A.

Tahap Replikasi pada sel Eukariot dan Prokariot

Proses replikasi prokariot dan eukariot serupa. Perbedaan proses replikasi

pada prokariot dan eukariot yang paling utama adalah berkaitan dengan jumlah
DNA. Eukariot memiliki jumlah DNA jauh lebih banyak dari prokariot (lebih 1000 kali
dari jumlah E. Coli) dan memiliki protein histon dalam nukleosom. Replikasi pada
prokariot terdapat satu titik mulai (origin of replication) sedangkan replikasi pada
eukariot mempunyai banyak titik (origin of replication) tempat awal replikasi dimulai.
DNA polimerase pada eukariot yaitu a, b, d, g dan e. Sedangkan DNA polimerase
pada prokariot yaitu polimerase I, II, dan III. DNA polimerase pada prokariotik dan
eukariot memiliki fungsi yang berbeda. Pada eukariot fragmen Okazaki lebih pendek
daripada prokariot.
 Replikasi DNA prokariotik

Replikasi DNA dalam prokariota digambarkan sebagai berikut:

 Proses replikasi DNA membutuhkan sejumlah besar protein dan enzim yang

memainkan peran penting selama proses tersebut.

 Salah satu enzim yang paling penting dalam proses ini adalah DNA polimerase,

yang menambah urutan nukleotida ke rantai DNA yang berkembang.

 Pada prokariota, ada urutan nukleotida spesifik yang dikenal sebagai asal replikasi

yang merupakan ti-tik inisiasi dari proses replikasi.

 E.coli memiliki asal replikasi tunggal yang kaya dengan urutan A T. Protein tertentu

mengenali situs asal dan mengikat dengan itu.

 Enzim helikase membuka DNA dengan memecah ikatan hidrogen.

 DNA membentuk struktur berbentuk Y disebut garpu replikasi.

 Untai tunggal yang mengikat protein melapisi untai DNA dekat garpu replikasi yang

mencegah DNA tidak berliku kembali.

 Enzim DNA Polimerase menambahkan nukleotida hanya pada arah 5′-3’.

 Leading stand yang melengkapi dari arah 3 ‘ke 5’ untai orangtua disintesis terus

menerus menuju garpu replikasi.

 lagging strand yang melengkapi dalam arah 5 ‘ke 3’ untai orangtua yang

membutuhkan RNA primer untuk mensintesis nukleotida dalam fragmen pendek

yang dikenal sebagai fragmen Okazaki.

 enzim DNA Polimerase I menggantikan primer RNA dengan nukleotida DNA.

 DNA ligase menutup celah antara fragmen Okazaki yang bergabung dengan

fragmen untuk membentuk molekul DNA tunggal.

Replikasi DNA eukariotik

Replikasi DNA pada eukariota adalah proses yang sangat rumit yang melibatkan

banyak enzim dan protein. Proses ini terjadi dalam 3 tahap utama: inisiasi, elongasi

dan terminasi.

Inisiasi

Dalam proses inisiasi ada urutan spesifik nukleotida disebut asal replikasi yang

merupakan situs untuk inisiasi replikasi. Protein tertentu mengikat ke situs asal,

enzim helikase membuka heliks DNA dan membentuk dua garpu replikasi. Eukariota

memiliki beberapa asal replikasi yang memungkinkan replikasi secara simultan di

beberapa tempat.

Elongasi

Selama proses perpanjangan enzim yang disebut DNA polymerase menambahkan

nukleotida DNA pada ujung 3 ‘ template. Leading adalah Untai yang disintesis dalam

arah 5 ‘- 3’. Lagging strand, nukleotida baru dalam bentuk nukleotida RNA

kemplementer yang baru ditambahkan. Nukleotida RNA kemudian diganti dengan

nukleotida DNA. Leading strand yang melengkapi ke untai DNA orangtua disintesis

terus menerus menuju garpu replikasi, karena DNA polimerase dapat mensintesis

DNA dalam arah 5 ‘ke 3’. Lagging strand disintesis dalam bentuk fragmen Okazaki.

Fragmen ini memerlukan primer RNA untuk memulai sintesis.

Terminasi

Selanjutnya dalam proses, primer RNA dihapus dan nukleotida RNA digantikan oleh

nukleotida DNA oleh polimerase DNA enzim. Celah antara fragmen ditutup oleh

enzim DNA ligase.

B. Tahap Transkripsi pada sel Eukariot dan Prokariot

Transkripsi dalam Prokariota

Transkripsi dalam sel prokariotik memiliki empat tahap: pengikatan, inisiasi, elongasi

dan terminasi. Sintesis untai RNA dikatalisis oleh enzim yang disebut RNA

polimerase.
Pengikatan RNA polimerase ke urutan promotor adalah langkah pertama dalam

transkripsi. Dalam sel bakteri, hanya ada satu jenis RNA polimerase yang

mensintesis semua kelas RNA: mRNA, tRNA dan rRNA. RNA polimerase ditemukan

pada Escherichia coli (E-coli) terdiri dari dua subunit α dan dua subunit β dan faktor

sigma.

