JKK, Tahun 2016, Vol 5(1), halaman 24-28 ISSN 2303-1077

OPTIMASI PRODUKSI PROTEIN SEL TUNGGAL (PST) DARI BAKTERI YANG

TERDAPAT PADA GASTROINTESTINAL (GI) IKAN NILA (Oreochromis niloticus)
DAN IKAN KEMBUNG (Scomber canagorta)

Berly Inuhan*1, Savante Arreneuz1, Muhamad Agus Wibowo1

1
Program Studi Kimia, Fakultas MIPA, Universitas Tanjungpura,
Jl. Prof. Dr. H. Hadari Nawawi, Pontianak
*
email: inuhanberly@yahoo.co.id

ABSTRAK

Ikan nila (Oreochromis niloticus) dan ikan kembung (Scomber canagorta) merupakan jenis ikan
yang dikonsumsi hanya bagian daging sedangkan bagian gastrointestinal (GI) dibuang sebagai
limbah terhadap lingkungan. Bagian GI ikan-ikan ini mengandung banyak jenis dari bakteri yang
dapat dimanfaatkan sebagai sumber bakteri penghasil protein sel tunggal (PST) dengan proses
fermentasi. Aplikasi pemanfaatan protein yang bersumber dari bakteri lebih sering digunakan
dibandingkan sumber dari hewan dan fungi, hal ini dikarenakan proses pertumbuhan dan
regenerasinya yang sangat cepat. Tujuan penelitian ini adalah memperoleh kondisi optimum
dalam produksi protein dan penentuan kadar protein yang didapat dari GI ikan nila (O. niloticus)
dan ikan kembung (S. canagorta) menggunakan metode Bradford dengan alat spektrofotometer
UV-Vis. Isolat-isolat terpilih dari sumber ikan nila (O. niloticus) adalah N1, N2, dan N3
sedangkan sumber ikan kembung (S. canagorta) adalah K1, K2, dan K3. Tahapan dalam
penentuan kondisi optimum produksi PST adalah penentuan waktu fermentasi, temperatur dan
pH. Isolat terpilih dari sumber ikan nila (O. niloticus) dan ikan kembung (S. canagorta) N3 dan
K3 berdasarkan kondisi optimum produksi PST. Waktu fermentasi optimum dari isolat N3 dan
K3 adalah 36 jam, temperatur optimum dari isolat N3 dan K3 yaitu 40oC dan derajat keasaman
optimum dari isolat N3 dan K3 adalah pH 7. Hasil penelitian terhadap kondisi optimum produksi
PST pada isolat N3 dan K3 memiliki kondisi optimum yang sama yaitu waktu fermentasi 36
jam, temperatur 40oC dan pH 7 dengan kadar PST masing-masing untuk isolat terpilih N3 dan
K3 yaitu 1,123 dan 1,039 mg/ml.

Kata kunci : Protein sel tunggal, Oreochromis niloticus, Scomber canagorta, pH,
temperatur, fermentasi

PENDAHULUAN Protein sel tunggal merupakan

produk biomassa berkadar protein tinggi
Indonesia merupakan negara
yang berasal dari mikrobia (Batubara,
kepulauan yang memiliki potensi yang
2009). Mikrobia penghasil PST umumnya
besar di bidang perikanan. Sumber Ikan
tumbuh pada limbah yang memiliki unsur
yang didapat berasal dari hasil
karbon dan nitrogen (Pawignya, 2011).
penangkapan di laut dan pembudidayaan
Bakteri, fungi, algae, dan yeast merupakan
(Huffard et al., 2012). Jenis ikan yang
jenis dari mikrobia yang dapat memproduksi
sangat popular berasal dari hasil
PST. Bakteri yang dapat memproduksi PST
penangkapan dilaut adalah ikan kembung
antara lain: Brevibacterium sp,
(Scomber canagorta) (Dirjen Perikanan,
Methylophilus sp, Acromobacter delvaevate,
1990), sedangkan yang berasal dari hasil
Acinetobacter calcoacenticu, Aeromonas
pembudidayaan adalah ikan nila
hydrophilla, Bacillus sp, Lactobacillus sp,
(Oreochromis niloticus) (Kordik, 2010).
Cellulomonas sp, Methylomonas sp,
Bagian ikan yang tidak digunakan dan
Pseudomonas sp, Rhodopseudomonas sp,
menghasilkan limbah terdapat pada bagian
Flavobacterium sp (Adedayo et al., 2011;
gastrointestinal (GI) ikan yang dibuang
Ashok et al., 2014).
begitu saja dapat mengganggu lingkungan.
Mikroba yang digunakan sebagai
Limbah GI ikan ini perlu dimanfaatkan lebih
penghasil PST harus memiliki kriteria yaitu
lanjut sebagai sumber bakteri penghasil
tidak bersifat patogen, memiliki nilai nutrisi
protein sel tunggal (PST) (Balaji et al., 2012;
yang baik, dapat digunakan sebagai
Gethanjali dan Subash., 2011).

