Anda di halaman 1dari 60

BACTERIA

1. NORMAL FLORA OF RESPIRATORY TRACT and BACTERIA THAT


COLONIZED SPUTUM AND MUCOSAL SURFACE

NORMAL FLORA OF RESPIRATORY TRACT


Flora normal di saluran nafas yang paling menonjol terdiri dari Corynebacterium, Staphylcoccus
seperti S. epidermidis dan S. aureus), dan Streptococcus.. Bayi yang dilahirkan melalui vagina memiliki
kelompok bakteri (di semua habitat tubuh) yang komposisinya paling mirip ke kelompok vagina para ibu;
Bayi yang lahir secara C-section kekurangan bakteri dari komunitas vagina (misalnya, Lactobacillus,
Prevotella, Atopobium, dan Sneathia spp.). Bayi dilahirkan melalui C-section harbor, komunitas bakteri
(di seluruh tubuh habitat) yang paling mirip dengan komunitas kulit ibunya (misalnya, Staphylococcus,
Corynebacterium, atau Propionibacterium spp.).

Infeksi pada mulut dan saluran pernapasan biasanya disebabkan oleh campuran flora oronasal
anaerob. Infeksi periodontal, abses perioral, sinusitis, dan mastoiditis mungkin melibatkan P.
melaninogenica, Fusobacteria, dan Peptostreptococci. Aspirasi air liur (mengandung hingga 102
organisme dan aerob ini) mungkin mengakibatkan pneumonia nekrotikans, abses paru-paru, dan
empiema.

1. Staphylococcus aureus

a. Biologi dan virulensi


• Katalase positif, gram positif , bergerombol dan berkoloni seperti buah anggur
• Spesies yang ditandai oleh kehadiran koagulase, protein A, dan spesifik spesies asam ribitol teichoic
dengan N-acetylglucosamine residu ("polisakarida A")
• Faktor virulensi termasuk struktural komponen yang memfasilitasi penghindaran fagositosis oleh sel
imun host, serta bissa melepaskan berbagai toxin dan enzim-enzim hidrolitik
• Infeksi diperoleh dari rumah sakit dan masyarakat infeksi dengan resisten metisilin Staphylococcus
aureus (MRSA)
b. Epidemiologi
• Flora normal pada kulit manusia dan mukosa permukaan, terutama nares anterior
• Organisme dapat bertahan hidup pada permukaan kering jangka panjang (karena tebalnya lapisan
peptidoglikan dan tidak adanya membran bagian luar)
• Penyebaran dari orang-ke-orang melalui kontak langsung atau kontak dengan benda yang
terkontaminasi fomites (misal : seprai, pakaian)
• Faktor risiko termasuk kehadiran benda asing pada tubuh (misalnya : serpihan, jahitan, prostesis,
kateter), prosedur bedah sebelumnya, dan penggunaan antibiotik yang menekan yang flora normal
• Pasien yang berisiko untuk penyakit tertentu termasuk bayi (scalded skin syndrome), anak-anak muda
dengan kebersihan pribadi yang buruk (Impetigo dan infeksi kulit lainnya), wanita menstruasi (toxic
shock syndrome), pasien dengan intravascular kateter (bakteremia dan endokarditis) atau shunts
(meningitis), dan pasien dengan fungsi paru terganggu atau infeksi pernafasan virus anteseden
(pneumonia)
• MRSA sekarang menjadi penyebab paling umum kulit dan jaringan lunak yang didapat masyarakat
infeksi (community acquired)
c. Penyakit
• Penyakit termasuk penyakit yang dimediasi toksin (Keracunan makanan toxic shock syndrome, scalded
skin syndrome), penyakit piogenik (Impetigo, folikulitis, furunkel, karbunkel, infeksi luka), dan penyakit
sistemik lainnya.
d. Diagnosis
• Alur mikroskopis berguna untuk infeksi piogenik tetapi tidak infeksi darah atau infeksi dimediasi toksin
• Staphylococcus tumbuh dengan cepat saat dikultur di media nonselektif
• Media selektif (Mannitol Salt Agar) dapat digunakan untuk menumbuhkan S. aureus di spesimen
terkontaminasi
• Nucleic acid amplification test bermanfaat untuk menyaring pasien untuk menguji pasien apakah dia
methicillin-sensitive S. aureus (MSSA) atau MRSA
• S. aureus diidentifikasi dengan uji biokimia (misal : koagulase), molecular probe, atau massa
spektrometri
e. Pengobatan
Terapi oral dapat termasuk trimethoprim-sulfamethoxazole, doksisiklin atau minocycline, clindamycin,
atau linezolid; vankomisin adalah obat pilihan terapi intravena, dengan daptomycin, tigecycline, atau
linezolid dapat sebagai alternatif.

2. Streptococcus pyogenes (Group A Streptococci)


a. Biologi dan Virulensi
• Kokus, gram positif yang tumbuh dengan cepat ,tersusun rantai
• Terdapat kelompok karbohidrat (antigen) dan protein tipe-spesifik (protein M) di dinding sel
• Virulensi ditentukan oleh kemampuan untuk menghindari fagositosis (dimediasi terutama oleh kapsul,
protein seperti M dan M, C5a peptidase), menyerang sel inang (Protein M, asam lipoteikoat, protein F),
dan menghasilkan racun (Streptococcus pyrogenic eksotoksin, streptolisin S, streptolisin O, streptokinase,
DNases)

b. Epidemiologi
• Kolonisasi secara menetap pada tractus respiratorius dan permukaan kulit, menyebabkan penyakit
tertentu sebelum antibodi protektif dihasilkan
• Faringitis dan infeksi soft tissue biasanya disebabkan oleh strain dengan M protein yang berbeda

c. Penyakit
Bertanggung jawab atas penyakit supuratif (faringitis, infeksi jaringan lunak, streptococcal toxic
shock syndrome) dan penyakit nonsuppurative (demam rematik, glomerulonefritis)

d. Diagnosis
• Tampakan mikroskopis berguna pada infeksi jaringan lunak tetapi tidak faringitis atau penyakit
nonsuppurative
• Tes langsung untuk antigen group A berguna untuk diagnosis faringitis streptokokus
• Isolat diidentifikasi oleh katalase (negatif), PYR positif (L-pyrrolidonyl arylamidase) reaksi, sensitive
terhadap bacitracin, dan kehadiran antigen spesifik kelompok (kelompok A antigen)
• Tes Antistreptolysin O berguna untuk mengkonfirmasikan demam rematik atau terkait dengan
glomerulonephritis faringitis streptokokus; uji anti-DNase B harus dilakukan untuk glomerulonephritis
terkait dengan faringitis atau jaringan lunak infeksi

e. Treatment
Penisilin V ataua amoxicillin yang digunakan untuk mengobati faringitis; sefalosporin oral atau macrolide
untuk pasien alergi penisilin; intravena penisilin plus klindamisin digunakan untuk sistemik infeksi.

3. Streptococcus pneumonia
a. Biologi dan virulensi
• Cocci gram positif memanjang diatur berpasangan (diplococci) dan rantai pendek; dinding sel termasuk
asam teichoic yang kaya akan fosforilkolin (C polisakarida), yang diperlukan untuk aktivitas suatu enzim
autolytic, amidase
• Virulensi ditentukan oleh kemampuan menjajah oropharynx (adhesi protein permukaan), menyebar ke
jaringan yang biasanya steril (pneumolysin, imunoglobulin [Ig] A protease), merangsang peradangan
lokal respon (asam teichoic, peptidoglikan fragmen, pneumolysin), dan menghindar pembunuhan
fagositik (polisakarida kapsul)
• Bertanggung jawab atas pneumonia, sinusitis dan otitis media, meningitis, dan bacteremia

b. Epidemiologi
• Sebagian besar infeksi disebabkan oleh endogen menyebar dari nasofaring terjajah atau oropharynx ke
situs distal (mis., paru-paru, sinus, telinga, darah, meninge); orang ke orang menyebar melalui droplet
adalah langka
• Kolonisasi paling tinggi pada anak kecil dan kontak mereka

c. Diagnosa
• Mikroskopi sangat sensitif, seperti kultur, kecuali pasien telah dirawat antibiotik
• Tes antigen untuk pneumokokus C polisakarida peka terhadap cairan serebrospinal (meningitis) tetapi
tidak dengan urin (meningitis, pneumonia, lainnya infeksi)
• Tes berbasis asam nukleat tidak umum dilakukan digunakan untuk diagnosis
• Kultur membutuhkan penggunaan nutrisi yang diperkaya media (mis., agar darah domba); organisme
sangat rentan terhadap banyak antibiotik, jadi kultur dapat negatif pada sebagian perawatan pasien
• Isolat diidentifikasi oleh katalase (negatif), kerentanan terhadap optochin, dan kelarutan dalam empedu

d. Treatment
• Penisilin adalah obat pilihan untuk strain yang rentan, meskipun resistensi semakin umum
• Vankomisin yang dikombinasikan dengan seftriakson adalah digunakan untuk terapi empiris;
monoterapi dengan sefalosporin, fluoroquinolone, atau vankomisin dapat digunakan pada pasien dengan
isolat yang rentan
• Imunisasi dengan 13 valensi terkonjugasi Vaksin direkomendasikan untuk semua anak lebih muda dari
2 tahun; sebuah valensi 23 vaksin polisakarida direkomendasikan untuk orang dewasa berisiko terkena
penyakit.
4. Corynebacterium diphteriae
a. Biologi dan Virulensi
• Batang pleomorfik Gram-positif
• Faktor virulensi utama adalah difteri toksin, eksotoksin A-B; menghambat sintetis protein

b. Epidemiologi
• Distribusi seluruh dunia dipertahankan di pembawa asimptomatik dan pasien yang terinfeksi
• Manusia adalah satu-satunya reservoir yang diketahui, dengan carriage di oropharynx atau di permukaan
kulit
• Menyebarkan orang ke orang melalui paparan tetesan pernapasan atau kontak kulit
• Penyakit diamati pada yang tidak divaksinasi atau sebagian kebal anak-anak atau orang dewasa
bepergian ke negara-negara dengan penyakit endemik

c. Penyakit
• Agen etiologik difteri: pernapasan

d. Diagnosa
• Mikroskopi tidak spesifik; metakromatik butiran diamati pada C. diphtheriae dan corynebacteria
lainnya
• Budaya harus dilakukan pada nonselektif (agar darah) dan selektif (cystein-tellurite agar, media
Tinsdale, media colistin-nalidixic)
• Identifikasi dugaan C. diphtheria dapat didasarkan pada adanya sistinase dan tidak adanya
pirazinamidase; pasti, definitive identifikasi dengan tes biokimia atau sekuensing gen spesifik spesies
• Demonstrasi eksotoksin dilakukan oleh Tes ELEK atau uji reaksi rantai polimerase

e. Treatment
• Infeksi yang diobati dengan antitoksin difteri untuk menetralkan eksotoksin, penisilin atau eritromisin
untuk menghilangkan C. diphtheriae dan menghentikan produksi toksin, dan imunisasi pasien yang
sembuh dengan toksoid difteri untuk merangsang antibody proteksi
• Administrasi vaksin difteri dan foto booster untuk populasi yang rentan

BACTERIA THAT COLONIZED SPUTUM AND MUCOSAL SURFACE


1. Bacteroides fragilis
Karakteristik
• Batang anaerob, pleomorfik, gram negatif
• Dikelilingi oleh kapsul polisakarida
• Komponen dinding sel utama lipopolisakarida tetapi tanpa aktivitas endotoksin
• Faktor polisakarida utama virulensi sebagai antifagositik
• Berbeda dengan molekul LPS dalam batang gram negatif aerob, Bacteroides LPS memiliki sedikit atau
tidak ada aktivitas endotoksin. Ini karena komponen lipid A dari LPS tidak memiliki gugus fosfat pada
residu glukosamin, dan jumlah asam lemak yang terkait dengan gula amino berkurang; kedua faktor
tersebut berkorelasi dengan hilangnya aktivitas pirogenik
• pertumbuhannya dirangsang oleh empedu
Epidemiologi
Reservoir: Colon manusia
• Mengkolonisasi saluran pencernaan hewan dan manusia sebagai anggota kecil mikrobioma; jarang atau
tidak ada dari orofaring atau saluran genital individu yang sehat
• Infeksi endogen

Penyakit
• Berhubungan dengan infeksi pleuropulmonary, intraabdominal, genital, dan kulit dan jaringan lunak
yang ditandai dengan pembentukan abses
• penyakit diare menghasilkan toksin zinc metalloprotease yang labil panas (B. fragilis toxin). Toksin ini
menyebabkan perubahan morfologis epitel usus melalui penataan ulang F-actin, dengan stimulasi yang
dihasilkan dari sekresi klorida dan kehilangan cairan. Enterotoksin juga menginduksi sekresi IL-8 oleh sel
epitel usus, sehingga berkontribusi terhadap kerusakan inflamasi pada epitel.

Diagnosis:
-Kondisi anaerob yang teridentifikasi tes biokimia dan gas
-Chromatography
• Karakteristik pewarnaan Gram dari spesimen klinis
• Tumbuh cepat dalam kultur yang diinkubasi secara anaerob

Media :
Robertson’s Cooked Meat
Bacteriodes bile esculin agar

Perawatan, Pencegahan, dan Kontrol


• Tahan terhadap penisilin dan 25% isolat yang resisten terhadap klindamisin; rentan terhadap
metronidazol, dan sebagian besar strain terhadap karbapenem dan piperasilin-tazobaktam

Pewarnaan Gram Bacteriodes bile esculin agar


2. Mobiluncus
Karakteristik :
• batang melengkung anaerob
• variabel gram-negatif
• ujung meruncing
• motil

Berdasarkan pewarnaan Gram, mereka diklasifikasikan sebagai batang gram positif karena mereka :
(1) memiliki dinding sel gram positif,
(2) kekurangan endotoksin, dan
(3) rentan terhadap vankomisin , klindamisin, eritromisin, dan ampisilin tetapi resisten terhadap colistin.

Organisme ini sulit untuk tumbuh , tumbuh perlahan bahkan pada media yang diperkaya yang dilengkapi
dengan serum kelinci atau kuda. Dari dua spesies Mobiluncus, M. curtisii jarang ditemukan di vagina
wanita sehat tetapi melimpah pada wanita dengan bakteri vaginosis (vaginitis).

3. Gardnerella vaginalis
Karakteristik :
• Flora normal pada vagina
• Berhubungan dengan vaginosis
• Batang Gram-variabel ; memiliki envelope sel Gram-positif
• Anaerob fakultatif
• Katalase negatif dan oxidase negatif

Reservoir: Vagina manusia

Transmission: endogen (flora normal terganggu , peningkatan pH)

Pathogenesis
• Infeksi polimikroba
• Bekerja secara sinergis dengan organisme flora normal lainnya termasuk : Lactobacillus, Mobiluncus,
Bacteroides, Peptostreptococcus
Penyakit : Vaginosis bakteri (bau vagina, peningkatan keputihan (tipis, abu-abu,
cairan yang melekat)

Diagnosis:
pH >4.5, clue cells (sel epitel yang dilingkupi bakteri ) pada vagina
saline smear; untuk Whiff test, ditambahkan KOH pada sampel and bau amis

Pengobatan : metronidazole atau clindamycin

4. Propionibacterium

Karakteristik :
batang
gram positif
kecil yang sering disusun dalam rantai pendek atau rumpun
anaerob

Lokasi : kulit, konjungtiva, dan telinga luar, dan pada orofaring dan saluran genital wanita.
Spesies yang paling umum diisolasi : Propionibacterium acnes. P. acnes bertanggung jawab atas dua jenis
infeksi:
(1) acne vulgaris (sesuai namanya) pada remaja dan dewasa muda
(2) infeksi oportunistik pada pasien dengan perangkat prostetik ( misalnya, katup atau sendi jantung
buatan) atau garis intravaskular (misalnya, kateter, cairan serebrospinal).
Propionibacteria juga biasanya diisolasi dalam kultur darah, tetapi temuan ini biasanya merupakan
kontaminasi dengan bakteri pada kulit di situs proses mengeluarkan darah.
Patogenesis :
Peran sentral P. acnes dalam jerawat adalah untuk merangsang respons peradangan. Produksi peptida
dengan berat molekul rendah oleh bakteri yang berada dalam folikel sebasea menarik leukosit. Bakteri
difagositosis dan setelah pelepasan enzim hidrolitik bakteri (lipase, protease, neuraminidase, dan
hyaluronidase), merangsang respons inflamasi lokal. P. propionicum dikaitkan dengan abses endodontik
dan canaliculitis lacrimal (peradangan pada saluran air mata).
Pengobatan :
Jerawat tidak terkait dengan efektivitas pembersihan kulit, karena lesi berkembang dalam folikel
sebaceous. Untuk alasan ini, jerawat dikelola terutama melalui aplikasi topikal benzoil peroksida dan
antibiotik.
Antibiotik seperti erythromycin dan clindamycin

