Jurnal HPT Volume 3 Nomor 3

Agustus 2015
ISSN: 2338-4336

EKSPLORASI BAKTERI PATOGEN PADA BEBERAPA SPESIES TANAMAN

KANTONG SEMAR (Nepenthes sp.)

Abdul Karim Fanani, Abdul Latief Abadi, Luqman Qurata Aini

Jurusan Hama dan Penyakit Tumbuhan, Fakultas Pertanian, Universitas Brawijaya

Jalan Veteran, Malang 65145

ABSTRACT
This research aims to determine the diseases on pitcher plant (Nepenthes) caused by
bacterial pathogens. This study included the observation and exploration of bacterial
disease on leaves, stems and roots of Nepenthes, isolation of bacterial pathogen from
diseased tissues, pathogenicity assay on host plant, hypersensitive response assay on
tobacco leaf, characterization of colony and cell morphology, and identification based
on biochemical and physiological characters. The result showed that wetbrown spots
symptom on leaves of N. mirabilis was caused by the Erwinia sp.. Yellow spots
symptoms on leaves of N. ampullaria and N. rafflessiana were caused by Xanthomonas
sp., while black rot symptoms on stems N. ampullaria and N. rafflessiana were caused
by Pseudomonas sp.
Keywords: exploration, identification, Nepenthes, pathogenic bacteria

ABSTRAK
Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui jenis-jenis bakteri patogen pada tanaman
kantong semar (Nepenthes sp.). Penelitian ini meliputi pengamatan gejala dan eksplorasi
penyakit pada daun, batang dan akar Nepenthes, isolasi bakteri patogen dari gejala, uji
patogenesitas pada tanaman inang, uji hipersensitif pada daun tembakau, karakterisasi
morfologi koloni dan morfologi sel, dan identifikasi secara biokimia dan fisiologi. Hasil
penelitian mennjukkan gejala bercak cokelat kebasahan pada daun N. mirabillis
disebabkan oleh Erwinia sp., gejala bintik kuning pada daun N. ampullaria dan N.
rafflessiana disebabkan oleh bakteri Xanthomonas sp., sedangkan gejala busuk hitam
pada batang N. ampullaria dan N. rafflessiana disebabkan oleh bakteri Pseudomonas
sp.
Kata kunci: bakteri patogen, eksplorasi, identifikasi, Nepenthes

PENDAHULUAN tanaman hias. Kepopuleran Nepenthes

saat ini sebagai tanaman hias yang unik
Satu diantara plasma nutfah yang semakin meningkat seiring dengan minat
banyak terdapat di Indonesia adalah masyarakat pecinta tanaman hias untuk
tanaman kantong semar (Nepenthes sp.) menangkarkannya (Akhriadi dan
(Mansur, 2006). Nepenthes merupakan Hernawati, 2006).
tanaman hias unik yang cukup diminati Permintaan yang meningkat
karena keindahan bentuk dan warna terhadap Nepenthes mengakibatkan
kantong pada ujung daun yang merupakan keberadaan tanaman ini semakin terancam
ciri khasnya (Isnaini, 2011). Kantong karena perusakan habitat dan pengambilan
tersebut berfungsi sebagai perangkap bagi oleh masyarakat langsung dari alam
beberapa jenis binatang kecil dan (Clarke, 2001). Oleh sebab itu, sebagai
serangga untuk dijadikan sebagai sumber salah satu tumbuhan dalam daftar
nutrisi (Kurniawan, 2013). Nepenthes tanamandilindungi Nepenthes perlu
memiliki potensi untuk dijadikan sebagai dilestarikan, diperbanyak, dipelajari dan

