Abstrak
Racun protein yang dihasilkan oleh bakteri merupakan penyebab dari banyak penyakit diare
yang mengancam jiwa. Banyak dari racun ini, termasuk toksin kolera (CT), masuk ke sel
dengan terlebih dahulu mengikat glikolipid di dalam membran sel, lalu menghambat interaksi
protein / karbohidrat multivalen ini dan akan mencegah racun memasuki sel dan
menyebabkan diare. Di jurnal ini, menjelaskan bahwa modifikasi spesifik protein sangat
cocok dalam ukuran dan valensi untuk target toksin, dan menyediakan rute yang sesuai ke
multivalen inhibitor sehingga menjadi efektif. Jurnal ini juga menampilkan neoglikoprotein
pentavalen yang menghasilkan potensi penghambatan (IC50) dari 104 pm untuk CT B-
subunit (CTB), yang merupakan inhibitor pentavalen paling kuat untuk target yang
dilaporkan. Kompleksasi inhibitor dan CTB menghasilkan heterodimer protein. Strategi
penghambatan ini dapat berpotensi dan banyak diterapkan ke banyak reseptor multivalen dan
juga membuka peluang baru untuk strategi perakitan protein.
Introduction
Banyak virus, bakteri, dan racun dari protein melekat pada sel target dengan
mengikat karbohidrat yang ada pada permukaan sel yang spesifik. Penyakit diare yang
diinisiasi dengan cara seperti ini sekitar dua juta kematian setiap tahun [1]. Misalnya, kolera
yang disebabkan oleh racun protein AB5 yang memiliki racun tunggal sub unit A yang terkait
dengan lima B-subunit tidak beracun (CTB), yang merupakan reseptor pentamerik untuk
GM1 glikolipid dan ditemukan di permukaan sel-sel epitel usus. [2] Pengikatan multivalen
antara CTB dan lima salinan ligan GM1 memfasilitasi masuknya toksin ke dalam sel
endocytosis. Multivalensi adalah fitur umum dari adhesi permukaan sel dan dengan demikian
menyediakan fokus utama untuk menciptakan inhibitor protein pengikat karbohidrat,
termasuk CTB. [3] Struktur polimer dan dendrimers dengan kedua residu galactosyl atau
GM1 yang lebih kuat mengikat ligan oligosakarida (GM1) telah menunjukkan peningkatan
potensial dalam kegiatan yang multivalensi. [4] Struktur berbentuk bintang Pentavalent yang
cocok dengan valensi dan posisi kelompok ligan untuk CTB terbukti menjadi beberapa
inhibitor yang paling sukses. Sebuah inti pentacyclen dengan ligan galaktosa digunakan oleh
Fan et al untuk menghasilkan inhibitor dengan nilai IC50 yang dilaporkan dari 1,4 µm. [5]
Pendekatan modular mereka menunjukkan kecocokan, karena tepatnya ukuran dan jarak
ligan untuk mengikat situs CTB dapat mengoptimalkan potensi penghambatan. [5b, 6]. Studi
terbaru lainnya telah menggunakan ligan GM1os pada kedua corannulene [7] dan calixarene
core. [8] Struktur pentavalen memberi nilai IC50 hingga 5 nm dan 450 pm. Sebuah inti
karbohidrat pentamerik juga telah digunakan dalam ligan Starfish yang sangat efektif untuk
shiga-like toksin. [9] Sementara ligan pentavalent sintetis telah terbukti sebagai inhibitor
yang efektif, sintesis sebesar (diameter> 5 nm), scaffolds multivalen menghambat aplikasi
dalam skala besar. Di sini kami melaporkan inhibitor multivalen untuk toksin kolera,
berdasarkan protein CTB mutan yang tidak aktif yang dimodifikasi dengan ligan GM1os
(Gambar 1). Upaya sebelumnya untuk memperkenalkan gula di lokasi yang ditentukan pada
pengulangan ankyrin protein [10] dan protein barstar [11] menyebabkan ligan dan inhibitor
dari lektin tumbuhan. Namun, karena tidak ada upaya yang dibuat untuk mencocokkan
ukuran dan jarak dari ligan untuk mengikat situs, senyawa multivalen ini hanya menyebabkan
perangkat tambahan yang sederhana dalam aktivitas / agregasi lectin, yang mungkin tidak
diinginkan. Dalam contoh yang dilaporkan di sini, inhibitor pentavalen dicocokkan dengan
ukuran dan valensi dari target protein CTB, yang mengarah ke kompleks dan penghambatan
yang kuat. Kami menggunakan CTB mutan protein yang tidak aktif sebagai perancah, setelah
dimodifikasi dengan karbohidrat, ligan pentavalen yang dihasilkan harus memberikan
kecocokan yang tepat pada kelompok ligan dengan jarak dan konfigurasi pengikatan situs
pada tipe CTB (Gambar 1).