5. Actinomyces
Karakteristik :
Anaerob fakultatif
Gram positif
Rod
Tumbuh lambat di media kultur
Menyebabkan infeksi kronik dan lama
Memiliki bentukan filamen atau hifa saat di kultur
Tidak memiliki mitokondria dan membran nucleus
Reproduksi dengan pembelahan
Dihambat dengan Penicillin

Epidemiologi :
Berkolonisasi di saluran nafas bagian atas, Gastrointestinal dan genital wanita, tetapi tidak pada kulit.
Memiliki potensi infeksi yang rendah dan hanya menyebabkan penyakit pada barier mucosa normal
karena trauma, pembedahan, atau infeksi
Sifat infeksinya endogen, tanpa penyebaran antar manusia

Penyakit: Actinomycosis
Pembentukan lesi granulomatous kronik yang berkembang menjadi supuratif dan membentuk abses dan
dihubungkan oleh saluran sinus
Secara makroskopis, koloninya seperti tumpukan pasir pada abses dan sinus.
Koloni ini disebut Granul Sulfur karena berwarna oranye atau kuning dan berfilamen
Area supuratif dikelilingi jaringan fibrous sehingga permukaannya kasar

Lokasi :
Cervicofacial
Thoraks
Abdomen
Pelvis
CNS

Pengobatan :
Drainase abses
Debridement abses dan jaringan
Antibiotik : Penicillin
Menjaga oral hygiene

6. Nocardia
Karakteristik :
Batang filamen
Positif asam
Dinding sel dengan asam mikolat
Aerob
Kemampuan untuk menghindari pembunuhan intraseluler
• Katalase dan superoksida dismutase menonaktifkan metabolit oksigen toksik (misalnya, hidrogen
peroksida, superoksida)
• Faktor fili mencegah pembunuhan intraseluler dalam fagosit dengan mengganggu fusi fagosom dengan
lisosom

Epidemiologi
• Tanah yang kaya dengan bahan organik
• Infeksi eksogen diperoleh melalui inhalasi (paru) atau pengenalan traumatis (kulit)
• Patogen oportunistik yang menyebabkan penyakit paling umum pada pasien immunocompromised
dengan defisiensi sel T

Penyakit
• Bronkopulmoner (misalnya, penyakit kavitasi) atau infeksi kulit primer (mis. misetoma, infeksi
limfokutan, selulitis, abses subkutan)
• Diseminasi paling umum ke sistem saraf pusat (mis. , abses otak) atau

Diagnosis
• Mikroskopi sensitif
• Kultur lambat, membutuhkan inkubasi hingga 1 minggu; media selektif mungkin diperlukan untuk
mengisolasi Nocardia dalam kultur campuran
buffered charcoal yeast extract [BCYE] agar
ciri : Filamen, Basil lemah asam, aerial hifa di permukaan koloni
Perawatan, Pencegahan, dan Kontrol
• Infeksi diobati dengan antibiotik dan perawatan luka yang tepat
• Cotrimoxazole

7. Fusobacterium
Terdapat 13 spesies Fusobacterium, tetapi infeksi tersering pada manusia disebabkan oleh Fusobacterium
necrophorum dan Fusobacterium nucleatum.

F necrophorum sangat pleomorfik, batang panjang dengan ujung bulat. Dapat menyebabkan infeksi berat
pada kepala dan leher yang berkembang menjadi called Lemierre’s disease. Dengan gejala
thromboflebitis vena jugularis akut yang dapat bermetastasis ke paru, mediastinum, dan hepar. Penyakit
ini sering terjadi pada remaja dan dewasa muda.

F nucleatum Batang kecil dengan ujung meruncing dan termasuk komponen pada gingiva seperti genital,
gastrointestinal dan saluran napas atas. Infeksi yang dapat disebabkan antara lain infeksi pada
pleuropulmonar, obstetri, chorioamnionitis, dan abses otak.

F nucleatum F necrophorum

Karakteristik
Gram-negatif batang, anaerob, flora normal oral

Transmission: endogen

Pathogenesis: Porphyromonas memiliki gingipains:bekerja sebagai protease, adhesin,


menurunkan IgG antibodi and sitokin inflamasi
Disease: penyakit periodontal

Diagnosis: anaerob, batang gram-negatif dari abscess

Treatment: metronidazole
2. Mycobacterium (tuberculosis, leprae), Bordetella pertussis
Bordetella pertussis
 Coccobacilus gram negatif yang sangat kecil
 Nonfermentative tetapi dapat mengoksidasi asam amino sebagai sumber energi
 Sangat aerob
 Pertumbuhan in vitro membutuhkan inkubasi berkepanjangan di media yang dilengkapi dengan
arang, pati, darah, atau albumin. (Medium Bordet-Gengou (agar kentang-darah-gliserol))
 Kepatuhan terhadap sel eukariotik yang dimediasi oleh pertaktin, hemagglutinin berfilamen, dan
fimbria; perusakan jaringan lokal yang dimediasi oleh toksin dermonekrotik dan sitotoksin trakea;
toksisitas sistemik yang dihasilkan oleh toksin pertusis
 Pertusis ditandai dengan tiga tahap: catarrhal (batuk ringan dan bersin), paroksismal (berbunyi
"Whoop" saat inhalasi, cepat lelah dan dapat disertai muntah, sianosis, dan kejang) dan
penyembuhan.
 Tes amplifikasi asam nukleat adalah tes yang paling sensitif dan spesifik
 Deteksi immunoglobulin (Ig) G atau IgA dapat digunakan sebagai tes konfirmasi
 Pengobatan dengan makrolida (yaitu, azithromycin, clarithromycin), efektif dalam memberantas
organisme dan mengurangi panjang tahap menular
 Azitromisin digunakan untuk profilaksis
 Vaksin yang mengandung toksin pertusis inaktif, hemagglutinin berfilamen, dan pertaktin efektif
 Vaksin pediatrik diberikan dalam 5 dosis (pada usia 2, 4, 6, dan 15 hingga 18 bulan, dan antara usia
4 dan 6 tahun); vaksin dewasa diberikan pada usia 11 hingga 12 tahun dan antara 19 hingga 65 tahun
Mycobacterium tuberculosis
 Tidak dapat diklasifikasikan menjadi gram positif maupun gram negatif, sangat asam, batang aerobik
 Dinding sel-kaya akan Lipid, membuat organisme ini resisten terhadapat disinfektan, deterjen,
antibiotik antibakteri umum, dan respon host immune
 Mampu tumbuh di intraseluler dalam makrofag alveolar
 Infeksi primer adalah paru
 Penyebaran ke situs tubuh mana pun paling sering terjadi pada pasien dengan immunocompromised
 Tes tuberkulin kulit dan interferon (IFN) -γ adalah penanda sensitif untuk paparan terhadap
organisme
 Mikroskopi dan kultur sensitif dan spesifik (Lowenstein-Jensen agar)
 Tes amplifikasi asam nukleat penting jika biakan tidak tersedia dan mikroskop tidak akurat
 Isoniazid (INH), ethambutol, pyrazinamide, dan rifampin selama 2 bulan diikuti oleh 4 hingga 6
bulan INH dan rifampin atau obat kombinasi alternatif.
 Profilaksis untuk pajanan terhadap tuberkulosis dapat mencakup INH selama 6 hingga 9 bulan atau
rifampisin harian selama 4 bulan; pyrazinamide dan etambutol atau levofloxacin digunakan selama 6
hingga 12 bulan setelah terpapar M.tuberculosis yang resistan terhadap obat
 Immunoprophylaxis dengan bacille Calmette-Guérin (BCG) di negara-negara endemik
 Kontrol penyakit melalui pengawasan aktif, intervensi profilaksis dan terapeutik, dan pemantauan
kasus yang cermat
Mycobacterium leprae
 Tidak dapat diklasifikasikan menjadi gram positif maupun gram negatif, sangat asam, batang.
 Dinding sel-kaya akan Lipid
 Tidak dapat dikultur di media buatan, tetapi dapat dikultur pada hewan (armadillo)
 Tuberkuloid (paucibacillary) dan lepromatous (multibacillary) bentuk kusta
 Mikroskopi (Pengerokan kulit atau mukosa nasal dengan skalpel atau dari biopsi kulit daun telinga
digoreskan pada slide dan diwarnai dengan tehnik Ziehl-Neelsen) sensitif untuk bentuk lepromatosa
tetapi tidak untuk bentuk tuberkuloid
 Tes kulit diperlukan untuk memastikan kusta tuberkuloid
 Bentuk tuberculoid diobati dengan rifampisin dan dapson selama 6 bulan; clofazimine ditambahkan
ke rejimen ini untuk pengobatan bentuk lepromatosa, dan terapi diperpanjang hingga minimal 12
bulan
 Penyakit dikendalikan melalui pengenalan dan perawatan yang cepat dari orang yang terinfeksi
3. Staphylococcus and Streptoococcus
Staphylococcus
Gram positif adalah kumpulan heterogen dari bakteri. Fitur yang mereka miliki adalah bentuk
coccus mereka, reaksi pewarnaan Gram mereka, dan tidak adanya endospora. Ada atau tidaknya katalase,
suatu enzim yang mengubah hidrogen peroksida menjadi air dan oksigen. Yang paling penting genus
positif-aerob katalase adalah Staphylococcus dan catalase negative aerobik..
Stafilokokus adalah kokus gram positif yang tumbuh dalam karakteristik pola menyerupai
sekelompok anggur (Gambar 18-1dan Tabel 18-1), meskipun organisme dalam spesimen klinis juga dapat
muncul sebagai sel tunggal, pasangan, atau rantai pendek. stafilokokus berukuran besar, berdiameter 0,5
hingga 1,5 μm, dan mampu tumbuh dan berpotensi menghasilkan penyakit dalam berbagai kondisi —
atmosfer aerobik dan anaerob, di hadapannya dengan konsentrasi garam yang tinggi (mis., 10% natrium
klorida),dan pada suhu mulai dari 18 ° C hingga 40 ° C .genus saat ini terdiri dari 49 spesies dan 27
subspesies,banyak yang ditemukan pada kulit dan selaput lendir manusia. Beberapa spesies memiliki
ceruk yang sangat spesifik tempat mereka biasa ditemukan. Misalnya, Staphylococcus aureus menjajah
nares anterior, Staphylococcus capitis ditemukan di kelenjar sebaceous (mis., dahi),dan Staphylococcus
haemolyticus dan Staphylococcus hominis ditemukan di area di mana ada kelenjar apokrin (mis.,ketiak).
Stafilokokus adalah patogen penting pada manusia,menyebabkan infeksi oportunistik dan spektrum luas
penyakit sistemik yang mengancam jiwa, termasuk infeksi kulit, jaringan lunak, tulang, dan saluran
kemih . spesies yang paling sering dikaitkan dengan penyakit manusia adalah S. aureus ,Staphylococcus
epidermidis, S. haemolyticus,Staphylococcus lugdunensis, dan Staphylococcus saprophyticus.

Fisiologi dan Struktur


Kapsul dan Lapisan Lendir,Lapisan terluar dari dinding sel pada kebanyakan stafilokokus ditutupi
dengan kapsul polisakarida. Sebelas kapsul serotipe telah diidentifikasi di S. aureus. Serotipe 1 dan 2
dikaitkan dengan kapsul yang sangat tebal dan mucoid muncul koloni tetapi jarang dikaitkan dengan
penyakit manusia.

Sebaliknya, serotipe 5 dan 8 dikaitkan dengan sebagian besar infeksi pada manusia. Kapsul melindungi
bakteri dengan menghambat fagositosis organisme oleh leukosit polimorfonuklear (PMN). Terikat,film
yang larut dalam air (slime layer atau biofilm) terdiri darimonosakarida, protein, dan peptida kecil
diproduksioleh kebanyakan stafilokokus dalam jumlah yang bervariasi. Ekstraseluler ini Zat mengikat
bakteri ke jaringan dan benda asing seperti kateter, cangkok, katup dan sendi prostetik, dan pirau dan
sangat penting untuk kelangsungan hidup relatif stafilokokus koagulase negatif virulen.

Membran sitoplasma
Membran sitoplasma terdiri dari kompleks protein, lipid, dan sejumlah kecil karbohidrat. berfungsi
sebagai penghalang osmotik untuk sel dan menyediakan jangkar untuk biosintesis seluler dan pernapasan
Enzim

A. Staphylococcus Koagulase Positif

Staphylococcus aureus
Bakteri berbentuk coccus, gram positif,katalase positif ,koagulase positif ,non motil,tidak memiliki spora
Katalase positif artinya adanya enzim katalase, suatu enzim yang dapat mengubah hidrogen peroksida
menjadi air dan oksigen,ditandai dengan adanya gelembung-gelembung udara
Komponen struktural
 Kapsul : Menghambat kemotaksis dan fagositosis,menghambat proliferasi dari sel mononuclear
 Slime layer : memfasilitasi perlekatan benda asing
 Peptidoglikan : menyediakan stabilitas osmotik,menstimulasi produksi dari pyrogen endogen
(endotoxin like activity);menghmbat fagositosis
 Asam teichoic : pengikat fibronektin
 Protein A : Menghambat pembersihan media antibody dengan mengikat igG1,igG2,dan igG4 fc
reseptor

Toxin –toxin
 Cytotoxins : toxic pada banyak sel, mengandung eritrosit,fibroblast,leukosit,makrofag,dan platelet
 Toxin Alpha, yang dapat dikodekan pada kromosom bakteri dan plasmid, adalah polipeptida
33.000 Da yang diproduksi oleh sebagian besar strain S. aureus yang menyebabkan penyakit
pada manusia. Toksin mengganggu otot polos di pembuluh darah dan beracun bagi banyak
jenis sel, termasuk eritrosit, leukosit, hepatosit, dan trombosit. Alfa toksin berikatan dengan
permukaan sel, teragregasi menjadi heptamer (7 molekul toksin) membentuk pori 1 hingga 2-
nm, dan memungkinkan penghilangan cepat K + dan masuknya Na +, Ca2 +, dan molekul
kecil lainnya, yang mengarah ke osmotik pembengkakan dan lisis sel. Racun alfa diyakini
sebagai mediator penting dari kerusakan jaringan pada penyakit stafilokokus.
 Beta toksin, juga disebut sphingomyelinase C, adalah 35.000-Da protein labil panas yang
diproduksi oleh sebagian besar strain S. aureus yang bertanggung jawab untuk penyakit pada
manusia dan hewan.
 Delta toksin adalah polipeptida 3000-Da yang diproduksi oleh hampir semua strain S. aureus
dan stafilokokus lainnya (mis., S. epidermidis, S. haemolyticus). Toksin ini memiliki spektrum
aktivitas sitolitik yang luas, mempengaruhi eritrosit, banyak sel mamalia lainnya, dan struktur
membran intraseluler.
 Gamma toksin (dibuat oleh hampir semua strain S. aureus) dan leukocidin P-V adalah racun
bikomponen yang terdiri dari dua rantai polipeptida: komponen S (protein yang mengalami
pelepasan lambat) dan komponen F (protein yang cepat mengelupas)
 Enterotoxins (A-E,G-I) : Menstimulasi proliferasi dari sel T dan menghasilkan sitokin,menstimulasi
pengeluaran media inflamator pada sel mast,meningkatkan peristaltik gastrointestinal dan
pengeluaran cairan dan juga terjadinya mual muntah
 Exfoliative toxin
 Toxic shock syndrome toxin-1

Enzim-enzim
 Koagulase : mengubah fibrinogen menjadi fibrin
 Hyaluronidase : hidrolisis asam hyaluronic pada jaringan ikat,mempromosikan penyebaran
staphylococcus di jaringan ikat
 Fibrinolisin : melarutkan gumpalan fibrin
 Lipase : hidrolisis lipid
 Nuclease : hidrolisis DNA

Epidemiologi
 Flora normal di kulit mnusia dan di permukaan mukosa.
 Dapat bertahan pada pemukaan kering untuk waktu yang lama .
 Penyebaran melalui kontak langsung atau terpapar benda mati yang terkontaminasi
 Fakto risiko dengan adanya kehadiran benda asing (e.g., splinter, suture, prosthesis,catheter).
 Prosedur sebelum pembedahan ,penggunaan antibiotik yang menekan microba flora normal .
 Pasien dengan risiko penyakit tertentu seperti pada bayi (scalded skin syndrome),anak-anak dengan
personal hygiene yang buruk (impetigo dan infeksi kulit lainnya ),wanita yang menstruasi (toxic
shock syndrome ),pasien dengan penggunaan intravascular catheters (bacteremia dan endocarditis
),meningitis,dan pasien dengan gangguan fungsi paru atau infeksi pernapasan (pneumonia) .
 MRSA sekarang menjadi penyebab paling umum infeksi kulit dan jaringan lunak yang didapat
masyarakat

Penyakit
Penyakit yang dimediasi/diperantai oleh toxin (keracunan makanan, toxic shock syndrome,scalded skin
syndrome), penyakit pyogenik (impetigo, folliculitis, furuncles, carbuncles,infeksi luka), dan penyakit
sistemik lainnya

Diagnosis
 Mikroskopi berguna untuk infeksi piogenik tetapi tidak untuk infeksi darah atau infeksi yang
dimediasi racun .
 Stafilokokus tumbuh dengan cepat saat dikultur di media nonselektif.
 Selective media (mannitol-salt agar) dapat digunakan untuk memulihkan S. aureus di
spesimen yang terkontaminasi.
 Tes amplifikasi asam nukleat bermanfaat untuk menyaring pasien untuk pengangkutan methicillin-
sensitive S. aureus (MSSA) dan MRSA (methicillin resisten S.aureus)
S. aureus diidentifikasi dengan uji biokimia (mis., koagulase), probe molekuler, atau massa
spektrometri.
Terapi ,pencegahan ,dan kontrol
 Infeksi lokal yang akibat sayatan dan drainase; terapi antibiotik diindikasikan untuk infeksi sistemik.
 Terapi empiris harus mencakup antibiotik aktif melawan strain MRSA.
 Terapi oral dapat termasuk trimethoprimsulfamethoxazole, doksisiklin atau minocycline,
clindamycin, atau linezolid; vankomisin adalah obat pilihan terapi intravena, dengan daptomycin,
tigecycline, atau linezolid dapat diterima alternatif.
 Pengobatan simtomatik untuk pasien dengan keracunan makanan (meskipun sumber infeksi harus
diidentifikasi sehingga prosedur pencegahan yang tepat dapat dilakukan.
 Pembersihan luka dan penggunaan yang tepat desinfektan membantu mencegah infeksi.
 Mencuci dan menutupi tangan dengan teliti kulit yang terbuka membantu tenaga medis mencegah
infeksi atau menyebar ke pasien lain.

