STRUKTUR GEN DAN PROSES EKSPRESI GEN

STRUKTUR KROMOSOM EUKARIOT

Kromosom ~ kromatid ~ kromatin
Kromosom tersusun dari kromatin dengan kata lain kromosom adalah kromatin yang berlipat-lipat beribu kali
sehingga panjangnya menyusut tapi diameter membesar, sehingga bisa diamati saat metafase.
 kromatin= kompleks DNA-protein
 Kromatin terdiri dari subunit kecil yang disebut nukleosom yang bersambu-sambum menjadi
polinukleosom, dan menggulung-gulung membentuk kromosom. Waktu kromosom akan membelah
menjadi kromatid (1 kromosom 2 kromatid) atau kromatid bersaudara. Di ujung kromosom memiliki
telomer untuk mencegah kromosom yang sayu menyambung dengan kromosom yang lain. Ujung
kromosom bisa berada di tengah, bisa di ujung akan tetapi kemungkinannya kecil.
 Protein: histon (5 macam: H1, H2A, H2B, H3, H4)
 Ujung kromosom: telomer untuk menyegel (seal) supaya tidak dapat menyambung dengan ujung
kromosom lainnya
 Tumbuhan diploid: 2 set kromosom
Kromosom Eukaryot
BENTUKDAN STRUKTUR BAKTERI
Kromosom bakteri satru eksemplar atau satu set. Sehingga disebut haploid. Ada juga diploid parsial/ struktur
kromosom bakteri yang ditekankan adalh kromosom tetap diikat oleh suatu protein. Setiap 40 ribu pasang basa
diikat oleh 1 protein seperti histon hingga membentu 6 ikatan dan membentuk superkoil.
DNA VIRUS
DNA virus tidak digulung. Ada dua materi genetik pada virus yaitu DNA dan RNA. Contohnya virus TMV
memiliki bahan genetik RNA yang diikan oleh protein. Selain itu virus fage lamda yang menginfeksi e-coli, dan
mirip dengan covid-19. Akan tetapi covid materi genetiknya RNA
BAHAN GENETIK
•Bahan yang diwariskan kepada generasi berikutnya
• berupa Asam nukleat:
polinukleotida
DNA:semua makhluk hidup ( organisme eukaryot, prokaryot & virus)
RNA: virus tertentu. Virus dikatakan bukan makhluk hidup karena tidak bisa melakukan metabolisme,
sehingga dianggap bukan MH meski punya asam nukleat (nukleotida)
•Nukleotida tersusun dari: 1 gula (Carbon 5) sehingga disebut pentosa + gugus fosfat + basa N
•Perbedaan DNA & RNA
Utas: ganda (DNA), tunggal (RNA)
Basa N: T (DNA), U (RNA)
Gula pentosa: deoksiribosa (DNA), ribosa (RNA), kedua ini relatif sanma perbedananya sangat kecil
Antar basa N agar mebentuk utas ganda terdapat ikatan hidrogen yang bersifat lemah atau mudah putus
misal dengan panas, larutan basa NAOH, dst

Polinukleotida

 Gula + fosfat sama, membentuk tulang punggung polinukleotida

 Basa N berbeda: urutan nukleoida= urutan basa N
 Karna urutan gula dan fosfat sama Untuk memudahkan dalam penulisan sehingga ditulis berdasarkan
nama basa nitrogennya.
Dalam sebuah ikatan nukleotida, unsuc c no 1 pada gula pentosa berikatan dengan basa N, c no 5 dengan
phosfat, C no 3 berikatan dengan hidroksi untuk berikatan dengan nukleotida lainnya, C no 2 pembeda
gulanya DNA (H) dan RNA (OH).
Basa Nitrogen
Purin (Pu): A dan G
Pirimidin (Py): T(U) dan C
Menurutsejarah evolusi bahwa purin berasal dari pirimidin, karena molekulnya sederhana atau 1 molekul siklik.
Sedangkan pirimidin bertemu dengan imidazol membentu 2 ikatanmolekul siklik yang disebut purin. Molekulnya
purin lebih berat dari pada pirimidin.
Perpasangan Nukleotida
Adenin(A) berpasangan dengan Timin(T) dengan duaikatan hidrogen
Guanin(G) berpasangan dengan Citosin(C) dengan tigaikatan hidrogen yang lebih kuat sehinggga akan melakukan
pemisahan utas DNA lebih banyak G dan C maka akan dibutuhkan energi panas yang lebih tinggi, yng disebut suhu
penempelan primer atau anheiling.
Pada kondisi tertentu RNA dapat membutuk stry=uktur sekunder atau terbentuknya utas ganda yang mana Adenin
berpasangan dengan Urasil karna tidak ada Timin atau sell complementarity.
Polinukleotida
Poli nukleotida satu dengan polinukleotida yang lain saling berikatan yang disebut ikatan fosfodiester, adalah ikatan
kovalen yang tidak mudah putus
5’P dari Nt2 diikatkan dengan 3’OH Nt1 (polinukleotida)
Penambahan Nt baru pada ujung 3’OH pertumbuhan 5’P ke3’OH

