Anda di halaman 1dari 7

LATIHAN 1 SOAL BIOTEK

Nama : Andriyani
Nim : 150332601538

1) Apa yang dimaksud dengan:


a. Bioteknologi
Bioteknologi berasal dari kata Bios (hidup), teuchos (Alat), logos (ilmu, sehingga bioteknologi
dapat diartikan sebagai cabang ilmu yang mempelajari pemanfaatan makhluk hidup (bakteri,
fungi, virus, dan lain-lain) maupun produk dari makhluk hidup (protein bioaktif, enzim, vitamin,
asam basa organik, alkohol, dan lain-lain) dalam proses produksi untuk menghasilkan barang
dan jasa dalam meningkatkan kesejahteraan umat manusia.
b. Vektor kloning
Vektor adalah potongan DNA melingkar yang dapat dengan mudah diamplifikasi dalam E.Coli,
disimpan untuk waktu yang lama, dan mudah dimanipulasi dalam tabung reaksi. Vektor juga
memiliki arti sebagai alat yang membawa DNA ke dalam sel induk barunya yang dapat
diekspresikan/bereplikasi dalam sel induk baru (sel inang). Vektor plasmid yang khas
mengandung:
 asal replikasi yang memungkinkan untuk direplikasi di dalam sel bakteri
 penanda pilihan, misalnya kode gen beta laktamase untuk resistensi ampisilin
 beberapa situs kloning, yang dapat dibelah dengan beberapa enzim restriksi, seperti BamHI,
(G-GATCC), EcoRI (G-AATTC) atau Ncol (C-CATGG)
Agen pembawa fragmen DNA
c. Organisme transgenik
Organisme transgenik merupakan organisme yang telah disisipi atau memiliki gen asing dari
spesies organisme lain. Gen yang ditransfer dapat berasal dari spesies lain seperti bakteri, virus,
hewan, dan tanaman lain. Susunan dari materi genetik diubah dengan cara menyisipkan gen baru
yang unggul ke dalam kromosom organisme tersebut.
d. Enzim restriksi
Enzim restriksi merupakan enzim yang digunakan untuk memotong DNA secara spesifik. Enzim
restriksi yang digunakan untuk memotong insert dan vektor harus sama agar urutan basanya bisa
sesuai sehingga insert dan vektor bisa bersatu (komplemen).
2) Mengapa:
a. Organisme hasil Kawin silang bukan tergolong organisme transgenik
Karena organisme hasil kawin silang berasal dari organisme dengan spesies yang sama.
Organisme ini masih memiliki sifat yang sama dengan induknya. Organisme hasil kawin
silang menggunakan teknik hibridisasi berikatannya suatu untaian tunggal DNA atau RNA
dengan untaian komplemen yang berasal dari RNA atau DNA yang berbeda. Hasil kawin
silang ini masih dalam satu spesies. Organisme transgenik terjadi rekayasa genetik melalui
transformasi gen dari makhluk hidup ke dalam spesies yang tujuannya untuk menghasilkan
spesies yang memiliki sifat unggul yang lebih dari spesies sebelumnya.
b. Untuk membuat DNA rekombinan vektor dan gen insert harus dipotong dengan enzim
restriksi yang sama.
Pemotongan insert dan vektor menggunakan enzim yang bernama enzin restriksi. Enzim ini
merupakan enzim yang digunakan untuk memotong DNA secara spesifik. Enzim restriksi
yang digunakan untuk memotong insert dan vektor harus sama agar urutan basanya bisa
sesuai sehingga insert dan vektor bisa bersatu (komplemen). Contoh enzim EcoRI.
c. Vektor DNA harus mempunyai Ori / ARS dan gen penanda (Marker)
Ori (origin of replication) merupakan urutan tertentu dalam genom di mana replikasi dimulai
(titik awal) pada sel prokariot dan ARS pada sel eukariot. sedangkan gen penanda (Marker
Gen) adalah gen atau urutan DNA dengan lokasi yang diketahui pada kromosom yang dapat
digunakan untuk mengidentifikasi individu atau spesies. Vektor DNA tanpa Ori DNAnya
tidap dapat akan dapat direplikasi dan gen penanda untuk maintenace plasmid dalam sel.
3) Apa bedanya:
a. Biotek konvensional dan biotek modern
Bioteknologi konvensional merupakan proses bioteknologi yang mengandalkan jasa
mikroba untuk menghasilkan produk yang dibutuhkan manusia melalui proses fermentasi.
Bioteknologi konvensional tidak melakukan manipulasi organisme atau rekayasa, tetapi
menciptakan kondisi dan bahan makanan yang cocok bagi mikroba untuk berkembangan
secara optimal.
Bioteknologi modern merupakan penerapan bioteknologi yang menggunakan alat dan cara
kerja yang canggih, dilakukan dalam keadaan bersih dan steril, kualitas produk lebih baik,
dan kuantitas hasil produk yang dibuat lebih banyak dan terarah. Konsep penggunaan
bioteknologi ini lebih menekankan pada bagaimana cara memanipulasi materi genetik
