Anda di halaman 1dari 10

18 TIP Rev. Esp.Cienc.Cuím.Biol. Vol.7, No.

MENGULAS ARTIKEL

DR © TIP Jurnal Khusus dalam Ilmu Kimia-Biologi, 7 (1): 18-25, 2004

SELULOSA BAKTERI PADA PTGLUCONACETOBACTER


XYLINUM: BIOSYNTHESIS DAN APLIKASI

Juan Luis Chávez-Pacheco, Suri Martínez-Yee,


Martha Contreras-Zentella dan Edgardo Escamilla-Marván *
Dept. Biokimia, Institut Fisiologi Seluler, UNAM. Kotak Pos 70-242,
CP 04510, Ciudad Universitaria, México, DF E-mail: eescami@ifc.unam.mx

RINGKASAN
Selulosa adalah molekul organik yang paling melimpah di alam dan sangat penting di tingkat industri; itu disintesis oleh
berbagai organisme, termasuk tumbuhan, alga, jamur, bakteri, dan hewan. Gluconacetobacter xylinum merupakan
bakteri dengan kapasitas penghasil selulosa tertinggi dan merupakan organisme model dalam penelitian proses yang
mengatur biosintesis polimer. Dokumen ini menawarkan tinjauan kemajuan dalam memahami proses sintesis selulosa,
karakteristik khusus selulosa bakteri sebagai sumber alternatif selulosa nabati, dan aplikasi bioteknologinya.
Kata kunci: Biosintesis selulosa, selulosa bakteri, Gluconacetobacter xylinum.

ABSTRAK
Selulosa adalah molekul organik paling melimpah di alam dan sangat penting untuk industri; itu disintesis oleh berbagai
organisme, termasuk tumbuhan, alga, jamur, bakteri dan hewan. Gluconacetobacter xylinum merupakan bakteri dengan
laju produksi selulosa tertinggi dan merupakan organisme model dalam penelitian biosintesis polimer. Makalah ini
menawarkan tinjauan kemajuan dalam pemahaman proses sintesis selulosa, karakteristik khusus dari selulosa bakteri
sebagai sumber alternatif selulosa nabati dan aplikasi bioteknologinya.
Kata kunci: Biosintesis selulosa, selulosa bakteri, Gluconacetobacter xylinum.

PENGANTAR 1) asal nabati, dari tanaman berkayu (lebih banyak


Selulosa adalah molekul alami yang paling digunakan dan penting di tingkat industri)

L melimpah, 1011 hingga 1012 ton diproduksi


setiap tahun dari sumber yang berasal dari
tumbuhan. Polimer ini adalah komponen
struktural utama dinding sel tumbuhan.
2) dari organisme dari kerajaan yang berbeda: Jamur
(Dictyostelium),

Catatan: Artikel diterima pada 22 Maret 2004 dan diterima


Organisme yang termasuk dalam kerajaan yang pada 14 Juni 2004.
berbeda mampu mensintesisnya. Selulosa adalah bahan Monera (Agrobacterium, Rhizobium,
baku serbaguna: itu adalah bahan konstruksi, pembuatan Gluconacetobacter),
serat tekstil dan pembuatan kertas, selain itu, turunannya Hewan (Tunicidae);
(ester, asetat, nitrat) terlibat dalam berbagai proses 3) melalui sintesis enzimatik in vitro1,2; dan
industri.
4) Sintesis kimiawi in vitro dari turunan glukosa
berbensil 3.
Saat ini selulosa dapat diperoleh dari berbagai sumber:

Sintesis in vitro dengan reaksi kimia


memungkinkan diperolehnya jumlah minimum
Juni 2004 Chávez-Pacheco, JL dkk. 19

polimer, peningkatannya dapat menjadikannya optimum tergantung pada menghasilkan regangan


