PROTEIN

Nama protein berasal dari bahasa Yunani yang berarti “yang paling utama”.
Sedangkan pengertian protein secara umum adalah senyawa organik kompleks
berbobot molekul tinggi yang merupakan polimer dari monomer-monomer asam amino
yang dihubungkan satu sama lain dengan ikatan peptida. Molekul protein
mengandung karbon, hidrogen, oksigen, nitrogen dan kadang kala sulfur serta fosfor. 

 Karakteristik Protein
Protein adalah senyawa organik kompleks
berbobot molekul tinggi yang merupakan polimer dari
monomer-monomer asam amino yang dihubungkan
satu sama lain dengan ikatan peptida. Molekul protein
mengandung karbon, hidrogen, oksigen, nitrogen dan
kadang kala sulfur serta fosfor. Protein berperan
penting dalam struktur dan fungsi semua sel makhluk
hidup dan virus.
Kebanyakan protein merupakan enzim atau
subunit enzim. Jenis protein lain berperan dalam fungsi
struktural atau mekanis, seperti misalnya protein yang
membentuk batang dan sendi sitoskeleton. Protein
terlibat dalam sistem kekebalan (imun) sebagai Susu Sapi Merupakan
antibodi, sistem kendali dalam bentuk hormon, Salah Satu Sumber Protein
sebagai komponen penyimpanan (dalam biji) dan
juga dalam transportasi hara. Sebagai salah satu sumber gizi, protein berperan
sebagai sumber asam amino bagi organisme yang tidak mampu membentuk asam
amino tersebut (heterotrof).
Protein merupakan salah satu dari biomolekul raksasa, selain polisakarida,
lipid, dan polinukleotida, yang merupakan penyusun utama makhluk hidup. Selain
itu, protein merupakan salah satu molekul yang paling banyak diteliti dalam
biokimia. Protein ditemukan oleh Jöns Jakob Berzelius pada tahun 1838.
Biosintesis protein alami sama dengan ekspresi genetik. Kode genetik yang
dibawa DNA ditranskripsi menjadi RNA, yang berperan sebagai cetakan bagi
translasi yang dilakukan ribosom. Sampai tahap ini, protein masih "mentah",
hanya tersusun dari asam amino proteinogenik. Melalui mekanisme pascatranslasi,
terbentuklah protein yang memiliki fungsi penuh secara biologi.

 Struktur
Struktur tersier protein.
Protein ini memiliki banyak struktur
sekunder beta-sheet dan alpha-helix
yang sangat pendek. Model dibuat
dengan menggunakan koordinat dari
Bank Data Protein (nomor 1EDH).
Struktur protein dapat dilihat
sebagai hirarki, yaitu berupa
struktur primer (tingkat satu),
sekunder (tingkat dua), tersier
(tingkat tiga), dan kuartener (tingkat
empat). Struktur primer protein
merupakan urutan asam amino
penyusun protein yang
dihubungkan melalui ikatan peptida
(amida). Sementara itu, struktur sekunder protein adalah struktur tiga dimensi
lokal dari berbagai rangkaian asam amino pada protein yang distabilkan oleh
ikatan hidrogen. Berbagai bentuk struktur sekunder misalnya ialah sebagai
berikut:
  alpha helix (α-helix, "puntiran-alfa"), berupa pilinan rantai asam-asam amino
berbentuk seperti spiral;
 beta-sheet (β-sheet, "lempeng-beta"), berupa lembaran-lembaran lebar yang
tersusun dari sejumlah rantai asam amino yang saling terikat melalui ikatan
hidrogen atau ikatan tiol (S-H);
 beta-turn, (β-turn, "lekukan-beta"); dan
 gamma-turn, (γ-turn, "lekukan-gamma").
Gabungan dari aneka ragam dari struktur sekunder akan menghasilkan
struktur tiga dimensi yang dinamakan struktur tersier. Struktur tersier biasanya
berupa gumpalan. Beberapa molekul protein dapat berinteraksi secara fisik tanpa
ikatan kovalen membentuk oligomer yang stabil (misalnya dimer, trimer, atau
kuartomer) dan membentuk struktur kuartener. Contoh struktur kuartener yang
terkenal adalah enzim Rubisco dan insulin.
Struktur primer protein bisa ditentukan dengan beberapa metode: (1)
hidrolisis protein dengan asam kuat (misalnya, 6N HCl) dan kemudian komposisi
asam amino ditentukan dengan instrumen amino acid analyzer, (2) analisis
sekuens dari ujung-N dengan menggunakan degradasi Edman, (3) kombinasi dari
digesti dengan tripsin dan spektrometri massa, dan (4) penentuan massa molekular
dengan spektrometri massa.
Struktur sekunder bisa ditentukan dengan menggunakan spektroskopi
circular dichroism (CD) dan Fourier Transform Infra Red (FTIR). Spektrum CD dari
puntiran-alfa menunjukkan dua absorbans negatif pada 208 dan 220 nm dan
lempeng-beta menunjukkan satu puncak negatif sekitar 210-216 nm. Estimasi dari
komposisi struktur sekunder dari protein bisa dikalkulasi dari spektrum CD. Pada
spektrum FTIR, pita amida-I dari puntiran-alfa berbeda dibandingkan dengan pita
amida-I dari lempeng-beta. Jadi, komposisi struktur sekunder dari protein juga
bisa diestimasi dari spektrum inframerah.
Struktur protein lainnya yang juga dikenal adalah domain. Struktur ini
terdiri dari 40-350 asam amino. Protein sederhana umumnya hanya memiliki satu
domain. Pada protein yang lebih kompleks, ada beberapa domain yang terlibat di
dalamnya. Hubungan rantai polipeptida yang berperan di dalamnya akan
menimbulkan sebuah fungsi baru berbeda dengan komponen penyusunnya. Bila
struktur domain pada struktur kompleks ini berpisah, maka fungsi biologis
masing-masing komponen domain penyusunnya tidak hilang. Inilah yang
membedakan struktur domain dengan struktur kuartener. Pada struktur
kuartener, setelah struktur kompleksnya berpisah, protein tersebut tidak
fungsional.

