Diterjemahkan dari bahasa Inggris ke bahasa Indonesia - www.onlinedoctranslator.

com

Evaluasi Sistematis Serotipe Penyebab Penyakit

Pneumokokus Invasif pada Anak Balita: The
Pneumococcal Global Serotype Project
Harapan L. Johnson1*, Maria Deloria-Knoll1, Orin S. Levine1, Sonia K. Stoszek2, Laura Freimanis Hance2,
Richard Reithinger2¤, Larry R. Muenzo2, Katherine L. O'Brien1
1 Pusat Akses Vaksin Internasional, Departemen Kesehatan Internasional, Sekolah Kesehatan Masyarakat Universitas Johns Hopkins Bloomberg, Baltimore,
Maryland, Amerika Serikat, 2Westat, Rockville, Maryland, Amerika Serikat

distribusi serotipe global dan regional penyebab IPD pada anak usia ,5 tahun.

acak dan dikombinasikan dengan perkiraan insiden dan mortalitas PD untuk menyimpulkan beban PD spesifik serotipe global dan regional. Dari 1.292, studi ditinjau, 169 dimasukkan terdiri dari 60.090

0) Evaluasi Sistematis Serotipe Penyebab Penyakit Pneumokokus Invasif pada Anak Balita: Proyek Serotipe Global Pneumokokus. PLoS Med 7(10): e1000348. doi:10.1371/journal.pmed.1000348
rima 30 Maret 2010; Diterima 26 Agustus 2010; Diterbitkan 5 Oktober 2010
ntuan Lisensi Atribusi Creative Commons, yang mengizinkan penggunaan, distribusi, dan reproduksi tanpa batas dalam media apa pun, asalkan penulis dan sumber asli dicantumkan.
pengumpulan dan analisis data, keputusan untuk menerbitkan, atau persiapan naskah.

uk Vaksin dan Imunisasi; GBD, beban penyakit global; ICC, korelasi intrakelas; IPD, penyakit pneumokokus invasif; LAC, Amerika Latin dan Karibia; NA, Amerika Utara; PCV, vaksin konjugat pneumokokus; PD, penyakit pneumokokus; SP

