Resume Asam Nukleat

Nama : Karman Nusi

NIM : 432419002

Kelas : A

Prodi : Biologi

A. Pengertian Asam Nukleat

Asam nukleat dari biologi molekul penting bagi kehidupan, dan termasuk DNA (asam
deoksiribonukleat) dan RNA (asam ribonukleat). Bersama dengan protein, asam nukleat
membentuk paling penting makromolekul , masing-masing ditemukan dalam kelimpahan
dalam semua makhluk hidup, di mana mereka berfungsi dalam pengkodean, transmisi dan
mengekspresikan informasi genetik.

Asam nukleat ditemukan oleh FriedrichMiescher pada tahun 1869. Studi

Eksperimental asam nukleat merupakan bagian utama modern biologi dan penelitian medis ,
dan membentuk dasar untuk genom dan ilmu forensik , serta bioteknologi dan industri
farmasi. Kemudian AlbrechtKossel menemukan asam nukleat yang tersusun oleh suatu gugus
gula, gugus fosfat, dan gugus basa.

Ciri- ciri Asam Nukleat :

a.       Terdapat pada semua sel hidup

b.      Merupakan makromolekul dengan monomer Mononukleotida

B. Fungsi Asam Nukleat

Fungsi Asam Nukleat adalah sebagai berikut:

1. Menyimpan, mereplikasi dan mentranskripsi informasi genetika

2. Turut dalam metabolisme
3. Penyimpan energi
4. Sebagai ko-enzim
 C. Struktur Asam Nukleat

D.    Tata nama Asam Nukleat

Asam nukleat istilah adalah nama keseluruhan untuk DNA dan RNA, anggota
keluarga biopolimer, dan ini identik dengan polinukleotida. Asam nukleat dinamai untuk
penemuan awal mereka dalam inti, dan untuk gugus fosfat (terkait dengan asam fosfat).
Meskipun pertama kali ditemukan dalam nukleus dari eukariotik sel, asam nukleat sekarang
dikenal dapat ditemukan dalam semua bentuk kehidupan, termasuk dalam bakteri, archaea,
mitokondria, kloroplas, virus dan viroid. Semua sel hidup dan organel mengandung DNA dan
RNA, sedangkan virus mengandung baik DNA atau RNA, tetapi biasanya tidak keduanya.
Komponen dasar asam nukleat biologis adalah nukleotida yang masing-masing berisi gula
pentosa (ribosa atau deoksiribosa), sebuah fosfat kelompok, dan nucleobase . Asam nukleat
juga dihasilkan dalam laboratorium, melalui penggunaan enzim (DNA dan RNA polimerase)
dan dengan padat-fase sintesis kimia. Metode kimia juga memungkinkan generasi asam
nukleat yang berubah yang tidak ditemukan di alam, misalnya asam nukleat peptida .

• Gula pada asam nukleat adalah ribosa.

• Ribosa (b-D-furanosa) adalah gula pentosa (jumlah karbon 5).
• Perhatikan penomoran. Dalam penulisan diberi tanda prime(') untuk
membedakan penomoran pada basa nitrogen
• Ikatan gula ribosa dengan basa nitrogen (pada atom karbon nomor 1).
• Ikatan gula ribosa dengan gugus fosfat (pada atom karbon nomor 5).
• Gugus hidroksil pada atom karbon nomor 2

BASA NITROGEN
 Basa nitrogen berikatan dengan ikatan-b pada atom karbon nomor1' dari gula ribosa
atau deoksiribosa.

Pirimidin berikatan ke gula ribosa pada atom N-1 dari struktur cincinnya.

Purin berikatan ke gula ribosa pada atom N-9 dari struktur cincinnya.

BASA PURIN

GUGUS FOSFAT

 Nukleosida : Senyawa antara purin dan primidin dengan ribosa dan deoksiribosa.
Beberapa nama nukleosida :
 Nukleotida : Ester nukleosida dengan asam fosfat. Singkatan nama beberapa
nukleotida :

Fungsi nukleotida :

1. Sebagai pembawa energy. Nukleotida yang penting : AMP, ADP, ATP→ penting
dalam penyimpanan dan pemanfaatan energi selama metabolisme sel.
ATP pembawa energi utama dalam sel :
1. ADP + Pa ATP (fosforilase oksidatif)
2. Energi
3. ATP + H2O→ ADP + Pa (as. fosfat) + energi (hidrolisis)
4. Pembawa bahan pembentuk dasar suatu molekul.
 Contoh :
- Nukleotida UridinDifosfat (UDP) untuk sintesis glikogen
- KolinSitidinDifosfat sintesis kolin fosfolipid.
- Nukleotida trifosfat (NTP) sintesis DNA dan RNA
5. Sebagai ko enzim
- Nikotamida Mono Nukleotida (NMN) → merupakan vitamin
- Flavin Mono Nukleotida (FMN) → koenzim proses oksidasi – reduksi
pada respirasi sel.

