Diterjemahkan dari bahasa Inggris ke bahasa Indonesia - www.onlinedoctranslator.
com
Evolusi hiperosifikasi memperluas keragaman tengkorak pada
katak
Daniel J. Paluha,b,1-, Edward L. StanleyA-, dan David C. BlackburnA-
ADepartemen Sejarah Alam, Museum Sejarah Alam Florida, Universitas Florida, Gainesville, FL 32611; danBDepartemen Biologi, Universitas Florida, Gainesville, FL
32611
Diedit oleh Neil H. Shubin, University of Chicago, Chicago, IL, dan disetujui 28 Februari 2020 (diterima untuk ditinjau 16 Januari 2020)
Katak (Anura) adalah salah satu ordo vertebrata yang paling beragam, terdiri lebih dari 7.000
spesies dengan distribusi di seluruh dunia dan keanekaragaman ekologi yang luas. Berbeda
dengan tetrapoda lainnya, katak memiliki bentuk tubuh yang sangat rendah dan tengkorak yang
disederhanakan. Dalam banyak garis keturunan anuran, peningkatan mineralisasi telah
menyebabkan tengkorak yang mengalami hiperosifikasi, tetapi fungsi sifat ini dan hubungannya
dengan aspek lain dari morfologi kepala sebagian besar belum dieksplorasi. Menggunakan data
morfologi tiga dimensi dari 158 spesies yang mewakili semua keluarga katak, kami menilai pola
skala besar variasi bentuk di semua garis keturunan utama, merekonstruksi sejarah evolusi
hiperosifikasi tengkorak di seluruh filogeni anuran, dan menguji hubungan antara ekologi,
bentuk tengkorak, dan hiperosifikasi. Meskipun banyak katak memiliki bentuk tengkorak yang
sama, beberapa bentuk ekstrem telah berulang kali berevolusi yang umumnya dikaitkan dengan
hiperosifikasi, yang telah berevolusi secara independen lebih dari 25 kali. Variasi bentuk
tengkorak tidak dijelaskan oleh hubungan filogenetik tetapi berkorelasi dengan pergeseran
ukuran tubuh dan ekologi. Spesies dengan tengkorak hiperosifikasi yang sangat berbeda sering
kali memiliki makanan khusus atau mekanisme pertahanan pemangsa yang unik. Dengan
demikian, evolusi hiperosifikasi telah berulang kali memfasilitasi perluasan kepala menjadi
berbagai bentuk dan fungsi baru. tengkorak hyperossified sering memiliki diet khusus atau
mekanisme pertahanan predator yang unik. Dengan demikian, evolusi hiperosifikasi telah
berulang kali memfasilitasi perluasan kepala menjadi berbagai bentuk dan fungsi baru.
tengkorak hyperossified sering memiliki diet khusus atau mekanisme pertahanan predator yang
unik. Dengan demikian, evolusi hiperosifikasi telah berulang kali memfasilitasi perluasan kepala
menjadi berbagai bentuk dan fungsi baru.
Anura | tengkorak | ornamen kulit | morfometrik geometris |
tomografi mikrokomputer
Saya
mengidentifikasi faktor-faktor yang mendorong perubahan evolusioner di
kepala vertebrata telah menjadi tantangan lama karena kesulitan
pengambilan sampel taksa secara luas, mengukur morfologi kompleks, dan
mengidentifikasi kemungkinan mekanisme yang bertanggung jawab untuk
menghasilkan pola makroevolusi. Tekanan selektif beragam diusulkan
untuk mendorong derivasi ekstrim di tengkorak termasuk spesialisasi
dalam biologi makan (1), penggunaan habitat (2), dan penggerak (3). Seleksi
seksual juga diperkirakan mempengaruhi morfologi kepala karena
tengkorak seringkali dimorfik secara seksual dalam ukuran dan bentuk (4,
5). Interaksi di antara tekanan selektif ini dapat menghasilkan pertukaran
fungsional (6) yang membentuk kepala sebagai sistem terintegrasi yang
harus menampung organ sensorik, menangkap mangsa, memberikan
perlindungan, dan mengambil bagian dalam penggerak dan reproduksi (7).
Mekanisme nonadaptif kendala arsitektur (yaitu, alometri; ref. 8) dan
konservatisme filogenetik (9) juga telah dipanggil untuk menjelaskan variasi
morfologi di dalam dan di seluruh garis keturunan, terutama dalam kasus di
mana pergeseran ekstrim tidak ada. Diversifikasi tengkorak biasanya hasil
dari perubahan ukuran atau bentuk elemen yang sudah ada sebelumnya
atau hilangnya tulang (10), tetapi asal usul struktur baru juga mungkin
bertanggung jawab atas pergeseran morfologi (11).
Peningkatan mineralisasi atau hiperosifikasi tengkorak merupakan ciri
yang berulang di antara vertebrata; itu juga dikenal sebagai ornamen kulit
(12, 13). Dalam bentuknya yang paling sederhana, tulang membran
Diunduh di Indonesia: PNAS Disponsori pada 31 Oktober 2021
tambahan diendapkan pada kerangka untuk membentuk punggungan dan
puncak yang menghasilkan pola retikulat atau lubang pada permukaan
tulang (eksostosis), tetapi, dalam kasus yang ekstrim, hiperosifikasi dapat
menyebabkan pembentukan helm. seperti tonjolan (casquing) atau
koosifikasi antara kerangka dan dermis (14). Hiperosifikasi diduga hasil dari
proses heterokronik dari
8554–8562 | PNAS | 14 April 2020 | jilid 117 | tidak. 15
peramorphosis, yang merupakan perpanjangan atau percepatan
lintasan ontogenetik leluhur (15). Meskipun kejadiannya tersebar luas
di actinopterygians, amfibi, dan amniota, peran fungsional
hiperosifikasi dan hubungannya dengan aspek lain dari morfologi
kepala, seperti bentuk tengkorak, sebagian besar belum dieksplorasi.
Evolusi tengkorak telah dipelajari dengan buruk menggunakan metode
kontemporer pada anuran (katak dan kodok) relatif terhadap lebih banyak
spesies garis keturunan miskin [misalnya, mamalia karnivora (1, 16) dan
buaya (17, 18)]. Tengkorak katak dapat dipelajari karena diasumsikan bahwa
Bauplan yang sangat diturunkan dan morfologi kerangka dari clade ini
dilestarikan dengan ketat (19). Karya Trueb (14) mewakili satu-satunya
deskripsi komprehensif osteologi tengkorak pada anuran, tetapi jumlah
spesies yang dijelaskan telah meningkat lebih dari dua kali lipat sejak
publikasinya [3.260 spesies pada 1979 (20), 7.165 spesies pada 2020 (21)],
dan pemahaman kita tentang pohon kehidupan anuran telah berubah
secara mendasar dengan perkembangan filogenetik molekuler (22-24).
Anatomi tengkorak katak umumnya dianggap berkorelasi dengan ukuran
tubuh (25), biologi makan (26), dan penggunaan mikrohabitat [misalnya,
terestrial, akuatik, fosil (14, 27)]. Kebanyakan anuran memiliki tengkorak
yang disederhanakan [karena berkurangnya jumlah elemen tengkorak
dibandingkan dengan amfibi lain (22)] yang bertindak sebagai perancah
pendukung untuk organ sensorik kepala (28), tetapi beberapa spesies
memiliki peningkatan osifikasi [misalnya, beberapa kodok bufonid, hylids
berkepala casque (22)]. Hiperosifikasi kranial adalah
Makna
Kepala vertebrata adalah sistem terintegrasi yang penting untuk
fungsi sensorik, menangkap mangsa, dan mekanisme pertahanan.
Anatomi kepala telah lama menarik perhatian ahli biologi, namun
mengidentifikasi faktor-faktor yang bertanggung jawab atas
evolusi bentuk morfologi yang menyimpang tetap menjadi
tantangan lama. Katak adalah salah satu ordo vertebrata yang
paling beragam tetapi belum dipelajari secara menyeluruh
sehubungan dengan variasi morfologi tengkorak. Kami
menggunakan pengambilan sampel ekstensif dari semua garis
keturunan utama untuk mengukur keragaman tengkorak,
merekonstruksi evolusi peningkatan mineralisasi (hiperosifikasi),
dan menguji hubungan antara ekologi, bentuk tengkorak, dan
hiperosifikasi. Kami menemukan bahwa beberapa bentuk
tengkorak ekstrem telah berulang kali berevolusi pada katak,
hiperosifikasi telah muncul secara independen berkali-kali,
Kontribusi penulis: penelitian yang dirancang DJP, ELS, dan DCB; DJP melakukan penelitian; DJP
menganalisis data; DJP, ELS, dan DCB menulis makalah; dan DJP dan ELS menghasilkan data CT.
Para penulis menyatakan tidak ada kepentingan bersaing.
Artikel ini adalah PNAS Direct Submission.
Artikel akses terbuka ini didistribusikan di bawah Lisensi Atribusi-NonKomersial-Tanpa Turunan
Creative Commons 4.0 (CC BY-NC-ND).
Deposisi data: Data tomografi terkomputasi (tumpukan tiff dan file mesh) telah disimpan di
MorphoSource (lihat Kumpulan Data S1 untuk DOI). Data dan skrip untuk semua analisis tersedia
di GitHub dihttps://github.com/dpaluh/hyperossification.
1Kepada siapa korespondensi dapat ditujukan. Email: dpaluh@ufl.edu.
Artikel ini berisi informasi pendukung online di https://www.pnas.org/lookup/suppl/ doi:10.1073/
pnas.2000872117/-/DCSupplemental.
Diterbitkan pertama kali 27 Maret 2020.
www.pnas.org/cgi/doi/10.1073/pnas.2000872117
 diekspresikan pada lima elemen dermal (frontoparietal, nasal, premaxilla,
maxilla, squamosal) dan tiga tulang baru (prenasal, internasal, dermal
sphenethmoid) pada katak (29). Meskipun hiperosifikasi telah dijelaskan
dalam keragaman taksa, belum ada upaya untuk menguji jumlah asal-usul
sifat ini atau fungsinya pada anuran yang masih ada. Peningkatan
mineralisasi telah dihipotesiskan untuk membantu dalam pencegahan
kehilangan air melalui penguapan di mikrohabitat kering (14, 30),
memperkuat tengkorak untuk menangkap mangsa besar (27), atau
memperkuat tengkorak untuk perlindungan terhadap predator pada katak
yang menggunakan kepala mereka untuk mengisi. rongga atau lubang blok