B. Staphylococcus koagulase negatif (CoNS)


Yang termasuk dalam kelompok ini diantaranya adalah Staphylococcus epidermidis,Staphylococcus
haemolyticus , Staphylococcus saprophyticus.
Oportunistik, lapisan lendir, subakut

Biologi dan Virulensi


 Katalase positif, koagulase negatif,coccus,gram positif .
 Relatif avirulen, meskipun produksi Lapisan "slime" /slime layer dapat memungkinkan perlekatan
pada foreign body (mis., kateter, cangkok, prostetik katup dan sambungan, pintasan) dan
perlindungan dari fagositosis dan antibiotik.
 Epidemiologi
 Flora normal pada kulit manusia dan permukaan mukosa.
 Organisme dapat bertahan hidup pada permukaan kering pada jangka panjang.
 Penyebaran Orang-ke-orang menyebar melalui kontak langsung atau kontak dengan benda mati yang
terkontaminasi, meskipun sebagian besar infeksi dengan organisme pasien sendiri.
 Pasien beresiko ketika ada benda asing.
 Organisme ada di mana-mana, begitu juga ada tidak ada batasan geografis atau musiman.
Penyakit
Infeksi meliputi endokarditis subakut, infeksi benda asing, dan infeksi saluran kemih
Diagnosis
 Mikroskopi berguna untuk infeksi piogenik tetapi tidak untuk infeksi darah atau infeksi yang
dimediasi racun .
 Stafilokokus tumbuh dengan cepat saat dikultur di media nonselektif.
 Selective media (mannitol-salt agar) dapat digunakan untuk memulihkan S. aureus di
spesimen yang terkontaminasi.
 Tes amplifikasi asam nukleat bermanfaat untuk menyaring pasien untuk pengangkutan methicillin-
sensitive S. aureus (MSSA) dan MRSA (methicillin resisten S.aureus)
S. aureus diidentifikasi dengan uji biokimia (mis., koagulase), probe molekuler, atau massa
spektrometri.

Perawatan, Pencegahan, dan Kontrol
 Antibiotik pilihan adalah oksasilin (atau penisilin resisten penicillinase lainnya) atau vankomisin
untuk strain yang resisten oksasilin.
 Penghapusan benda asing diperlukan untuk keberhasilan perawatan.
 Pengobatan segera untuk endokarditis atau pintasan infeksi diperlukan untuk mencegah lebih lanjut
kerusakan jaringan atau kompleks imun pembentukan.

1. Staphylococcus haemolyticus

 Merupakan kelompok dari coagulase negatif staphylococci (CoNS).


 Bagian dari flora kulit normal manusia dan dengan populasi yang luas,biasanya ditemukan di
axilla,perineum,dan di area inguinal.
 Staphylococcus haemolyticus juga menyerang primata dan hewan peliharaan.
 patogen oportunistik yang terkenal, dan merupakan CoNS kedua yang paling sering diisolasi (S.
epidermidis adalah yang pertama).
 Infeksi dapat dilokalisasi atau sistemik, dan sering dikaitkan dengan penyisipan perangkat medis.
 Fenotipe yang sangat resisten terhadap antibiotik dan kemampuan untuk membentuk biofilm
menjadikan S. haemolyticus sebagai patogen yang sulit diobati.

Biology dan biochemistry

 S.haemolyticus bersifat nonmotil, tidak menstabilkan, anaerob fakultatif, dan Gram-positif.


 Sel biasanya berbentuk coccus dan berdiameter 0,8-1,3 μm.
 Ia hidup di berbagai substrat, termasuk glukosa, gliserol, maltosa, sukrosa, dan trehalosa. tes positif
untuk produksi acetoin, arginin, dihidrolase, benzidin, katalase, hemolisis, dan lipase;
 tes negatif untuk coagulase, DNase, ornithine decarboxylase, phosphatase, urease, dan oksidase.

Kondisi pertumbuhan

Pertumbuhan optimal terjadi antara 30 dan 40 ° C di hadapan oksigen dan 10% NaCl. Namun, beberapa
galur dapat tumbuh pada suhu yang berkisar antara 18 dan 45 ° C. Pertumbuhan pada 15 ° C atau 15%
NaCl buruk atau tidak ada.

Pembentukan biofilm(biofilm formation)

Kemampuan untuk mematuhi perangkat medis dan kemudian membentuk biofilm adalah faktor virulensi
utama yang terkait dengan S. haemolyticus. Pembentukan biofilm meningkatkan resistensi antibiotik dan
sering menyebabkan infeksi persisten .Biofilm S. haemolyticus tidak bergantung adhesin polisakarida
(PIA), dan kurangnya ica operon (kluster gen yang mengkode produksi PIA) dapat digunakan untuk
membedakan isolat S. haemolyticus dari spesies CoNS lainnya.

Pembentukan biofilm dipengaruhi oleh berbagai faktor termasuk karbohidrat, protein, dan DNA
ekstraseluler. Uji detasemen dengan NaIO4, proteinase K, atau DNase menghasilkan detasemen 38%,
98%, dan 100%.

Klinis

haemolyticus adalah CoNS kedua yang paling terisolasi secara klinis (S. epidermidis adalah yang
pertama) dan dianggap sebagai patogen nosokomial yang penting.] Infeksi pada manusia meliputi:
endokarditis katup asli, sepsis, peritonitis, dan infeksi saluran kemih, luka, tulang, dan sendi. Infeksi
jaringan lunak yang jarang terjadi biasanya terjadi pada pasien immunocompromised. Seperti CoNS
lainnya, S. haemolyticus sering dikaitkan dengan penyisipan benda asing, seperti katup prostetik, pirau
cairan serebrospinal, prostesis ortopedi, dan kateter intravaskular, kemih, dan dialisis. S. haemolyticus
adalah multi-obat yang kebal dan mampu membentuk biofilm, yang membuat infeksi sangat sulit diobati.

Toxin
Beberapa strain S. haemolyticus menghasilkan enterotoksin (SE) dan / atau hemolisin. Dalam studi 64
strain S. haemolyticus, produksi SEA, SEB, SEC, dan / atau SEE dicatat (hanya SED yang tidak ada).
Selain itu, 31,3% strain ditemukan menghasilkan setidaknya satu jenis enterotoksin.

2. Staphylococcus epidermidis

 Staphylococcus epidermidis adalah salah satu spesies bakteri dari genus Staphylococcus yang
diketahui dapat menyebabkan infeksi oportunistik (menyerang individu dengan sistem kekebalan
tubuh yang lemah

fakultatif, koagulase negatif, katalase positif, gram-positif, berbentuk kokus, dan berdiameter 0,5-1,5
µm.

Bakteri ini secara alami hidup pada kulit dan membran mukosa manusia.

Infeksi S. epidermidis dapat terjadi karena bakteri ini membentuk biofilm pada alat-alat medis di
rumah sakit dan menulari orang-orang di lingkungan rumah sakit tersebut (infeksi nosokomial).

Secara klinis, bakteri ini menyerang orang-orang yang rentan atau imunitas rendah, seperti penderita
AIDS, pasien kritis, pengguna obat terlarang (narkotika), bayi yang baru lahir, dan pasien rumah
sakit yang dirawat dalam waktu lama.

3. Staphylococcus saphrophyticus

 Staphylococcus saprophyticus adalah coccus non-hemolitik, Gram-positif, koagulase negatif, yang


merupakan penyebab umum infeksi saluran kemih tanpa komplikasi (ISK), terutama pada wanita
muda yang aktif secara seksual. Lebih jarang, ini bertanggung jawab untuk komplikasi termasuk
pielonefritis akut, uretritis, epididimitis, dan prostatitis.
 S. saprophyticus dapat dibedakan dari stafilokokus koagulase-negatif lainnya dengan resistensi
terhadap Novobiocin. Seperti uropatogen lainnya, S. saprophyticus memanfaatkan urease untuk
menghasilkan amonia. Namun, tidak seperti banyak dari organisme ini, ia tidak dapat mengurangi
nitrat.
 S. saprophyticus adalah bagian dari flora normal manusia yang membentuk koloni pada perineum,
rektum, uretra, serviks, dan saluran pencernaan.
 S. saprophyticus juga telah ditemukan adalah flora gastrointestinal yang umum pada babi dan sapi dan
dengan demikian dapat ditularkan ke manusia melalui makan makanan masing-masing.

Staphylococcus haemolyticus staphylococcus aureus

On a sheep blood aagar plate

Staphylococcus aureus

Staphylococcus epidermidis Pada media bap koloni sedang besar,putih


susu,non hemolisis
Staphylococcus saphrophyticus

Streptococcus (pneumoniae, pyogenes, agalactiae)


- Cocci gram +
- Tersusun berpasangan/rantai
- Anaerob fakultatif, dan beberapa pertumbuhan kapnofilik (hanya tumbuh di atmosfer yang ditingkatkan
dengan CO2)
- Katalase (–)

1. Streptococcus pyogenes
Biologi, Virulence, dan Penyakit
dengan cepat tumbuh kocci gram positif diatur dalam rantai; Kelompok-spesifik karbohidrat (A antigen)
dan jenis-protein spesifik (M protein) di dinding Virulence ditentukan oleh kemampuan untuk
menghindari fagositosis (dimediasi terutama oleh kapsul, protein M dan M-seperti, C5a peptidase),
mematuhi dan menyerang sel inang (M protein, lipoteichoic acid, F protein), dan menghasilkan racun
(streptokokus pirogenik exotoxins, streptolysin S, streptolysin O, Streptokinase, dnases) bertanggung
jawab untuk penyakit suppuratif (radang tekak, infeksi softtissue, syok toksik streptokokus) dan penyakit
nonsuppuratif (demam rematik, Glomerulonefritis)

Epidemiologi
Kolonisasi transien pada saluran pernapasan bagian atas dan permukaan kulit dengan penyakit yang
disebabkan oleh strain yang baru diperoleh (sebelum antibodi pelindung diproduksi) faringitis dan infeksi
jaringan lunak biasanya disebabkan oleh strain dengan protein M berbeda orang-ke-orang yang tersebar
dengan tetesan pernapasan (radang tekak) atau melalui istirahat di kulit setelah kontak langsung dengan
orang yang terinfeksi, fomite, atau vektor Arthropoda individu di lebih tinggi risiko penyakit meliputi
anak usia 5 sampai 15 tahun (faringitis); anak berusia 2 hingga 5 tahun dengan kebersihan pribadi yang
buruk (pyoderma); pasien dengan infeksi jaringan lunak (sindrom kejut toksik streptococcal); pasien
dengan faringitis Streptococcus sebelumnya (demam rematik, Glomerulonefritis) atau infeksi jaringan
lunak (Glomerulonefritis)

Diagnosis Microscopy
berguna dalam infeksi jaringan lunak, tetapi tidak faringitis atau komplikasi nonsuppurative tes langsung
untuk kelompok A antigen berguna untuk diagnosis faringitis Streptococcus, tetapi hasil negatif harus
dikonfirmasi oleh budaya atau molekul isolat diidentifikasi oleh catalase (negatif), positif PYR (L-
pyrrolidonyl arylamidase) reaksi, kerentanan terhadap bacitracin, dan kehadiran kelompok-spesifik
antigen (kelompok antigen) Antistreptolysin O tes ini berguna untuk mengkonfirmasikan demam rematik
atau Glomerulonefritis terkait dengan faringitis Streptococcus; tes anti-DNase B harus dilakukan untuk
Glomerulonefritis terkait dengan faringitis atau infeksi jaringan lunak

Pengobatan, Pencegahan, dan Kontrol


Penisilin V atau amoksisilin digunakan untuk mengobati radang tekak; sefalosporin oral atau makrolida
untuk pasien penisilin-Alergi; penisilin intravena ditambah clindamisin digunakan untuk infeksi sistemik
dari kereta orofaringeal yang terjadi setelah pengobatan dapat diobati kembali; pengobatan tidak
diindikasikan untuk pengangkutan asimtomatik yang berkepanjangan karena antibiotik mengganggu Flora
pelindung yang normal mulai terapi antibiotik dalam waktu 10 hari pada pasien dengan faringitis
mencegah demam rematik untuk pasien dengan riwayat demam rematik, profilaksis antibiotik diperlukan
sebelum prosedur (misalnya, gigi) yang dapat menginduksi bakteremias mengarah ke Endokarditis untuk
Glomerulonefritis, tidak ada pengobatan antibiotik tertentu atau profilaksis diindikasikan

2. Streptococcus agalactiae
Biologi, Virulensi, dan Penyakit
Dengan cepat tumbuh kocci gram positif yang teratur dalam rantai; Kelompok-spesifik karbohidrat (B
antigen) dan typespecific karbohidrat kapsular (ia, IB, II-VIII) Virulensi ditentukan terutama oleh
kemampuan untuk menghindari fagositosis (dimediasi oleh kapsul) yang bertanggung jawab untuk
penyakit neonatal (awal-onset dan akhir-onset penyakit dengan meningitis, pneumonia, bakteremia),
infeksi pada wanita hamil (endometritis, infeksi luka, infeksi saluran kemih), dan orang dewasa lainnya
(bakteremia, pneumonia, infeksi tulang dan sendi, infeksi kulit dan jaringan lunak)

Epidemiologi
Kolonisasi asimtomatik pada saluran pernapasan atas dan saluran genitourinari penyakit onset dini
diperoleh oleh neonatal dari ibu selama kehamilan atau pada saat kelahiran neonatus berada pada risiko
yang lebih tinggi untuk infeksi jika (1) ada pecah prematur membran, tenaga kerja yang berkepanjangan,
kelahiran prematur, atau disebarluaskan kelompok B penyakit Streptococcus, dan (2) ibu tidak memiliki
antibodi jenis tertentu dan memiliki tingkat pelengkap yang rendah wanita dengan kolonisasi genital
beresiko untuk penyakit pascamelahirkan pria dan wanita non hamil dengan diabetes mellitus, kanker,
atau alkoholisme berada pada peningkatan risiko penyakit tidak ada kejadian musiman

Diagnosis
Pemeriksaan Mikroskop berguna untuk meningitis (cairan serebrospinal), pneumonia (menurunkan
sekresi pernapasan), dan infeksi luka (ekdates) tes antigen tidak terlalu sensitif daripada mikroscopy dan
tidak boleh digunakan sebagai tes kultur yang paling sensitif; kaldu selektif (yaitu LIM) diperlukan untuk
deteksi optimal kereta vagina reaksi berantai polimerase – berdasarkan tes untuk mendeteksi
pengangkutan vagina pada wanita hamil yang tersedia secara komersial, sensitif dengan budaya dan isolat
yang cepat yang diidentifikasi oleh demonstrasi kelompok-spesifik dinding sel karbohidrat atau tes
amplifikasi asam nukleat positif

Pengobatan, Pencegahan, dan Kontrol


Penisilin G adalah obat pilihan; terapi empirik dengan antibiotik spektrum luas (cephalosporin spektrum
luas ditambah aminoglycoside) digunakan sampai patogen tertentu diidentifikasi; kombinasi penisilin dan
aminoglycoside digunakan pada pasien dengan infeksi serius; cephalosporin atau Vankomisin digunakan
untuk pasien alergi terhadap penisilin untuk bayi berisiko tinggi, penisilin diberikan setidaknya 4 jam
sebelum pengiriman tidak ada vaksin saat ini tersedia

