Langkah-langkah Transkripsi Dari DNA ke RNA

DNA atau asam deoksiribonukleat adalah molekul yang mengkode informasi genetik.
Namun, DNA tidak dapat secara langsung memesan sel untuk membuat protein. DNA harus
ditranskripsi terlebih dahulu menjadi RNA atau asam ribonukleat. RNA kemudian ditranslasi
oleh sistem seluler untuk membuat asam amino, yang bergabung bersama untuk
membentuk polipeptida dan protein

Gambar 1. Jalur dari DNA ke protein. Aliran informasi genetik dari DNA ke RNA (transkripsi)
dan dari RNA ke protein (translasi) terjadi di semua sel hidup.

Transkripsi
Transkripsi adalah tahap pertama ekspresi gen menjadi protein. Dalam transkripsi,
perantara mRNA (messenger RNA) ditranskripsi dari salah satu untai molekul DNA. RNA
disebut messenger RNA karena membawa "pesan," atau informasi genetik, dari DNA ke
ribosom, di mana informasi tersebut digunakan untuk membuat protein. RNA dan DNA
menggunakan pengkodean komplementer di mana pasangan basa cocok, mirip dengan
bagaimana untaian DNA mengikat untuk membentuk heliks ganda.
Gambar 2. Transkripsi DNA menghasilkan molekul RNA untai tunggal yang saling melengkapi
satu untai DNA.

Satu perbedaan antara DNA dan RNA adalah RNA menggunakan urasil sebagai
pengganti timin yang digunakan dalam DNA. RNA polimerase memediasi pembuatan untai
RNA yang melengkapi untai DNA. RNA disintesis dalam arah 5 '-> 3' (seperti yang terlihat
dari transkrip RNA yang berkembang). Ada beberapa mekanisme proofreading untuk
transkripsi, tetapi tidak sebanyak replikasi DNA. Terkadang kesalahan pengkodean terjadi

Perbedaan dalam Transkripsi

Ada perbedaan yang signifikan dalam proses transkripsi pada prokariota versus eukariota.

Gambar 3. Eukariota mengandung nukleus yang terdefinisi dengan baik, sedangkan pada
prokariota, kromosom terletak di sitoplasma di daerah yang disebut nukleoid.
 Pada prokariota (bakteri), transkripsi terjadi di sitoplasma. Terjemahan mRNA
menjadi protein juga terjadi di sitoplasma. Pada eukariota, transkripsi terjadi pada nukleus
sel. mRNA kemudian pindah ke sitoplasma untuk ditranslasi.
DNA pada prokariota jauh lebih mudah diakses oleh RNA polimerase daripada DNA
pada eukariota. DNA eukariotik melilit protein yang disebut histones untuk membentuk
struktur yang disebut nukleosom. DNA eukariotik dikemas untuk membentuk kromatin.
Sementara RNA polimerase berinteraksi langsung dengan DNA prokariotik, protein lain
memediasi interaksi antara RNA polimerase dan DNA pada eukariota.
RNA polymerase adalah enzim yang mentranskripsi DNA menjadi RNA.
Menggunakan template DNA. Sebagai contoh, apabila terdapat G pada template DNA, RNA
polymerase akan menambahkan C pada strand RNA yang sedang disusun.

Gambar 4 . Mekanisme kerja RNA polymerase yang menyusun strand RNA menggunakan
template dari DNA dan selalu mengarah dari arah 5’ ke 3’.