 Kekurangan Protein
Protein sendiri mempunyai banyak sekali fungsi di tubuh kita. Pada
dasarnya protein menunjang keberadaan setiap sel tubuh, proses kekebalan
tubuh. Setiap orang dewasa harus sedikitnya mengkonsumsi 1 g protein pro kg
berat tubuhnya. Kebutuhan akan protein bertambah pada perempuan yang
mengandung dan atlet-atlet. Kekurangan Protein bisa berakibat fatal:
 Kerontokan rambut (Rambut terdiri dari 97-100% dari Protein -Keratin)
 Yang paling buruk ada yang disebut dengan Kwasiorkor, penyakit kekurangan
protein. Biasanya pada anak-anak kecil yang menderitanya, dapat dilihat dari
yang namanya busung lapar, yang disebabkan oleh filtrasi air di dalam
pembuluh darah sehingga menimbulkan odem.Simptom yang lain dapat
dikenali adalah:
 hipotonus
 gangguan pertumbuhan
 hati lemak
 Kekurangan yang terus menerus menyebabkan marasmus dan berkibat
kematian.
 Sintese protein
Dari makanan kita memperoleh Protein. Di sistem pencernaan protein akan
diuraikan menjadi peptid peptid yang strukturnya lebih sederhana terdiri dari
asam amino. Hal ini dilakukan dengan bantuan enzim. Tubuh manusia
memerlukan 9 asam amino. Artinya kesembilan asam amino ini tidak dapat
disintesa sendiri oleh tubuh esensiil, sedangkan sebagian asam amino dapat
disintesa sendiri atau tidak esensiil oleh tubuh. Keseluruhan berjumlah 21 asam
amino. Setelah penyerapan di usus maka akan diberikan ke darah. Darah
membawa asam amino itu ke setiap sel tubuh. Kode untuk asam amino tidak
esensiil dapat disintesa oleh DNA. Ini disebut dengan DNAtranskripsi. Kemudian
mRNA hasil transkripsi di proses lebih lanjut di ribosom atau retikulum
endoplasma, disebut sebagai translasi.

 Sumber Protein
 DagingIkan
 Telur
 Susu, dan produk sejenis Quark
 Tumbuhan berbji
 Suku polong-polongan
 Kentang
Studi dari Biokimiawan USA Thomas Osborne Lafayete Mendel, Profesor
untuk biokimia di Yale, 1914, mengujicobakan protein konsumsi dari daging dan
tumbuhan kepada kelinci. Satu grup kelinci-kelinci tersebut diberikan makanan
protein hewani, sedangkan grup yang lain diberikan protein nabati. Dari
eksperimennya didapati bahwa kelinci yang memperoleh protein hewani lebih cepat
bertambah beratnya dari kelinci yang memperoleh protein nabati. Kemudian studi
selanjutnya, oleh McCay dari Universitas Berkeley menunjukkan bahwa kelinci
yang memperoleh protein nabati, lebih sehat dan hidup dua kali lebih lama.