3. Streptococcus pneumoniae
Biologi, Virulensi, dan Penyakit
Cocci gram-positif memanjang (diplococci) dan rantai pendek; dinding sel termasuk asam teichoic kaya
fosforilkolin (C polisakarida), yang diperlukan untuk aktivitas enzim autolitik, amidase Virulence
ditentukan oleh kemampuan untuk menjajah orofaring (permukaan protein adhesi), menyebar ke biasanya
steril Jaringan pneumolysin, iga protease), merangsang respons peradangan lokal (asam teichoic, fragmen
peptidoglikan, pneumolysin), dan menghindari pembunuhan fagositosis (kapsul polisakarida) yang
bertanggung jawab untuk pneumonia, sinusitis dan otitis media, meningitis, dan bakteremia

Epidemiologi
Sebagian besar infeksi disebabkan oleh penyebaran endogen dari nasofaring kolonisasi atau orofaring ke
situs distal (misalnya, paru, sinus, telinga, darah, meninges); orang-toperson menyebar melalui tetes
menular adalah kolonisasi langka adalah tertinggi pada anak muda dan kontak mereka individu dengan
penyakit saluran pernapasan virus atau kondisi lain yang mengganggu izin bakteri dari pernapasan adalah
pada peningkatan risiko untuk penyakit paru anak dan orang tua berada pada risiko terbesar untuk
meningitis orang dengan gangguan Hematologi (misalnya, keganasan, penyakit sel sabit) atau asplenia
fungsional beresiko untuk fulminan sepsis meskipun organisme ini di mana-mana, penyakit ini lebih
sering terjadi pada bulan sejuk

Diagnosis
Pemeriksaan Mikroskop sangat sensitif, seperti kultur, kecuali pasien telah diobati dengan antibiotik tes
antigen untuk pneumokokus C polisakarida sensitif dengan cairan serebrospinal (meningitis) tetapi tidak
dengan urin (meningitis, pneumonia, infeksi lain) asam nukleat-tes berbasis tidak umum digunakan untuk
diagnosis budaya membutuhkan penggunaan media yang diperkaya-gizi (misalnya, darah domba agar);
organisme sangat rentan terhadap banyak antibiotik, sehingga budaya dapat negatif pada pasien
diperlakukan sebagian isolat diidentifikasi oleh catalase (negatif), kerentanan terhadap optochin, dan
kelarutan dalam empedu

Pengobatan, Pencegahan, dan Kontrol


Penisilin adalah obat pilihan untuk strain yang rentan, meskipun resistensi semakin umum vancomycin
dikombinasikan dengan ceftriaxone digunakan untuk terapi empirik; monoterapi dengan sefalosporin,
fluoroquinolone, atau Vankomisin dapat digunakan pada pasien dengan kekebalan isolat rentan dengan
vaksin 13-Valen dikonjualkan dianjurkan untuk semua anak muda dari usia 2 tahun; sebuah 23-Valent
vaksin polisakarida dianjurkan untuk orang dewasa beresiko untuk penyakit

4. Streptococcus viridans

Penyakit yang disebabkan Streptococcus sp.


Streptococcus pyogenes (kelompok A) infeksi faringitis: memerah faring dengan ekdates umumnya hadir;
Limfadenopati serviks dapat menonjol demam kirmizi: menyebar ruam eritematous dimulai pada dada
dan menyebar ke ekstremitas; komplikasi streptokokus faringitis pyoderma: infeksi kulit lokal dengan
vesikel maju ke pustula; tidak ada bukti penyakit sistemik Erysipelas: infeksi kulit lokal dengan nyeri,
peradangan, pembesaran kelenjar getah bening dan gejala sistemik selulitis: infeksi kulit yang melibatkan
jaringan subkutan Necrotizing fasciitis: Deep infeksi kulit yang melibatkan penghancuran otot dan lapisan
lemak Streptococcal Toxic Shock Syndrome: infeksi sistemik multiorgan yang menyerupai
staphylococcal Toxic Shock Syndrome; Namun, sebagian besar pasien bakteremi dan dengan bukti
fasciitis

Penyakit suppuratif lainnya: berbagai infeksi lain yang diakui termasuk insis nifas, lymphangitis, dan
pneumonia infeksi nonsuppurative demam rematik: ditandai dengan perubahan inflamasi jantung
(pancarditis), sendi (arthralgias untuk arthritis), pembuluh darah, dan jaringan subkutan Glomerulonefritis
akut: peradangan akut glomeruli ginjal dengan edema, hipertensi, hematuria, dan proteinuria
Streptococcus agalactiae (kelompok B) penyakit neonatal onset awal: dalam 7 hari kelahiran, bayi baru
lahir mengembangkan tanda dan gejala pneumonia, meningitis, dan sepsis penyakit neonatal onset akhir:
lebih dari 1 minggu setelah lahir, neonatus mengembangkan tanda dan gejala bakteremia dengan
meningitis infeksi pada wanita hamil: paling sering hadir sebagai endometritis Postpartum, infeksi luka,
dan kencing Streptococcus pyogenes (kelompok A) infeksi faringitis: memerah faring dengan ekdates
umumnya hadir; Limfadenopati serviks dapat menonjol demam kirmizi: menyebar ruam eritematous
dimulai pada dada dan menyebar ke ekstremitas; komplikasi streptokokus faringitis pyoderma: infeksi
kulit lokal dengan vesikel maju ke pustula; tidak ada bukti penyakit sistemik Erysipelas: infeksi kulit
lokal dengan nyeri, peradangan, pembesaran kelenjar getah bening dan gejala sistemik selulitis: infeksi
kulit yang melibatkan jaringan subkutan Necrotizing fasciitis: Deep infeksi kulit yang melibatkan
penghancuran otot dan lapisan lemak Streptococcal Toxic Shock Syndrome: infeksi sistemik multiorgan
yang menyerupai staphylococcal Toxic Shock Syndrome; Namun, sebagian besar pasien bakteremi dan
dengan bukti fasciitis
Penyakit suppuratif lainnya: berbagai infeksi lain yang diakui termasuk insis nifas, lymphangitis, dan
pneumonia infeksi nonsuppurative demam rematik: ditandai dengan perubahan inflamasi jantung
(pancarditis), sendi (arthralgias untuk arthritis), pembuluh darah, dan jaringan subkutan Glomerulonefritis
akut: peradangan akut glomeruli ginjal dengan edema, hipertensi, hematuria, dan proteinuria
Streptococcus agalactiae (kelompok B) penyakit neonatal onset awal: dalam 7 hari kelahiran, bayi baru
lahir mengembangkan tanda dan gejala pneumonia, meningitis, dan sepsis penyakit neonatal onset akhir:
lebih dari 1 minggu setelah lahir, neonatus mengembangkan tanda dan gejala bakteremia dengan
meningitis infeksi pada wanita hamil: paling sering hadir sebagai endometritis Postpartum, infeksi luka,
dan infeksi saluran kemih; bakteremia dan disebarluaskan komplikasi dapat terjadi infeksi pada pasien
dewasa lain: penyakit yang paling umum termasuk bakteremia, pneumonia, infeksi tulang dan sendi, dan
kulit dan jaringan lunak infeksi lain-lain β-hemolitik streptococci pembentukan abses di dalam jaringan:
terkait dengan S. anginosus kelompok faringitis: terkait dengan S. dysgalactiae; penyakit menyerupai
yang disebabkan oleh S. pyogenes; dapat menjadi rumit dengan Glomerulonefritis akut dari pembentukan
Abscess viridans streptococci dalam jaringan dalam: terkait dengan S. anginosus kelompok Septicemia
pada pasien neutropenik: terkait dengan S. mitis kelompok

Endokarditis subakut: terkait dengan S. mitis dan kelompok S. salivarius karies gigi: terkait dengan S.
kelompok mutans Malignancies dari saluran pencernaan: terkait dengan S. bovis kelompok (S.
gallolyticus subsp. gallolyticus) meningitis: terkait dengan S . gallolyticus subsp. pasteurianus, S. suis,
dan S. mitis kelompok Streptococcus pneumoniae pneumonia: onset akut dengan menggigil parah dan
demam berkelanjutan; batuk produktif dengan dahak yang diwarnai darah; lobar konsolidasi meningitis:
infeksi berat yang melibatkan meninges, dengan sakit kepala, demam, dan sepsis; mortalitas tinggi dan
defisit neurologis berat dalam penyintas Bakteremia: lebih umum pada pasien dengan meningitis
dibandingkan dengan pneumonia, otitis, media, atau sinusitis; sepsis luar biasa pada pasien asplenic

S. pneumoniae
Streptococcus pyogenes

Streptococcus agalactiae

Streptococcus viridans

Streptococcus mutans
Streptococcus mitis

Streptococcus bovis

Streptococcus anginosus

6. Corynebacterium diphtheriae
Corynebacterium sp.
4. Corynebacterium diphtheriae,Bacillus anthracis, Pseudomonas aeruginosa
Corynebacterium diphtheriae
Secara umum memiliki dinding sel yang mengandung arabinosa, galaktosa, asam
mesodiaminopimelik (meso-DAP) dan kebanyakan spesies memiliki asam mikolik rantai pendek.
Contohnya pada Corynebacterium diphtheriae yang dinding selnya mengandung asam mikolik rantai
pendek sehingga bakteri ini tidak tahan asam karena bakteri ini tidak bisa terwarnai oleh pewarnaan Basil
Tahan Asam (BTA) berbeda dengan Mycobacterium tuberculosis yang memiliki dinding sel yang
mengandung asan mikolik rantai sedang-panjang. Maka Corynebacterium diwarnai dengan pewarnaan
gram yang menghasilkan bentuk “club shape” (ibaratnya seperti cottonbud yang lentur). Bakteri jenis ini
merupakan Obligat aerob atau bisa juga fakultatif anaerob. Dibuktikan karena dapat memfermentasikan
karbohidrat dan menghasilkan asam laktat sebagai hasil akhir (proses glikolisis). Bakteri ini non motil
(tidak bergerak) dan katalase positif.

Enzim katalase
2H2O2 2H2O + O2
*apakah bakteri ini merupakan flora normal??
Why? Karena bersifat
Oportunistik patogen
Ya (artinya memanfaatkan
Kesempatan)

Bisakah menyebabkan penyakit?


Jumlahnya banyak kekebalan
tubuh menurun

Ya

Bakteri ini sebenarnya secara alamiah merupakan flora normal yang ada pada kulit, saluran
pernapasan, saluran gastrointestinal dan saluran urogenitalia. Spesies yang paling terkenal menyebabkan
penyakit adalah Corynebacterium diphtheriae.

Corynebacterium diphtheriae memiliki 4 biotipe antara lain; mitis, gravis, intermedius dan
belfanti. Biotipe yang paling sering menyebabkan penyakit adalah mitis. Pada umumnya bakteri
patogenesisnya menyebabkan penyakit melalui tiga jalan yaitu 1) menginvasi sistem imun sehingga
menyerang, 2) memiliki sel bakteri yang kuat sehingga kemudian dapat memperbanyak diri, 3) memiliki
alat perang seperti toksin, kapsul dan enzim. Corynebacterium diphtheriae menyebabkan penyakit melalui
toksin yang dihasilkan yaitu toksin diphtheria. Karena tadi sudah dijelakan bahwa bakteri ini memiliki
sifat oportuniskik patogen. Bagaimana bakteri ini mendapatkan sifat tersebut? Ternyata melalui adanya
virus ʙ-phage (corynebacteriophage).

Litik
Pada umumnya virus
menginvasi melalui dua fase
Lisogenik

Menginjeksikan asam
B-phage virus nukleat tapi tidak
membunuh bakteri
Alurnya
1). Diikat sama reseptor binding region melalui reseptor heparin binding epidermal growth factor.
2). Translokasi reseptor sehingga terbuka membuat subunit A masuk
3). Terjadi proses katalitik, yang kemudian menghambat elongasi faktor 2 yang berhubungan dengan
sintesis protein. Yang kemudian akan menghambat proses tersebut yang lama-kelamaan menyebabkan
kematian sel.
Proses ini hanya terjadi pada manusia. Penyakit yang disebabkan oleh bakteri ini ada dua jenis pada upper
respiratory tract; respiratory diphtheria, dan pada kulit; cutaneus diphtheria.

Disease cause by
Corynebacterium
diphtheriae
Upperrespiratory tract ;
Skin ; Cutaneus
Respiratory diphtheria
diphtheria

Apa saja manifestasi 1) Biasanya membentuk


klinis? ulcer (borok)
2) biasanya ditemukan
bersamaan dengan
Eksudatif faringitis yang Staphylococcus aureus &
Streptococcus pyogenes
sangat khas
PSEUDOMEMBRAN

Kalau sampai di pembuluh


darah sekitar
menyebabkan;
1) miokarditis;
progresif menjadi
gagal jantung
kongetif, aritmia
2) neurotoksisity;
menyebabkan
paralisis N.
Occulomotorius
paralisis ciliaris

Cara mendiagosis
1. Lewat manifestasi klinis berupa pseudomembran sudah cukup membantu.
2. Laboratorium
- Pemeriksaan mikroskop
- Kultur identifikasi
- Toksigenik testing

Media selektif untuk pertumbuhan bakteri Corynebacterium diphtheriae ini antara lain;
1. media CTBA (Cystein Tellurite Blood Agar). Bakteri ini menghasilkan enzim cysteinase yang
nantinya akan mendegradasi komponen Cystein pada media tersebut yang menghasilkan koloni
halo brown. Untuk komponen Tellurite berfungsi untuk menghambat pertumbuhan bakteri lain.
2. Tinsdale medium, adalah yang terbaik untuk media perkembang biakan tetapi kekurangannya
adalah usia bakteri pada medium ini pendek dan komponennya adalah darah kuda.
3. Colistine- nalidixic agar (CNA); merupakan bakteri yang sering digunakan untuk pengembang
biakan bakteri gram positif yang dapat menjadi alternatif medium

IDENTIFIKASI
 Adanya enzim Cystinase
 Tidak adanya pirazinamidase
 Katalase positif (+)

TES TOKSIGENIK
1. Elek Test (in vitro immunodiffusion assay); merupakan gold standar untuk mengidentifikasi
toksin bakteri ini.
2. Polimerase Chain Reaction (PCR)- melalui metode peningkatan Asam Nukleat; dapat diambil
melalui spesimen klinis.

TREATMENT & PENCEGAHAN


1). Pemberian Anti Toksin diphtheria
2). Antibiotik; penisilin (B-laktase) dan eritromycin (makrolite)

 Pemberian Vaksin DPT (Diphtheria, Pertusis, Tetanus);


Bacillus anthracis (especially Wool-sorter's disease)
Bacillus anthracis
Morfologi :
Basil, gram negatif, tersusun seperti rantai panjang dengan letak spora di tengah dan bersifat non motil.
Pada media agar darah : putih abu-abu, bentuk medusa head, ground glass appearance, non motil, non
hemolysis. Spora/endospore terletak di tengah dan berbentuk elips diantara basil dan mempunyai sifat
resisten terhadap perubahan lingkungan, pemanasan, desinfektan kimia dan mampu hidup lama dalam
tanah kering.

Faktor virulensi :
1. Kapsul polipeptida
2. Toksin Antraks
Toksin anthrax tersusun atas tiga protein: antigen protektif (PA), faktor edema (EF), dan faktor letal (LF)'
PA berikatan dengan reseptor sel spesifik, dan setelah aktivasi proteoiitik, membentuk suatu kanal
membran yang memperantarai masuknya EF dan LF ke dalam sei. EF adalah adenilil siklase; bersama
dengan PA membentuk suatu toksin yang dikenal sebagai toksin edema. LF ditambah PA memLentuk
toksin letal' yang merupakan faktor virulensi utama dan menyebabkan kematian pada hewan yang
terinfeksi.
Penyakit dan Manifestasinya :
Cutaneous anthrax:
Pada manusia, sekitar 957o kasus adalah anthrax kutaneus dan 5o/o adalah anthrax inhalasi.
Anthrax gastrointestinal sangat jarang terjadi; dan telah dilaporkan dari Afrika, Asia, dan Amerika Serikat
setelah kejadian orang makan daging dari hewan yang terinfeksi. Kejadian bioterorisme pada musim
gugur 2001 (menyebabkan 22 kasus anthrax: 1 1 anthrax inhalasi dan anthrax I 1 kutaneus. Lima pasien
anthrax inhalasi meninggal dunia. Pasien lainnya selamat. Anthrax kutaneus secara umum terjadi pada
permukaan lengan dan tangan yang terpajan, diikuti wajah dan leher. Papul pruritus terjadi selama 1-7
hari setelah masuknya organisme atau spora melalui garukan. Awalnya menyerupai gigitan serangga.
Papul secara cepat berubah menjadi vesikel atau cincin kecil vesikel yang menyatu (koalesen),
dan terjadi ulkus nekrotik. Lesi secara khas berdiameter 1-3 cm dan mempunyai karakteristik eskar hitam
di tengah. Terjadi edema yang jelas. Limfangitis dan limfadenopati serta tanda dan gejala sistemik seperti
demam, malaise, dan nyeri kepala dapat terjadi. Setelah 7-10 hari eskar terjadi secara penuh. Akhirnya
mengering, kendur, dan terpisah; penyembuhannya melalui granulasi dan meninggalkan parut. Butuh
waktu beberapa minggu bagi lesi untuk menyembuh dan edema menghilang. Terapi antibiotik tidak
tampak mengubah perkembangan alami penyakit. Pada sebanyak 20o/o pasien, anthrax kutaneus dapat
menyebabkan sepsis, sebagai akibat infeksi sistemiktermasuk meningitis-dan kematian.

