Disusun Oleh :
NIM : 172210101065
Kelas :A
FAKULTAS FARMASI
UNIVERSITAS JEMBER
2019
TERAPI GEN
PENDAHULUAN
Terapi gen adalah penggunaan asam nukleat sebagai agen untuk mengobati
penyakit. Terapi gen biasanya menargetkan satu atau lebih gen yang termutasi tanpa
memengaruhi gen normal di sekitar lokasi penyakit. Target terapi gen dapat berupa
onkogen abnormal yang produknya dapat menyebabkan tumor atau mutasi gen yang
mana seharusnya produk tersebut sangat penting untuk mempertahankan fungsi
fisiologis normal. Dibandingkan dengan obat-obatan molekul kecil, terapi gen tidak
akan menyebabkan resistensi obat bahkan setelah perawatan berulang karena target
pengobatan gen bukanlah reseptor tertentu tetapi gen yang mengkode penyakit
tersebut.
Plasmid adalah molekul DNA sirkuler, untai ganda yang mengandung DNA
komplementer (cDNA) pengkodean urutan untuk gen terapeutik dan beberapa elemen
genetik lainnya termasuk elemen bakteri, transcription regulatory elements (TRE),
multiple cloning sites (MCS), daerah yang tidak diterjemahkan (UTR), intron, urutan
polyadenylation (polyA), dan tag fusion, yang semuanya memiliki dampak besar pada
fungsi produk genetik akhir.
Elemen Bakteri
Plasmid memiliki dua fitur yang penting untuk perbanyakan bakteri. Salah
satunya adalah Ori, yang merupakan urutan DNA spesifik itu mengikat faktor-faktor
yang mengatur replikasi plasmid dan mengendalikan jumlah salinan plasmid per
bakteri. Elemen yang diperlukan kedua adalah penanda, biasanya gen yang
memberikan resistensi terhadap antibiotika.
Enhancer adalah urutan DNA pendek yang bisa mengikat faktor transkripsi atau
aktivator untuk ditingkatkan tingkat transkripsi gen dalam kluster gen. Enhancer tidak
langsung bertindak pada wilayah promotor, tetapi akan didapatkan efeknya setelah
diikat oleh aktivator atau faktor transkripsi lainnya. Protein ini merekrut RNA polimerase
dan faktor transkrip umum dan menstabilkan inisiasi transkripsi kompleks.
Beberapa situs kloning (MCS), dikenal sebagai polylinker, adalah segmen DNA
pendek yang berisi banyak sisi pembatas restriksi endonuclease. Dalam setiap MCS,
biasanya ada hingga 20 situs pembatasan yang dapat diidentifikasi dan mudah dibelah
dengan restriksi endonuklease. MCS memungkinkan penyisipan cDNA tunggal atau
multiple cDNA bergantung pada persyaratan gen terapeutik.
Daerah yang tidak diterjemahkan (UTR) merujuk pada dua bagian di setiap sisi
pengkodean urutan pada untai mRNA. 5 ′ UTR adalah wilayah transkripsi mRNA yang
terletak di antara capsite dan kodon inisiasi. 5 ′ UTR berisi elemen pengatur yang
mengendalikan ekspresi gen. 3 ′ UTR adalah wilayah transkrip mRNA mengikuti kodon
terminasi. 3 ′ Memainkan UTR peran penting dalam stabilitas mRNA.
Intron
Sinyal polyA adalah situs pengenalan yang terdiri dari Hexamer AAUAAA
diposisikan 10-30 nukleotida hulu dari ujung 5 ′ dan elemen kaya GU atau U terletak
maksimal 30 nukleotida di hilir 3′end. Fungsi terpenting dari urutan poliA adalah untuk
mencegah mRNA degradasi enzimatik.
Tag Fusion
Tag fusi adalah protein atau peptida yang terletak di C- atau N- terminal protein
target untuk mengerahkan satu atau beberapa fungsi seperti meningkatkan ekspresi,
kelayakan, deteksi, pemurnian, atau pelokalan. Maltose binding protein (MBP) sering
digunakan untuk meningkatkan kelarutan protein rekombinan diekspresikan dalam
sistem E. coli. Tag protein fluoresen akan memberikan informasi tentang lokasi
intraseluler dari ekspresi transgen.