104
Jurnal HPT Volume 3 Nomor 3
dimanfaatkan secara berkelanjutan
(Isnaini, 2011). Selain teknik perbanyakan
yang relatif sulit, masalah budidaya yang
umum adalah munculnya hama dan
penyakit. Meskipun tidak terlalu banyak
hama dan penyakit yang menyerang
Nepenthes, namun pengendalian tetap
harus dilakukan (Purwanto, 2007). Hama
yang biasa menyerang Nepenthes antara
lain kutu putih, thrips, kutu sisik, dan
tungau. Sedangkan untuk penyakit yang
sering dijumpai yaitu bintik merah yang
disebabkan oleh jamur Cercospora dan
rebah batang oleh jamur Phytium
aphanidermatum (Handoyo dan
Sitanggang, 2006).
Penyakit yang banyak dijumpai
sebagian besar adalah yang disebabkan
oleh jamur, oleh karena itu penelitian ini
dilakukan untuk mengetahui jenis-jenis
penyakit yang disebabkan oleh bakteri
patogen agar upaya pelestarian Nepenthes
berjalan dengan baik.
METODE PELAKSANAAN
Waktu dan Tempat
Penelitian dilaksanakan pada bulan
Oktober sampai dengan bulan Desember
2014 di Laboratorium Bakteriologi,
Jurusan Hama dan Penyakit Tumbuhan
Fakultas Pertanian, Universitas Brawijaya,
Malang, Jawa Timur.
Eksplorasi dan Pengambilan Sampel
Eksplorasi ini bertujuan untuk
mendapatkan sampel bakteri patogen dari
beberapa spesies tanaman Nepenthes.
Sampel ditentukan secara acak didalam
Rumah Paranet Kebun Raya Bogor.
Tanaman yang ditentukan sebagai sampel
adalah tanaman yang tidak sehat atau
tanaman yang sedang terinfeksi patogen
tanaman. Spesies yang ditentukan sebagai
sampel adalah N. rafflessiana, N.
mirabillis, dan N. ampullaria.
105
Agustus 2015
Isolasi dan Pemurnian Bakteri
Isolasi dilakukan dari bagian daun,
batang, dan akar tanaman untuk
mendapatkan isolat murni bakteri patogen
pada bagian tersebut.
Uji Patogenisitas
Uji ini dilakukan untuk
membedakan bakteri patogen dan bakteri
saprofit. Suspensi bakteri 108 sel/ml yang
diduga patogen diinokulasikan pada
tanaman inang bakteri tersebut (Kerr,
1980). Bakteri patogen akan menimbulkan
gejala penyakit.
Uji Hipersensitif
Pengujian ini bertujuan untuk
mengetahui apakah isolat bakteri yang
ditemukan merupakan bakteri patogen
tanaman atau bukan. Suspensi bakteri 108
sel/ml diinfiltrasikan pada daun tembakau.
Gejala hipersensitif terlihat jika pada
bagian yang diinfiltrasi supensi bakteri
terjadi nekrosis dalam waktu 1–4 hari
(Klement, 1990).
Karakterisasi Morfologi
Pengamatan ini dilakukan untuk
mengetahui morfologi koloni bakteri agar
bisa diidentifikasi secara morfologi.
Pengamatan morfologi koloni meliputi
bentuk, ukuran, tepi, warna, dan
permukaan koloni. Bakteri yang diamati
ditumbuhkan pada media NA dan
berumur 48 jam.
Karakterisasi Fisiologi
Karakterisasi ini bertujuan untuk
menentukan genus isolat bakteri. Metode
yang digunakan berdasarkan Schaad et al.
(2001). Karakterisasi ini meliputi uji
Gram dengan kelarutan KOH 3% dan
pewarnaan Gram, uji Oksidatif-
Fermentatif, uji produksi pigmen
fluorescent dengan menggunakan media
King’s B, dan terakhir uji pertumbuhan
pada media Yeast Extract-Dextrose-
Carbonat (YDC).
 Fanani et al., Eksplorasi Bakteri Patogen Pada Beberapa…

1 2 3

4 5
Gambar 1. Gejala Penyakit pada bagian daun dan batang. 1) gejala pada daun N.
mirabilis, 2) gejala pada batang N. ampullaria, 3) gejala pada daun N.
ampullaria, 4) gejala pada batang N. rafflessiana, 5) gejala pada daun N.
rafflessiana.

