Genexpert
Genexpert
net/publication/332406568
CITATIONS READS
0 319
18 authors, including:
Some of the authors of this publication are also working on these related projects:
Analisa faktor dominan yang berpengaruh pada kejadian malaria di daerah hypoendemis di Sumatera Utara : Pengembangan Model Predilsi Diagnosis Asymptomatic
malaria pada layanan kesehatan primer View project
All content following this page was uploaded by Elva Susanty on 14 April 2019.
Elva Susanty1, Zainuddin Amir2, Parluhutan Siagian2, Rina Yunita3, Putri Chairani Eyanoer4
1
Mahasiswa Ilmu Kedokteran Tropis Fakultas Kedokteran Universitas Sumatera Utara, 2Departemen
Pulmonologi dan Ilmu Kedokteran Respirasi Fakultas Kedokteran Universitas Sumatera Utara, Rumah
Sakit Umum Pusat Haji Adam Malik Medan, 3Departemen Mikrobiologi Fakultas Kedokteran Universitas
Sumatera Utara, Rumah Sakit Umum Pusat Haji Adam Malik Medan , 4Departemen Ilmu Kedokteran
Komunitas Fakultas Kedokteran Universitas Sumatera Utara
Email: kaylaelva007@gmail.com
Abstrak
Latar Belakang: Kasus multidrug resistant tuberculosis (MDR TB/TB MDR) semakin meningkat
jumlahnya di dunia dan memerlukan deteksi dini untuk mencegah penyebaran yang lebih lanjut. GeneXpert
MTB/RIF adalah alat yang dapat digunakan untuk mendeteksi resistensi rifampisin, sebagai tanda
pengganti untuk TB MDR. Penelitian ini bertujuan untuk menilai sensitivitas dan spesifisitas GeneXpert
MTB/RIF dalam mendiagnosa TB MDR.
Metode: Penelitian ini merupakan uji diagnostik yang dilakukan di poli TB MDR Rumah Sakit Umum
Pusat Haji Adam Malik Medan. Subjek penelitian adalah semua suspek penderita TB MDR yang
mempunyai hasil GeneXpert MTB/RIF positif baik resisten rifampisin maupun sensitif rifampisin dan
mempunyai hasil uji kepekaan obat metode proporsi dengan media Lowenstein Jensen. Data diambil dari
rekam medik periode Januari sampai dengan Desember 2013.
Hasil: didapatkan 64 sampel yang mempunyai hasil GeneXpert MTB/RIF positif dan mempunyai hasil uji
kepekaan obat, 87,5% sampel yang resisten rifampisin juga resisten terhadap isoniazid. Pemeriksaan
GeneXpert MTB/RIF menunjukkan sensitivitas 92,86% dan spesifisitas 59,09%.
Kesimpulan: GeneXpert MTB/RIF mempunyai sensitivitas tinggi untuk mendiagnosa TB MDR terhadap
baku emas uji kepekaan obat metode proporsi pada media Lowenstein Jensen. Penelitian ini menganjurkan
GeneXpert MTB/RIF digunakan sebagai alat skrining TB MDR.
Kata kunci: GeneXpert MTB/RIF, multidrug resistant tuberculosis, uji kepekaan obat, media Lowenstein
Jensen
Abstract
Background: Cases of multidrug resistant tuberculosis (MDR TB) is increasing in number in the world and
requires early detection to prevent further transmission. GeneXpert MTB/RIF is a tool that can be used for
detection of rifampicin resistance, as a surrogate marker for MDR TB. This study aims to assess the
sensitivity and specificity of the GeneXpert MTB/RIF in diagnosis of MDR TB.
Methods: diagnostic test study was conducted at a poly MDR TB General Hospital Haji Adam Malik
Medan. The subjects were all suspected MDR TB who had results positive GeneXpert MTB/ RIF with
sensitive rifampin or resistant rifampin and had a drug sensitivity test results with the proportion method
Lowenstein Jensen medium. Data retrieved from the medical records, between January until December
2013.
Results: founded 64 samples that had results of GeneXpert MTB/RIF test positive and had the results of
drug sensitivity, 87.5% of rifampin-resistant samples were also resistant to isoniazid. The GeneXpert
MTB/RIF examination showed the sensitivity of 92.86% and the specificitu of 59.09%.