sebagai alternatif untuk selulosa nabati. Selulosa 10.
bakteri (CB) karena kemurnian dan struktur
kristalnya menonjol sebagai sumber alternatif selain Komposisi media kultur bervariasi sesuai dengan
yang berasal dari tumbuhan. Dalam ulasan ini kami strain yang digunakan dalam sistem, karbohidrat
menyajikan kemajuan dalam biosintesis CB merupakan sumber karbon yang cukup untuk
(biokimia, molekuler dan struktural) dan sintesis CB, produksi CB dilaporkan dalam media
relevansinya dalam aplikasi bioteknologi. yang mengandung sukrosa, glukosa, fruktosa,
laktosa, manitol11, 12; bakteri dapat mensintesis
Gluconacetobacter xylinum: DIA ORGANISME MODEL glukosa de novo dari asam laktat atau asam
Produksi CB di kerajaan Monera beragam, sintesis suksinat. Ekstrak ragi merupakan sumber nitrogen
diamati pada spesies dalam genera Achromobacter, yang paling banyak digunakan untuk pertumbuhan
Agrobacterium, Rhizobium, Sarcina, Zoogloea dan G. xylinum; pepton, polipepton, tripton, cairan
: Selulosa bakteri: Gluconacetobacter xylinum jagung, dan
amonium
Gluconacetobacter, yang terakhir termasuk G.
sulfat juga
xylinum, spesies dengan kapasitas produksi
digunakan dalam produksi CB. Penambahan
tertinggi. Bakteri ini adalah pola dasar untuk studi
natrium atau kalium fosfat umum terjadi pada
biogenesis CB, karena produknya memiliki
perubahan pH buffer, dan penambahan magnesium
kemurnian tinggi dan memiliki struktur yang mirip
sulfat atau klorida telah dilaporkan11,12.
dengan asal tumbuhan4. Keuntungan nyata untuk
manipulasi dan studi proses biosintesis telah
membuat G. xylinum model yang unik. Masa inkubasi tergantung pada sistem kultur, periode
kultur terguncang selama 24 hingga 72 jam digunakan
Gluconacetobacterxylinum (dahulu Acetobacter untuk produksi. Kultur statis ditandai dengan periode
xylinum) 5, adalah bakteri Gram negatif yang termasuk pertumbuhan yang lama mulai dari satu hingga dua
dalam famili Acetobactereaceae; aerobik ketat yang minggu.
melakukan oksidasi tidak lengkap berbagai gula dan
alkohol (proses yang dikenal sebagai fermentasi SELULOSA BAKTERI
oksidatif). Habitat aslinya adalah buah dan sayur dalam Selulosa dari sumber manapun, termasuk CB, adalah
proses pembusukan; Ia mampu menghasilkan CB pada polimer dari residu glukosa yang secara kovalen
media cair dan padat dengan membentuk "film" atau dihubungkan antara karbon 1 dan 4 (β1-4) membentuk
"krim" di permukaan. rantai lurus. Rantai linier dari asosiasi polimer
(mengkristal) dengan ikatan hidrogen dan gaya Van der
Film CB bekerja sebagai mekanisme "pelampung", Waals. Asosiasi rantai (setidaknya 10) membentuk
memungkinkan G. xylinum berada di antarmuka struktur yang disebut selulosa "mikrofibril" (Gambar 1).
udara / cairan agar lebih mudah mendapatkan O2
yang diperlukan untuk pertumbuhannya. Film Dua karakteristik khusus untuk mikrofibril CB:
adalah penghalang fisik yang melindungi bakteri polaritasnya searah dan ketebalannya bervariasi.
dari radiasi UV, meningkatkan kemampuan untuk Mekanisme kristalisasi mikrofibril pada G. xylinum
menjajah substrat, dan sifatnya yang sangat dapat memunculkan dua aloform selulosa: jika
higroskopis memungkinkannya untuk mikrofibril diorientasikan secara paralel, selulosa I
mempertahankan kelembapan yang mencegah disintesis, sedangkan jika susunan mikrofibril antiparalel,
substrat mengering6. diperoleh selulosa II.

Kondisi tumbuh Aloform yang dominan di alam adalah selulosa I, namun


Budidaya G. xylinum untuk produksi selulosa dalam beberapa kondisi selulosa II disintesis; dia
dilakukan dalam kondisi statis seperti dalam
produksi makanan penutup Filipina nata de coco7 Perlakuan kimiawi terhadap selulosa I atau II (proses
atau dalam kultur terguncang untuk tujuan mercerisasi industri) menimbulkan aloform lain yang
bioteknologi8,9. Kisaran suhu optimal untuk disebut selulosa III dan IV13 yang dibedakan oleh
tanaman adalah 28-30 ° C, meskipun produksi struktur kristalnya. Mikrostruktur CB terdiri dari
berlangsung pada 20 hingga 35 ° C, pH media mikrofibril dengan diameter 4 hingga 7 nm dan derajat
kultur dapat bervariasi dari 4,0 hingga 6,0, pH polimerisasi 2.000 hingga 14.000 molekul glukosa14,15.
20 TIP Rev. Esp.Cienc.Cuím.Biol. Vol.7, No.1

Mikrofibril pada gilirannya mengkristal menjadi paket 170 ° C). Berbagai zat pengoksidasi dapat
dan pita, yang mencapai ketebalan 1 sampai 9 µm dan mempengaruhi sifatnya dengan memutus rantai
membentuk struktur ikatan silang ekstensif yang dan mengubah strukturnya.
distabilkan oleh ikatan hidrogen16. Kondensasi pita
menimbulkan struktur tiga dimensi atau struktur makro Mekanisme sintesis CB memberikan kemurnian
CB. lebih tinggi daripada yang ada di sumber nabati
manapun (Tabel I) 19, yang memberikan
Struktur makro CB sepenuhnya bergantung pada kondisi karakteristik yang hanya ada dalam selulosa asal
budaya; Di bawah kondisi kultur statis, "film" atau bakteri: tingkat kristalisasi tinggi, ketahanan tinggi
"krim" dihasilkan pada antarmuka udara / cairan dari terhadap tekanan, elastisitas dan daya tahan.
media kultur. Mikrofibril yang terus menerus dilepaskan Selulosa memiliki kapasitas yang tinggi untuk
oleh bakteri, mengkristal menjadi pita, yang tumpang menyerap air dan karena diameter mikrofibril yang
tindih membentuk bidang paralel17. Dalam kultur lebih kecil, CB memiliki luas permukaan yang
terguncang, tingkat penggumpalan yang lebih rendah lebih besar daripada yang terdapat pada selulosa
tercapai, jumlah bidang paralel lebih sedikit dan kayu. Selain sifat fisikokimia dari kepentingan
akibatnya butiran yang tidak teratur, rantai CB18 berserat industri ini, CB secara metabolik inert, tidak
atau bercabang terbentuk (Gambar 2). beracun, dan tidak menyebabkan reaksi alergi pada
a) Budaya statis kontak, sifat yang sangat penting untuk tujuan
biomedis dan kosmetik20.

