Genética Evolutiva

Davinia María García Molina

Tema 3. Medidas para cuantificar la variación genética en poblaciones

A la hora de trabajar con poblaciones, debemos tener claros los conceptos de:

En genética existen varias herramientas que sirven para cuantificar la variabilidad genética. Las más usadas
son:
- Heterocigosidad media observada
- Heterocigosidad media esperada
- % de loci polimórficos
- Nº medio de alelos por locus

Todo esto nos permitirá distinguir entre una población con mucha variabilidad de otra con poca variabilidad.

1) Heterocigosidad media observada

Permite calcular la heterocigosidad observada para cada uno de los locus de manera independiente y luego
realizamos la media. La media de medias se suele acompañar de +- el error estándar.

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Día-2, Día-4 ... son los distintos loci. Para cada uno se ha analizado un número variable de individuos.
Para calcular la heterocigosidad observada promedio marcamos los valores de heterocigosidad en la tabla.
En el ejemplo, la población con más variabilidad genética es la roja, ya que es la que tiene una mayor
heterocigosidad media observada; seguida de la azul y siendo la de menor variabilidad la verde.

Trabajamos con el error típico porque estamos trabajando con la población entera.

2) Heterocigosidad media esperada

Las heterocigosidades esperadas son mayores que las observadas. Esto nos empieza a dar información sobre
las poblaciones.
Procesos poblacionales pueden estar causando que vea menos heterocigosidad de la que estaba esperando.
La roja es la de más variabilidad, seguida de la azul y por último de la verde. Pero, en este caso, entre la azul y
la verde no hay tanta diferencia como en la Ho.
Si la Ho y la He son distintas, significa que la población no está en equilibrio de Hardy-Weinberg.

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Cálculo del error estándar:

3) % de loci polimórficos (LP99 ó LP95 )

Un locus es polimórfico al 99% cuando la frecuencia del alelo más común es igual o inferior al 99%.
Un locus es polimórfico al 95% cuando la frecuencia del alelo más común es igual o inferior al 95%.
Un locus es monomórfico cuando esa población tiene solo un alelo para esa variación y la frecuencia es 100%.
Siendo en este caso la heterocigosidad tanto observada como esperada 0, pues los individuos son
homocigóticos y no hay manera alguna de que hayan heterocigóticos.

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En la población G78 miramos el alelo más frecuente de la población de cada uno de los marcadores. Por
ejemplo, para el marcador Dia-2 es 0,991. No cumple el requisito de ser polimórfico al 99% al ser mayor de
0,990. En cuanto al marcador Dia-4 tampoco es polimórfico al 99%, más bien es monomórfico. El Est-2 no se
pudo genotipar.
En cuanto a Est-4L, la frecuencia más alta es 0,833 o lo que es lo mismo 83’3%, por tanto, es polimórfico al
99%.
El Est-7 es 0,762. Cumple el requisito por lo que es polimórfico al 99%

El valor de loci monomórfico en G78 es igual a 1/4=0,25, es decir, 25%. Para GI es 2/5=0,4 (40%) y para M77
0/5 (0%).

A partir de estos resultados, la población M77 es la de mayor variabilidad, sin ningún locus monomórfico y
100% polimórficos. La siguiente con mayor variabilidad es la G78 y la última es GI.

4) Número medio de alelos por locus

En este caso usamos la desviación estándar en lugar del error estándar porque estamos trabajando con
puntos concretos de la distribución, además de que no estamos trabajando con medias sino con el número de
alelos en cada locus. Contamos el número de alelos por población en cada locus. Siempre que de un valor y
no sea un (-) se cuenta como alelo. Luego sumamos la cantidad de alelos y dividimos en el total.

Con los resultados obtenidos podemos deducir que tendrá una mayor cantidad de alelos M77, es decir, la que
tenía una mayor cantidad polimórficos y una mayor variabilidad.

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