Anda di halaman 1dari 2

Opsi ini 5 memberikan informasi seperti frekuensi alel, frekuensi genotipe, perkiraan Fis untuk

setiap alel, estimasi global Fis menurut Weir dan Cockerham (1984) dan Robertson dan Hill
(1984), dan keanekaragaman gen.
Suboption 2 memungkinkan seseorang untuk menghitung heterozygosities multilokus per
individu, yang mungkin berguna misalnya dalam studi tentang depresi perkawinan. Mereka akan
muncul pada tabel terakhir dari file output jika Anda measukkan setiap individu sebagai 'sampel',
(dipisahkan oleh 'Pop') dalam file input. Suboption 3 juga akan menghitung rata-rata multilokus
dari kuadrat perbedaan antara ukuran dua alel dari individu.
Suboption 1 Alel dan frekuensi genotipe
Opsi ini memberikan informasi dasar tentang kumpulan data. Untuk setiap lokus di setiap
sampel, beberapa variabel yang dihitung:
 frekuensi alel
 proporsi genotype yang diamati dan diharapkan.
 Estimasi Fis untuk setiap alel
 estimasi global
 jumlah homozigot dan heterozigot yang diamati dan 'diharapkan'. 'Diharapkan' di sini
berarti angka yang diharapkan, tergantung pada jumlah alel yang diamati, di bawah
keseimbangan HW; perbedaan dari produk frekuensi alel yang diamati kadang-kadang
disebut koreksi Levene, setelah Levene (1949).
 matriks genotipe.

Suboption 2 Identitas berdasarkan keragaman gen dan Fis


Opsi ini menghitung keragaman dalam individu ( '1Qintra'), dan di antara individu dalam sampel
( '1Qinter') per lokus per sampel, dan rata-rata dari sampel yang lebih atau lokus yang lebih.
Sesuai perkiraan Fis juga dihitung. Estimasi Onelocus FIS juga dihitung dengan cara yang
konsisten . Tidak ada perkiraan yang diberikan ketika tidak ada informasi yang tersedia
(misalnya tidak ada perkiraan keragaman antar individu dalam sampel ketika hanya satu individu
telah genotipe) .
untuk data haploid, hanya keragaman gen antar individu yang dihitung. perkiraan multilokus
mengabaikan lokus haploid, atau sebaliknya mengabaikan lokus diploid jika pengaturan
EstimationPloidy = haploid yang digunakan.
Suboption 3Ukuran Alel berdasarkan keragaman gen dan Fis
Opsi ini menghitung langkah-langkah keragaman berdasarkan ukuran alel, yaitu berarti
perbedaan ukuran kuadrat alel dalam individu ( 'MSDintra'), dan di antara individu dalam sampel
( 'MSDinter'), per lokus per sampel, dan rata-rata lebih dari sampel atau lebih lokus
Untuk data haploid, hanya rata-rata kuadrat selisih MSDinter antara individu yang dihitung.
Perkiraan multilokus mengabaikan lokus haploid, atau sebaliknya mengabaikan lokus diploid
jika pengaturan EstimationPloidy = haploid digunakan. dan diploid lokus terlepas dari
pengaturan ini
Untuk semua suboptions, hasilnya dikembalikan melalui web browser yang kemudian dapat
menyimpan hasil dan dapat dikirim ke email.

Anda mungkin juga menyukai