24
JKK, Tahun 2016, Vol 5(1), halaman 24-28
makanan atau pakan, tidak mengandung
senyawa yang beracun, dan biaya
produksinya murah (Adedayo et al., 2011).
Pemanfaatan PST dapat digunakan
sebagai pengganti protein dari sumber
konvensional seperti hasil pertanian,
perikanan, dan peternakan (Nigam, 1998;
Batubara, 2009; Ashok et al., 2014 )
Protein yang bersumber dari bakteri
lebih banyak dimanfaatkan dibandingkan
dengan hewan dan fungi. Hal ini
dikarenakan pertumbuhan dari bakteri
sangat cepat, tidak membutuhkan media
atau ruangan yang besar dan proses
regenerasinya sangat cepat. Salah satu
sumber dari bakteri dapat ditemukan pada
bagian GI biawak (Megiandari, 2009), ikan
Cyprinus carpio (Balaji et al., 2012) dan ikan
Labeo rohita (Gethanjali dan Subash.,
2011). Jenis bakteri yang mungkin
ditemukan pada ikan adalah Pseudomonas
sp, Bacillus sp, Micrococcus sp,
Staphylococcus sp, Streptococcus sp
(Buller, 2004).
Penelitian ini menggunakan bagian
GI ikan nila (O. niloticus) dan ikan kembung
(S. canagorta) digunakan sebagai sumber
bakteri penghasil PST. Habitat antara ikan
nila yang hidup di air tawar dan ikan
kembung yang hidup di air asin merupakan
suatu perbedaan lingkungan yang sangat
menonjol yaitu dari tingkat salinitas yang
berbeda dan keanekaragaman sumber
makanan yang berbeda sehingga perlu
dilakukan penelitian mengenai optimasi
produksi protein dari GI ikan nila (O.
niloticus) dan ikan kembung (S. canagorta)
berdasarkan pH, temperatur dan waktu
fermentasi serta kadar protein yang
diperoleh menggunakan metode Bradford
dengan alat spektrofotometer UV-Vis.
METODOLOGI PENELITIAN
Alat dan Bahan
Peralatan yang digunakan dalam
penelitian ini meliputi peralatan gelas, pisau
steril, orbital shaker incubator, pH universal,
neraca, spektrofotometer UV-Vis, alat
sentrifugasi, oven dan autoclave.
Sampel berupa GI dari O. niloticus
dan S. canagorta. Bahan-bahan yang
digunakan adalah NaCl, akuades, Nutrient
Agar, glukosa, pepton, susu skim milk, agar,
MgSO4.7H2O, KH2PO4, K2HPO4,
25
ISSN 2303-1077
FeSO4.7H2O, kasein, larutan buffer, Bovine
Serum Albumin (BSA), pereaksi bradford.
Preparasi Sampel (Gethanjali dan
Subash., 2011; Balaji et al., 2012).
Ikan dibedah bagian perutnya
dengan pisau steril dan dipisahkan GI dari
ikan. Selanjutnya dibuat larutan homogen
dengan penambahan GI ke larutan natrium
klorida 0.9%. (10:1; volume:berat) dibuat
larutan hingga 10-6. Selanjutnya dilarutkan
sampel (0.1 ml) ke media padat saline
nutrient agar kemudian diinkubasi pada
temperatur 37oC selama 24 jam. Koloni
dengan kecerahan dan zona diameter
terbaik yaitu isolat terpilih dari ikan
kembung (S. canagorta) adalah K1, K2, dan
K3 sedangkan ikan nila (O. niloticus) adalah
N1, N2, dan N3. Isolat-isolat ini dipindahkan
ke media skim milk salt agar sebagai
penghasil protein pada waktu fermentasi 24
jam dan temperatur 37oC. Selanjutnya
isolat-isolat ini digunakan untuk sampel
investigasi selanjutnya.
Produksi Protein (Gethanjali dan
Subash., 2011).
Media cair yang digunakan dalam
produksi protein adalah mengandung 0.5 %
glukosa (w/v), 0.75 % pepton (w/v), 0.05 %
MgSO4.7H2O (w/v), 0.05 % KH2PO4 (w/v)
dan 0,01% FeSO4.7H2O (w/v) kemudian
dibiakan dengan variasi 6 hingga 48 jam di
dalam inkubator shaking (140 rpm) pada
temperatur 40oC dan pH 7. Setelah proses
fermentasi diatas selesai selanjutnya di
lakukan sentrifugal 10.000 rpm selama 15
menit dan dipisahkan supernatan yang
bebas sel sebagai protein preparasi
selanjutnya dilakukan uji kadar protein
dengan metode Bradford.
Pengaruh pH terhadap produksi protein
(Gethanjali dan Subash., 2011).
Penentuan pengaruh pH terhadap
produksi protein dilakukan dengan variasi
pH (6.0-9.0), dimana larutan buffer pH 6.0-
7.0 (posfat buffer), pH 8.0-9.0 (boraks
buffer). Produksi protein diinkubasi pada
waktu optimum dengan temperatur 40oC.
Selanjutnya pengujian kadar protein dengan
metode yang sama dengan diatas.
JKK, Tahun 2016, Vol 5(1), halaman 24-28 ISSN 2303-1077

