Pada masa pemerintahan Presiden BJ. Habibie, merupakan masa transisi reformasi. Isu otonomi
pendidikan sebenarnya hak bagi setiap institusi untuk memutuskan apa yang baik bagi sebuah
institusi tanpa ada gangguan dari pihak luar. Konsep ini jelas datang dari semangat kebebasan
akademis, ketika hak-hak akademis individu untuk mengekspresikan opini mereka terjamin. Di dalam
Magna Carta of European Universities yang ditandatangani pada 1988 oleh para rektor dari
universitas terbaik se-Eropa dikatakan bahwa universitas merupakan lembaga yang otonom di
tengah-tengah masyarakat yang sangat beragam, baik secara geografis maupun budaya. Universitas
adalah produsen utama hampir seluruh produk sosial, politik, dan budaya yang bersinggungan
langsung dengan kehidupan masyarakat.
Dalam rangka nemarik minat pusat, pendidikan tinggi di Indonesia harus membuka program-
program pelatihan, sertifikat, serta kuliah jarak jauh yang dikelola dengan logika kolaboratif, yaitu
ketersambungan dunia bisnis dan dunia pendidikan. Networking atau jejaring adalah kata kunci yang
harus dikembangkan secara terus-menerus oleh setiap universitas dalam rangka mencari
partnership yang tepat antara universitas dan lembaga keuangan (bisnis,entertainer) dan lembaga
riset.