Model Struktur DNA

Dikemukakan oleh Watson & Crick, 1953
(utas ganda berpilin)
StrukturDNA:
•terdiri dari dua utas/sulur/rantai polinukleotida yang berpilin
•kedua utas bersifat anti paralel (5’P -3’OH // 3’OH -5’P) artinya sejajar tapi berlawanan.
•antar utas nukleotida berikatan padabasa-N secara komplementer (A dan T diikat oleh 2 atom H ) dan(G dan C
diikat oleh 3 atom H )

Perbanyakan DNA

Perbanyaan DNA Disebut replikasi Replikasi, umumnya Terjadi sebelum reproduksi (pembelahan) sel agar
sel anakan memiliki jumlah kromosom yang sama pada pembelahan mitosis. Sedangkan sel miosis
memiliki 1/2 kromosom selinduk. Ada 4 fase perbanyakan sel yaitu fase M atau mitosis, q1 atau gap 1, s
yaitu sintesis, q2 masuk lagi ke M, ketika sudah tua masuk ke Q0 atau sel mati.
 DNA diperbanyak Dari titik asal replikasi (ori), Ori harus sesuai dg DNA polimerase (DNA pol III dan
DNA pol I), Arah sintesis terjadi dari 5’P ke 3’OH. Ori menjadi penting agar DNA bisa dibaca oleh
polimerasi dan diperbanyak, maka juka tidak terdapat ori atau ori todak terbaca oleh DNA polimerase
makan DNA akan dipotong menjadi nukleotida.
 Pola rwplikasi DNA mengikuti pola semikonservatif: utas lama sebagai cetakan utas baru, utas ganda
tersusun dari utas lama dan baru
 Helikase: pengudaran atau memutus utas ganda menjadi utas tunggal, sehingga pada garpu replikasi
tegangannya tinggi atau pelintirannya sangat ketat dan tegangan tersbut dihilanglan oleh enzim Girase:
 menghilangkan tegangan. Dan untuk mencegah terbentuknya utas ganda kembali, maka ada protein
pengikat utas tunggal (PPUT/SSBP) akan mengikat pada ujung.

Utas kiri disebut utas leading, sedangkan utas kanan ada utas laging akarena telat, karena ada celah
sempit, serta proses sintesis DNA harus menunggu dibuka oleh ligase sepanjang tertentu baru bisa
trjadi disintesis, sehingga DNA yang terbentuk berupa potonga-potongan. Fargmen tersbut diesbut
okazaki dan kemudian disambung oleh enzim ligase. dalam proses perbanyakan DNA dibutuhkan
RNA primer sebagai pemulaan dalam sintesis DNA karena DNA polimerase tidak dapat memulai
atau mensintesis DNA, atau DNA polimerase hanya melanjutkan saaja atau memanjangkan.

LOKASI DNA
Terdapat du inti sel, mito kondria dan kloropplas, yang mana sama-sama terjadi replikasi, transkripsi dan
translaasi. Hanaya saja pada saat terertentu inti sel membrannya terurai atau terdegradasi, sehingga seluruh
kromosom memenuhi sitosol disebut intrafase.

GEN

•Gen adalah ruas DNA penyandi RNA(rRNA, tRNA & mRNA)

•Tidak semua RNA dijadikan sebagai cetakan untuk sintesis protein
•tidaksemuagen menyandiprotein hanya tRNA dan mRNA
•tidaksemua DNA adalah gen
•DNA yang dibatasi oleh promoter dan terminator yang bukan bagian dari gen karena tidak dijadikan cetakan RNA
Ekspresi Gen

•Transkripsi & translasi

•Eukaryot:
• Transkripsi terjadi di inti sel baik untuk mengasilkan tRNA atau mRNA dan rRNA. RNA yang disintesis
pertama kali disebut pre-mRNA yang kemufia menjadi mRNA matang yang kemudian di bawa ke sitosol.
Sedangkan tRNA membentuk sruktur tersier yang ketransfer ke sitosol. rRNA akan akan melipat berikatan
dengan protein dan membentuk ribosom. Pada saat proses translasai, mRNA, tRNA dan rRNA akan
bertemu.
• Translasi: sitosol
•proses ekspresi gen Terjadi pada saat DNA tidak berasosiasi dengan protein histon, karena DNA tidak dapat
dipudar.