[disebut perilaku phragmotic (27, 29)]. Bergantian, hyperossification
mungkin timbul sebagai produk sampingan dari miniaturisasi (31).
Menggunakan filogeni kaya spesies terbaru dari spesies amfibi yang
masih ada (32) dan pengambilan sampel taksonomi yang luas melalui
tomografi mikrokomputer sinar-X resolusi tinggi (158 spesies yang mewakili
semua 54 famili anuran yang dijelaskan), kami 1) mengevaluasi pola skala
luas dari keragaman bentuk tengkorak di semua garis keturunan katak
utama, 2) merekonstruksi sejarah evolusi hiperosifikasi tengkorak, dan 3)
menguji cara ukuran tubuh, biologi makan, penggunaan habitat mikro, dan
perilaku pertahanan phragmotic dikaitkan dengan bentuk tengkorak dan
berinteraksi dengan hiperosifikasi. Hasil kami menunjukkan bahwa,
meskipun banyak garis keturunan berbagi bentuk tengkorak yang
dilestarikan, beberapa arsitektur tengkorak yang sangat berbeda telah
berevolusi berulang kali sepanjang sejarah evolusi katak. Hiperosifikasi
telah berkembang secara independen berkali-kali dan sering terjadi
bersamaan dengan bentuk tengkorak yang berbeda. Ukuran tubuh,
penggunaan mikrohabitat, dan biologi makan masing-masing berkorelasi
dengan variasi bentuk kepala, dan predasi vertebrata dan perilaku
pertahanan phragmotic terjadi bersamaan dengan hiperosifikasi dan
bentuk tengkorak yang ekstrem.
Hasil
Keanekaragaman dalam Bentuk Tengkorak. Kami menggunakan
analisis morfometrik geometris tiga dimensi (3D) pada 36
landmark tetap (Lampiran SI, Gambar. S1) dalam paket R
geomorph versi 3.0.3 (33) untuk mengukur variasi bentuk di
antara tengkorak dari semua garis keturunan utama katak (Gbr.
1). Sumbu PC1 (21% variasi) terutama menggambarkan perbedaan
bentuk yang didorong oleh posisi relatif dari sendi rahang,
panjang dan lebar relatif frontoparietal, tinggi relatif tengkorak,
dan bentuk moncong dalam tampilan punggung (Gbr. 2,
tengkorak A dan B). Sumbu PC2 (16%) terutama menggambarkan
perbedaan bentuk yang didorong oleh ukuran relatif skuamosa
dan prosesusnya (ramus zigomatikus [proses anterior] dan ramus
otikus [prosesus posterior]), tinggi relatif tengkorak, dan lebar
relatif tengkorak ( Gambar. 2, tengkorak C dan D). Sumbu PC3
(11%) terutama menggambarkan perbedaan bentuk yang
didorong oleh tingkat fenestrasi pada atap tengkorak (Gbr. 2,
tengkorak E dan F).banyak = 0,52, P < 0,005). Spesies yang mendekati
nilai minimum dan maksimum PC1 hingga PC3 tersebar di seluruh
filogeni (Gbr. 1 danLampiran SI,Gambar. S2), menunjukkan bahwa
bentuk yang sangat berbeda telah berevolusi berulang kali. Tidak
ada dukungan untuk sinyal filogenetik dalam ukuran pusat
tengkorak (Kbanyak = 0,42, P = 0,07). Sebuah regresi filogenetik
menunjukkan ada ukuran positif untuk membentuk hubungan
(derajat kebebasan [df], 1; jumlah kuadrat [SS], 0,004845; berarti
kuadrat [MS], 0,004845; R2, 0,09035; F-rasio [F], 15,494; skor Z [Z],
7,0476;P < 0,005; Gambar 3A); spesies kecil memiliki cangkang
otak dan kapsul sensorik yang relatif besar berbeda dengan
spesies besar, yang memiliki cangkang otak kecil dan elemen
dermal yang diperluas.
Diunduh di Indonesia: PNAS Disponsori pada 31 Oktober 2021
Rekonstruksi Leluhur Hiperosifikasi. Hiperosifikasi
terjadi di 44 dari 158 taksa anuran di dataset kami dan didistribusikan di 39
genera dan 17 keluarga (Gbr. 1). Kami menggunakan rantai Markov
reversibeljump Monte Carlo (MCMC) di RevBayes (34) untuk mengambil
sampel kelima model Markov dari evolusi karakter fenotipik secara
proporsional dengan probabilitas posteriornya, dan maksimum a
Paluh dkk.
model posteriori evolusi hiperosifikasi adalah model satu tingkat
dengan probabilitas posterior 0,9 (Lampiran SI, Tabel S1). Model
ini sangat didukung pada model dua tingkat (faktor Bayes = 10,45)
dan kedua model ireversibel (faktor Bayes > 100;Lampiran SI,
Tabel S1). Rata-rata model keadaan leluhur katak posteriori tidak
mengalami hiperosifikasi dengan probabilitas posterior 0,99.
Hyperossification muncul secara independen 30 kali selama
filogeni, dan satu pembalikan dari hyperossified ke
nonhyperossified disimpulkan (Gbr. 1). Hiperosifikasi telah terjadi
3 kali di Mesobatrachia, 8 kali di Ranoidea, 18 kali di Hyloidea, dan
sekali di Calyptocephalellidae.
Ekologi, Bentuk Tengkorak, dan Hiperosifikasi. filogenetik multi-
Uji analisis varians (MANOVA) menunjukkan bahwa ada hubungan
yang signifikan antara penggunaan mikrohabitat (akuatik, arboreal,
fosil, terestrial) dan bentuk tengkorak (df, 3; SS, 0,002909; MS,
0,0009676; R2, 0,05425; F, 2.9447; Z, 4,8252;P <0,005; Gambar 2.A dan
B), biologi makan (predator invertebrata, predator vertebrata) dan
bentuk tengkorak (df, 1; SS, 0,002078; MS, 0,00207767; R2, 0,03846; F,
6.2877; Z, 5.0498;P < 0,005; Gambar 2.Cdan D), dan perilaku
phragmotic (ada, tidak ada) dan bentuk tengkorak (df, 1; SS, 0,001764;
MS, 0,00176366; R2, 0,03289; F, 5,3051; Z, 4.3166;P < 0,005; Gambar 2.A
dan B). Perbandingan berpasangan post hoc menunjukkan semua
kategori habitat mikro berbeda secara signifikan satu sama lain dalam
bentuk tengkorak rata-rata (Lampiran SI, Tabel S2). Tidak ada
perbedaan disparitas morfologi antara spesies hyperossified dan
EVOLUSI
nonhyperossified spesies (P = 0,14; nonhyperossified [NH] Procrustes
varians, 0,0261; hyperossified [H] varians Procrustes, 0,0318), tetapi
ada perbedaan yang signifikan dalam laju bersih evolusi morfologi
antara kedua kelompok (rasio laju yang diamati, 1,75;P = 0,0001),
dengan spesies yang mengalami hiperosifikasi secara fenotipik
berevolusi dua kali lebih cepat dari spesies yang tidak mengalami
hiperosifikasi (laju NH, 2,60 × 106; Tingkat H, 4,56× 106). Sebuah
MANOVA filogenetik menunjukkan bahwa bentuk tengkorak rata-rata
spesies hyperossified dan spesies nonhyperossified berbeda (df, 1; SS,
0,003657; MS, 0,0036575; R2, 0,0682; F, 11.419; Z, 6.7622;P < 0,005),
dengan demikian menunjukkan bahwa hiperosifikasi dikaitkan dengan
pergeseran morfologi tengkorak (Gbr. 1 dan 2). Interaksi faktor dan
homogenitas uji lereng menunjukkan tidak ada interaksi antara
hiperosifikasi dan ukuran tengkorak (derajat kebebasan residual
[ResDf], 154; jumlah kuadrat sisa [RSS], 0,044520; SS, 0,00035929; MS,
0,00035929; R2, 0,0067; F, 1,2428; Z, 0,77042;P = 0.22018; Gambar 3A)
dan tidak ada perbedaan panjang vektor kemiringan alometrik (P =
0,40) atau sudut (P =0,22) antara spesies hyperossified dan
nonhyperossified (Gbr. 3A).
Terdapat interaksi faktor yang signifikan antara hiperosifikasi dan
mikrohabitat setelah memperhitungkan masing-masing efek utama (ResDf,
150; RSS, 0,044780; SS, 0,0022117; MS, 0,00073725; R2, 0,041245; F, 2.4695;
Z, 3,8373;P < 0,005; Gambar 2.A dan B). Perbandingan berpasangan post
hoc menunjukkan bahwa interaksi terutama didorong oleh perbedaan
bentuk tengkorak antara katak terestrial yang mengalami hiperosifikasi dan
katak terestrial yang tidak mengalami hiperosifikasi dan perbedaan bentuk
tengkorak antara katak terestrial yang mengalami hiperosifikasi dan katak
arboreal yang mengalami hiperosifikasi (Lampiran SI, Tabel S3). Interaksi
faktor yang signifikan ditemukan antara hiperosifikasi dan biologi pakan
(ResDf, 154; RSS, 0,047777; SS, 0,00086747; MS, 0,00086747; R2, 0,016177; F,
2.7961; Z, 3,0178;P < 0,005; Gambar 2.C dan D), dan perbandingan
berpasangan post hoc mengungkapkan bahwa interaksi didorong oleh
perbedaan bentuk tengkorak antara predator vertebrata yang mengalami
hiperosifikasi dan predator vertebrata yang tidak mengalami hiperosifikasi (
Lampiran SI, Tabel S4). Taring odontoid tercatat pada rahang bawah dari 11
spesies (dari 158 yang diperiksa), dan gigi mandibula yang sebenarnya
diidentifikasi pada satu spesies (Gbr. 1 danLampiran SI). Sembilan dari 11
taksa dengan taring odontoid adalah predator vertebrata yang mengalami
hiperosifikasi (Kumpulan Data S1). Semua spesies anuran yang diketahui
menunjukkan perilaku pertahanan phragmotic juga adalah
PNAS | 14 April 2020 | jilid 117 | tidak. 15 |8555
 Gambar 1. Pohon filogenetik katak yang menggambarkan evolusi bentuk tengkorak dan hiperosifikasi. Gradien warna cabang sesuai dengan kemungkinan maksimum
bentuk tengkorak leluhur (PC2): Garis keturunan dengan skor positif (putih) memiliki tengkorak yang sempit dan rata, sedangkan garis keturunan dengan skor negatif
(hitam) memiliki tengkorak yang lebar dan tinggi. Warna titik simpul sesuai dengan model Bayesian rata-rata kondisi leluhur hiperosifikasi tengkorak katak: putih, tidak
ada; hitam, hadir. Ukuran setiap titik simpul mewakili probabilitas posterior dari keadaan leluhur yang paling mungkin. Warna titik ujung sesuai dengan keadaan
hiperosifikasi, diet, dan habitat mikro untuk semua 158 spesies. Garis horizontal pada titik diet menunjukkan adanya taring odontoid, dan garis vertikal pada titik
mikrohabitat menunjukkan adanya perilaku phragmotic.Lampiran SI, Gambar. S4, dan data sifat yang sesuai disediakan di Kumpulan Data S1.

