ABSTRAK: K v 11.1 (hERG) penghambat dengan potensi yang sebanding tetapi di ff kinetika pengikatan yang salah mungkin menampilkan pro-
risiko aritmia. Dalam studi ini, kami mengeksplorasi struktur -
hubungan kinetik dalam empat seri K v 11.1 pemblokir di samping strukturnya - Sebuah ffi hubungan nity. Kami mempelajarinya meskipun dramatis
di ff erences di a ffi nities dan tingkat asosiasi, hampir tidak ada variasi dalam konstanta laju disosiasi molekul ini dengan waktu tinggal (RT) hanya beberapa menit. Oleh
karena itu, kami mensintesis 16 molekul baru, khususnya dalam golongan senyawa piridinium, untuk mengatasi fenomena aneh ini lebih jauh. Kami menemukan molekul dengan RT yang
sangat pendek (misalnya 0,34 menit untuk 37) dan RT yang lebih lama (misalnya, 105 menit untuk 38). Ini memungkinkan kami untuk
membangun a k di - k mati - K D peta kinetik untuk semua senyawa dan kemudian membagi peta menjadi empat kuadran sementara, memberikan kerangka kerja yang mungkin untuk
kategorisasi K yang lebih jauh dan lebih tepat. v 11.1 pemblokir. Selain itu, dua perwakilan
senyawa ( 21 dan 38) diuji dalam tes penjepit patch, dan RT mereka dihubungkan ke IC fungsional mereka 50 nilai-nilai. Kami
fi Temuan sangat menyarankan pentingnya studi ligan secara simultan a ffi nities dan parameter kinetik, yang dapat membantu
menjelaskan dan memprediksi K v 11.1-dimediasi kardiotoksisitas.
Kata Pengantar
Keamanan jantung telah menjadi perhatian utama yang dihadapi industri farmasi
dan badan pengatur selama beberapa dekade terakhir. Sejumlah besar obat,
termasuk obat jantung dan nonkardiak, telah dibatasi dalam aplikasinya atau
ditarik dari pasar karena Konsep struktur - Sebuah ffi nity relationship
(SARs) yang menggambarkan kesalingtergantungan antara struktur majemuk
dan ikatan a ffi nities telah dieksplorasi secara ekstensif selama beberapa
dekade terakhir. 11,12 Namun, studi serupa yang menggambarkan
ketergantungan antara struktur senyawa dan kinetika pengikatan, disebut
sebagai struktur - Hubungan kinetik (SKR) kurang diteliti sampai saat ini.
Baru-baru ini, narkoba - kinetika target, khususnya reseptor - waktu tinggal
ligan (RT), telah terbukti juga menentukan potensi terapeutik kandidat obat
in vivo dan untuk memprediksi obat e ffi cacy dan keamanan. 13,14 Akibatnya,
muncul kesadaran akan pentingnya mengukur kinetika obat – interaksi
target. SKR sekarang sedang dilaporkan dan dibahas untuk pengikatan ligan
ke reseptor berpasangan protein G (GPCR) dan enzim.
adanya (kontrol) atau adanya unlabeled 31, 37, dan 38 di IC mereka 50 konsentrasi
nilai. Eksperimen dilakukan di 25 ° C menggunakan 20 μ g dari HEK293 K v 11.1
protein membran. Data yang ditampilkan berasal dari setidaknya tiga eksperimen
independen yang dilakukan di duplikat.
Gambar 3. Korelasi antara p K saya dan p K D ( A) atau p k di ( B) nilai semua
senyawa yang diuji seperti yang diperoleh dari [ 3 H] dofetilide kompetitif
percobaan perpindahan dan pengujian asosiasi persaingan, masing-masing.
Gambar 4. Peta kinetik semua senyawa yang diuji di mana tingkat disosiasi (hal k
mati, k mati: min - 1) diplot di y sumbu, sedangkan tingkat asosiasi (hal k di, k di: nM - 1 ·
min - 1) diplot di x sumbu. Identik K D nilai dapat dihasilkan dari di ff kombinasi
yang salah dari k di dan k mati nilai ( K D = k mati/ k di, garis putus-putus diagonal).