Gastrointestinal anthrax:
Hewan mendapatkan anthrax melalui penelanan spora dan penyebaran organisme dari traktus intestinalis.
Keadaan ini jarang pada manusia, dan anthrax gastrointestinal secara ekstrim jarang terjadi. Nyeri
abdomen, muntah, dan diare berdarah adalah tanda-tanda klinis yang jarang

Inhalation anthrax:
Periode inkubasi anthrax inhaiasi dapat mencapai 6 minggu. Manifestasi klinis awal berupa nekrosis
hemoragika yang jelas dan edema mediastinum. Nyeri substernal dapat menonjol, dan terdapat pelebaran
mediastinum yang nyata yang terlihat pada pemeriksaan sinar-X dada. Efusi pleura hemoragika terjadi
setelah pleura terkena; batuk disebabkan oleh efek pada trakea. Terjadi sepsis, dan dapat terjadi
penyebaran hematogen ke saluran cerna, yang menyebabkan ulserasi usus, atau ke meningen,
menyebabkan meningitis hemoragika. Angka fatalitas pada anthrax inhalasi tinggi dalam keadaan
pa.janan yang diketahui; lebih tinggi bila diagnosis antrax tidak diduga sejak awal.

Uji Diagnosis :
Spesimen yang diperiksa adalah cairan atau pus dari lesi lokal, darah, dan sputum. Apusan yang diwarnai
dari lesi lokal atau darah dari hewan yang mati scring memperlihatkan batang gram positif besar
berbentuk rantai. Anthrax dapat diidentifikasi dalam apusan yang dikeringkan dengan teknik pewarnaan
imunofluoresensi. Bila ditumbuhkan dalam lempeng agar darah, organisme menghasilkan koloni
nonhemolitik abu-abu sampai putih dengan tetr<stur kasar dan gambaran 'groundglass". Perutmbuhan
keiuar berbentuk koma (Kaput Medusa) dapat menonjol dari koloni. Pewarnaan Gram memperlihatkan
batang gram positif besar. Fermentasi karbohidrat tidak berguna. Pada medium semi-padat, basilus
anthrax selalu nonmotii, sedangkan organisme nonpatogenik terkait (misal nya, B cereus)
memperlihatkan motilitas secara "berkelompok". Biakan anthrax yang virulen membunuh tikus atau
marmut pada injeksi intraperitoneal. Demonstrasi kapsul memerlukan pertumbuhan pada medium yang
mengandung bikarbonat dalam 5-70/o karbon dioksida. Lisis oleh bakteriofag-y anthrax spesifik dapat
membantu dalam mengidentifikasi organ isme . En z,ym e- lin b e d im m un o as s ay (ELISA) telah
dikembangkan untuk mengukur antibodi terhadap edema dan toksin letal, tetapi uji tersebut belum
dipelajari secara luas. Serum akut dan konvalesen yang diperoleh dengan selang waktu 4 minggu harus
diuji. Hasil yang positif adalah perubahan empat kali atau titer tunggal lebih dari 1:32.

Pengobatan :
Rekomendasi pengobatan empiris saat ini adalah penggunaan ciprofloxacin atau doxycycline
dikombinasikan dengan satu atau dua antibiotik tambahan (misalnya, rifampin, Vankomisin, penisilin,
imipenem, Klindamisin, klaritromisin). Meskipun resistansi penisilin diamati untuk antraks, penisilin oral
(Amoxicillin) masih dianjurkan untuk anthrax kulit.

Pencegahan :
Tanah terkontaminasi oleh spora anthrax dari kerangka hewan yang mati. Spora tersebut tetap dapat hidup
berpuluh-puluh tahun lamanya. Mungkin spora dapat tumbuh dalam tanah pada pH 6,5 dan pada
temperatur yang sesuai. Hewan ternak yang terinfeksi melalui membran mukosa yang iuka berperan
mempertahankan terus-menerus rantai infeksi. Kontak dengan hewan yang terinfeksi atau dengan kulit,
rambut, dan bulunya adalah sumber infeksi pada manusia. Tindakan pengendalian meliputi (1) membuang
kerangka hewan dengan membakar atau menanamnya dalam lubang kapur, (2) dekontaminasi (biasanya
dengan autoklaf) produk-produk hewan, (3) pakaian dan sarung tangan pelindung untuk menangani
bahan-bahan yang berpotensi terinfeksi, dan (4) imunisasi aktif hewan peliharaan dengan vaksin hidup
yang dilemahkan. Orang-orang dengan risiko pekerjaan ringgi harus diimunisasi.

Pseudomonas aeruginosa
Morfologi
Spesies Pseudomonas biasanya bersifat motil, basil gram negatif berbentuk lurus atau sedikit melengkung
biasanya disusun berpasangan. Anggota genus pseudomonas ditemukan pada tanah, bahan organik yang
terurai, vegetation, dan air. Namun bisa juga ditemukan pada lingkungan rumah sakit.

Faktor virulensi
 Adhesin
setidaknya ada 4 komponen surface bacteria yang berperan dalam pelekatan bakteri ke host cell :
flagella, pilli, lipopolisakarida(LPS -> Lipid A yang terkandung dalam LPS berperan sebagai
endotoxin), alginate (membentuk prominent capsule, dimana berperan sebagai antifagosit)
 Toxins dan Enzim
Exotoxin A (ETA) dipercayai sebagai faktor virulensi yang paling penting. Toksin ini mengganggu
sintesis proteins dengan memblok elongasi rantai peptide pada sel eukaryotic.
Contoh lainnya : procyanin, proverdin, elastases, proteases, phospholipase C, exoenzymes S dan T

Penyakit yg disebabkan dan manifestasinya


penyakit yang disebabkan pada repiratory tract, urinary tract, skin and soft tissue, ears and eyes, bahkan
bakterimia dan endokarditis
P. aeruginosa menginfeksi pada bagian lower respiratory tract, dimana nantinya dapat menimbulkan
inflamasi pada bronchialis (tracheobronchitis) hingga necrotizing bronchopneumonia yang parah.
Kondisi yang mempengaruhi immunocompromised pasien dengan infeksi Pseudomonas adalah (1)
riwayat terapi dengan antibiotik spektrum luas yang mengubah keadaan normal(2) penggunaan peralatan
ventilasi mekanis, yang mungkin menyebabkan organisme ke saluran pernafasan bawah.

Diagnosis
Mikroskopik : ditemukannya bakteri batang gram negatif yang sendiri atau berpasangan
Kultur : dapat tumbuh pada meddia MacConkey. Tapi media yang sering digunakan adalah cetrimide agar
dimana nanti P. Aeruginosa akan berwarna hijau karena produksi pigmen biru (pyocyanin) dan pigmen
kuning kehijauan (pyoverdin) serta memiliki bau “grape-like odor”

Terapi antimicroba untuk P. Aeruginosa bukan lah suatu hal yang mudah karena resistan pada
kebanyakan antibiotik dan pasien yang terinfeksi dengan immunocompromised tidak dapat memmberikan
efek maksimal terhadap antibiotik. Kombinasi dari beberapa antibiotik aktif umumnya inlah yang
digunakan dalam terapi.

(Pseudomonas aeruginosa)
5. ATYPICAL PNEUMONIA (Chlamydophila pneumoniae, Chlamydophila psittaci, Chlamydia
trachomatis, Haemophilus influenzae, Mycoplasma pneumoniae, Legionella pneumophila, Coxiella
burnettii)

1. Chlamydophila pneumoniae

Micrograph of Chlamydophila (Chlamydia) pneumoniae in an epithelial cell in acute bronchitis:


1 – infected epitheliocyte,
2 – uninfected epitheliocytes,
3 – chlamydial inclusion bodies in cell,
4 – cell nuclei
Fitur Klinis
 Pneumonia; penyakit kardiovaskular

Fitur Epidemiologi
 Anak-anak, dewasa muda

Pengobatan
 Makrolida; doksisiklin, levofloxacin
Pintu Masuk Bakteri: Penghirupan

2. Haemophilus influenza

Batang Gram-Negatif
Fitur Klinis
 Strain tipe b enkapsulasi: meningitis, septikemia, selulitis, epiglottitis,
 Strain yang tidak berkapsul: otitis media, sinusitis, bronkitis, pneumonia
Fitur Epidemiologi
 Penularan aerosol pada anak muda yang belum diimunisasi; menyebar dari saluran pernapasan atas pada
pasien usia lanjut dengan penyakit pernapasan kronis
Pengobatan
 Sefalosporin spektrum luas, azitromisin, atau fluoroquinolon; banyak strain resisten terhadap ampisilin
Pertumbuhan sebagian besar spesies Haemophilus memerlukan suplementasi media dengan satu atau
kedua faktor penstimulasi pertumbuhan berikut:
(1) hemin (juga disebut faktor X untuk “faktor yang tidak diketahui”) dan
(2) nicotinamideadenine dinucleotide (NAD; Juga disebut Faktor V untuk "vitamin").
Meskipun kedua faktor hadir dalam media yang diperkaya darah, agar darah domba harus dipanaskan
dengan lembut untuk menghancurkan penghambat faktor V. Untuk alasan ini, agar darah yang dipanaskan
("coklat") digunakan untuk isolasi Haemophilus dalam kultur.
Struktur dinding sel Haemophilus adalah tipikal dari batang gram negatif lainnya. Lipopolysaccharide
dengan aktivitas endotoksin hadir di dinding sel, dan protein spesifik-regangan dan spesies-spesifik
ditemukan di membran luar. Analisis protein strain-spesifik ini berharga dalam penyelidikan
epidemiologis. Permukaan banyak, tetapi tidak semua, strain H. influenzae ditutupi dengan polisakarida
kapsul, dan enam serotipe antigenik (a sampai f) telah diidentifikasi.
3. Mycoplasma pneumoniae

Fitur Klinis
 Trakeobronkitis; faringitis; Pneumonia atipikal

Fitur Epidemiologi
 Penyakit simtomatik lebih sering terjadi pada anak-anak daripada orang dewasa; penyakit parah pada
pasien dengan hipogammaglobulinemia

Pengobatan
 Eritromisin, doksisiklin, fluoroquinolon
Pintu Masuk Bakteri: Penghirupan
Adhesin: Protein P1
Reseptor: asam sialat
Situs: Saluran pernapasan
4. Coxiella burnetii

Fitur Klinis
 Q fever: akut (demam, sakit kepala, menggigil, mialgia, hepatitis granulomatosa) atau kronis
(endokarditis, disfungsi hati)

Fitur Epidemiologi
 Orang yang terpapar ternak yang terinfeksi; terutama diperoleh melalui inhalasi; relatif tidak umum di
Amerika Serikat

Pengobatan
 Penyakit akut: doksisiklin
 Penyakit kronis: doksisiklin + hidroksi klorokuin; fluoroquinolon digunakan sebagai alternatif doksisiklin

5. Chlamydia trachomatis

Tempat masuk bakteri: Penularan seksual


Adhesin: Lektin permukaan sel
Reseptor: N-Acetylglucosamine

Fitur Klinis
Trakhoma; konjungtivitis dan pneumonia neonatal; uretritis; servisitis; proktitis;
salpingitis; limfogranuloma venereum
Fitur Epidemiologi
Trachoma di negara berkembang; paparan sekresi yang terinfeksi selama kelahiran atau kontak seksual

Pengobatan
Doksisiklin, eritromisin, orazitromisin; fluoroquinolones
6. Chlamydophila psittaci

SMALL GRAM NEGATIVE RODS, INTRACELULLAR BACTERIA


C. psittaci is transmitted by inhalation, contact, or ingestion among birds and to mammals

Infeksi pernapasan: dapat berkisar dari kolonisasi tanpa gejala (asimptomatik) hingga
bronkopneumonia berat dengan infiltrasi lokal inflamasi sel, nekrosis, dan hemorrhage
Disease : Pneumonia (psittacosis) /PARROT FEVER
Natural reservoir C. psittaci : hampir semua spesies burung, dan penyakitnya disebut ornithosis
(untuk burung). ditularkan ke manusia melalui inhalasi kotoran kering, urin, atau pernapasan sekresi dari
burung psittacine (mis., burung beo/parrots, parkit, macaw, cockatiels). Penularan dari orang ke orang
jarang terjadi.
Resiko infeksi meningkat pada dokter hewan, penjaga kebun binatang, pekerja toko hewan
peliharaan, dan karyawan pabrik pengolahan unggas.
The illness develops after an incubation of 5 to 14 days and usually manifests as headache, high
fever, chills, malaise, and myalgias

Pengobatan : dengan doksisiklin atau makrolida.

Pencegahan : Psittacosis hanya dapat dicegah melalui pengendalian infeksi di dalam negeri dan impor
burung peliharaan. Kontrol burung dengan merawat menggunakan chlortetracycline hydrochloride selama
45 hari. Tidak ada vaksin saat ini ada untuk penyakit ini.

7. Legionella pneumophila
 Legionella, first recognized outbreak was at an American Legion convention; pneumôn, lung; phila,
loving; pneumophila, lung-loving. Members of the genus Legionella are slender, pleomorphic, gram-
negative rods. Intracellular pathogen . Port of entry : Inhalasi
 Bacteri Legionella adalah patogen penting pada pernapasan; akan tetapi, tidak pernah tumbuh dalam
kultur sampai ditemukan bahwa munculnya organisme ini perlu menggunakan media yang dilengkapi
dengan zat besi dan L-sistein.
 Media Kultur Khusus : Buffered charcoal yeast extract (BCYE) agar ( bersama Nocardia)

 Identifikasi pada kultur: Weakly staining, thin, gram-negative rods; slow-growing; growth on
specialized agar; no growth on blood, chocolate, or MacConkey agars

Klinis:

 Legionnaires’ disease (pneumonia) : severe pneumonia with acute onset of fever, chills, nonproductive
cough, and headache progressing to multilobar consolidation of the lungs and multiorgan failure
 Pontiac fever (flulike illness): self-limited febrile disease with chills, myalgias, malaise, and headache
but no evidence of pneumonia

 Waterborne (air yang terkontaminasi); elderly and immunocompromised patients

 Diagnosis :

 Microscopy is insensitive
 Antigen tests are sensitive for L. pneumophila serogroup 1 but have poor sensitivity for other serogroups
and species
 Culture on buffered charcoal yeast extract agar is the diagnostic test of choice
 Seroconversion must be demonstrated; this can take as long as 6 months to develop; positive serology
may persist for months
 Nucleic acid amplification assays are as sensitive and specific as culture

 Pengobatan : Macrolides (erythromycin, azithromycin, clarithromycin); fluoroquinolones as


alternative therapy

 Pencegahan : pada environmental sources associated with disease, treat with hyper chlorination,
superheating, or copper-silver ionization
6. Croup , Measles Virus , RSV , Mumps Virus
Croup
Parainfluenza virus infect epithelial cells of respiratory tract, can cause giant cell formation and
lysis.Rarely cause viremia. More rapid than measles and mumps regards to bettter replication ability.
Generally stay in Upper Respiratory tract. Ouarter of cases, can spreads to lower respiratory tract, 2-3%
may take severe form of croup. Viral Factor : Large enveloped Virion, easyly inactivated by dryness and
Acid. Doesnt Cause Viremia

Serotypes:1,2,3,4
- Type 1,2,3 : At the Second place after the RSV as the most important cause of severe lower respiratory
tract infection in infants and young chidren, especially associated with
LARYNGOTRACHEOBRONCHITIS ( Croup ).
- Type 1,2 tend to occur in autum and is identified as the major cause of Croup.
- Type 1, 2, 3 may cause respiratory tract syndrome ranging from mild coldlike upper respiratory tract
infection ( Coryza, pharyngitis, mild bronchitis, and fever ) to bronchilitis and pneumonia. Milder
infection usually occur in children and adult. But may found pneumonia in elderly.
- Type 4 : Only cause mild upper respiratory tract infection in children and adult

Croup Characteristic :
Subglottal swelling that may close the airway. Hoarseness, Seal bark cough. Tachypnea,
tachicardia, and suprasternal retraction develop in patients after 2 to 6 day incubation period. Children
mostly recover within 48 hours. DD : Epiglotitis caused by Haemophilus influenzae

Parainfluenza Virus Ubiquotous, with a very common Infection. Transmission by direct contact
from person to person and respiratory droplets. Primary infection commonly found in children <5 years
old and infant. Reinfection can occur through life, indicating short lived immunity. Spread readyly within
hospitals and can cause outbreak in nurseries and pediatric wards.

Lab diagnosis :
Specimen Isolated from nasal washing and respiratory secretion ( Nasal Swab ). Grows well in primary
monkey kidney cell. Rapid RT PCR is considered as the method of choice to detect and identify
parainfluenza from respiratory secretion.