Komposisi (%)
Sumber Selulosa Hemiselulosa Lignin
Extrbertindak
Bakteri 98 0 0 0
Kapas 95 dua satu 0.4
Henequen 78 4-8 13 4 Ixtle 73 4-8 17 2
Kayu 43-47 23-35 16-24 2-8
Bagasse 40 30 dua puluh 10
Tabel I. Kandungan selulosa dari sumber tumbuhan yang berbeda
dibandingkan dengan selulosa bakteri. Diadaptasi dari Klemm et al.,
200219

b) Budaya yang gelisah BIOGENESIS SELULOSA


Selama lebih dari tiga dekade, kelompok penelitian
yang berbeda telah bekerja untuk mengkarakterisasi
enzim yang bertanggung jawab untuk sintesis rantai
CB dan bagaimana rantai ini diekskresikan dan
dirakit untuk membentuk sebuah film. Kelompok
Hestrin21 adalah pelopor dalam pekerjaan dengan
G. xylinum, menetapkan kondisi budidaya yang
optimal dan jalur dasar dalam metabolisme karbon;
Selanjutnya, studi Colvin22 meletakkan dasar-dasar
pada aspek morfologi dan struktural dari film CB
dan kelompok Glaser23 menunjukkan bahwa
sintesis CB dikaitkan dengan membran plasma.

Gambar 2. Struktur Makro Panel CB a) Film CB dalam kultur statis, b) Butiran Pada tahun 1964, Preston mengusulkan "hipotesis
CB dalam kultur terguncang. butiran tersusun" di mana enzim sintetik
Karakteristik selulosa bakterial Secara umum, CB membentuk kompleks untuk menghasilkan rantai
stabil dalam larutan basa tetapi rentan terhadap glukan bersama-sama; rantai ini berasosiasi sendiri
hidrolisis alkali dalam kondisi drastis (1 M NaOH, dalam proses ekstrusi. Kelompok Brown24
mengidentifikasi kompleks ini dalam membran
Juni 2004 Chávez-Pacheco, JL dkk. 21

plasma menggunakan teknik cryofracture. UDPglucose dengan lipid membran plasma29,30


Kompleks terminal G. xylinum menunjukkan sedangkan varian lain31 menganggap bahwa
susunan linier dan merupakan tempat ekstrusi prekursor terlarut berinteraksi langsung dengan CS.
polimer25. Kemajuan terpenting dalam pemahaman Tidak ada data yang pasti untuk memvalidasi
biosintesis CB telah terjadi dalam dua puluh tahun proposal ini.
terakhir.
Reaksi global dalam sintesis CB melibatkan pengeluaran
: Selulosa bakteri: Gluconacetobacter xylinum dua ikatan energi
tinggi untuk setiap
Biokimia biosintesis residu glukosa yang
Untuk biosintesis CB, dua jalur amphibole penting ditambahkan ke polimer (proses intensif energi), yang
beroperasi pada bakteri ini: siklus fosfat Pentoses dan menghabiskan hingga 10% ATP yang dihasilkan oleh
siklus Krebs26. Yang pertama berpartisipasi dalam metabolisme. Kontribusi energi untuk sintesis berasal
oksidasi karbohidrat sedangkan yang kedua dari metabolisme aerobik, di mana rantai pernapasan
mengoksidasi asam organik. Glikolisis tidak dapat berperan penting dalam sintesis CB.
digunakan karena kurangnya enzim fosfofruktokinase 1,
yang bertanggung jawab untuk konversi fruktosa-6-fosfat Fluks karbon menuju CB atau siklus pentosa tampaknya
menjadi fruktosa-1,6-bifosfat. Bakteri ini mampu diatur oleh keadaan energi seluler, titik krusialnya adalah
menghasilkan glukosa de novo dari substrat seperti enzim glukosa-6-fosfat dehidrogenase; dalam G. xylinum
gliserol, sitrat, dan zat antara lain dari siklus Krebs terdapat dua isoenzim, salah satunya tidak aktif pada
melalui glukoneogenesis dan dapat mengubah heksosa konsentrasi ATP yang tinggi dan mendukung aliran
fosfat (fruktosa, manosa) menjadi glukosa6-fosfat, untuk karbon menuju sintesis polisakarida32.
sintesis polisakarida27.
Gen untuk biosintesis
Jalur biosintesis CB di G. xylinum dipahami Pemurnian dan identifikasi CS memfasilitasi identifikasi
dengan baik: produksi polisakarida dilakukan dari gen yang mengkodekannya. Kompleks CS terdiri dari
glukosa yang diangkut dari luar atau diperoleh dari empat subunit protein yang disebut A, B, C dan D, yang
sumber internal (Lihat Gambar 3), yang dikodekan dalam operon bcs33 (sintesis selulosa bakteri)
difosforilasi menjadi glukosa-6-fosfat dengan cara pada kromosom G. xylinum.
enzim glukokinase. Selanjutnya, glukosa-6-fosfat
diubah menjadi glukosa-1-fosfat oleh enzim Analisis fungsional menunjukkan bahwa subunit A (83
fosfoglukomutase; UDPGpyrophosphorylase dari kDa) mengandung situs katalitik enzim34. Analisis
glukosa-1-fosfat dan dengan adanya uridine komparatif dengan subunit katalitik dari CS yang berbeda
triphosphate (UTP) mengkatalisis produksi UDP- menunjukkan kesamaan yang lebih besar dari 70% 35
glukosa; Nukleotida gula ini adalah substrat untuk dalam urutan asam amino dari enzim ini. Fungsi subunit
enzim selulosa sintase (CS) 28 (Gambar 3). B (90 kDa) adalah untuk mengikat regulator alosterik
positif, asam diguanilikik siklik bis (2 ', 5') (c-di-GMP)
Ada kontroversi tentang cara penggunaan media dan dengan demikian meningkatkan laju sintesis polimer.
oleh CS; satu hipotesis menyiratkan hubungan
22 TIP Rev. Esp.Cienc.Cuím.Biol. Vol.7, No.1

Selain CS, dua gen di hulu operon bcs diperlukan


untuk biosintesis. Yang pertama mengkodekan
endoglikanase β1-4, yang fungsinya akan menjadi
penghentian rantai CB; yang kedua mengkodekan
protein kaya prolin dengan fungsi yang tidak
diketahui. Gangguan kedua gen menyebabkan
hilangnya kapasitas sintesis in vivo tetapi tidak
secara in vitro38.

