ENZIM, KINETIKA ENZIM DAN

PENGENDALIANNYA

Prof. DR. Suhartati, dr., MS

1
ENZIM :
PROTEIN  BIOKATALISATOR

ALUR METABOLIK

E1 E2 E3 E4 E5 E6 E7
A B C D E F G P

 A = substrat awal
 P = produk akhir
 B,C,D,E,F,G = senyawa2 antara (intermediates)
 E1 searah
E. regulator
LETAK ENZIM DALAM SEL
 BERKAITAN DGN FUNGSI ORGANEL Ybs.
 E. MITOKONDRIAL  REAKSI PENGADAAN ENERGI
Rantai respirasi [ dalam mitokondria
 E. RIBOSOMAL  SINTESIS PROTEIN

KATALISATOR  mempercepat reaksi

 IKUT SERTA DALAM REAKSI KIMIA & MEMPERCEPAT REAKSI
KIMIA, TETAPI PADA AKHIR REAKSI AKAN DIDAPAT KEMBALI
SEPERTI SEMULA
 DIBUTUHKAN DALAM. JUMLAH KECIL

CELAH AKTIF

E
+ S
+
P
KOMPLEKS [ES] E
 ACTIVE SITES
Enzyme molecules contain a special pocket or cleft called the
active sites. {Celah Aktif}
Active Site

6
 KATALISATOR ENZIM
INORGANIK
1. H+, OH- 1. PROTEIN  biokatalisator
2. E. aktivasi  2. E aktivasi 
3. - 3. BEREAKSI SPESIFIK
4. - 4. TIDAK TAHAN PANAS
 kead. transisi

G E. level tanpa katalisator

Ea
=

dgn katalisator inorg

E. bebas
Ea'
dgn enzim

Ea''
kead. awal G = Perubahan
E. bebas

kead. akhir

Perjalanan
reaksi
 A+B C+D
ΔG = 0  seimbang ( equilibrium )
ΔG < 0  Rx ke kanan bersifat eksergonik
ΔG > 0  Rx ke kanan bersifat endergonik

Keadaan transisi : saat awal ikatan kimia akan terbentuk dan terjadi
perubahan geometrik  enzim menstabilkan keadaan transisi dgn
menurunkan energi aktivasi  enzim berikatan kuat dgn molekul yg
dalam keadaan transisi

9
Ea = ENERGI AKTIVASI
 JUMLAH ENERGI YG DIPERLUKAN UNTUK MEMBAWA SEMUA
MOLEKUL DLM. 1 MOLE SUATU BAHAN PD. SUATU SUHU TERTENTU
DR. KEADAAN AWAL MENUJU KEADAAN TRANSISI
 MENGATASI HAMBATAN ENERGI

ΔG : PERUBAHAN ENERGI BEBAS

 TIDAK DIPENGARUHI KATALISATOR
KLASIFIKASI & TATANAMA ENZIM

NAMA ENZIM
 DULU  SEDERHANA
Mis: EMULSIN, PTYALIN
 ‘S’ + ASE
Mis: UREASE, LIPASE
JENIS REAKSI + ASE
Mis: TRANSFERASE, DEHIDROGENASE
‘S’ + JENIS REAKSI + ASE
Mis: MALAT DEHIDROGENASE
‘S’ Jenis reaksi
 TATANAMA ENZIM IUBMB:
1. REAKSI & ENZIMNYA DIBAGI DALAM 6 KELAS UTAMA
2. NAMA ENZIM TERDIRI 2 BAGIAN:
Bgn. 1  NAMA SUBSTRAT
Bgn. 2  JENIS REAKSI + ASE

11
KLASIFIKASI & TATANAMA ENZIM

Mis:
1.1.1.1 Alkohol : NAD Oksidoreduktase
= alkohol dehidrogenase
3. INFORMASI TAMBAHAN DALAM ( )
Mis:
 1.1.1.37 L-MALAT : NAD OKSIDOREDUKTASE
(decarboxylating)
L-MALAT + NAD+  PIRUVAT + CO2 + NADH + H+
 1.1.1.37 L-MALAT : NAD OKSIDOREDUKTASE
L-MALAT + NAD+  OKSALOASETAT + NADH + H+
4. NOMOR KODE SISTEMATIK
Mis : EC.2.7.1.1 enzim yg dimaksud : heksokinase
Transferase Akseptor gugus alkohol
Transfer fosfat

