com
BBA - Bioenergi
beranda jurnal: www.elsevier.com/locate/bbabio
Kata kunci: Dalam sel hidup, pertumbuhan adalah hasil penggabungan antara katabolisme substrat dan berbagai proses metabolisme
Mitokondria yang terjadi selama proses pembentukan dan pemeliharaan biomassa bersih. Selama pertumbuhan, baik ATP/ADP maupun
Termodinamika NADH/NAD+ molekul memainkan peran kunci. Metabolisme energi sel karenanya mengacu pada jalur metabolisme yang
metabolisme energi sel
terlibat dalam sintesis ATP yang terkait dengan pergantian NADH. Dengan demikian, dua jalur utama terlibat dalam
kinetika
metabolisme energi sel: glikolisis/fermentasi dan fosforilasi oksidatif. Glikolisis dan fosforilasi oksidatif mitokondria terjalin
Efek pohon kepiting
melalui batasan termodinamika dan kinetik yang ditinjau di sini. Selanjutnya, pengetahuan kita saat ini tentang regulasi
Efek Warburg
Pemodelan metabolisme
metabolisme energi sel jangka pendek dan jangka panjang akan ditinjau menggunakan contoh-contoh seperti Crabtree dan
efek Warburg.
1. Pendahuluan: metabolisme energi sel, definisi energi sintesis ATP) dengan potensial elektrokimia proton melintasi
membran sebagai perantara. Rantai respirasi didefinisikan sebagai
Dalam sel hidup, pertumbuhan adalah hasil penggabungan antara kumpulan kompleks (I, II, III, dan IV), beberapa di antaranya (I, III & IV)
katabolisme substrat dan berbagai proses metabolisme yang terjadi selama menggabungkan reaksi redoks dengan ekstrusi proton. Kompleks semacam
pembentukan biomassa bersih dan proses pemeliharaan (yaitu itu disebut situs kopling dan menghasilkan potensial elektrokimia proton.
pemeliharaan gradien ionik, protein, lipid, dan pergantian asam nukleat). ragiSaccharomyces cerevisiae mitokondria sedikit aneh karena mereka tidak
Selama pertumbuhan, baik ATP/ADP maupun NADH/NAD+ molekul menunjukkan kompleks I tetapi memiliki sejumlah dehidrogenase eksternal
memainkan peran kunci (Skema 1). Jalur anabolik yang diperlukan untuk dan internal di membran mitokondria bagian dalam yang memberikan
biosintesis akan mengkonsumsi ATP dan menghasilkan NADH. Jalur elektron mereka melalui kolam kuinon ke kompleks III. Oksidasi substrat
katabolik, seperti fosforilasi oksidatif mitokondria akan menghasilkan ATP menyebabkan transfer elektron melalui rantai pernapasan, dengan akseptor
dari ADP + Pi dan mengoksidasi NADH di NAD+. Akibatnya, baik ATP dan NAD elektron terminal menjadi oksigen. Fluks pernapasan dengan demikian
+ adalah molekul pusat untuk memungkinkan pertumbuhan yang akan mencerminkan fluks oksidasi substrat. Gaya gerak proton dikonsumsi oleh
tergantung pada ketersediaan masing-masing. Metabolisme energi sel sistem fosforilasi (ATPsintase, pembawa ATP/ADP dan Pi/H+ pembawa) yang
karenanya mengacu pada jalur metabolisme yang terlibat dalam sintesis mengarah pada produksi ATP.
ATP yang terkait dengan pergantian NADH. Sintesis ATP terjadi baik melalui
fosforilasi tingkat substrat (glikolisis dan siklus Krebs,Skema 2) atau melalui 2. Hubungan jangka pendek antara dua jalur energik: glikolisis dan
fosforilasi oksidatif (Skema 3). NADH dapat dioksidasi baik oleh fermentasi mitokondria
(laktat dehidrogenase pada mamalia, alkohol dehidrogenase dalam ragi)
atau oleh rantai pernapasan yang terlokalisasi di membran dalam 2.1. Kontrol termodinamika
mitokondria (kompleks I pada mamalia, dehidrogenase NADH dalam dan
luar dalam ragi). Glikolisis adalah jalur sitosol yang mengkatabolisme Glikolisis dan fosforilasi oksidatif mitokondria saling terkait melalui
glukosa menjadi piruvat dan menghasilkan 2 ATP per glukosa yang batasan termodinamika dan kinetik. Dari sudut pandang
dikatabolisme. Fosforilasi oksidatif mitokondria terletak di membran dalam termodinamika, dua gaya terlibat dalam kedua jalur: G . sitosolredoks
mitokondria, yang mengandung semua protein yang terlibat dalam proses (NADH/NAD+) dan G . sitosolP (ATP)/ (ADP.Pi). Dalam glikolisis, kontrol
ini yaitu transformasi energi redoks menjadi potensial fosfat (yaitu termodinamika ini terletak pada tingkat
Singkatan: ATP, Adenosin trifosfat; Gp, potensial fosfat; Gredoks, potensial redoks; HAI2, oksigen; ANT, translocator nukleotida adenin
kan Penulis koresponden di: IBGC du CNRS, Laboratorium Bioenergi dan Metabolisme Sel, 1 rue Camille Saint Saëns, 33077 Bordeaux cedex, Prancis.
https://doi.org/10.1016/j.bbabio.2020.148276
Diterima 4 Mei 2020; Diterima dalam bentuk revisi 7 Juli 2020; Diterima 8 Juli 2020
Tersedia online 24 Juli 2020
0005-2728/ © 2020 Elsevier BV Hak cipta dilindungi undang-undang.
M. Rigoulet, dkk. BBA - Bioenergi 1861 (2020) 148276
2
M. Rigoulet, dkk. BBA - Bioenergi 1861 (2020) 148276
Skema 2. Glikolisis dan Siklus Krebs. Sintesis ATP dapat terjadi melalui fosforilasi tingkat substrat di jalur ini.
2.3.2. Organisasi supramolekul dari rantai pernapasan tidak stabil dan ini dikaitkan dengan kekurangan energi [33,34]. Apakah
Telah ditunjukkan bahwa kompleks mitokondria dikaitkan ke dalam kekurangan energi berasal dari destabilisasi super kompleks sulit untuk
ansambel supramolekul di seluruh rentang organisme.22–24]. Seperti disimpulkan karena kardiolipin telah terbukti diperlukan untuk
dijelaskan di atas, keuntungan fungsional umum superkompleks beberapa aktivitas kompleks rantai pernapasan mitokondria.
dibandingkan dengan kompleks terpisah adalah peningkatan katalitik, Cara lain untuk melihat ansambel ini adalah bahwa dalam
penyaluran substrat, sekuestrasi intermediet reaktif, dan stabilisasi fosforilasi oksidatif, asosiasi protein-protein tidak hanya melibatkan
struktural satu kompleks spesifik dengan pembentukan superkompleks. kompleks pernapasan (respirasomes) tetapi mencakup protein yang
Pada mitokondria yang diisolasi dari ragiS. cerevisiae, studi struktural telah mengambil bagian dari membran internal, mengoptimalkan
menunjukkan bahwa pembentukan superkompleks rantai pernapasan ragi pembentukan pH delta dan akibatnya fosforilasi ADP serta nukleotida.
