MIKROBIOLOGI
DOSEN PENGAJAR
DISUSUN OLEH
UNIVERSITAS PALANGKARAYA
FAKULTAS PERTANIAN
2019/2020
KATA PENGANTAR
Puji syukur saya panjatkan kehadirat Tuhan Yang Maha Esa karena atas
limpahan rahmat dan hidayahnya sehingga saya dapat menyelesaikan makalah
yang berjudul “ ”Pada makalah ini saya banyak mengambil dari berbagai
sumber dan refrensi dan pengarahan dari berbagai pihak .oleh sebab itu, dalam
kesempatan ini saya mengucapkan terima kasih sebesar-sebesarnya kepada semua
pihak yang telah membantu dalam penyusunan makalah ini.
Akhir kata penyusun mengucapkan terima kasih dan semoga makalah ini dapat
bermanfaat untuk semua pihak yang membaca.
PalangkaRaya,
11 April Oktober 2020
Restu Astuti
DAFTAR ISI
KataPengantar................................................................................................
Daftar Isi..........................................................................................................
BAB I PENDAHULUAN
1.1. Latar Belakang................................................................................
1.2. Tujuan.............................................................................................
BAB II PEMBAHASAN
2.1. Pengertian Bakteri..........................................................................
2.2. Struktur Sel Bakteri .......................................................................
2.3. Penggolongan Bakteri ....................................................................
2.4. Klasifikasi Bakteri.........................................................................
2.5. Fungsi Serta Peran Bakteri Dalam Kehidupan Manusia...............
2.6. Bakteri Penyebab Penyakit Pada Ikan............................................
BAB III PENUTUP
3.1 Kesimpulan.......................................................................................
Daftar Pustaka................................................................................................
BAB I
PENDAHULUAN
1.1. LATAR BELAKANG
Mikroorganisme identik dengan objek biologi yang amat kecil dan tidak
dilihat dengan mata telanjang. Keberadaannya tidak terlihat namun penting di
dalam kehidupan. Sejalan dengan perkembangan ilmu biologi masa kini,
mikroorganisme ditelaah dan dimanfaatkan untuk kepentingan hidup manusia.
Mikrobiologi berasal dari bahasa yunani (micros adalah kecil dan bios
adalah hidup dan logos adalah pengetahuan), jadi mikrobioloagi adalah ilmu yang
mempelajari tentang makhluk-makhluk hidup yang sangat kecil. Dunia
mikroorganisme terdiri dari lima kelompok organism yaitu bakteri, protozoa,
virus, serta algae dan cendawan mikrokopis.
Untuk itulah penulis membuat makalah ini. Disamping sebagai
pemenuhan tugas mata kuliah mikrobiolgi, juga berguna bagi penulis sendiri
untuk mengetahui lebih lanjut tentang intrumen mikrobiologi dan cara
mengamatinya.
1.2. TUJUAN
1. apa itu bakteri ?
2. Mengetahui klasifikasi bakteri ?
3. Mengetahui struktur, fungsi serta penggolongan bakteri ?
BAB II
PEMBAHASAN
2.1. Pengertian Bakteri
Bakteri adalah nama sekelompok mikroorganisme yang termasuk
prokaryotae yang bersel satu, berkembang biak dengan membelah diri dan bahan-
bahan genetiknya tidak terbungkus dalam membran inti. Pada umumnya bakteri
tidak mempunyai klorofil, kecuali beberapa species tertentu yang mempunyai
pigmen fotosintesis. Oleh karena itu, ada bakteri yang hidupnya heterotrof dan
ada juga bacteria yang hidup autotrof. Bakteri heterotrof dapat dibedakan menjadi
bakteri yang hidup sebagai parsit dan saprofit, Sedangkan bakteri autotrof dapat
dibedakan berdasarkan atas sumber energi yang digunakan untuk mensentetis
makanannya menjadi bakteri fotoautotrof dan kemoautotrof. Bakteri dapat hidup
dimana saja, ada yang merugikan manusia, hewan maupun tumbuhan. Namun
demikian ada juga bakteri yang menguntungkan bagi umat manusia.
Beberapa kelompok bakteri dikenal sebagai agen
penyebab infeksi dan penyakit, sedangkan kelompok lainnya dapat memberikan
manfaat dibidang pangan, pengobatan, dan industri. Struktur sel bakteri relatif
sederhana: tanpa nukleus/inti sel, kerangka sel, dan organel-organel lain
seperti mitokondria dan kloroplas. Hal inilah yang menjadi dasar perbedaan
antara selprokariot dengan sel eukariot yang lebih kompleks.Bakteri dapat
ditemukan di hampir semua tempat: di tanah, air, udara, dalam simbiosis dengan
organisme lain maupun sebagai agen parasit (patogen), bahkan dalam tubuh
manusia.