Treatment consist of Administration of nebulized cold or hot steam and careful monitoring of the upper
airway. Intubation may necessary, in rare occasion. No specific Vaccine ( Live attenuated Vaccine ) and
antiviral agent available.There are no modes of Control
CROUP IN RADIOLOGY , THE ARROW POINTED
AT THE STRICTURE OF THE AIRWAY.

Measles virus

Measles Virus ( Measles Morbilivirus ), Single Stranded, Negative sense , enveloped, non
segmented RNA. , also known as Rubeola, one of the five classic childhood exanthems, along with
rubella, roseola, fift disease, chicken pox.One of the most common and unpleasant virus infection, with
potential sequale.

Measles virus binds to the CD46 (membrane cofactor protein [MCP]) present on most cell types,
nectin 4 on epithelial cells, and also CD150 (signaling lymphocyte-activation molecule [SLAM]), which
is expressed on activated T and B cells. Measles is known for its propensity to cause cell fusion, leading
to the formation of giant cells. 2) and the ability to pass directly from cell to cell to escape antibody
control. Virus production occurs with eventual cell lysis. Persistent infections without lysis can occur in
certain cell types

Highly contagius, transmitted by respiratory droplets. The characteristic maculopapular measles


rash is caused by immune T cells targeted to measles infected endothelial cells lining small blood vessels.
Recovery follows the rash in most patients, who then have lifelong immunity to the virus. Death due to
pneumonia, diarrhea,or encephalitis can occur. The characteristic maculopapular measles rash is caused
by immune T cells targeted to measles infected endothelial cells lining small blood vessels. Recovery
follows the rash in most patients, who then have lifelong immunity to the virus. Death due to pneumonia,
diarrhea,or encephalitis can occur.

T-cell–deficient children who are infected with measles have an atypical presentation consisting
of giant cell pneumonia without a rash. Measles is more severe for people deficient in vitamin A. Vitamin
A is important for optimal effector T-cell function and resolution of measles infection.
Measles infection is immunosuppressive. The virus depresses the immune response by (1)
directly infectingmonocytes and T and B cells and (2) depressing interleukin (IL)-12 production and TH1-
type T-cell helper responses. Depression of cell-mediated immune and delayed-type hypersensitivity
(DTH) responses increases risk to concurrent opportunistic and other infections.

The measles virus has only one serotype and infects only humans, and infection usually manifests
with symptoms. The Modes of Control is Live attenuated vaccine (Schwartz or Moraten variants of
Edmonston B strain) can be administered. Immune serum globulin can be administered after exposure.
Virus endemic from autumn to spring, possibly because of crowding indoors. Virus has large enveloped
virion that is easily inactivated by dryness and acid. This Virus disease is considere as a febrile illness.
The incubation period lasts 7 to 13 days, and the prodrome starts with high fever and “CCC and P”—
cough, coryza, conjunctivitis,and photophobia. After 2 days of prodromal illness, the typical mucous
membrane lesions known as Koplik spots, can be found in mucosal membrane, mostly around mouth,
sometimes at vagina. Within 12 to 24 hours of the appearance of Koplik spots, the exanthem of measles
starts below the ears and spreads over the body. The Macropapular rash, which takes 1 or 2 days to cover
the body, fades in the same order in which it appeared. The fever is highest and the patient is sickest on
the day the rash appears.

Pregnant women, immunocompromised individuals, and people with allergies to gelatin or


neomycin (components of the vaccine) should not receive the MMR vaccine. Exposed susceptible people
who are immunocompromised should be given immune globulin to lessen the risk and severity of clinical
illness. This product is most effective if given within 6 days of exposure. High-dose vitamin A treatment
reduces the risk of measles mortality and is recommended by the World Health Organization.
MEALES MACROPAPULAR RASH
Mumps virus
a. Virus Mumps
Virus mumps adalah penyebab parotitis virus akut dan jinak (pembengkakan kelenjar liur yang
menyakitkan). Gondong jarang terlihat di negara-negara yang mempromosikan penggunaan vaksin hidup,
yang diberikan dengan vaksin hidup campak dan rubella, tetapi wabah telah terjadi baru-baru ini.Virus ini
paling erat kaitannya dengan virus parainfluenza 2, tetapi tidak ada kekebalan silang dengan virus
parainfluenza.

Patogenesis dan Kekebalan


Virus gondong, yang hanya diketahui satu serotipe, menyebabkan infeksi sel. Virus memulai
infeksi di sel epitel saluran pernapasan atas dan menginfeksi kelenjar parotis, baik melalui saluran
Stensen atau melalui viremia. Virus ini disebarkan oleh viremia ke seluruh tubuh ke testis, ovarium,
pankreas, tiroid, dan organ lainnya. Respons peradangan menyebabkan pembengkakan kelenjar dan
terutama bertanggung jawab atas gejala.

Sindrom Klinis
Infeksi gondok seringkali tidak menunjukkan gejala. Penyakit klinis biasanya bermanifestasi
sebagai parotitis yang hampir selalu bilateral dan disertai demam. Pemeriksaan oral menunjukkan
kemerahan dan pembengkakan ostium pada saluran Stensen (parotis).Pembengkakan yang disebabkan
oleh gondok orchitis dapat menyebabkan kemandulan. Virus gondong melibatkan sistem saraf pusat pada
sekitar 50% pasien.

Diagnosis Laboratorium
Virus dapat dipulihkan dari saliva, urin, faring, sekresi dari saluran Stensen, dan cairan
serebrospinal. Virus hadir dalam air liur selama sekitar 5 hari setelah timbulnya gejala dan dalam urin
selama 2 minggu.

Diagnosis klinis
dapat dikonfirmasikan dengan deteksi RT-PCR genom virus atau dengan ELISA, imunofluoresensi, dan
tes penghambatan hemaglutinasi untuk mendeteksi virus gondong, antigen, atau antibodi.

Pengobatan, Pencegahan, dan Kontrol


Vaksin menyediakan satu-satunya cara yang efektif untuk mencegah penyebaran infeksi gondong.
Respiratory Syncytial Virus (RSV)
Pertama kali diisolasi dari simpanse . RSV adalah anggota genus Pneumovirus. Glikoprotein
RSV tidak mengikat asam sialic atau sel darah merah, dan oleh karena itu virus tidak memerlukan atau
memiliki neuraminidase. Ini adalah penyebab paling umum dari infeksi saluran pernapasan akut yang
fatal pada bayi dan anak kecil. Ini menginfeksi hampir semua orang pada usia 2 tahun, dan infeksi ulang
terjadi sepanjang hidup, bahkan di antara orang tua.

Patogenesis dan Kekebalan RSV


menghasilkan infeksi yang terlokalisasi pada saluran pernapasan

Sindrom Klinis

Diagnosis Laboratorium
RSV sulit untuk diisolasi dalam kultur sel. Kehadiran genom virus dalam sel yang terinfeksi
dan pencucian hidung dapat dideteksi dengan teknik RT-PCR, dan tes imunofluoresensi dan enzim
immunoassay yang tersedia secara komersial tersedia untuk mendeteksi antigen virus.

Perawatan, Pencegahan, dan Kontrol


Pada bayi yang sehat, perawatan bersifat suportif, terdiri dari pemberian oksigen, cairan
intravena, dan uap dingin nebulisasi. Imunisasi pasif profilaksis dan terapeutik dengan imunoglobulin
anti-RSV atau antibodi monoklonal (palivizumab) tersedia untuk anak-anak muda yang berisiko tinggi
terhadap penyakit serius.
Langkah-langkah pencegahan termasuk mencuci tangan dan mengenakan gaun, kacamata, dan
topeng. Tidak ada vaksin saat ini tersedia untuk profilaksis RSV. Vaksin yang sebelumnya tersedia yang
mengandung RSV tidak aktif menyebabkan penerima memiliki penyakit RSV yang lebih parah ketika
kemudian terpapar virus hidup.
7. Coronavirus , Rhinovirus (common cold), Influenza virus, Flue Singapore
and Herpangina

CORONAVIRUS
Diberi nama coronavirus karena proyeksi permukaanya memberi penampakan seperti corona
matahari “solar corona-like appearance” pada virionnya ketika dilihat dari mikroskop elektron.
Coronavirus adalah penyebab umum kedua “common cold” (rhinovirus penyebab pertama).

Coronavirus telah menyebabkan wabah sindrom pernafasan akut yang parah (SARS) di Cina. Di
timur tengah (sindrom pernapasan timur tengah, MERS). Temuan mikroskopis elektron juga telah
menghubungkan coronavirus dengan gastroenteritis pada anak-anak dan orang dewasa

Virus corona adalah enveloped virion yang diselimuti dengan genom asam ribonukleat (RNA)
positif terpanjang. Virion berukuran :Diameter 80 hingga 160 nm (Kotak 47-1). Glikoprotein pada
permukaan envelope tampak seperti proyeksi berbentuk klub “club shaped projections”yang muncul
sebagai halo (corona) di sekitar virus. Tidak seperti kebanyakan virus yang diselimuti, (envelope)
"korona" yang dibentuk oleh glikoprotein memungkinkan virus untuk bertahan dalam kondisi di saluran
pencernaan dan disebarkan melalui rute fecal-oral.

Sebagian besar human coronavirus memiliki suhu optimal pertumbuhan virus dari 33 ° C hingga
35 ° C, dan oleh karena itu infeksi tetap ada terlokalisasi pada saluran pernapasan bagian atas. Virus
korona hewan, termasuk SARS-CoV dan MERS-CoV, dapat bereplikasi pada suhu 37 ° C dan
menyebabkan penyakit sistemik. Virus corona menyebabkan infeksi sitolitik dan ketika diinokulasi ke
pernapasan saluran sukarelawan manusia, mereka menginfeksi dan mengganggu fungsi sel epitel bersilia.

Virusnya paling banyak kemungkinan disebarkan oleh aerosol. Sebagian besar virus korona
manusia (human coronavirus) menyebabkan infeksi saluran pernapasan bagian atas, terhitung sekitar 10%
hingga 15% dari infeksi saluran pernapasan atas pada manusia. Penyakit ini mirip dengan common cold
oleh rhinovirus tetapi dengan periode inkubasi yang lebih lama (rata-rata,3 hari). Infeksi dapat
memperburuk penyakit paru kronis yang sudah ada sebelumnya, seperti asma atau bronkitis, dan pada
jarang kesempatan dapat menyebabkan pneumonia.

Infeksi terjadi terutama pada bayi dan anak-anak. Penyakit coronavirus muncul secara sporadis
atau berjangkit musim dingin dan musim semi. Biasanya, satu strain mendominasi sebuah wabah.
Antibodi terhadap coronavirus seragam hadir pada usia dewasa, tetapi reinfeksi umum terjadi antibodi
serum yang sudah ada sebelumnya.

Penyakit virus ini pernah terjadi saat hewan reservoir telah melakukan kontak dengan manusia.
SARS-CoV dan MERS-CoV adalah virus sitolitik yang dapat bereplikasi di tubuh suhu dalam sel epitel,
limfosit, dan leukosit. Kombinasi patogenesis virus dan imunopatogenesis menyebabkan kerusakan
jaringan yang signifikan dan penipisan sel-sel kekebalan pada paru-paru, ginjal, hati, dan pencernaan.
SARS adalah bentuk pneumonia atipikal yang ditandai oleh demam tinggi (> 38 ° C), kedinginan,
kekakuan, sakit kepala, pusing, malaise, mialgia, batuk, atau kesulitan bernapas, menyebabkan sindrom
gangguan pernapasan akut. Hingga 20% pasien juga akan mengalami diare. Orang dengan SARS terpapar
dalam 10 hari sebelumnya. Kematian setidaknya 10% dari orang bergejala. Meskipun SARS-CoV sangat
mungkin ditransmisikan dalam tetesan pernapasan, juga hadir dalam keringat,urin, dan feses.
MERS-CoV juga menyebabkan sindrom gangguan pernapasan akut, dengan 50% kematian dari
mereka yang diidentifikasi terinfeksi dengan MERS. Sebagian besar kasus MERS terjadi diSemenanjung
Arab. Kelelawar dan unta adalah reservoir alami dari MERS-CoV.

Replikasi virus korona manusia. Glikoprotein E2 berinteraksi dengan reseptor pada sel epitel,
virus atau sekering endositosis ke dalam sel, dan genom dilepaskan ke dalam sitoplasma. Sintesis protein
dibagi menjadi fase awal dan akhir, mirip dengan yang ada di togavirus. Genom mengikat ribosom, dan
RNA polimerase yang bergantung pada RNA diterjemahkan. Enzim ini menghasilkan templat RNA total-
panjang dan negatif untuk produksi genom virion baru dan enam mRNA individu untuk coronavirus
lainnya. protein. Genom tersebut berasosiasi dengan membran retikulum endoplasma kasar yang
dimodifikasi oleh protein virion dan tunas ke dalam lumen.retikulum endoplasma kasar. Vesikel yang
mengandung virus bermigrasi ke membran sel, dan virus dilepaskan oleh eksositosis

Tes laboratorium tidak dilakukan secara rutin untuk mendiagnosis infeksi coronavirus selain
untuk SARS dan MERS. RT-PCR adalah metode pilihan untuk mendeteksi virus Genom RNA dalam
sampel pernapasan dan tinja. Isolasi virus dari coronavirus sulit dan untuk SARS-CoV danMERS-CoV
membutuhkan tingkat keamanan yang ketat.

Kontrol transmisi pernapasan dari common cold bentuk coronavirus akan sulit dan mungkin tidak
perlu karena keringanan infeksi. Karantina ketat pada individu yang terinfeksi dan skrining demam pada
pelancong dari suatu daerah dengan wabah SARS-CoV dan MERS-CoV membatasi penyebaran virus ini.
Tidak ada vaksin atau terapi antivirus khusus yang tersedia.

Influenza Virus
Influenza virion bersifat pleomorfik, muncul berbentuk bola atau berbentuk tabung dan memiliki
diameter dari 80 hingga 120 nm. Envelope itu berisi dua glikoprotein,hemagglutinin (HA) dan
neuraminidase (NA), dan protein membran (M2) dan secara internal dibatasi oleh matriks (M1) protein.
Genom virus influenza A dan B terdiri dari delapan segmen nukleokapsid heliks yang berbeda masing-
masing berisi RNA perasaan negatif yang terkait dengannya nucleoprotein (NP) dan transcriptase
(komponen RNA polimerase: PB1, PB2, PA) (Tabel 49-1). Influenza C hanya memiliki tujuh segmen
genomik.Segmen genom dalam kisaran virus influenza A. dari 890 hingga 2340 pangkalan. Semua
protein dikodekan segmen yang terpisah, dengan pengecualian nonstruktural protein (NS1 dan NS2) dan
protein M1 dan M2, yang masing-masing ditranskripsi dari satu segmen

Influenza Virus berukuran besar, terbungkus (envelope), (-) RNA genom tersegmentasi.
Mengkode RNA polimerase yang tergantung RNA,mereplikasi dalam nukleus. Setiap segmen
mengkodekan satu atau dua protein. Infeksi campuran menghasilkan pencampuran genetik segmen:
reassortment Mengikat asam sialat (HA glikoprotein) dan mengkodekan aktivitas neuraminidase (NA
glikoprotein)• Antibodi dapat menghambat penyakit• Respon imun yang dimediasi sel pentinguntuk
kontrol tetapi menyebabkan patogenesis • Influenza A, bukan influenza B, adalah zoonosis • Gejala
seperti flu akut karena besar pelepasan sitokin • Penghancuran luas epitel bersilia• Pneumonia akibat
influenza atau sekunder infeksi bakteri

Epidemiologi
• Ditransmisikan oleh aerosol
• Epidemi tahunan karena mutasi, pandemi karena reassortment genom segmen antara virus manusia dan
hewan
Diagnosis
• Symptomatology, analisis genom RT-PCR sekresi pernapasan, tes imunologi (ELISA), hemaglutinasi
dan penghambatan hemaglutinasi

Perawatan, Pencegahan, dan Kontrol


• Vaksin tahunan mengandung dua influenza A dan satu jenis influenza B: tidak aktif vaksin mengandung
HA dan NA, hidup dilemahkan vaksin hidung (untuk anak usia 2-49 tahun)
• Inhibitor neuraminidase dan amantadine / obat antivirus rimantadine

Rhinovirus
Rhinovirus adalah penyebab paling penting dari penyakit infeksi saluran pernapasan atas dan
common cold. Infeksi seperti itu bersifat mandiri, namun, dan tidak menyebabkan penyakit serius. Lebih
dari 100 serotipe rhinovirus telah diidentifikasi. Setidaknya 80% dari rhinovirus memiliki reseptor umum
yang juga digunakan oleh beberapa virus coxsackie. Reseptor ini telah diidentifikasi sebagai ICAM-1,
anggota superfamili imunoglobulin, yang diekspresikan pada epitel, sel fibroblast, dan B-
limfoblastoid.Tidak seperti enterovirus, rhinovirus tidak dapat bereplikasi di saluran pencernaan.
Rhinovirus labil terhadap pH asam. Juga, mereka tumbuh paling baik pada 33 ° C, sebuah fitur yang
berkontribusi pada preferensi mereka untuk pendingin lingkungan mukosa hidung. Infeksi dapat dimulai
oleh sesedikit satu partikel virus menular.
Selama puncak penyakit, sekresi hidung mengandung konsentrasi 500 hingga 1000 virion
menular per mililiter. Virus masuk melalui hidung, mulut, atau mata dan memulai infeksi pada bagian
atas saluran pernapasan, termasuk tenggorokan. Kebanyakan replikasi virus terjadi di hidung, dan
timbulnya dan keparahan gejala berkorelasi dengan waktu pelepasan dan jumlah virus (titer) gudang
virus. Sel yang terinfeksi melepaskan bradikinin dan histamin, yang menyebabkan “pilek.

