Universidad de los Andes

Facultad de Ingeniería
Centro de Simulación y Modelos - CeSiMo
Maestría en Modelado y Simulación de Sistemas

Estimación del coeficiente de difusión

mesoscópico en imágenes mamográficas
con presencia de lesiones tumorales.

Jonas Borjas
CI: 14928900
 RESUMEN

El presente trabajo pretende estudiar el coeficiente de difusión local, simulado

sobre imágenes mamográficas digitalizadas. Hoy en día existen muchos
métodos empleados para la determinación y diagnostico de lesiones patológicas
mamarias, dentro de los que destaca la mamografía digital, debido a su rapidez
de obtención y mayor rango dinámico en tonos de grises, sin embargo, el uso
de esta herramienta se ha limitado únicamente al campo cualitativo. Se pretende
implementar un método que permita el uso de la información contenida en una
imagen mamográfica con presencia de lesiones; para generar un método basado
en el tratamiento de imágenes y la dinámica de colisión de multipartículas,
que permita cuantificar el coeficiente de difusión en una región de interés y
eventualmente constatar la utilidad potencial de la mamografía digital en el
campo cuantitativo, dada la relación que existe entre el coeficiente de difusión y
la celularidad de los tejidos tumorales.
 INTRODUCCIÓN.
Difusión molecular.

Técnicas computarizadas comunes empleadas en la detección y estudio de lesiones

mamarias:

DTI MRI
(Diffusion Tensor Imaging) (Quantitative Diffusion Image)

Difusión Anisotrópica Difusión Anisotrópica

Análisis de
lesiones mamarias

DWI
(Diffusion Weighted Indice) Mamografía
Difusión Isotrópica (Método cualitativo)
 INTRODUCCIÓN.
La aplicación de los métodos imagenológicos
computarizados modernos resultan costosos y específicos:

• RM (especifica para caracterizar lesiones y baja

diferenciación de lesiones en tejido mamario).

• DWI (método novedoso y acertado para diferenciar

lesiones en lugares específicos como el cerebro e
hígado).
 INTRODUCCIÓN.
La mamografía digital representa el método expedito por excelencia
para detección y diagnostico de lesiones en mama.

Implica:

• Facilidad de manejo y disposición.

• Bajo costo, respecto a los otros métodos.
• Es el método imagenologico de uso mas generalizado y común.
• Combina caracterización y diferenciación en sus resultados.

Sin embargo mas allá de su aplicación como método

cualitativo, no se ha establecido su uso en la determinación
del coeficiente de difusión de lesiones mamarias.
 DIFUSIÓN MOLECULAR LIBRE O ISOTRÓPICA.

H2O

H2O

H2O
DIFUSIÓN ISOTRÓPICA APARENTE.

H2O

H2O

H2O
 DIFUSIÓN MOLECULAR ISOTRÓPICA (DWI).

La difusión isotrópica se produce de forma libre y en todas las direcciones en tejidos

biológicos organizados aleatoriamente, en general sólo se ve restringida por :

• ISQUEMIA

• VISCOSIDAD

• CELULARIDAD
 DIFUSIÓN MOLECULAR ANISOTRÓPICA.

Movimiento aleatorio de moléculas de agua a lo largo de las vainas de mielina. (Vías nerviosas
Mielinizadas)
 JUSTIFICACIÓN.
“Profundizar en torno a la aplicación de la mamografía
digital como medio cuantitativo de lesiones mamarias,
dada la naturaleza restringida que el método supone al
respecto”.

Para el alcance de la meta es necesario:

• Recolectar información digitalizada de imágenes mamográficas con lesiones de

diferentes densidades, formas y bordes.

• Considerar las características del fluido que se inoculará al sistema.

• Aplicar el tratamiento matemático correspondiente a la información obtenida

(velocidad de partículas).
 ESTADO DEL ARTE
(REVISIÓN BIBLIOGRÁFICA)
• Hatakenaka , M et al. (2008). Apparent Duffusion Coefficients of Breast Tumors:
Clinical Aplication. Magn Reson Med Sci, Vol.7, No. 1, pp 23-29.

