- Mengandungbanyak subunit RNA polymerase

BIOKIMIA - Susunan kromosomnya linier

1.SEL
Sel adalah bagian terkecil dari makhluk hidup
Sel terbagi menjadi 2:
a. Sel Prokariotik
Sel yang intinya tidak memiliki membran, materi inti
tersebar dalam sitoplasma (sel yang memiliki satu
sistem membran. Yang termasuk dalam kelompok ini
adalah bakteri dan alga biru
Ex. bakteri
2. ORGANEL SEL
- Dinding sel  Pelindung dan pembatas antara extra dan
intraselular, tempat melekatnya reseptor, Sebagai
penjaga kestabilan pH, kestabilan ion, dan membuang
sisa-sia hasil metabolisme sel
- Mitokondria  Respirasi Sel
- Lisosom  melakukan proses pencernaan intra sel
- Badan golgi  proses sekresi, baik itu sekresi lendir,
karbohidrat, glikoprotein, lemak, dan juga enzim.
Aparatus golgi juga berfungsi untuk membentuk lisosom.
- inti sel  replikasi Sel
- Ribosom  sistesis protein yang akan ditranspor ke
organel lainnya untuk diproses
- Sitoplasma  Cairan yang ada didalam sel
- Retikulum endoplasma, dibedakan menjadi dua :
•Retikulum Endoplasma Kasar, sebagai tempat
melekatnya ribosom.
•Retikulum Endoplasma Halus.
3. REPLIKASI SEL

Ciri :
- Tidak memiliki inti sel yang jelas karena tidak
memiliki membran inti sel yang dinamakan nucleoid
- Organel-organelnya tidak dibatasi membran
- Membran sel tersusun atas senyawa peptidoglikan
- Diameter sel antara 1-10mm
- Mengandung 4 subunit RNA polymerase
- Susunan kromosomnya sirkuler

Ex. Hewan dan tumbuhan

b. Sel Eukariotik
sel eukariotik, sel yang intinya memiliki membran.
Materi inti dibatasi oleh satu system membran
terpisah dari sitoplasma. Yang termasuk kelompok
ini adalah semua makhluk hidup kecuali bakteri dan
alga biru
a. Transkripsi
Ciri : Pengkopian atau penyalinan molekul DNA menjadi RNA
- Memiliki inti sel yang dibatasi oleh membran inti dan Yang dibutuhkan pada tahapan transkripsi:
dinamakan nucleus Enzim Helikase  memotong untaian DNA
- Organel-organelnya dibatasi membran DNA Polimerase I  mengganti RNA menjadi DNA
- Membran selnya tersusun atas fosfolipid DNA polimerase III  Replikasi dari 5’ sampai 3’
- Diameter selnya antara 10-100mm
Semoga kompre sukses ya .. Bismillah dulu sebelum sidang ,, Orang tua menunggu kabar kelulusan – IHR.
 DNA Topoisomerase II  membantu mengurangi c. Translasi
tegangan pada untai tunggal mencegah bergabungnya
kembali DNA untai ganda
RNA Primase  Membentuk untai RNA awal
DNA ligase  menempelkan DNA

- Inisiasi
Ditemukannya TATA Box

- Elongasi
RNA Polimerase bergerak sepanjang molekul DNA, dan
dilakukan perpanjangan

Proses :
DNA double helix untaian nya di buka oleh enzim helikase
, kemudian lagging dan strain strandnya ditahan agar
tidak kembali menyatu oleh DNA Topoisomerase II,
Setelah transkripsi RNA Processing , barulah pre RNA akan
kemudian proses pengkopian dilakukan oleh DNA
keluar dari inti sel kemudian akan menuju ribosome ,
Polimerase III dari 5’ KE 3’ kemudian RNA Primase akan
berdasarkan nukleotida ini :
membentuk awal pembuatan RNA, dilanjutkan oleh DNA
Polimerase II dari 3’ ke 5’ dan DNA Polimerase I
mengganti rantai Awal RNA yang dibentuk oleh RNA
Primase kemudian rantai yang terputus putus akan di
betulkan dan di tempelkan oleh DNA Ligase. Sehingga
proses pengkopian DNA menjadi m-RNA sudah selesai

b. RNA Procecing

Maka polipeptida akan terbentuk sesuai dengan Asam

Asam amino yang telah di bentuk oleh kodon dan
antikodon yang ada

4. PEMBELAHAN SEL
- MITOSIS  proses pembelahan sel yang menghasilkan 2
sel anak baru yang memiliki sifat sapa seperti induknya