VEKTOR VIRAL
Untuk membangun vektor virus, gen yang bertanggung jawab untuk replikasi virus
dan patogenisitas dihilangkan dan diganti dengan kaset transgen. Kemudian genom
virus rekombinan dimasukkan ke dalam plasmid dan ditransduksi ke garis sel yang
berisi gen yang bertanggung jawab untuk replikasi virus untuk menghasilkan vektor
virus rekombinan. Konstruk vektor berisi urutan terminal (ITRs atau LTRs), sinyal
pengemasan (ψ), dan kaset transgen. Sinyal pengemasan (ψ) mengatur proses
penting dari pengemasan materi genetik ke dalam kapsid virus selama replikasi.
Retrovirus, lentivirus, adenovirus, dan virus terkait adeno (AAV) banyak dipelajari dan
digunakan sebagai vektor virus untuk terapi gen.
■ Retrovirus
Biologi
Retrovirus adalah virus RNA yang diselimuti dua salinan genom RNA untai tunggal.
Retrovirus berdiameter 80-100 nm dan memiliki virus genom sekitar 7-10 kb, terdiri dari
kelompok spesifik kode gen antigen (gag) untuk protein inti dan struktural virus; kode
gen polimerase (pol) untuk reverse transcriptase, protease, dan integrase; dan kode
gen amplop (env) untuk protein mantel retroviral. Pengulangan panjang terminal (LTR)
mengontrol ekspresi gen virus, karena bertindak sebagai penambah promotor.
Virus leukemia murine Moloney (MoMLV), salah satu yang paling teliti dicirikan
retrovirus, adalah vektor virus pertama yang digunakan klinik untuk mengobati
kekurangan ADA yang disebabkan oleh SCID, penyakit bawaan di mana penumpukan
deoxyadenosine yang disebabkan oleh defisiensi ADA melarang ekspansi limfosit,
untuk mengobati bentuk langka X-linked parah kombinasi immunodeficency (X-SCID).
■ Lentivirus
Biologi
Lentivirus adalah retrovirus unik yang dapat ditiru di kedua sel membelah dan
tidak membelah. Lentivirus miliki enam gen aksesori seperti tat, rev, vpr, vpu, nef, dan
vif, yang mengatur sintesis dan pemrosesan viral RNA dan fungsi replikasi lainnya.
■ Adenovirus
Biologi
Adenovirus adalah virus tanpa lipid bilayer luar , icosahedral, virus DNA litik
yang terdiri dari nukleokapsid dan genom beruntai ganda linier. Adenovirus mampu
menginfeksi sel yang membelah dan yang tidak membelah.
Saat ini, sekitar 23% dari semua uji klinis terapi gen melibatkan adenovirus
rekombinan, menjadikannya vektor yang paling banyak digunakan untuk transfer gen.
Cerepro, obat yang terdiri dari thymidine kinase (TK) yang mengkode adenovirus
rekombinan, telah diberikan status obat orphan oleh European Committee for Orphan
Medicinal Products dan Office of Orphan Products Development (FDA).
Biologi
Genom AAV adalah molekul DNA 4,1 kb linier, beruntai tunggal yang terdiri dari
dua frame pembacaan terbuka (ORF), rep, cap, dan dua pengulangan terminal terbalik
(ITR) yang menentukan awal dan akhir dari genom virus dan urutan pengemasan. Gen
rep mengkode protein yang bertanggung jawab untuk replikasi virus, sedangkan gen
topi mengkode protein kapsid struktural. ITR diperlukan untuk replikasi, pengemasan,
dan integrasi genom.
Lipid kationik
Sebagian besar lipid kationik terdiri dari tiga bagian: (i) kelompok jangkar lipid
hidrofobik; (ii) kelompok penghubung, seperti ester, amida, atau karbamat; dan (iii)
kelompok kepala bermuatan positif, yang berinteraksi dengan DNA plasmid bermuatan
negatif, yang mengarah pada pembentukan kondensasi dan agregatnya (rentang
nanometer / mikrometer). 2, 3-dioleyloxypropyl-1-trimethyl ammonium bromide
(DOTMA) dan 3-β [N (NV, NV- dimethylaminoethane) -carbamoyl] kolesterol (DC-Chol)
adalah dua lipid kationik yang umum digunakan dengan struktur yang berbeda. Lipid
kationik biasanya dicampur dengan ko-lipid netral seperti
dioleoylphosphatidylethanolamine (DOPE) pada rasio molar tertentu untuk mengurangi
toksisitas dan meningkatkan pengiriman gen. PEGilasi poliplex sering digunakan untuk
mengurangi pengikatan plasma dan meningkatkan waktu sirkulasi liposom kationik.