-          Nikotinamida Adenin Dinukleotida (NAD), Nikotinamida Adenin

Dinukleotida Fosfat (NADP), Flavin Adenin Dinukleotida (FAD) → koenzim proses
oksidasi – reduksi

E. Komposisi Molekuler dan Ukuran Asam Nukleat

Asam nukleat dapat bervariasi dalam ukuran, tetapi umumnya molekul yang sangat
besar. Memang, molekul DNA yang mungkin merupakan molekul individu terbesar yang
diketahui. Dipelajari dengan baik biologi molekul asam nukleat berbagai ukuran dari 21
nukleotida ( kecil mengganggu RNA ) ke kromosom besar ( 1 kromosom manusia adalah
molekul tunggal yang berisi pasangan basa 247 juta ).

Dalam kebanyakan kasus, molekul DNA alami adalah untai ganda RNA dan molekul
untai tunggal. Ada pengecualian banyak, namun-beberapa virus memiliki genom terbuat dari
RNA untai ganda dan virus lainnya memiliki DNA beruntai tunggal genom, dan, dalam
beberapa keadaan, struktur asam nukleat dengan tiga atau empat helai bisa terwujud.

Asam nukleat adalah linear polimer (rantai) dari nukleotida. Setiap nukleotida terdiri
dari tiga komponen: purin atau pirimidinnucleobase (kadang-kadang disebut basis nitrogen
atau hanya basa), sebuah pentosa gula, dan fosfat kelompok. Sub-struktur yang terdiri dari
gula nucleobase ditambah disebut sebuah nukleosida . Jenis asam nukleat berbeda dalam
struktur gula dalam nukleotida mereka - DNA berisi 2'- deoksiribosa sedangkan RNA
mengandung ribosa (di mana satu-satunya perbedaan adalah adanya gugus hidroksil ). Juga,
nukleobasa ditemukan di kedua jenis asam nukleat yang berbeda: adenin , sitosin , dan guanin
dapat ditemukan di kedua RNA dan DNA, sedangkan timin terjadi pada DNA dan urasil
terjadi pada RNA.
Gula dan fosfat dalam asam nukleat saling terhubung satu sama lain dalam rantai bolak (gula-
fosfat tulang punggung) melalui fosfodiester hubungan. Dalam nomenklatur konvensional ,
karbon-karbon dimana gugus fosfat melampirkan adalah ujung 3'-5 dan '-akhir karbon dari
gula. Hal ini memberikan asam nukleat directionality, dan ujung-ujung molekul asam nukleat
yang disebut sebagai 5'-end dan 3'-end. Para nukleobasa bergabung ke gula melalui N-
glikosidik hubungan yang melibatkan nitrogen cincin nucleobase (N-1 untuk pirimidin dan
N-9 untuk purin) dan karbon 1 'dari cincin gula pentosa.

F. Jenis-Jenis asam nukleat

1. Asam Deoksiribonukleat

Asam deoksiribonukleat merupakan asam nukleat yang berisi instruksi genetik yang
digunakan dalam pengembangan dan fungsi dari semua organisme hidup dikenal. Peran
utama dari molekul DNA adalah penyimpanan jangka panjang informasi dan DNA sering
dibandingkan dengan satu set cetak biru, karena berisi petunjuk yang dibutuhkan untuk
membangun komponen lain sel, seperti protein dan molekul RNA. Segmen DNA yang
membawa informasi genetik ini disebut gen, tetapi urutan DNA lain memiliki tujuan
struktural, atau terlibat dalam mengatur penggunaan informasi ini genetik.

Ciri-ciri Asam Deoksiribonukleat :

 Makromolekul dengan Mr yang sangat besar.