Propone en su estudio evaluar la utilidad del coeficiente de difusión aparente (ADC), para
evaluar el diagnostico diferencial de tumores de mama, así como determinar la relación
entre la celularidad del tumor y el ADC. Llegando a la conclusión de que el ADC es en
definitiva potencialmente útil en la diferenciación de tumores benignos y malignos , y que
existe una correlación inversamente proporcional respecto a la celularidad del tumor y el
ADC. Método empleado: MR Imaging.
 ESTADO DEL ARTE
(REVISIÓN BIBLIOGRÁFICA)
• Rubesova, E et al. (2006). Quantitative Diffusion Imaging in Breast Cancer: A Clinical
Prospective Study. Journal of Magnetic Resonance Imaging, 24 : 319-324.

Estudia la correlación que puede existir entre el coeficiente de difusión aparente (ADC) y la
patología en pacientes con lesiones tumorales indefinidas, con el objeto de validar cuan
relacionado esta el ADC respecto a la histología de la lesión, además de definir un valor limite
de ADC para distinguir lesiones malignas de las benignas. Método empleado: MR Imaging.
 ESTADO DEL ARTE
(REVISIÓN BIBLIOGRÁFICA)
• Miho, I et al. (2008). Relation between cancer celularity and apparent diffusion
coeficient values using Diffusion - Weighted magnetic resonance imaging in breast
cancer. Radiat Med, DOI: 10.1007/s11604-007-0218-3.

Examina en su estudio la relación existente entre la celularidad cancerígena y el valor de

coeficiente de difusión aparente (ADC) empleando imágenes de difusión ponderada (DW) y de
resonancia magnética (RM). Concluyendo que existe diferencias significantes entre los valores
de ADC de tumores malignos y lesiones benignas. Método empleado: DW-MR Imaging.
 ESTADO DEL ARTE
(REVISIÓN BIBLIOGRÁFICA)
• Furman, E et al. (2016). Can Diffusion Tensor Anisotropy Indices Assist in Breast
Cancer Detection? Wiley Periodicals, DOI: 10.1002/jmri.25292.

Evalúa experimentalmente varios índices anisotropicos derivados de imágenes de tensores de

difusión (DTI), para verificar si pueden caracterizar la estructura de mamas sanas y
diferenciar el cáncer de tejido mamario normal. Finalmente asegura que aunque la técnica
experimental falla en la detección del cáncer, puede asistir en la diferenciación del mismo en
tejido normal de mamas, haciendo ajustes en términos de autovalores propios del tensor de
difusión .
 ESTADO DEL ARTE
(REVISIÓN BIBLIOGRÁFICA)
• Vaidehi, K et al. (ICICT 2014). Automatic Characterization of Benign and Malignant
masses in Mammography. DOI: 10.1016/j-procs.2015.02.128

Propone el desarrollo de un sistema automatizado para la caracterización de masas

mamarias (tumores) para asistir al estudio radiológico en el análisis de mamografías
digitales, empleando técnicas de segmentación y niveles cromáticos en el intervalo blanco y
negro aplicados sobre la región de interés.
 (IMPACTO SOBRE LA PROPUESTA)

Numerosos estudios y publicaciones científicas denotan la

versatilidad del coeficiente de difusión molecular para el análisis y
estudio de lesiones mamarias, en este sentido:

• El empleo de la difusión molecular es relevante y bastante acertado para el

análisis y estudio de las formaciones tumorales mamarias (lesiones). Este hecho
experimentalmente comprobado hace tomar en cuenta al fenómeno físico como el
parámetro fundamental de la investigación y desarrollo del problema propuesto.

• Se hace oportuno el empleo de una técnica cuyos resultados se encuentran

plasmados en una imagen estática, a fin de demostrar con el desarrollo de este
trabajo que es posible obtener una herramienta analítica alternativa de lesiones
mamarias.
 OBJETIVO GENERAL
“Desarrollar un método que permita el cálculo del coeficiente de
difusión en una región de interés sobre una mamografía digital”.

OBJETIVOS ESPECÍFICOS.
• Determinar las velocidad y posición de las partículas que fluyen a través del
mapa volumétrico de píxeles, generado a partir del tratamiento de una imagen
mamográfica digital y calcular el coeficiente de difusión.