2.2. Struktur Sel Bakteri
Pada umumnya, bakteri berukuran 0,5-5 μm, tetapi ada bakteri tertentu
yang dapat berdiameter hingga 700 μm, yaitu Thiomargarita. Mereka umumnya
memiliki dinding sel, seperti sel tumbuhan dan jamur, tetapi dengan bahan
pembentuk sangat berbeda (peptidoglikan). Beberapa jenis bakteri bersifat motil
(mampu bergerak) dan mobilitasnya ini disebabkan oleh flagel.
Bakteri memiliki bentuk sel yang bervariasi, bulat (coccus), batang
(bacillus) dan lengkung (vibrio, coma atau spiral). Umumnya sel bakteri yang
berbentuk bulat berdiameter sekitar 0,7 - 1,3 mikron. Sedangkan sel bakteri
berbentuk batang lebarnya sekitas 0,2 - 2,0 mikron dan panjangnya 0,7 - 3,7
mikron.
Bagian tubuh bakteri pada umumnya dapat dibagi atas 3 bagian yaitu
dinding sel, protoplasma (di dalamnya terdapat membran sel, mesosom, lisosom,
DNA, endospora), dan bagian yang terdapat di luar dinding sel seperti kapsul,
flagel, pilus. Di antara bagianbagian tersebut ada yang selalu didapatkan pada sel
bakteri, yaitu membran sel, ribosom dan DNA. Bagian-bagian ini disebut sebagai
invarian. Sedangkan bagian-bagian yang tidak selalu ada pada setiap sel bakteri,
misalnya dinding sel, flagel, pilus, dan kapsul. Bagianbagian ini disebut varian.
Susunan bagian-bagian utama sel bakteri, dijelaskan sebagai berikut:
a. Membran sel
Membran sel merupakan selaput yang membungkus sitoplasma beserta
isinya, terletak di sebelah dalam dinding sel, tetapi tidak terikat erat dengan
dinding sel. Bagi membran sel sangat vital, bagian ini merupakan batas antara
bagian dalam sel dengan lingkungannya. Jika membran sel pecah atau rusak,
maka sel bakteri akan mati. Membran sel terdiri atas dua lapis molekul fosfolipid.
Pada lapisan fosfo-lipid ini terdapat senyawa protein dan karbohidrat dengan
kadar berbeda-beda pada berbagai sel bakteri.
b. Ribosom
Ribosom merupakan bagian sel yang berfungsi sebagai tempat sintesa
protein. Bentuknya berupa butir-butir kecil dan tidak diselubungi membran.
Ribosom tersusun atas protein dan RNA.
c. DNA (Deoxyribonucleic Acid)
DNA merupakan materi genetik, terdapat dalam sitoplasma. DNA bakteri
berupa benang sirkuler (melingkar). DNA bakteri berfungi sebagai pengendali
sintesis protein bakteri dan pembawa sifat. DNA bakteri terdapat pada bagian
menyerupai inti yang disebut nukleoid. Bagian ini tidak memiliki membran
sebagaimana inti sel eukariotik.
d. Dinding sel
Dinding sel bakteri tersusun atas makromolekul peptidoglikan yang terdiri
dari monomer-monomer tetrapeptidaglikan (polisakarida dan asam amino).
Berdasarkan susunan kimia dinding selnya, bakteri dibedakan atas bakteri gram-
positif dan bakteri gramnegatif. Susunan kimia dinding sel bakteri gram-negatif
lebih rumit daripada bakteri gram-positif. Dinding sel bakteri grampositif hanya
tersusun atas satu lapis peptidoglikan yang relatif tebal, sedangkan dinding sel
bakteri gram-negatif terdiri atas dua lapisan. Lapisan luar tersusun atas protein
dan polisakarida, lapisan dalamnya tersusun atas peptidoglikan yang lebih tipis
dibanding lapisan peptidoglikan pada bakteri gram-positif. Dinding sel bakteri
berfungsi untuk memberi bentuk sel, memberi kekuatan, melindungi sel dan
menyelenggarakan pertukaran zat antara sel dengan lingkungannya.
e. Flagel
Flagel merupakan alat gerak bagi bakteri, meskipun tidak semua gerakan
bakteri disebabkan oleh flagel. Flagel berpangkal pada protoplas, tersusun atas
senyawa protein yang disebut flagelin, sedikit karbohidrat dan pada beberapa
bakteri mengandung lipid. Jumlah dan letak flagel pada berbagai jenis bakteri
bervariasi. Jumlahnya bisa satu, dua, atau lebih, dan letaknya dapat di ujung, sisi,
atau pada seluruh permukaan sel. Jumlah dan letak flagel dijadikan salah satu
dasar penggolongan bakteri.
f. Pilus
Pada permukaan sel bakteri gram-negatif seringkali terdapat banyak
bagian seperti benang pendek yang disebut pilus atau fimbria (jamak dari pilus).