Pengaruh Temperatur terhadap produksi Berdasarkan kurva pada Gambar 1

protein (Gethanjali dan Subash., 2011).
Penentuan pengaruh temperatur
terhadap produksi protein dilakukan dengan
variasi temperatur 30, 40, 50, 60oC pada pH
dan waktu fermentasi optimum. Selanjutnya
pengujian kadar protein dengan metode
yang sama dengan diatas.
HASIL DAN PEMBAHASAN
Pengaruh Variasi Waktu Fermentasi
Terhadap Produksi protein
Penelitian ini dilakukan pada variasi
waktu yaitu 0-48 jam dengan interval 6 jam
terhadap Isolat terpilih dari sumber ikan nila
(O. niloticus) yaitu N1, N2, dan N3
sedangkan isolat terpilih dari sumber ikan
kembung (S. canagorta) adalah K1, K2, dan
K3. Fermentasi dilakukan pada temperatur
40oC dan tingkat keasaman pH 7 (Balaji et
al., 2008).
1,2
1 temperatur dan variasi pH pada waktu
Konsentrasi (mg/ml)
dan 2 maka dapat diketahui fase lag terjadi
pada waktu 6-12 jam yaitu penyesuaian
bakteri terhadap lingkungan, fase log terjadi
pada waktu 12-24 jam dengan terjadinya
interaksi bakteri dengan substrat yang
meningkat membentuk protein,fase
stasioner terjadi pada waktu 24-36 jam yang
merupakan waktu optimum dari produksi
protein, tetapi setelah 36 jam yaitu fase
kematian diperoleh konsentrasi protein
yang menurun hal ini disebabkan jumlah
substrat yang mulai habis, jumlah protein
yang terbentuk dapat menghambat
pertumbuhan bakteri dan terjadinya
degradasi terhadap protein (Nelson dan
Cox., 2008; Hui, 2006).
Berdasarkan nilai konsentrasi
protein maksimum maka isolat K3 dan N3
memiliki nilai yang tertinggi dari masing-
masing isolat yaitu 1,039 mg/ml dan 1,123
mg/ml. Isolat K3 dan N3 terpilih untuk
selanjutnya dilakukan pengaruh variasi

0,8 fermentasi optimum yaitu 36 jam.

