Anda di halaman 1dari 28

ChemDraw

Tutorial Penggunaan Aplikasi


ChemDraw
Muhammad Nazar
Jurusan Pendidikan Kimia FKIP Universitas Syiah Kuala

Menggambar struktur suatu senyawa organik merupakan


keahlian khusus yang harus dimiliki oleh mahasiswa kimia di berbagai
tingkat pendidikan. Menggambar struktur secara manual menggunakan
pulpen dan kertas memang mudah dan tidak menjadi masalah bagi
sebagian besar mahasiswa. Akan tetapi untuk menggambar struktur
secara detail dan benar menggunakan sebuah komputer juga penting
dan sangat diperlukan oleh mahasiswa baik untuk menyelesaikan tugas
perkuliahan, melakukan publikasi atau keperluan akademik lainnya.
Menggambar struktur senyawa dan mekanisme reaksi ini dapat
dilakukan menggunakan berbagai macam software seperti chemsketch,
chemdoodle, chemdraw secara offline, bahkan secara online pun dapat
dilakukan di http://www.molinspiration.com/cgi-bin/properties.
ChemDraw merupakan software yang sederhana, mudah digunakan dan
relatif lebih lengkap sehingga software ini lebih direkomendasikan
untuk digunakan untuk keperluan akademik.

Instalasi dan syarat sistem


Sistem yang dibutuhkan untuk instalasi ChemDraw pada
Windows® system:
Operating System. Windows 2000, XP Pro (32-bit only), Vista (32-bit
only), Windows 7, Windows 8 dan Windows 10.
Browsers. Microsoft Internet Explorer 7.x ke atas, Mozilla Firefox 1.5
atau lebih, google chrome.
Microsoft Office. Microsoft Office 2000, Office XP, Office 2003,
Office 2007, Office 2010, Office 2013

ICT dalam Pembelajaran Kimia 1


ChemDraw

Dalam buku panduan ini, software yang digunakan sebagai


acuan adalah ChemDraw Ultra v.8. Proses installasi dapat dilakukan di
komputer berbasis windows, untuk memulai installasi, klik dua kali
pada file chemoffice803-ultra.exe, hingga timbul jendela installasi sbb:

Kemudian klik next

Klik next

ICT dalam Pembelajaran Kimia 2


ChemDraw

Masukkan 7 digit Serial Number dan 18 digit Registration Code yang


disediakan. Klik next dan finish. Setelah selesai, software sudah dapat
digunakan.

Area Kerja
Active sheet atau Work Area dari chemdraw tampil setiap kali
anda membuka jendela baru chemdraw. Work area menampilkan
toolbar yang umum digunakan, menu utama dan tampilan status
dokumen. Tampilan work area dapat dilihat pada gambar 1 berikut:

ICT dalam Pembelajaran Kimia 3


ChemDraw

Gambar 1. Work Area

Tipe Struktur
ChemDraw menyediakan fitur yang memungkinkan anda
menggambar stuktur organik dengan beberapa model atau tipe.
Diantaranya dapat dilihat pada contoh senyawa butana-2-ol berikut:

ICT dalam Pembelajaran Kimia 4


ChemDraw

OH
H H H OH H2
CH3CH2CH(OH)CH3 C CH
H C C C C H H3C C CH3
H2
H H H H c
a b

OH
OH OH
H3 C Me
d CH3 Me
e f
OH
OH OH
H3 C Me
H CH3 Me
g h i

Gambar 2. Struktur 2 butanol dengan berbagai tipe


Secara teknis semua tipe struktur di atas sudah benar dan sesuai
dengan kaidah keilmuan kimia. Sehingga ke semua jenis proyeksi di
atas dapat digunakan dalam membuat sebuah dokumen, tergantung
kepada fokus pembahasan. Jika berbicara tentang prioritas misalkan,
struktur g akan lebih cocok. Tetapi struktur yang sangat umum
digunakan adalah e/h dan f/i lebih direkomendasikan untuk digunakan
dalam menggambar struktur. Sedangkan penggunaan singkatan untuk
karbon end group seperti Me untuk metil pada f/i dibenarkan, singkatan
lain yang umum digunakan termasuk Et (etil), Pr (propil), i-Pr
(sopropil), Ph (fenil) dan Ac (Asetat), sedangkan singkatan yang jarang
dipakai, anda dapat mendefinisikan sendiri dan memberi catatan kaki.

