Setelah proses transesterifikasi biodiesel, dilakukan dalam tangki pemurnian yang

telah dilengkapi oleh pengaduk dan adsorben. Biodiesel yang telah masuk ke dalam tangki
kemudian dilakukan pengadukan yang bertujuan untuk mempercepat kontak antara adsorben
yaitu adsorben pasir silika dan adsorbat yang berupa gliserol.
Pada proses pemurnian ini menggunakan prinsip adsorpsi yaitu molekul-molekul
gliserol dalam biodiesel akan terabsorbsi menuju lapisan tilm , karena adsorben yang
digunakan berbentuk serbuk yang dapat membentuk luas permukaan yang besar, maka daya
serap adsorben terhadap adsorbatnya cukup tinggi.. Selanjutmya dilakukan difusi gliserol
Yang teradsorpsi melalui kapiler atau pori dalam adsorben dan yang terakhir adalah gliserol
yang telah teradsorb akan berada pada dinding pori atau permukaan adsorben.