Conclusion: GeneXpert MTB/ RIF has a high sensitivity for diagnosing MDR TB compared the gold
standard drug sensitivity testing proportion method on Lowenstein Jensen medium. This study recommends
the GeneXpert MTB/RIF be used for MDR TB screening tool.
Keywords: GeneXpert MTB/RIF, multidrug resistant tuberculosis, drug susceptibility test, Lowenstein
Jensen medium
19
Jurnal Biosains Vo. 1 No. 2 Agustus 2015 ISSN 2443-`1230 (print)
ISSN 2460-6804 (online)
20
Jurnal Biosains Vo. 1 No. 2 Agustus 2015 ISSN 2443-`1230 (print)
ISSN 2460-6804 (online)
GeneXpert MTB/RIF menggunakan tabel 2x2 suspek, 158 diantaranya diperiksa dan
untuk mengukur sensitivitas dan spesifisitas mempunyai hasil GeneXpert MTB/RIF, 81
yang dibandingkan dengan baku emas sampel yang mempunyai hasil uji kepekaan
pemeriksaan uji kepekaan obat metode obat, 64 sampel yang mempunyai hasil
proprosi dengan media Lowenstein Jensen. GeneXpert MTB/RIF dan uji kepekaan obat, 42
sampel positif TB MDR berdasarkan gold
Hasil standard yaitu uji kepekaan obat metode
Gambar 1 menunjukkan hasil proporsi dengan media LJ yang diambil data
penelusuran catatan medik dari bulan Januari dasarnya. Dari data rekam medik mulai
sampai dengan bulan Desember 2013 dan Januari sampai dengan Desemberi 2013
terlihat bahwa suspek TB MDR dari Januari didapatkan 64 sampel yang memenuhi
sampai dengan Desember 2013 terdapat 222 kriteria inklusi.
Suspek TB MDR yang mempunyai hasil Genexpert MTB/RIF (+) dan uji kepekaan obat
(n = 64)
Pemeriksaan GeneXpert
Hasil uji kepekaan obat dari MTB/RIF (+)
BPLK Bandung (n = 64)
(n = 64)
Pengambilan data
Sensitif
karakteristik dasar penderita Resisten
Rifampisin
TB MDR Bukan TB MDR positif TB MDR, tempat Rifampisin
(n = 16)
(n = 42) (n = 22) berobat TB sebelumnya, (n = 48 )
penyakit komorbid dan
kriteria suspek TB MDR
(n = 42)
21
Jurnal Biosains Vo. 1 No. 2 Agustus 2015 ISSN 2443-`1230 (print)
ISSN 2460-6804 (online)
Karakteristik n %
Usia
< 25 1 2,38
25-34 13 30,95
35-44 8 19,05
45-54 10 23,81
55-64 8 19,05
≥ 65 2 4,76
Jenis Kelamin
Laki-laki 30 71,43
Perempuan 12 28,57
Status Pernikahan
Menikah 38 90,48
Belum Menikah 4 9,52
Pekerjaan
PNS/TNI/Tenaga medis 4 9,52
Petani 4 9,52
Buruh/karyawan 11 26,19
Wiraswasta 9 21,43
Ibu rumah tangga 10 23,81
Tidak bekerja 1 2,38
Tidak ada data 3 7,15
Tempat Berobat TB Sebelumnya
Dokter spesialis 5 11,90
Rumah Sakit 7 16,67
Puskesmas 11 26,19
Penderita yang berpindah-pindah berobat 9 21,43
Tidak ada data 10 23,81
Penyakit Komorbid
Diabetes Melitus 10 23,81
HIV/AIDS 0 0
Tidak ada penyakit komorbid 27 64,29
Tidak ada data 5 11,90
Kriteria Suspek TB MDR
1. Pasien TB kronik. 2 4,76
2. Pasien TB pengobatan kategori 2 yang tidak 4 9,52
konversi setelah 3 bulan pengobatan.