0,6 K1
Pengaruh Variasi Temperatur dan pH
0,4 K2 Terhadap Produksi Protein
0,2 K3 Pengaruh variasi temperatur
0 dilakukan pada pH 7 (Balaji et al., 2008)
terhadap isolat N3 dan K3 dengan waktu
-0,2 0 6 12 18 24 30 36 42 48 54
fermentasi 36 jam. berikut ini gambar grafik
-0,4 Waktu ( Jam ) variasi temperatur terhadap kadar protein.

Gambar 1. Kurva konsentrasi protein 1,2

1,123
Kadar Protein (mg/ml)

terhadap waktu fermentasi 1

isolat terpilih ikan kembung (S.
canagorta) 0,8 0,836

1,2 0,6
1,0 0,4
Konsentrasi (mg/ml)

0,8 0,2 0,259 0,209

N1
0,6
N2 0
0,4 20 30 40 50 60 70
0,2 N3
Temperatur (oC)
0,0
-0,2 0 6 12 18 24 30 36 42 48 54 Gambar 3. Isolat N3 variasi temperatur
-0,4 pada pH 7 dan waktu
Waktu (Jam) fermentasi 36 jam
Gambar 2. Kurva konsentrasi protein
terhadap waktu fermentasi Berdasarkan Gambar 3 dan 4
isolat terpilih ikan nila (O. diperoleh konsentrasi protein meningkat
niloticus) hingga temperatur 40oC, hal ini karena
semakin sesuai kondisi temperatur yang
dibutuhkan bakteri untuk pertumbuhan dan

26
JKK, Tahun 2016, Vol 5(1), halaman 24-28 ISSN 2303-1077

berkembangbiak, tetapi setelah temperatur perubahan struktur molekul dan

40oC terjadi penurunan konsentrasi protein kelarutannya (Pawignya, 2011; Mathews et
hal ini karena temperatur tinggi dapat al., 2004).
mengubah sifat fisik dari membran sel dan 1,2

kadar protein (mg/ml)

mempengaruhi sistem sekresi ekstraseluler 1 1,039
dari bakteri (Gethanjali dan Subash., 2011;
Balaji et al., 2012). 0,8
0,6
1,2 0,517 0,522
kadar protein (mg/ml)

0,4
1 1,039 0,465
0,2
0,8
0,6 0
5 6 7 8 9 10
0,4 pH
0,345 0,313
0,2 Gambar 6. Isolat K3 variasi pH pada
0,128
0 temperatur 40oC dan waktu
20 30 40 50 60 70 fermentasi 36 jam
Temperatur (oC) Berdasarkan hasil penelitian maka
Gambar 4. Isolat K3 variasi temperatur dapat diketahui bahwa isolat dari N3 dan K3
pada pH 7 dan waktu memiliki kondisi optimum yang sama yaitu
fermentasi 36 jam pada temperatur 40oC, pH 7, dan waktu
fermentasi 36 jam sehingga N3 dan K3
Pengaruh variasi pH dilakukan pada memiliki potensi sebagai penghasil PST.
temperatur dan waktu fermentasi optimum Hal ini dapat dilihat pada penelitian
yaitu 40oC dan 36 jam terhadap isolat N3 terdahulu yaitu pH 7 dan temperatur 40oC
dan K3. Berikut ini adalah gambar grafik untuk GI ikan Cyprinus carpio (Balaji et al.,
variasi pH terhadap kadar protein. 2012), pH 9 dan temperatur 40oC untuk GI
ikan Labeo rohita (Gethanjali dan Subash.,
2011), pH 9 dan temperatur 55oC usus
1,2 biawak Varanus salvator (Megiandari,
1,123
Kadar Protein (mg/ml)