Lipoplexes diambil oleh sel melalui rute endosome. Untuk pelepasan dan
transportasi endosom ke dan melalui membran inti, elemen fungsional tambahan dapat
dilampirkan: untuk pelepasan endosom (peptida fusiogenik yang peka terhadap pH),
untuk transportasi dalam sitoplasma, dan bagian membran inti (inti peptida
translokasi).
Peptida
Sama seperti lipid kationik, peptida kationik memadatkan DNA dengan cara
yang serupa dan dapat digunakan sebagai pembawa pengiriman gen. Poly (L -lysine)
(PLL), suatu polidisperse, pengulangan sintetis dari asam amino lisin, adalah salah
satu peptida kationik pertama yang menghasilkan gen. Namun, peningkatan panjang
PLL menyebabkan peningkatan sitotoksisitas. Selain itu, PLL menunjukkan efisiensi
transfeksi terbatas dan membutuhkan penambahan agen endoosmolitik seperti peptida
fusogeni untuk memfasilitasi pelepasan plasmid ke dalam sitoplasma.
Polimer
Polimer kationik sintetik dan alami merupakan kategori lain dari pembawa gen.
Polyethyleneimine (PEI) telah menjadi polimer kationik yang paling banyak digunakan
untuk pengiriman gen dalam dua dekade terakhir. Namun, PEI, terutama PEI dengan
berat molekul tinggi (> 25 kD), sangat sitotoksik. PEI menginduksi gangguan membran
sel yang menyebabkan kematian sel nekrotik segera dan gangguan membran
mitokondria setelah internalisasi yang mengarah ke apoptosis. PEI berikatan dengan
komponen darah, matriks ekstraseluler, dan sel yang tidak ditargetkan setelah injeksi
intravena. Modifikasi kimia PEI diusulkan untuk mengatasi masalah ini, misalnya
cholesteryl chloroformate siap membentuk misel (10-100 nm) dalam larutan air ketika
terkonjugasi menjadi PEI bercabang. Lipopolymer baru ini menunjukkan penurunan
toksisitas dan efisiensi transfer gen yang optimal.
Secara kolektif, studi-studi klinis ini menyediakan "prinsip bukti" untuk terapi
gen nonviral tetapi juga menyoroti perlunya pengembangan formulasi dengan
peningkatan efisiensi transfeksi dan kemanjuran terapeutik. Juga harus disebutkan
bahwa sebagian besar uji coba ini tidak terkontrol, label terbuka, desain fase I terutama
menyelidiki keselamatan dan kelayakan. Kemungkinan efek plasebo yang kuat tidak
dapat diabaikan dalam uji coba ini. Hasil dari studi ini harus ditafsirkan dengan hati-hati
dan hanya dapat dinilai dengan melakukan uji coba fase II / III lebih lanjut.
TERAPI GEN BERBASIS SEL PUNCA
Terapi gen berbasis sel punca adalah proses multistep, dimulai dengan isolasi
sel punca dari pasien. Langkah ini diikuti oleh ekspansi sel punca dan transduksi ex
vivo dengan vektor transfer gen. Akhirnya, sel-sel punca yang ditransfusikan kembali
diinfuskan ke pasien untuk mengobati penyakit tertentu.
Sel punca paling awal dalam kehidupan manusia adalah embryonic stem cells
(ESC), yang berasal dari massa sel dalam blastokista dan mampu berdiferensiasi
menjadi semua turunan dari tiga lapisan benih utama: ektoderm, endoderm, dan
mesoderm. Selain ESC, yang hanya dapat diisolasi dari embrio awal, ada jenis sel
punca lain di jaringan dewasa semua mamalia tua yang disebut sel punca dewasa. Sel
punca dewasa memiliki kapasitas pembaruan diri yang tidak terbatas dan potensi
diferensiasi yang lebih terbatas. Sel punca dewasa yang paling terkenal adalah sel
punca hematopoietic stem cells (HSC), yang memunculkan semua tipe sel darah dan
garis keturunan limfoid. Sumsum tulang juga mengandung populasi sel punca dewasa
yang bernama mesenchymal stem cells (MSC).