TRANSKRIPSI
•Transkripsi adalah proses pembentukan atau oenyusunan RNA dengan DNA sebagai cetakannya
•Perangkat transkripsi:
Satu utas DNA sebagai cetakan, satunya sebagai utas pendamping
Enzim transkriptase= RNA polimerase.
Hasil RNA yang terbentuk saat transkripsi sama persis dengan utas pendamping, keculai T diganti U. RNA
polimerase tidak membutuhkan primer artinya transkripsi tidak membutuhkan primer, sedangkan proses replikasi
membutuhkan primer.

TRANSKRIPTASE(E. coli)
Subunit Ukuran#Fungsi
Subunit holoenzim transkriptase
B 155,000 1 Penempelan pada DNA
b’ 151,000 1 Situspolimerisasi RNA
a 36,000 2 ?
w 11,000 1 ?
sigma 70,000 1 Mengenali promoter (tidak semua DNA punya promotor hang bersifat spesifik)
Subunit pendukung (boleh ada atau tidak)
nusA 69,000 1Mengenali terminator
r 46,000 1 Mengakhiriproses transkripsi
TRANSKRIPTASE EUKARIOT
1.RNA Polimerase I: (dalam inti) terlibat sintesis RNA ribosom
2.RNA PolimeraseII: (dalam inti) terlibat sintesis pra-mRNA/hnRNA
3.RNA Polimerase III: (dalam inti) terlibat sintesis tRNA
4.RNA polimerase mitokondria
5.RNA polimerase kloroplas
PROSES TRANSKRIPSI
 1. Inisiasi terjadi pada promotor, jalan terus, sampai mulai sinteris RNA hingga ketemu dengan terminator,
sbeelum ketemu terminator ketemu sigmaA bertemu dengan enzim inti

2. Sintesis RNA
Proses Sintesis/PerpanjanganRNA
•Setelah inisiasi selesai (pengenalan faktor sigma denga GACA dan TATAA box),faktor sigma melepaskan diri dari
enzim inti transkriptase
•Enzim inti aka nbekerj alebih cepat tanpa faktor sigma (karena sigma bekerja sangatteliti)
•Faktor nusA bergabung dengan enzim inti untuk membantu mengenali terminator
•Enzim inti berhenti bila sampai pada terminator
Berikut gambaran fungsi enzim transkiptase

3. Proses akhir dari transkripsi

Proses Akhir Transkripsi (kasusE.coli)
•Gabungan Enzim-inti dan nusA akanmengenali terminator
•Berkat adanya struktur berulang terbalik pada terminator maka pada RNA akan terbentuk struktur jepit rambut
•Adanya struktur jepit rambut memberi tanda pada transkriptase untuk berhenti bekerja. Terjadinya struktur jepit
rambut dikarenakan adanya urutan berulang terbalik.
Terdapat dua macam terminator yaitu yang memiliki poli A yang tidak memerlukan faktor Rho dan terminator yang
tidak mengandung poli A memerlukan faktor Rho

RNA Hasi lTranskripsi

•mRNA: berfungsi sebagai cetakan pembentukan protein dalam translasi, berstruktur linear
•tRNA: berfungsi sebagai pembawa asam amino dan penterjemah kodon mRNA, membentuk lipatan tiga dimensi
•rRNA: berfungsi sebagai penyusun ribosom dan mengenali tRNA dan mRNA dalam proses translasi
Proses transkripsi Pra-rRNA
•PadaE. Coli rRNA dibentuk oleh tujuh operon {rrnA, rrnB, rrnC, rrnD, rrnE, rrnG, rrnH}
•pra-rRNA(30S) E.coli mengandung rRNA5S, rRNA23S, rRNA16S, dansejumlah tRNA sebagai penyelang
•melalui proses pascatranskripsi akan dipisahkan komponen rRNA satu dari yang lain, serta dari tRNA