Pilus merupakan alat lekat sel bakteri dengan sel bakteri lain atau dengan bahan-
bahan padat lain, misalnya makanan sel bakteri.
g. Kapsul
Kapsul merupakan lapisan lendir yang menyelubungi dinding sel bakteri.
Pada umumnya kapsul tersusun atas senyawa polisakarida, polipeptida atau
protein-polisakarida (glikoprotein). Kapsul berfungsi untuk perlindungan diri
terhadap antibodi yang dihasilkan sel inang. Oleh karenanya kapsul hanya
didapatkan pada bakteri pathogen.
h. Endospora
Di antara bakteri ada yang membentuk endospora. Pembentukan
endospora merupakan cara bakteri mengatasi keadaan lingkungan yang tidak
menguntungkan. Keadaan lingkungan yang tidak menguntungkan antara lain:
panas, dingin, kering, tekanan osmosis dan zatkimia tertentu. Jika kondisi
lingkungan membaik maka endospora akan tumbuh menjadi sel bakteri.
Endospora bakteri tidak berfungsi sebagai alat perkembangbiakan, tetapi sebagai
alat perlindungan diri.
Sel-sel bakteri yang membentuk spora tampak sebagai ruangan berisi
benda bulat, yang letaknya dapat di salah satu ujung ruang itu, dapat pula di
tengah-tengah.
Apabila lingkungan hidup bakteri menjadi buruk, maka banyak yang mati,
akan tetapi ada juga bakteri-bakteri yang dapat membentuk spora spora yang
tahan terhadap lingkungan ynag buruk seperti kekeringan, kekurangan bahan
makanan dan lain sebagainya. Jika keadaan menjadi baik kembali, maka spora itu
akan tumbuh menjadi bakteri biasa yang disebut bentuk vegetaif. Spora-spora
pada bakteri ini dibentuk disebelah dalam dinding sel bakteri sehigga dinamakan
endospora. Proses pembentukan endospora yang di dalam sel induk dikenal
sebagai sporulasi atau sporogenesis.
Pada tahap pertama proses sporulasi ini dapat dilihat terjadinya replikasi
kromosom bakteri dan sebagai kecil dari sitoplasma terpisah oleh suatu
sekat(septum) spora. Sekat spora ini menjadi membrane yang berlapis dua yang
masing-masing mengelilingi kromosom dab sitoplasma. Struktur ini seluruhnya
dibungkus idalam sel asal yang disebut fore spore. Lapisan-lapisan peptidoglikan
yang tebal terdapat diantara 2 lapisan membran. Kemudian suatu mantel spora
yang tebal yang terdiri dari protein terbentuk disebelah luar membran. Mantel ini
berfungsi untuk melindungi endospora terhadap zat-zat kimia keras. Kemudian
endospora dapat keluar atau bebas dari sel. Letaknya endospora di dalam sel
bakteri tergantung dari spesies bakterinya.
Apabila endospora telah matang dinding sel vegetatif melebur dan
endospora dibebaskan. Inti endospora yang mengalami dehidrasi yang tinggi,
hanya mengandung sedikit DNA, RNA, ribosom, enzim dan beberapa molekul
yang penting. Endospora itu dapat dianggap sebagai bentuk laten dari bakteri yang
dapat berlangsung dalam jangka waktu yang lama sekali. Endospora yang kembali
kepada keadaan vegetatif mengalami suatu proses yang disebut dengan germinasi.
Proses germinasi atau perkecambahan ini dipacu adanya kerusakan fisik dan
kemis pada mantel endospora. Enzim-enzim yang terdapat dalam endospora akan
merusak lapisan-lapisan lain terdapat di sekeliling endospora, kemudian air dapat
masuk sehingga metabolism dapat berlangsung. Oleh karena satu sel vegetatif
hanya membentuk satu endospora, maka sporogenesis pada bakteri bukan
merupakan alat perkembangbiakan, karena tidak ada pertambahan jumlah sel.