HASIL DAN PEMBAHASAN batang, jika serangan parah batang

Deskripsi Gejala
Berdasarkan hasil uji patogenisitas
diperoleh lima gejala penyakit pada daun
dan batang N. mirabilis, N. ampullaria,
dan N. rafflessiana (Gambar 1).
1. Gejala pada daun N. mirabilis
Gejala penyakit yang menyerang
daun N. mirabilis ini mula-mula muncul
bercak warna cokelat, tepi berwarna
kuning, mudah sobek dan licin jika
digesek, dan akhirnya akan mati karena
menyebar ke seluruh helai daun. Penyakit
ini menular melalu percikan air dan
gesekan antar daun. Gejala ini hampir
sama dengan gejala penyakit yang
disebabkan oleh bakteri Erwinia sp. pada
anggrek bulan, seperti yang dikemukakan
oleh Handayati et al. (2008), bahwa gejala
bintik kecil berair dan berwarna cokelat
muncul pada daun serta dikelilingi warna
kuning.
2. Gejala pada batang N. ampullaria
Gejala penyakit bakteri yang
menyerang batang N. ampullaria ini
berupa bercak berwarna kehitaman pada
menjadi busuk hingga mengering, dan
akhirnya tanaman mati. Gejala yang
ditimbulkan pada N. ampularia ini hampir
sama dengan gejala yang diakibatkan oleh
bakteri Pseudomonas pada anggrek yaitu
gejala dapat muncul dimana saja terutama
pada daun, awalnya berwarna hijau kotor,
kemudian infeksi menyebar dan akhirnya
berwarna cokelat kehitaman dan
kemudian mengering (Bottom, 2010).
3. Gejala pada daun N. ampullaria
Gejala ini belum teridentifikasi
secara jelas. Berawal dengan munculnya
bintik kuning pada daun dan semakin
lama bintik kuning melebar tanpa batas
yang jelas. Perkembangan selanjutnya
adalah berubah menjadi cokelat basah dan
mengering. Penyakit ini mirip dengan
penyakit yang ditemukan oleh Lingga
(2007) pada daun Anthurium, daun yang
terinfeksi menguning yang berubah
menjadi bercak cokelat.
4. Gejala pada batang N. rafflessiana
Gejala penyakit ini hampir mirip
dengan gejala penyakit pada N.
ampullaria, yaitu batang berwarna cokelat

106
Jurnal HPT Volume 3 Nomor 3 Agustus 2015

hingga hitam. Serangan parah

mengakibatkan pucuk mati dan tidak bisa
tumbuh. Gejala yang mirip juga
dikemukakan oleh Iswanto (2002) yaitu
penyakit bercak cokelat pada anggrek
Cattleya sp. yang disebabkan oleh bakteri
Pseudomonas cattleyae pv. Savul.
Serangan bakteri ini ditandai dengan
terjadinya bercak lunak kebasahan,
kemudian berubah menjadi cokelat atau
hitam. Serangan bakteri ini dapat Gambar 2. Isolat bakteri yang telah
menyebabkan kematian tanaman. Penyakit dimurnikan pada media
ini dapat menular melalui percikan air. Nutrient Agar.
5. Gejala pada daun N. rafflessiana.
Penyakit ini bermula dengan bercak Hasil Uji Patogenisitas
kuning hingga jingga tua, kemudian Tujuan uji patogenisitas ini adalah
melebar hingga seluruh helai daun. untuk membuktikan bahwa isolat yang
Serangan berat mengakibatkan daun layu didapatkan bisa menimbulkan gejala yang
dan gugur. Gejala mirip dengan yang sama dengan gejala penyakit yang
ditemukan oleh Sudir et al. (2012) yaitu ditemukan sebelumnya. Dari 18 isolat
gejala kresek maupun hawar pada bakteri yang diujikan, hanya lima isolat
Anthurium dimulai dari tepi daun, yang menimbulkan gejala penyakit.
berwarna keabu-abuan dan lama-lama
daun menjadi kering.