mikroorganisme untuk menghasilkan clone yang lebih unggul.
b. Rekayasa genetika” teknik kawin silang” dan “teknik rekombinan DNA”
Perkawinan silang (hibridisasi) merupakan perkawinan antara dua individu yang berbeda
sifat namun masih dalam satu spesies. Bibit yang disilangkan adalah bibit yag memiliki sifat-
sifat unggul atau paling baik pada spesies tersebut.
Teknik rekombinan DNA merupakan penggabungan DNA suatu spesies dengan DNA dari
spesies lain dengan tujuan untuk mendapatkan spesies dengan sifat yang baru.
c. Plasmid dan Kosmid di Ori dan ARS
Plasmid adalah molekul DNA sirkuler (lingkaran tertutup) yang berantai ganda dan dapat
bereplikasi sendiri di luar kromosom serta tidak mengandung gen-gen esensial. Plasmid
terdapat pada organisme prokariot maupun eukariot berfungsi sebagai pembawa sifat
rekombinan pada organisme yang akan direkayasa.
Kosmid merupakan jenis hibrida plasmid urutan cos fag lambda yang digunakan untuk
membangun tempat pengumpulan genom. Kosmid dapat bereplikasi sebagai plasmid jika
memiliki ori.
Ori (origin of replication) merupakan tempat awal replikas DNA sel prokariot. Pada daerah
ini terdapat basa Adenin (A) dan Timin (T), ikatan yang terjadi di antara basa ini terdiri dari
dua buah ikatan hidrogen sehigga kemungkinan untuk memisahkan diri ketika replikasi DNA
akan lebih muddah dibandingkan dengan pasangan G-C (Guanin-Sitosin).
ARS (Autonomus Replication Sequence) merupakan tempat awal replikasi DNA sel eukariot.
Pada daerah ini banyak mengandung basa adenin dan timin.
4) Beri contoh masing-masing, apa saja manfaat bioteknologi di bidang, pertanian, kesehatan dan
lingkungan?
 Bidang pertanian
- Bakeri Ice (ice minus): bakteri yang telah direkayasa sehingga tidak membeku pada suhu
rendah. Digunakan (disemprotkan) pada tanaman agar tanaman tidak membeku pada
musim dingin.
- Tanaman tahan hama, misalnya kapas Bt dan tomat Bt.
- Golden rice: dapat meningkatkan kandungan vitamin A dalam beras.
 Bidang kesehatan
- Insulin manusia telah diproduksi secara massal dengan menggunakan bakteri E.coli.
(untuk penyakit diabetes)
- Hormon tumbuh manusia (GH) diproduksi menggunakan E. Coli dan digunakan untuk
kelainan pertumbuhan.
- Vaksin hepatitis B digunakan untuk mencegah infeksi virus hepatitis.
 Bidang lingkungan
- Bioremidiasi, proses penguraian limbah organik atau anorganik secara biologis.
- Biofertilizer: penggunaan mikroba sebagai pelarut dan pengikat hara yanng dapat
membantu meningkatkan kesuburan tanah dan membantu mengurangi penggunaan dosis
pupuk kimia yang berbahaya.
- Biodekomposer: yaitu pemberian aktivator dekomposisi yang berupa mikroba potensial
proses dekomposisi sampah-sampah organik dapat dipercepat.
5) Bagaimana caranya:
a. Menyeleksi gen target dari seluruh gen yang ada di kromosom
Dengan menggunakan marker yang proses seleksinya tidak secara langsung, sifat yang dipilih
berdasarkan penanda yang dikaitkan dengan sifat yang diminati. Gen yang diinginkan secara
langsung menyebabkan produksi protein atau RNA yang menghasilkan sifat atau fenotip
yang diinginkan sedangkan marker secara genetik terikat dengan gen yag diinginkan.
b. Memasukkan DNA rekombinan ke dalam, masing-masing : sel bakteri, sel hewan, dan sel
tanaman ?
Sel bakteri. Memasukkan DNA rekombinan ke dalam sel bakteri dapat melalui 3 cara yaitu
konjugasi (perpindahan DNA dari satu sel ke dalam sel bakteri lainnya melalui kontak fisik
antara kedua sel), transformasi (pengambilan DNA oleh bakteri dari lingkungan ke
sekelilingnya), dan transduksi (pemindahan DNA dari satu sel ke dalam sel lainnya melalui
perantara fage).
Sel Hewan. Mikroinjeksi, DNA disuntikkan langsung ke inti hewan dengan pipet yang
sangat halus. Setelah DNA ditransfer ke dalam sel, ia diintegrasikan ke dalam kromosom, dan
sel telur yang telah dibuahi ditanamkan ke dalam hewan untuk selesainya pengembangan.
Sel tanaman. Memasukkan DNA rekombinan melalui teknik mikroprojektil yaitu dengan
cara menembakkan partikel DNA secara langsung ke dalam sel tanaman menggunakan pistol
penembak gen. Selain itu dapat juga melalui teknik mikroinjeksi yaitu dengan cara
mentransfer DNA secara langsung ke dalam sel menggunakan jarum suntik yang berukuran
kecil atau mikro.