Yang dibutuhkan : Guanin Triposfat & Poly A Tail

Tahapan mitosis :
mRNA hasil pengkopian dipilih berdasarkan kodon kodon
a. Profase
terterntu yang
Terjadi perubahan nukleus dan sitoplasma.
Intron  urutan nukleotida yang tidak mengkode protein
Dalam nukleus, benang benang kromatin
Exon  urutan nukleotida yang ikut mengkode protein
menebal dan memendek membentuk
Maka dari itu intron harus dihilangkan melalui proses RNA
kromosom.
Splicing oleh Spliseosome
b. Metafase

Semoga kompre sukses ya .. Bismillah dulu sebelum sidang ,, Orang tua menunggu kabar kelulusan – IHR.
 Kromosom tersebar dibidang ekuator dari sel.
Kromosom menyusun diri secara acak pada satu
bidang ekuator/ tengah tengah sel.

c. Anafase
Sentromer membelah dan kedua buah kromatid
memisahkan diri bergerak menuju kutub nya
masing masing dari spindel yang berlawanan.

d. Telofase
Terbentuk membran nukleus baru, spindel RNA : untai tunggal
menghilang dan nukleus dibentukoleh necleolar Ada 3 jenis RNA :
organizer dari sebuah kromosom. Dengan 1. mRNA
terbentuknya 2 buah nukleus baru, maka 2. tRNA
ditengah sel terjadi dinding baru . 3. rRNA

5. ASAM NUKLEAT, GEN & KROMOSOM

Nukleotida terdiri dari 5 atom karbon , dan basa nitrogen

purin (Adenin “A” & Guanin ‘G’) dan basa nitrogen
pirimidin (Cytosin ‘C’, Tymin ‘T’)

Gen : fragmen DNA/potongan DNA yang mengode satu

polipeptida atau RNA

Genom : kumpulan semua gen yang terdapat dalam

semua kromosom, termasuk daerah antar gen
(keseluruhan informasi genetik yang terdapat pada satu
spesies)

- Satu asam amino dikode oleh tiga nukleotida

- Polipeptida 350 a.a dikode oleh 1050 pb
- Gen eukariot di interupsi oleh urutan yang tidak
MONONUKLEOTIDA :
mengkode, sehingga ukurannya lebih panjang daripada
Nukleosida Monofosfat (NMP)
perhitungan diatas.
Nukleosida Difosfat (NDP)
Nukleosida Trifosfat (NTP)

Polinukleotida:
Polimer dari mononukleotida

Ada dua golongan :

Asam Deoxy ribonukleat (DNA)
- Kromosom dibentuk oleh serat kromatin
Asam ribonukleat (RNA)
- Serat kromatin dibentuk oleh nukleosom
- Nukleosom adalah gabungan protein histon dan DNA
Pada DNA dan RNA :
heliks ganda
Antara monomer dihubungkan oleh ikatan fosfodiester.
Ujung fosfat = ujung 5’
6. PROTEIN
Ujung –OH = ujung 3’
Semoga kompre sukses ya .. Bismillah dulu sebelum sidang ,, Orang tua menunggu kabar kelulusan – IHR.
- Komponen utama semua sel hidup
- Biomakromolekul yang bila dihidrolisis menghasilkan
satuan monomernya, yaitu asam amino.
Ciri Protein :
- Berat molekul besar (ribuan-jutaan)
- Umumnya terdiri dari 20 asam amino
- Terdapat ikatan kimia lain → membentuk struktur 3D
- Strukturnya tdk stabil thd pH, radiasi dan suhu
- Umumnya reaktif dan sangat spesifik
- Β-sheet : Terjadi karena adanya ikatan hidrogen
antara N-H dan O karbonil pada rantai
polipeptida yang berbeda (atau sama tapi
jaraknya berjauhan).Terdiri dari rantai-rantai
peptida yang tersusun bersisian membentuk
struktur yang menyerupai lembaran yang
terlipat-lipat.