Hasil Eksplorasi
Berdasarkan hasil eksplorasi yang
dilakukan pada bulan Agustus 2014,
ditemukan ada 12 gejala penyakit pada N.
mirabilis, N. ampularia, dan N.
rafflessiana. Masing-masing gejala
penyakit ditemukan pada batang dan daun
tanaman, tetapi tidak ditemukan gejala
penyakit pada bagian akar tanaman. Gambar 3. Inokulasi suspensi isolat
bakteri pada tanaman inang
Hasil Isolasi Dan Pemurnian yang sehat.
Hasil isolasi ditemukan 18 isolat
bakteri pada bagian daun, batang dan akar.
Hasil Uji Hipersensitif
Isolat bakteri dimurnikan pada media NA Reaksi hipersensitif adalah respon
yang baru dengan metode cawan gores ketahanan tanaman untuk melokalisasi
(streak method). Dengan menggunakan bakteri sehingga tanaman dapat mengatasi
metode ini didapatkan koloni tunggal dari serangan berbagai jenis bakteri yang
isolat bakteri yang didapatkan. berpotensi menyebabkan penyakit
(Schaad et al., 2001).

107
 Fanani et al., Eksplorasi Bakteri Patogen Pada Beberapa…

ini menunjukkan bahwa kelima isolat

diduga merupakan bakteri patogen
tanaman.

Hasil Karakterisasi
1. Karakterisasi morfologi
Pengamatan karakteristik morfologi
koloni maupun sel bakteri bertujuan untuk
mengetahui karakter dan ciri bakteri yang
didapatkan untuk keperluan identifikasi
bakteri. Pengamatan morfologi sel
Gambar 4. Reaksi hipersensitif
meliputi bentuk sel bakteri ketika diamati
ditunjukkan dengan gejala
di bawah mikroskop. Sedangkan
nekrosis di bagian infiltrasi
pengamatan morfologi koloni meliputi
bakteri pada daun tembakau.
bentuk, ukuran, tepi, warna, dan
permukaan.
Kelima isolat yang diujikan
menunjukkan gejala nekrosis dalam waktu
48 jam setelah inokulasi (Gambar 4). Hal

Tabel 1. Karakteristik Morfologi Koloni dan Sel Bakteri

Morfologi koloni
Bentuk
Isolat Ukuran
bakteri Bentuk Tepi Warna Permukaan
(cm)
MD Batang Bulat Rata Putih susu Cembung 0,2
A1B Batang Bulat Rata Putih susu Cembung 0,1
A2D Batang Bulat Rata Putih kekuningan Cembung 0,4
R1B Batang Bulat Rata Putih susu Cembung 0,1
R3D Batang Bulat Rata Putih krem Cembung 0,3
Keterangan: Kode isolat MD (mirabilis daun), AD (ampullaria daun), AB (ampullaria
batang), RD (rafflessiana daun), dan RB (rafflessiana batang).

Sebagian besar koloni bakteri yang
tumbuh memiliki ciri-ciri yang hampir
sama, seperti tepi koloni rata atau halus,
bentuk koloni bulat, warna koloni putih
sedikit kekuningan maupun agak krem,
serta permukaan koloni yang cembung.
Ketika diamati di bawah mikroskop
dengan perbesaran 100x, bakteri
berbentuk batang (basil). Isolat A2D dan
R3D memiliki kemiripan warna koloni
dan ukuran koloni yaitu berwarna kuning
pucat dan berukuran 0,3 cm. Sama halnya
dengan isolat A1B dan R1B yang
berwarna putih susu dan berukuran 0,1 cm
(Tabel 1).
2. Karakterisasi fisiologi dan biokimia
Karakterisasi fisiologi dan biokimia
bertujuan untuk dasar identifikasi bakteri
hingga tingkat genus. Brenner et al.
(2005) mengatakan bahwa bakteri
memiliki berbagai aktivitas biokimia
untuk pertumbuhan dan perbanyakan
dengan menggunakan nutrisi yang
diperoleh dari lingkungan sekitarnya.

