Maudy Kusdina

Off B/170351616513

1. Apa nama lengkap protein yang Saudara temukan?

Enzim Asparaginase

Nama Lengkap Enzim : Crystal Structure Of Linker Less Pyrococcus Furiosus L-

asparaginase[Hydrolase, EC: 3.5.1.1]

2. Termasuk protein sederhana atau protein apakah yang Saudara temukan? Tunjukkan!

konjugat

konjugat

Protein konjugasi, karena memiliki konjugat pada strukturnya

3. Protein yang Saudara temukan, termasuk kuartener atau tersier? Mengapa?

kuartener karena memiliki 2 polipeptida

4. Tentukan dan tunjukkan ujung C dan ujung N dari protein yang Saudara temukan!
5. Berapa panjang protein (jumlah asam amino) dari masing-masing sub-unitnya?

Polipeptida A: Loc 204 – loc 22 = panjangnya 182

 Polipeptida B: Loc 147 – loc 20 = panjangnya 127

6. Tentukan daerah-daerah atau domain yang mempunyai struktur coil/beta-sheet/alfa-

helix (dengan menyebutkan dan menunjukkan bagiannya)!

POLIPEPTIDA_A
Coil (loc 23-loc25)
Beta sheet (Loc 26-loc 27)

Coli (Loc 28-Loc 37)

 Coil (Log 43-Loc 48)

Alfa Helix (Loc 49-Loc 56)

Coil (Loc 57-Loc 62)
Beta Sheet (Loc 63-Loc 73)
 Coil (Loc 74-79)

Alfa Helix (Loc 80-Loc 92)

 Coil (Log 93-Log 96)

Beta Sheet (Loc 97-Loc 103)

Coil (Log 104-Log 107)
Alfa Helix (Loc 108-Loc119)

Coil (Loc 120-Loc 124)

Beta Sheet (Loc 125-Loc 130)
 Coil (Loc131-Loc 141)

Alfa Helix (Loc142-Loc 154)

Coil (Loc155-Loc161)
Beta Sheet (Loc162-Loc163)

Coil (Loc164-Loc165)
Beta Helix (Loc166-Loc 170)
 Coil (Loc171-Loc 172)

Beta Helix (Loc173-Loc177)

Coil (Loc178-Loc 183)
Beta Sheet (Loc184-Loc188)

Coil (Loc 189-Loc 192)

Beta Helix (Loc 193-Loc 204)
POLIPEPTIDA_B

Coil (Loc 21)

Beta Helix (Loc 22-Loc 28)

Coil (Loc 29-Loc 34)

Alfa Helix (Loc 35-Loc 43)

Coil (Loc 44 - Loc 45)

Beta Sheet (Loc 48- Loc 52)
 Coil (Loc53- Loc63)

Alfa Helix (Loc64- Loc72)

Coil (Loc 73-Loc 75)
Beta Sheet (Loc76-82)

Coil (Loc 83-Loc 93)

Alfa Helix (Loc 96-Loc 104)
Beta Sheet (Loc 105-Loc108)

Coil (Log 109-Loc 112)

Alfa Helix (Loc 113-Loc126)
 Coil (Loc 127-Loc 129)

Alfa Helix (Loc 130-Loc 138)

Coil (Log 139-Log 147)
7. Tunjukkan penampakan luar dari protein itu dengan gugus prostetiknya (jika ada)!

8. Adakah asam amino di protein tersebut yang tidak terdeteksi oleh sinar X? Apa
buktinya? Asam amino yang tidak terdeteksi tulisannya berwarna abu-abu transparan