hiperosifikasi; oleh karena itu, interaksi faktor antara dua sifat tempurung otak yang besar dan dermatokranium yang berkurang (misalnya,
tidak mungkin. Paedophryne swiftorum; Gambar 4, tengkorak 5) dibandingkan dengan spesies
besar (misalnya, Conraua goliat; Gambar 4, tengkorak 6), pola yang sebelumnya
Diskusi ditemukan pada katak (35). Cangkang otak yang relatif besar dan kapsul sensorik
Diunduh di Indonesia: PNAS Disponsori pada 31 Oktober 2021

Keanekaragaman dalam Bentuk Tengkorak. Kami mengidentifikasi keragaman tengkorak
yang substansial di 158 spesies anuran yang diperiksa (Gbr. 4). Keterkaitan filogenetik
tidak menjelaskan variasi dalam tengkorak, seperti yang ditunjukkan oleh beberapa
garis keturunan yang secara konvergen berkembang menjadi bentuk ekstrem yang
serupa (Gbr. 2A dan B). Hubungan alometrik yang signifikan mencirikan semua
tengkorak katak dalam kumpulan data kami. Anuran kecil memiliki
yang diamati pada spesies miniatur menunjukkan neurokranium mungkin
memiliki minimum kritis, dibatasi cukup besar untuk menampung otak dan organ
sensorik. Bentuk tengkorak berbeda di antara katak yang menempati habitat
mikro yang berbeda. Spesies fosil dan akuatik hampir tidak tumpang tindih dalam
morphospace (Gbr. 2A dan B), dengan spesies fosil yang memiliki tengkorak
pendek dan tinggi dengan

8556 | www.pnas.org/cgi/doi/10.1073/pnas.2000872117 Paluh dkk.

 EVOLUSI

Gambar 2. Plot phylomorphospace dari (A dan C) PC1 dan PC2 dan (B dan D) Variasi bentuk sumbu PC2 dan PC3 menunjukkan keragaman morfologi tengkorak pada katak. Poin
persegi, hiperosifikasi hadir; titik lingkaran, hiperosifikasi tidak ada. Titik diwarnai dengan (A dan B) habitat mikro dan (C dan D) status diet. Poin nomor 1 sampai 30 sesuai dengan
spesies pada Gambar 4. Tengkorak A sampai F adalah spesies yang mendekati skor bentuk PC minimum dan maksimum untuk setiap sumbu variasi: tengkorak A,Nasikabatrachus
sahyadrensis (CESF 203; –PC1); tengkorak B,Conraua beccarii (TNHC 37720; +PC1); tengkorak C,Ceratophrys aurita (CAS 84998; –PC2); tengkorak D,Barbourula busuangensis (UF
70546; +PC2); tengkorak E,Hildebrandtia ornata (CAS 154657; –PC3); dan tengkorak F,Triprion petasatus (UF 98441; +PC3). (Bilah skala, 1 mm.) Label spesies untuk semua titik
Diunduh di Indonesia: PNAS Disponsori pada 31 Oktober 2021

disediakan diLampiran SI, Gambar. S5.

sendi rahang anterior (+PC1; Gambar 2, tengkorak A dan Gambar 3B) dan taksa perbedaan bentuk tengkorak antara katak yang memangsa vertebrata dan yang hanya
akuatik yang memiliki tengkorak pipih memanjang dengan sendi rahang diketahui memakan invertebrata (Gbr. 2 C dan D). Sebagian besar spesies yang mampu
posterior (−PC1; Gbr. 2, tengkorak B dan Gbr. 3B). Kami menemukan signifikan memakan mangsa vertebrata memiliki tengkorak yang relatif tinggi

Paluh dkk. PNAS | 14 April 2020 | jilid 117 | tidak. 15 |8557

 Gambar 3. (A) Regresi multivariat antara bentuk tengkorak (RegScore) dan ukuran pusat tengkorak. Garis regresi kuadrat terkecil biasa ditampilkan untuk spesies yang mengalami
hiperosifikasi (titik hitam, garis hitam) dan spesies yang tidak mengalami hiperosifikasi (titik putih, garis putus-putus abu-abu) untuk menunjukkan kurangnya perbedaan kemiringan
antara kedua kelompok ini (lihat hasil keragaman bentuk tengkorak). Label spesies untuk semua titik disediakan diLampiran SI, Gambar S6. (B) Plot hangat lebah (67) dari skor PC
yang menggambarkan bentuk yang sangat berbeda terkait dengan habitat mikro fosorial dan akuatik (PC1), pemangsaan vertebrata (PC2), dan perilaku phragmotic (PC3). Garis
hitam, hiperosifikasi hadir; garis abu-abu, hiperosifikasi tidak ada. Garis median dan 95% CI ditampilkan untuk setiap skor PC.