ASAM AMINO

3. Struktur tertier  terjadi karena pelipatan struktur

sekunder akibat adanya interaksi antara rantai
samping: interaksi hidrofobik, ionik, hidrogen, dan
jembatan disulfida membentuk konformasi tiga
dimensi

4. Struktur kuarterner  Interaksi antara sub unit atau

polipeptida yang satu dengan polipeptida yang lain.
Asam amino pembentuk protein ada 20 macam. Asam
amino diklasifikasikan berdasarkan struktur dan sifat
gugus R (rantai samping).
Reaksi Protein :

Asam asam amino yang berikatan Ikatan Peptida
1. transaminasi : Proses katabolisme asam amino berupa
pemindahan gugus amino darisuatu asam amino ke
senyawa lain (keto. Asam piruvat, ketoglutarat atau
oksaloasaetat). Sehingga (keto)senyawa tersebut dirubah
menjadi asam amino. Sedangkan asam amino dirubah
menjadi senyawa keto)

KLASIFIKASI PROTEIN :
1. Struktur primer
Urutan asam amino dalam rantai protein, yang dibangun
oleh ikatan peptida (ikatan kovalen) antar asam amino
dengan asam amino lain dalam rantai polipeptida

2. Struktur sekunder
- Α-helix : Dibangun oleh ikatan hidrogen antara
suatu N-H pada ikatan peptida dan oksigen Yang berperan penting : Alanin Transminase (Alanin),
karbonil dari gugus ikatan peptida lain, dalam Glutamat transminase (Glutamat)
rantai peptida yang sama.
2. Deaminasi oksidatif : Asam glutamat dapat mengalami
deaminasi oksidatif mengunakan glutamat

Semoga kompre sukses ya .. Bismillah dulu sebelum sidang ,, Orang tua menunggu kabar kelulusan – IHR.
 dehidrogenase, menghasilkan NH4+ NADP NAD sebagai
akseptor elektron
Pembentukan Asetil koenzim A
Merupakn senyawa penghubung antra metabolisme
asam amino dengan sikulus asam sitrat(merubah menjadi
energi)
1. jalur asam piruvat
2. jalur asam asetoasetat
Semua hasil tujuannya sama, yaitu untuk mendapatkan
ATP yang dihasilkan besar, dimana untuk sintesis Asam
Amino ini dibuat 2 jalur pembentukan, yaitu Glukogenik
dan Ketogenik, dimana Jalur jalur ini sama sama
mengandalkan piruvate untuk menjadi asetil Co-A dan
jalur Acetoacetate untuk masuk kedalam siklus krebs di
mitokondria.
7. ENZIM
- Semua enzim adalah protein, tapi ada sekelompok kecil
mol. RNA yang juga bekerja seperti enzim (ribozim).
- Enzim utuh (holoenzim):
- Bagian protein (apoenzim)
- Bagian nonprotein:
o Kofaktor: Ion anorganik (Fe 2+, Mg 2+, Mn 2+, Zn 2+)
o Koenzim: Mol organik kompleks yang membantu
kerja enzim (tidak terikat kuat pada apoenzim ,
contoh: NADH.
o Gugus prostetik (mulekul organik, terikat kuat secara
kovalen pada apoenzim ), misal FADH2
CARA KERJA ENZIM
1.Lock and key (E. Fischer 1890)
Suatu enzim akan mengikat substrat tertentu karena sisi
aktif (active site) dan substrat mempunyai struktur yang
komplementer yang kaku.
2.Induced fit (Koshland)
Semoga kompre sukses ya .. Bismillah dulu sebelum sidang ,, Orang tua menunggu kabar kelulusan – IHR.
Substrat tidak secara persis cocok (fit) ke dalam sisi aktif
enzim tetapi lebih fleksibel; interaksi nonkovalen antara
enzim dengan substrat dapat mangubah struktur sisi aktif
enzim sehingga cocok dengan struktur substrat
8. KARBOHIDRAT
Karbohidrat itu :
• Biomolekul yang paling banyak ditemukan di alam
• Terdiri dari carbon (C) dan hydrate (air  H2O)
• Mempunyai rumus molekul (CH2O)n untuk
monosakarida
• Disintesis dari CO2 dan H2O dlm proses fotosintesis
• Dikenal juga sebagai sakarida
• Memiliki gugus fungsi C=O dan OH
• Merupakan senyawa polihidroksi aldehid atau
polihidroksi keton
Fungsi Karbohidrat :
• Sumber energi
• Pengikat jaringan dan dinding sel pada organisme
• Pelumas sendi kerangka, perekat antar sel dan sifat
mempunyai kekhususan antar permukaan sel
• Komponen struktural dan penyangga pada dinding sel
tanaman dan bakteri
• Sumber penyedia glukosa sementara.
Klasifikasi Karbohidrat :
• Monosakarida (1 unit monomer)
Karbohidrat yang paling sederhana dan tidak dapat
dihidrolisis lebih lanjut
Klasifikasi monosakarida
Aldosa (C1) dan ketosa (C2).
Ikatan yang ada : Ikatan Glikosida
• Disakarida (2 unit monomer)
Karbohidrat yang mengandung 2 satuan monosakarida
• Oligosakarida (3-10 unit monomer)
Karbohidrat yang jika dihidrolisis menghasilkan 3 – 10
satuan monosakarida
• Polisakarida (lebih dari 10 unit monomer)
 Karbohidrat yang jika dihidrolisis menghasilkan banyak
satuan monosakarida d. GLUKONEOGENESIS
Metabolisme karbohidrat Pembentukan glukosa dari bahan bukan karbohidrat,
Pada mamalia terutama terjadi di : hati dan ginjal
*Substrat :
1. Asam laktat dr. otot, eritrosit
2. Gliserol dr. hidrolisis Triasilgliserol dlm. jar.
lemak ( adiposa )
3. Asam amino glukogenik
4. Asam propionat pd ruminansia