Faktor protein lain yang terkait dengan sintesis


adalah protein pengikat c-di-GMP39, yang
dianggap mengatur konsentrasi pengatur alosterik
dalam bentuk bebas dan pada gilirannya
menyalurkannya ke CS. Ada kontroversi mengenai
keberadaan protein ini, ada kemungkinan
merupakan produk degradasi dari subunit B CS,
yang juga mengikat c-di-GMP, dilema ini belum
teratasi38.
Gambar 3. Sintesis selulosa dan jalur metabolisme di G. xylinum. CS, sintase
selulosa; FBP, fruktosa bifosfatase; FC, fruktokinase; F1FC, fruktosa-1-P Akhirnya, gen yang mengkode sintesis dan
kinase, FGI, fosfoglikomerase; FGM, fosfoglukomutase; FTS,
fosfofruktotransferase; GC, glukokinase; GP, glukosa menghilang; G6P-DH, degradasi dari pengatur alosterik c-di-GMP
glukosa-6-P dehidrogenase; UGP, uridine diphosphate memiliki peran yang relevan. Genom G. xylinum
glycopyrrophosphorylase.
mengandung tiga operon cdg yang mengandung
Subunit C dan D (masing-masing 138 dan 17 kDa), tampaknya gen pdeA dan gen dgc, yang masing-masing
memiliki fungsi struktural. Strain mutan pada gen subunit D mengkode fosfodiesterase A dan diguanylate
menghasilkan selulosa tipe II, menunjukkan bahwa subunit ini cyclase.
tidak berpartisipasi dalam sintesis CB tetapi terlibat dalam
proses kristalisasi. Operon kedua telah dilaporkan dalam Siklase diguanylate mengkatalisis sintesis c-di-
genom G. xylinum dengan gen untuk produksi CB36, yang GMP dari GTP dan fosfodiesterase A berpartisipasi
produk proteinnya berfungsi, dan ulasan rinci tentang biologi dalam degradasi. Sangat menarik bahwa keduanya
molekuler sintesis selulosa di G. xylinum dan bakteri lain telah terletak dalam operon yang sama40 mengingat
dipublikasikan.35 , 37. keduanya melakukan fungsi enzimatik yang
berlawanan. Selain pdeA dan dgc, operon cdg1
CS adalah protein membran integral, secara keseluruhan, rantai mengandung gen cdg1a yang mengkodekan
polipeptida melintasi membran delapan sampai sepuluh kali, aktivator transkripsi teregulasi O2 dan gen cdg1d
dengan daerah bola yang mengandung situs katalitik. yang mengkode protein dengan fungsi yang tidak
Penyelarasan CS dengan anggota keluarga β-glikosil diketahui. Gangguan pada gen dgc mengurangi
transferase menunjukkan empat residu aspartat yang sangat produksi in vivo, menunjukkan pentingnya
kekal dan motif QXXRW. Motif ini diamati pada semua aditif aktivator. Peran diguanylate cyclase dan
β-glikosil transferase, yaitu mentransfer lebih dari satu residu phosphodiesterase A dalam laju sintesis kofaktor
gula pada satu waktu; transferase β-glikosil non-aditif (yang dijelaskan di bawah ini.
mentransfer satu residu gula per reaksi) hanya memiliki tiga
residu aspartat yang dilestarikan. Pengaturan proses sintesis
Mekanisme yang mengatur laju sintesis G. xylinum
Sifat katalitik enzim telah dievaluasi dalam keadaan terlarut sangat khusus, karena nukleotida siklik baru adalah
dan tertanam di membran, dalam kedua bentuk ketergantungan pengatur alosterik41 dari enzim CS. Kehadiran c-
oleh Mg + 2 diamati. Kisaran pH optimum adalah 7,5 hingga di-GMP dalam sistem in vitro mampu mempercepat
8,5, suhu optimumnya adalah 30 ° C dan menunjukkan laju sintesis dengan faktor hingga 200 kali dan
perilaku kinetik tipe Michaelis-Menten sehubungan dengan inaktivasi in vivo sangat mengurangi polimerisasi
UDP-glukosa (Km = 125 µM). CS dihambat secara kompetitif glukan. Konsentrasi bersih c-di-GMP dikontrol
oleh uridine 5 fosfat (UTP atau UDP, KI = 14 µM, UMP KI = oleh sintesis dan degradasinya. Diguanylate cyclase
71 µM) 26. Keduanya terlarut dan terikat pada membran, mensintesis c-di-GMP dari dua molekul guanosine
enzim ini sensitif terhadap pengatur alosterik c-di-GMP, triphosphate (GTP); Proses degradasi
meningkatkan laju reaksi hingga 200 kali lipat26.
Juni 2004 Chávez-Pacheco, JL dkk. 23