Gejala common cold yang disebabkan oleh rhinovirus tidak bisa dengan mudah dibedakan dari
yang disebabkan oleh virus lain patogen pernapasan (mis., enterovirus, paramyxoviruses,coronavirus).
Infeksi saluran pernapasan atas biasanya dimulai dengan bersin, yang segera diikuti oleh rinore (Hidung
berair). Rinore meningkat dan kemudian disertai dengan gejala sumbatan hidung. Sakit tenggorokan
ringan juga terjadi, bersamaan dengan sakit kepala dan malaise tetapi biasanya tanpa demam. Penyakit
memuncak dalam 3 hingga 4 hari, tetapi batukdan gejala hidung dapat bertahan selama 7 hingga 10 hari
atau lebih.

Sindrom klinis common cold biasanya begitu Karakteristik bahwa diagnosis laboratorium tidak
perlu. Virus dapat diperoleh dari pencucian hidung. Virus badak adalah tumbuh di sel fibroblast diploid
manusia (mis., WI-38) di 33 ° C. Virus diidentifikasi oleh efek sitopatologis yang khas dan demonstrasi
labilitas asam. Serotyping jarang terjadi diperlukan tetapi dapat dilakukan dengan menggunakan kolam
serum penetral tertentu. Identifikasi juga dapat dilakukan dengan analisis genom oleh RT-PCR. Kinerja
serologis pengujian untuk mendokumentasikan infeksi rhinovirus tidak praktis.
Ada banyak obat bebas untuk common cold . Vasokonstriktor hidung dapat memberikan bantuan,
tetapi penggunaannya dapat diikuti oleh rebound congestion dan memburuknya gejala. Menghirup udara
panas, lembab, dan bahkan uap dari sup ayam panas, sebenarnya dapat membantu dengan meningkatkan
drainase hidung.

Tidak ada obat antivirus yang efektif Pemberian interferon dapat dilakukan secara intranasal
memblokir infeksi untuk waktu yang singkat setelah paparan diketahui, tetapi penggunaan jangka
panjangnya (mis., sepanjang "musim dingin") bisa menyebabkan gejala seperti flu yang setidaknya sama
buruknya dengan infeksi rhinovirus.

Rhinovirus bukan kandidat yang baik untuk program vaksin. Serotipe multipel, penyimpangan
antigenik yang jelas pada antigen rhinoviral, persyaratan untuk produksi sekretorik IgA, dan kefanaan
tanggapan antibodi menjadi masalah utama. Masalah untuk pengembangan vaksin. Selain itu, rasio risiko
penerima manfaat akan sangat rendah karena rhinovirus tidak menyebabkan penyakit yang signifikan.
Cuci tangan dan desinfeksi benda yang terkontaminasi adalah cara terbaik untuk mencegah penyebaran
virus. Wajah virus jaringan yang diresapi dengan asam sitrat juga dapat membatasi penyebaran
rhinovirus.

FLUE SINGAPORE (Hand-Foot and Mouth Disease) dan Herpangina

Picornaviridae memiliki arti nama virus kecil (pico) asam riboksinukleat (RNA) yang memiliki struktur
kapsid telanjang. Picornaviridae memiliki beberapa genus, beberapa hal lainnya termasuk :
- Enterovirus
- Rhinovirus
- Hepatovirus
- Cardiovirus
- Apthoviruses

Rantai RNA plus dari picornavirus dikelilingi oleh kapsid icosahedral yang berdiameter sekitar 30 nm.
Kapsid icosahedral memiliki 12 simpul pentameric, masing-masing yang terdiri dari lima unit protein
protomer. Protomers terbuat dari empat virion polipeptida (VP1 hingga VP4).

ENTEROVIRUS
- penularan : fecal - oral
- resiten pada ph3 - ph9 (detergen, air limbah, panas)
- tahan terhadap asam lambung, protease, dan empedu.
- patogenesis : Virus yang masuk melalui fecal oral dan melalui jalur pernapasan atas mulai bereplikasi di
mukosa atau jaringan limfoid seperti amadel dan faring. Virus menginfeksi sel M dan limfoit peyer
patches serta eristrosit di mukosa usus. Viremia primer menyebabkan virus ke reseptor jaringan dan
menyebabkan viremia dan gejala sekunder.
- bersifat sitolitik
- berbentuk icosahedral (30nm)
- terdiri dari RNA
- genomnya menyerupai RNAm
- inang alami : Manusia
Hand Foot Mouth Disease
- disebabkan oleh : Coxscakieviruses A5, A7, A9, A10, A16, B1, B2, B3, B5, echovirus dan enterovirus
lainnya. Paling seing disebabkan oleh coxsackievirus A16 ( gejala ringan), Enterovirus 71 (Gejala berat).
- lesi vesikuler berbentuk ulkus di bagian tangan, kaki, dan mulut
- penyakit menular
- biasa menyerang anak-anak ( kurang dari 10 tahun)
- Faktor resiko : sanitasi jelek, status ekonomi rendah, kondisi tempat tinggal yang padat
- bersifat self limited disease

Coxscakievirus A16 menyebabkan lesi mukokutan ringan. Sembuh dalam 7-10 hari. Jarang memiliki
komplikasi.

Pemeriksaan Penunjang :
- Gold standar : Isolasi Virus
- Pemeriksaan PCR

HERPANGINA
- Enantema tanpa lesi kulit
- lokasi tersering : plika anterior fossa tonsilaris, uvula, tonsil, palatum molle

TREATMENT : inactivated polio vaccine (IPV) dan Live attenuated Oral Polio Vaccine ( OPV)
Anak-anak harus mendapatkan IPV di usia 2 bulan, 4 bulan, 15 bulan, dan 4-6 tahun.

Pencegahan :
- meningkatkan sanitasi lingkungan
- lebih banyak minum air putih.
8. SYSTEMIC MYCOSIS and OPPORTUNISTIC MYCOSIS

The endemic mycoses are fungal infections caused by the classic dimorphic fungal pathogens, exist as
yeasts or spherules at 37° C and molds at 25° C.They are generally confined to geographic regions
where they occupy specific environmental or ecologic niches. The endemic mycoses are often referred to
as systemic mycoses because these organisms are true pathogens and can cause infection in healthy
individuals. All of these agents produce a primary infection in the lung, with subsequent dissemination
to other organs and tissues.

1. Blastomycosis
Blastomycosis is a systemic fungal infection caused by the dimorphic pathogen Blastomyces
dermatitidis.
 nonencapsulated yeastlike cells in tissue and in culture on enriched media at 37° C
The yeast cells are spherical, hyaline, 8 to 15 µm in diameter, multinucleated, and have thick
“double-contoured” walls. The yeast cells reproduce by the formation of buds or blastoconidia
 white to tan, filamentous mold colonies on standard mycologic media at 25° C. round to oval or
pear-shaped conidia,

 Staining:
The yeast forms may be visualized in tissue stained with hematoxylin and eosin (H&E)
Gomori methenamine silver (GMS) and periodic acid–Schiff (PAS) locate the organisms and
delineate their morphology.

 B. dermatitidis appears to be in decaying organic matter. infection is acquired after inhalation of


aerosolized conidia.
 Clinical illness caused by B. dermatitidis may present as pulmonary disease or an extrapulmonary
disseminated disease.
 Clinical illness caused by B. dermatitidis may present as pulmonary disease or an extrapulmonary
disseminated disease.
 The diagnosis of blastomycosis rests with microscopic detection of the fungus in tissue or other
clinical material, with confirmation by culture
 Amphotericin B for the treatment of life-threatening or meningeal disease. Mild or moderate disease
may be treated with itraconazole. Fluconazole, posaconazole, or voriconazole may be alternatives
for those patients unable to tolerate itraconazole

2. Coccidioidomycosis
Caused by either of two indistinguishable species, Coccidioides immitis and C. posadasii. The disease is
caused by inhalation of infectious arthroconidia. C. immitis is localized to California, and C. posadasii
accounts for the majority of infections outside California. Aside from these differences, there appears to
be no additional difference

 a mold in nature and when cultured in the laboratory at25° C


 as an endosporulating spherule in tissue and under very specific conditions in vitro
 endemic to the desert southwestern United States, northern Mexico, and scattered areas of Central and
South America
 it is known to disproportionately affect persons aged 65 and older (≈36 per 100,000) and those with
human immunodeficiency virus (HIV) infection (≈20 per 100,000).
 secondary coccidioidomycosis, which may include nodules, cavitary disease, or progressive
pulmonary disease
 Primary disease usually resolves without therapy and confers a strong, specific immunity
to reinfection, which is detected by the coccidioidin skin test.
 xtrapulmonary sites of infection include skin, soft tissues, bones, joints, and meninges
 Clinical exudates should be examined directly in 10% to 20% potassium hydroxide (KOH) with
calcofluor white, and tissue from biopsy can be stained with H&E or specific fungal stains such as
GMS or PAS microscopic diagnosis methods
 amphotericin B.--> Primary coccidioidomycosis in the third trimester of pregnancy or during the
immediate postpartum period
 amphotericin B followed by an azoleImmunocompromised patients or others with diffuse
pneumonia
 The total length of therapy should be at least 1 year.
 Immunocompromised patients should be maintained on an oral azole as secondary prophylaxis

3. Emmonsiosis
Emmonsia crescens and E. parva are the agents of adiaspiromycosis, E. pasteuriana was reported as
causing disseminated infection in HIV-infected adults.
 grew as a mold at 25° C
 as a yeast at 37° C.
 Most cases in South Africa
 All reported cases of disseminated infection due to Emmonsia spp. occurred in immunocompromised
adults, the vast majority of whom suffered from late-stage HIV infection.
 Clinical manifest: very low CD4+ T-cell counts (median, 16 cells/mm3), were profoundly anemic, and
had widespread skin lesions that varied from erythematous papules and plaques to ulcerated boggy
and crusted plaques
 The yeast cells of Emmonsia spp. were readily detected by histopathologic examination of skin
biopsies and were isolated in culture from blood, bone marrow, and cutaneous tissue.
 amphotericin B deoxycholate followed by itraconazole maintenance therapy

4. Histoplasmosis
H. capsulatum var. capsulatum; pulmonary and disseminated infections in the eastern half of the United
States and most of Latin America.
H. capsulatum var. duboisii; predominantly skin and bone lesions and is restricted to the tropical areas of
Africa.
 a hyaline mold in nature and in culture at 25° C and as an intracellular budding yeast in tissue and in
culture at 37° C
 The mold colonies grow slowly and develop as white or brown hyphal colonies after several days to a
week.
 inhalation of microconidia, which in turn germinate into yeasts within the lung and may remain
localized or disseminate hematogenously or by the lymphatic system
 The selflimited form of acute pulmonary histoplasmosis is marked by a flulike illness with fever,
chills, headache, cough, myalgias, and chest pain heavy inoculum H.capsulati. Another rare
complication of histoplasmosis is a condition known as mediastinal fibrosis
 Histoplasmosis duboisii The localized form of histoplasmosis duboisii is a chronic disease
characterized by regional lymphadenopathy with lesions of skin and bone.
A more fulminant disseminated form of histoplasmosis duboisii may be seen in profoundly
immunodeficient individuals.
 The diagnosis of histoplasmosis may be made by direct microscopy, culture of blood, bone marrow, or
other clinical material, and by serology, including antigen detection in blood and urine
 Most patients with histoplasmosis recover without therapy, the first decision must be whether specific
antifungal therapy is necessary or not. Some immunocompetent patients with more severe infection
may benefit from treatment with itraconazole. In cases of severe acute pulmonary histoplasmosis
with hypoxemia and acute respiratory distress syndrome, amphotericin B should be administered
acutely, followed by oral itraconazole to complete a 12-week course

5. Paracoccidioidomycosis
Paracoccidioides brasiliensis is the pathogen. This infection is also known as South American
blastomycosis and is the major dimorphic endemic fungal infection in Latin American countries more
prevalent in South America than Central America
 The mold phase of P. brasiliensis grows slowly in vitro at 25° C.
 The characteristic yeast form is seen in tissue and in culture at 37° C.
 The variability in size and number of blastoconidia and their connection to the parent cell are
identifying features These features are best disclosed by GMS stain but may also be seen in H&E-
stained tissues or in KOH mounts of clinical material.
 infection occurs in children (peak incidence 10 to 19 years), overt disease is uncommon in both
children and adolescents. In adults, disease is more common in men aged 30 to 50 years.
 A subacute disseminated form is seen in younger patients and immunocompromised individuals
with marked lymphadenopathy, organomegaly, bone marrow involvement, and osteoarticular
manifestations mimicking osteomyelitis.
 adults most often present with a chronic pulmonary form of the disease marked by respiratory
problems, often as the sole manifestation.
 the organism may be visualized by a variety of staining methods, including calcofluor white
fluorescence, H&E, GMS, PAS, or Papanicolaou stains .The presence of multiple buds
distinguishes P. brasiliensis from Cryptococcus neoformans and B. dermatitidis
 Itraconazole is the treatment of choice for most forms of the disease and generally must be given
for at least 6 months. More severe or refractory infections may require lipid amphotericin B
therapy followed by either itraconazole

6. Talaromycosis marneffei
Talaromycosis marneffei is a disseminated mycosis caused by the dimorphic fungus Talaromyces
(formerly Penicillium) marneffei. This infection involves the mononuclear phagocytic system and
occurs primarily in HIV-infected individuals in Thailand and southern China
 In its mold phase in culture at 25° C,
 it exhibits sporulating structures that are typical of the genus. Identification is aided by the formation
of a soluble red pigment that diffuses into the agar
 At 37° C in culture and in tissue, T. marneffei grows as a yeast-like organism
 The yeast form is intracellular in vivo and in this way resembles H. capsulatum, although it is
somewhat more pleomorphic and elongated and does not bud
 Inhalation of conidia of T. marneffeientry
 at 25° C to 30° C, isolation of a mold that exhibits typical Penicillium-like morphology and a
diffusible red pigment is highly suggestive
 Microscopic detection of elliptic fission yeasts inside phagocytes in buffy coat preparations or
smears of bone marrow, ulcerative skin lesions, or lymph nodes is diagnostic
 A lipid formulation of amphotericin B, voriconazole, and itraconazole are often used to treat
infection with T. marneffei.

OPPORTUNISTIC MYCOSIS
Sama seperti oportunistik bacteria, namun memiliki faktor infeksi yang berbeda yaitu fungi.
Dimana prevalansi nya meningkatkan saat Bone Marrow Transplantation, kondisi immune yang ditekan,
Major surgery pada GI, AIDS, Neoplasma, therapi immunosuppressive, usia lanjut dan lain-lain. Adapun
oportunistik bakteri yang tersering yaitu Candida albicans, Cryptococccus neoformans, dan Aspergillus
fumigatus. Dari golongan Yeaslike-fungi, ada Trichosporum spp, Melasezia spp. Dari Hyaline mold,
seperti Fusarium, Acremonium, Scadesporium.

Candidiasis, disebabkan oleh Candida sp. Yang paling sering yaitu Candida albicans, Candida
glabarata, Candida parapsilosis, dan Candida tropicalis. Morphologinya secara garis besar, berbentuk
oval, pada fase yeastlike form, memiliki buds atau blastoconidia, juga berbentuk pseudohyphae atau true
hyphae, kecuali pada Candida glabarata.