•Glukoneogenesis penting sekali untuk penyediaan

glukosa
bila karbohidrat tidak cukup dlm makanan

- Siklus Kreb
Metabolisme karbohidrat terbagi menjadi :
- Metabolisme Awal karbohidrat:
a. GLIKOLISIS
Glikolisis adalah rangkaian reaksi yang mengubah
glukosa menjadi dua molekul piruvat.
Dalam keadaan Aerob : Perubahan pemecahan
glukosa  Asam piruvat  Mitokondria (Asetil CoA)
 Siklus Krebs
Dalam keadaan Anaerob : Asam Laktat
Bersifat irreversibel. Menghilangkan gugus karboksi
piruvat . Memerlukan 3 enzim (piruvat dehidrogenase,
dihidrolipoil dehidrogenase, dan dihidrolipoil
transasetilase) dan 5 koensim. Dihasilkan: 2 NADH
Siklus tersebut melibatkan kombinasi molekul asetil-KoA
dengan oksaloasetat sehingga membentuk senyawa
sitrat. Terjadi serangkaian reaksi yang melepaskan CO2
dan membentuk kembali senyawa oksaloasetat. Karena
hanya sejumlah kecil oksaloasetat diperlukan untuk
memperlancar proses konversi sejumlah besar unit asetil
menjadi CO2, oksalo asetat dianggap memainkan
peranan katalitik

Proses :
Glukosa  Glukosa-6-Fosfat  Fruktosa-6-fosfat 
Fruktosa-1,6-bisphosphate  Dihidroxyacetone
phospate dan Glyceraldehyd phospate

b. GLIKOGENESIS
Sintesis glikogen dari glukosa
Terjadi di dalam hati dan otot

c. GLIKOGENOLISIS
Proses pemecahan glikogen
* Dalam otot : tujuannya untuk mendapat energi bagi
otot
* Dalam hati : tujuannya untuk mempertahankan
kadar glukosa darah di antara dua waktu makan