Memulai kerja
Ketika program chemdraw dibuka, layar blank baru atau
dokumen terakhir akan terbuka dan daftar toolbar dengan posisi vertikal
juga akan terbuka secara otomatis. Toolbar ini lah yang akan digunakan
secara reguler dan intensif setiap kita menggunakan chemdraw. Jika ada
tool yang tidak tampil, anda dapat memilihnya di view> dan memilih

ICT dalam Pembelajaran Kimia 5


ChemDraw

tool yang ingin ditampilkan seperti diperlihatkan pada gambar 3


berikut:

Gambar 3. Menampilkan tool melalui view

Penggunaan berbagai fitur dan tool dalam chemdraw sangat


mudah karena semua tool telah disediakan dengan lengkap dan user
hanya perlu memilih dan melakukan drag di bagian kanvas kerja. Ada
beberapa hint yang dapat membantu anda menggambar sebuah struktur
yang kompleks. Sebagai contoh, menggambar struktur senyawa
strychnine berikut mungkin akan susah bagi pemula, namun dengan
sedikit latihan, dan trik, maka menggambar akan menjadi mudah dan
menyenangkan.
Baiklah, untuk memulai menggambar struktur, mari kita lihat
senyawa strychnine berikut ini.

ICT dalam Pembelajaran Kimia 6


ChemDraw

Gambar 4. Struktur senyawa strychnine

Struktur senyawa di atas dapat digambarkan dengan berbagai


bentuk. Cara mudah membuat struktur yang baik adalah memulai
dengan kerangka kerja yang jelas, menggunakan tool yang tepat dan
dominan dalam struktur dan abaikan masalah ikatan dan atom yang
terlibat, karena itu dapat diatur setelah strukturnya jadi, untuk latihan ini
kita akan menggunakan struktur (B) sebagai acuan.
Oke, kita mulai dengan warming up dulu supaya tidak terlalu
kaku.

Warming up
1) Pilih menu ikatan (solid bond)
2) Gambarlah ikatan tunggal dengan klik di kanvas, klik di beberapa
tempat dan perhatikan tampilannya.
3) Jika ikatan terlihat kurang panjang tekan alt sambil menggambar,
perintah ini akan membuat panjang ikatan berubah sesuai dengan
keinginan anda.
4) Tapi disarankan agar tetap menggunakan fix length supaya struktur
lebih rapi
5) Untuk mengubah arah ikatan klik tool marquee, tool pertama
sebelah kanan, klik di kanvas yang kosong, kemudian klik di ujung
ikatan dan arahkan ikatan sesuai keinginan

ICT dalam Pembelajaran Kimia 7


ChemDraw

6) Untuk menambahkan ikatan rangkap, seret kursor ke tengah ikatan


hingga muncul warna biru dan tanda panah jika sudah, klik di
bagian itu, perhatikan yang terjadi

Menggambar struktur
1) Klik tool benzen, di bagian bawah.
2) Klik di kanvas, kemudian pilih ikatan siklik 5 cincin dan sisipkan di
samping kanan benzen, akan terlihat seperti gambar berikut

3) Untuk mengubah cincin lima menjadi seperti pada struktur B, klik


marquee dan seret setiap sudut hingga bentuk nya seperti gambar di
bawah

4) Untuk menghindari ketidakseimbangan struktur, cincin lima juga


dapat digambar dengan solid bond, sehingga ikatan akan lebih rapi

5) Kemudian tambah benzen yang lain dan cincin 5 hingga struktur


setengah jadi, tapi ketika anda menambah senyawa sikloheptana
(cincin 7), struktur akan jadi seperti ini