Kuadran ( I, II, III,Iv)secara sewenang-wenang de fi diwarnai dengan garis horizontal
merah dan garis vertikal hijau menurut variasinya k di, k mati dan K D nilai dalam
kombinasi dengan tiga senyawa referensi astemizole (titik merah), dofetilide (kuning
titik), dan ranolazine (titik hijau). Persimpangan merah dan hijau garis-garis disusun
pada garis putus-putus diagonal yang mewakili a K D nilai 316 nM, sementara
intersepnya dengan y dan x sumbu adalah 1 (RT = 10 min) dan 3,5 ( k pada = 3.2 × 10 - 4
nM - 1 · min - 1), masing-masing. Perhatikan bahwa parameter kinetik senyawa 34
tidak bisa ditentukan karenabke K-nya yang agak rendah v 11.1 a ffi nity dan dengan
demikian dikecualikan dalam peta ini.
Gambar 5. ( A) Penghambatan yang bergantung pada konsentrasi 21 dan 38 untuk
K v 11.1 arus ekor dalam eksperimen elektrofisiologi. (B) Tergantung waktu
penghambatan K v 11.1 arus ekor oleh 21 dan 38 ( 1 μ M). Percobaan
c R R R n n K k di k KD R
o say ( nM - mati ( n T
m 1 2 3 1 2 a 1 · min ( mi M) (
p ( n - 1) n - m
d M) 1) nt
)
1 4- 4- H. 2 2 47 0,0054 0.27 5 3.
TI TI ± ± ± 3 7
D D 1 0,0015 0,06 ±
A A ± 0.
K K 8
2 2 6
2 4- 4- CH 2 2 24 0,041 0.82 2 1.
TI TI 3 ± ± ± 0 2
D D 2 0,004 0,09 ±
A A ± 0.
K K 1
2 2 4
3 4- 4- CH 2 2 4. 0.15 0.26 3.0 3.
TI TI 2 2 ± ± ± 8
D D CH ± 0,06 0,07 0.2 ±
A A 3 0, 1.
K K 5 0
2 2
4 4- 4- CH 2 2 65 0,0096 0.30 41 3.
TI TI 2 ± ± ± ± 3
D D CH 13 0,0019 0,08 11 ±
A A 2 F 0.
K K 9
2 2
5 4- 4- CH 2 2 20 0,0046 0.40 99 2.
TI TI 2 3 ± ± ± ± 5
D D CN 6 0,0012 0,05 26 ±
A A 0.
K K 3
2 2
6 4- 4- CH 2 2 58 0,0013 0.35 26 2.
TI TI 2 8 ± ± 0 9
D D CO ± 0,0001 0.10 ± ±
A A OH 31 52 0.
K K 8
2 2
7 4- 4- CO 2 2 25 0,0098 1.8 13 0
TI TI CH 1 ± ± 2 ± ,
D D 3 ± 0,0034 0.2 5 5
A A 32 6
K K ±
2 2 0
,
0
6
8 4- 4- CO 2 2 35 0,0025 0.61 24 1.
TI TI CF 3 5 ± ± 7 6
D D ± 0,0003 0,09 ± ±
A A 14 27 0.
K K 3
2 2
9 4- 4- CH 4 2 1. 0.64 0.26 0.7 3.
TI TI 3 6 ± ± 3 ± 8
D D ± 0.29 0,05 0.3 ±
A A 0. 9 0.
K K 3 7
2 2
1 4- 4- CH 4 1 66 0,0028 0.22 8 4.
0 TI TI 3 ± ± ± 5 5
D D 6 0,0008 0,05 ±
A A ± 1.
K K 0
2 2 7
1 3, 3, CH 2 2 55 (6.2 ± 0.19 58 5.
1 4- 4- 3 71 3.0) ± 07 3
di- di- ± x10 - 5 0,01 ± ±
Cl Cl 50 22 0.
7 8 2
1 H. 4- CH 2 2 94 (5.6 ± 0.30 59 3.
2 O 3 4 0,9) ± 1± 3
C ± x10 - 4 0,07 19 ±
H 58 7 0.