 Keuntungan Protein
 Sumber energi
 Pembetukan dan perbaikan sel dan jaringan
 Sebagai sintesis hormon,enzim, dan antibody
 Pengatur keseimbangan kadar asam basa dalam sel

 Ciri-ciri Molekul Protein

1. Berat molekulnya cukup besar, dan dapat mencapai ribuan bahkan jutaan
sehingga merupakan suatu makromolekul.
2. Pada Umumnya terdiri dari 20 macam asam amino, asam amino tersebut
berkaitan secara kovalen satu dengan yang lainnya dalam variasi urutan yang
bermacam - macam membentuk suatu rantai polipeptida.
3. Ikatan kimia lainnya menyebabkan terbentuknya lengkungan -lengkungan
rantai polipeptida menjadi struktur tiga dimensi protein, sebagai contohnya
yaitu ikatan hidrogen dan ikatan ion.
4. Struktur tidak stabil terhadap beberapa faktor, antara lain, pH, radiasi,
temperatur, dan pelarut organik.

 Penggolongan Protein Berdasarkan Fungsi

 Enzim merupakan protein yang berfungsi sebagai kataisator brokimia. Hamper
semua reaksi organic dapat di katalisis oleh enzim. Aktivitas enzim bergantung
pada ketahanan struktur sekunder, tersier, dan kuarter. Suatu enzim
merupakan protein elips yang sisa asam amino polarnya ada bagian luar
sehingga dapat dipastikan larutan dalam cairan tubuh.
 Protein transport merupakan protein yang mengikat dan memindahkan molekul
atau sel darah merah mengikat oksigen di paru-paru dan mengedarkannya ke
seluruh tubuh.
 Protein natrium (penyimpan) adalah proteinyang berfungsi mengubah energi
kimia menjadi energy gerak. Misalnya, aktin dan myosin yang berperan dalam
system kontraksi otot rangka.
  Protein struktur adalah protein yang berperan dalam kekuatan struktur biologi
atau perlindungan. Misalnya, kalagen (banyak terdapat pada rambut, kuku,
bulu burung), fibrion (komponen utama pada serat surat dan jarring laba-laba).
 Protein pertahanan (antibody) adalah protein yang melindungi organisme
terhadap serangan organisme lain (penyakit). Misalnya, imunoglobin atau anti
bodi dapat menetralkan protein asing ilepaskan oleh bakteri dan virus.
 Protein pengatur, yaitu protein yang berfungsi mengatur aktivitas seluler atau
fisiologi. Contohnya: ialah hormone, seperti insulin yang mengatur metabolism
gula darah. Kekurangan insulin akan menyebabkan penyakit diabetes. Contoh
lain adalah hormone pertumbuhan dan hormone sex.
 Protein kontraktil, yaitu protein yang memberikan kemampuan pada sel dan
organisme untuk mengubah bentuk atau bergerak. Contohnya ialah aktin dan
myosin, yaitu protein yang berperan dalam system kontraksi otot kerangka.

 Struktur Protein
Protein merupakan polimer yang tersusun dari rantai asam amino dengan
ikatan peptida. Setiap protein disusun oleh rantai asam amino yang memiliki
struktur berbeda secara kimiawi. Jumlah dan jenis asam amino pada berbagai
jenis protein juga bervariasi. Struktur protein dapat dilihat sebagai hierarki (dari
yang paling kecil sampai yang paling besar) yang terdiri dari:
1. Struktur Primer Protein
Struktur primer protein yaitu struktur sederhana dengan urutan rantai
asam amino linear yang tidak membentuk percabangan rantai. Struktur primer
dibentuk dengan ikatan peptida (amida) melalui ikatan gugus amino dengan
gugus karboksil. Struktur ini menentukan urutan asam amino dari suatu
polipeptida, juga menentukan sifat dasar protein tersebut dan bentuk struktur
sekunder juga bentuk tersiernya.

2. Struktur Protein Sekunder

Struktur sekunder protein yaitu struktur susunan struktur primer yang
linear yang distabilkan oleh ikatan hidrogen. Akibat kekuatan tarik-menarik
antar asam amino dalam rangkaian komponen tersebut, maka akan terbentuk
struktur utama yang membelit, melingkar, dan melipat. Bentuk yang dihasilkan
bisa berupa bentuk spiral, heliks, dan lembaran.