 -D-GLUKOSA Heksokinase/Glukokinase -D-GLUKOSA 6-P

Mg++
ATP ADP
 KELAS-KELAS ENZIM MENURUT IUBMB

ADA 6 KELAS (GOLONGAN) UTAMA :

1. OKSIDOREDUKTASE : sub kelas : dehidrogenase, oksidase, reduktase,
peroksidase, katalase, oksigenase, hidroksilase.
 MENGKATALISIS REAKSI OKSIDASI – REDUKSI.
P.U. : ENZIM PADA PROSES OKSIDASI BIOLOGIS
Laktat dehidrogenase
PIRUVAT + NADH + H+ LAKTAT + NAD+

2. TRANSFERASE : sub kelas : transaldolase, transketolase , kinase,

fosfomutase, ( asil, metil, glukosil, & fosfo ) transferase
 MENGKATALISIS TRANSFER/PEMINDAHAN GUGUS FUNGSIONAL
(BUKAN HIDROGEN) ANTARA SEPASANG SUBSTRAT
S–G + S’ S’–G + S

Heksokinase
-D-GLUKOSA+ATP Glukokinase -DGLUKOSA-6-P +ADP
Mg++
 KELAS-KELAS ENZIM MENURUT IUBMB

5. ISOMERASE :
 MENGKATALISIS PENYUSUNAN KEMBALI INTRAMOLEKULER
All Trans – retinin 11 – cis – retinin

6. LIGASE :
 MENGGABUNGKAN 2 MOLEKUL, DISERTAI PEMUTUSAN IKATAN
PIROFOSFAT PD. ATP ATAU SENYAWA SEJENIS
Mis :
~ PIRUVAT KARBOKSILASE :
O O
|| ||
– OOC – C – CH + CO – OOC – C – CH – COO –
3 2 2

PIRUVAT ATP ADP+Pi OKSALOASETAT

14
International CLASSIFFICATION of enzymes

Transfer of electron [ hydride ion or H atom

15
 KEKHUSUSAN ENZIM

BILA ADA KESESUAIAN ANTARA CELAH AKTIF DGN.

SUBSTRAT PD. STRUKTUR 3 DIMENSINYA MAUPUN
GUGUS REAKTIF YG. DIMILIKI KEDUANYA.

16
~ GUGUS REAKTIF ASAM AMINO  GUGUS YG. PUNYA POTENSI UNTUK
BEREAKSI, TDP. PD. RANTAI ‘R’.
H
SH R – C – COO– OH
| R | | R
CH2 NH3+ CH2
| |
H3+N – C – COO– H3 N – C – COO–
+

| |
H H
Cysteine (Cys) C Serin (Ser) S
SISTEIN
S
~
E

• GUGUS REAKTIF YG. BERPERAN LANGSUNG PD. PROSES KATALISIS ADALAH

GUGUS REAKTIF PD. CELAH AKTIF
• – LOGAM BERAT  MENGIKAT GUGUS –SH  E MENJADI INAKTIF
Hg++
17
 CELAH AKTIF (ACTIVE SITE)
• CELAH KATALITIK
• CELAH PENGIKAT ‘S’

CELAH AKTIF TERBENTUK O. K. ADANYA STRUKTUR TERSIER

PD. CELAH AKTIF DIDAPATKAN GUGUS2 REAKTIF DARI ASAM2
AMINO YG. AKAN MELAKUKAN REAKSI KATALITIK.
ASAM2 AMINO TSB. MUNGKIN BERJAUHAN DLM. STRUKTUR
PRIMERNYA, TTP. BERDEKATAN DLM. STRUKTUR TERSIERNYA.
GUGUS2 REAKTIF DI CELAH AKTIF :
 GUGUS2 PENGIKAT S
 GUGUS2 KATALITIK

18
 MEKANISME KATALISIS ENZIM

+ E
+
S
MOLEKUL MOLEKUL
P
BESAR KECIL Kompleks ES

 ACTIVE SITE (BENTUK CELAH)

= CATALYTIC SITE
= SUBSTRATE BINDING SITE

GUGUS2 PENGIKAT ‘S’
GUGUS2 KATALITIK

GUGUS REAKTIF ASAM2 AMINO DI DAERAH TSB.

