Asam amino

PROTEIN Asam amino Molekuler Universitas Elmhurst

Struktur
Protein Sekunder Protein Kuarter Kimia
Denaturasi
Struktur Struktur Departemen
Protein Tersier
Protein Globular Minitopik ChemBook Virtual
Struktur

Denaturasi Protein

Pengantar:

Denaturasi protein melibatkan gangguan dan kemungkinan kerusakan struktur sekunder dan tersier. Karena reaksi denaturasi tidak cukup kuat untuk memutus ikatan peptida, struktur
primer (urutan asam amino) tetap sama setelah proses denaturasi. Denaturasi mengganggu lembaran alfa-heliks dan beta normal dalam protein dan menguraikannya menjadi bentuk
acak.

Denaturasi terjadi karena interaksi ikatan yang bertanggung jawab atas struktur sekunder (ikatan hidrogen menjadi amida) dan struktur tersier terganggu. Dalam struktur tersier
terdapat empat jenis interaksi ikatan antara "rantai samping" yaitu: ikatan hidrogen, jembatan garam, ikatan disulfida, dan interaksi hidrofobik non polar. yang mungkin terganggu. Oleh
karena itu, berbagai reagen dan kondisi dapat menyebabkan denaturasi. Pengamatan yang paling umum pada proses denaturasi adalah pengendapan atau koagulasi protein.

Panas:

Panas dapat digunakan untuk merusak ikatan hidrogen dan interaksi hidrofobik non-polar. Ini terjadi karena panas meningkatkan energi kinetik dan menyebabkan molekul bergetar dengan
sangat cepat dan kuat sehingga ikatannya terputus. Protein dalam telur berubah sifat dan menggumpal selama pemasakan. Makanan lain dimasak untuk mengubah sifat protein agar lebih
mudah dicerna oleh enzim. Persediaan dan instrumen medis disterilkan dengan pemanasan untuk mengubah sifat protein pada bakteri dan dengan demikian menghancurkan bakteri.

Alkohol Mengganggu Ikatan Hidrogen:

Ikatan hidrogen terjadi antara gugus amida di sekunder struktur protein . Ikatan hidrogen antara "rantai samping" terjadi di t struktur protein tersier dalam berbagai kombinasi asam
amino. Semua ini terganggu dengan penambahan alkohol lain.

Larutan alkohol 70% digunakan sebagai desinfektan pada kulit. Konsentrasi alkohol ini mampu menembus dinding sel bakteri dan mengubah sifat protein dan enzim di dalam sel. Larutan
alkohol 95% hanya menggumpalkan protein di luar dinding sel dan mencegah alkohol masuk ke dalam sel. Alkohol mengubah sifat protein dengan mengganggu rantai samping ikatan
hidrogen intramolekul. Ikatan hidrogen baru terbentuk antara molekul alkohol baru dan rantai samping protein.

Dalam protein prion, tyr 128 adalah hidrogen yang terikat pada asp 178, yang menyebabkan salah satu bagian rantai terikat dengan bagian yang agak jauh. Setelah denaturasi, grafik
menunjukkan perubahan struktural yang substansial.

Protein Prion - Berbunyi di jendela baru

Ulangan: Sebutkan rantai samping asam amino lain yang mungkin terganggu oleh
denaturasi alkohol. Jawaban lain mungkinkah Alkohol dan Asam? Menjawab

Klik untuk gambar yang lebih besar

Alkohol dan Amina? Menjawab

Alkohol dan Amida? Menjawab

Asam dan Basa Mengganggu Jembatan Garam:

Jembatan garam hasil dari netralisasi asam dan amina pada rantai samping. Tinjau reaksi . Interaksi terakhir adalah ionik antara gugus amonium positif dan gugus asam negatif.
Kombinasi dari berbagai rantai samping asam amino asam atau amina akan memiliki efek ini.

Seperti yang diharapkan, asam dan basa mengganggu jembatan garam yang diikat oleh muatan ionik. Suatu jenis reaksi penggantian ganda terjadi di mana ion positif dan negatif dalam
garam berubah pasangan dengan ion positif dan negatif dalam asam atau basa baru yang ditambahkan. Reaksi ini terjadi dalam sistem pencernaan, ketika cairan lambung yang bersifat
asam menyebabkan pengentalan (penggumpalan) susu.

Contoh di sebelah kiri adalah dari protein prion dengan jembatan garam asam glutamat 200 dan lisin 204. Dalam hal ini dibuat loop yang sangat kecil karena hanya ada tiga asam
amino lain di antara keduanya. Jembatan garam memiliki efek meluruskan heliks alfa.

Itu denaturasi reaksi di jembatan garam dengan penambahan asam menghasilkan efek pelurusan lebih lanjut pada rantai protein seperti yang ditunjukkan pada grafik di sebelah kiri.

Protein Prion - Berbunyi di jendela baru

Garam Logam Berat:

Garam logam berat bertindak untuk mengubah sifat protein dengan cara yang sama seperti asam dan basa. Garam logam berat biasanya mengandung Hg + 2, Pb + 2,
Ag + 1 Tl + 1, Cd + 2 dan logam lain dengan berat atom tinggi. Karena garam bersifat ionik, mereka mengganggu jembatan garam dalam protein. Reaksi garam logam berat dengan protein biasanya
menghasilkan garam protein logam yang tidak larut.

Reaksi ini digunakan untuk sifat disinfektannya dalam aplikasi eksternal. Misalnya AgNO 3 digunakan untuk mencegah infeksi gonore di mata bayi baru lahir. Perak nitrat juga digunakan
dalam pengobatan infeksi hidung dan tenggorokan, serta untuk membakar luka.
Klik untuk gambar yang lebih besar
Garam merkuri yang diberikan sebagai Mercurochrome atau Merthiolate memiliki sifat serupa dalam mencegah infeksi pada luka.

Reaksi yang sama ini digunakan secara terbalik dalam kasus keracunan logam berat akut. Dalam situasi seperti itu, seseorang mungkin telah menelan garam logam berat dalam jumlah
yang signifikan. Sebagai penawar, protein seperti susu atau putih telur dapat diberikan untuk mengendapkan garam beracun. Kemudian obat emetik diberikan untuk merangsang muntah
sehingga protein logam yang mengendap dikeluarkan dari tubuh.

Ulangan: Sebutkan asam amino lain yang mungkin terlibat dalam jembatan garam. Jawaban lain
dimungkinkan
Menjawab

Asam?

Amina? Menjawab

Garam Logam Berat Mengganggu Perusakan Ikatan:

Logam berat juga dapat mengganggu ikatan yang rusak karena sifat dan daya
tariknya yang tinggi terhadap sulfur dan juga akan menyebabkan denaturasi protein.

Agen Pengurang Mengganggu Obligasi Perusak:

Obligasi disulfida dibentuk oleh oksidasi gugus sulfhidril pada sistein. Tinjau reaksi . Rantai protein yang berbeda atau loop dalam satu rantai disatukan oleh ikatan disulfida kovalen
yang kuat. Kedua contoh ini diperlihatkan oleh insulin pada gambar di sebelah kiri.

Jika zat pengoksidasi menyebabkan pembentukan ikatan disulfida, maka zat pereduksi, tentu saja, bekerja pada ikatan disulfida untuk memisahkannya. Agen pereduksi menambahkan atom
hidrogen untuk membuat gugus tiol, -SH. Reaksinya adalah:

Klik untuk gambar yang lebih besar

Protein Insulin - Berbunyi di jendela baru