www.plosmedicine.org 1 Oktober 2010 | Jilid 7 | Edisi 10 | e1000348


pengantar
Pneumonia, sepsis, dan meningitis bersama-sama merupakan .25% dari 10 juta
kematian yang terjadi pada anak-anak berusia ,5 tahun di seluruh dunia
[1]. Streptokokus pneumonia (SP, pneumococcus) adalah bakteri
penyebab utama penyakit ini. Organisasi Kesehatan Dunia (WHO)
memperkirakan sekitar 800.000 anak meninggal setiap tahun karena
penyakit pneumokokus (PD), dan 90% dari kematian tersebut terjadi di
negara berkembang [2].
Tiga vaksin konjugasi pneumokokus (PCV) saat ini
tersedia dan bersifat protektif pada anak kecil. Vaksin 7-
valent (PCV7, Prevnar, Pfizer) dilisensikan pada tahun 2000
dan mengandung serotipe SP 4, 6B, 9V, 14, 18C, 19F, 23F—
serotipe yang paling sering menyebabkan PD invasif (IPD)
di antara anak kecil di Amerika Utara (NA). PCV10 (Synflorix,
GlaxoSmithKline) dilisensikan untuk digunakan di Kanada,
Australia, dan Eropa pada akhir 2008 hingga awal 2009 dan
mengandung serotipe PCV7 plus serotipe 1, 5, dan 7F.
PCV13 (Prevnar13, Pfizer) menambahkan serotipe 3, 6A,
dan 19A ke serotipe PCV10 dan dilisensikan di Chili dan
oleh European Medicines Agency pada tahun 2009. PCV7
saat ini digantikan oleh vaksin PCV13 karena produksi dan
pasokan ditingkatkan.
Terlepas dari ketersediaan PCV7 sejak tahun 2000, beberapa
negara di wilayah geografis dengan beban penyakit pneumokokus
tertinggi telah memperkenalkan vaksin ke dalam program
imunisasi nasional. Pada bulan Oktober 2006, WHO mengadakan
pertemuan konsultasi ahli untuk mengevaluasi komposisi serotipe
minimum atau optimal dari PCV untuk digunakan di negara-negara
miskin sumber daya. Perkiraan distribusi serogrup diterbitkan pada
tahun 2000 oleh Hausdorff et al., tetapi sejak itu, data tambahan
telah tersedia untuk serotipe untuk negara-negara di wilayah di
mana beban penyakit tertinggi [3]. Setelah meninjau epidemiologi
IPD dan literatur yang ada tentang distribusi global serotipe [3],
kelompok ahli menyimpulkan bahwa perkiraan terbaru dari
distribusi serotipe diperlukan [4].
Pada bulan Februari 2007, Aliansi GAVI mengumumkan AMC Pneumococcal
senilai US$1,5 miliar, untuk mendanai mekanisme pendanaan vaksin baru guna
mempercepat pengembangan dan pengenalan vaksin pneumokokus untuk negara-
negara termiskin di dunia (GAVI Alliance–memenuhi syarat: negara-negara dengan
pendapatan nasional bruto per kapita
, US$1.000 pada tahun 2003). Penting untuk AMC Pneumokokus adalah
penetapan spesifikasi produk vaksin minimum, juga dikenal sebagai
profil produk target (TPP), agar vaksin memenuhi syarat untuk dana
AMC. Di sini kami melaporkan tinjauan sistematis dan meta-analisis
serotipe yang menyebabkan IPD pada anak-anak, 5 tahun sebagai
bagian dari Proyek Serotipe Global Pneumococcal (GSP), yang
memperkirakan distribusi serotipe global dan regional, beban penyakit
spesifik serotipe, dan potensi kesehatan masyarakat. dampak formulasi
PCV untuk menginformasikan pengambilan keputusan mengenai
pengembangan dan pengenalan vaksin pneumokokus.
Metode
Kami melakukan tinjauan sistematis literatur yang diterbitkan dan meta-
analisis menggunakan protokol yang dikembangkan oleh penulis dan
diringkas di bawah ini.
Penelitian Manusia
Penelitian ini tidak dianggap sebagai penelitian partisipan manusia dan
oleh karena itu tidak memerlukan persetujuan dari Institutional Review Board.
www.plosmedicine.org
Proyek Serotipe Global Pneumokokus
Sumber Data
Kami mengidentifikasi artikel yang diterbitkan pada 15
Juli 2007 dengan data serotipe sebelum pengenalan PCV
dari kasus IPD (didefinisikan sebagai isolasi SP dari situs
yang biasanya steril) di antara anak-anak, 5 tahun dengan
mencari secara sistematis 12 database literatur (PubMed,
Medline, Embase, Basis Data Kesehatan Global, Biosis,
PASCAL, Konten Terkini, Medicus Indeks Afrika, Indeks
Medicus untuk Wilayah Mediterania Timur WHO [IMEMR],
Informasi Ilmu Kesehatan Amerika Latin dan Karibia
(LILACS), Literatur Kesehatan, Layanan Perpustakaan dan
Informasi (HELLIS), yang juga berisi Index Medicus untuk
Wilayah Asia Tenggara [IMSEAR]), memodifikasi kata kunci
dan istilah pencarian yang dijelaskan di tempat lain (Tabel
S1) [5]. Daftar referensi dari makalah yang diambil dicari
untuk studi lebih lanjut.
Kriteria Inklusi
Kami memasukkan penelitian yang melaporkan setidaknya 20 isolat
pneumokokus serotipe yang diperoleh dari tempat yang biasanya steril
(misalnya, darah, cairan serebrospinal, cairan pleura) yang dilakukan sejak
tahun 1980 dengan durasi setidaknya 12 bulan pengawasan karena sifat
musiman PD dan, untuk AS, Kanada, Australia, dan Eropa, pengenalan
nasional pra-PCV7. Jika memungkinkan, data dibatasi pada anak-anak berusia
,5 tahun, tidak termasuk neonatus. Namun, data sering disajikan secara
agregat dengan anak-anak yang lebih tua dan kami berusaha untuk
menghubungi setiap penulis untuk mendapatkan data serotipe terbatas pada
anak-anak usia ,5 tahun. Dengan berkonsultasi dengan Komite Ahli Eksternal
(EEC), yang memberikan tinjauan teknis dan saran tentang metode penelitian
dan interpretasi analisis kami, kami memutuskan untuk memasukkan studi
dengan data serotipe dari anak-anak usia $60 bulan jika data disajikan secara
agregat dengan data serotipe dari anak-anak usia 0-59 bulan untuk
meningkatkan keterwakilan geografis dari data serotipe yang termasuk
dalam analisis, terutama pada beban penyakit yang tinggi daerah. Kami
mengasumsikan sebagian besar kasus dalam penelitian ini terjadi di antara
anak-anak usia #5 tahun dan termasuk penelitian di NA dan Eropa hingga
usia 83 bulan yang konsisten dengan epidemiologi penyakit pneumokokus.
Untuk semua negara dan wilayah lain di mana datanya kurang banyak, kami
menyertakan studi dengan data serotipe agregat hingga usia 215 bulan. Data
serotipe tambahan dari anak-anak tersedia dari negara-negara tetapi tidak
dimasukkan dalam analisis jika data serotipe disajikan secara agregat dengan
anak-anak yang lebih tua dari batas usia masing-masing (yaitu, 83 bulan di NA
dan Eropa dan 215 bulan di semua wilayah geografis lainnya). Studi yang
menguji atau melaporkan hanya serotipe yang termasuk dalam formulasi
vaksin yang ada (misalnya, hanya cakupan serotipe vaksin PCV7 yang
dilaporkan) dikeluarkan dari analisis karena potensi bias dari serotipe
nonvaksin yang tidak dilaporkan.
Pengumpulan dan Pengelolaan Data
Dua pengulas mengabstraksi setiap studi menggunakan formulir kertas
yang telah diuji sebelumnya. Data yang diabstraksi meliputi desain dan
setting penelitian, dan proporsi IPD yang disebabkan oleh setiap serotipe
yang dikelompokkan berdasarkan usia, sindrom (yaitu, meningitis,
pneumonia, nonpneumonia/nonmeningitis, misalnya bakteremia tanpa fokus,
dan IPD tidak ditentukan lain), jenis spesimen, dan status HIV. Definisi
sindrom didasarkan pada laporan penulis dan tidak ada upaya yang dilakukan
untuk membakukan definisi di seluruh studi. Data yang tidak sesuai
diabstraksi ulang oleh resensi ketiga yang abstraksinya dianggap final. Data
dimasukkan dua kali ke dalam database Microsoft Access (Microsoft) yang
disesuaikan, yang mencakup beberapa pemeriksaan data untuk:
2 Oktober 2010 | Jilid 7 | Edisi 10 | e1000348
memastikan kelengkapan dan keakuratan data yang diabstraksikan dan
dimasukkan.
Analisis data
Proporsi IPD karena masing-masing serotipe diperkirakan
independen dari serotipe lain menggunakan meta-analisis efek acak
marginal dalam wilayah geografis yang ditentukan menurut definisi PBB
untuk memperkirakan distribusi serotipe regional [6,7]. Isolat serogrup
yang tidak disubtipekan lebih lanjut dibagi menjadi serotipe dengan
menerapkan estimasi serotipe regional untuk serogrup tersebut dari
analisis saat ini. Nilai kecil bukan nol (0,5 isolat untuk pembilang dan
penyebut) ditambahkan ke semua pengamatan untuk mengakomodasi
serotipe yang dilaporkan sebagai 0% yang bobot studinya (kebalikan
dari varians) tidak akan ditentukan. Untuk meminimalkan bias yang
dihasilkan, estimasi dibatasi hanya pada 21 serotipe dan kategori
agregat ''semua serotipe lainnya''. Pemilihan serotipe yang akan
dimodelkan didasarkan pada 20 serotipe paling umum teratas secara
global setelah disesuaikan dengan kejadian PD regional dalam analisis
awal yang terbatas pada studi dengan semua serotipe isolat (Tabel S2).
Serotipe yang diidentifikasi sebagai 20 teratas secara global termasuk
serotipe PCV13 dan 13 serotipe paling umum di setiap wilayah dengan
pengecualian serotipe 9A. Serotipe 9A termasuk di antara 13 serotipe
peringkat teratas di NA tetapi tidak termasuk di antara 20 serotipe
global yang paling umum (peringkat 25), sehingga ditambahkan sebagai
serotipe ke-21 yang diperkirakan. Untuk menormalkan pendugaan
serotipe sehingga jumlahnya mencapai 100%, masing-masing proporsi
serotipe yang diestimasi secara independen dibagi dengan jumlah
proporsinya. Rentang ketidakpastian untuk setiap proporsi serotipe
diperkirakan dengan interval kepercayaan 95% (CI) dari meta-analisis
dan batas bawah ditetapkan ke nol jika negatif. Metode statistik yang
sama diterapkan untuk memberikan perkiraan menggunakan kategori
lain untuk analisis bertingkat termasuk distribusi serotipe menurut
wilayah tidak termasuk negara tunggal dengan jumlah isolat terbesar
dalam analisis regional, oleh kelayakan Aliansi GAVI, dan distribusi
serotipe berdasarkan kelompok usia.
Kesesuaian proporsi serotipe yang diamati antara studi individu yang
digunakan dalam analisis regional diperiksa dengan menghitung
korelasi intraclass (ICC) untuk setiap serotipe [8]. Ketika ICC tinggi (yaitu,
secara informal didefinisikan sebagai antara 0,7 dan
1.0), variabilitas dalam proporsi serotipe antara studi dianggap
kecil dibandingkan dengan variasi statistik alami dalam studi (yaitu,
varians dalam studi). Sebaliknya, ketika ICC rendah (yaitu, 0,05),
studi yang berbeda adalah sebagai, atau lebih, variabel dalam
pelaporan proporsi serotipe yang diberikan daripada variasi
statistik alami dalam sebuah penelitian.
Untuk memperkirakan distribusi serotipe global, distribusi
serotipe regional dibobot oleh perkiraan beban penyakit global
WHO dari insiden regional kasus PD (Proyek GBD) [2]. Insiden dan
mortalitas PD serotipe spesifik diperkirakan dengan mengalikan
distribusi serotipe regional dengan perkiraan insiden dan
mortalitas Proyek GBD [2]. Distribusi serotipe yang identik untuk
PD bakteremik dan nonbakterimik diasumsikan untuk kedua kasus
dan kematian. Untuk memperkirakan ketidakpastian, kami
mengalikan batas atas dan bawah dari 95% CI untuk setiap
proporsi serotipe dengan batas ketidakpastian atas dan bawah dari
perkiraan Proyek GBD [2].
Cakupan serotipe PCV7, PCV10, dan PCV13 didefinisikan sebagai
jumlah estimasi meta-analisis proporsi serotipe tipe vaksin dengan
95% CI yang diperkirakan menggunakan metodologi bootstrap [9].
Kami mengasumsikan proteksi silang serotipe 6A/6B untuk PCV7
dan PCV10 berdasarkan bukti dari uji kemanjuran PCV dan data
dampak pengenalan pascavaksin dari Pusat Pengendalian dan
Pencegahan Penyakit AS, surveilans Inti Bakteri Aktif
[10-12]. Untuk memperkirakan beban penyakit yang terkait dengan
formulasi PCV spesifik, cakupan serotipe vaksin untuk IPD dikalikan
dengan perkiraan insiden dan mortalitas Proyek GBD untuk PD [2].
Analisis statistik dilakukan di SAS (Versi 9.1.3, SAS
Institute) dan divalidasi oleh programmer statistik kedua.
MEE danAD hoc konsultasi dengan ahli lain yang relevan
memberikan tinjauan teknis dan saran tentang metode
studi dan interpretasi analisis.
Hasil
Data Ditinjau
Kami mengidentifikasi 1.232 artikel dan laporan yang diterbitkan dan
peneliti memberikan data yang tidak dipublikasikan dari 60 studi tambahan
(Gambar S1; Teks S1). Kami mengambil teks lengkap dari 618 artikel setelah
penyaringan judul dan abstrak dan penghapusan data duplikat (n =44).
Skrining teks lengkap mengecualikan studi tanpa SP yang diisolasi dari situs
steril (n =139), atau data serotipe (n =161), atau jika data serotipe yang
dilaporkan tidak dapat diabstraksikan untuk tujuan penelitian (misalnya,
disajikan secara agregat dengan kelompok umur/spesimen yang tidak
memenuhi kriteria inklusi) (n =149).
169 studi dimasukkan dalam analisis akhir, mewakili 70
negara dan 60.090 isolat serotipe (Tabel 1). Setiap wilayah
geografis menyumbangkan sejumlah besar penelitian
(kisaran: 16–42) dan isolat (kisaran: 3.649–18.788), dengan
jumlah isolat paling sedikit dari Oseania (3.649) dan Asia
(4.752). Jumlah isolat dari penelitian yang termasuk dalam
analisis berkisar antara 20 hingga 8.221, dan sebagian
besar penelitian di Afrika, Asia, dan Eropa melaporkan data
serotipe untuk kurang dari 100 kasus IPD. Studi biasanya
melaporkan jumlah isolat serotipe yang lebih kecil jika
surveilans (a) memiliki metode deteksi yang kurang sensitif,
(b) durasinya lebih pendek, atau (c) tidak mengisolasi
serotipe dari semua kasus yang diidentifikasi.
Distribusi Serotipe Regional
Perkiraan regional dari proporsi IPD di antara anak kecil
menunjukkan bahwa sejumlah serotipe yang terbatas
tampaknya menyebabkan sebagian besar IPD di seluruh
dunia (Gambar S2). Jumlah serotipe yang menyumbang
$70% dari IPD berkisar dari 6 di NA (95% CI 5-7) hingga 9 di
Afrika (95% CI 8-11) dan 11 di Asia (95% CI 9-13) (Gambar
S3 ). Tujuh serotipe (1, 5, 6A, 6B, 14, 19F, dan 23F) adalah
yang paling umum secara global (Gambar 1), tujuh paling
umum di Afrika dan Asia, dan menyumbang 58% -66% dari
IPD di setiap wilayah (Gambar S2). Setiap wilayah memiliki
satu negara dengan jumlah isolat yang jauh lebih besar
daripada negara lain di wilayah itu (yaitu, Asia, Israel;
Afrika, Afrika Selatan; Amerika Latin dan Karibia (LAC),
Brasil; NA, AS; Eropa, Inggris Raya : dan Oseania, Australia)
(Gambar S4).
Serotipe 14 adalah serotipe yang paling umum terhitung 12% -29% dari
IPD di setiap wilayah. Serotipe 6B menduduki peringkat kedua di setiap
wilayah, kecuali Afrika (peringkat kelima); ketika dikombinasikan dengan
serotipe 6A, serogrup ini menyumbang 14% -18% dari IPD di seluruh wilayah.
Serotipe 6C, yang diidentifikasi pada tahun 2007 [13,14], tidak dilaporkan
dalam penelitian yang termasuk dalam analisis ini. serotipe
1, penyebab yang diketahui dari wabah meningitis di meningitis Afrika
 Tabel 1. Ringkasan data serotipe yang tersedia untuk analisis.

