Gambar skematis dari mekanisme ekspresi gen yang diaktifkan hormon

glukokorikoid.

Dengan tidak adanya hormon, reseptor glukokortikoid membentuk

kompleks dengan protein yang disebut Hsp90 dan tetap berada dalam sitoplasma.
Ketika terdapat hormon, akan terikat dengan protein reseptor (Hsp90 dilepaskan),
dan komplek memasukkan nukleus melalui pori-pori amplop inti sel. Komplek
hormon-reseptor kemudian mengikat (mungkin dimer) ke elemen respon
glukokortikoid (GRE) dalam penambah yang yang terletak di dekat masing-
masing gen target. Hasilnya tingkat transkripsi gen target sangat meningkat pada
hormon.

Ecdysone dan Kromosom “Puffs”pada Lalat

Pada kromosom kelenjar ludah raksasa lalat dipteran tertentu, seperti

spesies Drosophila dan Chironomus tentans, masing-masing pita kromosom
mengalami perubahan morfologis yang mencolok pada waktu tertentu selama
perkembangan. Pita-pita individual berekspansi menjadi struktur-struktur
pewarnaan difus yang tidak terlalu padat yang disebut “puffs”. Fenomena ini
sering disebut “puffing”.
 Gambar “Puffs”

Fotomikrograf (a) dan autoradiograf (b) dari polytene kromosom kelenjar

ludah IV dari lalat Chironomus tentans, menunjukkan tiga giant puffs (panah)
yang merupakan karakteristik dari kromosom ini. Ketiga puffs ini disebut
Balbiani Ring (BR1, BR2 dan BR3). Balbiani ring 2 (berlabel BR2) adalah
embusan besar, yang telah terbukti mengarahkan sintesis transkrip RNA 75S yang
sangat besar. Molekul mRNA raksasa ini diyakini menentukan sintesis salah satu
polipeptida saliva yang besar. Template untuk 75S mRNA raksasa telah
ditunjukkan berada di BR2; ditunjukkan dengan memurnikan radioaktif berlabel
75S mRNA dari sitoplasma poliribosom dan menggunakan mRNA berlabel BR2
untuk melakukan hibridisasi in situ dan autoradiografi.
 Gambar Ilustrasi skematis dari sekuens kromosom yang diinduksi
ecdysone pada larva Drosophila.

Ecdysone adalah hormon steroid yang bertanggung jawab untuk memicu

peristiwa yang terkait dengan berganti bulu pada banyak serangga.

Snustad
Jalur RNAi

Melibatkan molekul RNA kecil yang disebut short interfering RNAs

(siRNAs) atau microRNAs (miRNAs). Molekul-molekul ini, panjnagnya 21-28
pasangan basa, yang dihasilkan dari yang lebih besar, molekul RNA
doublestranded oleh aksi enzimatik dari protein yang doublestranded RNA
spesifik endonuklease.
 Gambar Jalur RNAi

(1) RNA untai ganda besar, molekul dipotong menjadi kecil. (2) Gangguan
pada untai ganda RNA 21-28 pasangan basa panjang. RNA kecil yang menggangu
dan protein berkumpul menjadi partikel ribonukleoprotein. (3) RNA kecil yang
mengganggu di partikel ribonukleoprotein tidak dapat menghasilkan RNA-
Induced Silencing Complex (RISC). (4) RISC menargetkan urutan dalam RNA
messenger itu saling melengkapi dengan mengganggu RNA. (5) RNA
mengganggu pasangan-pasangan RNA dengan targetnya di RNA messenger.

Sumber Gangguan Pendek RNAs dan MicroRNAs

 Gambar Regulasi Ekspresi Gen oleh Gangguan RNA

(a) Struktur batang-loop transkrip dari C. elegans microRNA gen lin-4. (b)
Pasangan-pasangan antara microRNA berasal dari transkrip lin-4 dan urutan di 3
wilayah yang tidak diterjemahkan dari lin-14 messenger RNA.

Ekspresi Gen dan Organisasi Chromatin

Kromosom eukariotik terdiri dari bagian DNA yang kira-kira sama dan
protein. Materi ini disebut kromatin. Kombinasi analisis genetik dan molekuler
telah menunjukkan bahwa sebagian besar gen eukariotik terletak di eukromatin.
Selain itu, ketika eukromatin gen artifisial dialihkan ke lingkungan
heterochromatic, mereka cenderung berfungsi normal dan dalam beberapa kasus
tidak berfungsi sama sekali.