19
 TEORI KUNCI & ANAK KUNCI  FISHER

 TEORI KESESUAIAN IMBAS (KOSHLAND)

PENGIKATAN S PERUBAHAN KONFORMASI

(SUSUNAN ATOM DLM RUANG)

• BENTUK BERPASANGAN TERJADI SETELAH E MENGIKAT S

20
TEORI KOSHLAND

21
 KOFAKTOR

ENZIM :
 SEDERHANA  PROTEIN SAJA
 YG. LEBIH KOMPLEKS  PROTEIN + KOFAKTOR
KOFAKTOR :
 SENYAWA NON ORGANIK : LOGAM
 SENYAWA ORGANIK NON PROTEIN YG. SPESIFIK (KOENZIM)
IKATAN ENZIM – KOFAKTOR :
 ADA YG. KUAT (KOVALEN)
 ADA YG. LEMAH
ENZIM YG. PERLU KOFAKTOR HARUS MENGIKAT
KOFAKTORNYA TERLEBIH DAHULU SEBELUM
MELAKUKAN PROSES KATALISIS.
Mg++
Ex. : GLUKOSA + ATP GLUKOSA–6P + ADP
Heksokinase

22
CO FACTOR

23
 KOFAKTOR LOGAM

~ IKATAN KUAT / KOVALEN : METALLO-ENZIM

~ IKATAN YG. LEMAH
FUNGSI :
1. IKUT LANGSUNG PD. PROSES KATALISIS
~ GUGUS KATALITIK
2 STABILISATOR TEMPAT KATALISIS
3 MENDEKATKAN KEDUDUKAN‘S’ DAN ‘E’
L
 E–S–L  E |
 L–E–S S
 E–L–S
 Zn++  KARBOKSIPEPTIDASE
 Mg++  HEKSOKINASE
 Fe++ / Fe+++  SISTEM SITOKROM

24
 APOENZIM : - BAGIAN PROTEIN DR. ENZIM
- JK. SENDIRIAN  TIDAK AKTIF

 IKATAN :
• KUAT / KOVALEN : GUGUS PROSTETIK
H2O2 + H2O2 Katalase 2H2O + O2
 KATALASE : GUGUS PROSTETIKNYA SUATU HEME
 SELAMA E BEKERJA, HEME MENGALAMI OKSIDASI DAN REDUKSI

mengandung Fe

• LEMAH : KO-SUBSTRAT  perlu energi dari hidrolisis ATP , tapi

tanpa memasukkan fosfat ke produk

25
26
 • LEMAH : KO-SUBSTRAT
PIRUVAT + NADH + H+ LAKTAT + NAD+
Laktat Dehidrogenase
S Ko-substrat

- MENGHUBUNGKAN 2 MACAM REAKSI DGN. 2 MACAM ENZIM

Pd GLIKOLISIS :
Gliseraldehid 3-P 1,3-Bisfosfogliserat
S + NAD+ P + NADH + H+
+ Pi
KE R.R. (O2)
Bila O2  / anaerob :

PIRUVAT + NADH + H+ LAKTAT + NAD+

LDH

27
 FUNGSI KOENZIM
 PERANTARA PEMBAWA GUGUS, ATOM TERTENTU ATAU
ELEKTRON
R.R
CONTOH:
S  NAD+  FAD
• NAD+ 
• NADP+ KoQ
• FMN ATOM H 
Sistem sitokrom
• FAD

• KoQ ½ O2
• ELEKTRON : HEME
• GUGUS LAIN :  ATP  FOSFAT
 PIRIDOKSAL FOSFAT  –NH2
VITAMIN B TERMASUK KOENZIM
• TPP  THIAMIN
• NAD  NIASIN
• NADP  NIASIN
• FAD  RIBOFLAVIN
• KoA  ASAM PANTOTENAT

28
 PROENZIM=ZYMOGEN
ENZIM YG. DISEKRESI DALAM BENTUK YG. BELUM AKTIF
TUJUAN :
 MELINDUNGI ORGAN TUBUH
 MENYEDIAKAN BAHAN SETENGAH JADI
CONTOH : PEPSINOGEN
UNTUK MENGAKTIFKAN DIGUNAKAN ENZIM PROTEOLITIK ATAU
H+