• Evaluar los resultados obtenidos y compararlos con los valores determinados

por mediciones directas del coeficiente de difusión aparente, a través de otros
métodos.

• Establecer la veracidad de los resultados obtenidos, con el objeto de evaluar y

validar el desempeño del método experimental propuesto.
 METODOLOGÍA
(DINÁMICA DE COLISIÓN DE MULTIPARTÍCULAS.)
Supone un conjunto de N partículas puntuales con masa m en un volumen V=L3 .

La partícula 𝑖 tiene coordenadas continuas 𝑥𝑖 y velocidades 𝑣𝑖 y se modifican

bajo pasos de transmisión y colisión.

Paso de transmisión:

𝒙𝒊 (𝒕 + 𝝉) = 𝒙𝒊 (𝒕) + 𝒗𝒊 (𝒕)𝝉
Donde τ es un intervalo de tiempo discreto elegido.

Paso de colisión:
Las partículas 𝒊 interaccionan entre si, las velocidades se actualizan de acuerdo a:

^ 1
𝒗′𝒊 = 𝒗𝝃 + 𝝎(𝒗𝒊 − 𝒗𝝃 ) donde 𝑣𝜉 = 𝑣𝑖
𝑛𝜉
𝑖|𝑥∈𝑉
 DINÁMICA DE COLISIÓN DE MULTIPARTÍCULAS.

Fig.1 a) Propagación: partículas de fluido puntuales se mueven con movimiento balístico para cada
diferencial de tiempo, b) Colisión: las partículas son colocadas dentro de celdas cubicas de longitud de
lado ao intercambian momento unas con otras dentro de cada celda conservando el momento total.

Fig.2 Representación esquemática de la división de un sistema para la aplicación de colisión

de multipartículas.
 DINÁMICA DE COLISIÓN DE MULTIPARTÍCULAS.

La dinámica de colisión de partículas es construida, como consecuencia las leyes de

conservación de masa, momento y energía son satisfechas.
Conservación de momento.

𝑵𝝃 𝑵𝝃 𝑵𝝃
^
𝒎𝒗′𝒊 = 𝒎(𝒗𝝃 + 𝝎𝝃 |𝒗𝒊 − 𝒗𝝃 |) = 𝒎𝒗𝒊
𝒊=𝟏 𝒊=𝟏 𝒊=𝟏

Conservación de energía.

𝑵𝝃 𝑵𝝃 𝑵𝝃
𝒎 ′𝟐 𝒎 ^ 𝒎
|𝒗 | = |𝒗𝝃 + 𝝎𝝃 [𝒗𝒊 − 𝒗𝝃 ]|𝟐 = |𝒗𝒊 |𝟐
𝟐 𝒊 𝟐 𝟐
𝒊=𝟏 𝒊=𝟏 𝒊=𝟏
LEYES MACROSCÓPICAS EN LA DINÁMICA DE COLISIÓN DE PARTÍCULAS

Ecuación de difusión
𝟑𝜸
𝑫 = 𝒌𝑩 𝑻𝝉 −𝟏
(𝜸 − 𝟏 + 𝒆−𝜸 )(𝟏 − 𝐜𝐨𝐬 𝜶)

Ecuación hidrodinámica

Viscosidad cortante cinética

𝒌𝑩 𝑻𝝉𝝆 𝟓𝜸 − (𝜸 − 𝟏 + 𝒆−𝜸 )(𝟐 − 𝒄𝒐𝒔𝜶 − 𝒄𝒐𝒔𝟐𝜶)

𝜼𝒌𝒊𝒏 =
𝟐𝒎 (𝜸 − 𝟏 + 𝒆−𝜸 )(𝟐 − 𝒄𝒐𝒔𝜶 − 𝒄𝒐𝒔𝟐𝜶)

Viscosidad cortante de colisión

𝒎
𝜼𝒄𝒐𝒍 = (𝜸 − 𝟏 + 𝒆−𝜸 )(𝟏 − 𝒄𝒐𝒔𝜶)
𝟏𝟖𝒂𝝉
PARÁMETROS FÍSICOS IMPORTANTES EN LA DINÁMICA DE
MULTIPARTÍCULAS Y ESCALA DE TIEMPO ADECUADA.