dengan sendi rahang yang bergeser ke belakang, yang memungkinkan untuk menganga
lebar (Gbr. 2, tengkorak C dan ref. 26). Wilayah morphospace yang sangat berbeda
ditempati oleh spesialis myrmecophagous (makanan semut dan rayap) yang telah
berkumpul pada bentuk tengkorak yang dicirikan oleh moncong yang runcing, pendek,
titik rahang yang bergeser ke anterior, skuamosa yang berkurang, dan tengkorak yang
tinggi (misalnya,Rhinophrynus dorsalis, Hemisus guttatus, Myobatrachus gouldii;
Gambar 4, tengkorak 13 sampai 18). Bentuk kepala yang ekstrem ini kemungkinan lebih
didorong oleh pola makan daripada mode lokomotor yang menggali, seperti yang
ditunjukkan oleh Vidal-Garcia dan Keogh (9) bahwa di antara katak myobatrachid yang
menggali, hanya spesialis semut dan rayap yang memiliki moncong pendek dan runcing.
Katak pipid tanpa lidah memiliki tengkorak yang aneh dan pipih (misalnya,pipa parva;
Gambar 4, tengkorak 12; ref. 36), yang terkait erat dengan mekanisme turunannya untuk
menangkap mangsa di bawah air melalui pengisapan makanan (37, 38).
Evolusi Hiperosifikasi. Hiperosifikasi terjadi pada garis keturunan katak yang
beragam dan telah muncul secara independen lebih dari 25 kali pada
anuran hidup. Tidak adanya hiperosifikasi pada akar katak didukung oleh
catatan fosil karena semua salientian batang yang diketahui dengan bahan
tengkorak tidak mengalami hiperosifikasi.Triadobatrachus
(39), Prosalirus (40), Vieraela (41), Liaobatrachus (42)]. Spesies hyperossified
memiliki tingkat evolusi bentuk tengkorak yang lebih tinggi dibandingkan dengan
spesies nonhyperossified, yang menunjukkan bahwa katak hyperossified dapat
dengan cepat menyerang ke daerah baru morphospace. Ini juga konsisten
dengan hipotesis bahwa hiperosifikasi adalah sifat peramorfik (31) yang mungkin
terkait dengan lintasan ontogenetik yang dipercepat dan perubahan morfologi
(15, 43). Bentuk rata-rata katak hiperosifikasi berbeda secara signifikan dari taksa
nonhiperosifikasi, tetapi, sebagai sebuah kelompok, mereka tidak lebih bervariasi
(yaitu, berbeda). Garis keturunan hiperosifikasi telah berevolusi setidaknya dua
bentuk tengkorak yang sangat berbeda (ruang PC2 ekstrem, ruang +PC3 ekstrem;
Gbr. 3B), dan, jika dilihat di phylomorphospace, ada bukti evolusi berulang atau
Diunduh di Indonesia: PNAS Disponsori pada 31 Oktober 2021
lereng (Gbr. 3A); dengan demikian, hiperosifikasi tidak berkembang sebagai
produk sampingan dari miniaturisasi. Hyperossification hadir di kedua miniatur
dan spesies raksasa (berkisar dari 5 mm [Brachycephalus ephippium, Gambar 4,
tengkorak 10] sampai 56 mm [Ceratophrys aurita, Gbr. 2, tengkorak C] di panjang
kepala), serta banyak taksa berukuran menengah. Dalam anuran yang masih ada,
baik yang terkecil (pedofrin; Gambar 4, tengkorak 5) dan terbesar (Conraua goliat;
Gambar 4, tengkorak 6) katak tidak mengalami hiperosifikasi; namun, katak fosil
kelompok mahkota terbesar dijelaskan,Beelzebufo ampinga dari Kapur Akhir (44),
mengalami hiperosifikasi.
Penggunaan Mikrohabitat. Katak hiperosifikasi dapat ditemukan di semua
mikrohabitat, tetapi frekuensi relatif sifat tersebut lebih rendah pada katak air
(3/33 spesies, 9%) dibandingkan kategori lainnya (arboreal: 14/38, 37%; fossorial:
18/7, 39%, terestrial: 20/69, 29%; Kumpulan Data S1). Distribusi luas habitat mikro
yang digunakan oleh garis keturunan hiperosifikasi menunjukkan bahwa
hiperosifikasi tidak sepenuhnya terkait dengan lingkungan kering. Lebih jauh lagi,
banyak genus fossorial yang teradaptasi kering (misalnya,Breviceps,
Myobatrachus) kurangnya hiperosifikasi (Lampiran SI). Kami mengidentifikasi
interaksi antara hiperosifikasi dan penggunaan mikrohabitat yang didorong oleh
perbedaan bentuk tengkorak antara katak terestrial yang mengalami
hiperosifikasi dan katak terestrial yang tidak mengalami hiperosifikasi dan
perbedaan antara katak terestrial yang mengalami hiperosifikasi dan katak
arboreal yang mengalami hiperosifikasi. Katak terestrial nonhyperossified dan
hyperossified sebagian besar dipisahkan oleh sumbu variasi bentuk PC2 (Gbr. 2A),
dengan katak terestrial nonhiperosifikasi memiliki tengkorak yang lebih datar dan
lebih sempit dengan ramus zigomatikus yang lebih pendek dari skuamosa.
Perbedaan bentuk antara kedua kelompok ini kemungkinan tidak terkait dengan
penggunaan habitat terestrial secara berbeda, melainkan dengan pola makan
(dibahas di bawah). Katak arboreal terestrial dan hiperosifikasi sebagian besar
dipisahkan oleh sumbu variasi bentuk PC3 (Gbr. 2B), dengan katak terestrial
hiperosifikasi memiliki frontoparietal yang lebih sempit dan rongga orbit yang

konvergen karena taksa yang berhubungan jauh ditemukan dalam jarak dekat.
Beberapa tekanan fungsional yang berbeda yang tidak terkait dengan ukuran
tubuh dapat dikaitkan dengan evolusi hiperosifikasi (lihat di bawah). Tengkorak
anuran yang tidak mengalami hiperosifikasi dan yang mengalami hiperosifikasi
memiliki alometrik yang sama
lebih besar. Atap tengkorak yang diperluas dari katak arboreal yang mengalami
hiperosifikasi dapat dikaitkan dengan mencegah hilangnya air melalui
penguapan, karena telah ditunjukkan bahwa gradien kelembaban antara tanah
dan kanopi di hutan hujan tropis dapat lebih curam daripada gradien kelembaban
di seluruh ketinggian (45). Selain itu, tingkat penguapan kulit

8558 | www.pnas.org/cgi/doi/10.1073/pnas.2000872117 Paluh dkk.

 EVOLUSI

Gambar 4. Representatif tengkorak katak yang digunakan dalam penelitian ini menggambarkan keragaman morfologi: 1, Ascapus truei (UF 80664); 2,Diskoglosus pictus
(KU 144217); 3,Rana klamitan (UF 76511); 4,Hyla chrysoscelis (UF 64907); 5,Paedophryne swiftorum (BPBM 31884); 6,Conraua goliat (UF 64720); 7,Scaphiopus holbrookii (
Diunduh di Indonesia: PNAS Disponsori pada 31 Oktober 2021

UF9620); 8,Aubria Masako (MCZ A-135999); 9,Chacophrys pierottii (KU 191932); 10,Brachycephalus ephippium (UF 72725); 11,Makrogenioglottus alipoii (USNM 200455);
12,pipa parva (UF 37924); 13,Rhinophrynus dorsalis (CAS 71766); 14,Hemisus guineensis (CAS 258533); 15,Myobatrachus gouldii (MCZ A-139543); 16,kopiula oxyrhina (
AMNH A-60046); 17,Pherohapsis menziesi (AMNH 8449); 18,Melanophryniscus stelzneri (UF63183); 19,Diaglena spatulata (UF 109706); 20,Aparasphenodon brunoi (UF
71781); 21,Corythomantis greeningi (UF 92220); 22,Smilisca fodiens (KU 062348); 23,Gastrotheca galeata (KU 174361); 24,Peltophrine guentheri (UF 104862); 25,
Pyxicephalus adspersus (UF 92093); 26,Lepidobatrachus laevis (UF 12347); 27,Hemiphractus proboscideus (CAS 122210); 28,Ceratobatrachus guentheri (UF 80585); 29,
Calyptocephalella gayi (CAS 10082); 30,Proceratophrys boiei (CM 45985). (Bilah skala, 1 mm.)