Candida albicans, memiliki germ tube, terminal thickwall clamydiochonidia, colony berbentuk
smooth wthie, creamy, and doomed. Kurang baik pada pewarnaan dengan H&E, namun dapat
teridentifikasi baik pada pewarnaan PAS ( Periodic Acid Schiff), GMS ( Gormoni Methenamine Silver)
dan gridley fungus stain. Candida albicans memiliki kemampuan untuk merubah phenotype nya, sehingga
dapat tumbuh dihampir semua bagian tubuh, akibat perbadaan environment yg ditinggalinya. Biasanya
berkoloni pada GIT, Vagina, urethra, dan dibawah kuku pada keadaan overgrowth, dan didapati pasien
mengalami kondisi imun yang rendah sehingga Candida barrier nya melemah, maka kemungkinan akan
terjadi penyebaran melewati aliran darah hal ini dikenal dengan infeksi endoken. Sedangkan infeksi
eksogen nya terjadi melalui masuknya cairan ataupun benda asing yang terkontamiansi, baik itu tangan
health care. Faktor yang mempengaruhi seperti usia, terjadi nya immunosupressan, terpapar anti fungal,
penggunaan azole as prophylaxis, dan Cell transplant. Penggunaan CVC, meningkat apabila telah ada
koloni. Infeksi dapat menyerang hamper setiap inci dari tubuh manusia. Mucosal infectionnya dapat
menyerang hampir semua mucosa tubuh, baik di oropharynx, atau extend to whole GIT, juga pada vagina,
dimana hal ini terkait lagi pada imun pasien, serta overgrowth dari candida nya itu sendiri, dimana
terbentuk white “cottage-cheese”patch, atau pseudomembarouns, yang kemerahan, flat red serta sore ares,
pada kulit sering pada daerah yang tertutup dan lembab, biasanya terjadi pruritic ash serta erythema, dapat
menyebabkan Obstruksi pada bladder, keadaan peritonitis pada pasien peritoneal dyalisis, hingga
gangguan CNS yang menyerupai Bacterial meningitis. Infeksi Candida albicans bisa didapat melalui
scrapping mucosal, atau cutaneous, kemudian dicampur dengan KOH 10-20% serta diberi calcofluor
white, adapun kita memperhatikan budding yeastlikeform dan pseudohyphae dengan microscop
flourescense. Culture dilakukan pada Chromagar candida, pada daerah yg dibiopsi, dapat dilakukan
pewarnaan dengan GMS atau pewarnaan jamur specific lainnya.atau dilakukan tes serologic untuk
menemukan Peptide Nucleic Acid – Flow in situ Hybridization (PNA-FISH). Treatment dapat dilakukan
dengan pemberian cream, lotion, dan suppository, serta azole therapy (Fluconazole atau itraconazole).
Pada bladder infection dapat diberikan amphotericin B atau fluconazole. Namun C. glabrata dan C. krusei
dikatakan memiliki resistant terhadap fluconazole.

Cryptococcosis
Memiliki basidiomyycosis yang encapsulated, tergabung dalam yeast like fungi. Adapun species
yang paling sering yaitu Cryptococcus neoformans, dan Cryptococcus gatttii. Penyebarannya biasanya
dari tanah yang banyak terkena feces pigeon, pada eucalyptus sering ditemukan C. gattii. Morphologynya
sendiri Fungi ini memiliki bentuk spheric hingga oval, encapsulated, yeastlike organism, biasanya hanya
single buds, tapi mungkin juga chains of budding cells. Pada pewarnaan dengan tinta india, didapati
bentuk yg bervariasi, baik ukuran, bentuk yg sphere, oval, pinggiran elips, memiliki spheric zone “halos”
yang menunjukkan ekstracel polysakarida capsule. Memiliki diameter hingga 5 kali cell fungal, dan
mudah dideteksi dengan stain seperti Mayer mucicarmine. Poorly stained with H&E, namun mudah
diperiksa dengan PAS dan GMS, melanin pada C. neoformans dapat dideteksi dengan Fontana-Masson
stain. Penyebarannya dapat melalui inhalasi, karena sel nya yg easily aerosolized. Paling utama
menyerang paru, kemudian CNS dan kulit, tentunya patogenik pada pasien immunocompetent. Tanda-
tanda yg muncul seperti demam, headache, meningismus, visual disturbance, abnormal mental status,
bahkan kejang. Dimana cyproptocossis, dapat diperiksa dengan pemeriksaan darah, csf, atau cairan tubuh
lainnya, khususnya dengan pewarnaan gram ataupun tinta india, akan didapatkan morfologi yg sesuai,
atau dengan pemeriksaan urease yang positif, carbohydrate assimilation test, culture pada Niger seed agar
(brown to black colony). Atau dengan phenoloxidase test. Pada cryptococcal meningitis, akan fatal jika
dibiarkan, dan dapat diberikan Amphotericin B serta Flucytosine selama 2 minggu (induction therapy)
kemudian dilanjutkan consolidation therapy dengan fluconazole atau itraconazole selama 8 minggu. Pada
pasien dengan AIDS diberikan fluconazole atau itraconazole seumur hidup, pada pasien non aids, jika
tidak dilakukan consolidation therapy, akan relapse dalam 3-6 bulan, jika kambuh diberikan consolidation
therapy selama 1 tahun. Jika terjadi perubahan keadaan atau perburukan, perlu dilakukan 3 kali lumbal
pungsi, pada akhir terapi induksi, pada akhir consolidation therapy, dan pada perubahan mental status
pasien.

Aspergillosis
Genus aspergilus mostly indistinguishable, adapun the majority infections disebabkan A.
fumigatus, A. flavus, A. niger, dan A. terreus. Biasanya tumbuh pada kultur sebagai hyaline molds,
berwarba hitam, abu, hijau, kuning dan putih. Microscopically dapat ditemukan hyphae berseptate,
conidial heads, dan spheric conidiophoe, dengan vesicle, dengan conidial head yg terdiri dari 1 atau 2
lapis phialides. Spheric conidia diakibatkan dari perpanjangan phialides. Infection phase dari aspergilus
sendiri yaitu pada mycelial phase. Di jaringan poorly stained dengan H&E, tapi well stained dengan PAS,
GMS, dan gridley fungal stains. Hyphae nya biasanya homogen, uniform in width, dengan contur parallel,
regular septate, dan tree like patterns. Hyphae nya dapat ditemukan pada blood vessels dan menyebabkan
thrombosis. A. terreus, ditemukan pada tissue dengan spheric/oval aleurioconidia. Biasanya menyebar
melalui udara, shower, hospitalwater, dan seringnya mengenai respi tract. Biasanya terjadi
Hipersensitivitas pad bronchopumonary menyebabkan asthma, peripheral eosinophilia, peningkatan IgE
dll. Biasanya juga ditemukan bersamaan dengan Penyakit paru seperti cystic fibrosis, chronic bronchitis,
dan bronchiectasis. Bisa juga menyerang paranasal sinus, yang biasanya asymptomatic. Pada bronchial
infections menyebabkan wheezing, cough, bahkan hemoptysis. Pada pasien imunodeficiensi didapati
demam, infiltrate paru(fungus ball), dan pleuritic chest pain disertai hemoptysis. Tanpa pemberian anti
fungal. Diagnosis dapat dilakukan pemeriksaan sputum atau culture darah, namun biasanya didapatkan
negative, pada histoPA didapati moniliaceum, septate, dichotomy branches type, culture dengan potato
dextrose agar. Biasanya diambil dengan fine needle aspiration, atau specimen bronchoscopy, kemudian
dilakukan rapid test dengan elisa. Preventive nya dapat dilakukan dengan penggunaan masker, specific
antifungal bisa diberikan amphotericin B dengan voriconazole, sedangkan pada A.terreus diberikan
voriconazole saja, pengobatan akhir dapat dilakukan surgical resection.

Mucormycosis
Disebabkan oleh Mucorales yaitu Rhizopus, Mucor, Lichtheimia (formerly Absidia), Rhizomucor,
Saksenaea, Cunninghamella, Syncephalastrum, and Apophysomyces, infection rate nya rendah. Tumbuh
cepat menghasilkan gray to brown wooly coenocytic hyphae, pada microscopic didapatkan molds with
broad hyaline, sparselyseptate. Sporangiospores berada pada ujung tangkai that terminate bulbous
swelling membetuk columella, dan juga terdapat rootlike structures called rhizoids.hyphae nya biasanya
memiliki contoured irregularly, pleiomorphic, dan often folding. Weakly stained with GMS, more often
ease with H&E. mostly Rhizopus arrhizus Rhizopus, Rhizomucor, Lichtheimia, and Cunninghamella are
known to cause invasive disease in hospitalized individuals. Penyebaran melalui udara, termakan, ataupun
luka yg terkontaminasi. Gejala yang ditimbulkan seperti aspergillosis pada pasien immunocompromised.
Sering juga ada pasien dengan solid organ transplant, dengan DM. Pada pasien dengan rhinocerebral
mucormycosis terjadi infeksi pada nasal cavity, paranasal sinus, serta orbita. Pada primary infectionnya
yaitu pulmonary mucormicosis ditemukan gejala yang mirip dengan aspergillosis. Pada radiography
didapatkan bronchopneumonia segmental, ataupun lobar, ditemukan fungus ball seperti aspergillosis,
apad GIT didapatkan hemorrhage, hingga perforation.diagnosis dilakukan dengan scraping nasal mucose,
aspiration of sinus, broncho alveolar lavage, serta bipsy. Direct examine dengan KOH 10-20% ditambah
calcofluor white, ditemukan broad, aseptate hyphae. Pada histoPA dengan pewanaan H&E atau PAS,
dapat ditemukan, broad, irregularly branched, pauciseptate, twist hyphae that can be observed. Dapat
dilakukan culture dengan cara minced then put in media fungi dengan diberikan cycloheximide, walaupun
40%nya gagal. Treatmentnya diberikan amphotericin B sebagai firstline, posaconazole juga dapat
diberikan. Biasanya pada pasien immunocompetent dilakukan debridement disertai immune reconstitution
serta pemberian amphotericin B.

Hyalohypomycetes or hyaline molds.


Morphologically consist of hyaline, septate, branchy filamentous fungi, that mostly
indistinguishable for Aspergillus, mosly caused in incidental infection inhaled or progressive from
previous infection.
Fussarium spp, peningkatan frequensi dari infeksi akibat dari disseminated infection pada pasien
immunocompromised, dimana menyebabkan fungal keratits, khususnya pada pasien dengan kontak lens,
hallmark infeksi nya yaitu ada nya multiple purpuric cutaneus noduls dengan central necrosis yang jika
dibiopsi didapatkan gambaran fungi yg brancing hyaline, septate, hyphae invading dermal blood vessel,
dimana hal ini membedakan dari aspergilus sp yg negative didarah. Pada hasil kultur didapatkan rapid
grow, dengan cottony to wolly, with flat and spreads coloured by blue, green, beige, salmon, lavender, red
violet, and porple, pada microscopic didapatkan micro dan macroconidia. Resistant pada pemberian
amphotericin B, namun effective pada pemberian voriconazole, dan posaconazole, first linenya pemberian
lipid formulation of amphotericin B, ditambah voriconazole dengan imun reconstitution
Scadesporium spp, dua species utama yaitu S. apiosprenum, dan S, proliferans, dimana S.
apiospernum menyebabkan ulcus cornea, endophthalium, sinusitis pneumonia, endocarditis, meningitis,
arthritis. Dimana ini resistant terhadap amphotericin B, suspect dengan voriconazole, dan pasaconazole.
Colony tampak woolly to cottony, coloured with white to smoky brown to green, micros didapatkan
conidia one cell, elongate, dan pale brown. S. proliferans infection usually emerge, perlu penanganan
segera, biasanya pada soft tissue yang trauma, widespreade invasive, causing necrosis and osteomyelitis.
Bentukannya ameloconidia in wet clumps at the apices of annelids dengan swollen base. Resistant pada
semua antifungal dan therapy 1 1 nya yaitu surgical resection.

Acremonium spp, biasanya didapat pada pasien neutropenia, solid organ transplant, and other
imun deficient condition. Terdapat dissemination hematogen, dan positif pada culture darah. Mudah
ditemukan pada sayuran dan makananyang decay on soil. Coloni nya berentuk abu keputihan atau rose,
dengan velvety to cottony surface, conidia single celled in cains atau conidial mass, unbranched, tapered
phialides.biasanay pemberian extend spectrum triazoles.

Paecilomycosis spp, merupakan penyebab invasive disease biasanya pada stem cell recipient,
AIDS, dan lainnya. Tersebar melalui kulit ataupun IV catheter, pada gambaran microscopic didapatkan
sel unicellular, ovoid to fusiform, dan form chains, terdapat hialides dengan swollen base dan long
tapered neck. Treatment dengan amphotericin B, namun pada P. lilacinus resistens. Voriconazole, treat
both severe cutaneous infection, dan disseminated disease.

Trichoderma spp, baru-baru ini diketahui sebagai opportunistic dissemination bacteria, T.


longibrachiatm biasanya menginfeksi pada pasien Bone Marrow transplant, atau solid organ transplant,
decreased suspectibility pada pemberian Amphotericin B, itraconazole, fluconazole, dan flucytosine. And
voriconazole are active against the test.

Scopuariosis spp. Rarely invasive infection. S. brevicaulis salah satu species yang tersering, dan
menginfeksi pada kuku. Terjadi pada pasien neutropenia, leukemia ataupun setelah BMT. Pada culture
dan histolopatology, dengan standard mycologic agar, macros didapatkan gambaran smooth, granular, to
powdery, conidiophores simple atau bercabang, create broomlike structure, anneloconidia, smooth, dan
kasar saat mature, berbentuk seperti bohlam, membentuk basipetal chains. Pada penelitian didapatkan
resisten itraconazole dan sensitive dengan amphotericin B. pada infeksi yang invasive perlu dilakukan
surgical method.

PHAEOHYPOMYCOSIS
Tissue infection by dematiaceous hyphae or yeast, prevalansi meningkat, membentuk
disseminated disease, or localize to lung, paranasal sinus, or CNS. Pada CNS infection, sering terjadi
Brain abscess, merupakan infeksi progressive dari sinusistis. Pada tissue, biasnya hyphae dengan atau
tanpa yeast are present. Didapati gambaran pale brown to dark melanin like pigment dengan cell wall
appear in H&E or papanicolau stained tissue atau dengan Fontana Maison Technique

Alternania spp, penyebab paranasala infection baik pada pasien sehat atau immunocompromised.
Namun juga bisa menginfeksi pada skin soft tissue, cornea, lower respt tract. Paling sering yaitu
Alternania alternate, colony nya tumbuh cepat, cottony, dan gray to black, conidiophores nya soliter,
simple or branched.

Cladosporium spp biasanya menginfeksi superficial cutaneus,atau deep as well, tumbuh cepat
dengan velvety olive, gray to black colony. Conidiophores hyphae dan dermatiaceous, tall, branchy,
smooth or rough, and single to several celled.

Cuvularia spp, ditemukan pada daerah inhabitants soil, dan menyebabkan disseminated and local
infection, menyebabkan infeksi pada endorcard, catether site, nasal septum paranasal sinus. Pada culture
didapatkan tumbuh cepat, woolly, dengan grayy to grayish black colour. Conidia didapatkan
dermatiaceous, solitary to group, simple to branched, sympodial and geniculate. human infection include
C. geniculata, C. lunata, C. pallescens, and C. senegalensis.

Bipolaris dan exserophilum. Memiliki bentuk seperti aspergillus spp, namun tumbuh lebih
lambat, namun dapat menyebabkan vascular invasion, dan tissue necrosis, khususnya pada
immunocompromised people, tumbuh cepat, dengan gambaran woolly,black, gray bleach colony.
Microscopically conidiophores are sympodial and geniculate, conidia are dematiaceous oblong to
cylindric dan multicelled. Treatment pada deep infection belum ditemukan, namun bisa diusahakan
dengan ampho B dan eksisi. Posaconazole dapat berguna pada Exophiala spinifera , dan perlu pemberian
triazole long term dan exision, mungkin dapat mencegah reccurency.

PNEUMOCYSTOSIS
P. jirovecii, ekslusively pada pasien dengan immunosuppressive, khususnya pada infeksi HIV,
(AIDS) adapun penggunaan antiretroviral therapy dapat menurunkan angka kejadiannya. P. jirovicii
memiliki siklus hidup seksual dan aseksual pada infeksi manusia, baik pada freetropic form, sebagai
uninucleate sporocyst, as a cyst containing up to 8 ovoid, hingga fusiform intracystic bodies, yang bila
rupture akan mengeluarkan ovoid. Reservoirnya di alam masih unknown, although, has been documented
experimentally on rodent, namun strains geneticnya berbeda dengan pada manusia, Hallmark infeksinya
yaitu interstitial pneumonitis, dengan mononuclear infiltrate yang terdiri dari predominantly plasma cell.
Tanda dan gejala yang ditimbulkan seperti dyspnea, cyanosis, tachypnea, cough, dan fever. Pada
gambaran radiography didapatkan infiltrate intersitial dengan ground glass appearance. Dimana angka
mortality masih tinggi jika tidak ditangani. Histologically, foamy exudate is seen pada ruang alveolar,
dengan interstitial infiltrate yang terdiri dari plasma cells. Bisa didapatkan diffuse alveolar damage,
noncaseating granulomatous inflammation, dan infarct like coagulative necrosis. Diagnosis bisa dilakukan
dengan microscop dengan specimen Bronchoalveolar lavage fluid(most sensitive), bronchial brushing,
induced sputum, dan transbronchial or open lung biopsy specimen. Pada sputum pasien AIDS bisa
didapat 20-25% false negative untuk pemeriksaan P. jirovicii. Stains yang bisa digunakan seperti GMS,
Giemsa, PAS, toluidine blue, calcofluor white, dan immunflourescence. Pewarnaan giemsa menunjukkan
trophic form, dimana GMS menunjukkan cyst wall, sedangkan immunofluorescent stain menunjukkan
keduanya. Prophylaxis dan treatment dapat diberikan trimethroprim-sulfomethoxazole. Alternative pada
pasien AIDS, engan pentamidine, trimethoprim-dapsone, clindamycin-primaquine, atovaquone, dan
trimetrexate.