Parámetros típicos de simulación en el método de colisión de multipartículas:

Densidad de partículas por celda: 𝝆 = 𝟏𝟎/𝒂𝟑

Velocidad de partícula: (Distribución Gaussiana) consistente con : 𝑻 = 𝜺/𝒌𝑩

El ángulo de rotación generalmente se escoge con una amplitud alta por ejemplo: α = 130º

La unidad de tiempo : se establece como: 𝝉 = 𝒎𝒂𝟐 /𝜺 y 𝜟𝒕 = 𝟎, 𝟏𝝉

Números adimensionales imprescindibles:

𝑺𝒄 = 𝜼𝒌𝒊𝒏 /𝑫 Número de Schmidt Tasa relativa entre el flujo viscoso y la difusión másica

𝑹𝒆 = 𝒗𝒔 /𝜼𝒌𝒊𝒏 Número de Reynolds Caracterización de movimiento del fluido

 DINÁMICA DE COLISIÓN DE MULTIPARTÍCULAS.

𝒙𝒊 (𝒕+𝝉) = 𝒙𝒊 𝒕 + 𝒗𝒊 (t )τ

𝒗′𝒊 = 𝒗ξ + ωξ 𝒗𝒊 − 𝒗ξ
Fig.3 El algoritmo básico de la dinámica de colisión de multipartículas consta de pasos
sucesivos de transmisión y colisión. La cuadrícula de células se desplaza aleatoriamente
cada paso de tiempo para restaurar la invariancia Galileana.
CONSIDERACIONES DE LA DINÁMICA DE COLISIÓN DE
MULTIPARTÍCULAS.

• Representa el medio mediante partículas puntuales.

• En la dinámica de colisión las partículas no son consideradas moléculas

individuales, en cambio en conjunto, modelan perfectamente la ecuación de Navier
Stokes, con la intervención de ruido térmico.

• Entre colisiones las partículas no interactúan entre si.

• La cantidad de movimiento y la energía son localmente conservadas .

• El método incluye por si solo las interacciones Brownianas e hidrodinámicas del

sistema analizado.
La versatilidad del método permite aplicarlo en:

• Polímeros.
• Suspensiones coloidales.
• Sistemas reactivos.
Fluidos no ideales Fluidos inmiscibles
 METODOLOGÍA
(APLICACIÓN DEL MÉTODO.)

• Captura y tratamiento de la imagen mamográfica. Por ejemplo: (EBImage).

• Obtención del mapa de bits (raster) y array de valores del mapa.
Lectura e • Volumetrización del área de interés de la imagen. (Normalización).
interpretación
de imagen

• Generar flujo de partículas a través de la región de interés. Las propiedades del

fluido y su respectivo flujo a través del medio de interés, están condicionados por
Aplicación de la la dinámica de colisión de multipartículas.
dinámica de
multipartículas
al sistema

• Cálculo del coeficiente de difusión en función de la velocidad de salida de las

partículas . Cuantificación de acuerdo a la integración de velocidades de salida de
Salida de las partículas ,del medio analizado (región de interés o lesión) .
simulación

Fig. 4. Diagrama de bloques mostrando los diferentes pasos del método propuesto.
Tratamiento de la imagen.
Vista de perfil del sistema propuesto.

Empleo de MPC Dynamics para

modelar fluido y flujo a través del medio
estudiado.
Vista superior del sistema propuesto.
 METODOLOGÍA
(APLICACIÓN DEL MÉTODO.)

Región de interés

Tratamiento de la imagen

Señal
Salida de simulación
D0
MPC Dynamics

Negro Blanco
 CONCLUSIONES.

• El coeficiente de difusión es una propiedad físico química que

puede ser empleada para la caracterización de lesiones tumorales.

• La dinámica de colisión de multipartículas, es una herramienta

útil para el cálculo del coeficiente de difusión molecular, ya que
implica movimiento de partículas en el espacio continuo y toma en
cuenta los pequeños cambios en la heterogeneidad del medio de
difusión.

• La imagen mamográfica digitalizada, puede ser extrapolada a un

espacio volumétrico y puede emplearse para calcular el
coeficiente de difusión en una región de interés, esperando una
correspondencia entre la lesión tumoral y el valor del coeficiente
de difusión.