Patofisiologi keratitis berupa proses inflamasi pada kornea yang
dapat terjadi karena proses infeksi maupun noninfeksi. Proses
inflamasi ini akan menyebabkan destruksi stroma kornea sehingga berakibat pada terjadinya gangguan penglihatan dan rasa nyeri pada pasien.
Kornea mata umumnya memiliki mekanisme pertahanan terhadap
infeksi maupun trauma. Bagian epitelium pada kornea dapat menjadi pembatas yang efisien masuknya mikroorganisme ke dalam kornea. Bagian mata lainnya, seperti air mata, dan kelopak mata juga membantu mencegah terjadinya keratitis. Apabila mekanisme pertahanan dari kornea menurun maka dapat meningkatkan risiko terjadinya keratitis.