Semoga kompre sukses ya .. Bismillah dulu sebelum sidang ,, Orang tua menunggu kabar kelulusan – IHR.
Asetil KoA yang merupakan hasil katabolisme dari KH, protein dan lipid, ditarik masuk ke dalam siklus as. Sitrat bersama
H2O, dan kemudian dioksidasi menjadi CO2 dengan pelepasa ekuivalen pereduksi (2H). Oksidasi 2H yang terjadi sesudah
itu di dalam rantai respiratorik menghasilkan fosforilasi berpasangan ADP menjadi ATP

Semoga kompre sukses ya .. Bismillah dulu sebelum sidang ,, Orang tua menunggu kabar kelulusan – IHR.
Keterlibatan siklus as.sitrat dalam transaminasi dan - Sentral dalam siklus oksidatif dlm respirasi, dimana
glukoneogensis. Anak panah tebal menunjukan lintasan semua makromolekul dikatabolis (Karbohidrat, Lipid
utama glukoneogenesis. dan Protein)
- Untuk kelangsungannya membutuhkan :
Berfungsi mengoksidasi hasil glikolisis mjd CO2 dan juga - NAD, FAD, ADP, Pyr dan OAA
menyimpan energi ke bentuk molekul berenergi tinggi spt
ATP, NADH, FADH2
Semoga kompre sukses ya .. Bismillah dulu sebelum sidang ,, Orang tua menunggu kabar kelulusan – IHR.
 Siklus krebs adalah sistem lanjutan dari Asam Piruvat
yang sudah dihasilkan, dimana Asam piruvat oleh
Piruvate karboxilase dirubah menjadi Acetyl Co-A, dan
Acetyl Co-A ini akan dirubah menjadi Sitrat pada proses
ini menghasilkan CO2, kemudian dilakukan transaminase
menjadi α-ketoglutamate oleh bantuan Glutamat hasil
sintesis protein, dan terkhir oleh Tyrosine Phenilalanin
dirubah menjadi Fumarate yang selanjutnya akan
menghasilkan Oxaloacetat , dan kembali kesiklus awal .
- untuk TAG yg disintesis dr hati, akan dibawa oleh VLDL
ke organ lain
- setelah mencapai organ target di kapiler TAG
akan dihidrolisis menjadi gliserol dan asam lemak
- Asam lemak bebas diserap, sisanya dibawa oleh
serum albumin ke sel lain
- Asam lemak yg telah masuk ke dalam sel
- Diubah menjadi energi
- Diubah menjadi TAG untuk disimpan di adiposa

9. LIPID
Metabolisme LIPID
– Degradasi Lipid, Oksidasi asam lemak
• Pencernaan, penyerapan dan transpot lemak
• oksidasi asam lemak
–Biosintesis Lipid
• Biosintesis asam lemak
• Biosintesis triasilgliserol
• Biosintesis fosfolipid
• Biosintesis kolesterol dan steroid

Lemak  diemulsi oleh garam empedu – disintesis oleh

liver & disimpan dlm empedu  mudah dicerna &
diserap
Transportasi  membentuk kompleks dg protein 
lipoprotein
Garam empedu terdiri dr asam empedu yg berasal dari
kolesterol
Garam empedu  bersifat amfifatik  mengemulsi
lemak  membentuk misel
Lemak  dipecah oleh lipase pankreas  hasil?

METABOLISME
Penyerapan oleh sel mukosa usus halus
•Asam lemak yg diserap disintesis kembali mjd lemak
dalam  badan golgi dan retikulum endoplasma sel
mukosa usus halus
•TAG  masuk ke sistem limfa membentuk kompleks
dgn protein  chylomicrons
Gliserol hasil hidrolisis TAG : dirubah mjd DHAP oleh
ensim :
1 Glycerol Kinase
2 Glycerol Phosphate Dehydrogenase.
Masuk ke dalam daur Glikolisis

- Chylomicron kmdn membawa TAG dari sel mukosa usus

halus ke organ lain seperti jantung, otot, dan jaringan
lemak.

Semoga kompre sukses ya .. Bismillah dulu sebelum sidang ,, Orang tua menunggu kabar kelulusan – IHR.