Total
Data serotipe Kategori Afrika Asia Eropa LAC tidak Oceania (Global)

n Negara (persentase — 13/53 (24,5) 18/47 (38.3) 16/42 (38.1) 17/33 (51,5) 2/2 (100,0) 16/4 (15.0) 70/193 (36.3)
negara di kawasan)

n Negara yang memenuhi syarat GAVI — 10/39 (25.6) 22/6 (27.3) 0/2 (0.0) 3/6 (50,0) 0/0 (0.0) 3/3 (100,0) 20/72 (27,8)
(persen negara di kawasan)

n Studi — 22 33 39 42 17 16 169
n Studi oleh n isolat serotipe dalam 20–49 7 (31.8) 7 (21.2) 13 (33.3) 4 (9.5) 2 (11.8) 4 (25.0) 37 (21.9)
penelitian (persen studi di wilayah):
50–99 4 (18.2) 11 (33.3) 9 (23.1) 8 (19.1) 2 (11.8) 2 (12.5) 36 (21,3)

100–199 6 (27.3) 9 (27.3) 5 (12.8) 10 (23.8) 2 (11.8) 5 (31.3) 37 (21.9)

200–499 2 (9.1) 5 (15.2) 8 (20,5) 9 (21,4) 6 (35.3) 1 (6.3) 31 (18.3)

$500 3 (13.6) 1 (3.0) 4 (10.3) 11 (26.2) 5 (29.4) 4 (25.0) 28 (16,6)

n Studi dengan data serotipe bertingkat 11/22 (50,0) 8/33 (24.2) 12/39 (23.1) 4/42 (9,5) 11/17 (64.7) 16/6 (37,5) 49/169 (29.0)
untuk anak-anak usia ,2 y dan
$2 y (persen studi di wilayah)
n Studi berdasarkan sindrom Hanya Meningitis 22/3 (13.6) 3/33 (9.1) 3/39 (7.7) 5/42 (11,9) 0/17 (0.0) 0/16 (0.0) 14/169 (8.3)
(persen studi di wilayah):
Nonmeningitis saja 1/22 (4.6) 3/33 (9.1) 4/39 (10.3) 1/42 (2.4) 17/1 (5.9) 1/16 (6.2) 11/169 (6.5)

CampuranA 18/22 (81,8) 27/33 (90.8) 32/39 (82,0) 36/42 (85,7) 16/17 (94.1) 15/16 (93,8) 144/169 (85.2)

n Terisolasi — 11.181 4.752 10.279 18.788 11.441 3,649 60.090

n Isolat per 100.000 anak ,5 — 9 1 28 34 53 136 9

tahun pada tahun 2000

AStudi dengan kasus dari salah satu sindrom berikut: meningitis, pneumonia, nonpneumonia/nonmeningitis (misalnya, bakteremia tanpa fokus), penyakit invasif tidak
ditentukan/tidak diketahui.
doi:10.1371/journal.pmed.1000348.t001

sabuk [15], peringkat di antara empat serotipe teratas di wilayah dengan

sebaliknya tidak akan terdefinisi, yang memiliki dampak lebih besar
beban IPD tertinggi (Afrika, Asia, dan LAC). Serotipe 5 menempati peringkat
pada perkiraan proporsi IPD karena serotipe yang kurang umum.
ketiga di Afrika dan LAC, dan kelima di Asia. Serotipe 1, 5, dan 14 bersama-
sama menyumbang 28% -43% dari IPD di seluruh wilayah. Serotipe 23F dan
19F bertanggung jawab atas 9% -18% IPD secara keseluruhan. Serotipe 18C Distribusi Serotipe oleh GAVI Alliance Eligibility
adalah umum (peringkat keempat atau kelima) di daerah dengan sebagian Data serotipe (4.678 isolat) yang tersedia dari 20 dari 72 negara termiskin di

besar negara berpenghasilan tinggi (yaitu, Eropa, NA, dan Oseania). Serotipe dunia (negara-negara yang memenuhi syarat Aliansi GAVI) menunjukkan bahwa

19A, yang sering dikaitkan dengan resistensi antibiotik [16], relatif lebih serotipe 14, 5, dan 1 adalah serotipe paling umum yang menyumbang 0,30% dari

penting di Eropa (6%) daripada wilayah lain (kisaran: 3% -4%). Heterogenitas IPD (Gambar 2). Di negara-negara yang tidak memenuhi syarat Aliansi GAVI,

dalam prevalensi serotipe yang dilaporkan bervariasi menurut serotipe dan serotipe 14 menyebabkan sebagian besar (24%) IPD, dan serotipe 1 dan 5 masing-

wilayah (Tabel S4). Serotipe peringkat teratas di wilayah dengan beban masing menempati peringkat kelima dan kedelapan. Serotipe 6B, 19F, dan 23F

penyakit pneumokokus tertinggi (Afrika, Asia, dan LAC) memiliki ICC rendah adalah serotipe yang paling sering diamati berikutnya untuk negara-negara yang

yang menunjukkan variabilitas tinggi di seluruh studi dalam proporsi IPD memenuhi syarat GAVI Alliance dan non-GAVI Alliance.