Organisasi Molekuler dari DNA Transkripsional Aktif

Gambar Gen Beta globin manusia berada di sebuah cluster yang berukuran
28 kilobase kromosom 11.
 Gen beta globin manusia berada di sebuah cluster yang berukuran 28
kilobase kromosom 11. Setiap gen dalam kluster adalah duplikat dari gen beta
globin sebelumnya. Seiring berjalannya waktu evolusi, gen individu dalam gugus
telah menyimpang satu sama lain dengan mutasi acak hingga hari ini, masing-
masing dari mereka menyandikan sedikit polipeptida yang berbeda. Dalam salah
satu gen, mutasi yang tidak masuk akal telah menghapuskan kemampuan untuk
membuat polipeptida. Gen nonkode semacam itu disebut pseudogen.

Remodeling Kromatin

DNA yang ditranskripsi dikemas menjadi nukleosom. Namun, dalam

DNA yang ditranskripsi, nukleosom diubah oleh kompleks multiprotein yang
pada akhirnya memfasilitasi aksi RNA polimerase. Perubahan nukleosom ini
dalam persiapan untuk transkripsi disebut remodeling kromatin. Dua tipe umum
kompleks kromatin telah diidentifikasi. Satu tipe ini terdiri dari enzim yang
mentransfer gugus asetil ke asam amino lisin di posisi spesifik dalam histone
nukleosom. Sebagai kelas, enzim ini adalah disebut histone acetyl transferases
(HATs).

Metilasi DNA

Gambar Struktur 5-methylcytosine

Modifikasi kimia nukleotida juga tampaknya penting untuk regulasi gen

dalam beberapa eukariota, terutama mamalia. Dari sekira 3 miliar pasangan basa
dalam genom mamalia yang khas, sekitar 40 persen adalah pasangan basa G: C,
dan sekitar 2 hingga 7 persennya dimodifikasi dengan penambahan gugus metil ke
dalam sitosin. Sebagian besar sitosin termetilasi ditemukan dalam pasangan basa
doublet dengan struktur :
 5’ mC pG 3’

3’ GpCm 5’

Imprinting

Metilasi DNA pada mamalia juga bertanggung jawab untuk kasus-kasus

yang tidak biasa di mana ekspresi gen dikendalikan oleh asal orang tuanya.
Misalnya, pada tikus, Gen Igf 2, yang mengkode faktor pertumbuhan mirip insulin,
diekspresikan saat diwariskan dari ayah tetapi bukan dari ibu. Sebaliknya, gen
yang dikenal sebagai H19 adalah diekspresikan ketika diwariskan dari ibu tetapi
tidak dari ayah. Kapanpun ekspresi gen dikondisikan oleh asal orang tuanya, ahli
genetika mengatakan bahwa gen telah imprinted. Istilah yang dimaksudkan untuk
menyampaikan gagasan bahwa gen tersebut telah terbentuk ditandai dengan
beberapa cara sehingga ia "mengingat" dari mana orangtua itu berasal.

QUESTION AND ANSWER

Pertanyaan Dorris Ningtyas Bidarsis (170341615113)

1. Bagaimana gen nonkode dapat terjadi?

Jawab : Seiring berjalannya waktu evolusi, gen individu dalam gugus telah
menyimpang satu sama lain dengan mutasi acak hingga hari ini, masing-masing
dari mereka menyandikan sedikit polipeptida yang berbeda. Dalam salah satu gen,
mutasi yang tidak masuk akal telah menghapuskan kemampuan untuk membuat
polipeptida. Gen nonkode semacam itu disebut pseudogen.

Pertanyaan Dorris Ningtyas Bidarsis (170341615113)

2. Bagaimana mekanisme ekspresi gen yang diaktifkan hormon

glukokorikoid?

Jawab : Reseptor glukokortikoid membentuk kompleks dengan protein yang

disebut Hsp90 dan tetap berada dalam sitoplasma. Ketika terdapat hormon, akan
terikat dengan protein reseptor (Hsp90 dilepaskan), dan komplek memasukkan
nukleus melalui pori-pori amplop inti sel. Komplek hormon-reseptor kemudian
mengikat (mungkin dimer) ke elemen respon glukokortikoid (GRE) dalam
penambah yang yang terletak di dekat masing-masing gen target.