108
Jurnal HPT Volume 3 Nomor 3 Agustus 2015

Tabel 2. Karakteristik Fisiologi dan Biokimia

Isolat
Uji fisiologi dan biokimia
MD A1B A1D R1B R3D
KOH 3% - - - - -
Uji Gram
Pewarnaan Gram - - - - -
Pertumbuhan anaerob (OF) + - - - -
Produksi Pigmen Fluorescent - + - + -
Pertumbuhan pada YDC - T + T +
Pertumbuhan pada suhu 33oC T T + T +
Keterangan: simbol negatif (-) adalah tidak dapat tumbuh, positif (+) adalah dapat
tumbuh, dan T adalah tidak dilakukan pengujian.

Kelima isolat bakteri yang Agrios (2005) mengemukakan bahwa

dikarakterisasi berdasarkan Schaad et al.
(2001) terdapat perbedaan pada hasil
pengujian yang dilakukan (Tabel 2). Isolat
MD merupakan bakteri Gram negatif,
bersifat fermentatif, tidak memproduksi
pigmen fluorescent, dan berwarna putih
pada media YDC. Hasil pengujian
tersebut menunjukkan isolat MD termasuk
genus Erwinia sp.
Isolat A1B dan R1B merupakan
bakteri Gram negatif, bersifat oksidatif,
dan memproduksi pigmen fluorescent.
Hasil tersebut menunjukkan kedua isolat
tersebut termasuk genus Pseudomonas.
Sedangkan isolat A1D dan R3D
merupakan bakteri Gram negatif, bersifat
oksidatif, tidak memproduksi pigmen
fluorescent, berwarna kuning pada media
YDC dan dapat tumbuh pada suhu 33oC.
Hasil pengujian tersebut menunjukkan
kedua isolat tersebut termasuk genus
Xanthomonas.
Pembahasan Umum
Bakteri Erwinia yang menyerang
daun N. mirabilis menyebabkan penyakit
bercak cokelat kebasahan. Berawal
dengan bercak berwarna cokelat, mudah
sobek dan licin jika digesek, dan akhirnya
mati karena menyebar ke seluruh helai
daun (Gambar 1). Bakteri berbentuk
batang ini merupakan golongan bakteri
Gram negatif, tumbuh secara fermentatif
pada media glukosa (anaerobik fakultatif),
dan berwarna putih pada media YDC.
bakteri Erwinia merupakan bakteri Gram
negatif, berbentuk batang lurus, berukuran
0,5-1,0 x 1,0-3,0 μm.
Bakteri Pseudomonas yang
menyerang batang N. ampullaria dan N.
rafflessiana menimbulkan gejala berwarna
kehitaman pada batang, jika serangan
parah batang menjadi busuk hingga
mengering, akhirnya tanaman mati
(Gambar 1). Bakteri ini termasuk bakteri
Gram negatif, hanya tumbuh pada
keadaan aerob, dan mampu memproduksi
pigmen fluorescent. Menurut Abadi
(2003) Pseudomonas merupakan bakteri
Gram negatif, berbentuk seperti tongkat
lurus atau melengkung, berukuran 0,5-1 x
1,5-4 μ. Beberapa jenis Pseudomonas
penyebab penyakit pada tumbuhan
(seperti P. syringae) disebut sebagai
Pseudomonas flourescent karena pada
medium yang mengandung besi rendah
bakteri ini membentuk pigmen fluoresent
yang berwarna kuning kehijau-hijauan
yang terdifusikan dalam medium.
Gejala penyakit yang menyerang
daun N. ampullaria dan N. rafflessiana
pada serangan awal yang ditimbulkan
berupa bintik kuning yang menggerombol,
kemudian bersatu dan menyebar keseluruh
permukaan daun (Gambar 1). Penyakit ini
disebabkan oleh bakteri dari genus
Xanthomonas. Bakteri ini merupakan
Gram negatif, koloni berwarna kuning
pada media YDC, serta dapat tumbuh
pada suhu 33oC. Hasil ini sesuai dengan