Dipandang dari segi klinis, endospora ini sangat penting karena tahan terhadap
pemanasan, pendinginan, penggunaan zat-zat kimia dan radiasi. Kebanyakan sel
vegetatif akan mati pada suhu 700C sedangkan endospora dapat tetap hidup pada
air mendidih sampai setengah jam atau lebih.
Perbedaan dasar antara bakteri gram positif dan negatif adalah pada
komponen dinding selnya. Kompleks zat iodin terperangkap antara dinding sel
dan membran sitoplasma organisme gram positif, sedangkan penyingkiran zat
lipida dari dinding sel organisme gram negatif dengan pencucian alcohol
memungkinkan hilang dari sel. Bakteri gram positif memiliki membran tunggal
yang dilapisi peptidohlikan yang tebal (25-50nm) sedangkan bakteri negative
lapisan peptidoglikogennya tipis (1-3 nm).
Sifat bakteri terhadap pewarnaan Gram merupakan sifat penting untuk
membantu determinasi suatu bakteri. Beberapa perbedaan sifat yang dapat
dijumpai antara bakteri Gram positif dan bakteri Gram negatif yaitu:
Ciri-ciri bakteri gram negatif yaitu:
Struktur dinding selnya tipis, sekitar 10 – 15 mm, berlapis tiga atau
multilayer.
Dinding selnya mengandung lemak lebih banyak (11-22%), peptidoglikan
terdapat didalam
lapisan kaku, sebelah dalam dengan jumlah sedikit ± 10% dari berat
kering, tidak mengandung asam tekoat.
Kurang rentan terhadap senyawa penisilin.
Pertumbuhannya tidak begitu dihambat oleh zat warna dasar misalnya
kristal violet.
Komposisi nutrisi yang dibutuhkan relatif sederhana.
Tidak resisten terhadap gangguan fisik.
Resistensi terhadap alkali (1% KOH) lebih pekat
Peka terhadap streptomisin
Toksin yang dibentuk Endotoksin
Micrococcus, Staphylococcus, Leuconostoc, Pediococcus dan Aerococcus.
Klasifikasi bakteri :
a) Bakteri fototrofik
Bakteri fototrofik dibedakan dengan kelompok lainnya atas dasar
kemampuannya untuk menggunakan cahaya matahari untuk mendorong
pembentukan molekul-molekul ATP. Bakteri fototrofik tidak melibatkan oksigen
dalam proses sintesis nutriennya termasuk anoksifotobacteria. Bakteri fototrofik
yang aerob terdapat di habitat air sering tumbuh air sedimen, didanau- danau yang
dangkal yang memenuhi kondisi:
1. Masih cukup mendapatkan cahaya matahari
2. Anaerob untuk memungkinkan jasad ini hidup
3. Adanya sumber s atau senyawa organic yang berperan sebagai donor elektron
untuk menghasilkan koenzim.
4. Memiliki ciri-ciri yaitu:
a. Bentuk sel bulat, batang, vibrio, atau spiral.
b. Perkemmbangbiakan dengan pembelahan biner.
c. Bergerak dengan flagella atau nonotil.
d. Fotosintetik prosesnya terjadi dalam keadaan anaerobic dan tidak
melibatkan oksigen.
e. Bakteroklorofil yaitu suatu pigmen fotosintetik terdapat dalam semua sel.
f. Berpigmen: ungu-lembayung, ungu, hijau, merah, coklat-jingga, hijau
g. Habitat yaitu dilingkungan akuatik.
b. Myxococcae
- Mikrosista bulat atau jorong, punya dinding nyata.
- Contoh: Sporocytophaga myxoccoides: sel spiral, lentur, bergerak seperti ular.
Myxococcus virescens, dengan tubuh buah berwarna kuning kehijauan.
c) Bakteri selubung
Bakteri yang mempunyai selubung mencakup semua bacteria yang sel-
selnya terdapat didalam suatu struktur yang disebut sebagai sheath. Dengan
terbentuknya selubung, memungkinkan bakeri ini dapat melekat pada permukaan
benda padat. Bakteri ini hidup di dalam air, limbah, dan air buangan industry.
Selnya terbungkus dalam selubung yang terbuat dari deposit senyawa-senyawa
dan mangan yang tak larut. Bentuk sel adalah batang atau seperti filamen, motil
karena flagella atau nonmotil, beberapa membentuk pelengkap (dasar penghisap)
yang dipergunakan untuk menempelkan diri pada permukaangram negatif.