yang dilaporkan karena serotipe ini. Di wilayah geografis dengan ICC rendah
untuk serotipe yang dilaporkan, penambahan atau penghapusan studi
memiliki dampak besar pada meta-estimasi regional keseluruhan untuk
serotipe tersebut. Di Afrika, sepuluh serotipe memiliki ICC,0.2, sehingga meta-
estimasi untuk sepuluh serotipe ini sangat sensitif terhadap penambahan
atau penghapusan data serotipe di wilayah ini. Asia dan LAC juga memiliki
sejumlah besar serotipe dengan ICC,0.2 (masing-masing enam dan lima
serotipe). Sebaliknya, di Oseania, hanya serotipe 14 yang memiliki ICC,0,2,
yang menunjukkan homogenitas relatif dalam data proporsi serotipe yang
dilaporkan untuk wilayah ini. Nilai ICC yang lebih tinggi untuk serotipe yang
kurang umum mungkin mencerminkan bias dalam pelaporan yang kurang
dari serotipe yang kurang umum dalam penelitian yang dipublikasikan, atau
mungkin karena, sebagian, metode yang digunakan dalam analisis ini,
termasuk dimasukkannya studi dengan sejumlah kecil isolat serotipe yang
tidak dapat memperkirakan proporsi IPD yang disebabkan oleh serotipe yang
kurang umum; dan, selanjutnya, penambahan nilai kecil bukan nol pada
proporsi serotipe untuk mengakomodasi serotipe yang dilaporkan sebagai
0% yang bobot studinya
Distribusi Serotipe Menurut Kelompok Umur
Dalam 49 penelitian dengan data serotipe yang tersedia untuk kelompok
usia 2 tahun dan $2 tahun, sekitar 26% dari 25.493 isolat berasal dari anak-
anak usia $2 tahun. Sementara serotipe 14 mendominasi distribusi serotipe
global untuk kedua kelompok umur, serotipe 1 kurang umum di antara anak-
anak usia ,2 tahun (peringkat kesembilan) daripada di antara anak usia 2-4
tahun (peringkat kedua; Gambar 3); temuan serupa diamati di setiap wilayah
(data tidak dipublikasikan).
Beban Penyakit Spesifik Serotipe
Berdasarkan perkiraan insiden dan kematian Proyek GBD
WHO tahun 2000, tujuh serotipe global (1, 5, 6A, 6B, 14,
19F, dan 23F) menyumbang sekitar 9 juta kasus dan
500.000 kematian akibat PD pada anak-anak usia ,5 tahun. Di
daerah dengan insiden PD tinggi (yaitu, Afrika, Asia, LAC, Oseania),
insiden yang dicatat oleh tiga serotipe paling umum melebihi total
insiden PD dan angka kematian di NA dan Eropa (Tabel S6, S7, S8,
S9) .
Gambar 1. Proporsi IPD pada anak kecil karena serotipe yang paling umum secara global. Bilah kesalahan menunjukkan 95% CI untuk
proporsi PD invasif karena masing-masing dari 21 serotipe. Garis kumulatif menunjukkan proporsi kumulatif PD invasif karena 21
serotipe. *Disesuaikan untuk insiden kasus regional.
doi:10.1371/journal.pmed.1000348.g001
Cakupan Serotipe Vaksin dan Potensi Dampak Kesehatan
Serotipe yang termasuk dalam PCV7 menyumbang $ 49% dari IPD di
setiap wilayah, tetapi persentase ini bervariasi secara substansial
berdasarkan wilayah (kisaran: 49% -82%), dengan cakupan serotipe
tertinggi di NA dan Eropa (Gambar 4A). Cakupan PCV10 mirip dengan
PCV13, dengan serotipe menyumbang $70% dari IPD di setiap wilayah
dan lebih sedikit variabilitas regional (berkisar: 70%–84% dan 74%–88%,
masing-masing) dibandingkan dengan PCV7 (Gambar 4, dan S6, S7, S8).
Secara global, serotipe PCV7 menyumbang sekitar 7,4 juta kasus dan
400.000 kematian akibat PD pada anak-anak usia ,5 tahun (Gambar 4B,
4C). Serotipe tambahan di PCV10 dan PCV13 masing-masing
menyumbang 2,8 dan 3,4 juta kasus PD dan 170.000 dan 200.000
kematian PD.
Diskusi
Temuan kami bertentangan dengan anggapan konvensional bahwa
serotipe paling umum yang menyebabkan IPD sangat bervariasi di seluruh
wilayah geografis. Serotipe 14 adalah penyebab paling umum IPD di setiap
wilayah, dan tujuh serotipe (1, 5, 6A, 6B, 14, 19F, 23F) menyumbang lebih
dari setengah IPD di setiap wilayah. Serotipe 1 merupakan penyebab penting
IPD di Afrika, Asia, dan di Eropa, bertentangan dengan anggapan umum
bahwa serotipe ini hanya umum di negara berkembang [4]. Meskipun kami
mengidentifikasi tujuh serotipe yang umum di seluruh wilayah, proporsi IPD
yang disebabkan oleh serotipe ini bervariasi di seluruh dan di dalam wilayah.
Serotipe yang termasuk dalam PCV yang ada bertanggung jawab atas
sebagian besar
porsi IPD di setiap daerah; PCV10 dan PCV13 memberikan cakupan yang
jauh lebih besar daripada PCV7 di wilayah dengan beban PD terbesar.
Serotipe yang tidak termasuk dalam formulasi vaksin yang ada kurang
umum, oleh karena itu formulasi vaksin berbasis serotipe yang
dikembangkan untuk memperluas valensi di luar PCV13 yang ada
mungkin hanya memberikan cakupan serotipe tambahan yang marjinal
dan mungkin lebih kompleks dan mahal untuk diproduksi.
Perkiraan cakupan serotipe vaksin spesifik wilayah kami
konsisten dengan yang disediakan di tempat lain [3,10,16]. Kami
memperkirakan 82% (95% CI 78%-84%) cakupan serotipe PCV7
(dengan asumsi perlindungan silang serotipe 6A/6B) untuk NA,
yang konsisten dengan penurunan 78% (95% CI 74%-82%) yang
diamati. Vaksin IPD dan serotipe terkait vaksin pasca pengenalan
PCV7 di AS sebelum efek kelompok yang signifikan terlihat [10];
dan, mirip dengan perkiraan sebelumnya, cakupan serotipe PCV7 di
NA kira-kira 10% lebih besar daripada di Eropa [3].
Ada perbedaan penting dalam hasil kami dibandingkan dengan
analisis tahun 2000 oleh Hausdorff et al. [3], yang mungkin disebabkan
oleh perbedaan dalam studi yang disertakan, ketersediaan data serotipe
versus serogrup, dan metode pemodelan statistik yang digunakan
(analisis meta-efek acak versus efek tetap di Hausdorff et al.). Analisis
serotipe yang disajikan di sini mencakup lebih dari dua kali lipat jumlah
studi, isolat, dan data dari negara berkembang dibandingkan analisis
oleh Hausdorff et al. [3]. Jumlah isolat yang dikelompokkan dan tidak
disubtipekan lebih lanjut dalam analisis ini sedikit (6,7% dari semua
isolat) dan biasanya merupakan serogrup yang lebih umum (6, 18, 19,
23) yang kuat
Gambar 2. Proporsi IPD pada anak kecil karena 21 serotipe yang paling umum atau penting menurut kelayakan GAVI Alliance. (A) negara yang memenuhi syarat
Aliansi GAVI dan (B) negara yang tidak memenuhi syarat Aliansi GAVI. Bilah kesalahan menunjukkan 95% CI. Garis menunjukkan proporsi kumulatif di seluruh
serotipe.
doi:10.1371/journal.pmed.1000348.g002
Gambar 3. Proporsi IPD pada anak kecil secara global karena serotipe yang paling umum menurut usia. (A) anak usia 0–23 bln (n= 18.829 isolat) dan (B) anak usia
24-59 bulan (n= 6.664 isolat). Bilah kesalahan menunjukkan 95% CI. Garis menunjukkan proporsi kumulatif IPD di seluruh serotipe. *Terbatas untuk studi (n=49)
dengan data serotipe yang tersedia untuk kedua kelompok umur.
doi:10.1371/journal.pmed.1000348.g003

