We have many types of stains, the most important are: 

Basophilic Acidophilic

Hematoxylin (H) Eosin (E)

Nucleus (always blue, if 
the cell wasn't properly 
stained it will be red),  mitochondria, smooth ER, 
ribosomes (seen as  and other organells which 
granules associated with  show the cytoplasm in 
rough ER, especially in  deep red color
neurons)
WHY? DNA, RNA are acids

Blue to violet
Red to pink
 

 
• Both H & E are the most used in hospital. 
• Other stains (will be discussed in detailes later on) 
1. Some special stains that stain the cytoplasm with green 
2. Metachromatic ( =changing in color) stains: such as some which are 
blue but they stain the cell with red (metachromate) 
3. PAS stain (Periodic Acid Schiff’s reaction): for carbohydrate 
components, such as those in basement membrane, see page 7 
4. Silver salts: which reacts with them argyrophillic (silver loving) 
components, such as those in the basement membrane, page 7 

 
There are some notes that you should know, you can add them to your handout 
because they are just “missing pieces”: 
Page 1 
• Epithelium is avascular (has no blood vessels), how does it get its nutrition? 
• It is always connected to a connective tissue, which is very vascular, so it gets its 
nutrition by the process of diffusion. 
• If the cancer is from surface epithelium, it’s called carcinoma, if it was from glandular 
epithelium, it’s called adenocarcinoma. 
• Special epithelium, also called: receptors. 
• When we say shape, we mean the nuclei shapes, because we can’t see the 
boundaries of cells easily. 
 
Page 2 
• WATCH OUT!! Small ducts are made of simple cuboidal, large ducts are made of 
pseudostratified. 
• Low columnar epithelium: between columnar and cuboidal. 
• Proximal convoluted tubes are either columnar or low columnar. 
• Large bronchioles are made of pseudo, small are made of columnar. 
• Except for the alveoli and small bronchioles, the respiratory passages are made of 
pseudo. So we can describe the respiratory passages to be: pseudostratified, ciliated, 
with goblet (mucus secreting) cells. 
• Mucus is for humidity 
 
Page 3 
• Skin is 2 layers: epidermis (keratinized epithelium), dermis (connective tissue) 
• Conjunctiva: mucus membrane on the eyeball and eyelids (connects them to each 
other), ‫الملتحمة‬. 
• Transitional epithelium: 
o The outermost cells have neither of the previous shapes, they are dome 
shaped, and a one cell may contain 2 nuclei. 
o If the layers were compressed and subjected to pressure (as in  the bladder), 
some their number will decrease for example from 6 to 4, that happens by 
some layers becoming between the others, and that’s why we call this type 
transitional. 
• The germinal epithelium cells are actually the 1ry spermatocytes, 2ry, spermatids, 
sperms… 
 
Page 4 
• Apical: also called lumenar. 
• Cilia are specifically in the ampulla of the uterine tube. 
• Stereocilia are in the epididymis ONLY. 
• Remember: epididymis is 6m long, for sperm maturation, at the testes dorsal surface. 
 
Page 5 
• Example of macula (or fascia) occludens: between venules’ cells, so they allow WBC’s 
to pass and kill bacteria. 
 
Page 6 
• Tonofilaments are type of intermediate filaments. 
 
Page 8 
• Goblet cells secrete mucus, and they are in: 
o Respiratory passages 
o Small and large intestine, being more in the large intestine, WHY? 
Because what reaches the large is mostly feces, so more G.cells means more 
mucus which ‘lubricates’ the feces movement. While in the small nutrients 
must be absorbed, so slow movement is preferred. 
• MISPRINT: “connective tissue that supports these components...” 
The arrow is pointing to Æ stroma 
Page 9 
• Shape of secretory units can’t be used to identify the gland in cross section, because 
the microtome cutting can be inclined for example, showing the tubular as being 
acinar. 
• DON’T FORGET TO SEE THE EXAMPLES ON THE DIAGRAM ITSELF, SOME ARE NOT 
REPEATED IN THE NEXT PAGE. 
• Sebaceous glands: produce adipocytes, 
meibomian is the sebaceous glands in eyelids. 
 
Page 10 
• Parotid gland: one of the salivary glands, below 
ears [fig 1] 
The other two major salivary glands are: 
submandibular (below the jaw) [fig 2], 
sublingual (below tongue) [fig 3] 
• Pancreas: we mean the exocrine part. 
Page 11 
• Zymogen = enzyme generating. 
• Heterochromatic nucleus: when nucleus at the base of the cell, chromatin is 
condensed. 
• Euochromatic nucleus: when nucleus is rounded, at the center of the cell, chromatin 
is spread (so the nucleus is pale) 
• Mucus disappears when we prepare the slide for studying, so that’s why we see it 
pale. 
• Why we have rough ER in secretory? Because they secrete enzymes, enzymes are 
proteins, proteins are produced in ribosomes on the ER. 
• BACK TO SALIVARY GLANDS: parotid pair is purely serous while the other are mixed, 
knowing that submandibular is more serous (less mucous) than the sublingual. 
 
Page 11 
• we call them myoepithelial cells because they contain thin and thick filaments 
(fibers) actin and myosin, which causes the contraction of glands. 
 
Page 13 
• remember: integrins are proteins of cell membranes embedded in them. 
 
Page 14 
• Perlecan = heparan sulphate (HS) 
 
 
 
NOTE: The first practical lecture (how to prepare a specimen) is from Junquiera Histology 
book, first chapter. 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
A dedication to all my friends especially:
My best friend: Mo2ayad Kittaneh
Those who are dear to my heart: A7mad Abu 7alaweh, Ma2moon
sha3ban, Yazeed Neif, Yazeed 8aysyah,Osama, Moh 8taishat,
Yousef Kittaneh, Hammam Ryalat, Feras Nemer, Mohammad
3assaf, Fahd 3adel, Mohammad Alsboo3, A7mad Abu 5adijah,
A7mad Al 3eesah, 3abderra7man Al3attili, Far7an Alkooz,
Martin Qaqeesh, Wa2el touqan, Amjad 3ayyash, moh faqeeh,
7azem, Rami ya3’I, A7mad Shalabi,Ayyoob 3ennabi, Waseem, Moh
AbuHanyyeh, A7mad 7ara7sheh, Hesham 7erzallah, Hashem
AbuMa7footh, Sami 3abdeen, Sohaib Sawajneh, Mohammad
Tayseer, 3abderrahman 5ateeb, Yezan 3toom, 3’aleb 5erfan,
3omar Doudeen, Mohammad Almoumani.

And all my Colleagues in medical school

Special thanks to dr.faraj

Hamza Jassar

Best Wishes
Thank U

JUMS Forums: www.jums.forumotion.com