ICT dalam Pembelajaran Kimia 8


ChemDraw

6) Tanda kotak merah menunjukkan error dan ikatan belum menyatu,


untuk memperbaikinya, pilih marquee dan seret kotak kiri bawah
hingga menyatu sehingga struktur menjadi

7) Selanjutnya tambah struktur lain hingga lengkap seperti gambar di


bawah

8) Untuk mendapatkan struktur yang sesuai, hapus ikatan yang tidak


diperlukan dengan memilih tool (sebelah kanan nomor 3 dari atas.
Setelah dihapus struktur menjadi gambar di bawah ini. Selain
dengan menggambar dengan benzen atau aromatik lain,

ICT dalam Pembelajaran Kimia 9


ChemDraw

menggunakan tool siklik juga dapat dilakukan sehingga anda tidak


perlu menghapus ikatan rangkap.

9) Untuk melengkapi ikatan, tambah ikatan rangkap sesuai struktur


dengan memilih solid bond sehingga struktur menjadi

Sampai dengan tahap ini, struktur strychnine sudah selesai,


namun belum sempurna karena belum ada end atom yang ditambah
sesuai permintaan, dan juga aspek ikatan seperti menjauhi atau
mendekati pengamat belum ditambahkan.

Tipe ikatan dan mengubah tipe ikatan


Berbagai tipe ikatan dapat digambar langsung dengan
menggunakan tool yang disediakan di main menu. Jika ikatan sudah
dibuat dengan ikatan biasa dapat juga diubah menggunakan tool yang
sesuai dengan melakukan klik di atas ikatan yang sudah ada. Gambar
dibawah ini menunjukkan perubahan dari ikatan di beberapa bagian
struktur sesuai dengan permintaan di atas.

ICT dalam Pembelajaran Kimia 10


ChemDraw

NB: Ikatan putus-putus yang menandai ikatan terjepit biasanya


digunakan untuk menunjukkan stereokimia, tapi penggunaannya kadang
sering menyalahi konsep, jadi penggunaannya sebaiknya dihindari
kalau tidak diperlukan.

Menyisipkan atom / unsur


Ada beberapa cara untuk menyisipkan atom atau gugus fungsi
ke dalam sebuah struktur.
Dengan menggunakan Teks
 Pilih tool teks (gambar A) pada toolbar
 Klik pada bagian ujung atau sudut struktur yang akan disisip
 Ketik unsur atau gugus fungsi yang akan disisip dan tekan
enter.

H
N
H
O O
H

Menggunakan hotkeys
Selain menggunakan fitur teks sebagaimana dijelaskan di atas,
menyisipkan atom ke dalam semuah struktur juga dapat dilakukan

ICT dalam Pembelajaran Kimia 11


ChemDraw

dengan hotkeys. Fitur hotkeys ini seperti auto correct atau shortkey yang
ditanamkan pada program chemdraw ini. Fitur ini digunakan dengan
cara:
1. Gambar struktur yang diinginkan
2. Pastikan tidak ada yang diblok salah satu, sebagian atau semua
bagian dari struktur
3. Pilih tool mana saja selain teks
4. Bawa kursor ke bagian dimana atom akan disisipkan
5. Ketik huruf yang sesuai (seperti pada tabel 1)
Contoh 1.1
Buatlah sebuah struktur senyawa berikut:
CH2OH

 Pilih tool benzena


 Tambah satu ikatan di atom C ke dua
 Bawa kursor ke ujung cabang hingga muncul warna biru
 Ketik angka 6

Penyisipan atom atau gugus tertentu dengan cara hotkeys


sebagaimana tertera dalam tabel 1, dapat dilakukan satu persatu seperti
pada contoh 1.1, atau dapat disisip secara bersamaan dalam sebuah
struktur.