3. Struktur Tersier Protein

Struktur tersier protein yaitu struktur gabungan dari beberapa struktur
sekunder yang biasanya akan membentuk seperti gumpalan. Penggabungan
antar struktur sekunder ini bisa dilakukan dengan ikatan hidrogen, Ikatan ion,
ikatan kovalen, dan ikatan hidrofobik.

4. Struktur Kuarterner Protein

Struktur kuarterner protein yaitu struktur tiga dimensi yang dibentuk
dari gabungan beberapa subunit protein dari struktur tersier atau struktur
sekunder maupun struktur primer. Ikatan yang menjaga struktur kuarterner
adalah ikanan non-kovalen. Struktur ini akan membentuk protein kompleks
yang fungsional.

 Klasifikasi Jenis Protein

1. Berdasarkan Komponen Penyusunnya
 Protein Sederhana
Protein sederhana, yaitu protein hasil hidrolisa yang penyusunnya
hanya campuran berbagai jenis asam amino saja.
 Protein Kompleks
Protein kompleks, yaitu protein hasil hidrolisa yang selain memiliki
berbagai asam amino juga disusun oleh komponen lain seperti unsur logam
dan fosfat.
 Protein Derivat
Protein Derivat, yaitu ikatan hasil hidrolisa parsial (tidak sempurna)
protein native (protein dasar/natural).
 2. Berdasarkan Sumbernya
 Protein Nabati
Protein nabati, yaitu protein yang bersumber dari tumbuhan seperti
buah, sayur dan kacang-kacangan.
 Protein Hewani
Protein hewani, yaitu protein yang bersumber dari hewan seperti
daging, telur dan susu.

3. Berdasarkan Fungsinya
 Protein Sempurna
Protein sempurna, yaitu protein yang memiliki asam amino lengkap
jenis dan jumlahnya sehingga dapat menjalankan fungsi pertumbuhan dan
bisa mempertahankan kondisi suatu sel atau jaringan.
 Protein Kurang Sempurna
Protein kurang sempurna yaitu protein yang memiliki asam amino
lengkap tapi dalam jumlah sedikit, sehingga tidak bisa menjalankan fungsi
pertumbuhan namun tetap mampu mempertahankan kondisi optimal suatu
sel atau jaringan.
 Protein Tidak Sempurna
Protein tidak sempurna, yaitu protein yang hanya memiliki atau
bahkan tidak memiliki asam amino esensial, sehingga fungsi untuk
pertumbuhan dan menjaga kondisi optimal tidak bisa dijalankan. Terdapat 2
jenis asam amino yang dalam protein yaitu asam amino essensial dan asam
amino non essensial.
1) Asam amino esensial, yaitu asam amino yang tidak dapat dibentuk oleh
tubuh manusia. Sehingga asam amino esensial bisa terpenuhi dari
makanan berprotein yang berasal dari hewan atau tumbuhan.
2) Asam amino non esensial, yaitu jenis asam amino yang dapat dibentuk
atau diproduksi di dalam tubuh manusia.

4. Sumber Protein
Terdapat dua jenis sumber protein diantaranya yaitu:
1) Sumber Protein Nabati, yaitu protein yang sumbernya berasal dari
tumbuhan. Contohnya sayur (bayam, brokoli dll), buah dan kacang-
kacangan (kedelai, almond, gandum dll).
2) Sumber Protein Hewani, yaitu protein yang sumbernya berasal dari hewan.
Contohnya daging, telur, susu, dan lain sebagainya.

 Penggolongan Protein  Berdasarkan Komposisi kimia

 Protein sederhana. Protein yang tersusun atas satuan asam amino saja.
Contoh : valin, glisin, alanin.
 Protein terkonjugasi. Protein yang tersusun atas sejumlah asam amino dan
yang bukan asam amino. Contoh : hemoprotein, glikoprotein, metal protein,
lipoprotein, fosfoprotein.

 Penggolongan Protein Berdasarkan bentuk

Berdasar bentuknya protein digolongkan menjadi dua, yaitu protein globular
dan protein serabut. Protein globular memiliki rantai polipeptida berlipat rapat
menjadi bentuk bulat padat (globular), yang memiliki fungsi gerak. Contoh:
Hemoglobin dan enzim