: Selulosa bakteri: Gluconacetobacter xylinum keberadaan dua


membutuhkan dua enzim: fosfodiesterase A, yang pusat katalitik
mengkatalisis pecahnya cincin c-di-GMP, menghasilkan dalam enzim diasumsikan43.
molekul linier, dan fosfodiesterase B, yang mengkatalisis
pembelahan dinukleotida linier menjadi dua molekul 5 CB adalah polimer glukosa yang residu di
'guanosin monofosfat. sekitarnya diputar 180 ° terhadap satu sama lain;
perubahan orientasi pada monomer ini
Dalam proses ini, O2 menunjukkan peran pengaturan menyebabkan masalah torsi pada katalisis. Untuk
pada sintesis CB, karena baik siklase diguanilat dan memecahkan masalah torsi, Saxena43,44
fosfodiesterase A mengandung domain penginderaan O2. mengusulkan model "dua pusat katalitik" yang
Phosphodiesterase A mengandung pada N-terminusnya bekerja untuk transferase β-glikosil aditif lainnya
domain PAS dengan gugus heme dan pada C-terminus (seperti kitin dan sintase hyaluron).
domain phosphodiesterase. Domain PAS didistribusikan
Model dua pusat katalitik didasarkan pada analisis
secara luas dan berpartisipasi dalam transduksi sinyal. Di
kelompok hidrofobik, yang mengidentifikasi dua
antara sinyal yang dideteksi domain PAS adalah:
domain dalam CS: domain dengan tiga
oksigen, cahaya, potensi redoks, dll. Domain PAS dari
karakteristik residu aspartat dari aditif β-glikosil
fosfodiesterase A homolog dengan yang ada dalam
transferase dan domain kedua dengan residu
protein penginderaan oksigen seperti FixL. Kelompok
aspartat diikuti oleh domain katalitik QXXRW .
heme PDEA bisa dalam dua bentuk: oxyheme atau
Arsitektur domain ganda memungkinkan model di
deoxyheme tergantung pada ada atau tidak adanya O242
mana, dua pusat katalitik berfungsi untuk
terkait.
menambahkan dua molekul UDP-glukosa per
reaksi, masing-masing pusat berorientasi 180 °
Dengan adanya O2, bentuk oxyheme menurunkan terhadap satu sama lain memungkinkan sintesis
aktivitas fosfodiesterase dan akibatnya meningkatkan polimer tanpa masalah puntiran. Meskipun
konsentrasi bersih c-di-GMP sementara dengan tidak modelnya layak dan tampaknya menjadi perantara
adanya O2, bentuk deoksiam mengaktifkan enzim dan lipid untuk pengiriman ke CS. Meskipun model
akibatnya meningkatkan degradasi aktivator, memperlihatkan kedatangan substrat ke CS,
menurunkan dengan demikian, laju sintesis. Sistem ekstrusi polimer memerlukan penjelasan. a) Situs
pengaturan ini menghubungkan sintesis CB dengan katalitik terletak di sitoplasma,
keadaan energi, bergantung pada fosforilasi oksidatif,
mempertahankan kecepatan proses polimerisasi sesuai Model IV. Asosiasi glikosil-transferase.
dengan metabolisme sel, melalui mekanisme di mana
aktivitas diguanylate cyclase terkait dengan proses
dependen lainnya. GTP sebagai sintesis protein atau
asam nukleat. Di sisi lain, O2 sangat penting untuk
fosforilasi oksidatif, diperlukan untuk sintesis ATP yang
diperlukan dalam sintesis CB.

MEKANISME SINTESIS DAN EKSTRUSI CB


Katalisis dalam sintase selulosa
Mekanisme aksi SC penuh dengan spekulasi dan
kontradiksi, berbagai hipotesis telah dirumuskan atas
data yang dikumpulkan. Pada awalnya, diasumsikan
bahwa rantai CB disintesis dari ujung reduksi D-glukosa,
tetapi saat ini dianggap berlanjut melalui ujung non-
pereduksi31. Dinyatakan juga bahwa prekursor UDP-
glukosa ditransfer melalui partisipasi lipid dari membran
plasma30, meskipun dianggap lebih layak karena
ketersediaannya, transfer langsung dari sitoplasma.
Akhirnya, kontroversi terbaru dalam CS dan transferase
β-glikosil aditif lainnya terletak pada hipotesis bahwa
24 TIP Rev. Esp.Cienc.Cuím.Biol. Vol.7, No.1

Ini adalah model yang paling kompleks, ini melibatkan dua


transferase β-glikosil, satu di sisi sitoplasma (non-aditif) dan
yang lainnya ekstraseluler (aditif). Model menunjukkan bahwa
glukosa pertama-tama menambahkan senyawa lipid (lipidyl-
UDP-Glukosa) di sisi sitoplasma membran sel, zat antara lipid
bergerak ke sisi ekstraseluler membran sel, di mana transferase
aditif mengkatalisis polimerisasi, dengan cara ini, a) dua situs
katalitik diperlukan, satu terletak di sisi sitoplasma dan
ekstraseluler lainnya, b) polimerisasi berlangsung

memecahkan mekanisme katalitik, jalur ekstrusi polimer tetap


menjadi misteri.

Model sintesis dan ekstrusi


Untuk mengatasi cara CB disintesis dan kemudian
diekstrusi, harus dipertimbangkan bahwa CS adalah
enzim membran integral dan oleh karena itu
sintesisnya dikaitkan dengan membran plasma.
Polimer harus melintasi membran plasma dan muncul
di ruang ekstraseluler di mana, melalui ikatan
hidrogen, ia bergabung dengan rantai polimer lain
yang membentuk pengaturan kristal. Memperhatikan
tiga tahap
(Polimerisasi, ekstrusi dan kristalisasi), beberapa
model hipotetis dihasilkan untuk menjelaskan proses
kompleks dalam biogenesis CB31.

Model I. Situs katalitik CS berorientasi ke sitoplasma.


Berdasarkan prediksi segmen transmembran dan
ketersediaan substrat, diusulkan bahwa jika
polimerisasi terjadi di sitoplasma, maka: a) terjadi
katalisis di sitoplasma, b) terjadi polimerisasi di sana,
dan c) ekstrusi ia membutuhkan struktur "pori" yang
disediakan oleh CS atau oleh protein lain yang terkait
dengannya (Gambar 4a).