1
0,8
0,6
0,4
0,2
0
5 6
Gambar 5. Isolat N3 variasi pH pada
temperatur 40oC dan waktu
fermentasi 36 jam
Berdasarkan gambar 5 dan 6 diperoleh
konsentrasi protein yang meningkat hingga
pH 7 karena kesesuaian kondisi keasaman
dengan lingkungan hidup dari bakteri
sehingga aktivitas pertumbuhannya untuk
mengubah substrat menjadi protein juga
meningkat, tetapi setelah pH 7 konsentrasi
protein menurun yang disebabkan proses
denaturasi protein sehingga aktivitas
biologis dari bakteri terganggu akibat dari
2009).
SIMPULAN
Berdasarkan hasil penelitian yang
0,655 telah dilakukan dapat disimpulkan bahwa:
0,452 1. Waktu fermentasi, temperatur dan pH
0,462 untuk menghasilkan produk protein dari
isolat K3 dan N3 memiliki kondisi
optimum yang sama yaitu 36 jam, pH 7
dan suhu 40oC.
7 pH 8 9 10
2. Kadar protein dari isolat K3 dan isolat
N3 yaitu 1,039 mg/ml dan 1,123 mg/ml.
DAFTAR PUSTAKA
Adedayo, M.R., Ajiboye, E.A., Akintunde,
J.K., dan Odaibo, A., 2011, Single Cell
Proteins: As Nutritional Enhancer,
Pelagia Research Library, Vol.2 (5):
396-409.
Ashok, G.V., Pounikar, M.A dan Gulhane,
P.A., 2014, Liquid Whey: A Potential
Substrate for Single Cell Protein
Production from Bacillus subtilis NCIM
2010, Int. J. of Life Sciences, Vol. 2(2):
119-123.

27
JKK, Tahun 2016, Vol 5(1), halaman 24-28
Buller N.B., 2004, Bacteria from Fish and
Other Aquatic Animals A Practical
Identification Manual, CABI Publishing.
Balaji N., Rajasekaran K. M, Kanipandian
N., Vignesh V dan Thirumurugan R.,
2012, Isolation and screening of
proteolytic bacteria from freshwater
Fish Cyprinus Carpio, International
Multidisciplinary Research Journal, Vol
2(6):56-59.
Batubara, U. M., 2009. Pembuatan Pakan
Ikan dari Protein Sel Tunggal Bakteri
Fotosintetik Anoksigenik dengan
Memanfaatkan Limbah Cair Tepung
Tapioka yang Diuji pada Ikan Nila
(Oreochormis niloticus), Departemen
Biologi USU: Medan (Skripsi).
Direktorat Jenderal Perikanan, 1990, Buku
Pedoman Pengenalan Sumber daya
Perikanan Laut, Jakarta.
Geethanjali, S., dan Subash, A., 2011,
Optimization Of Protease Production
By Bacillus subtilis Isolated From Mid
Gut Of Fresh Water Fish Labeo Rohita,
world journal of fish and marine
sciences, Vol.3(1) : 88-95.
Huffard, C.L., Mark V.E., dan Tiene G.,
2012, Prioritas Geografi
Keanekaragaman Hayati Laut Untuk
Pengembangan Kawasan Konservasi,
Kementerian Kelautan dan Perikanan.
28
ISSN 2303-1077
Hui, Y.H., 2006, Food Biochemistry And
Food Processing, First
Edition,Blackwell Publishing, IOWA.
Kordik, K., 2010, Budidaya Ikan Nila di
Kolam Terpal, Lily Publisher,
Yogyakarta.
Mathews, Von Holde and Ahren, 2004,
Biochemistry, Third Edition, Companio
Website.
Megiandari, A., 2009, Isolasi Dan Pencirian
Enzim Protease Keratinolitik Dari Usus
Biawak Air, Departemen Kimia Fakultas
Matematika Dan Ilmu Pengetahuan
Alam Institut Pertanian Bogor (Skripsi).
Nelson D.L and Cox M. M., 2008, Lehninger
Priciples of Biochemistry, fifth edition,
W.H. Freeman and Company, New
York.
Nigam, J.N., 1998. Single cell Protein from
Pineapple Cannery Effluent. World
Journal of Microbiology &
Biotechnology. 14: 693-696.
Pawignya, H., 2011, Pembuatan Protein Sel
Tunggal dari Limbah Nanas dengan
Proses Fermentasi, Prosiding Seminar
Nasional Teknik Kimia “Kejuangan”,
ISSN 1693 – 4393.