(yaitu asosiasi kompleks III dan IV) tergantung pada kondisi pertumbuhan [ transpor dan gradien ion dalam ruang terpencil [35,36]. Dalam
22]. Namun, hingga hari ini, keuntungan sebenarnya dari superkompleks makalah yang disebutkan, peran terkenal dari dimer ATPsintase
tetap ambigu. Informasi struktural dan biofisik tidak mendukung bersama dengan protein pembentuk krista lainnya diselidiki dalam hal
peningkatan katalisis dengan menyalurkan substrat [25]. Selain itu, fungsi fosforilasi oksidatif (sintesis ATP, transfer elektron, produksi
informasi struktural untuk superkompleks ini telah ditafsirkan baik untuk ROS, potensi elektrokimia proton membran lokal…). Karena banyak
mendukung [26,27] atau dalam pemberhentian [28,29]. Destabilisasi hubungan telah dilaporkan untuk morfologi krista dan keadaan
kompleks ini telah ditunjukkan dalam mutan ragi yang dihapus untuk metabolik, fisiologis, atau patologis, dianggap perlu untuk
sintase kardiolipid, menunjukkan bahwa kardiolipid diperlukan untuk mengintegrasikan aspek fisiologi mitokondria ini dengan studi
organisasi supramolekul rantai pernapasan.30–32]. Studi kami tentang bioenergi mitokondria.
mutan semacam itu telah menunjukkan bahwa dengan tidak adanya
organisasi supramolekul yang terdeteksi dari rantai pernapasan, fluks
2.3.3. Penyaluran ATP di jantung (Skema 5)
pernapasan yang dinilai untuk setiap substrat atau kombinasi substrat
Mitokondria dalam sel otot jantung sangat terorganisir mengikuti
serupa untuk tipe liar dan mitokondria yang kekurangan kardiolipin. [21].
pola "seperti kristal".37,38]. Dalam sel otot ini, setiap sarkomer yang
Akibatnya, tampaknya tidak ada keuntungan kinetik ketika rantai
mengkonsumsi ATP memiliki mitokondria yang mensintesis ATP dan
pernapasan mitokondria diatur dalam superkompleks. Di sisi lain, telah
bersama dengan sistem phosphotransfer - isoform kreatin kinase yang
ditunjukkan bahwa pada Pasien Sindrom Barth, superkompleks mitokondria
terkotak-kotak - dan sinyal metabolisme umpan balik, menciptakan unit
sangat kuat
energi intraseluler.39]. Ketika nukleotida adenin
3
M. Rigoulet, dkk. BBA - Bioenergi 1861 (2020) 148276
Skema 3. Fosforilasi oksidatif dalam ragi (A) dan mamalia (B). Sistem OXPHOS dapat digambarkan sebagai dua entitas fungsional: Rantai pernapasan (RC) dan sistem
fosforilasi. RC disusun oleh holoenzim sebagai NADH dehidrogenase (kompleks I; Nde&Ndi dalam ragi), suksinat dehidrogenase (kompleks II), sitokrom-C reduktase
(kompleks III), dan sitokrom-C oksidase (kompleks IV). Ada juga dehidrogenase lain seperti gliserol-3-fosfat dehidrogenase (G3PDH) yang dapat dihubungkan ke RC. RC
juga disusun oleh pembawa elektron bergerak sebagai koenzim Q dan sitokrom-C. RC secara fungsional digabungkan ke sistem fosforilasi yang disusun oleh ATP sintase,
transporter nukleotida adenin (ANT), dan pembawa anorganik fosfat (PiC). Struktur PDB berikut digunakan untuk gambar ini: (A) Ndi: PDB:4G9K dari S. cerevisiae; Nde1/2:
PDB:4G6H (NDH dengan NADH dari S. cerevisiae); Kompleks II: PDB:1ORZ dari S.cerevisiae; Gut2p: PDB:3PYM dari S. cerevisiae; Kompleks III: PDB:1KB9 dari S. cerevisiae
Kompleks IV: PDB: 1V54 dari Bos Taurus; Cyt c: PDB:1CRH dari S.cerevisiae; L-LDH: PDB:1LDC dari S. cerevisiae; ATP sintase: PDB:6O7V dari S. cerevisiae; SEMUT: PDB:4C9G
dari S. cerevisiae (B) Kompleks I, III dan IV: PDB: 5GPNdari Bos Taurus (respirasome); Kompleks II: PDB:3SFD dari Sus scrofa; ATPsintase:PDB:5FIL dari Bos Taurus; Cyt c:
PDB:2B4Z dari Bos Taurus; SEMUT: PDB:1OKCdari Bos Taurus; Gliserol-3-fosfat Dehidrogenase: PDB:2QCU dari Escherichia coli.
difusi dibatasi (channeling), energi potensial fosforilasi dikeluarkan dari asosiasi enzim dengan elemen sitoskeleton dijelaskan [41]. Enzim
mitokondria jantung oleh phosphocreatine yang dihasilkan oleh glikolitik yang berinteraksi dengan elemen sitoskeletal telah terbukti
mitokondria creatine kinase (MtCK) dari mitokondria ATP dan creatine ( menjadi aldolase dan fosfofruktokinase, yang distabilkan oleh
Skema 5). Peran superkompleks fungsional dan struktural ini adalah mikrotubulus, mengoptimalkan aktivitas gabungannya.42]. Selain itu,
untuk meningkatkan efisiensi sintesis ATP oksidatif dan hidrolisis ATP dalam Sel Ovarium Hamster Cina (CHO), gliseraldehida-3-fosfat
perifer. Struktur ini mewakili jenis organisasi supramolekul yang dehidrogenase dan laktat dehidrogenase berpartisipasi dalam
beroperasi jauh dari keseimbangan. metabolisme glikolitik yang terikat pada aktin.43]. Bukti meyakinkan
mengenai penyaluran jalur glikolitik diperoleh dengan menambahkan
glukosa radioaktif ke sel dan menunjukkan bahwa dalam sel
permeabilisasi, tidak ada pengenceran glukosa ini dari substrat
2.3.4. Penyaluran glikolisis endogen.44]. Selain itu, proses penyaluran ini telah terbukti dinamis
Keberadaan "tim enzim glikolitik" yang terikat pada membran dalam ragi di mana penarikan sumber karbon menghasilkan pelepasan
dalam eritrosit dan ragi telah diusulkan beberapa waktu lalu [40]. Ini enzim glikolitik dari sitoskeleton dan dalam reorganisasi aktin.45].
kemudian dikonfirmasi di otot rangka di mana glikolitik
4
M. Rigoulet, dkk. BBA - Bioenergi 1861 (2020) 148276
Skema 4. Pesawat ulang-alik malat-aspartat. Antar-jemput malat-aspartat memungkinkan translokasi ekuivalen pereduksi melintasi membran dalam mitokondria.
Pesawat ulang-alik ini diperlukan karena membran dalam mitokondria tidak permeabel terhadap NADH. Pesawat ulang-alik terdiri dari empat enzim: malat dehidrogenase
dalam matriks mitokondria dan sitosol, aspartat aminotransferase dalam matriks mitokondria dan sitosol, antiporter malat-alfa-ketoglutarat di membran dalam,
antiporter glutamat-aspartat di membran dalam.