data subtipe tersedia di tingkat regional. Karena kurangnya data

Kekuatan dari analisis ini adalah dimasukkannya sejumlah besar penelitian
serotipe yang tersedia, Hausdorff et al. memberikan perkiraan distribusi
dan isolat yang mencakup lebih dari 20 tahun yang memungkinkan untuk
serogrup saja, dan oleh karena itu perkiraan cakupan serotipe vaksin
"memperhalus" tren sekuler dan penelitian kecil untuk memperkirakan
kurang spesifik. Hausdorff dkk. menemukan cakupan serotipe PCV7
distribusi serotipe rata-rata yang menyebabkan PD secara global dan regional
yang lebih rendah di Asia (,30%) dibandingkan dengan penelitian kami
dari waktu ke waktu. Tren sekuler dan wabah distribusi serotipe diketahui
(,50%), dan bahwa serotipe penting di Afrika berbeda dengan di Asia [3],
terjadi [17-19]. Studi tentang risiko durasi pendek yang terlalu tinggi atau
sedangkan kami menemukan bahwa tujuh serotipe yang paling umum
meremehkan cakupan serotipe karena ketidakmampuan untuk
di Afrika identik dengan yang ada di Asia, meskipun proporsi IPD yang
memperhitungkan periodisitas serotipe.
disebabkan oleh serotipe tersebut bervariasi.
Data serotipe dari sejumlah besar negara juga memperkuat
Keterbatasan review oleh Hausdorff et al. dan analisis saat ini adalah
perkiraan regional. Meskipun data terbatas atau tidak ada yang
memasukkan isolat dari anak-anak usia $60 bulan dalam analisis yang
dimasukkan dari negara-negara dengan populasi terbesar anak-anak
memperkirakan distribusi serotipe untuk anak-anak (lihat Tabel S10). Serotipe
berusia ,5 tahun (misalnya, Cina daratan dan India masing-masing
1 lebih penting pada anak yang lebih besar (seperti yang terlihat pada
menyumbang ,250 isolat, dan tidak ada isolat yang dimasukkan dari
Gambar 3; data tambahan yang tidak dipublikasikan), sehingga ada
Indonesia dan Nigeria), data serotipe dari negara-negara tetangga
kemungkinan bahwa perkiraan proporsi IPD yang disebabkan oleh serotipe 1
( misalnya, Pakistan, Bangladesh, Papua Nugini, Taiwan, Hong Kong,
sedikit dilebih-lebihkan, tetapi efeknya kemungkinan minimal karena insiden
Ghana, Burkina Faso) dimasukkan dalam analisis ini dan memastikan
yang lebih rendah. IPD pada kelompok usia ini. Keterbatasan tambahan
beberapa representasi data dari subkawasan ini. Sementara data
termasuk yang umum dalam analisis data yang dipublikasikan: (a) data sering
tambahan memungkinkan untuk menghasilkan perkiraan subregional
disajikan secara agregat tanpa spesifikasi lebih lanjut (yaitu, dalam ''lain''); (b)
dan penilaian efek usia, sindrom, status HIV, atau faktor lain pada
data yang dikelompokkan berdasarkan kategori tidak konsisten dengan
distribusi serotipe, tidak mungkin bahwa data serotipe pengenalan pra-
variabel yang diminati sehingga membatasi ketersediaan data untuk analisis
PCV tambahan akan secara signifikan mengubah kesimpulan regional
bertingkat (misalnya, distribusi serotipe berdasarkan status dan sindrom HIV);
dari analisis ini (Gambar S5). Namun, surveilans lanjutan diperlukan
dan (c) kesulitan dalam menafsirkan data serotipe yang hilang sebagai tidak
untuk memantau tren distribusi serotipe pasca pengenalan PCV untuk
diuji, atau diuji dan tidak dilaporkan, atau diuji dan dikelompokkan dalam
mengevaluasi dampak dan nilai vaksin spesifik dan strategi imunisasi.
''lainnya''. Analisis distribusi serotipe spesifik sindrom dikacaukan oleh usia
dan oleh karena itu tidak dilaporkan di sini tetapi analisis multivariabel
Sejumlah besar data serotipe yang tersedia untuk analisis ini
menggunakan kumpulan data besar dengan data tingkat kasus saat ini
mencerminkan peningkatan kesadaran dan dukungan untuk surveilans
sedang berlangsung dan diharapkan dapat memberikan wawasan lebih lanjut
pneumonia bakteri dan meningitis [20-24]. Selain perkiraan cakupan
tentang perbedaan distribusi serotipe berdasarkan usia, sindrom, dan status
serotipe vaksin, ini adalah laporan pertama, sepengetahuan kami,
HIV.
perkiraan global insiden dan kematian PD serotipe spesifik,
Beberapa fitur dari data serotipe membatasi kelayakan memungkinkan kami untuk memproyeksikan potensi dampak
metode statistik yang lebih canggih. Kami
kesehatan masyarakat dari formulasi PCV yang ada. Dengan kemajuan
mengabstraksikan dan menggunakan proporsi serotipe
dalam pengembangan vaksin dan mekanisme pembiayaan untuk
yang dilaporkan dalam setiap studi dalam analisis dan juga
pengadaan vaksin, perkiraan beban penyakit dan distribusi serotipe
dapat menganalisis transformasi logit dari proporsi
sangat penting untuk menginformasikan pengambilan keputusan untuk
tersebut, tetapi ini kemungkinan hanya akan berdampak
pengenalan vaksin dan untuk memantau dampak vaksin.
pada perkiraan untuk serotipe yang kurang lazim di mana
PD adalah penyakit utama yang dapat dicegah dengan vaksin di antara anak-anak
beberapa studi menyertakan jumlah isolat yang cukup
, 5 tahun usia secara global [25]. Sampai saat ini, negara-negara dengan insiden dan
untuk dapat memperkirakan proporsi IPD yang disebabkan
kematian PD yang tinggi belum memiliki akses ke vaksin pneumokokus yang
oleh serotipe yang kurang umum. Metode statistik
menyelamatkan jiwa. Pada bulan April 2009, Rwanda adalah negara pertama yang
multivariat komposisi seperti regresi logistik multinomial
memenuhi syarat untuk GAVI Alliance yang memperkenalkan PCV ke dalam
lebih disukai tetapi tidak layak karena banyaknya serotipe
imunisasi rutin anak. Negara-negara lain sedang mempertimbangkan atau
(yaitu, kategori) yang diperkirakan, karena serotipe yang
mempersiapkan analisis kebijakan produk PCV. Meskipun kami tidak memberikan
berbeda dilaporkan di seluruh penelitian, dan, karena sulit
perkiraan distribusi serotipe tingkat negara, perkiraan dampak vaksin spesifik
untuk menginterpretasikan data serotipe yang hilang
seperti yang disebutkan sebelumnya . Selain itu, negara dapat dibuat dengan menggunakan nomor beban PD tingkat negara yang
dikombinasikan dengan perkiraan serotipe regional yang disediakan di sini [2].
Penggunaan perkiraan prevalensi serotipe regional ini dalam perhitungan dampak
Karena kurangnya data insiden dan kematian serotipe spesifik yang
vaksin dan analisis efektivitas biaya sedang berlangsung dan akan memberikan
tersedia dalam literatur yang diterbitkan, perkiraan kami mengandalkan
perkiraan kepada pembuat kebijakan tingkat negara tentang dampak potensial dari
prevalensi serotipe di antara kasus IPD yang diperkirakan dari literatur
berbagai formulasi PCV, yang harus memberikan kontribusi substansial untuk
yang diterapkan pada perkiraan morbiditas dan mortalitas
proses pengambilan keputusan. Demikian juga produsen dapat bekerja dari satu set
pneumokokus yang ada. Perkiraan kejadian serotipe-spesifik
konsensus perkiraan cakupan serotipe untuk merencanakan dan merancang
mengasumsikan distribusi serotipe yang sama untuk penyakit
formulasi vaksin berbasis serotipe di masa depan yang menargetkan beban
bakteremia dan nonbakteremia (yaitu, IPD dan PD); dan mortalitas
penyakit pneumokokus terbesar. Kemajuan terbaru menuju peningkatan akses ke
spesifik serotipe mengasumsikan risiko kematian yang seragam untuk
PCV di negara-negara dengan beban tinggi akan berkontribusi untuk mencapai
setiap serotipe, yang mungkin tidak sepenuhnya benar, oleh karena itu
target Tujuan Pembangunan Milenium 4 tahun 2015 untuk mengurangi kematian
perkiraan morbiditas dan mortalitas spesifik serotipe mungkin sedikit
anak hingga dua pertiga [26].
berlebihan atau diremehkan untuk masing-masing serotipe.
Gambar 4. (A) Proporsi IPD, jumlah (B) kasus PD, dan (C) kematian pada anak ,5 tahun karena serotipe dalam formulasi PCV yang ada. Mengasumsikan proteksi
silang serotipe 6A/6B, secara global dan berdasarkan wilayah. Bilah kesalahan menunjukkan 95% CI (A) atau perkiraan ketidakpastian (B, C). Serotipe PCV7
meliputi: 4, 6B, 9V, 14, 18C, 19F, 23F. PCV10 menambahkan serotipe: 1, 5, dan 7F. PCV13 menambahkan serotipe: 3, 6A, dan 19A. doi:10.1371/
journal.pmed.1000348.g004