 Terdiri dari mononukleotida utama :

dAMP, dGMP, dTMP, dCMP

 Terdiri dari dua atau lebih rantai polinukleotida

yang tersusun dalam struktur heliks (heliks ganda)

 Setiap spesies/organisme mononukleotida utamanya mempunyai perbandingan,

urutan dan berat molekul (Mr) yang spesifik.
 Pada sel prokariotik (mengandung hanya satu kromosom) DNA nya merupakan
makromolekul tunggal dengan Mr = 2 x 109.
 Pada sel eukariotik (mengandung banyak kromosom) mempunyai banyak molekul
DNA dengan Mr yang sangat besar.
  DNA terutama terdapat dalam inti sel (DNA inti) bergabung dengan protein histon.
Juga bisa terdapat pada sitoplasma (DNA sitoplasma), dalam mitokondria, dalam
khloroplas.
 Pada sel bakteri selain terdapat dalam inti sel juga bisa pada sel membran = mesosom
dan dalam sitoplasma di luar kromosom = plasmid/episom.
 DNA normal dari suatu spesies yang berbeda menunjukkan adanya keteraturan
(regularitas)

CHARGAFF’S RULES :

-  Komposisi basa dari DNA suatu organisme adalah tetap pada semua sel nya dan
mempunyai karakteristik tertentu

- Komposisi basa dari DNA bervariasi dari suatu organisme dengan organisme lainnya
dinyatakan dengan dissymmetryratio : (A + T) / (G + C)

- Komposisi basa dari suatu spesies tidak berubah oleh umur, keadaan nutrisi, ataupun
lingkungan.

- Jumlah adenin dalam DNA suatu organisme selalu sama dengan jumlah timin (A = T).

- Jumlah guanin dalam DNA suatu organisme selalu sama dengan jumlah sitosin (G=C).

- Jumlah total basa purin dalam DNA suatu organisme selalu sama dengan jumlah total basa
pirimidin : (A + G) = (T + C).

DEOKSIRIBONUKLEOTIDA UTAMA

2. Asam Ribonukleat

Asam ribonukleat (RNA) fungsi dalam mengkonversi informasi genetik dari gen ke
dalam sekuens asam amino dari protein. Ketiga jenis universal termasuk RNA transfer
(tRNA), messenger RNA (mRNA), dan RNA ribosomal (rRNA). Messenger RNA bertindak
untuk membawa informasi urutan genetik antara DNA dan ribosom, mengarahkan sintesis
protein. Ribosomal RNA adalah komponen utama dari ribosom, dan mengkatalisis
pembentukan ikatan peptida. transfer RNA berfungsi sebagai molekul pembawa untuk asam
amino yang akan digunakan dalam sintesis protein, dan bertanggung jawab untuk
decodingmRNA. Selain itu, banyak kelas RNA sekarang dikenal.
Ciri-ciri Asam Ribonukleat :

 Terdiri dari rantai tunggal poliribonukleotida.

 Hampir seluruhnya terdapat di sitoplasma, juga terdapat pada virus.
 Rantai tunggal→ Chargaff’sRules tidak berlaku
 Ada 3 macam :

- tRNA (transfer-RNA)

-mRNA (messenger-RNA)

-rRNA (ribosomal-RNA)

-tRNA

 Molekul yang kecil

 Basanya : A, G dan U yang termetilasi.
 Jumlahnya hanya sedikit dari total RNA dalam sel
 Mengangkut (transport) asam amino spesifik ke
 Ribosom untuk proses sintesis protein

-mRNA

 Basa nya : A, G, C dan U

 Disintesis dalam inti sel pada proses transkripsi
 Pembawa informasi genetik dari DNA untuk
 Sintesis protein
 Umurnya pendek→ mengalami Degradasi/resintesis

-r RNA

 Bagian terbanyak dari RNA dalam sel (80%)

 Merupakan 60% dari berat ribosom
 Basa utamanya : A, G, C, U
 Fungsinya belum jelas
RIBONUKLEOTIDA UTAMA

G.    Hidrolisis Asam Nukleat

1. Hidrolisis dengan enzim→ enzim nuklease, yang terdiri dari :

a. enzim eksonuklease→ menyerang ujung rantai polinukleotida

b. enzim endonuklease→ menyerang bagian dalam rantai

2. Hidrolisis dengan asam/basa

a. Hidrolisis DNA dengan asam→ terbentuk asam apurinat (DNA tanpa purin) dan asam
apirimidat (DNA tanpa pirimidin)
b. DNA tidak dihidrolisis oleh basa
c. Hidrolisis RNA dengan basa memutuskan→ ikatan gugus hidroksil – 2 ribosa.