LAPORAN

PERMODELAN STRUKTUR KIMIA 2D DAN 3D

MENGGUNAKAN CHEMOFFICE DAN CHEM 3D

Ditujukan untuk memenuhi Tugas Mata Kuliah Kimia Medisinal

Disusun oleh :

YONA VISTA VIANA

191FF04020

UNIVERSITAS BHAKTI KENCANA

FAKULTAS FARMASI
2019
1. TUJUAN
- Mampu menggambar struktur 2D dan 3D dengan menggunakan tools yang ada
di aplikasi Chemoffice dan Chem 3D
- Mengetahui dan dapat menganalisis sifat fisiko-kimia dari suatu senyawa

2. TEORI DASAR
Chem Office merupakan salah satu software yang digunakan untuk
membuat struktur kimia dengan mudah. Sofware ini banyak memilki kelebihan
untuk mempermudah kita menggambar rumus kimia. Untuk menggambar rumus
molekul kimia Chem Office menyertakan Chem Draw dan Chem 3D.
Chem Draw merupakan salah satu program aplikasi dari Chem Office,
untuk menggambar struktur 2D dalam bidang ilmu kimia, terutama kimia organik,
biokimia, dan polimer. Software ini dapat membantu kita dalam menggambar
struktur kimia dengan berbagai fasilitasnya. Sementara itu, pemodelan 3D struktur
senyawa kimia dapat dibuat melalui Chem 3D.

3. PROSEDUR
 Membuat struktur 2D

Struktur yang diinginkan

Masuk ke aplikasi Chemoffice digambar menggunakan tools
yang tersedia

 Memberi nama struktur kimia

Klik menu Dipilih menu

Struktur yang telah
"Structure" di "Convert Structure
dibuat, di blok
toolbar to Name"

 Menampilkan data fisiko-kimia

Dipilih menu "Show Chemical

Klik menu "View" di toolbar
Properties Windows"
 Menampilkan geseran kimia 1H-NMR

Dipilih menu "Predict 1H-NMR

Klik menu "View" di toolbar
Shifts"

 Menampilkan geseran kimia 13C-NMR

Dipilih menu "Predict 13C-NMR

Klik menu "View" di toolbar
Shifts"

 Membuat struktur 3D

Struktur kimia yang telah

Struktur diubah dari "stick"
dibuat diblok dan di copy ke
menjadi "cylindrical bond"
Chem Ultra 3D

 MM2

Klik menu Dipilih menu

Didapat nilai
"MM2" di "Minimize Diklik "Run"
energi total
toolbar energy"

 MOPAC

Dipilih
Klik menu "All Didapat
menu Diklik
"MOPAC" properties" analisis
"Computer "Run"
di toolbar diblok fisiko-kimia
properties"

 Menghitung sifat fisiko-kimia

Setelah muncul list

Klik menu Dipilih menu sifat-fisiko kimia,
"Analyze" di "Computer dipilih poin mana
toolbar properties" saja yang akan
ditampilkan
4. HASIL PENGAMATAN
 Struktur Kimia 2D dan Nama Senyawa

 Struktur Kimia 3D
 Geseran Kimia 1H-NMR

 Spektrum 1H-NMR

 Geseran Kimia 13C-NMR

 Spektrum 13C-NMR

 MM2 (Total Energi)

 MOPAC
 Analisis Fisiko-kimia


5. PEMBAHASAN
Pada praktikum kali ini yang dilakukan adalah membuat struktur kimia
berdasarkan contoh yang diberikan. Aplikasi yang digunakan adalah Chemoffice
dan Chem 3D. Struktur kimia yang dibuat adalah (E)-N-(3-Nitrobenzylidene)-4-(4-
nitrophenyl)thiazol-2-amine. Fungsi lain dari aplikasi tersebut adalah mampu
melakukan penamaan secara otomatis dari struktur yang dibuat, juga dapat
menampilkan sifat fisiko-kiia dari senyawa yang digambar. Aplikasi ini dapat
digunakan pula untuk melihat pergeseran 1H-NMR dan 13C-NMR lengkap dengan
spektrumnya.
Fitur lain yang ada pada Chemoffice, merupakan Chem 3D. Aplikasi
tersebut biasanya digunakan untuk mengubah bentuk 2D menjadi 3D. selain itu
juga dapat digunakan untuk menghitung sekaligus menentukan sifat fisiko-kimia
dari senyawa yang digambar. Hasil dari praktikum kali ini didapatkan energi total
dari senyawa tersebut adalah -35.4527; titik didih 794.254 K; tekanan kritis 32.9159
 bar; energi elektron -26012.5 eV; diameter 15; dan BM 354.042. Senyawa tersebut
cenderung melepaskan kalor karena dilihat dari pada energi total dan energi
elektron yang bernilai negatif.

6. KESIMPULAN
Hasil dari praktikum kali ini didapatkan energi total dari senyawa (E)-N-
(3-Nitrobenzylidene)-4-(4-nitrophenyl)thiazol-2-amine adalah -35.4527; titik didih
794.254 K; tekanan kritis 32.9159 bar; energi elektron -26012.5 eV; diameter 15;
dan BM 354.042.

7. DAFTAR PUSTAKA
Agustina, Widiastuti, dkk. 2018. Modul Chem Office (Chem Draw & Chem 3d).
Surakarta: FKIP Universitas Sebelas Maret.