PEPSINOGEN PEPSIN
H+ / PEPSIN
H+ / Enzim proteolitik

PEPSINOGEN

PEPSIN

29
30
 ISOZIM
 MENGKATALISIS REAKSI YG. SAMA
 CONTOH : LAKTAT DEHIDROGENASE (LDH)

• T.D. 4 RANTAI POLIPEPTIDA

• 2 JENIS RANTAI : M
H

 ISOZIM LDH ADA 5 :

I1=H4 I2=H3M I3=H2M2 I4=HM3 I5=M4

 M & H : SUSUNAN ASAM AMINO BERBEDA

 DISTRIBUSI ISOZIM DLM. JARINGAN BERVARIASI
 DAPAT MEMBANTU DIAGNOSIS PENYAKIT
 SIFAT FISIK, KIMIA, IMUNOLOGIS  SEDIKIT BEDA
31
 PENGUKURAN KADAR ENZIM DLM. PLASMA
 UNTUK MEMBANTU DIAGNOSIS

ENZIM PLASMA FUNGSIONAL ENZIM PLASMA NON FUNGSIONAL

(YG. BERFUNGSI DLM. PLASMA) (YG. BERFUNGSI DI JARINGAN LAIN,
TIDAK DLM. PLASMA)

MIS. :
N : PERGANTIAN SEL (SEL MATI
 ENZ.2 PROSES PEMBEKUAN DIGANTI SEL BARU)
DARAH
DIFFUSI PASIF
 LIPOPROTEIN LIPASE

 : SEL MATI 
KADAR  :  RADANG
 GANGGUAN PROSES SINTESIS DI  Ca
HATI
 TRAUMA
 / (-) : KELAINAN GENETIK  PENYAKIT GENETIK
 DEFISIENSI F VIII : HEMOFILIA (CONTOH: DMD)

 GEN : SUATU SEGMEN DNA YG. BERISI INFORMASI/KODE

GENETIK SUSUNAN ASAM AMINO, SUATU RANTAI POLI-
PEPTIDA/PROTEIN  mRNA  POLPEPTIDA/PROTEIN
32
 PEMERIKSAAN ENZIM PD. PENYAKIT GENETIK :

 DEFISIENSI FENILALANIN HIDROKSILASE

FENIL KETON URIA

 DMD = DUCHENNE MUSCULAR DISTROPHY
BMD = BECKER M. DISTROPHY
GEN DISTROFIN CACAT x°y
DISTROFIN CACAT
SEL OTOT RUSAK

CREATIN KINASE 

PEMERIKSAAN [E]  DALAM SERUM

33
 KELAINAN GENETIK : DEFISIENSI G6PD

PD. ORANG NORMAL ENZIM G6PD >> TDP. PD : KELENJAR

ADRENALIS, JARINGAN LEMAK, ERITROSIT & KELENJAR
MAMMAE (LAKTASI) DLM. SERUM SEDIKIT SEKALI
DEFISIENSI G6PD : ERITROSIT MUDAH HEMOLISIS BILA
TERPAPAR BAHAN OKSIDAN (Mis : PRIMAQUIN)
PEMERIKSAAN KADAR G6PD : DLM. ERITROSIT  DEFISIEN-
SI G6PD  KADAR G6PD DLM. DARAH .
 G6PD  NADPH (HMP SHUNT)  GSH  MENGHILANGKAN H2O2

34
 CACAT ENZIMATIK GENETIK

Enz.1 Enz.2 Enz.3 Enz.4

• A B C D E P

BILA GEN ENZ. 4 CACAT  [ENZ. 4] <  PENUMPUKAN METABOLIT D,C,B,A 

• FENIL KETON URIA : DEFISIENSI ENZ. FENILALANIN HIDROKSILASE


PENUMPUKAN METABOLIT ()

KERUSAKAN SEL2 SARAF

MENTAL RETARDASI
KELAINAN GENETIK ?
 PREMARITAL COUNSELLING
 PRENATAL COUNSELLING
 HAMIL  amniosintesis dsb
 NEONATUS  SCREENING TEST (UJI SARING)

PERAWATAN KHUSUS
DIET KHUSUS mis : FENIL KETONURIA
TERAPI GEN ? MASIH TAHAP PENELITIAN 35
 DNA SEL

 DNA INTI (KROMOSOM) : ½ DARI IBU; ½ DARI BAPAK.