3. Regulasi metabolisme mitokondria jangka panjang diferensiasi sel, dan dalam berbagai situasi fisio-patologis [54–63].
Namun, untuk menguraikan asal dan mekanisme molekuler yang
Ada dua cara, non-eksklusif, untuk mengatur fosforilasi oksidatif terlibat dalam proses ini, diperlukan evaluasi yang kuat dan definisi
mitokondria di dalam sel. Ini dapat diatur secara kinetik, memungkinkan konten dan aktivitas mitokondria dalam sel. Pertanyaan yang diajukan
peningkatan atau penurunan fluks sintesis ATP sebagai respons terhadap di sini adalah bagaimana cara terbaik mendefinisikan konten
modulasi permintaan ATP. Ini juga dapat diatur dengan menambah atau mitokondria dalam sel. Sejumlah parameter dapat dinilai seperti jumlah
mengurangi «jumlah» mitokondria di dalam sel (dengan ini didefinisikan mereka, ukuran mereka, volume mereka, jumlah sitokrom mitokondria,
sebagai jumlah unit rantai pernapasan mitokondria). Memang, untuk fluks jumlah DNA mitokondria, jumlah lipid, protein atau aktivitas enzimatik.
konstan melalui rantai pernapasan, menggandakan jumlah rantai Di sini kami akan meninjau secara singkat berbagai parameter yang
pernapasan per sel akan menggandakan fluks per sel. Kedua proses telah dinilai serta kelebihan dan kekurangannya.
dibuktikan dalam sel-sel yang berproliferasi. Dalam sel glioma C6, Seperti yang dinyatakan di atas, ketika dibiakkan dengan glukosa, ragi
penurunan aktivitas fosforilasi oksidatif telah ditunjukkan ketika sel Saccharomyces cerevisiae menunjukkan kandungan mitokondria yang rendah
mencapai pertemuan. Hal ini disebabkan oleh penurunan aktivitas spesifik sebelum pergeseran diauxic sedangkan konten ini meningkat pesat selama dan
kompleks I melalui fosforilasi salah satu subunitnya,46]. Dalam ragi setelah pergeseran ini. Studi awal dari Yotsuyanagi et al telah menunjukkan
Saccharomyces cerevisiae tumbuh pada substrat yang tidak dapat dengan mikroskop elektronik bahwa sebelum pergeseran diauxic, ragi
difermentasi, hasil pertumbuhan konstan berkat hubungan yang ketat dan Saccharomyces cerevisiae menunjukkan sangat sedikit mitokondria. Setelah
linier antara laju pertumbuhan dan aktivitas fosforilasi oksidatif. Selain itu, pergeseran diauxic, jumlah mitokondria meningkat dan tampak seperti jaringan
aktivitas fosforilasi oksidatif dalam model ini dikontrol secara ketat oleh filamen yang saling berhubungan yang berkorelasi dengan peningkatan aktivitas
jumlah unit rantai pernapasan, yang dinilai oleh jumlah sitokrom fosforilasi oksidatif seluler.64]. Kemudian, bagian serial dan rekonstruksi 3D
mitokondria dalam sel.47]. menunjukkan bahwa sebelum pergeseran diauxic mitokondria akan mencapai
sekitar 3% dari volume seluler dan hingga 10-12% setelah pergeseran diauxic [65].
Sebuah studi yang sangat baru dikonfirmasi oleh rekonstruksi 3D gambar
3.1. Evaluasi jumlah mitokondria
confocal bahwa mitokondria mewakili sekitar 5% dari volume seluler ketika
tumbuh dalam glukosa, dan volume ini meningkat menjadi 11% selama
Sejumlah penelitian telah membuktikan modulasi aktivitas fosforilasi
pergeseran diauxic dan hingga 35% selama pertumbuhan etanol [48]. Protein
oksidatif seluler baik dalam ragi selama pergeseran diauxic.48–53] atau
fluoresen yang ditujukan ke kompartemen mitokondria memiliki
pada mamalia di jaringan yang berbeda, selama perkembangan dan
5
M. Rigoulet, dkk. BBA - Bioenergi 1861 (2020) 148276
Skema 5. Menyalurkan di hati. Respirasi, sintesis ATP dan ekspor ATP melalui membran mitokondria bagian dalam melalui transporter nukleotida adenin (ANT) secara erat
digabungkan ke trans-fosforilasi ATP ke PCr oleh MtCK dan ekspor PCr ke dalam sitosol oleh saluran anion yang bergantung pada tegangan membran luar (Porin). ).
juga telah digunakan dalam sel mamalia untuk menilai volume mitokondria [55–57,60,66,82]. Last but not least, ketika seseorang tertarik pada aktivitas
dan parameter ini berkorelasi baik dengan penanda mitokondria lainnya fosforilasi oksidatif, jumlah sitokrom mitokondria adalah pengukuran
seperti sitrat sintase atau jumlah DNA mitokondria [66]. Volume mitokondria kompleks mitokondria yang kuat dan kuantitatif [47,83–85]. Namun, ini
juga telah dinilai, baik dengan probe radioaktif [67,68] atau probe fluoresen membutuhkan sejumlah besar bahan biologis dan mungkin tidak berlaku
[69]. Namun, probe fluoresen telah terbukti sangat sensitif terhadap potensi untuk semua model dan kondisi. Sintase sitrat mitokondria (enzim matriks)
mitokondria, pH dan ROS dan karenanya harus digunakan dengan hati-hati. sering digunakan sebagai penanda jumlah mitokondria [86–88] dan sampai
70–72]. Sementara jumlah dan/atau ukuran atau interkonektivitas tubulus hari ini telah membuktikan pengukuran yang cukup relevan. Sebagai
mitokondria yang diukur dalam berbagai penelitian sangat bergantung catatan, sementara hanya isoform sitrat sintase mitokondria yang
pada jenis sel dan kondisi fisiologis.57,73–76], volume mitokondria ditemukan pada mamalia, isoform sitosolik tambahan dari enzim hadir
keseluruhan dalam sel bisa sangat informatif (lihat di atas). Namun, telah dalam ragi. Namun demikian, aktivitas ini terbukti juga relevan pada ragi
ditunjukkan bahwa kompartemen mitokondria mungkin tidak bervariasi yang ditumbuhkan pada substrat yang tidak dapat difermentasi karena
secara keseluruhan tetapi mungkin ada pengayaan spesifik dari beberapa berkorelasi baik dengan pengukuran sitokrom.89].
komponen dan jalur metabolisme.48,59,62,77,78] mengisyaratkan bahwa Kesimpulannya, meskipun semua parameter yang diuraikan di atas menarik untuk
volume organel mungkin berguna tetapi tidak cukup untuk menilai konten mitokondria ketika diambil secara individual, pilihan parameter yang
menggambarkan jumlah bahan tergantung pada pertanyaan yang diajukan. paling cocok sangat bergantung pada model dan pertanyaan yang dibahas. Selain itu,
Pendekatan lain adalah dengan mengukur protein mitokondria atau lipid disarankan untuk menggunakan kombinasi parameter, seperti yang diilustrasikan dalam
seperti kardiolipin yang hanya dimiliki oleh membran mitokondria. beberapa penelitian yang dikutip di seluruh bagian ini, untuk menghindari bias dan
Kuantifikasi cardiolipin misalnya terbukti berguna tetapi sering bergantung untuk meningkatkan kesimpulan yang lebih kuat.
pada probe fluorescent dengan batas yang disebutkan di atas [56,71,79–81].