informasi pendukung
Gambar S1 Diagram alir identifikasi studi. Rincian studi yang dikecualikan
dapat ditemukan dalam teks. *Sumber data lain termasuk data yang tidak
dipublikasikan yang diterima dari peneliti yang dihubungi.
Ditemukan pada: doi:10.1371/journal.pmed.1000348.s1 (0,07
DOKTER)
Gambar S2 Proporsi IPD pada anak kecil karena
21 serotipe yang paling umum atau penting menurut wilayah.
(A) Afrika, (B) Asia, (C) Eropa, (D) LAC, (E) NA, (F) Oseania.
Bilah kesalahan menunjukkan 95% CI. Garis menunjukkan
proporsi kumulatif di seluruh serotipe [27].
Ditemukan di: doi:10.1371/journal.pmed.1000348.s2 (0,51 MB PDF)
Gambar S3 Jumlah serotipe yang dibutuhkan untuk 60%,
70%, dan 80% IPD pada anak kecil menurut wilayah.
Bilah kesalahan menunjukkan 95% CI. *Batas atas 95% CI adalah .21
serotipe.
Ditemukan di: doi:10.1371/journal.pmed.1000348.s3 (0,03 MB PDF)
Gambar S4 Peta jumlah isolat dari masing-masing negara
dengan data serotipe pneumokokus termasuk dalam
analisis. Daerah abu-abu adalah negara tanpa isolat
serotipe dalam analisis.
Ditemukan di: doi:10.1371/journal.pmed.1000348.s4 (0,05 MB PDF)
Gambar S5 Proporsi kumulatif IPD pada anak kecil karena 21
serotipe yang paling umum atau penting di setiap wilayah.
Proporsi kumulatif IPD termasuk (garis merah dengan
penanda persegi) dan tidak termasuk satu negara di kawasan
yang memberikan kontribusi jumlah isolat terbesar untuk
analisis (garis biru dengan penanda lingkaran) untuk (A) Afrika
dan (B) Asia.
Ditemukan di: doi:10.1371/journal.pmed.1000348.s5 (0,02 MB PDF)
Gambar S6 Proporsi IPD pada anak kecil akibat serotipe pada
PCV7 yang ada menurut wilayah. Mengasumsikan proteksi
silang serotipe 6A/B. Serotipe PCV7 meliputi: 4, 6B, 9V, 14,
28C, 19F, 23F. PCV10 menambahkan serotipe: 1, 5, dan 7F.
PCV13 menambahkan serotipe: 3, 6A, dan 19A.
Ditemukan di: doi:10.1371/journal.pmed.1000348.s6 (0,05 MB PDF)
Gambar S7 Proporsi IPD pada anak kecil akibat serotipe
pada PCV10 yang ada menurut wilayah. Mengasumsikan
proteksi silang serotipe 6A/B. Serotipe PCV10 meliputi: 4,
6B, 9V, 14, 28C, 19F, 23F, 1, 5, dan 7F.
Ditemukan di: doi:10.1371/journal.pmed.1000348.s7 (0,05 MB PDF)
Gambar S8 Proporsi IPD pada anak kecil akibat serotipe
pada PCV13 yang ada menurut wilayah. Serotipe PCV13
meliputi: 4, 6B, 9V, 14, 28C, 19F, 23F, 1, 5, 7F, 3, 6A, dan 19A.
Ditemukan di: doi:10.1371/journal.pmed.1000348.s8 (0,05 MB PDF)
Tabel S1 Strategi pencarian untuk mengidentifikasi potensi relevan
studi dalam literatur yang diterbitkan.
Ditemukan pada: doi:10.1371/journal.pmed.1000348.s9 (0,04
DOKTER)
Tabel S2 Langkah-langkah dalam pemilihan serotipe yang dimodelkan
berdasarkan analisis pendahuluan terbatas pada studi dengan semua isolat
serotipe. Langkah 1: Lakukan meta-analisis prevalensi serotipe untuk semua
90 serotipe di antara studi yang melaporkan data serotipe (yaitu, tidak
termasuk studi yang hanya melaporkan data serotipe). Langkah 2:
Bandingkan peringkat dan prevalensi relatif serotipe serotipe secara global
dan regional untuk mengidentifikasi serotipe yang paling umum (seperti yang
terlihat di bawah). N, serotipe yang tidak termasuk dalam vaksin
PS-23, serotipe yang termasuk dalam vaksin pneumokokus
polisakarida 23-valent; RelProp, proporsi relatif; ST, serotipe;
Y,
termasuk dalam vaksin pneumokokus polisakarida 23-valent.
Ditemukan di: doi:10.1371/journal.pmed.1000348.s10 (0,09 MB
DOC)
MB
Tabel S3 Karakteristik penelitian yang termasuk dalam analisis (n=
169). GAVI Alliance–negara yang memenuhi syarat ditunjukkan oleh
(G). Studi yang hanya melaporkan data serogrup ditunjukkan oleh
(X). Data yang tidak dipublikasikan ditunjukkan oleh PC (komunikasi
pribadi) dan data tambahan ({).
Ditemukan di: doi:10.1371/journal.pmed.1000348.s11 (0.34 MB
DOKTER)
Tabel S4 Perbandingan ICC untuk serotipe-
proporsi spesifik IPD di antara anak-anak kecil yang dilaporkan di
seluruh studi di setiap wilayah geografis. Hanya 20 serotipe paling
umum yang terjadi secara global yang disajikan. Nilai ICC yang
lebih tinggi menunjukkan tingkat korelasi yang lebih tinggi.
Serotipe yang tidak teramati di suatu wilayah ditunjukkan dengan
''-.'' Ditemukan di: doi:10.1371/journal.pmed.1000348.s12 (0,05 MB
DOC)
Tabel S5 Proporsi (%) IPD pada anak kecil menurut masing-
masing serotipe menurut wilayah. 95% CI [27].
Ditemukan di: doi:10.1371/journal.pmed.1000348.s13 (0.07 MB
DOC)
Tabel S6 Insiden regional penyakit pneumokokus (per 100.000) pada
anak-anak yang dikaitkan dengan masing-masing serotipe. Insiden
penyakit pneumokokus diperkirakan dengan menerapkan proporsi
kasus pneumonia yang disebabkan oleh SP yang diturunkan dari
perkiraan efikasi dari uji coba vaksin ke perkiraan spesifik negara WHO
dari semua kasus pneumonia penyebab kemudian dikalikan dengan
perkiraan negara populasi yang lebih muda dari 5 tahun (untuk rincian
lebih lanjut tentang perkiraan kejadian penyakit pneumokokus lihat [2]).
LB, batas bawah estimasi ketidakpastian; UB, batas atas estimasi
ketidakpastian; SSI, insiden spesifik serotipe (per
100.000 anak, usia 5 tahun).
Ditemukan di: doi:10.1371/journal.pmed.1000348.s14 (0.07 MB
DOC)
Tabel S7 Kasus penyakit pneumokokus pada anak kecil yang dikaitkan
dengan setiap serotipe berdasarkan wilayah. Kasus penyakit
pneumokokus diperkirakan dengan menerapkan proporsi kasus
pneumonia yang disebabkan oleh SP yang diturunkan dari perkiraan
kemanjuran dari uji coba vaksin ke perkiraan spesifik negara WHO dari
semua kasus pneumonia penyebab di antara anak-anak di bawah usia 5
tahun (untuk rincian lebih lanjut tentang kasus penyakit pneumokokus
perkiraan lihat [2]). LB, batas bawah estimasi ketidakpastian; UB, batas
atas estimasi ketidakpastian.
Ditemukan di: doi:10.1371/journal.pmed.1000348.s15 (0.08 MB
DOKTER)
Tabel S8 Kematian akibat penyakit pneumokokus (per 100.000)
pada anak kecil karena setiap serotipe secara global, dan berdasarkan
MB wilayah. Kematian penyakit pneumokokus diperkirakan dengan menerapkan
proporsi kasus pneumonia yang disebabkan oleh SP yang diturunkan dari
pneumokokus polisakarida 23-valent; Amerika Utara, Amerika
Utara;
perkiraan efikasi dari uji coba vaksin ke perkiraan spesifik negara WHO dari semua
penyebab kematian pneumonia kemudian dikalikan dengan perkiraan negara populasi
yang lebih muda dari 5 tahun (untuk rincian lebih lanjut tentang perkiraan kematian
penyakit pneumokokus lihat [2]). LB, batas bawah estimasi ketidakpastian; UB, batas atas
estimasi ketidakpastian; SSM, mortalitas spesifik serotipe (per
100.000 anak, usia 5 tahun).
Ditemukan di: doi:10.1371/journal.pmed.1000348.s16 (0.08 MB DOC)
Tabel S9 Kematian akibat penyakit pneumokokus pada anak kecil yang
dikaitkan dengan setiap serotipe berdasarkan wilayah. Kematian akibat
penyakit pneumokokus diperkirakan dengan menerapkan proporsi
pneumonia yang disebabkan oleh SP yang diturunkan dari perkiraan
kemanjuran dari uji coba vaksin ke perkiraan spesifik negara WHO dari semua
penyebab kematian pneumonia di antara anak-anak di bawah usia 5 tahun
(untuk rincian lebih lanjut tentang perkiraan kematian penyakit pneumokokus
lihat [2]). LB, batas bawah estimasi ketidakpastian; UB, batas atas estimasi
ketidakpastian.
Ditemukan di: doi:10.1371/journal.pmed.1000348.s17 (0.08 MB
DOKTER)
Tabel S10 Jumlah studi dalam analisis kami dengan
data serotipe dari usia anak $60 bln, menurut wilayah.
Ditemukan di: doi:10.1371/journal.pmed.1000348.s18 (0.03 MB
DOKTER)
Teks S1 Daftar periksa PRISMA.
Ditemukan di: doi:10.1371/journal.pmed.1000348.s19 (0,07 MB
DOC)
Ucapan Terima Kasih
Terutama, kami ingin mengucapkan terima kasih kepada banyak
kontributor proyek yang dengan murah hati menyediakan data untuk
analisis dan berbagi penelusuran dan ulasan literatur: Samir Saha, Steve
Luby, Abdullah Brooks, Aliya Naheed, Syams el-Arifeen, Maksuda Islam,
Hassan Al Emran ; Jan Verhaegen; Bradford D. Gessner dan Judith
Mueller atas nama Agence de Medecine Preventive, Paris, Prancis; Jean-
Louis Koeck, Lassana Sangare, Berthe-Marie Njanpop-Lafourcade,