“Gene Gun” Technique


DNA coated Cell’s DNA
golden particles

Plant cell
Gene gun

A plant cell with


the new gene

Transgenic plant Cell division

c. Menyeleksi sel transforman dari sel non transforman


Sel transforman adalah sel yang berhasil menyerap DNA plasmid, sedangkan sel
nontransforman adalah sel yang tidak membawa DNA plasmid. Seleksi transforman
umumnya berdasarkan adanya marka (penanda) seleksi yang disisipkan pada plasmid. Marka
seleksi merupakan gen yang memberi karakterisrik baru pada sel transforman yang tidak
dimiliki oleh sel bukan transforman. Sel transforman dikultur pada media ampisilin maka
akan tumbuh pada cawan dengan membentuk koloni warna putih. Sedangkan sel non
transforman tidak tumbuh pada media ampisilin
Soal tambahan

1. Dalam kawin silang juga terjadi rekombinasi gen, sehingga organisme kawin silang juga
mendapatkan sifat genetik dari kedua induknya, tetapi mengapa organisme kawin silang BUKAN
TERMASUK ORGANISME TRANSGENIK?
Karena organisme hasil kawin silang berasal dari organisme dengan spesies yang sama. Dalam
kawin silang ini organisme memiliki sifat berbeda namun masih dalam satu spesies, sehingga
organisme yang dihasilkan masih memiliki sifat yang sama dengan induknya. Organisme ini masih
memiliki sifat yang sama dengan induknya. Sedangkan organisme transgenik merupakan organisme
yang gennya telah disisipi oleh organisme spesies lain, sehingga sifat yang dihasilkan tidak sama
dengan organisme awal dengan kata lain sifat yang dihasilkan lebih unggul dibandingkan organisme
sebelumnya.
2. Apa saja perbedaan (minimal 3) antara GMO mikroba, GMO Tanaman dan GMO Hewan
GMO Mikroba GMO Tanaman GMO Hewan
Dapat digunakan untuk Untuk meningkatkan mutu Terdapat double strand DNA
memproduksi vaksin, kandungan gizi. tumor virus.
penicilin dengan jangka
waktu yang relatif cepat.
Dapat digunakan untuk Dapat tahan terhadap hama Dihasilkan di induk eukariot
teknik bioremidiasi dan penyakit.
Dapat mengurangi Memiliki nutrisi yang lebih Dapat digunakan untuk
pencemaran polusi merkuri banyak daripada yang asli menghasilka obat
dan mendeteksi arsenik
dalam air minum
Meningkatkan efektivtas Dapat mengurangi Meningkatkan resisten terhadap
kerja pada fermentasi penggunaan pestisida penyakit
Gen yang dimasukkan dalam Meningkatkan produk dari
GMO tanaman dapat hewan ternak seperti daging,
mentransfer ke dalam DNA susu, dan telur lebih berkualitas
bekteri yang hidup dala tubuh
manusia sedangkan tanaman
dikonsumsi.
3. Sebutkan Ori, Marker dan daerah MCS pada plasmid pUKC630 dan peT-21a
pUKC630

MCS= SUP45

MARKER

ORI

MARKER =
Ap(3988-4845)

= AP(3988-
4845)
MCS = lac1
(714-1793)

ORI
4. Dengan Percobaan Bagaimana anda dapat membedakan antara plasmid pUKC630 dengan peT-21a
Plasmid pUKC630 dengan peT-21a dapat dibedakan melalui percobaan in silico dan eksperimen basah
dengan bantuan perangkat lunak yang menangani peta plasmid antara lain ApE, Clone Manager, Gene
Construction Kit, Geneious, Compiler Genome, LabGenius, Lasergene, MacVector, pDraw32, Serial
Cloner, VectorFriends, Vector NTI, dan WebDSV.