Keanekaragaman Jamur Endofit di Theobroma cacao (cacao) dan Pohon T.

grandiflorum (cupuacu) dan

Potensinya Untuk Promosi Pertumbuhan dan Biokontrol Penyakit Black-pod

Mikroorganisme membentuk simbiotik, mutualistis, dan jenis interaksi lainnya dengan semua hewan dan
tumbuhan di bumi. Terlepas dari kenyataan itu banyak jamur berperanan sebagai patogen tanaman.
Berbagai macam jamur termasuk spesies patogen, hidup sebagai endofit, pada intra dan interselular
daun dan jaringan pembuluh akar dan batang. Jamur endofit kaya sumber mikroorganisme yang dapat
secara langsung dan tidak langsung lebih untuk pertumbuhan dan perkembangan tanaman. Terbukti
bahwa semakin tinggi jamur endofit dalam tanaman, semakin besar kemungkinan menemukan
mikroorganisme yang memiliki efek bermanfaat pada tanaman tersebut.

Secara umum, jamur endofit lebih beragam di daerah tropis daripada daerah beriklim sedang.
Kemungiinan ini disebabkan bahwa ekosistem tropis memiliki variasi yang lebih tinggi jenis jamur dan
segala macam terkait stress terhadap faktor biotik dan abiotik juga lebih beragam dalam ekosistem
tropis. Oleh karena itu muncul ide untuk memunculkan konsep organisasi yang lebih tinggi dan lebih baik
disesuaikan dengan dinamika lingkungan mikrobiota secara spesifik.

The Black-Pod Rot (BPR) adalah penyakit terenting pada tanaman kakao (Theobroma cacao L.) seperti
yang terjadi di semua negara penghasil kakao dan kerugian di seluruh dunia. Penyakit ini disebabkan
oleh beberapa spesies dari straminipile (sebelumnya Oomycetes) genus Phytophthora, dengan
kerusakan mencapai hingga 90% dari produksi, baik secara keseluruhan gizi keadaan fisiologis dan bebas
dari semua jenis bahan kimia keadaa biologis.

Tujuan dari penelitian ini adalah untuk menilai keanekaragaman hayati culturable dari endofitik jamur
di dua spesies Theobroma terkait (kakao dan cupuacu), dan mencari endofitik dengan potensi biokontrol
terhadap Phytophthora palmi-vora, agen penyebab penyakit BPR kakao di neotropical daerah penghasil
kakao Brasil.

Percobaan ini dilakukan pada daerah lapangan dan fasilitas baik di Instituto Nacional de Pesquisas da
Amazonia (INPA, Manaus-AM) dan Almirante Cacau Ltd (Itajuı'pe-BA) yang terletak di Amerika dari
Amazonas dan Bahia. Sekitar 60 pohon Theobroma cacao L. (kakao) dan 10 dari Theobroma
grandiflorum (Willd. Ex Spreng.) K. Schum (cupuacu) dari Negara Amazonas dari utara Brasil (beberapa
tanaman cacao berasal dari Bahia Negara, timur laut Brasil) yang digunakan untuk isolasi endofitik jamur.
Tanaman dipilih atas dasar empat kriteria: penampilan yang sehat, keanekaragaman jamur di
Theobroma spp. dan biokontrol hitam-pod busuk. Isolasi jamur terdiri jaringan internal dari cabang dan
ranting dan kulit batang dengan menggunakan pisau bedah yang telah dibakar. Dari setiap tanaman,
jaringan kolektif yang dipotong, dipindahkan ke cawan Petri yang berisi media 20 mL kentang dekstrosa-
agar (PDA rebusan 40 g kentang, 20 g dekstrosa dan 20 g agar-agar per liter air). Baru muncul miselium
disubkultur setiap hari. Jamur endofit culturable ini diberi label dan disimpan dalam silika gel.

Kesimpulannya, penelitian ini menunjukkan bahwa pohon Theobroma (kakao dan cupuacu) memiliki
keragaman besar jamur endophytes sebagai konsekuensi di daerah tropis. Dalam pengertian ini,
tingginya jumlah culturable isolat dari batang dan cabang menunjukkan beberapa derajat kontrol dengan
kegiatan antagonistic signifikan, namun hasil yang diperoleh tidak begitu kuat. Disarankan bahwa perlu
dilakukan pendekatan yang bertujuan meng-isolasi dan biokontrol yang efektif dalam mengidentifikasi
potensi BCA terhadap penyakit Phytophthora. Selain itu, disediakan sarana untuk lebih mempelajari
beberapa aspek pada tanaman inang yang berinteraksi dengan endofit untuk merancang efisien dan
berkelanjutan untuk mencapai hasil tanaman kakao yang sehat dan produktif.