13h às 17h
* Estratégias e aplicações da Espectrometria de Massas
Dra. Lucilene Delazari dos Santos
UNESP, Campus Rio Claro, SP.
ldsantos@rc.unesp.br
História da Espectrometria de Massas
– Quantificar compostos
• Informação Estrutural
• Sequenciamento de peptídeos
• Identificar modificações pós-traducionais (fosforilação,
glicosilação e pontes de sulfeto)
Como um espectrômetro de massas trabalha?
– m = massa; z = carga
– Formar íons;
Ionização Detecção
Separação
+
Ion Detection
Analyzer
Source
Formação de íons
Ions detectados
100
100
75
75
Inlet • Sólida 50
50
• Liquida 25
25
• Gasosa 00
1330
1330 1340
1340 1350
1350
Preparação da amostra
Ácido cinâmico
Métodos de ionização
+ Accelerated
+ + ++ +
+ ++++ ++
charged
+ particles
+ + + +
Pulsed
Laser Beam
Strong
electric field
(5-20 kv)
Características da Técnica MALDI-TOF MS
Análise Proteômica
Utilizar
resultados para
pesquisa em
banco de dados
Métodos de ionização
Métodos de ionização
Métodos de ionização
Fonte de ionização
Métodos de ionização
Métodos de ionização
Evaporação no ESI
Métodos de ionização
H H H 4+
H M E H F R W G K
4+ 3+ 2+ 1+
H
H H H H
H H H H H
Métodos de ionização
4+ 3+ 2+ 1+
H
H H H H
H H H H H
ES-MS
2+
Re l. I nte n.
3+
1+
4+
m/z
Métodos de ionização
Vantagens do ESI
•Sistema dinâmico;
•Opções de MS/MS
R= m/ m
m= m/R
Análise de proteínas no ESI - BSA
1954.345 3165
100
2076.494
2143.433
90 1846.291
2214.905
1748.868
80
2291.345
1704.449
70
2373.148
% Intensity
60 1661.850 2461.494
1620.910
50 2556.378
2658.149
40
30
1510.337
2893.649
20
1453.913 3025.703 3909.434
3164.460 3690.996
10 3327.893
4153.774
0
1000 1700 2400 3100 3800 4500
Mass (m/z)
Análise de proteínas no ESI - BSA
100 66424 3.9E+4
90
80
66533
70
% Intensity
60
50
40
66684
30 66805
20
10
0 0
66000 66320 66640 66960 67280 67600
Mass (m/z)
Resolução LC-MS-MS
Baixa resolução (700) Alta resolução
692.5
~13000
1.8e5 692.429
Precisão
Intensity, cps
693.439
694.0
2.0e4
y
z
x
Quadrupolo
MS1 MS2
MS1, seleção do íon pai.
Detector
Ion Q1 q2 Q3
Source
m/z
MS/MS
Detector
Ion Q1 q2 Q3
Source
m/z
MS/MS
Detector
Ion Q1 q2 Q3
Source
m/z
MS/MS
Detector
Ion Q1 q2 Q3
Source
m/z
Aminoácidos são sub unidades da proteína
side chain
ALANI NA
Aminoácidos são ligados por ligações peptídicas e
formam poli peptídeos
+ +
H2N COOH
b6 y1
+ +
H2N COOH
y2
b5
+ +
H2N COOH
b4 y3
y
Relative I ntensity
1 y
b1
3
y b2
2
K G L F
F L G b K
3 m/z
Nomenclatura dos fragmentos dos peptídeos
Analisador de Massas
Tempo de Vôo
Tempo de Vôo
Laser
Detector
Signal processing
Analisador de Massas
Tempo de Vôo
Laser
Detector
Signal processing
Analisador de Massas
Tempo de Vôo
Laser
Detector
Signal processing
Analisador de Massas
Tempo de Vôo
Laser
Detector
Signal processing
Spectrum
Analisador de Massas
Tempo de Vôo
Laser
Detector
Signal processing
Spectrum
Analisador de Massas
Reflectron TOF Z2
Signal
processing
DETECTOR
PULSED LASER
BEAM ION-GATE
m/z 1
m/z 2
20 kV
m/z1 = m/z2
Signal
processing
DETECTOR
LASER
ION-GATE
20 kV
Signal
processing
DETECTOR
LASER tx
ION-GATE
20 kV
Signal
processing
DETECTOR
LASER
ION-GATE
20 kV
Signal
processing
DETECTOR
m/z
LASER
ION-GATE
20 kV
Signal
processing
DETECTOR
m/z
ION-GATE
20 kV
Signal
processing
DETECTOR
m/z
ION-GATE
20 kV
íons b
m/z
íons y
m/z
Ac-S P D M V M K/Q G I/L K/Q I/L
N C
Multiplicador de elétrons
Multiplica uma corrente eletrônica, por aceleração de elétrons na
superfície de um eletrodo. A colisão libera um número de elétrons
secundários maior que o número de elétrons incidentes Os elétrons
secundários são acelerados também por um outro eletrodo que por sua
vez libera outros elétrons secundários e assim por diante, resultando em
uma amplificação do sinal.