Contoh 1.2
Buatlah struktur rantai lurus bercabang seperti gambar di bawah ini.

kemudian klik tool marquee dan tekan tombol “c”, struktur akan
berubah menjadi gambar berikut:

ICT dalam Pembelajaran Kimia 12


ChemDraw

CH3 CH3
CH CH CH3
H3 C C C
H2 H2
proses menyisipkan atom C sekaligus atom H menjadi lebih
cepat,mudah dan terhindar dari kesalahan.

Ada beberapa tombol khusus yang dapat digunakan untuk


menggambar berbagai atom atau gugus fungsi yang umum digunakan
dalam struktur senyawa kimia. Tabel 1 berikut memberikan beberapa
hotkey tersebut.

Tabel 1. Hotkeys
Label atom tombol Label atom tombol Label atom tombol
A a COOCH3 E O o
Ac A atau 5 D d Ots T
B B Et e P p
Br b F f Ph P atau 4
n-Bu 1 H h Q q
s-Bu 2 I i R r
t-Bu 3 K k S s
C c Me m Si S
Cl C atau l N n TMS t
CH2OH 6 Na N X x

Menggunakan Tabel Periodik


Cara lain yang dapat digunakan untuk menyisipkan sebuah
atom adalah dengan menampilkan tabel periodik melalui menu utama.
Pilih view>Periodic Tabel. Chemdraw akan menampilkan tool tabel
periodik yang dapat dipilih jika kita mau menggambar atau menysipkan
sebuah atom tertentu.

ICT dalam Pembelajaran Kimia 13


ChemDraw

Gambar 5. Periodic tabel view

Daftar tabel periodik ini memberikan kemudahan user untuk


dapat menyisipkan semua atom dalam tabel periodik, tetapi tabel
periodik ini tidak menyediakan tombol untuk gugus fungsi organik.
Contoh 1.2
Buatlah struktur senyawa berikut:
a

Pilih atom Na pada tabel periodik dan tempelkan pada ujung ikatan
berlabel “a” hingga diperoleh struktur sbb:
Na

Meskipun dapat juga dilakukan manual, tapi dengan melakukan


insert melalui tabel periodik, kita dapatmeminimalisir kesalahan
ketik.

ICT dalam Pembelajaran Kimia 14


ChemDraw

Selain menampilkan informasi dasar, menu tool tabel periodik


juga menyediakan informasi tambahan (sifat fisika setiap unsur)
ditampilkan dengan cara klik tanda >> sudut kiri bawah. Informasi yang
diberikan memang tidak begitu lengkap tapi beberapa hal seperti jumlah
isotop, titik didih, titik leleh, densiti dan sebagainya cukup membantu
pemakai jika membutuhkan data cepat untuk unsur-unsur dalam tabel
periodik ini. Jika memerlukan data tambahan tentu anda dapat
memperolehnya secara online di http://www.webelements.com
misalnya, atau sumber-sumber online lain yang banyak tersedia di
internet atau handbook.

Gambar 6. Beberapa sifat fisika unsur Cr

Latihan
Buatlah struktur-struktur senyawa berikut:

ICT dalam Pembelajaran Kimia 15


ChemDraw

O
Me
OH

NH2
N

O
CO2Et
Me Me
H CO2Et
Me
O
O
N
O Me
O
Me
Me
Copy n paste
Struktur yang sudah dibuat di atas kanvas, dapat dikopi dan di
tempel di program office lainnya seperti word, excel dll., untuk
mengkopi, pilih lasso atau marquee, pilih bagian struktur yang akan
dikopi, tekan ctrl+c dan paste di word.

Memberi nama sebuah struktur

ICT dalam Pembelajaran Kimia 16


ChemDraw

Struktur kimia yang sudah digambar, dapat diberikan nama


dengan menggunakan program ini. Pemberian nama tentu berdasarkan
database yang ada dalam program ini. Sebagian besar struktur dapat
dengan mudah diberikan nama. Nama struktur mengacu pada aturan
IUPAC = International Union of Pure and Applied Chemistry.

Contoh 1.3
Gambarlah struktur berikut:

H
OH
Klik marquee hingga struktur terpilih semua, klik structure di menu
utama bagian atas, pilih convert structure to name.