23 pasang kromosom mengandung

banyak GEN
dari bapak dari ibu
 DNA MITOKONDRIA
MENGANDUNG SEDIKIT GEN

ASAL : DARI IBU SAJA OLEH KARENA PADA SPERMA DNA MITOKONDRIA
TERLETAK DIBGN EKOR
MOLEKUL DNA GEN a GEN b GEN c

TRANSKRIPSI
mRNA
TRANSLASI

1 RANTAI POLIPEPTIDA/PROTEIN

3 nukleotida  1 asam amino

36
Hb TERDIRI DARI 2 RANTAI 
2 RANTAI 

Hb dikode oleh 2 gen  gen  dan gen 

37
38
KINETIKA
ENZIM

39
FILTER

40
SUMBER CAHAYA :
PUNYA BANYAK SPEKTRUM

FILTER / MONOCHROMATOR :
 UNTUK MENDAPATKAN BERKAS SINAR / SPEKTRUM
YANG DIINGINKAN

SLIT : MENINGKATKAN KEMURNIAN KROMATIK

( λ = PANJANG GELOMBANG )

KUVET : BERISI LARUTAN YANG DIPERIKSA

 SINAR YANG DITERUSKAN DARI KUVET AKAN
MENUJU KE FOTOSEL

41
FOTOSEL :  MENGUBAH ENERGI SINAR MENJADI ENERGI LISTRIK

GALVANOMETER :
 MENGUBAH ENERGI LISTRIK MENJADI ENERGI
MEKANIK  MENGGERAKKAN JARUM

TRANSMITTANCE : 0 -100%
ABSORBANCE = OD (OPTICAL DENSITY)
= EXTINCTION = 2 - LOG T

42
 TRANSMITTANCE :
 SESUAI SINAR YANG DITERUSKAN

ABSORBANCE
 SESUAI SINAR YANG DISERAP

 Misalkan T = 100% maka Abs = 2 – L0G 100 = 0

T = 10%  Abs = 2 – LOG 10 = 1

ABSORBANCE TERGANTUNG
 SIFAT
 KADAR
BAHAN/ LARUTAN YANG DIPERIKSA

43
 Abs ~ KADAR ( BERBANDING LURUS )

BL = BLANK
ST = STANDARD
U = UNKNOWN
BL ST U

SEBAGAI TITIK 0 ALAT SPEKTROFOTOMETER :

AQUADEST/ AQUABIDEST ATAU BLANK ( BERISI REAGEN SAJA )

ST: LARUTAN STANDARD YANG SUDAH DIKETAHUI KADARNYA

U : BAHAN / LARUTAN YANG AKAN DIPERIKSA KADARNYA

44
 MENGUKUR KADAR/ AKTIVITAS ENZIM

JUMLAH ENZIM :  SEDIKIT ( KADARNYA KECIL )

 ISOLASINYA SULIT

JADI YANG DIUKUR BIASANYA ADALAH AKTIVITAS

KATALITIK ENZIM TERSEBUT

AKTIVITAS KATALITIK DAPAT DIUKUR DARI:

 JUMLAH PRODUK YANG TERBENTUK / WAKTU TERTENTU
 JUMLAH SUBSTRAT YANG TELAH DIUBAH / WAKTU TERTENTU

45
 CARA MENGUKUR AKTIVITAS ENZIM

PENGUKURAN KADAR/ AKTIVITAS ENZIM

MACAM-MACAM CARA:

1. DENGAN CARA MEMBANDINGKAN DENGAN AKTIVITAS

ENZIM MURNI : [E] ~ [vo] ASAL [E] << [S]

2. MENGUKUR DALAM UNIT MENURUT PERJANJIAN. IUBMB :

1 INTERNATIONAL UNIT (IU ) ENZIM ADALAH JUMLAH ENZIM
YANG MENGKATALISIS PEMBENTUKAN 1 MIKROMOL PRODUK /
MENIT PADA KONDISI YANG TERTENTU.
= MENGUBAH 1 MIKROMOL SUBSTRAT/ MENIT