Mathilde Lourd, Seydou Yaro; James Kellner atas nama CASPER-Calgary
Area S. Pneumoniae Epidemiology Research Group; Allison McGeer dan
Donald E. Low atas nama Jaringan Penyakit Bakteri Invasif Toronto;
Jesus M. Feris Iglesias, Jacqueline Sanchez, Hilma Coradin, Josefina
Fernandez; Erica Dueger, Edwin Asturias, Neal Halsey; Ron Dagan dan
Noga Givon-Lavi atas nama Grup Bakteremia dan Meningitis Israel;
Nahoko Chiba, Kimiko Ubukta, Keisuke Sunakawa; Anthony Scott, Brett
Lowe, Salim Mwarumba, Joyce Nyiro, Salome Njenga, Angela Karani, Eva
Wanjiru, Stella Ngugi, Daisy Mugo, Moses Ndiritu; Maranga Wamae dan
Sandra Mudhune atas nama grup netSPEAR; Ghassan Dbaibo, George
Araj, Omar Salam, Sahar Koubar; Guillermo Pimentel atas nama Global
Emerging Infections Surveillance and Response System (DOD-GEIS);
Souleymane Diallo, Uma Onwuchekwa, Mahamadou M. Keita, Mama N.
Doumbia, Myron M. Levine, Karen Kotloff, Milagritos D. Tapia, Samba O.
Sow; Anna Roca, L Morais, B. Sigaúque, L. Quintó, I. Mandomando, Mda.
G. Carvalho, B. Beall, A. Schuchat, M. Soriano-Gabarró, B. Flannery, PL
Alonso; Andrew J. Pollard, Neelam Adhiraki, Stephen Thorson, Dominic
Kelly, David Murdoch; AG Falade, RA Bakare, AA Odekanmi; Suleiman El-
Busaidy, Kevin Russell, dan kelompok lab di Pusat Penelitian Kesehatan
Angkatan Laut AS di San Diego, California; Anita KM Zaidi; Mark
Steinhoff, Kurien Thomas, Poorva Kulkarni atas nama grup SAPNA; Alina
Martynova; Anne von Gottberg atas nama Group for Enteric, Respiratory
and Meningeal Disease Surveillance (GERMS-Afrika Selatan);
Kementerian Kesehatan Masyarakat Thailand, Surang Dejsiri,
Leelawadee Sangsuk; Program Infeksi Emerging Internasional CDC AS -
Thailand, Sonja J. Olsen, Leonard Peruski, Possawat Jorakate, Anek
Kaewpan, Prasert Salika, Henry C. Baggett, Susan Maloney; Katherine L.
O'Brien, Mathuram Santosham, Robert Weatherholtz, Ray Reid; Nadjia
Ramdani; Vicki Krause, Heather Cook; Paul Roche, Lyn Gilbert, Denise
Murphy, Marion Easton;
Referensi
1. Organisasi Kesehatan Dunia (2008) Beban penyakit global: pembaruan 2004.
Jenewa: Organisasi Kesehatan Dunia.
2. O'Brien KL, Wolfson LJ, Watt JP, Henkle E, Deloria-Knoll M, dkk. (2009) Beban
global penyakit karenaStreptococcus pneumoniae pada anak kurang dari 5
tahun. Lancet 374: 893–902.
3. Hausdorff WP, Bryant J, Paradiso PR, Siber GR (2000) Serogrup pneumokokus mana yang
menyebabkan penyakit paling invasif: implikasi untuk formulasi dan penggunaan
vaksin konjugasi, bagian I. Clin Infect Dis 30: 100-121.
Universitas Melbourne, Departemen Layanan Kemanusiaan
Victoria, dan Departemen Kesehatan dan Penuaan
Persemakmuran; Eitan Berezin; Maria Cristina C. Brandileone, Luiza
Helena F. Carvalho, Marco Aurelio Safadi, Claudia Lopes; Cristiana
Maria Nascimento-Carvalho, Otávio Augusto Moreno-Carvalho,
Noraney Nunes Alves, Renilza Menezes Caldas, Maria Goreth
Barberino, Jussara Duarte, Maria Angélica Brandão, Maria Luiza
Guerra, José Luis Di Fabio; Orlando Mantese; Catherine Doit,
Edouard Bingen; Richard A. Adegbola, Philip Hill, Brian M.
Greenwood, Felicity Cutts; Benoit Garin; Mario Ramirez, J. Melo-
Cristino; Karl Ekdahl; Jonas Hedlund; Sener Bursin; Gary JA
Eltringham, John P. Leeming, David Spencer, Angel M. Kearns,
Katherine Eastham, Julia Clark; Robert George, Pauline Kaye, Liz
Miller; Matthew Moore, Tamara Pilishvili, Bernard Beall, Cynthia
Whitney atas nama kelompok Pengawasan Inti Bakteri Aktif CDC,
Thomas Adamkiewicz, Catherine Lexau, Lindsey Lesher; Maurice
Mufson, Ronald Stanek; Maria Hortal; William Hausdorff, Peter
Paradiso, Greg Yothers; Anushua Sinha, Jackson Wan, Dharmistha
Kaul; Rosalyn O'Loughlin, Maria Teresa Valenzuela, Elizabeth
Gomez, Fernando Pio de la Hoz; B. Nyambat, PE Kilgore, XY Wang,
SH Lee, M. Grandy, LY Chun, L. Jodar; Liudmyla Chernyshova, Anton
Luchitsky, Eileen Quinn, Elena Kononova, Halyna Romaniyk; dan
banyak orang yang berkontribusi pada pengumpulan data di lokasi
ini, laboratorium yang melakukan pengujian laboratorium, dan
sponsor penelitian dan pengawasan khusus lokasi. Kami juga
sangat berterima kasih kepada Komite Ahli Eksternal Proyek
Serotipe Global Pneumokokus (Steve Goodman, James Kellner,
Keith Klugman,
Akhirnya, kami ingin mengucapkan terima kasih kepada individu-individu
berikut atas dukungannya terhadap proyek: Thomas Cherian, Joachim
Hombach, Emily Henkle, Zunera Gilani, Cristina Merkhofer, Jim Korelitz, Kellar
Wilson, Bhumika Patel, Rebekah Zanditon, Jeannine Sachar, Maureen Stawick,
Wen- Chau Haung, David Chang, Johns Edmonds, Katie Hubbell, Bethany
Baer, Andrea Sutherland, Moussa Sarr, Karen Megazzini, Judith Chamberlin,
Brian Stout, Margot Krauss.
Perkiraan awal dari Gambar 1-3 dan S2 disajikan dalam format
lisan dan poster pada Simposium Internasional ke-6 tentang
Penyakit Pneumokokus dan Pneumokokus, 8-12 Juni 2008,
Reykjavik, Islandia (abstrak S01-O3 dan P1-034). Presentasi teknis
hasil awal dari Gambar 1–3, S2, dan S6 dipresentasikan kepada
Strategic Advisor Group of Experts (SAGE) di Organisasi Kesehatan
Dunia dan juga telah dibuat untuk tujuan pengambilan keputusan
kebijakan pada November 2007. Final perkiraan dari Gambar S2
dan Tabel S3, S4 disajikan dalam laporan sebagai bagian dari Profil
Produk Target Komitmen Pasar Lanjutan Pneumokokus yang
tersedia di: http://www. vaksinamc.org/files/TPP_Codebook.pdf.
Kontribusi Penulis
Kriteria ICMJE untuk kepengarangan dibaca dan dipenuhi: HLJ MDK OSL
SKS LFH RR LRM KLO. Setuju dengan hasil dan kesimpulan naskah: HLJ
MDK OSL SKS LFH RR LRM KLO. Merancang percobaan/penelitian: HLJ
MDK OSL LFH LRM KLO. Analisis data: OSL SKS LFH RR LRM. Data yang
dikumpulkan/melakukan eksperimen untuk penelitian: HLJ SKS LFH RR.
Menulis draft pertama makalah: HLJ. Berkontribusi dalam penulisan
makalah: HLJ MDK OSL SKS RR LRM KLO. Mengawasi pelaksanaan
proyek dan berpartisipasi dalam interpretasi temuan studi: HLJ.
Mengembangkan dan mengawasi desain, pelaksanaan, dan analisis
proyek dan menafsirkan temuan studi: MDK KLO. Berkontribusi untuk
mengedit makalah setelah ditulis: LFH.
4. Cherian T (2007) Konsultasi ahli WHO tentang komposisi serotipe vaksin konjugat
pneumokokus untuk digunakan di negara berkembang yang miskin sumber daya, 26–
27 Oktober 2006, Jenewa. Vaksin 25: 6557–6564.
5. Organisasi Kesehatan Dunia (2009) Tinjauan literatur global tentang Haemophilus
influenzae tipe b dan Streptococcus pneumoniae penyakit invasif di antara anak-anak
kurang dari lima tahun 1980-2005. Jenewa: Organisasi Kesehatan Dunia.
6. DerSimonian R, Laird N (1986) Meta-analisis dalam uji klinis. Uji
Klinis Terkendali 7: 177–188.
 7. Divisi Kependudukan PBB. Prospek Populasi Dunia: Laporan Analisis Revisi
2004. Tersedia: http://www.un.org/esa/population/publications/WPP2004/
WPP2004_Vol3_Final/Preface_TOC_ExpNotes.pdf. Diakses 19 Oktober
2009.
8. Fleiss JL (1986) Desain dan analisis eksperimen klinis. New York: Wiley.
9. Efron B, Tibshirani RJ (1993) Pengantar bootstrap. New York: Chapman &
Hall/CRC Press.
10. Whitney CG, Farley MM, Hadler J, Harrison LH, Bennett NM, dkk. (2003)
Penurunan penyakit pneumokokus invasif setelah pengenalan vaksin
konjugat proteinpolisakarida. N Engl J Med 348: 1737–1746.
11. Whitney CG, Pilishvili T, Farley MM, Schaffner W, Craig AS, dkk. (2006) Efektivitas
vaksin konjugasi pneumokokus tujuh valen terhadap penyakit pneumokokus
invasif: studi kasus-kontrol yang cocok. Lancet 368: 1495–1502.
12. Eskola J, Takala AK, Kilpi TM, Lankinen KS, Kayhty H (1998) Evaluasi klinis
vaksin pneumokokus baru: pendekatan Finlandia. Dev Biol Stand 95: 85–
92.
13. Park IH, Pritchard DG, Cartee R, Brandao A, Brandileone MC, dkk. (2007)
Penemuan serotipe kapsuler baru (6C) dalam serogrup 6 dariStreptokokus
pneumonia. J Clin Mikrobiol 45: 1225–1233.
14. Park IH, Park S, Hollingshead SK, Nahm MH (2007) Dasar genetik untuk serotipe
pneumokokus baru, 6C. Infeksi Imun 75: 4482–4489.
15.Dagan R (2009) Penggantian serotipe dalam perspektif. Vaksin 27 Suppl 3: C22–
