel pada resipien
DNA, disebut juga sebagai betina. Kemudian sebuah jembatan sitoplasmik sementara akan
terbentuk di antara kedua sel tersebut, yang menyediakan untuk transfer DNA. Pada sebagian
besar kasus, kejantanan, yaitu kemampuan untuk membentuk pili seks dan menyumbangkan
DNA selama konjugasi, disebabkan adanya potongan DNA khusus yang disebut faktor F (F
untuk fertilisasi).
Faktor F dari sel Hfr, yang terintegrasi di dalam kromosom bakteri, membawa DNA
kromosom ketika ia berpindah ke sel F-. Plasmid R menghasilkan resistensi terhadap berbagai
macam antibiotik. Transfer plasmid R di antara sel-sel bakteri bisa menimbulkan masalah
kesehatan. Trasposon, segmen DNA yang dapat memasuki banyak tempat di dalam DNA sel,
juga memiliki kontribusi terhadap terjadinya perubahan genetik pada bakteri dan eukariota.
Urutan insersi, transposon bakteri yang paling sederhana, dapat mempengaruhi fungsi gen
dimana ia bergerak. Urutan insersi terdiri dari pengulangan dalam arah yang terbalik DNA
yang mengapit gen untuk transporsase. Transposon gabungan memiliki gen-gen tambahan,
Plasmid adalah molekul DNA kecil, sirkular, dan dapat bereplikasi sendiri, yang
melakukan penggabungan reversibel ke dalam kromosom sel. Elemen genetik yang dapat
bereplikasi baik sebagai plasmid ataupun sebagai bagian dari kromosom bakteri disebut
23
episom. Selain beberapa plasmid, virus-virus temperat, seperti faga λ, juga tergolong dalam
episom. Plasmid tidak seperti virus, tidak memiliki lapisan protein dan dalam keadaan normal
tidak terdapat di luar sel. Plasmid pada umumnya menguntungkan sel bakteri, sedangkan
Plasmid hanya memiliki sedikit gen, dan gen-gen ini tidak diperlukan untuk
pertahanan hidup dan reproduksi bakteri pada keadaan normal. Walaupun demikian, gen-gen
pada plasmid dapat memberikan keuntungan bagi bakteri yang hidup di lingkungan yang
banyak tekanan. Plasmid F yang terdiri dari 25 gen, sebagian besar diperlukan untuk
memproduksi pili seks. Flasmid R yaitu gen-gen yang memberikan resistensi antibiotik pada
shigella dan bakteri patogenik lainnya. Beberapa dari gen-gen yang menimbulkan resistensi
tersebut, misalnya mengkode enzim yang secara spesifik menghancurkan beberapa antibiotik
Bentuk dasar bakteri terdiri atas bentuk bulat (kokus), batang (basil), dan spiral
(spirilia) serta terdapat bentuk antara kokus dan basil yang disebut kokobasil.
Bakteri memiliki alat gerak, yaitu berupa flagellum atau bulu cambuk. Flagellum
memungkinkan bakteri bergerak untuk menuju kondisi lingkungan yang menguntungkan dan
menghindari dari lingkungan yang merugikan bagi kehidupannya. Dilihat dari jumlah
24
BAB III
PENUTUP
3.1 Kesimpulan
1. Genetika mikroba adalah ilmu yang mempelajari tentang pewarisan sifat yang turun
3. Komponen ; DNA terdiri dari Gula : deoksiribosa dan Basa N : timin, adenin, guanin
dan sitosin. Sedangkan RNA Gula : ribosa dan Basa N : urasil, adenin, guanin dan
sitosin.
perubahan susunan asam nukleat dari DNA (gen) atau menyelipkan gen baru ke
5. Proses mutasi dipengaruhi oleh faktor intrinsic dan ekstrinsik. Faktor ekstrinsik dapat
berupa agen kimiawi, fisik, maupun agen biologis. Sedangkan faktor intrinsik dapat
6. Mekanisme pemindahan bahan genetik pada bakteri secara umum dilakukan dengan tiga
25
DAFTAR PUSTAKA
http://dewirha93.blogspot.co.id/2015/03/genetika-mikroba.html
http://mynameisobos.blogspot.co.id/2014/10/makalah-genetika-mikroba.html
http://ag1992.blogspot.co.id/2015/06/genetika-mikroba.html
26