3. Pasien TB yang mempunyai riwayat pengobatan 0 0
TB yang tidak standar serta menggunakan
kuinolon atau obat injeksi lini kedua minimal
selama 1 bulan. 13 30,96
4. Pasien TB kategori 1 yang gagal. 2 4,76
5. Pasien TB pengobatan kategori 1 yang tetap positif
setelah 3 bulan pengobatan. 17 40,48
6. Pasien TB kasus kambuh (relaps) kategori 1 dan
kategori 2. 4 9,52
7. Pasien TB kasus kambuh setelah loss to follow-up
(lalai berobat/default). 0 0
8. Suspek TB yang mempunyai riwayat kontak erat
dengan pasien TB MDR. 0 0
9. Pasien koinfeksi TB-HIV yang tidak respon
terhadap pemberian OAT.
22
Jurnal Biosains Vo. 1 No. 2 Agustus 2015 ISSN 2443-`1230 (print)
ISSN 2460-6804 (online)
Berdasarkan data tabel 2 terdapat yang resisten dan sensitif terhadap isoniazid
resistensi terhadap rifampisin pada 48 sampel tidak berbeda jauh dengan rifampisin yaitu 44
(75%) dan sensitif terhadap rifampisin pada sampel (68,8%) dan 20 sampel (31,2%).
16 sampel (25%). Angka resistensi sampel
Dari data tabel 3 dapat dilihat bahwa penelitian ini didapatkan 42 dari 48 sampel
pada penelitian ini didapatkan 42 dari 48 yang resisten terhadap rifampisin juga
sampel yang resisten terhadap rifampisin juga resisten terhadap isoniazid berdasarkan hasil
resisten terhadap isoniazid berdasarkan hasil uji kepekaan metode proporsi dengan media
uji kepekaan metode proporsi dengan media LJ atau terdapat 87,5% penderita yang
LJ atau terdapat 87,5% penderita yang resisten terhadap rifampisin juga resisten
resisten terhadap rifampisin juga resisten terhadap isoniazid. Terdapat 4 dari 48 sampel
terhadap isoniazid. Terdapat 4 dari 48 sampel resisten rifampisin yang sensitif terhadap
resisten rifampisin yang sensitif terhadap rifampisin berdasarkan uji kepekaan metode
rifampisin berdasarkan uji kepekaan metode proporsi dengan media LJ (8,3%).
proporsi dengan media LJ (8,3%). Pada
Tabel 3 Perbandingan Hasil GeneXpert MTB/RIF dengan Hasil Uji Kepekaan Obat Metode Proporsi
Media LJ
RR 39 5 1 3 48
SR 3 1 1 11 16
Total 42 6 2 14 64
23
Jurnal Biosains Vo. 1 No. 2 Agustus 2015 ISSN 2443-`1230 (print)
ISSN 2460-6804 (online)
Resisten Rif 44 4 48
Sensitif Rif 4 12 16
Total 48 16 64
Tabel 5 Sensitivitas GeneXpert MTB/RIF Mendiagnosa TB MDR Dibandingkan dengan Baku Emas
Kultur
20
24
Jurnal Biosains Vo. 1 No. 2 Agustus 2015 ISSN 2443-`1230 (print)
ISSN 2460-6804 (online)
21
25
Jurnal Biosains Vo. 1 No. 2 Agustus 2015 ISSN 2443-`1230 (print)
ISSN 2460-6804 (online)
22
26
Jurnal Biosains Vo. 1 No. 2 Agustus 2015 ISSN 2443-`1230 (print)
ISSN 2460-6804 (online)
23
27
Jurnal Biosains Vo. 1 No. 2 Agustus 2015 ISSN 2443-`1230 (print)
ISSN 2460-6804 (online)
24
28
Jurnal Biosains Vo. 1 No. 2 Agustus 2015 ISSN 2443-`1230 (print)
ISSN 2460-6804 (online)
59,09% dan 75%. Hasil penelitian ini juga Mycobacterium tuberculosis and
menunjukkan bahwa 87,5% penderita yang rifampin resistance in sputum
resisten terhadap rifampisin juga resisten samples. J Clin Microbio.
terhadap isoniazid dan ada 8,3% penderita 2014;52(2):502-507.
yang resisten rifampisin pada pemeriksaan Coovadia YM, Mahomed S, Pillay M, Werner L,
GeneXpert MTB/RIF tetapi pada pemeriksaan Mlisana K. Rifampicin Mono-
uji baku metode proporsi dengan media LJ Resistance in Mycobacterium
menunjukkan sensitif rifampisin. tuberculosis in KwaZulu-Natal, South
Africa: A Significant Phenomenon in a
Saran high prevalence TB-HIV region. Plose
Diperlukan adanya kelengkapan data One. 2013;8(11).