Paluh dkk. PNAS | 14 April 2020 | jilid 117 | tidak. 15 |8559

 kehilangan air dari kepala hylid arboreal hyperossified (Trachycephalus
jordani) ditemukan lebih rendah daripada di air dan arboreal
nonhyperossified anurans [rana dan Hyla, berturut-turut (30)].
Mengukur laju kehilangan air di seluruh keragaman anuran yang tidak
mengalami hiperosifikasi dan hiperosifikasi di sepanjang gradien
habitat mikro dan iklim mikro kemungkinan diperlukan untuk
menguraikan lebih lanjut hubungan ini.
Biologi Makan. Interaksi yang signifikan ditemukan antara hiperosifikasi dan
biologi makan yang didorong oleh perbedaan bentuk tengkorak antara
predator vertebrata hiperosifikasi dan predator vertebrata
nonhiperosifikasi. Kelompok-kelompok ini sebagian besar dipisahkan oleh
sumbu variasi bentuk PC2 (Gbr. 2C dan 3B),dengan predator vertebrata
hiperosifikasi memiliki tengkorak yang lebih lebar, lebih tinggi, dan lebih
pendek secara anteroposterior dengan skuamosa yang membesar. Ramus
zygomaticus squamosal sangat berkembang, membentuk artikulasi tulang
dengan proses posterior rahang atas, pada 12 dari 14 predator vertebrata
hiperosifikasi (Gbr. 2, tengkorak C, Gambar 4, tengkorak 8 dan 9 dan
tengkorak 25 sampai 30, danKumpulan Data S1). Hanya satu spesies
nonhiperosifikasi yang memiliki kontak tulang antara skuamosa dan rahang
atas (Discoglossus pictus; Gambar 4, tengkorak 2), dan subset spesies
hiperosifikasi yang tidak diketahui mengkonsumsi vertebrata juga memiliki
artikulasi ini (misalnya, Scaphiopus holbrookii;Gambar 4, tengkorak 7 dan
Kumpulan Data S1). Kontak antara squamosal dan maxilla membentuk
margin posterior lengkap ke orbit dan tidak hanya memperkuat tengkorak
tetapi juga meningkatkan ukuran ruang adduktor (yang membentuk
saluran untuk lewatnya otot-otot adduktor rahang primer), sebuah struktur
yang bersisik dengan kekuatan gigitan (46).
Predator vertebrata yang mengalami hiperosifikasi sebagian besar terisolasi di
wilayah baru morphospace yang mencakup spesies yang berkerabat jauh dari 10
famili dan semua kategori habitat mikro (Kumpulan Data S1 dan Gambar 4,
tengkorak 25 sampai 30). Taksa ini mungkin telah berkumpul pada bentuk
tengkorak yang memungkinkan mereka untuk menahan kekuatan tinggi yang
dihadapi saat memakan mangsa yang besar dan keras. Beberapa predator
vertebrata hiperosifikasi dengan bentuk tengkorak paling ekstrim juga memiliki
taring odontoid di rahang bawah [Gbr. 2C; dan kadang-kadang di langit-langit
mulut (47)], yang merupakan struktur seperti gigi yang memungkinkan terjadinya
luka seperti gigitan dan diperkirakan berkembang pada spesies yang
mengkhususkan diri pada mangsa besar (48). Taring odontoid juga telah
berevolusi pada katak yang menggunakan pertempuran jantan-jantan (misalnya,
Adelotus, Limnonectes), tetapi taksa ini tidak memiliki hiperosifikasi dan tidak
menempati morfospace predator vertebrata yang mengalami hiperosifikasi. Satu-
satunya anuran yang diketahui dengan gigi asli di rahang bawah (Gastrotheca
guentheri; titik dengan garis putus-putus pada Gambar. 2C, dan ref. 22)
menempati wilayah morphospace yang sama dengan predator vertebrata yang
mengalami hiperosifikasi. Tidak ada pengamatan tentang spesies ini yang
memakan vertebrata di alam liar, tetapiG. guentheri akan dengan mudah
memakan vertebrata di penangkaran dan diketahui memakan mangsa besar
lebih dari setengah panjang tubuhnya (49).
Perilaku Phragmotik. Spesies yang diketahui menggunakan perilaku
phragmotic menempati wilayah baru morphospace yang dicirikan oleh
atap tengkorak yang luas (frontoparietals + nasal), menghasilkan
jendela dorsolateral kecil ke rongga orbit yang memungkinkan katak
ini menarik mata mereka ke medial di bawah rak tulang. untuk
perlindungan (Gbr. 2, tengkorak F dan Gambar 4, tengkorak 19 sampai
24). Setidaknya empat garis keturunan telah secara independen
mengembangkan bentuk tengkorak unik ini yang diasosiasikan
dengan perilaku phragmotic—dua clades dari casque-headed hylids,
Peltofrina kodok, dan Gastrotheca galeata (Gambar 1). Banyak dari
hylids berkepala danPeltofrina telah diamati menggunakan
Diunduh di Indonesia: PNAS Disponsori pada 31 Oktober 2021
phragmosis (29, 50), tetapi perilaku hanya dihipotesiskan di G. galeata (
51). Semua taksa ini mengalami hiperosifikasi, menunjukkan bahwa
bentuk tengkorak ekstrem ini dicapai dengan hiperosifikasi.
Phragmosis dan tengkorak yang sangat diturunkan dari hylid berkepala
casque awalnya dihipotesiskan terutama sebagai adaptasi untuk mencegah
kehilangan air melalui penguapan saat menempati lubang pohon,
8560 | www.pnas.org/cgi/doi/10.1073/pnas.2000872117
bromeliad, celah batu, atau liang di lingkungan kering (14, 30, 52, 53).
Pekerjaan terbaru menunjukkan sifat-sifat ini juga dapat melindungi hewan-
hewan ini dari pemangsa. Tiga genera hylid berkepala phragmotic telah
ditemukan berbisa (Aparasphenodon, Argenteohyla, Corythomantis),
dengan kelenjar granular yang membesar terkait dengan tulang tengkorak
yang mengalami hiperosifikasi yang bertindak sebagai sistem pengiriman
racun (Gbr. 4, tengkorak 20 dan 21, dan ref. 54–56). Spesies phragmotic
yang tersisa tidak diketahui memiliki adaptasi ini, tetapi juga belum
diselidiki secara histologis untuk kelenjar yang sama. Spesies phragmotic
telah berulang kali mengembangkan tulang atap tengkorak baru yang tidak
ada pada semua katak lainnya (internasal, dermal sphenethmoid, prenasal;
ref. 29 dan 57 danLampiran SI,Gambar S3), dan elemen-elemen ini
kemungkinan berkontribusi pada bentuk tengkorak ekstrem yang dimiliki
spesies phragmotic ini.
Hiperosifikasi pada Fosil Anuran. Hiperosifikasi sering terjadi pada
fosil anuran (mungkin karena elemen hiperosifikasi lebih mungkin terawetkan
dalam catatan fosil) dan terdapat pada kemungkinan arkeobatrachia,
mesobatrachia, dan neobatrachia (58). Mengidentifikasi penempatan filogenetik
dari taksa fosil ini merupakan tantangan karena bahannya seringkali terpisah-
pisah, dan hiperosifikasi tampaknya menghasilkan pengelompokan buatan
berdasarkan fitur homoplastik (44, 59, 60), terlepas dari perbedaan bentuk yang
diidentifikasi di seluruh spesies yang mengalami hiperosifikasi dalam penelitian
kami. Hasil kami menguatkan temuan sebelumnya ini: Hiperosifikasi
kemungkinan telah berevolusi beberapa kali di seluruh anuran kelompok
mahkota, yang mengarah pada peningkatan tingkat evolusi bentuk. Selain itu,
banyak garis keturunan hyperossified yang terkait jauh telah berkumpul pada
bentuk tengkorak ekstrem serupa yang mungkin terkait dengan fungsi atau
perilaku tertentu. Termasuk sampel taksonomi yang luas, menggunakan pohon
perancah molekuler, melakukan analisis sensitivitas, dan mengecualikan atau
menurunkan bobot karakter yang mungkin terkait dengan hiperosifikasi dapat
menghilangkan beberapa masalah homoplasy ini, tetapi ketidakpastian