CTB homopentamer memiliki lima residu treonin N-terminal yang terletak pada
permukaan protein ke arah ligand-binding face dan jarak yang sama sekitar protein antara
situs pengikatan GM1. Dalam hal ini, residu mengandung kelompok alkohol amino vicinal
yang unik, yang bisa secara selektif dikonversi oleh oksidasi ke aldehida sebelumnya melalui
reaksi dengan oxyamine. [12] Modifikasi protein perancah di situs-situs ini dengan lima ligan
GM1os akan menghasilkan ligan pentavalent. Ligan GM1os disiapkan dengan terlebih
dahulu mensintesis Bocprotected aminooxy alkyne 3 (Skema 1) menurut prosedur yang
dilaporkan. [14] GM1 azide 2 disiapkan menggunakan pendekatan chemo-enzymatic [15]
sebelum ligasi terhadap aminooxy alkuna (3) menggunakan siklikal alkuna azik tembaga-
katalis (CuAAC) pada suhu kamar dengan waktu pengadukan 48 jam. Upaya dilakukan untuk
menggunakan bantuan gelombang mikro CuAAC untuk sintesis, [16] tetapi dalam kasus ini
terbukti tidak berhasil. Setelah pemurnian dengan kolom kromatografi fase balik, GM1os
ligan 4 diisolasi. Kelompok Boc dihapus dengan TFA untuk membentuk oxyamine 5,
langsung sebelum tanpa pemurnian lebih lanjut (supaya gugus aminooksi yang sangat reaktif
tetap ada). Untuk menciptakan perancah protein, mutan yang tidak mengikat CTB diperlukan.
Berdasarkan penelitian Jobling dan Holmes, [17] residu triptofan (W88) dalam pengikatan
GM1 diubah menjadi residu asam glutamat oleh situs-diarahkan mutagenesis. Protein mutan
CTB yang dihasilkan (W88E) tidak lagi mampu mengikat ke GM1OS (Gambar S3 dalam
Informasi pendukung). Kelima vicinal amino N-terminal kelompok alkohol di W88E
kemudian dioksidasi dengan NaIO4 (Skema 1) untuk memberikan aldehida, yang diamati
dalam bentuk terhidrasi W88E oleh ESI-MS (ditemukan: 11557.8 Da; calcd: 11 557.9 Da).
Protein teroksidasi kemudian dibiarkan bereaksi dengan oxyamine 5 yang terlindungi dengan
kehadiran anilin pada pH 7. Aniline dikenal sebagai katalis oksit yang efektif pada pH 4,5,
[18] namun, sebagai penyangkalan protein CTB dalam kondisi asam, nilai pH netral
digunakan dan reaksinya masih berlanjut sampai 24 jam.
Skema 1. a) Sintesis oligosakarida
GM1 yang dimodifikasi dengan
oksime ligan 5; b) Oksidasi N-
terminal dari protein CTB W88E
dan ligasi dengan ligan 5.