Injeksi langsung dari ESC yang sangat berpotensi majemuk ke dalam organ
ektopik sering menimbulkan teratoma, tumor jinak yang mengandung turunan dari
ketiga lapisan benih. MSC kurang potensial untuk menginduksi teratoma atau
transformasi ganas lainnya karena mereka hanya memiliki potensi diferensiasi
terbatas. Dibandingkan dengan sel punca dewasa lainnya seperti HSC, sel punca
mammae, atau sel punca saraf, MSC memiliki efek trofik dan sifat imunomodulator
yang dikarakterisasi dengan baik, menjadikannya kandidat yang baik dalam mengobati
penyakit degeneratif. Sebagai mediator trofik, MSC menghasilkan faktor bioaktif yang
menghambat apoptosis, mempromosikan angiogenesis, dan merangsang mitosis dan
diferensiasi menjadi sel reparatif spesifik jaringan.
Ada dua arah utama terapi gen berbasis sel punca: (1) sel punca digunakan
sebagai sarana pengiriman gen untuk mengekspresikan gen terapeutik di lokasi target
dan (2) sel punca diprogram ulang atau ditransdifferensiasikan dengan modifikasi
genetik untuk mengisi kembali sel atau jaringan cacat (obat regeneratif).
Karena kasus terapi gen pertama yang berhasil di mana gen ADA dimasukkan
ke dalam limfosit T autologus untuk mengobati ADA yang mengalami defisiensi SCID,
beberapa kelompok memiliki tujuan ambisius untuk memperbaiki kekurangan ADA
secara permanen dengan memasukkan gen ADA ke dalam sel-sel progenitor
hematopoietik dari sumsum tulang dan darah tali pusat.
Terapi gen tradisional berfokus pada pengenalan materi genetik dalam sel
dewasa untuk mengobati penyakit genetik bawaan, sedangkan terapi gen berbasis sel
punca dapat mewakili pengobatan permanen untuk penyakit genetik ini.
Vektor virus adalah alat yang paling populer untuk mengarahkan diferensiasi
sel punca dalam pengobatan regeneratif. Namun, karena risiko mutagenesis insersi
dan generasi replikasi virus yang kompeten, vektor nonviral juga dipelajari dalam terapi
gen berbasis sel.
Perlu dicatat bahwa sebagian besar terapi gen berbasis sel punca, terutama
yang menggunakan retrovirus atau lentivirus sebagai vektor pengiriman gen, tidak
menyediakan mekanisme untuk mematikan ekspresi gen terapeutik ketika ekspresi
lebih lanjut tidak diperlukan atau untuk membersihkan sel-sel punca proliferatif ketika
jaringan yang rusak sepenuhnya sembuh. Untuk membersihkan kelebihan sel punca
ketika jaringan yang rusak sembuh sepenuhnya, sel punca embrionik manusia yang
direkayasa secara genetika untuk mengekspresikan gen “bunuh diri” dapat dihilangkan
secara in vivo dengan pemberian obat gansiklovir yang disetujui FDA.
Mayoritas uji klinis terapi gen saat ini dikhususkan untuk mengobati kanker.
Ada dua manfaat potensial menggunakan terapi gen untuk mengobati kanker: (a)
perawatan berbasis gen dapat menyerang kanker yang ada pada tingkat molekuler,
menghilangkan kebutuhan akan obat-obatan, radiasi, atau operasi dan (b)
mengidentifikasi gen kerentanan kanker pada individu atau keluarga mungkin memiliki
dampak signifikan dalam mencegah penyakit sebelum terjadi. Strategi untuk mencapai
tujuan-tujuan ini termasuk (a) koreksi mutasi genetik yang berkontribusi pada fenotip
ganas dengan mengganti gen yang hilang atau mengubah gen cacat dengan gen
sehat, (b) peningkatan respon imun pasien terhadap kanker (imunoterapi), (c)
penyisipan gen ke dalam sel kanker untuk membuatnya lebih sensitif terhadap
kemoterapi dan radioterapi konvensional atau perawatan lain, (d) pengenalan "Suicide
genes" ke dalam sel kanker pasien yang secara enzimatik dapat mengaktifkan prodrug
dalam sel-sel ini untuk menghancurkannya, dan ( e) langsung membunuh tumor
melalui virus oncolytic.
Dalam pendekatan ini, terapi gen digunakan untuk memperbaiki mutasi genetik
yang berkontribusi pada fenotip ganas dengan mengganti gen yang hilang atau
menghilangkan gen cacat. Memahami kanker pada tingkat molekuler adalah dasar
untuk koreksi gen dalam terapi kanker. Inaktivasi atau aktivasi gen tertentu dapat
berkontribusi pada pertumbuhan tumor. Meskipun proses kompleks perkembangan
dan pertumbuhan tumor membatasi kegunaan strategi ini, sekitar 12% uji klinis terapi
gen kanker melibatkan ekspresi berlebih dari gen penekan tumor seperti p53, MDA-7,
dan ARF. Mutasi pada gen p53 paling sering terlihat pada spektrum tumor yang luas.