taksonomi fosil ini kemungkinan akan tetap ada (60). Kerangka kerja kami akan
berguna dalam studi paleobiologis fosil katak berikutnya, terutama ketika
struktur 3D tengkorak dapat dipulihkan. Sebagai contoh, terutama ketika struktur
3D tengkorak dapat dipulihkan. Sebagai contoh, terutama ketika struktur 3D
tengkorak dapat dipulihkan. Sebagai contoh,Harga Baurubatrachus dari Kapur
Akhir Brasil (60), Beelzebufo ampinga dari Kapur Akhir Madagaskar (44), dan
Thaumastosaurus gezei dari Eosen Prancis (61) memiliki tengkorak lebar yang
hiperosifikasi dengan sendi rahang yang bergeser ke belakang dan artikulasi
tulang antara skuamosa dan rahang atas, menunjukkan bahwa katak ini
berspesialisasi dalam memakan mangsa vertebrata yang relatif besar.
Kesimpulan. Hiperosifikasi telah berkembang dalam garis keturunan katak yang beragam secara filogenetis dan ekologis dan berulang kali dikaitkan
dengan ekspansi morfologis kepala menjadi berbagai bentuk dan fungsi baru. Kami tidak menemukan dukungan untuk hubungan antara hiperosifikasi
dan ukuran. Mikrohabitat berkorelasi dengan bentuk tengkorak tetapi memiliki interaksi terbatas dengan hiperosifikasi. Beberapa katak berkerabat
jauh yang berspesialisasi dalam memakan mangsa vertebrata besar memiliki tengkorak hiperosifikasi dan berkumpul pada bentuk kepala ekstrem yang
memperkuat tengkorak dan kemungkinan menghasilkan kekuatan gigitan yang lebih tinggi. Subset dari predator vertebrata yang mengalami
hiperosifikasi juga telah mengembangkan taring odontoid di rahang bawah secara konvergen, memungkinkan mereka untuk menimbulkan luka seperti
gigitan pada mangsa. Fragmosis dan bentuk tengkorak yang ekstrim terkait erat satu sama lain dan hanya terjadi ketika hiperosifikasi hadir. Sifat-sifat
ini memfasilitasi sistem pengiriman racun dalam subset spesies phragmotic untuk melindungi hewan-hewan ini dari pemangsa dan dapat bertindak
sebagai penghalang untuk menghindari pengeringan pada hewan lain. Hyperossification hadir di beberapa spesies anuran yang tidak memakan
mangsa besar atau menggunakan perilaku phragmotic, dan ada kemungkinan bahwa, dalam taksa ini, fungsi hyperossification, jika ada, dapat
dikaitkan dengan osmoregulasi. Selain mengeksplorasi lebih baik interaksi bentuk tengkorak, hiperosifikasi, dan keseimbangan air, jalan penelitian di
masa depan adalah untuk menyelidiki apakah ukuran tengkorak dan tingkat pengerasan berdampak pada kemampuan lokomotor anuran. Studi kami
menunjukkan Sifat-sifat ini memfasilitasi sistem pengiriman racun dalam subset spesies phragmotic untuk melindungi hewan-hewan ini dari pemangsa
dan dapat bertindak sebagai penghalang untuk menghindari pengeringan pada hewan lain. Hyperossification hadir di beberapa spesies anuran yang
tidak memakan mangsa besar atau menggunakan perilaku phragmotic, dan ada kemungkinan bahwa, dalam taksa ini, fungsi hyperossification, jika
ada, dapat dikaitkan dengan osmoregulasi. Selain lebih mengeksplorasi interaksi bentuk tengkorak, hiperosifikasi, dan keseimbangan air, jalan
penelitian di masa depan adalah untuk menyelidiki apakah ukuran tengkorak dan tingkat pengerasan berdampak pada kemampuan lokomotor anuran.
Studi kami menunjukkan Sifat-sifat ini memfasilitasi sistem pengiriman racun dalam subset spesies phragmotic untuk melindungi hewan-hewan ini dari
pemangsa dan dapat bertindak sebagai penghalang untuk menghindari pengeringan pada hewan lain. Hyperossification hadir di beberapa spesies
anuran yang tidak memakan mangsa besar atau menggunakan perilaku phragmotic, dan ada kemungkinan bahwa, dalam taksa ini, fungsi
hyperossification, jika ada, dapat dikaitkan dengan osmoregulasi. Selain lebih mengeksplorasi interaksi bentuk tengkorak, hiperosifikasi, dan
keseimbangan air, jalan penelitian di masa depan adalah untuk menyelidiki apakah ukuran tengkorak dan tingkat pengerasan berdampak pada
kemampuan lokomotor anuran. Studi kami menunjukkan Hyperossification hadir di beberapa spesies anuran yang tidak memakan mangsa besar atau
menggunakan perilaku phragmotic, dan ada kemungkinan bahwa, dalam taksa ini, fungsi hyperossification, jika ada, dapat dikaitkan dengan osmoregulasi. Selain lebih menge
Paluh dkk.
 hubungan multifaset antara bentuk tengkorak, hiperosifikasi, dan
ekologi pada katak dan menyoroti pentingnya data sejarah alam dasar
untuk mengidentifikasi mekanisme yang bertanggung jawab untuk
menghasilkan pola makroevolusi fenotipe kompleks.
Bahan dan metode
Sampling dan Computed Tomography. Untuk perbandingan morfologi dan analisis
statistik, kami mengambil sampel hampir semua genus katak hiperosifikasi yang
dilaporkan dari literatur (ditinjau dalam referensi 14 dan 22), garis keturunan saudara
dari genus ini yang tidak memiliki hiperosifikasi kranial, dan setidaknya satu perwakilan
dari masing-masing dari 54 anuran yang dijelaskan. keluarga (Kumpulan Data S1).
Hiperosifikasi diidentifikasi menggunakan kondisi primer eksostosis (pola retikulat atau
pitting; ref. 14). Kami melakukan pemindaian tomografi terkomputasi sinar-X resolusi
tinggi di Fasilitas Penelitian Nanoscale University of Florida, menggunakan Phoenix vJ
untuk sayaJx M (Solusi Pengukuran & Kontrol GE; Lampiran SI). Kami menyimpan
tumpukan gambar (TIFF) dan file mesh 3D (STL) di MorphoSource (Kumpulan Data S1).
Rekonstruksi Negara Leluhur. Kami melakukan rekonstruksi keadaan leluhur dari
hiperosifikasi pada anuran yang masih ada menggunakan data ada/tidak ada
yang dikumpulkan dari 158 spesies anuran (mewakili 145 genera dan semua 54
famili) dan filogeni Jetz dan Pyron (32). Rekonstruksi keadaan leluhur Bayesian
dihitung menggunakan MCMC lompatan-reversibel di RevBayes (34) untuk
mengambil sampel kelima model Markov dari evolusi karakter fenotipik (satu-
tingkat, dua-tingkat, nol-ke-satu ireversibel, satu-ke-nol ireversibel, tidak berubah)
sebanding dengan probabilitas posterior mereka (Lampiran SI). Kami
membandingkan kecocokan model menggunakan faktor Bayes dan
memperhitungkan ketidakpastian model dengan membuat perkiraan keadaan
leluhur rata-rata model (ref. 62 dan 63 danLampiran SI).
Analisis Bentuk. Kami memperoleh file bentuk kesetiaan tinggi untuk 158 spesies,
masing-masing diwakili oleh satu spesimen. Kami mengukur variasi bentuk
antarspesies tengkorak menggunakan analisis morfometrik geometris 3D dalam
paket R geomorf versi 3.0.3 (33). Tiga puluh enam landmark tetap didigitalkan
pada setiap file bentuk, sesuai dengan titik homolog dan berulang (Lampiran SI,
Gambar. S1). Analisis Procrustes umum dilakukan untuk menyelaraskan,
memutar, dan menskalakan data tengara spesimen ke sistem koordinat umum
dan ukuran pusat satuan untuk menghilangkan variasi posisi, orientasi, dan
ukuran (64). Analisis komponen utama dari variasi bentuk tengkorak dilakukan,
dan spesimen yang disejajarkan dengan Procrustes diplot dalam tiga dimensi