46
3. UNTUK ENZIM DEHIDROGENASE
NAD+  NADH + H+
NADP+  NADPH + H+

1 UNIT DEHIDROGENASE :
YANG MEMBERI PERUBAHAN OD PADA λ 340 nm
SEBESAR 0.001 PER MENIT

4. LAIN-LAIN

47
 PROGRESS CURVE
DIUKUR DENGAN SPEKTROFOTOMETER

LARUTAN
ENZIM

DIIKUTI SECARA
KONTINU
Abs P

O
α
• LARUTAN PENYANGGA O t (waktu)

• pH TERTENTU • Abs P (PRODUK) DAPAT

• [ So ] DIKONVERSI MENJADI P

• DLL • P = Δ S [ JUMLAH SUBSTRAT

YANG TELAH DIUBAH ]
• SUHU TERTENTU
• λ TERTENTU 48
 PROGRESS CURVE

 Hubungan antara P dengan t

R’  Hubungan antara Δ S dengan t
 Hubungan antara abs P dengan t
P
 vo = tangens α = R’R / OR
O
α R
O t (waktu)
 PROGRESS CURVE MULA-MULA
BERBENTUK LURUS, LALU BERBELOK
 Sebab:
R’  Jumlah substrat makin lama makin sedikit
 Adanya mekanisme hambatan oleh produk
P (product inhibition)
A P
O
α R E Θ
O t (waktu) 49
 MACAM-MACAM KECEPATAN

 KECEPATAN SESAAT
C”
 vsesaat di suatu titik merupakan
tangens sudut yang dibentuk
C’ β oleh grafik di titik itu dengan
sumbu X
α
B’ C*  vsesaat = - dS/dt
P = dP/dt

α  vsesaat di titik o disebut vo atau

O
B kecepatan awal = tg α
O t (waktu)

50
  KECEPATAN RATA-RATA

C’  vrata-rata di titik B = B’B/OB

B’ C*  vrata-rata di titik C = C’C/OC

P
 vrata-rata di titik B > vrata-rata
di titik C
α C
B
0
t (waktu)

51
  KECEPATAN SESAAT PADA to
vo = tg α = C”C / OC
C” PADA TITIK B

vsesaat = C”C* / BC* = tg α

C’
β PADA TITIK C

B’ α vsesaat = tg β < tg α
C*
P
vrata-rata
α B C
0 PADA B = B’B / OB = tg α
t (waktu)
PADA C = C’C / OC < tg α

52
 JADI PADA AWAL PROGRESS CURVE WAKTU GRAFIK MASIH LURUS
 KECEPATAN RATA-RATA PADA TIAP TITIK =
KECEPATAN SESAAT = vo = tg α

 vo ATAU KECEPATAN AWAL (INITIAL VELOCITY) ADALAH

KECEPATAN SESAAT DI TITIK 0.
 PADA to KADAR SUBSTRAT = [ So ]  MASIH 100%

 vo DIUKUR DENGAN CARA MENGUKUR TANGENS SUDUT

YANG DIBENTUK GRAFIK DGN SUMBU X DI TITIK 0.

 vo MERUPAKAN TANGENS BAGIAN AWAL PROGRESS CURVE

YANG MASIH LURUS

53
 FAKTOR-FAKTOR YANG
MEMPENGARUHI KERJA ENZIM

 KADAR ENZIM
 KADAR SUBSTRAT
 pH
 SUHU
 EFEKTOR :  EFEKTOR POSITIF = AKTIVATOR
 EFEKTOR NEGATIF = INHIBITOR

54
 PENGARUH KADAR ENZIM

vo berbanding lurus dengan kadar E

Syarat : [ E ] << [ S ]
1U 2U 4U

to

4U
P 2U
t1

vrata-rata
1U

t2

0
 t1 t2 0
t 1U 2U 4U
Unit E
55
 Larutan E murni Larutan U

BL ST U

Larutan buffer, dll. Larutan buffer, dll. Larutan buffer, dll.

[ So ] [ So ]

 Buat progress curve larutan ST dan ukur vonya

 Buat progress curve larutan U dan ukur vonya
 Dengan membandingkan besarnya vo kita dapat
mengukur kadar E di dalam larutan U
 Vo ~ [E] asal [E] << [S]
56
57