Kuantifikasi protein mitokondria individu in situ atau dengan western blot
sebagian besar digunakan [46,55,57,63]. Namun, perhatian harus diberikan 3.2. Efek Warburg: contoh regulasi fosforilasi oksidatif mitokondria
pada fakta bahwa kesimpulan yang diambil akan bergantung pada protein jangka panjang
yang diperiksa dan seperti yang dikatakan sebelumnya, mungkin ada
pengayaan spesifik dari beberapa jalur metabolisme. Mungkin bermanfaat O. Warburg melakukan salah satu studi pertama tentang energi tumor
untuk menggunakan penanda protein dari kompartemen dan proses metabolisme. Penemuan awalnya menunjukkan bahwa sel kanker menunjukkan
mitokondria yang berbeda, misalnya komponen fosforilasi oksidatif dan penurunan respirasi dan peningkatan glikolisis sebanding dengan peningkatan
jalur metabolisme, tetapi juga fungsi pemeliharaan rumah seperti impor laju pertumbuhan mereka, menunjukkan bahwa mereka bergantung terutama
protein, pendamping, atau pemeliharaan dan ekspresi mtDNA. Pendekatan pada metabolisme fermentatif untuk menghasilkan ATP. Karena represi
proteomik mungkin diperlukan untuk menghargai regulasi diferensial metabolisme oksidatif terjadi bahkan jika oksigen berlimpah, fenomena
keseluruhan protein mitokondria [62]. Jumlah DNA mitokondria sering metabolisme ini disebut "glikolisis aerobik". Warburg kemudian mengusulkan
terbukti berkorelasi baik dengan jumlah mitokondria dan protein bahwa mitokondria yang disfungsional adalah akar dari glikolisis aerobik.90] dan
mitokondria selanjutnya berhipotesis bahwa peristiwa ini adalah penyebab utama kanker.
Konsekuensi pertama dari cacat mitokondria ini adalah penurunan
6
M. Rigoulet, dkk. BBA - Bioenergi 1861 (2020) 148276
aktivitas fosforilasi oksidatif [91]. Peningkatan fluks glikolitik dan dimulai untuk jalur linier [105–107] dan secara umum dengan
fermentasi bersamaan dengan penurunan fosforilasi oksidatif Christine Reder secara alami mendefinisikan koefisien kontrol C F Saya dari langkah saya
mengkompensasi penurunan sintesis ATP oleh fosforilasi oksidatif pada fluks F pada kondisi tunak sebagai C F Saya = F/ΔvSaya, dimana F adalah perubahan
serta oksidasi NADH melalui fermentasi. Sebagaimana dinyatakan di diinduksi oleh perubahan vi di vi [108]. Ini adalah ukuran kuantitatif dari
atas, penurunan fosforilasi oksidatif yang dibuktikan dalam sel kanker kontrol langkah pada seluruh fluks pada kondisi mapan tertentu. Untuk
telah diusulkan sebagai akibat dari mitokondria yang rusak. Namun, menginduksi variasi vi, perlu untuk mengubah parameter yang
telah ditunjukkan bahwa penurunan ini juga dapat dikaitkan dengan mempengaruhi vi yang dapat berupa, misalnya, konsentrasi enzim Ei, suatu
penurunan jumlah seluler mitokondria (tanpa cacat mitokondria). penghambat Ei, suhu dll.. Sehingga definisi C F Saya adalah
Skildum dkk. telah menunjukkan, pada garis sel kanker payudara, CSaya
F = (ΔF/ΔpSaya)/(vSaya/ΔpSaya) = (F/pSaya)/(vSaya/pSaya)) dimana pSaya adalah parameter
bahwa peningkatan biogenesis mitokondria menurunkan proliferasi sel yang secara khusus bekerja pada vSaya. Ini sekaligus merupakan definisi
dan meningkatkan sensitivitas sel terhadap obat, berkat peningkatan matematis dan definisi eksperimental ketika F dan pSaya diukur secara
aktivitas fosforilasi oksidatif [92]. Jiang dkk. telah menunjukkan bahwa eksperimental di bawah pengaruh pSaya (untuk rincian tentang teori, lihat [
dalam sel-sel positif Warburg, penambahan mitokondria non- 109-113]).
disfungsional menginduksi penurunan fluks glikolitik serta proliferasi Salah satu hasil terpenting dari teori ini adalah bahwa, dalam jaringan
sel yang memperkuat gagasan bahwa penurunan fosforilasi oksidatif metabolisme, jumlah koefisien kontrol dari semua langkah pada fluks F
menginduksi saklar metabolisme Warburg [93]. Fantin dkk. telah pada kondisi tunak dalam jaringan ini sama dengan satu:
menunjukkan bahwa dengan tidak adanya fermentasi, penurunan C 1F + C F 2+ …. + CF n= 1 di mana n adalah jumlah langkah dalam
proliferasi sel tumor serta peningkatan fosforilasi oksidatif dapat jaringan.
dibuktikan [94]. Hal ini menunjukkan bahwa keseimbangan redoks Koefisien kontrol dari langkah-langkah yang berbeda dari fosforilasi
seluler adalah pemain kunci dalam efek Warburg [95]. Meskipun oksidatif pada respirasi mitokondria diukur untuk pertama kalinya di [
demikian, ada banyak bukti yang menantang paradigma sel kanker 103,104] dan menunjukkan tiga hasil penting: (i) bahwa kontrol laju
"glikolitik" murni [96]. Beberapa garis sel glioma, hepatoma dan kanker pernapasan dapat dibagi di antara beberapa langkah, yaitu pembawa
payudara memiliki mitokondria fungsional dan mereka memperoleh adenilat, pembawa dikarboksilat, suplai substrat pernapasan dan
ATP terutama dari fosforilasi oksidatif.46,97–99]. Ini menunjukkan kebocoran proton, (ii) bahwa jumlah koefisien kontrol berjumlah
bahwa plastisitas metabolik yang diamati secara in vitro mungkin hampir satu dan (iii) bahwa distribusi koefisien kontrol bervariasi sesuai
berdampak pada fisiologi tumor in vivo. dengan kondisi tunak Saya. e. kondisi fisiologis. Hasil ini dikonfirmasi
Cara yang lebih finalis untuk menganalisis efek Warburg adalah dengan pada ragi [114], di otak dalam situasi patologis [115], pada otot
menyelidiki nilai tambah untuk mendorong pertumbuhan sel. Tinjauan literatur mamalia [116] dan pada jalur lain seperti fermentasi. Dalam kasus itu,
menunjukkan bahwa kemungkinan manfaat dari rewiring metabolisme energi ini empat langkah pengendalian utama dibuktikan: transportasi glukosa
untuk pertumbuhan sel kanker tidak jelas. Glikolisis aerobik tidak efisien dalam hal dan laktat, heksokinase dan fosfofruktokinase [117]. Piruvat kinase juga
hasil sintesis ATP bila dibandingkan dengan respirasi mitokondria. Namun, pada dapat memiliki kontrol yang signifikan tergantung pada kondisinya.
mamalia, laju metabolisme glukosa melalui glikolisis aerobik adalah 10 sampai 100
lebih tinggi dari oksidasi lengkap glukosa oleh fosforilasi oksidatif mitokondria.