ruang singgung (PC1, PC2, dan PC3). Semua analisis berikut dijalankan untuk:
1. S. Wroe, N. Milne, Konvergensi dan kendala yang sangat konsisten dalam evolusi
dari bentuk tengkorak karnivora. Evolusi 61, 1251–1260 (2007).
2. D. Schluter, Radiasi adaptif di sticklebacks: Ukuran, bentuk, dan efisiensi penggunaan habitat.
Ekologi 74, 699–709 (1993).
3. MH Wake, “Tengkorak sebagai alat gerak” di Tengkorak, J. Hanken, BK Hall, Eds.
(Universitas Chicago Press, 1993), vol. 3, hlm. 197–240.
4. A. Herrel, E. De Grauw, JA Lemos-Espinal, Bentuk kepala dan kinerja gigitan di
kadal xenosaurus. J. Eks. Zool.290, 101–107 (2001).
5. JS Morris, DR Carrier, Seleksi seksual pada bentuk kerangka di Carnivora. Evolusi 70,
767–780 (2016).
6. A. Herrel, V. Schaerlaeken, JJ Meyers, KA Metzger, CF Ross, Evolusi
desain dan kinerja tengkorak di squamates: Konsekuensi pengurangan tulang tengkorak
pada perilaku makan. Integrasi Komp. Biol.47, 107–117 (2007).
7. FC Barros, A. Herrel, T. Kohlsdorf, Evolusi bentuk kepala di Gymnophthalmidae:
Apakah penggunaan habitat membatasi evolusi desain tengkorak pada kadal fosil? J. Evol.
Biol. 24, 2423–2433 (2011).
8. SB Emerson, DM Bramble, “Penskalaan, alometri, dan desain tengkorak” di Tengkorak,
J. Hanken, BK Hall, Eds. (Universitas Chicago Press, 1985), vol. 3, hlm. 384–421.
9. M. Vidal-García, J. Scott Keogh, Konservatisme filogenetik dalam tengkorak dan evolusi
labilitas pada anggota badan—Evolusi morfologis di seluruh radiasi katak purba terbentuk
dengan diet, penggerak dan menggali. BMC Evol. Biol.17, 165 (2017).
10. J. Hanken, Balai BK, Tengkorak (Universitas Chicago Press, 1993), vol. 2.
11. GB Müller, GP Wagner, Kebaruan dalam evolusi: Restrukturisasi konsep. annu.
Pdt. Evolusi Sistem22, 229–256 (1991).
12. MK Vickaryous, J.-Y. Baginda, Kerangka integumen tetrapoda: Asal, evolusi
tion, dan pengembangan. J.Anat. 214, 441–464 (2009).
13. V. de Buffrénil, F. Clarac, A. Canoville, M. Laurin, Data komparatif pada perbedaan-
Diunduh di Indonesia: PNAS Disponsori pada 31 Oktober 2021
pembentukan dan pertumbuhan ornamen tulang pada gnathostoma (Chordata: Verte-
brata). J. Morpol. 277, 634–670 (2016).
14. L. Trueb, “Tulang, katak, dan evolusi” di Biologi Evolusi Anuran:
Penelitian Kontemporer tentang Masalah Utama, JL Vlal, Ed. (Universitas Pers Missouri,
1973), hlm. 65-132.
15. P. Alberch, SJ Gould, GF Oster, DB Wake, Ukuran dan bentuk dalam ontogeni dan
filogeni. Paleobiologi 5, 296–317 (1979).
Paluh dkk.
10.000 iterasi untuk pengujian signifikansi. Filogeni yang dipangkas dari Jetz dan
Pyron (32) memberikan perkiraan hubungan evolusioner untuk metode
perbandingan filogenetik.
Untuk mengkarakterisasi keragaman tengkorak di antara semua keluarga
katak secara lebih efektif, kami menguji sinyal filogenetik dalam bentuk tengkorak
dan ukuran centroid. Evolusi bentuk tengkorak divisualisasikan dengan
memperkirakan kemungkinan maksimum keadaan leluhur PC2 menggunakan
fungsi contMap dalam paket phytools (65). Kami melakukan MANOVA filogenetik
untuk menguji apakah bentuk rata-rata berbeda antara taksa hiperosifikasi dan
nonhiperosifikasi. Kami memperkirakan disparitas morfologis dan laju bersih
evolusi bentuk tengkorak untuk spesies hiperosifikasi dan non-hiperosifikasi
untuk menguji apakah ada perbedaan signifikan dalam varians Procrustes dan
laju evolusi morfologis antara kedua kelompok ini (66). Untuk menguji hubungan
antara ukuran dan bentuk pusat tengkorak, kami melakukan regresi filogenetik.
Sebuah MANOVA filogenetik dan uji homogenitas lereng dilakukan untuk menguji
apakah ada interaksi yang signifikan antara hiperosifikasi dan ukuran centroid
dan apakah kemiringan alometrik berbeda antara katak hiperosifikasi dan
nonhiperosifikasi. Kami menggunakan MANOVA filogenetik untuk menguji
apakah ada hubungan antara penggunaan mikrohabitat, biologi makan, perilaku
phragmotic, dan bentuk tengkorak, serta untuk menentukan apakah ada interaksi
yang signifikan dengan hiperosifikasi setelah memperhitungkan efek utama (
Lampiran SI). Penggunaan mikrohabitat (akuatik, arboreal, fossorial, dan
terestrial), biologi makan (predator invertebrata, predator vertebrata), dan data
perilaku phragmotic (ada, tidak ada) dikumpulkan dari literatur (lihatKumpulan
Data S1 untuk referensi). Kehadiran taring odontoid pada rahang bawah dicatat
untuk semua spesies dari data computed tomography.
Pernyataan Ketersediaan Data. Data tomografi terkomputasi (tumpukan tiff dan
EVOLUSI
file mesh) telah disimpan di MorphoSource (lihat Kumpulan Data S1 untuk DOI).
Data dan skrip untuk semua analisis tersedia di GitHub dihttps://github. com/
dpaluh/hiperosifikasi.
UCAPAN TERIMA KASIH. Materi ini didasarkan pada pekerjaan yang didukung oleh
NSF Graduate Research Fellowship ke DJP di bawah Hibah DGE-1315138 dan
DGE-1842473. Pemindaian tomografi terkomputasi yang digunakan dalam proyek
ini dihasilkan dari Jaringan Koleksi Tematik NSF (Grant DBI-1701714) dan
University of Florida. Kami berterima kasih kepada semua institusi, kurator, dan
pengelola koleksi yang telah meminjamkan kami spesimen untuk penelitian ini.
Kami berterima kasih kepada laboratorium DCB di Museum Sejarah Alam Florida
dan dua pengulas anonim atas komentar bermanfaat yang meningkatkan versi
awal naskah ini.
16. Hukum CJ, Pergeseran evolusioner dalam bentuk tengkorak mustelid (Mustelidae: Carnivora) yang
masih ada, ukuran tubuh dan bentuk tubuh bertepatan dengan Transisi Iklim Miosen Pertengahan.
Biol. Lett.15, 20190155 (2019).
17. F. Clarac dkk., Apakah morfologi tengkorak membatasi ornamen tulang? Sebuah analisis
morfometrik di Crocodylia.J.Anat. 229, 292–301 (2016).
18. PL Godoy, evolusi bentuk tengkorak Crocodylomorph dan hubungannya dengan ukuran
tubuh dan ekologi. J. Evol. Biol.33, 4–21 (2020).
19. GR Handrigan, RJ Wassersug, The anuran Bauplan: Tinjauan tentang dasar-dasar adaptif,
perkembangan, dan genetik morfologi katak dan kecebong. Biol. Pdt. Philos. Soc.82, 1–25
(2007).
20. WE Duellman, Jumlah Amfibi dan Reptil. Herpetol. Putaran.10, 83–84 (1979).
21. University of California, Berkeley, AmphibiaWeb: Informasi tentang biologi dan konservasi
amfibi. https://amphibiaweb.org/. Diakses 12 Februari 2020.
22. KAMI Duellman, L. Trueb, Biologi Amfibi (McGraw-Hill, 1986).
23. DR Frost dkk., Pohon kehidupan amfibi. Banteng. NS. Mus. Nat. Hist.297, 8–370 (2006).
24. YJ Feng dkk., Filogenomik mengungkapkan diversifikasi cepat dan simultan dari tiga kelas
utama katak Gondwanan di batas Kapur-Paleogen. Prok. Natal akad. Sci. Amerika Serikat114,
E5864–E5870 (2017).
25. L. Trueb, P. Alberch, “Miniaturization and the anuran skull: A case study of heterochrony” in
Morfologi Fungsional pada Vertebrata, HR Duncker, G. Fleischer, Eds. (Gustav Fischer Verlag,
1985), hlm. 113-121.