C24.
16. Constenla DGE, Pio de la Hoz F, O'Loughlin R, Sinha A, Valencia JE, dkk.
(2009) Beban penyakit pneumokokus dan efektivitas biaya vaksin
pneumokokus di Amerika Latin dan Karibia: tinjauan bukti dan analisis
ekonomi awal. Washington (DC): Institut Vaksin Sabin.
17. Yaro S, Lourd M, Traore Y, Njanpop-Lafourcade BM, Sawadogo A, dkk.
(2006) Karakteristik epidemiologi dan molekuler dari epidemi meningitis
pneumokokus yang sangat mematikan di Burkina Faso. Clin Infect Dis 43: 693–
700.
18. Fenoll A, Granizo JJ, Aguilar L, Giménez MJ, Aragoneses-Fenoll L, dkk.
(2009) tren temporal serotipe Streptococcus pneumoniae invasif dan pola
resistensi antimikroba di Spanyol 1979-2007. J Clin Microbiol 47:
1012-1020.
19. Lagos R, Muñoz A, San Martin O, Maldonado A, Hormazabal JC, dkk. (2008)
Penyakit pneumokokus invasif pediatrik spesifik usia dan serotipe: wawasan
dari pengawasan sistematis di Santiago, Chili, 1994-2007. J Menginfeksi Dis
198: 1809–1817.
20. Knoll MD, Moisi JC, Muhib FB, Wonodi CB, Lee EH, dkk. (2009) Standarisasi
surveilans penyakit pneumokokus. Clin Infect Dis 48 Suppl 2: S37–S48.
21. Levine OS, Cherian T, Hajjeh R, Knoll MD (2009) Kemajuan dan tantangan masa
depan dalam pengawasan terkoordinasi dan deteksi penyakit pneumokokus
dan Hib di negara berkembang. Clin Infect Dis 48 Suppl 2: S33–S36.
22. Rodenburg GD, de Greeff SC, Jansen AG, de Melker HE, Schouls LM, dkk.
(2010) Efek vaksin konjugasi pneumokokus 2 tahun setelah diperkenalkan,
Belanda. Muncul Menginfeksi Dis 16: 816–823.
23. Imöhl M, Reinert RR, van der Linden M (2010) Variasi temporal antara serotipe
penyakit pneumokokus invasif pada anak-anak dan orang dewasa di Jerman
(1992-2008). Int J Mikrobiol 2010: 874189.
24. Winther TN, Kristensen TD, Kaltoft MS, Konradsen HB, Knudsen JD, dkk.
(2009) penyakit pneumokokus invasif pada anak-anak Denmark, 1996-2007,
sebelum pengenalan vaksin konjugat pneumokokus heptavalent. Acta Paediatr
98: 328–331.
25. Organisasi Kesehatan Dunia (2003) Vaksin pneumokokus. Epidemiol Mingguan
Rec 78: 97-120.
26. Sidang Umum Perserikatan Bangsa-Bangsa (2001), sesi ke-56. Peta jalan
menuju implementasi deklarasi milenium PBB: laporan Sekretaris
Jenderal New York. New York: PBB.
27. PneumoADIP (2008) Distribusi Serotipe Regional Pneumokokus untuk TPP
Pneumokokus. Tersedia: http://www.vaccineamc.org/files/TPP_Codebook. pdf.
Diakses 19 Oktober 2009.
Ringkasan Editor
Latar belakang Terlepas dari semua perhatian internasional pada
diidentifikasi di Asia. Para peneliti juga menemukan bahwa
Tujuan Pembangunan Milenium (MDG) 4—untuk mengurangi
tujuh serotipe (1, 5, 6A, 6B, 14, 19F, dan 23F) adalah yang
kematian pada anak di bawah 5 tahun hingga dua pertiga pada
paling umum secara global dan ketujuh serotipe ini
tahun 2015—pneumonia, sepsis, dan meningitis bersama-sama
menyumbang 58% -66% dari penyakit pneumokokus invasif
merupakan .25% dari 10 juta kematian yang terjadi setiap tahun
di setiap wilayah. Berdasarkan perkiraan insiden dan
pada anak-anak ,5 tahun. Streptococcus pneumoniae adalah bakteri
mortalitas penyakit pneumokokus invasif untuk tahun 2000
penyebab utama penyakit ini dan Organisasi Kesehatan Dunia
(sebelum vaksin konjugat pneumokokus diperkenalkan),
memperkirakan bahwa sekitar 800.000 anak meninggal setiap tahun
para peneliti menemukan bahwa serotipe ini mewakili
karena penyakit pneumokokus invasif. Tiga vaksin konjugat
. 300.000 kematian di Afrika dan 200.000 kematian di Asia.
pneumokokus saat ini tersedia dan melindungi terhadap serotipe
yang paling sering menyebabkan penyakit pneumokokus invasif
Apa Arti Temuan Ini? Studi ini menunjukkan bahwa sejumlah serotipe
pada anak kecil di Amerika Utara. Namun, beberapa negara dengan
yang terbatas menyebabkan penyakit pneumokokus paling invasif di
beban penyakit pneumokokus invasif tertinggi telah
seluruh dunia. Temuan ini bertentangan dengan anggapan
memperkenalkan vaksin ke dalam program imunisasi nasional
konvensional bahwa serotipe yang paling umum menyebabkan
mereka. Tidak hanya penting untuk memperkenalkan vaksin, tetapi
penyakit pneumokokus invasif sangat bervariasi di seluruh wilayah
juga menggunakan vaksin yang mencakup serotipe yang sesuai yang
geografis. Yang terpenting, temuan penelitian ini juga menunjukkan
lazim di wilayah yang rentan.
bahwa serotipe yang saat ini termasuk dalam formulasi konjugat
pneumokokus yang ada menyumbang 49%-74% kematian di Afrika
Mengapa Studi Ini Dilakukan? Selama beberapa tahun terakhir,
dan Asia di mana morbiditas dan mortalitas penyakit pneumokokus
data tentang serotipe di banyak negara dengan beban tinggi
adalah yang tertinggi dan di mana sebagian besar anak-anak tidak
telah tersedia. Penulis melakukan penelitian ini (tinjauan
memilikinya. akses ke vaksin konjugasi pneumokokus saat ini.
sistematis dan meta-analisis) untuk mengukur serotipe yang
Meskipun penulis tidak memberikan perkiraan tingkat negara
menyebabkan penyakit pneumokokus invasif pada anak-anak
distribusi serotipe, Perkiraan dampak vaksin spesifik negara dapat
berusia ,5 tahun untuk memperkirakan distribusi serotipe global
dibuat dengan menggunakan angka beban penyakit pneumokokus
dan regional dan beban penyakit spesifik serotipe. Informasi ini
tingkat negara yang dikombinasikan dengan perkiraan serotipe
kemudian dapat digunakan untuk memperkirakan potensi
regional yang disediakan dalam penelitian ini. Ini berarti bahwa
dampak kesehatan masyarakat dari formulasi vaksin konjugasi
pembuat kebijakan nasional dapat menilai dampak potensial dari
pneumokokus dan membantu menginformasikan pengambilan
serotipe yang termasuk dalam vaksin konjugasi yang berbeda, yang
keputusan untuk pengembangan vaksin pneumokokus dan
seharusnya berkontribusi pada proses pengambilan keputusan
pengenalan vaksin ke wilayah tertentu.
mereka. Selain itu, produsen sekarang dapat bekerja dari satu set
konsensus perkiraan cakupan serotipe untuk merencanakan dan
Apa yang Peneliti Lakukan dan Temukan? Menggunakan studi yang
merancang formulasi vaksin berbasis serotipe di masa depan untuk
dipublikasikan dan data yang tidak dipublikasikan yang disediakan
menargetkan beban penyakit pneumokokus.
oleh para peneliti, para peneliti secara sistematis meninjau studi
yang mencakup data tentang serotipe penyakit pneumokokus invasif
Informasi tambahan. Silakan mengakses situs Web ini
di antara anak-anak berusia ,5 tahun. Para peneliti kemudian
melalui versi online dari ringkasan ini di
menggunakan alat statistik untuk mengumpulkan proporsi spesifik
http://dx.doi.org/10. 1371/journal.pmed.1000348
serotipe dan menggabungkan informasi ini dengan
insiden penyakit pneumokokus dan perkiraan kematian untuk n Organisasi Kesehatan Dunia memberikan informasi tentang
menghitung beban global dan regional penyakit pneumokokus pneumokokus
serotipe-spesifik.
Para peneliti meninjau 1.292 studi dan memasukkan 169 studi
n PneumoACTION memberikan informasi tentang pneumo-
nia dan penyakit pneumokokus
yang sesuai dalam analisis mereka, yang mencakup informasi
tentang 60.090 isolat dari 70 negara. Para peneliti menghasilkan n Aliansi Global untuk Vaksinasi dan Imunisasi telah
perkiraan regional dari serotipe yang menyebabkan penyakit informasi tentang semua aspek vaksinasi dan imunisasi
pneumokokus invasif di antara anak di bawah lima tahun di n Pusat Pengendalian Penyakit AS memberikan informasi
berbagai wilayah: enam serotipe diidentifikasi sebagai penyebab tentang vaksinasi konjugasi pneumokokus
penyakit pneumokokus paling invasif di Amerika Utara; sembilan
serotipe diidentifikasi di Afrika; dan 11 serotipe adalah
n Koalisi Hari Pneumonia Kata memberikan informasi
tentang pneumonia
Hak Cipta PLoS Medicine adalah milik Perpustakaan Umum Ilmu Pengetahuan dan isinya tidak boleh disalin atau dikirim melalui

email ke beberapa situs atau diposting ke listserv tanpa izin tertulis dari pemegang hak cipta. Namun, pengguna dapat mencetak,

mengunduh, atau mengirim email artikel untuk penggunaan individu.