Ketika faktor sigma ini mengikat ke urutan promotor DNA mengakibatkan

pembukaan untak DNA heliks ganda, inisiasi berlangsung. Menggunakan salah satu

untai DNA sebagai template, RNA polimerase mensintesis untai RNA yang bergerak

di sepanjang untai DNA heliks yang terbuka sedikit demi sedikit. Untai RNA ini

tumbuh dari 5 ‘ke 3’ membentuk hibrida pendek dengan untai DNA, dan yang

disebut elongasi.

Pemanjangan ini berhenti dengan transkripsi urutan khusus yang disebut sinyal

terminasi. Pada prokariota, ada dua jenis terminasi, faktor terminasi tergantung dan

pemutusan intrinsik. Faktor terminasi tergantung kebutuhan faktor Rho, dan

pemutusan intrinsik terjadi ketika template berisi urutan kaya GC pendek dekat ujung

3 ‘setelah beberapa basa Urasil.

Transkripsi pada Eukariota

Transkripsi dalam sel eukariot juga memiliki empat tahap yang sama seperti pada

prokariota; yaitu pengikatan, inisiasi, elongasi dan terminasi. Namun, proses

transkripsi lebih rumit dalam sel eukariotik. Dalam sel eukariotik, tiga jenis RNA

polimerase terjadi untuk mengkatalisis sintesis untai RNA dari template DNA.

Polimerase RNA ini dilambangkan sebagai I, II, III, dan berbeda dari lokasi dan jenis

RNA yang mensintesis mereka. Polimerase ini kemudian mengikat promotor DNA
 dengan bantuan faktor transkripsi. Pembukaan heliks DNA menjadi untai tunggal,

RNA polimerase mensintesis untai RNA.

Setelah RNA polimerase telah dibatasi dengan urutan promoter DNA mengakibatkan

pembukaan heliks ganda DNA, inisiasi berlangsung. RNA polimerase mensintesis

untai RNA bergerak di sepanjang untai heliks DNA yang terbuka. Untai RNA ini

tumbuh dari 5 ‘ke 3’ membentuk hibrida pendek dengan untai DNA dan yang disebut

elongasi. Pemanjangan ini berhenti dengan transkripsi urutan khusus yang disebut

sinyal terminasi. Pemutusan dikendalikan oleh berbagai sinyal yang berbeda dengan

enzim yang terlibat.

perbedaan antara transkripsi di Eukariota dan Prokariota?

 Transkripsi dalam sel eukariotik jauh lebih rumit daripada di sel prokariotik.

 Dalam transkripsi prokariot, satu jenis RNA polimerase yang terlibat, sedangkan sel

eukariotik memiliki tiga jenis RNA polimerase.

 transkripsi Eukariota membutuhkan paket tambahan protein yang disebut faktor

transkripsi untuk mengikat RNA polimerase pada promotor, dan mereka bukan

bagian dari RNA polimerase, sedangkan transkripsi prokariot membutuhkan faktor

sigma untuk mengikat promotor.

 promotor eukariotik memiliki lebih banyak variasi daripada promotor prokariota.

 Penghentian transkripsi membutuhkan faktor Rho pada prokariota, sedangkan

eukariota tidak perlu itu.

 Dalam prokariota, dua jenis transkripsi dapat terjadi; yaitu faktor terminasi

tergantung dan pemutusan intrinsik, sedangkan transkripsi eukariotik dikendalikan

oleh sinyal yang berbeda, yang berbeda dengan enzim yang terlibat
Proses selama translasi pada eukariotik dan proksriot : inisiasi , elongasi, terminasi.

Inisiasi Pada Translasi

Perbedaan utama antara permulaan translasi eukariot dan prikariot adalah, pada
prokariot yang kompleks permulaan tranlasi terjadi secara langsung di permulaan
codon, titik di mana sintesis protein akan mulai, sedangkan eukariot memakai proses
tak langsung untuk menemukan permulaan titik. Fungsi faktor tranlasi prokariot:
faktor inisiasi, elongasi, release.
Elongasi Pada Translasi

Elongasi pada eukariotik dan prokariotik, frameshifting terjadi selama elongasi,dan

terjadi secara acak karena polipeptida bersatu setelah frameshift mempunyai urutan

asam amino yang salah.

Terminasi Pada Translasi

Sintese Protein berakhir ketika salah satu dari ke tiga penghentian codon dicapai.
Suatu lokasi tidak dimasukkan oleh suatu tRNA tetapi oleh suatu protein yang
melepaskanvfaktor. Prokariot mempunyai tiga faktor pelepasan : RF-1 yang
mengenali penghentian codon 5’-UAA-3’ dan 5’-UAG-3’, RF-2 yang mengenali 5’-
UAA-3’ dan 5’-UGA-3’, dan RF-3 yang merangsang pelepasan RF1 dan RF2 dari
ribosome setelah penghentian, di dalam suatu reaksi yang menuntut energi dari
hidrolisis GTP. Eukaryotes hanya mempunyai dua faktor pelepasan eRf-1, yang
mengenali penghentian codon, dan eRF-3, yang mungkin berperan sama

Secara garis besar translasi pada eukariot sama dengan translasi pada prokariot,
perbedaannya hanya pada beberapa hal saja, misalnya, kelompok protein dari
methyonil-dRNAi Afet tidak dibentuk dan sebagian besar mRNA eukariot dipelajari
untuk memperoleh monogenik.