26. SB Emerson, Bentuk tengkorak pada katak–Korelasi dengan pola makan. Herpetologi 1985, 177– 188
(1985).
27. L. Trueb, "Pola keragaman tengkorak di antara Lissamphibia" di Tengkorak,
J. Hanken, BK Hall, Eds. (Universitas Chicago Press, 1993), vol. 2, hlm. 255–343.
28. KD Wells, Ekologi dan Perilaku Amfibi (Universitas Chicago Press, 2007).
29. L. Trueb, Hubungan evolusioner katak pohon berkepala peti dengan tengkorak yang mengeras
bersama (famili Hylidae). Univ. Kan. Publikasi Mus. Nat. Hist.18, 547–716 (1970).
30. EA Seibert, HB Lillywhite, RJ Wassersug, Koosifikasi kranial pada katak: Hubungan dengan
tingkat kehilangan air evaporatif. Fisiol. Zool.47, 261–265 (1974).
31. J. Hanken, "Adaptasi pertumbuhan tulang untuk miniaturisasi ukuran tubuh" di Tulang,
Balai BK, Ed. (CRC Press, 1993), vol. 7, hlm. 79-104.
PNAS | 14 April 2020 | jilid 117 | tidak. 15 |8561
 32. W. Jetz, RA Pyron, Interaksi antara diversifikasi masa lalu dan isolasi evolusioner dengan
bahaya saat ini di seluruh pohon kehidupan amfibi. Nat. Ekol. Evolusi2, 850–858 (2018).
33. DC Adams, E. Otarola-Castillo, geomorf: paket R untuk pengumpulan dan analisis data
bentuk morfometrik geometris. Metode Ekol. Evolusi4, 393–399 (2013).
34. S. Höhna dkk., RevBayes: Inferensi filogenetik Bayesian menggunakan model grafis dan
bahasa spesifikasi model interaktif. Sistem Biol.65, 726–736 (2016).
35. J. Yeh, Pengaruh ukuran tubuh miniatur pada morfologi kerangka pada katak. Evolusi 56,
628–641 (2002).
36. L. Trueb, LA Púgener, AM Maglia, Ontogeni yang aneh: Deskripsi osteologis dari pipa pipa (
Anura: Pipidae), dengan penjelasan perkembangan kerangka pada spesies. J. Morpol. 243,
75-104 (2000).
37. E. Fernandez, F. Irlandia, D. Cundall, Bagaimana katak, pipa pipa, berhasil atau gagal dalam
menangkap ikan. kopi 105, 108–119 (2017).
38. D. Cundall, E. Fernandez, F. Irlandia, Mekanisme hisap katak pipid, pipa pipa(Linnaeus, 1758).
J. Morpol. 278, 1229-1240 (2017).
39. E. Ascarrunz, JC Rage, P. Legreneur, M. Laurin, Triadobatrachus massinoti, lissamphibian
paling awal yang diketahui (Vertebrata: Tetrapoda) diperiksa ulang oleh CT-Scan, dan evolusi
panjang batang pada batrachian. Kontribusi Zool.85, 201–234 (2016).
40. NH Shubin, FA Jenkins Jr, Katak melompat Jurassic Awal. Alam 377, 49–52 (1995).
41. AM Báez, N. Basso, Katak paling awal yang diketahui dari Jurassic of South America: Review
dan penilaian cladistic dari hubungan mereka. Mengunyah. Geowiss. ab. A30, 131– 158
(1996).
42. K.-Q. Gao, Y. Wang, anuran Mesozoikum dari Provinsi Liaoning, Cina, dan hubungan
filogenetik dari klad anuran archaeobatrachian.J. Vertebr. paleontol.21,460–476 (2001).
43. SM Reilly, EO Wiley, DJ Meinhardt, Sebuah pendekatan integratif untuk heterokroni:
Perbedaan antara fenomena interspesifik dan intraspesifik. Biol. J. Lin. Soc. London.60,
119-143 (1997).
44. SE Evans, JR Groenke, MEH Jones, AH Turner, DW Krause, Materi baru dariBeelzebufo, katak
hiperosifikasi (Amphibia: Anura) dari Kapur Akhir Madagaskar. PLoS Satu 9, e87236 (2014).
45. BR Scheffers dkk., Meningkatkan arboreality dengan ketinggian: Dimensi biogeografis baru.
Prok. Biol. Sci.280, 20131581 (2013).
46. AK Lappin dkk., Kekuatan gigitan pada katak bertanduk (Ceratophrys cranwelli) dengan implikasi
untuk katak raksasa yang punah. Sci. Reputasi.7, 11963 (2017).
47. CA Sheil, JR Mendelson, III, Spesies baru Hemifraktus (Anura: Hylidae: Hemiphractinae), dan
deskripsi ulang dari H.johnson. Herpetologi57, 189-202 (2001).
48. M. Fabrezi, SB Emerson, Paralelisme dan Konvergensi pada Taring Anuran. J.Zol. (London.)
260, 41–51 (2003).
49. DJ Paluh, EL Stanley, DC Blackburn, Catatan diet pertama Gastrotheca guentheri(Boulenger,
1882), satu-satunya anuran dengan gigi mandibula sejati. Herpetol. Catatan12,699–700
(2019).
Diunduh di Indonesia: PNAS Disponsori pada 31 Oktober 2021
8562 | www.pnas.org/cgi/doi/10.1073/pnas.2000872117
50. JB Pramuk, tulang prenasal dan morfologi moncong di bufonid India Barat dan
Bufo granulosus kelompok spesies. J. Herpetol. 34, 334–340 (2000).
51. L. Trueb, WE Duellman, Katak berkantung berkepala baru yang luar biasa
(Hylidae: gastroteka). kopi1978, 498–503 (1978).
52. DV de Andrade, AS Abe, Kehilangan air evaporatif dan pengambilan oksigen dalam dua wadah
katak pohon berkepala, Aparasphenodon brunoi dan Corythomantis greeningi (Anura,
Hylidae). Komp. Biokimia. Fisiol. Sebuah Fisiol.118, 685–689 (1997).
53. CA Navas, C. Jared, MM Antoniazzi, Ekonomi air di pohon berkepala casque-
katak Corythomantis greeningi (Hylidae): Peran perilaku, kulit, dan kulit tengkorak co-
pengerasan. J.Zol. (London.)257, 525–532 (2002).
54. C. Jared dkk., Katak berbisa menggunakan kepala sebagai senjata. Curr. Biol.25, 2166–2170 (2015).
55. C. Jared dkk., Co-osifikasi kepala, phragmosis dan pertahanan di kepala bertopeng
katak pohon Corythomantis greeningi. J.Zol. (London.)265, 1–8 (2005).
56. R. Cajade dkk., Beberapa mekanisme anti-predator di Katak Argentina berbintik merah
(Amfibi: Hylidae). J.Zol. (London.)302, 94–107 (2017).
57. SA Smith, S. Arif, AN de Oca, JJ Wiens, Titik panas filogenetik untuk evolusi
hal baru di katak pohon Amerika Tengah. Evolusi 61, 2075–2085 (2007).
58. B. Sanchiz, Handbuch der Paläoherpetologie. Bagian 4. Salientia (Verlag Friedrich Pfeil,
1998).
59. S. Ruane, RA Pyron, FT Burbrink, Hubungan filogenetik katak Kapur
Beelzebufo dari Madagaskar dan penempatan batasan fosil berdasarkan suhu
bukti poral dan filogenetik. J. Evol. Biol.24, 274–285 (2011).
60. AM Báez, RO Gómez, Berurusan dengan homoplasy: Osteologi dan re- filogenetik
hubungan katak neobatrachian yang aneh Harga Baurubatrachus dari Atas
Kapur dari Brasil. J. Sistem. paleontol.16, 279–308 (2018).
61. F. Laloy dkk., Sebuah interpretasi ulang dari anuran Eosen Thaumastosaurus berdasarkan
pemeriksaan microCT dari spesimen 'mumi'. PLoS Satu 8, e74874 (2013).
62. WA Freyman, S. Höhna, model kromosom Cladogenetik dan anagenetik
evolusi angka: Pendekatan rata-rata model Bayesian. Sistem Biol.67, 195–215
(2018).
63. FD Freund, WA Freyman, CJ Rothfels, Menyimpulkan reduksi evolusioner
lobus umbi di isoëtes menggunakan model-model Bayesian rata-rata rekonstruksi keadaan leluhur
tion. NS. J. Bot.105, 275–286 (2018).
64. FJ Rohlf, DE Slice, Perpanjangan metode Procrustes untuk superim-
posisi landmark. Sistem Zool.39, 40–59 (1990).
65. LJ Revell, phytools: Paket R untuk biologi komparatif filogenetik (dan lainnya)
hal-hal). Metode Ekol. Evolusi3, 217–223 (2012).
66. DC Adams, Mengukur dan membandingkan tingkat evolusi filogenetik untuk bentuk
dan data fenotipik dimensi tinggi lainnya. Sistem Biol.63, 166–177 (2014).
67. A. Eklund, Beeswarm: The Bee Swarm Plot, sebuah Alternatif untuk Stripchart, paket R
Versi 0.2. 3. http://www.cbs.dtu.dk/~eklund/hangat lebah/. Diakses pada 22 Desember 2019.
Paluh dkk.