109
 Fanani et al., Eksplorasi Bakteri Patogen Pada Beberapa…
pendapat Abadi (2003) bahwa bakteri
Xanthomonas termasuk bakteri Gram
negatif, berbentuk seperti tongkat yang
lurus, berukuran 0,4-1 x 1,5-4 μ.
Pertumbuhan pada medium agar selalu
berwarna kuning.
KESIMPULAN
Ditemukan lima isolat bakteri
patogen yang menyebabkan penyakit pada
tanaman kantong semar. Identifikasi
morfologi, biokimia dan fisiologi yang
dilakukan didapatkan tiga genus bakteri
yaitu genus Erwinia pada daun N.
mirabilis, genus Pseudomonas pada
batang N. ampularia dan N. rafflessiana,
dan genus Xanthomonas pada daun N.
ampularia dan N. rafflessiana.
DAFTAR PUSTAKA
Abadi, A. L. 2003. Ilmu Penyakit
Tumbuhan: Dasar-dasar dan
Penerapannya. Bayumedia.
Malang.
Agrios, G. N. 2005. Plant Pathology 5th
Edition. Departemen of Plant
Pathology. University of Florida.
USA
Akhriadi, P dan Hernawati, 2006. A Field
Guide to The Nepenthes Of
Sumatera. Published by PILI-
NGO Movement and Nepenthes
Team.
Bottom, S. 2010. Orchid Pests and
Deseases. __. __.
Brenner, D. J. Krieg, N. R. dan Staley , J.
T. 2005. Bergey's Manual of
Systematic Bacteriology 2nd
edition. volume 2. Springer. New
York.
Clarke, C. 2001. Nepenthes of Sumatra
and Peninsular Malaysia. Natural
History Publications (Borneo),
Kota Kinabalu: 326 hlm.
Handayati, W., Rahardjo, I. B. dan
Kartikaningrum, S. 2008. Pra-
110
Evaluasi Ketahanan Anggrek
Phalaenopsis Terhadap Penyakit
Busuk Lunak (Erwinia sp.).
BALITHI. Cipanas.
Handoyo, F., dan Sitanggang, M.. 2006.
Petunjuk Praktis Perawatan
Nepenthes. AgroMedia. Jakarta.
Isnaini, Y. 2011. Penelitian Dan
Pengembangan Tanaman Hias
Unik Kantong Semar
(Nepenthesspp.) Secara In Vitro Di
Kebun Raya Bogor. Makalah
Seminar Nasional Perhorti. Kebun
Raya Bogor-LIPI. Bogor.
Iswanto, H. 2002. Petunjuk Perawatan
Anggrek. AgroMedia. Jakarta.
Kerr, A. 1980. Bacteria and Mycoplasmas
as Plant Parasites. In J. F. Brown,
A Course Manual in Plant
Protection (pp. 133-134). Vice-
chancellors' committee. Brisbane:
Australian.
Klement, Z., Rudolph, K., dan Sand, D. C.
1990. Methods in
Phytobacteriology. Academia
Kiado. Budapest.
Lingga, L. 2007. Anthurium. Gramedia
Pustaka Utama. Jakarta
Mansur, M. 2006. Nepenthe: Kantong
Semar yang Unik. Penebar
Swadaya. Jakarta.
Purwanto, A. W. 2007. Budidaya Ex-Situ
Nepenthes, Kantong semar nan
eksotis. Kanisius. Yogyakarta.
Schaad, N. W., Jones, J. B. and Chun. W.
2001. Plant Pathogenic Bacteria,
Third Edition. St. Paul, Minnesota:
The American Phytopathological
Society.
Sudir, N. B. dan Kadir, T.S.2012.
Epidemiologi, Patotipe, dan
Strategi Pengendalian Penyakit
Hawar Daun Bakteri pada
Tanaman Padi. Balai Besar
Penelitian Tanaman Padi. Iptek
Tanaman Pangan 7 (2) : 79-87.