Dengan demikian orang dapat berhipotesis bahwa salah satu fungsi efek Warburg 4.2. Penyaluran dan superkompleks
adalah untuk mendukung produksi ATP yang cepat yang dapat diatur dengan
cepat untuk mendukung permintaan sintesis ATP. Juga telah diusulkan bahwa Dalam teori kontrol metabolik, diduga enzim dan metabolit bebas
glikolisis aerobik intens diperlukan untuk memastikan pasokan intermediet berinteraksi sesuai dengan teori tumbukan. Inilah sebabnya mengapa
glikolitik sebagai blok bangunan untuk jalur biosintetik. Sampai hari ini, dan koefisien kontrol sering kali lemah. Penghambatan langkah
meskipun banyak penelitian, kemungkinan keuntungan dari rewiring metabolik ini meningkatkan konsentrasi substrat yang biasanya cenderung
masih dalam penyelidikan. Dari sudut pandang metabolisme, ragi yang meningkatkan laju reaksi, sehingga kondisi tunak baru tercapai dengan
memfermentasiSaccharomyces cerevisiae dan sel tumor berbagi beberapa fitur [ nilai antara seluruh fluks antara 0 dan vSaya: variasi konsentrasi
100,101]. Pada kedua proliferasi sel. Peran fosforilasi oksidatif dengan adanya metabolit menyangga perubahan aktivitas enzim. Kondisi interaksi
glukosa, dan fermentasi adalah model yang baik untuk mempelajari efek bebas antara enzim dan substrat serta produknya adalah wajib untuk
Warburg, di mana semua parameter dapat disusun kembali. Namun, teorema penjumlahan mendasar yaitu jumlah koefisien kontrol sama
bertentangan dengan apa yang diusulkan oleh Warburg dan sesuai dengan dengan 1. Sebaliknya, dalam kasus penyaluran dan superkompleks,
sejumlah laporan dari literatur, kami menunjukkan bahwa dalam model ini jumlah koefisien kontrol dapat bervariasi dari kurang dari satu ke
mitokondria tidak disfungsional: ada lebih sedikit unit rantai pernapasan jumlah total langkah karena menghambat satu langkah dalam
mitokondria per sel. Identifikasi mekanisme molekuler yang terlibat dalam proses superkompleks menghambat semua langkah [118]. Properti ini secara
ini memungkinkan kami untuk memisahkan parameter yang terlibat dalam efek elegan dieksploitasi secara eksperimental untuk membuktikan
Warburg dan kami menunjukkan bahwa represi fosforilasi oksidatif tidak wajib organisasi supramolekul parsial dari rantai pernapasan [119]. Dalam
untuk mendukung pertumbuhan sel. Last but not least, kami dapat menunjukkan karya ini penulis, menggunakan mitokondria jantung sapi dan partikel
bahwa fluks sintesis ATP seluler tidak mengontrol laju pertumbuhan seluler [102]. submitochondrial menunjukkan kemungkinan asosiasi kompleks I dan
III (jumlah koefisien kontrol > 1) sedangkan kompleks lainnya (II dan IV)
tampak independen secara fungsional. Hasil serupa diperoleh pada
ragiSaccharomyces cerevisiae di tingkat sel [120].
4. Masukan pemodelan untuk studi metabolisme energi sel MCT telah menjadi alat yang hebat untuk memecahkan teka-teki
lama tentang kontrol fosforilasi oksidatif. Pertimbangan fosforilasi
4.1. Kontrol fosforilasi oksidatif oksidatif dalam patologi dalam hal MCT juga bermanfaat untuk
memahami "efek ambang" pada penyakit mitokondria [121,122] dan
Pertanyaan mendasar yang ditangani adalah: langkah apa yang masih berbuah manis dalam pencarian target terbaik (langkah paling
mengontrol fosforilasi oksidatif? Berdasarkan Metabolic Control Theory terkontrol) obat anti kanker misalnya [117] dan parasit [123].
(MCT), hal ini dijawab dengan indah oleh dua kelompok, satu di
Amsterdam [103] dan yang lainnya di Magdeburg [104]. MCT menjawab 4.3. Memodelkan efek Warburg
pertanyaan sederhana: bagaimana seluruh fluks jaringan metabolisme
seperti fosforilasi oksidatif, (respirasi atau sintesis ATP) dimodulasi Ada beberapa upaya untuk memodelkan efek Warburg untuk lebih
ketika satu langkah (sitochromeC oksidase misalnya) dimodulasi? Teori memahami gaya yang bekerja dalam efek ini dan apakah
7
M. Rigoulet, dkk. BBA - Bioenergi 1861 (2020) 148276
mereka diperlukan untuk proliferasi sel kanker. Model minimal sangat [4] EA Siess, E. Banik, S. Neugebauer, Kontrol aktivitas piruvat karboksilase oleh
menarik karena mengungkapkan kendala mendasar yang mengarah ke efek keadaan redoks piridin-nukleotida di mitokondria dari hati tikus, Eur. J. Biokimia.
173 (1988) 369–374.
Warburg [124–127]. Model paling sederhana, menggabungkan tiga reaksi [5] M. Erecinska, RL Veech, FD Wilson, Hubungan termodinamika antara reaksi
yang mewakili glikolisis dan bifurkasi menuju laktat atau fosforilasi oksidatif, oksidasi-reduksi dan sintesis ATP dalam suspensi mitokondria jantung merpati
menunjukkan bahwa glikolisis aerobik disukai dengan adanya sejumlah terisolasi, Arch. Biokimia. Biofis. 160 (1974) 412–421.
[6] M. Erecinska, DF Wilson, Peraturan metabolisme energi seluler, J. Membr. Biol. 70
besar glukosa.124,125]. Sebaliknya, ketika glukosa langka, fosforilasi
(1982) 1–14.
oksidatif lebih disukai. Model yang lebih realistis dikembangkan dengan [7] M. Erecinska, DF Wilson, K. Nishiki, regulasi homeostatis metabolisme energi
mempertimbangkan tidak hanya bifurkasi piruvat tetapi juga reoksidasi seluler: karakterisasi eksperimental in vivo dan sesuai dengan model, Am. J.
Fisiol. lingkaran Fisiol. 234 (1978) 82–89,https://doi.org/10.1152/ajpcell.1978.
NADH yang diperlukan [126]. Dengan mengambil sampel secara acak
234.3.C82.
sejumlah besar ansambel fluks dari jaringan metabolisme sederhana ini [8] S. Helling, S. Vogt, A. Rhiel, R. Ramzan, L. Wen, K. Marcus, B. Kadenbach,
pada keadaan tunak, para penulis ini menganalisis bagaimana tingkat Fosforilasi dan kinetika mamalia sitokrom c oksidase, Mol. Sel. Proteomik 7
(2008) 1714–1724,https://doi.org/10.1074/mcp.m800137- mcp200.
proliferasi sel, produksi ATP, dan oksidasi NADH saling terkait. Dalam
banyak kasus mereka menemukan kombinasi fluks yang menggambarkan [9] HG Crabtree, Pengamatan pada metabolisme karbohidrat tumor, Biochem.
efek Warburg, tetapi mereka juga membuktikan situasi di mana sel-sel yang J.23 (1929) 536–545.
[10] S. Gatt, E. Racker, Mekanisme regulasi dalam karbohidrat: I. Efek Crabtree dalam sistem
berproliferasi tidak selalu menunjukkan efek Warburg. Hasil ini sesuai
yang direkonstruksi, J. Biol. Kimia 234 (1959) 1015–1023.
dengan data terbaru dari laboratorium kami yang menunjukkan bahwa [11] L. Wojtczak, VV Teplova, K. Bogucka, A. Czyz, A. Makowska, MR Wieckowski,
represi metabolisme mitokondria bukanlah prasyarat untuk mendorong J. Duszynski, YV Evtodienko, Pengaruh glukosa dan deoxyglucose pada redistribusi
proliferasi sel [102,128]. kalsium di Ehrlich asites tumor dan sel hepatoma Zajdela dan konsekuensinya
untuk energi mitokondria Argumen lebih lanjut untuk peran Ca 2
+ dalam mekanisme efek Crabtree, Eur. J. Biokimia. 263 (1999) 495–501.