Pengiriman dan ekspresi gen penekan tumor p53 tipe liar mencegah pertumbuhan sel
kanker manusia dalam kultur, menyebabkan regresi tumor manusia pada tikus, atau
sensitisasi tumor yang ada pada efek terapi kemoterapi konvensional dan radioterapi.
■ Imunoterapi
■ Sensitisasi Tumor
Pada langkah pertama prosedur ini, gen untuk enzim eksogen dikirim dan
diekspresikan dalam sel tumor. Selanjutnya, prodrug diberikan dan dikonversi menjadi
obat aktif (metabolit toksik) oleh enzim asing yang diekspresikan di dalam atau di
permukaan sel tumor. Suicide genes biasanya berasal dari virus atau prokariotik tanpa
homolog manusia. Namun, ini bukan persyaratan mutlak asalkan prodrug tidak
diaktifkan pada tingkat signifikan oleh enzim seluler asli. Ada beberapa varian terapi
diarahkan-enzim prodrug gen. Virus herpes simpleks virus-timidin kinase (HSV-tk) /
gansiklovir, sistem sitosin deaminase / 5-fluorositosin, sistem nitroreduktase / CB1954,
dan sistem G2 / CMDA karboksipeptidase adalah sistem yang paling populer. Cerepro,
obat gen yang dikembangkan oleh Ark Therapeutics Group PLC, telah diberikan status
obat yatim piatu oleh European Medicines Agency dan FDA. Cerepro adalah
adenovirus yang mengandung herpes simpleks tipe-1 timidin kinase transgen untuk
mengobati glioma ganas bersama dengan gansiklovir.
PENYAKIT MONOGENETIK
Tujuan utama terapi gen untuk gangguan monogenetik adalah mengganti gen
yang cacat dengan salinan yang baik untuk mengembalikan fungsi normal dan
membalikkan proses penyakit secara permanen. Hingga saat ini, kombinasi sindrom
imunodefisiensi adalah satu-satunya kelompok penyakit di mana terapi gen telah
bermakna secara klinis manfaat terapinya.
PENYAKIT KARDIOVASKULAR
Transfer gen untuk AIDS adalah aplikasi utama dikategori ini. Banyak uji coba
terapi gen untuk AIDS melibatkan pemindahan materi genetik secara ex vivo ke sel T
otonom menggunakan inaktivasi sendiri atau replikasi vektor virus untuk meningkatkan
sistem kekebalan tubuh pasien. Uji coba lain menggunakan ekspresi yang berlebih dari
inhibitor HIV seperti RevM10 untuk meningkatkan kelangsungan hidup sel T CD4 +
pada orang yang terinfeksi HIV.
Pencapaian paling penting dalam studi terapi gen untuk mengobati penyakit
infeksi adalah pengembangan vaksinasi DNA, suatu teknik untuk melindungi host dari
penyakit dengan memproduksi respon imunologis melalui suntikan virus hasil rekayasa
genetika DNA. Studi klinis penggunaan vaksin DNA untuk penyakit infeksi lainnya yang
disebabkan oleh virus hepatitis B (HBV), virus influenza, dan virus Ebola juga
dilaporkan. Saat ini, PENNVAXTM, sebuah produk DNA vaksin untuk HIV yang
dikembangkan oleh Inovio Pharmaceuticals, sedang dalam studi klinis fase I.
PENYAKIT NEUROLOGIS
Dua penyakit saraf yang paling umum ditargetkan oleh terapi gen adalah
penyakit Alzheimer dan penyakit Parkinson. Pada tahun 2005, fase I percobaan ex
vivo pengiriman gen faktor pertumbuhan syaraf (NGF) pada delapan individu dengan
penyakit Alzheimer ringan. Autologous fibroblasts diperoleh dari biopsi kulit kecil pada
setiap individu yang secara genetik telah dimodifikasi untuk memproduksi dan
mengeluarkan NGF menggunakan vektor retroviral dan ditanam kembali pada otak
depan. Hasil penelitian menunjukkan perbaikan dalam tingkat penurunan kognitif,
meningkatkan konsentrasi 18-fluorodeoxyglucose (PET imaging) di kortikal, dan
respon kuat pada pertumbuhan saraf ke NGF.