Hasil penamaan ditampilkan oleh gambar berikut:


O

H
OH
4-hydroxypentanal

ICT dalam Pembelajaran Kimia 17


ChemDraw

Mengubah Nama menjadi struktur


Selain dapat memberi nama struktur yang sudah digambarkan,
chemdraw juga dapat membuat struktur berdasarkan nama yang diinput
di atas kanvas.

Contoh 1.4
Pilih tool A pada toolbar, ketik nama Phenylalanin, kemudian pilih
Structure> convert nama to structure.

Phenylalanine O

H 2N OH

Catatan:
Nama harus ditulis secara benar dan dalam bahasa Inggris,
salah satu huruf saja, nama tidak dapat diubah menjadi struktur.
Misalkan phenol tertulis fenol.

Nama Phenol yang salah

ICT dalam Pembelajaran Kimia 18


ChemDraw

Contoh nama yang benar

Mengubah nama menjadi struktur dapat juga dilakukan


langsung memilih menu convert name to structure tanpa harus mengetik
namanya terlebih dahulu, jika menu ini dipilih jendela insert structure
akan muncul dan anda dapat mengetik nama senyawa kemudian tekan
ok.

Contoh 1.5
Pilih Stucture>convert name to structure hingga timbul jendela
seperti di bawah ini:

Klik ok

ICT dalam Pembelajaran Kimia 19


ChemDraw

cyclooctane
Memanipulasi Object
Memilih objek tertentu dalam sebuah struktur
1. Pilih lasso di main toolbar
2. Pilih objek, sebuah atom atau beberapa bagian
Bagian yang terpilih akan menunjukkan bagian yang berkedip dan
dapat diatur besar-kecil atau diputar seperti terlihat pada gambar
berikut

Memindahkan objek
1. Pilih lasso atau marquee, bawa kursor ke bagian tengah objek
hingga timbul gambar tangan

ICT dalam Pembelajaran Kimia 20


ChemDraw

2. Objek dapat dipindahkan kemana saja di atas kanvas kerja

Mengubah ukuran objek


Untuk mengubah ukuran objek, yang harus anda lakukan
adalah:
1. Pilih lasso atau marquee > lingkari atau pilih objek
2. Klik dan seret mouse sesuai ukuran yang diinginkan dan
lepaskan hingga timbul jendela pilihan

Jika ingin ukuran atom ikut disesuaikan dengan ikatan, pilih yes
maka struktur terlihat seperti ini:

N
N N
N N
N
Jika memilih no, maka struktur akan terlihat seperti di bawah
ini
N
N N

N N
N

ICT dalam Pembelajaran Kimia 21


ChemDraw

Menggabungkan objek
Objek yang digambar terpisah dapat digabungkan dengan
mendekatkan satu sama lain dan bagian yang akan digabung dapat
disatukan dengan memilih object > join.
Contoh 1.6
Gabungkan struktur A dan B menjadi struktur C seperti
berikut ini:
Me
Me OH
Me OH
Me

O
O N
N
Me
Me
A B C
1. Gambar struktur A dan B secara terpisah
Me

Me

Me
OH

N
2. Dekatkan A ke B secocok mungkin hingga timbul
kotak merah

ICT dalam Pembelajaran Kimia 22


ChemDraw

3. Block kedua struktur dan pilih object > join


Me
OH
Me

O N
Me
Tugas
Gambarlah struktur berikut ini:
O O

O O

ICT dalam Pembelajaran Kimia 23


ChemDraw

N
H
N N
H
N

Cl Cl
Ti

HO CHO
Me

H O O
H
H
Me Me H
Me O
H Me H H O O H
O O
H
O O
H H H H
O O O
H H H Me

Mekanisme reaksi
Pada umumnya tanda panah melengkung yang disediakan untuk
menggambar mekanisme reaksi terutama perpindahan elektron sudah
dapat digunakan untuk menggambar mekanisme reaksi kimia. Tapi
terkadang kita ingin menggambar sendiri tanda panah yang lebih
terlihat interaktif.