5. Penutup [12] M. Zizi, M. Forte, E. Blachly-Dysons, M. Colombinis, NADH Mengatur Gating VDAC,
Saluran Membran Luar Mitokondria*, (1994), hlm. 1614–1616.
[13] M. Rosas Lemus, E. Roussarie, N. Hammad, A. Mougeolle, S. Ransac, R. Issa, J.-
Studi metabolisme energi sel dan lebih khusus lagi hubungan P. Mazat, S. Uribe-Carvajal, M. Rigoulet, A. Devin, Peran fosfat heksosa yang
antara glikolisis dan fosforilasi oksidatif sebagian besar mengandalkan diturunkan dari glikolisis dalam induksi efek Crabtree, J. Biol. Kimia (2018),https://
analisis termokinetik dengan fokus besar pada peran perantara, doi.org/10.1074/jbc.RA118.003672 jbc.RA118.003672.
[14] R. Díaz-Ruiz, N. Avéret, D. Araiza, B. Pinson, S. Uribe-Carvajal, A. Devin,
kekhasannya (glikolisis dan fosforilasi oksidatif tidak setara dalam hal
M. Rigoulet, Fosforilasi oksidatif mitokondria diatur oleh fruktosa 1,6- bifosfat:
NADH/NAD+ pergantian) dan ketersediaan substrat (glukosa, oksigen, kemungkinan peran dalam induksi efek Crabtree? J.Biol. Kimia 283 (2008) 26948–
dll.) untuk jalur ini. Selanjutnya, apa yang diselidiki secara mendalam 26955,https://doi.org/10.1074/jbc.M800408200.
[15] MR Lemus, E. Roussarie, N. Hammad, A. Mougeolle, S. Ransac, R. Issa, J.-
adalah bagaimana jalur ini disesuaikan dengan modulasi baik energi
P. Mazat, S. Uribe-Carvajal, M. Rigoulet, A. Devin, Peran fosfat heksosa yang
(potensial fosfat) atau kendala redoks (potensial redoks). diturunkan dari glikolisis dalam induksi efek Crabtree, J. Biol. Kimia 293 (2018)
Kecenderungan yang mendasarinya adalah bahwa fluks sintesis ATP 12843–12854,https://doi.org/10.1074/jbc.RA118.003672.
disesuaikan dengan fluks konsumsi ATP dan/atau kendala redoks. Studi [16] PA Srere, Kompleks enzim metabolik sekuensial, Annu. Pdt. Biokimia. 56 (1987) 89–
124.
terbaru menunjukkan bahwa ketika glikolisis dan fosforilasi oksidatif [17] DE Atkinson, Metabolisme Energi Seluler dan Regulasinya, (1977).
aktif secara bersamaan, fluks melalui jalur ini dan saling [18] M. Rigoulet, H. Aguilaniu, N. Avéret, O. Bunoust, N. Camougrand, X. Grandier-
ketergantungannya tampaknya tidak dikendalikan oleh fluks sintesis Vazeille, C. Larsson, I.-L. Pahlman, S. Manon, L. Gustafsson, Organisasi dan
regulasi metabolisme NADH sitosol dalam ragi Saccharomyces cerevisiae, Mol.
ATP yang diperlukan untuk fungsi seluler. Selain itu, dominasi satu jalur Sel. Biokimia. 257–257 (2004) 73–81.
di atas yang lain tampaknya sebagian besar bergantung pada fisiologi [19] N. Avéret, V. Fitton, O. Bunoust, M. Rigoulet, B. Guérin, Metabolisme mitokondria
sel misalnya apakah sel berproliferasi atau tidak. ragi: dari studi kuantitatif in vitro ke in situ, Mol. Sel. Biokimia. 184 (1998) 67–79.
[1] RL Veech, JWR Lawson, NW Cornell, HA Krebs, potensi fosforilasi sitosolik, J. Biol. [30] K. Pfeiffer, V. Gohil, RA Stuart, C. Hunte, U. Brandt, ML Greenberg,
Kimia 254 (1979) 6538–6547. H. Schägger, Cardiolipin menstabilkan superkompleks rantai pernapasan*, J.
[2] A. Carmona, R. Freedland, Pengaruh gliserol dan dihidroksiaseton pada Biol. Kimia 278 (2003) 52873–52880,https://doi.org/10.1074/jbc.M308366200.
lipogenesis hati, Arch. Biokimia. Biofis. 271 (1989) 130-138. [31] C. Arnarez, J. Mazat, J. Elezgaray, S. Marrink, X. Periole, Bukti untuk situs pengikatan
[3] MN Berry, E. Kun, HV Werner, Peran regulasi transfer setara reduksi dari substrat cardiolipin pada permukaan yang terpapar membran dari sitokrom bc 1, J. Am.
ke oksigen dalam metabolisme hati gliserol dan sorbitol, Eur. J. Biokimia. 33 (1973) Kimia Soc. 135 (2013) 3112–3120,https://doi.org/10.1021/ja310577u.
407–417. [32] C. Arnarez, SJ Marrink, X. Periole, Mekanisme molekuler dari cardiolipin-mediated
8
M. Rigoulet, dkk. BBA - Bioenergi 1861 (2020) 148276
perakitan superkompleks rantai pernapasan , Chem. Sci. 7 (2016) 4435–4443, neuropati, Otak A J. Neurol. 137 (2014) 335–353,https://doi.org/10.1093/ brain/
https://doi.org/10.1039/c5sc04664e. awt343.
[33] A. Bashir, KL Bohnert, DN Reeds, LR Peterson, AJ Bittel, Gangguan bioenergi otot [56] S.-K. Kim, Y.Joe, M.Zheng, HJ Kim, J.-K. Yu, GJ Cho, KC Chang, HK Kim,
jantung dan rangka pada anak-anak, remaja, dan dewasa muda dengan J. Han, SW Ryter, HT Chung, Resveratrol menginduksi biogenesis mitokondria
Sindrom Barth, Laporan Fisiologis. 5 (2017) 1–12. hati melalui aktivasi berurutan dari produksi oksida nitrat dan karbon
[34] M. Mckenzie, M. Lazarou, DR Thorburn, MT Ryan, superkompleks rantai monoksida, Antioksidan. Sinyal Redoks. 20 (2014) 2589–2605,https://doi.org/10.
pernapasan mitokondria tidak stabil pada pasien sindrom Barth, J. Mol. Biol. 1089/ars.2012.5138.
361 (2006) 462–469, https://doi.org/10.1016/j.jmb.2006.06.057. [57] R. Rossignol, R. Gilkerson, R. Aggeler, K. Yamagata, SJ Remington, RA Capaldi,
[35] L. Plecita-Hlavata, P. Jezek, Jurnal internasional integrasi biokimia pembentukan Substrat energi memodulasi struktur mitokondria dan kapasitas oksidatif dalam
superoksida dan morfologi krista untuk pensinyalan redoks mitokondria, Int. J. Sel kanker, Kanker Res. 64 (2004) 985–993.