Contoh bakteri selubung:
Sphaerotilus natans merupakan contoh bakteri yng terselubung yang
sering dianggap sebagai jamur pada kotoran. Jasad ini biasanya dijumpai dalam
air mengalir yang tercemar seperti saluran pembuangan kotoran, dimana
jumlahnya dapat mencapai kadar yang tinggi.
d. Methylomonadaceae
2. Batang anaerobik fakultatif gram negatif
Memiliki batang pendek, banyak sekali kesamaan morfologi pad sel-sel
diantara taksa. Motil, sel-selnya peritrikus atau nonmotil. Cirri-ciri biokimia
banyak sekali terjadi perubahan pada substrat dan keterampilan ini memberikan
cara-cara dasar untuk pembedaan dn identifikasi spesies. Habitat adalah
lingkungan akuatik, tanah, makanan, air seni tinja.
Contoh: Escherichia coli dapat digunakan sebagai indikator terhadap
kontaminasi feses pada sumber-sumber air minum.
Enterobacteriaceae
- Menimbulkan fermentasi anaerobic pada glukosa, kadang laktosa.
- Sering terdapat pada saluran pernapasan dan saluran kencing vertebrata.
- Lainnya hidup bebas dan bersifat patogen.
- Contoh: Eschericia coli, Salmonella thyposa, S. parathypi, Shigella dysentriae.
3. Peptococaceae
j) Batang dan kokus pembentuk endospora
Ciri yang menonjol dari bakteri ini adalah kemampuannya untuk
membentuk endospora. Endospora tersebar luas dalam tanah dan terbawa oleh
partikel-partikel debu keudara. Endosporanya karena resistensinya yang tinggi
terhadap panas, dapat bertahan hidup lama.
Beberapa bias mengakibatkan infeksi pada manusia, hewan.
Contoh:
1. Bacillus merupakan bacteria yang aerob atau fakultatif anerob
2. Clostridium merupakan bakteri annaerob obligat,
k) Bakteri gram positif yang tidak dapat membentuk spora.
Memiliki laktobacilus yaitu berbentuk batang tidak membentuk spora yang erat
hubungannya dengan susu dan produk susu. Mereka mampu berfermentasi gula
susu menjadi asam laktat dan asam-asam lain. Banyak dijumpai dalam hewan
yang melakukan fermentasi dan produk tmbuhan serta dalam rongga mulut,
vagina dan saluran ppencernaa manusia dan hewan. Mereka tidak dianggap
patogenik.
Contoh: familia Lactobacillaceae, genus lactobacillus ( berperan penting dalam
pembuatan keju, yogurt dan makana fermentasi lainnya).
- Bakteri bentuk peluru atau batang, menimbulkan fermentasi asam laktat.
- Disebut bakteri laktat.
- Contoh: Lactobacillus caucasicus (yoghurt), Streptococcus
pygenes (menimbulkan nanah atau keracunan darah), Diplococcus
pneumonia (pneumonia).
l) Bangsa Actinomycetales
-Sel bentuk batang memanjang mirip hifa jamur, dan cenderung bercabang-
cabang.
-Anggotanya terdiri berbagai jenis jamur yang bersuku sebagai berikut:
a. Mycobacteriaceae
- Sel-sel tidak membentuk miselium atau hanya miselium yang rudimenter.
- Contoh: Mycobacterium tuberculosis (penyebab TBC), M. leprae (lepra/kusta).
b. Corynebacterium
c. Arthrobacter
d. Brevibacterium
e. Cellulomonas
f. Kurthia
m) Rickettsiae
Adalah parasit interseluler, tidak mempunyai kemampuan mengadakan
reaksi enzimatik untuk menghasilkan sejumlah ATP yang cukup untuk
reproduksinya. Banyak Rickettsiae menimbulkan penyakit pada hewan maupun
manusia. Banyak disebarkn oleh serangga-serangga seperti:
Rickettsiae rickettsii disebarkan oleh kutu dan dapat menimbulkan
penyakit”demam rocky mountain”.
n) chlamydia
Merupakan parasir uniseluler yang obigat yang dapat berkembang biak deengan
perubahan bentuk yang kecil yaitu bentuk dinding kaku dan tidak bersifat infeksi ,
memjadi betuk lebih besar dan tipis dan tidak bersifat parasit kemudian
membelah diri.
Contoh: Chlamidi psittaci
o) mycoplasma
golongan bakteri yang tidak mempunyai dinding sel dan merupakan jasad
yang paling kecil yang dapat mengadakan reprodksi sendiri. Apabila tumbuh pada
suatu media semu maka jasad ini akan membentk koloni –koloni yang sangat
kecil seperti telur goreng.
Anggota dari mycoplasma membutuhkansterol untuk pertumbuhannya.
Beberapa diantaranya menyebakan penyakit pada manusia yaitu pneumonia.