ICT dalam Pembelajaran Kimia 24


ChemDraw

Contoh 1.7
Buatlah mekanisme seperti di bawah ini, gunakan tanda panah yang
disediakan pada main tool.

O
H2N
Br

Lakukan hal yang sama tapi gunakan tool pen sehingga dapat
menghasilkan tanda panah yang lebih interaktif seperti di bawah ini:
O
H2N
Br

Prediksi Spektrum H-NMR dan C-NMR


ChemDraw menyediakan fitur prediksi spektrum NMR yang dapat
memudahkan ahli kimia untuk membuat prediksi, mencocokkan
spektrum hasil penelitian dan mengkonfirmasi struktur senyawa
organik. Prediksi dapat dilakukan untuk H-NMR atau C-NMR. Contoh
berikut memperlihatkan prediksi spektrum H-NMR dan C-NMR dari
senyawa phenol.

ICT dalam Pembelajaran Kimia 25


ChemDraw

ChemNMR H-1 Estimation

5.0
OH

6.73 6.73

7.09 7.09

6.82

7 6 5 4 3 2 1 0
PPM
Estimation Quality: blue = good, magenta = medium, red = rough

Gambar 1.7 Estimasi spektrum H-NMR

Gambar di atas menunjukkan estimasi serapan H-NMR untuk senyawa


fenol, selain menunjukkan spektrum, ditunjukkan pula posisi H yang
ekivalen dan nilai serapan pasti. Gambar 1.8 di bawah ini menunjukkan
estimasi C-NMR. Prediksi H-NMR dan Prediksi C-NMR memberikan
informasi tentang shift dan kuantitas atom H dan C yang ada dalam
sebuah struktur senyawa. Data ini dapat membantu ahli kimia untuk
memprediksi sebuah struktur dan membantu penelitian bidang kimia
organik.

ICT dalam Pembelajaran Kimia 26


ChemDraw

ChemNMR C-13 Estimation


Estimation Quality: blue = good, magenta = medium, red = rough

OH

115.9 115.9
158.5

130.2 130.2

121.4

160 140 120 100 80 60 40 20 0


PPM
Protocol of the C-13 NMR Prediction:

Node Shift Base + Inc. Comment (ppm rel. to TMS)

CH 115.9 128.5 1-benzene


-12.8 1 -O
0.2 general corrections
CH 130.2 128.5 1-benzene
1.4 1 -O
0.3 general corrections
CH 121.4 128.5 1-benzene
-7.4 1 -O
0.3 general corrections
CH 130.2 128.5 1-benzene
1.4 1 -O
0.3 general corrections
CH 115.9 128.5 1-benzene
-12.8 1 -O
0.2 general corrections
C 158.5 128.5 1-benzene
28.8 1 -O
1.2 general corrections
Gambar 1.8 C-NMR Shift

Selain fitur dan menu yang sudah dibahas di atas, chemdraw 8 telah
menambah banyak sekali fitur yang lain yang memudahkan kita
menggambar sepeti plat KLT, menggambar rancangan alat praktikum di
laboratorium dan berbagai struktur senyawa kompleks yang dapat
dikopi secara instant dari menu bar yang telah disesdiakan. Anda dapat
mengeksplor seluruh fitur yang dimiliki chemdraw jika anda semakin

ICT dalam Pembelajaran Kimia 27


ChemDraw

sering menggunakan program ini. Gambar distilasi sederhana berikut


dibuat dengan program chemdraw8.

air keluar
air masuk

Gambar 1.9 Rangkaian alat distilasi sederhana

Daftar Bacaan
Chem & Bio Draw, Chem and Bio Drawing Standard, 2009,
ChembridgeSoft Corporation.

Bienz, S, Short Manual to the Chemical Drawing Program Chemdraw ®,


University of Zurich

ICT dalam Pembelajaran Kimia 28

Anda mungkin juga menyukai