Detectores
Placa de Micros Canais (MCP)
Escorpiões Peptídeos
Anêmonas LMW
Bloqueadores de Receptores
Benzodiazipina
Parawixia bistriata
HO NH NH 2
NH NH 2
NH
O
HO NH
NH NH 2
NH
NH 2
Acylpolyamine Amide Toxins:
72 estructuras elucidadas
Non-Competitive Glutamate
Receptor Blockers
Nephila clavipes
OH O O O
NH
NH NH NH NH NH NH 2
O
HO CONH 2
O O O
NH
NH NH NH NH NH NH 2
O
NH CONH 2
O O O
NH
NH NH NH NH NH NH 2
O
HO NH CONH 2
Nephila clavipes Web
Insecto Toxins
Inseticidas
OH
NH CH2 CH3
CH3
N
CH2
NH
HO CH3 O
.Fe
NH2
5-hidroximetil-2-aminometil-N-carbonilamino-2-metilpropilfenona
Jelly Fish: Caribdea alata
OH O
OH
OH
O
Inflammatory factor: O
OH
OH
OH
Aplicações
I/L-I/L-G-T-I/L-I/L-G-I/L-I/L-K/Q-G-I/L-NH2
I/L-N-W-I/L-K/Q-I/L-G-K/Q-A-I/L-I/L-D-A-I/L-NH2
I/L-L-G-T-I-L-G-L-L-K-G-I/L-NH2
I/L-N-W-L-K-L-G-K-A-I-I-D-A-I/L-NH2
Atividades Biológicas
Degranulação de Mastócitos
Atividades Biológicas
Hemólise
Atividades Biológicas
Quimiotaxia
Atividades Biológicas
Quimiotaxia
Conclusões
A:
B2 B:
B1
Determinação Estrutural
Determinação Estrutural
Distinguindo Ile e Leu
Íons “d” e “w”
Distinguindo Ile e Leu
Íons “d” e “w”
Tempo de retenção
Determinação Estrutural
Sequência do peptídeo
I N W L K L G K M V I D A L-NH2
FR 13-1
A:
FR 13-2 B2 B:
B1
Química Degradativa de Edman
Sequeciamento N-Terminal
N-Terminal modificado
Espectro de Massas Sequencial (ESI-MS/MS)
Ac-S-A-D-L/I-V-K/Q-K/Q-L/I-W-D-N-P-A-L/I-NH2
Espectro de Massas Sequencial (ESI-MS/MS)
Ac-S-V-D-M-V-M-K/Q-G-I/L-K/Q-L/I-W-P-L/I-NH2
Uso Combinado de MS com Química de Proteínas
Polybine-I: Ac-S-A-D-L-V-K-K-I-W-D-N-P-A-L-NH2
Polybine-II: Ac-S-V-D-M-V-M-K-G-L-K-I-W-P-L-NH2
Degranulação de Mastócitos;
Hemólise;
Quimiotaxia;
Antibiose.
1 amostra
PROTEOMA
GENOMA PROTEOMA
Representa a soma de todos os genes Não é uma característica fixa no
de um organismo organismo
O material genético
pode ser expresso
de várias maneiras
“Splicing” do RNAm
Modificações pós-
traducionais
PROTEOMA
1995 Todas as proteínas expressas por um
genoma
Atualmente
Metodologia que objetiva documentar a
distribuição geral de proteínas de uma
amostra, identificar e caracterizar
proteínas individuais e principalmente
elucidar as suas associações e funções
Estudo comparativo de venenos:
identificação de proteínas de
interesse biotecnológico e
farmacológico.
SEQUENCIAMENTO PEPTÍDICO
Espectrometria de massas e/ou Sequenciamento
Automático (Química Degradativa de Edman)
Espectrometria de Massas
BIOINFORMÁTICA PROTEÔMICA
130
PROTEOMA DESCRITIVO
16 proteínas
identificadas:
Fosfolipases
Metaloproteases
43 spots comuns
Total: 239 spots diferentes
Extratos específicos para
diagnóstico e tratamento
Gel de Eletroforese Bidimensional em SDS-PAGE 15%(m/v) do veneno da vespa social Polybia
paulista. As proteínas foram focalizadas em fitas de pI de 3 a 10, com 13 cm de comprimento.
Aproximadamente, 225 proteínas foram detectadas pela coloração com CBB.
IMUNODETECÇÃO
Soros dos pacientes sensibilizados com o veneno da vespa Polybia paulista x Veneno da vespa P. paulista
16 proteínas imunoreativas
kDa
50
40
30
25
40
30
25