3 7
fl fleksibilitas, 24,39 perpanjangan rantai alkil antara pusat
nitrogen dan bagian fenoksi meningkatkan K v 11.1 a ffi tingkat nities dan
asosiasi ( 9 melawan 2) sambil memperpendek yang lain penaut alkil dengan
cincin fenil menurunkan a ffi tingkat nities dan asosiasi ( 10 melawan 2 dan
9). Namun, 9 ( RT = 3.8 ± 0,7 menit) dan 10 ( RT = 4,5 ± 1,0 menit)
menunjukkan hal serupa karakteristik disosiasi di K v 11.1 saluran dibandingkan
dengan senyawa lain pada Tabel 1, menunjukkan rantai yang bervariasi panjang
antara nitrogen pusat dan dua cincin aromatik perifer yang diberikan dapat
diabaikan e ff dll pada disosiasi proses ligan jenis ini dari K v 11.1 saluran. Di
Selain itu, penggantian NO 2 kelompok pada cincin fenoksi dan fenil dengan
3,4-di-Cl atau kelompok lain seperti OCH 3 secara dramatis menurunkan K v
11.1 a ffi nities dan tingkat asosiasi ligan ( 11 dan 12 melawan 2). Senyawa 11
memiliki
terendah a ffi nity ( K i = 5571 ± 507 nM), tingkat asosiasi paling lambat
( k pada = 6.2 ± 3.0) × 10 nM - 1 · min - 1), tetapi RT terpanjang 5,3 ±
0,2 menit di K v 11.1 saluran di antara semua turunan dofetilide ( 1 -
12). Ini menyiratkan bahwa penambahan penarikan elektron
kelompok pada cincin aromatik mengurangi a ffi nities dan kinetika
asosiasi K v 11.1 blocker dengan menghambat mereka π- susun dan
interaksi hidrofobik dengan Phe656 dan Tyr652
c R R X R n K k di k K D R
o 3 saya ( nM - 1 mati ( n T
m 1 2 ( n · min - ( min M) (
p M) 1) - 1) m
d n
t)
1 4- 3,4 C 2 5 0,021 0.39 36 2
3 Cl -di- H 4 ± ± ± .
Cl 0,009 0,06 22 6
± ±
0
3 .
4
1 4- H. C 3 6 0,017 0.49 34 2
4 C H 0 ± ± ± .
H 0,003 0.12 14 0
3 ± ±
0
2 ,
5
1 H. H. N 2 5418 (2.7 ± 0.46 181 2
5 ± 0,6) × ± 2 ± .
374 10 – 4 0,03 313 2
±
0
.
1
16 4-
Cl H. C
H C
H 2 48 0,048
± 0.35
± 18
±9 2.
3 ± 0,022 0,09 9±
1 0.
8
c R R2 SE n K k di ( nM k mati K D RT
o BU saya - 1 · min - ( min ( nM) (mnt
m 1 AH ( nM 1) - 1) )
p )
d
1 4-Cl-C 6 • CH 2 6 31 ± 0,048 ± 0.37 16 ± 2.7
7 H. 4 CH CH 2 • 5 0,019 ± 10 ±
2 0,04 0.3
1 C 6 H. 5 - HC: 6 119 0,0098 ± 0,50 86 ± 2.0
8 CH 2 CH - ±2 0,0042 ± 45 ±
0.12 0,5
1 4-CH 3- •C • C 6 328 (3.2 ± 0.13 1188 7.7
9 C 6 H. 5 • 2 ± 2.0) × 10 ± ± ±
613 - 4 0,03 122 1.6
2 4-CH 3- •C • C 2 119 (3.1 ± 0.15 637 6.7
0 C 6 H. 5 • 6 ± 0,7) × 10 ± ± ±
141 - 4 0,05 339 2.0
2 (C 6 H. •C • C 6 97 ± 0,0035 ± 0.27 100 3.7
1 5) 2 CH • 13 0,0008 ± ± 52 ±
0,06 0.8
22 4-Cl-C
H. 5 C
6
H •C• • C 6 1.8
± 0.17
0,07 ± 1.2 0.13
0.6 ±
± 7.7
±
C 2
0.2 0,04 2.6
H3
Tabel 3. Pengikatan A ffi nities dan Parameter Kinetik Clo fi Derivatif lium
Kesimpula