Model II. Situs katalitik CS berorientasi ke ruang ekstraseluler.


Model ini memungkinkan untuk menghindari proses
ekstrusi; Meski data yang ada tidak mendukung,
namun kendala utamanya adalah ketersediaan substrat.
Jadi, a) situs katalitik terletak di ruang ekstraseluler, b)
polimerisasi terjadi di ruang ekstraseluler, dan c) tidak
diperlukan
proses ekstrusi (Gambar 4b). Gambar 4. Model mekanisme sintesis dan ekstrusi CB di G. xylinum. a) Situs katalitik CS
berorientasi sitoplasma, Model III. Katalisis terkait dengan zat antara lipid. Katalisis terkait dengan zat antara lipid, d) Asosiasi
b) Situs katalitik CS berorientasi ke ruang ekstraseluler, c)
Model ini mengusulkan pengikatan UDP-glukosa ke a transferase glikosil.
Juni 2004 Chávez-Pacheco, JL dkk. 25

menempatkan di ruang ekstraseluler, dan c) ekstrusi tidak bergerak. Gengiflex® dikembangkan untuk
diperlukan (Gambar 4d). memulihkan jaringan periodontal.

Model-model ini dimaksudkan untuk menjelaskan sintesis dan Industri Aplikasi


ekstrusi polisakarida dan juga didalilkan untuk transferase β-
Kosmetik Stabilisasi emulsi, kondisioner,
glikosil lainnya.Kunci dalam memecahkan model yang paling
krim.
tepat untuk proses ini akan berasal dari data yang diperoleh
Generasi kuku palsu.
dari studi kristalografi CS. Setelah menganalisis kemajuan
yang diperoleh selama beberapa dekade di G. xylinum, banyak Tekstil Bahan serapan air tinggi.
di antaranya diekstrapolasi ke pabrik yang lebih tinggi, kami Kilang minyak Bahan untuk penyerapan racun dan
akan meninjau aplikasi CB potensial saat ini dan di masa minyak.
depan.
Kertas Pemulihan dokumen, kertas berkualitas
tinggi. Makanan Aditif makanan, pengemulsi, serat
P.ERSPEKTIF BIOTEKNOLOGI DARI ITU CB Karena
makanan.
kemurniannya yang tinggi dan sifat fisikokimia yang
Maquiladora Komponen suku cadang dan suku
tidak biasa, CB menawarkan berbagai macam cadang.
aplikasi potensial (Tabel II)dua puluh. Dalam 10 tahun Wisata Pakaian olahraga dan perlengkapan
terakhir, setidaknya lima puluh paten terkait sistem produksi berkemah.
dan aplikasi CB telah dibuat.
Penyelidikan Imobilisasi protein dan sel, resin
Membran CB memiliki kapasitas sonik yang tinggi (sifat yang untuk kromatografi.
sebanding dengan film aluminium atau titanium), properti ini Teknologi Diafragma sensitivitas tinggi di
digunakan oleh Sony Corp. dan Ajinomoto (Jepang) untuk mikrofon dan headphone.
membuat diafragma dengan ketepatan akustik yang tinggi Obat Pembuatan "kulit buatan" dalam
(PATEN AS 4,724,164). Pada tahun delapan puluhan, Johnson
terapi luka bakar.
& Johnson mulai menggunakan CB sebagai pembalut jenuh Komponen dalam implan gigi.
cairan untuk tujuan perawatan kulit (PATEN AS 4.655.758),
Tabel II. Aplikasi industri selulosa yang berasal dari bakteri. Diadaptasi
memanfaatkan kapasitas penyerap bahan yang tinggi. dari Krystynowicz dan Bielecki, 2002dua puluh.

Dengan cara yang sama penggunaan CB berserat untuk


pembuatan kertas dengan keawetan dan fleksibilitas yang lebih Sebuah grup Jerman telah menghasilkan
besar sedang dipersiapkan oleh perusahaan Mitsubishi Paper BASYC® (untuk akronimnya Bacterial
Mills Co. dalam konsorsium dengan Ajinomoto Co (JP Synthetized Cellulose), yang merupakan
PATENT 63.295.793), karakteristik makalah ini ideal dalam biomaterial dengan desain tubular yang
digunakan sebagai uang kertas atau bahan baku dalam ditujukan untuk aplikasi dalam bedah mikro
elaborasi buku10. arteri dan vena46. Kedokteran hewan juga
telah memanfaatkan keunggulan CB dan
Cellumed® telah dikembangkan untuk terapi
Penggunaan CB terbaru telah di bidang kedokteran. Kekuatan
ulkus pada kuda47.
mekanik yang tinggi dari film CB dalam keadaan terhidrasi,
permeabilitasnya terhadap cairan dan gas dan sedikit iritasi
kulit yang disebabkan oleh kontaknya, mendalilkannya sebagai KESIMPULAN
pengganti kulit dalam terapi luka bakar. Biofill® dan Sifat pengemulsi, kohesif dan absorptif, selain
Gengiflex® adalah produk CB dengan kegunaan luas dalam tidak menyebabkan reaksi alergi pada aplikasi
bedah gigi dan implan. dermal atau dalam pemrosesan makanan,
menjanjikan selulosa bakteri masa depan yang
Biofill® digunakan dalam kasus luka bakar derajat dua dan menjanjikan dalam aplikasi di industri
tiga serta bisul45; khasiatnya telah dibuktikan di lebih dari 300 makanan dan kosmetik. Banyak dari
kasus, Biofill® memungkinkan penggunaan antibiotik penggunaannya yang terhambat oleh
mengurangi risiko infeksi; penyerapan yang tinggi ketersediaan dan biaya polimer; titik kritis
menghindari dehidrasi pada pasien, risiko utama pada luka untuk eksploitasi sumber daya ini terletak
bakar. Satu-satunya kelemahan dan kelemahan utamanya pada peningkatan tingkat produksi dan
adalah elastisitas terbatas di area tubuh yang sangat mudah pengurangan biaya. Pembangkitan sistem
26 TIP Rev. Esp.Cienc.Cuím.Biol. Vol.7, No.1