Biokimia. Biol Sel. 80 (2016) 31–50,https://doi.org/10.1016/j. biocel.2016.09.010. [58] K. Weber, D. Ridderskamp, M. Alfert, S. Hoyer, RJ Wiesner, Budidaya dalam media yang
kekurangan glukosa merangsang biogenesis mitokondria dan metabolisme oksidatif
[36] M. Strauss, G. Hofhaus, RR Schröder, W. Kühlbrandt, Pita dimer dari ATP sintase dalam sel hepatoma HepG2, Biol. Kimia 383 (2002) 283–290,https://doi. org/10.1515/
membentuk membran mitokondria bagian dalam, EMBO. 27 (2008) 1154-1160, BC.2002.030.
https://doi.org/10.1038/emboj.2008.35. [59] S. Benlamara, L. Aubry, J. Fabregue, P. Bénit, P. Rustin, M. Rak, remodeling siklus
[37] M. Vendelin, N. Beraud, K. Guerrero, T. Andrienko, AV Kuznetsov, J. Olivares, Krebs Distinctive di iPSC-derived neural dan sel punca mesenchymal, Biochem.
L. Kay, VA Saks, N. Be, K. Guerrero, AV Kuznetsov, J. Olivares, L. Kay, Biofis. Res. komuni. 511 (2019) 658–664,https://doi.org/10.1016/j.bbrc.
VA Saks, Metode dalam fisiologi sel pengaturan reguler mitokondria dalam sel 2019.02.033.
otot: pola "seperti kristal", Am. J. Fisiol. lingkaran Fisiol. 288 (2005) C757–C767, [60] E. Fernández-Vizarra, JA Enríquez, A. Pérez-Martos, J. Montoya, P. Fernández-Silva,
https://doi.org/10.1152/ajpcell.00281.204. Perbedaan spesifik jaringan dalam aktivitas mitokondria dan biogenesis,
[38] N. Beraud, S. Pelloux, Y. Usson, AV Kuznetsov, X. Ronot, Y. Tourneur, V. Saks, Dinamika Mitokondria. 11 (2011) 207–213,https://doi.org/10.1016/j.mito.2010.09.011.
mitokondria dalam sel jantung: fluktuasi frekuensi tinggi amplitudo sangat rendah pada [61] D.-F. Dai, ME Danoviz, B. Wiczer, MA Laflamme, R. Tian, Pematangan mitokondria
kardiomiosit dewasa dan gerakan aliran di non mengalahkan sel Hl-1, J Bioenerg pada kardiomiosit turunan sel induk berpotensi majemuk manusia, Sel Punca Int.
Biomembr. 41 (2009) 195–214,https://doi.org/10.1007/s10863-009- 9214-x. 2017 (2017) 5153625,https://doi.org/10.1155/2017/5153625.
[62] Y. Kim, DS Yang, P. Katti, B. Sekilas, Komposisi protein retikulum mitokondria
[39] V. Saks, R. Guzun, N. Timohhina, K. Tepp, M. Varikmaa, C. Monge, N. Beraud, otot selama perkembangan pascakelahiran, J. Physiol. 597 (2019) 2707–2727,
T. Kaambre, A. Kuznetsov, L. Kadaja, M. Eimre, E. Seppet, Struktur – hubungan https://doi.org/10.1113/JP277579.
fungsi dalam regulasi umpan balik fluks energi in vivo dalam kesehatan dan [63] G. Benard, B. Faustin, E. Passerieux, A. Galinier, C. Rocher, N. Bellance, J.-
penyakit: Interactosom mitokondria, BBA - Bioenergi. 1797 (2010) 678–697,https:// P. Delage, L. Casteilla, T. Letellier, R. Rossignol, Keragaman fisiologis fosforilasi
doi. org/10.1016/j.bbabio.2010.01.011. oksidatif mitokondria, Am. J. Fisiol. Fisiol Sel. 291 (2006) C1172–C1182,https://
[40] DE Hijau, E. Murer, HO Hultin, SH Richardson, B. Salmon, GP Brierley, doi.org/10.1152/ajpcell.00195.2006.
H. Baum, Asosiasi jalur metabolisme terintegrasi dengan membran, Arch. [64] Y. Yotsuyanagi, Studi mitokondria ragi. I. Variasi dalam ultrastruktur mitokondria
Biokimia. Biofis. 112 (1965) 635–647. selama siklus pertumbuhan aerobik, J. Ultrastruct. Res. 7 (1962) 121–140,https://
[41] FM Clarke, CJ Masters, Tentang hubungan enzim glikolitik dengan protein struktural doi.org/10.1016/s0022-5320(62)80031-8.
otot rangka, Biochim. Biofis. Acta 381 (1975) 37–46. [65] B. Stevens, Struktur mitokondria, dalam: JN Strathern, EW Jones, JR Broach (Eds.), Mol. Biol.
[42] B. Ras, F. Ortega, J. Puigjaner, B. Comin, F. Orosz, J. Ovadi, M. Cascante, RagiSaccharomyces cerevisiae, Laboratorium Pelabuhan Mata Air Dingin, Pelabuhan
Karakterisasi kuantitatif homo- dan heteroassociations otot fosfofruktokinase Mata Air Dingin, New York, 1981, hlm. 471–504.
dengan aldolase, Biochim. Biofis. Acta 1479 (2000) 303–314. [66] A. Costanzini, G. Sgarbi, A. Maresca, V. Del Dotto, G. Solaini, A. Baracca, penilaian massa
[43] A. Hudder, L. Nathanson, MP Deutscher, Organisasi Sitoplasma Mamalia, Mol. Sel. mitokondria dalam garis sel yang dipilih di bawah kondisi metabolisme yang berbeda,
Biol. 23 (2003) 9318–9326,https://doi.org/10.1128/MCB.23.24.9318. Sel. 8 (2019) 1454,https://doi.org/10.3390/cells8111454.
[44] JS Clegg, SA Jackson, Metabolisme glukosa dan penyaluran zat antara glikolitik [67] P. Espié, A. Devin, B. Guérin, M. Rigoulet, Energetics dari pembengkakan hepatosit
dalam sel L-929 Permeabilisasi, Arch. Biokimia. Biofis. 278 (1990) 452–460. terisolasi yang disebabkan oleh asam amino yang diangkut bersama natrium, J.
Bioenergi. Biomebr. 29 (1997) 591–601,https://doi.org/10.1023/a:1022487119390.
[45] E. Espinoza-Simon, N. Chiquete-Felix, L. Morales-Garcia, U. Pedroza-Davila, [68] A. Devin, P. Espié, B. Guérin, M. Rigoulet, Energi pembengkakan pada hepatosit
X. Pérez-Martinez, D. Araiza-Olivera, F. Torres-Quiroz, S. Uribe-Carvajal, Dalam terisolasi: studi komprehensif, Mol. Sel. Biokimia. 184 (1998) 107-121http://
Saccharomyces cerevisiae, penarikan sumber karbon menghasilkan pelepasan www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9746316.
enzim glikolitik dari sitoskeleton dan dalam reorganisasi aktin, Biol Jamur. 124 [69] A. Chevrollier, J. Cassereau, M. Ferré, J. Alban, V. Desquiret-Dumas, N. Gueguen,
(2020) 15–23,https://doi.org/10.1016/j.funbio.2019.10.005. P. Amati-Bonneau, V. Procaccio, D. Bonneau, P. Reynier, Analisis mitokondria
[46] P. Pasdois, C. Deveaud, P. Voisin, V. Bouchaud, M. Rigoulet, B. Beauvoit, Kontribusi standar memberikan wawasan baru ke dalam dinamika mitokondria dan fungsi
kompleks terfosforilasi I dalam respirasi bergantung fase pertumbuhan sel glioma OPA1, Int. J. Biokimia. Biol Sel. 44 (2012) 980–988,https://doi.org/10.1016/
C6 in vitro, J. Bioenergi . Biomebr. 35 (2003) 439–450,https://doi.org/10.1023/ j.biocel.2012.03.006.