dasar karakteristik pasien seperti pekerjaan, Direktorat Jenderal Pengendalian Penyakit
tempat berobat sebelumnya, dan penyakit dan Penyehatan Lingkungan.
komorbid pada catatan medik pasien. Perlu Petunjuk teknis manajemen terpadu
dilakukan penghitungan besar sampel untuk pengendalian tuberkulosis resistan
melakukan uji diagnostik pada penelitian obat. Kementerian Kesehatan Republik
serta penelitian lebih lanjut mengenai Indonesia. 2013:1-86.
terjadinya negatif palsu dan positif palsu pada Dlamini-Mvelase NR, Wener R, Phili R, Cele
GeneXpert MTB/RIF dibandingkan dengan uji LP, Mlisana P. Effect of introducing
kepekaan obat konvensional. Sebaiknya hasil Xpert MTB/RIF test on multidrug
uji kepekaan obat konvensional sebagai baku resistant tuberculosis diagnosis in
emas diagnosa TB MDR tidak terlalu lama Kwazulu-Natal South Africa. BMC
keluar hasilnya dan kepada petugas Infectious Disease. 2014;14(442).
laboratorium agar memperhatikan kualitas Friedrich SO, Rachow A, Saathoff E, et al.
sputum, proses pengiriman sputum, lebih Assessment of the sensitivity and
teliti, dan mengikuti standar pemeriksaan specificity of Xpert MTB/RIF assay as
GeneXpert MTB/RIF dan uji kepekaan obat an early sputum biomarker of
metode proprosi dengan media LJ. response to tuberculosis treatment.
Lancet Respir Med. 2013;1(6):462-
Daftar Pustaka 470.
Battaglioli T, Rintiswati N, Martin A, et al. Gandhi NR, Nunn P, Dheda K, et al. Multidrug-
Comparative performance of Thin resistant and extensively drug-
Layer Agar and Lowenstein-Jensen resistant tuberculosis: a threat to
culture for diagnosis of tuberculosis. global control of tuberculosis. Lancet.
Clinical Microbiology and Infection. 2010; 375:1830–43.
2013;19(11):502-508. Halilu TB, Bala Z, Florence S, Yerima IB. Multi-
Blakemore R, Story E, Helb D, Kop J, et al. drug resistance tuberculosis (mdr-tb)
Evaluation of the analytical survey in North East Nigeria. J. Pharm.
performance of the Xpert MTB/RIF Cosmet.Sci. 2014;2(1):1-5.
assay. J Clin Microbiol. Helb D, Jones M, Story E, et al. Rapid detection
2010;48(7):2495-2501. of Mycobacterium tuberculosis and
Boehme C. Study protocol-Xpert TM MTB/RIF rifampin resistance by use of demand
demonstration-feasibility, impact and near patient technology. J Clin
cost-efficiency of decentralizing Microbiol; 48(1):229-237.
molecular testing for detection of Ioannidis P, Papaventsis D, Karabela S, et al.
tuberculosis and rifampicin rsistance Cepheid GeneXpert MTB/RIF assay
using XperTM MTB/RIF. FIND, 2009. for Mycobacterium tuberculosis
Brito RC, Mello FCQ, Andrade MK, et al. Drug- detection and rifampisisn resistance
resistant tuberculosis in six hospitals identification in patiens with
in Rio de Janeiro, Brazil. Int J Tuberc substantial clinical indications of
Lung Dis. 2010;14(1):24-33. tuberculosis and smear-negative
Calligaro GL, Moodley L, Symons G, Dheda K. microscopy results. J. Clin. Microbiol.
The medical and surgical treatment of 2011;49(8):3068-3070.
drug resistant tuberculosis. J Thorac Lawn SD, Nicol MP. Xpert® MTB/RIF assay:
Dis. 2014;6(3):186-195. development, evaluation and
Castan P, Pablo A, Romero A, et al. Point-of- implementation of a new rapid
care system for detection of molecular diagnostic for tuberculosis
25
29
Jurnal Biosains Vo. 1 No. 2 Agustus 2015 ISSN 2443-`1230 (print)
ISSN 2460-6804 (online)
26
30