MTs Negeri 2 Sleman Semula Bernama Madrasah Tsanawiyah Nahdhatul Ulama
(NU) Tempel Yang Berdiri Tahun 1967, Terletak Di Dusun Panggung, Lumbungharjo Tempel Kabupaten Sleman Atau Di Muka Stasiun Kereta Api Tempel. MTs Negeri 2 Sleman Didirikan Oleh Para Alim Ulama Atau Kyai Tokoh – Tokoh Muslim Wilayah Kecamatan Tempel Dan Sekitarnya. Para Kyai Yang Ikut Berperan Dalam Perintisan Madrasah Tsanawiyah Ini Antara Lain : K.H. Djumali : Pokoh Banyurejo Tempel (Alm) Kyai M. Sanusi : Krakitan, Salam, Magelang (Alm) Kyai Marzuki : Panggung Lum Bungharjo Tempel (Alm) K.H. Ismail S : Gondanglegi, Merdikorejo, Tempel (Alm) K.H. Akhiyari Hadi : Sleman Triharjo Sleman (Alm) M. Subiyanto BA : Kendal, Bangun Kerto, Turi (Alm) Munwar Syamsudin : Kendal, Bangunkero, Turi (Alm) H. Muhari Az, BA : Pulewulung, Banunkerto Turi Drs. H. Miftah Baidlowi : Ngentak, Pondokrejo, Tempel K.H Abu Salim Ali : Lodoyong Lumbungrejo Tempel Dll Selanjutnya Pada Kepemimpinannya Bapak H. Muhari AZ, BA Tepatnya Pada Bulan Januari 1968 Madrasah Tersebut Dinegerikan Dengan Nama MTs N AIN (Madrasah Tsanawiyah Negeri Agama Islam Negeri). Dalam Perkembangannya Selanjtnya MTsN AIN Tahun 1976 Pindah Sebelah Barat Kelurahan Lumbungrejo Sampai Awal Tahun 1978. Kemudian Kira-Kira Pertengahan Tahun 1978 MTsN AIN Tempel Pindah Ke Jl. Magelang Km 17 Ngosit, Margorejo, Tempel Kabupaten Sleman Sampai Sekarang. Nama MTs N AIN Berjalan 2 Tahun Dari Tahun 1968 Sampai 1970. Dan Pada Tahun 1970 MTs AIN Diganti Dengan MTs Negeri Tempel Berdasarkan Surat Keputusan Kantor Wilayah Kementerian Agama Propinsi DIY. Pada Tahun 2014 Berdasarkan Surat Keputusan Menteri Agama Nomor 157 Tahun 2014 Nama Madrasah Tsanawiyah Negeri Tempel Berubah Menjadi Madrasah Tsanawiyah Negeri 2 Sleman. Madrasah Tsanawiyah Negeri 2 Sleman Telah Dipimpin Oleh 15 Orang Kepala Madrasah, Berikut Ini Adalah Nama-Nama Yang Pernah Menjabat Sebagai Kepala MTs N 2 Sleman : 1. Bapak H. Muhari AZ, Ba Periode 1967 – 1976 2. Bapak Drs. Sarni Periode 1976 – 1980 3. Bapak H. Masyud Mz, BA Periode 1980 – 1984 4. Bapak Drs. H. Abdul Hadziq Periode 1984 – 1987 5. Bapak Drs. H. Sukiman Periode 1987 - 1990 6. Bapak Drs. H. M. Fadhil Periode 1990 - 1991 7. Bapak Drs. H. Qomari Zaman Periode 1991 – 1996 8. Ibu Dra. Siti Amriti Periode 1996 – 1998 9. Bapak Drs. Sudarno Periode 1998 – 2000 10. Bapak Drs. H. Moh. Achjadi Periode 2000 – 2003 11. Bapak Drs. Achmad Darodji, M.Pd.I Periode 2003 – 2007 12. Bapak Drs. Rudi Astono, S.Pd.I, M.Pd.I Periode 2007 – 2010 13. Bapak Drs. H. Ngabdullah, M.Pd.I Periode 2010 – 2014 14. Bapak Hadlirin, S.Ag, M.Pd Periode 20014 – 2019 15. Bapak Drs. H. Sigit Sugandono Periode 2020 - sekarang