produksi yang efisien akan menjadi dasar untuk mulai Bioteknologi Polandia di. www.biotechnology-pl.com/
mengeksploitasi kualitas sumber daya alam terbarukan science / krystynowicz.html.
21. Hestrin, S. & Schramm, M. Sintesis selulosa oleh A.
ini. xylinum:
persiapan sel kering beku yang mampu
mempolimerisasi glukosa menjadi selulosa.
REFERENSI Biochem. J. 58, 345 (1954).
1. Kobayashi, S., Kashiwa, K. & Shoda, S. Metode novel untuk 22. Colvin, J. & Leppard, G. Biosintesis selulosa oleh
polisakaridesintesis menggunakan enzim: sintesis selulosa in vitro Acetobacter xylinum. Anjing. J. Microbiol. 23, 701-709
pertama melalui jalur nonbiosintetik yang memanfaatkan selulase (1977).
sebagai katalis. J. Am. Chem. Soc. 118, 1677-1678 (1991). 23. Glaser, L. Sintesis selulosa dalam ekstrak bebas sel
2. Lee, J., Brown, R., Kuga, S., Shoda, S. & Kobayashi, S. Perakitan Acetobacter xylinum. J. Biol. Chem.232, 627-636
selulosa sintetis I. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91, 7425-7429 (1994). (1958).
3. Nakatsubo, F., Kamitakahara, H. & Hori, M. Polimerisasi pembukaan 24. Brown, R., Willison, J. & Richardson, C. Biosintesis
cincin kationik 3,6 D O-benzil-α-D-Glukosa 1,2,4-ortopivalat dan selulosa di Acetobacter xylinum: 1. Visualisasi tempat
sintesis kimia selulosa pertama. J. Am. Chem. Soc. 118, 1677-1678 sintesis dan pengukuran langsung proses in vivo. Proc.
(1996) Natl. Acad. Sci. USA. 73, 4565-4569 (1976).
4. Yamanaka, S., Watanabe, K., Kitamura, N. & Iguchi, M. Struktur dan 25. Kimura S., Chen, H., Saxena, I & Brown, M. Lokalisasi
sifat mekanik lembaran disiapkan dari selulosa bakteri. J. Mater. protein pengikat c-di-GMP dengan kompleks terminal
Sci.24, 3141-3145 (1989). linier Acetobacter
: Selulosa bakteri: Gluconacetobacter xylinum xylinum. J.
5. Yamada, Y, Hoshino, K. & Ishikawa, T. Biosci. Biotechnol. Biochem. Bacteriol. 183, 5668-
61, 1244-1251 (1997). 5674 (2001).
6. Williams, S. & Cannon, R. Peran lingkungan alternatif untuk selulosa 26. Ross, P., Mayer, R. & Benziman, M. biosintesis selulosa
yang diproduksi oleh Acetobacter xylinum. Appl. Mengepung. dan fungsi pada bakteri. Mikrobiol. Wahyu 55, 35-58
Mikrobiol. 55, 2448-2452 (1989). (1991).
7. Budhiono, A., Rosidi, B. & Iguchi, M. Aspek kinetik pembentukan 27. Weinhouse, H. & Benziman, M. Regulasi
selulosa bakteri dalam sistem kultur nata de coco. Karbohidrat Polym. fosfatemetabolisme heksosa di Acetobacter xylinum.
40: 137-143 (1999). Biochem. J. 138, 537-542 (1974).
8. Mormino, R. & Bungay, H. Komposit selulosa bakteri dan pembuatan 28. Swissa, M. et al. Langkah-langkah perantara dalam
kertas dengan bioreaktor disk berputar. Appl. Mikrobiol. Biotechnol. sintesis selulosa di Acetobacter xylinum: studi dengan sel
65: 503-506 (2003). utuh dan preparat bebas sel dari tipe liar dan mutan tanpa
9. Cheng, H., Wang, P., Chen, J. & Wu. W. Budidaya selulosa. J. Bacteriol. 143, 1142-1150 (1980).
Acetobacterxylinum untuk produksi selulosa bakteri dalam reaktor 29. Matthysse, A., Thomas, D. & White, A. Mekanisme
angkutan udara yang dimodifikasi. Biotechnol. Appl. Biochem. 35: sintesis selulosa di Agrobacterium tumefaciens. J.
125-132 (2002). Bacteriol. 177, 1076-1081 (1995).
10. Iguchi, M., Yamanaka, S. & Budhiono, A. Selulosa bakteri - 30. Hans, N. & Robyt, J. Mekanisme biosintesis selulosa
mahakarya seni alam. J. Mater. Sci.35, 261-270 (2000). Acetobacter xylinum: arah pemanjangan rantai dan peran
11. Heo, M. & Son, H. Pengembangan medium yang telah ditentukan intermediet pirofosfat lipid dalam membran sel.
secara kimiawi dan dioptimalkan untuk produksi selulosa bakteri oleh Karbohidrat Res.313, 125-133 (1998).
Acetobactr sp. A9 dalam budaya gemetar. Biotechnol. Appl. Biochem. 31. Brown, R. & Saxena, I. Biosintesis selulosa: Sebuah
36: 41-45 (2002). model untuk memahami perakitan biopolimer. Fisiol
12. Ramana, K., Tomar, A. & Singh, L. Pengaruh berbagai sumber karbon Tanaman. Biochem. 38, 57-67 (2000).
dan nitrogen pada sintesis selulosa oleh Acetobacter xylinum. Dunia J. 32. Benziman, M. & Mazover, A. NAD dan NAD phosphate
Microbiol. Biotechnol. 16: 245-248 (2000). specificglucose-6-phosphate dehydrogenases of
13. Pérez, S. & Mackie, B. Struktur dan Morfologi selulosa. Acetobacter xylinum dan perannya dalam regulasi siklus
Dikonsultasikan di www.cermav.cnrs.fr/cours/smc_anglais/contenu/ pentosa. J. Biochem. Chem. 248, 1603-1608 (1973).
Chap_4 / 4.html, 8 Januari 2003. 33. Wong, H. dkk. Organisasi genetik dari operon sintase
14. Fengel, D. & Kayu, G. Kimia, Ultrastruktur, Reaksi. (Fengeland selulosa di Acetobacter xylinum. Proc. Natl. Acad. Sci.
Wegener Eds.) Walter de Gruyter, New York, AS 66-105 (1989). USA 87, 81308134 (1990).
15. Watanabe, K., Tabuchi, M., Morinaga, Y. & Yoshinaga F. Fitur 34. Saxena, I., Kudlika, K., Okuda, K. & Brown, M.
struktural dan sifat selulosa bakteri yang diproduksi dalam kultur Karakterisasi gen dalam operon sintesis selulosa (operon
agitasi. Selulosa 5, 187-200 (1998). acs) dari Acetobacter xylinum: Implikasi untuk
16. Yamanaka, S. & Ishihara, M. & Sugiyama, J. Modifikasi struktural kristalisasi selulosa J. Bacteriol. 176, 5735-5752 (1994).
selulosa bakteri. Selulosa 7, 213-225 (2000). 35. Romling, U. biologi molekuler produksi selulosa pada
17. Jonas, R. & Farah, L. Produksi dan aplikasi mikroba selulosa.Polym. bakteri. Res. Microbiol. 153, 205-212 (2002).
Degrad. Menusuk. 59, 101-106 (1998). 36. Saxena, I. & Brown, M. Identifikasi sintasegen selulosa
18. Vandanmme, E., De Baets, S., Vanbaelen, A., Joris, K. & De Wulf, P. kedua (acsII) di Acetobacter xylinum. J. Bacteriol. 177,
Peningkatan Produksi Selulosa Bakteri dan Potensi Aplikasinya. 5276-5283 (1995).
Polym. Degrad. Menusuk. 59, 93-99 (1998). 37. Méndez-Ortiz, M. & Membrillo-Hernández, J.
19. Klemm, D., Schmauder, H. & Heinz, T. Selulosa bakteri di Mekanisme molekuler sintesis selulosa pada bakteri. TIP
Biopolimer Vol. 5 Polisakarida dari prokariot (Alexander Steinbüchel Jurnal Khusus dalam Ilmu Kimia-Biologi 7 (1), 26-34
Ed.) Wiley (2002). Dalam pers (2004).
20. Krystynowicz, A. & Bielecki, S. Biosintesis selulosa bakteri dan
aplikasi potensinya di industri yang berbeda. Konsultasi Berita
Juni 2004 Chávez-Pacheco, JL dkk. 27