mRNA yang dihasilkan sebagai hasil transkripsi tidak dimodifikasi dalam sel
prokariotik. Sel-sel eukariotik memodifikasi mRNA dengan splicing RNA, capping ujung 5 ',
dan penambahan ekor polyA.
Gambar 5. Siklus transkripsi RNA polymerase pada bakteri. Pada langkah 1, holoenzyme
RNA polimerase (faktor enzim plus enzim polimerase) berkumpul dan kemudian mencari
promotor). Polimerase melepaskan DNA pada posisi di mana transkripsi akan dimulai
(langkah 2) dan mulai menyalin (langkah 3). Sintesis RNA awal ini (kadang-kadang disebut
"inisiasi gagal") relatif tidak efisien. Namun, begitu RNA polimerase berhasil mensintesis
sekitar 10 nukleotida RNA, ia memutuskan interaksinya dengan DNA promotor dan
melemahkan, dan akhirnya memutus interaksinya dengan s. Polimerase sekarang bergeser
ke mode perpanjangan sintesis RNA (langkah 4), bergerak ke kanan sepanjang DNA dalam
diagram ini. Selama mode perpanjangan (langkah 5), transkripsi sangat prosesif, dengan
polimerase meninggalkan templat DNA dan melepaskan RNA yang baru ditranskripsi hanya
ketika bertemu dengan sinyal terminasi (langkah 6 dan 7). Sinyal terminasi biasanya
dikodekan dalam DNA, dan banyak fungsi dengan membentuk struktur RNA yang
mengganggu kestabilan pegangan polimerase pada RNA (langkah 7). Pada bakteri, semua
molekul RNA disintesis oleh satu jenis RNA polimerase dan siklus yang digambarkan dalam
gambar oleh karena itu berlaku untuk produksi mRNA serta RNA struktural dan katalitik.
(Diadaptasi dari figur yang berasal dari Robert Landick.)
Gambar 6. Nukleosom pada eukariota. Berbeda dari prokariota, DNA dari eukariota melilit
protein yang disebut histone dan membentuk nucleosome. Karena perbedaan struktur
inilah mengapa DNA pada prokariota jauh lebih mudah diakses oleh RNA polimerase
daripada DNA pada eukariota.

Langkah-langkah Transkripsi
Transkripsi dapat dibagi menjadi lima tahap: pra-inisiasi, inisiasi, elongasi, dan
terminasi:

1. Pra-inisiasi
Langkah pertama transkripsi disebut pra-inisiasi. RNA polimerase dan kofaktor
(faktor transkripsi umum) mengikat DNA dan mengurainya, menciptakan gelembung
inisiasi. Ruang ini memberikan akses RNA polimerase ke untai tunggal molekul DNA.
Sekitar 14 pasangan basa terpapar pada satu waktu.

2. Inisiasi
Inisiasi transkripsi pada bakteri dimulai dengan pengikatan RNA polimerase ke
promotor dalam DNA. Inisiasi transkripsi lebih kompleks pada eukariota, di mana
sekelompok protein yang disebut faktor transkripsi memediasi pengikatan RNA
polimerase dan inisiasi transkripsi. Berbeda dengan prokariota yang hanya memiliki
1 jenis RNA polymerase, Eukariota memiliki 3 jenis; RNA polymerase I, RNA
polymerase II dan RNA polymerase III. Ketiga jenis RNA polymerase ini memiliki
struktur yang serupa dan memiliki sebagian subunit yang sama namun berperan
dalam mentranskripsi gen yang berbeda-beda.
 Gambar 7. Inisiasi transkripsi dimulai dengan RNA polymerase yang mengikat DNA
pada regio yang disebut promotor. Pada dasarnya, promotor menentukan dimana
polymerase harus berikatan dan memulai proses transkiripsi

3. Elongasi
Setelah RNA polymerase sudah berada pada promotor, langkah selanjutnya yang
akan terjadi pada prosesn transkipsi adalah elongasi. Elongasi adalah tahap di mana
strand RNA menjadi lebih Panjang karena penambahan nucleotide. Selama proses
elongasi, RNA polymerase “berjalan” sepanjang strand DNA dari arah 3’ ke 5’. Untuk
setiap nucleotide pada template DNA, RNA polymerase menambahkan nucleotide
RNA yang sesuai pada ujung 3’ dari strand RNA. Satu untai DNA berfungsi sebagai
template untuk sintesis RNA, tetapi beberapa putaran transkripsi dapat terjadi
sehingga banyak salinan gen dapat diproduksi.

Gambar 8. RNA polymerase memperpanjang strand RNA dengan menambahkan nukleotida

yang sesuai menurut template DNA pada ujung 3’ dari strand RNA

4. Terminasi
terminasi adalah langkah terakhir transkripsi. Terminasi menghasilkan pelepasan
mRNA yang baru disintesis dari kompleks elongasi. Dalam eukariota, penghentian
transkripsi melibatkan pembelahan transkrip, diikuti oleh proses yang disebut
polyadenylation. Dalam polyadenylation, serangkaian residu adenin atau poly(A)
ditambahkan ke ujung 3' dari untai RNA baru. Rangkaian poly(A) ini penting dalam
menjaga kestabilan mRNA.

Gambar 9. Proses terminasi dari transkripsi DNA terjadi dengan pemutusan rantai
mRNA yang sudah selesai ditranskripsi disertai penambahan poly(A)