A:1027391831382. [70] C. Cottet-Rousselle, X. Ronot, X. Leverve, J.-F. Mayol, penilaian sitometrik
[47] A. Devin, L. Dejean, B. Beauvoit, C. Chevtzoff, N. Avéret, O. Bunoust, M. Rigoulet, mitokondria menggunakan probe fluoresen, Cytom. Bagian A. 79A (2011) 405–
Homeostasis hasil pertumbuhan dalam ragi yang bernafas disebabkan oleh penyesuaian 425,https://doi.org/10.1002/cyto.a.21061.
konten mitokondria yang ketat, J. Biol. Kimia 281 (2006) 26779–26784,https://doi.org/10. [71] E. Doherty, A. Perl, Pengukuran Massa Mitokondria dengan Aliran Sitometri selama
1074/jbc.M604800200. Stres Oksidatif, Bereaksi. oksigen Spesies (Apex, NC), 4 (2017), hlm. 275–283,
[48] F. Di Bartolomeo, C. Malina, K. Campbell, M. Mormino, J. Fuchs, E. Vorontsov, https://doi.org/10.20455/ros.2017.839.
CM Gustafsson, J. Nielsen, Kuantifikasi proteom mitokondria ragi mutlak mengungkapkan [72] B. Sekilas, Memvisualisasikan bentuk dan fungsi mitokondria di dalam sel, Trends
trade-off antara biosintesis dan pembangkitan energi selama pergeseran diauxic, Proc. Mol. Med. 26 (2020) 58–70,https://doi.org/10.1016/j.molmed.2019.09.009.
Natal akad. Sci. (2020),https://doi.org/10.1073/pnas.1918216117. [73] RK Dagda, SJ Cherra, SM Kulich, A. Tandon, D. Park, CT Chu, Hilangnya fungsi PINK1
[49] CP Henson, P. Perlman, CN Weber, HR Mahler, Pembentukan mitokondria ragi. mempromosikan mitofag melalui efek pada stres oksidatif dan fisi mitokondria, J.
II. Efek antibiotik pada aktivitas enzim selama derepresi, Biokimia 7 (1968) Biol. Kimia 284 (2009) 13843–13855,https://doi.org/10.1074/ jbc.M808515200.
4445–4454,https://doi.org/10.1021/bi00852a041.
[50] AJ Lamb, GD Clark-Walker, AW Linnane, Biogenesis mitokondria [74] C. Sauvanet, S. Duvezin-Caubet, J.-P. di Rago, M. Rojo, Persyaratan energi dan
4. Diferensiasi sistem sintesis protein mitokondria dan sitoplasma in vitro oleh modulasi bioenergi morfologi dan dinamika mitokondria, Semin. Pengembang
antibiotik, Biochim. Biofis. Acta 161 (1968) 415–427. Sel. Biol. 21 (2010) 558–565,https://doi.org/10.1016/j.semcdb.2009.12. 006.
[51] TG Cartledge, D. Lloyd, fraksinasi subselular dengan sentrifugasi diferensial dan zona dari
Saccharomyces carlsbergensis yang direpresi secara aerobik yang direpresi glukosa, [75] L. Wiemerslage, D. Lee, Kuantifikasi morfologi mitokondria di neurit neuron
Biochem. J. 126 (1972) 381–393. dopaminergik menggunakan beberapa parameter, J. Neurosci. Metode 262 (2016)
[52] CPM Görts, A. Hasilik, Pengaruh antibiotik terhadap perkembangan dan stabilitas 56–65,https://doi.org/10.1016/j.jneumeth.2016.01.008.
enzim mitokondria1 pada Sacchnromyces cerevisiae, Eur. J. Biokimia. 29 (1972) [76] S. Duvezin-Caubet, R. Jagasia, J. Wagener, S. Hofmann, A. Trifunovic, A. Hansson,
282–287. A. Chomyn, MF Bauer, G. Attardi, N.-G. Larson, W. Neupert, AS Reichert,
[53] HR Mahler, P. Perlman, CP Henson, CN Weber, Efek selektif kloramfenikol, Pemrosesan proteolitik OPA1 menghubungkan disfungsi mitokondria dengan
sikloheksimida dan biosintesis nalidiksat enzim pernapasan dalam ragi, Biochem. perubahan morfologi mitokondria *, J. Biol. Kimia 281 (2006) 37972–37979,
Biofis. Res. komuni. 31 (1968) 474–480. https://doi.org/10.1074/jbc.M606059200.
[54] T. Akimoto, SC Pohnert, P. Li, M. Zhang, C. Gumbs, PB Rosenberg, [77] S. Schmitt, S. Schulz, E.-M. Schropp, C. Eberhagen, A. Simmons, W. Beisker,
RS Williams, Z. Yan, Latihan merangsang transkripsi Pgc-1α di otot rangka melalui M. Aichler, H. Zischka, Mengapa membandingkan jumlah absolut mitokondria,
aktivasi jalur MAPK p38, J. Biol. Kimia 280 (2005) 19587–19593,https://doi.org/ Mitokondria. 19 (2014) 113–123,https://doi.org/10.1016/j.mito.2014.06.005.
10.1074/jbc.M408862200. [78] C. Fecher, L. Trov, SA Müller, N. Snaidero, J. Wettmarshausen, S. Heink,
[55] C. Giordano, L. Iommarini, L. Giordano, A. Maresca, A. Pisano, ML Valentino, O. Ortiz, I. Wagner, R. Kühn, J. Hartmann, RM Karl, A. Konnerth, T. Korn,
L. Caporali, R. Liguori, S. Deceglie, M. Roberti, F. Fanelli, F. Fracasso, FN Ross- W. Wurst, D. Merkler, SF Lichtenthaler, F. Perocchi, T. Misgeld, Profil sel-jenis-
Cisneros, P. D'Adamo, G. Hudson, A. Pyle, P. Yu-Wai-Man , PF Chinery, spesifik mitokondria otak mengungkapkan keragaman fungsional dan molekuler,
M. Zeviani, SR Salomao, A. Berezovsky, R. Belfort, DF Ventura, M. Moraes, M. Nat. ilmu saraf. 22 (2019) 1731–1742,https://doi.org/10.1038/s41593-019-0479-z.
Moraes Filho, P. Barboni, F. Sadun, A. De Negri, AA Sadun, A. Tancredi, [79] J. Jacobson, MR Duchen, SJR Heales, Distribusi intraseluler dari pewarna
M. Mancini, G. d'Amati, P. Loguercio Polosa, P. Cantatore, V. Carelli, Biogenesis mitokondria yang fluorescent nonyl acridine orange merespons potensi membran mitokondria:
efisien mendorong penetrasi yang tidak lengkap dalam optik herediter Leber implikasi untuk pengujian kardiolipin dan massa mitokondria, J.
9
M. Rigoulet, dkk. BBA - Bioenergi 1861 (2020) 148276
10