38. Delmer, P. Biosintesis selulosa: Waktu yang menyenangkan untuk


bidang studi yang sulit. Annu. Rev. Plant Physiol. Tanaman Mol.
Biol.50, 245-276 (1999).
39. Weinhouse, H., Shapir, S. & Benziman, protein pengikat M. c-di-
GMP, faktor baru yang mengatur sintesis selulosa di A. xylinum.
FEBS Lett. 416, 207-211 (1997).
40. Tal, R. dkk. Tiga operon cdg mengontrol pergantian seluler dari
diGMP siklik di Acetobacter xylinum: organisasi genetik dan
terjadinya domain yang dilestarikan dalam isoenzim. J. Bacteriol. 180,
44164425 (1998).
41. Ross, P., Mayer, R., Weinhouse, H., Amikan, D. & Benziman, M.
Sistem pengaturan asam diguanylic M. Thecyclic dari sintesis selulosa
di Acetobacter xylinum. J. Biol. Chem.265, 18933-18943 (1990).
42. Gilles-González, M. Transduksi sinyal oksigen. IUBMB Life 51,
165173 (2001).
43. Saxena, I., Brown, M., Fevre, M., Geremia, A. & Henrissat, B.
Arsitektur multidomain dari β glikosil transferase: implikasi untuk
mekanisme aksi. J. Bacteriol. 177, 1419-1424 (1995).
44. Brown, R., Saxena, I. & Kudlika, K. biosintesis selulosa di tanaman
yang lebih tinggi. Trends Plant. Sci. 1, 149-156 (1996).
45. Fontana, J., De Souza, A. & Torriani, L. Acetobacter selulosa pelikel
sebagai pengganti kulit sementara. Appl. Biochem. Biotechnol. 24/25,
253-264 (1990).
46. Klemm, D., Schumann, D. & Marsch, S. Pembuluh darah buatan
selulosa buatan bakteri untuk bedah mikro. Prog. Polym. Sci.26, 1561-
1603 (2001).
47. Schmauder, H., Frankenfeldt, K. & Lindner, B. Bakterienzellulose-
einteressantes biomaterial. Bioforum 2000 23, 484-486 (2000).

Anda mungkin juga menyukai