515 982 1 SM
515 982 1 SM
Pendahuluan
Kimia komputasi adalah cabang ilmu kimia yang
memanfaatkan program komputer untuk menghitung parameter-
parameter yang dimiliki oleh atom. Parameter yang selalu dilibatkan
dalam perhitungan ini adalah elektron-elektron yang dimiliki oleh
atom. Dengan perhitungan ini, atom atau senyawa dapat dipelajari
secara lengkap tanpa melalui studi empiris di laboratorium. Studi
ini dapat memenuhi kebutuhan informasi tentang materi kimia
yang sulit diperoleh dari studi laboratorium karena obyek yang
susah dideteksi, kondisi reaksi yang berbahaya, dan faktor-faktor
yang lain.
Salah satu ruang lingkup kimia komputasi yang banyak
Elkawnie: Journal of Islamic Science and Technology Vol. 1, No.1, Juni 2015 |19
(www.jurnal.ar-raniry.com/index.php/elkawnie)
Anjar Purba Asmara: Penentuan Metode Komputasi Untuk Analisis Hubungan Kuantitatif
Struktur Dan Aktivitas Senyawa Turunan Triazolopiperazin Amida
20| Elkawnie: Journal of Islamic Science and Technology Vol. 1, No.1, Juni 2015
(www.jurnal.ar-raniry.com/index.php/elkawnie)
Anjar Purba Asmara: Penentuan Metode Komputasi Untuk Analisis Hubungan Kuantitatif
Struktur Dan Aktivitas Senyawa Turunan Triazolopiperazin Amida
Metode
Penelitian ini menggunakan data struktur senyawa turunan
triazolopiperazin amida sebagai inhibitor DPP IV beserta data
aktivitasnya secara eksperimen yang diujikan pada tikus.
NH2 O
R
N
N
N
N
F
F
F
Elkawnie: Journal of Islamic Science and Technology Vol. 1, No.1, Juni 2015 |21
(www.jurnal.ar-raniry.com/index.php/elkawnie)
Anjar Purba Asmara: Penentuan Metode Komputasi Untuk Analisis Hubungan Kuantitatif
Struktur Dan Aktivitas Senyawa Turunan Triazolopiperazin Amida
22| Elkawnie: Journal of Islamic Science and Technology Vol. 1, No.1, Juni 2015
(www.jurnal.ar-raniry.com/index.php/elkawnie)
Anjar Purba Asmara: Penentuan Metode Komputasi Untuk Analisis Hubungan Kuantitatif
Struktur Dan Aktivitas Senyawa Turunan Triazolopiperazin Amida
Elkawnie: Journal of Islamic Science and Technology Vol. 1, No.1, Juni 2015 |23
(www.jurnal.ar-raniry.com/index.php/elkawnie)
Anjar Purba Asmara: Penentuan Metode Komputasi Untuk Analisis Hubungan Kuantitatif
Struktur Dan Aktivitas Senyawa Turunan Triazolopiperazin Amida
24| Elkawnie: Journal of Islamic Science and Technology Vol. 1, No.1, Juni 2015
(www.jurnal.ar-raniry.com/index.php/elkawnie)
Anjar Purba Asmara: Penentuan Metode Komputasi Untuk Analisis Hubungan Kuantitatif
Struktur Dan Aktivitas Senyawa Turunan Triazolopiperazin Amida
Tabel 2.2 Data sudut ikatan antaratom dalam satuan derajat (°)
senyawa triazolopiperazin amida hasil pemodelan dengan berbagai
metode perhitungan
Metode Komputasi
Ikatan
Ab initio CNDO MNDO AM1 PM3
C1-C7- C8 112,594 111,417 115,516 111,879 111,774
C7-C8-C9 113,593 113,743 116,106 108,745 112,74
C8-C9-C10 117,82 112,459 116,561 110,489 116,934
C9-C10-N11 116,299 116,582 115,753 120,567 117,366
C7-C8-N24 110,005 110,782 110,363 112,3 108,537
C9-C8-N24 109,624 107,811 108,509 110,978 111,777
C9-C10-O25 112,696 118,321 125,263 119,749 123,864
N11-C10-O25 120,495 117,512 118,983 119,522 118,705
Tabel 2.3 Data muatan atom bersih dalam satuan Mulliken senyawa
triazolopiperazin amida hasil pemodelan dengan berbagai metode
perhitungan
Metode Komputasi
Atom
Ab initio CNDO MNDO AM1 PM3
C7 -0,110506 0,013026 0,048226 -0,125733 -0,062721
C8 0,058709 0,154193 0,064436 -0,022078 -0,065377
C9 -0,129321 -0,052839 0,011604 -0,170054 -0,120445
C10 0,288707 0,362214 0,370476 0,308240 0,297334
Elkawnie: Journal of Islamic Science and Technology Vol. 1, No.1, Juni 2015 |25
(www.jurnal.ar-raniry.com/index.php/elkawnie)
Anjar Purba Asmara: Penentuan Metode Komputasi Untuk Analisis Hubungan Kuantitatif
Struktur Dan Aktivitas Senyawa Turunan Triazolopiperazin Amida
26| Elkawnie: Journal of Islamic Science and Technology Vol. 1, No.1, Juni 2015
(www.jurnal.ar-raniry.com/index.php/elkawnie)
Anjar Purba Asmara: Penentuan Metode Komputasi Untuk Analisis Hubungan Kuantitatif
Struktur Dan Aktivitas Senyawa Turunan Triazolopiperazin Amida
Elkawnie: Journal of Islamic Science and Technology Vol. 1, No.1, Juni 2015 |27
(www.jurnal.ar-raniry.com/index.php/elkawnie)
Anjar Purba Asmara: Penentuan Metode Komputasi Untuk Analisis Hubungan Kuantitatif
Struktur Dan Aktivitas Senyawa Turunan Triazolopiperazin Amida
Daftar Kepustakaan
[1.] Ananto, A. D., 2011, Analisis Hubungan Kuantitatif Antara
Struktur dan Aktivitas Insektisida Turunan Karbamat
Menggunakan Metode Semiempirik PM3, Tesis, Fakultas MIPA
UGM, Yogyakarta.
[2.] Asmara, A.P., 2012, Studi QSAR Senyawa Turunan
Triazolopiperazin Amida sebagai Inhibitor Enzim DPP-IV
Menggunakan Metode Semiempirik AM1 dan PM3, Tesis, Fakultas
MIPA UGM, Yogyakarta.
[3.] Asmara, A.P., Mudasir, Dwi Siswanta, Studi QSAR Senyawa
Turunan Triazolopiperazin Amida sebagai Inhibitor Enzim
Dipeptidil Peptidase-IV (DPP IV) Menggunakan Metode
Semiempirik AM1, Berkala MIPA, 23(3), September 2013.
[4.] Azra, F., 2002, Analisis Hubungan Kuantitatif Struktur Elektronika
dan Aktivitas Antiplasmodium dari Seri Senyawa Turunan
1,10-Fenantrolin, Tesis, Universitas Gadjah Mada, Yogyakarta.
[5.] Chyan, Y. J., dan Chuang, L. M., 2007, Dipeptidyl Peptidase-
IV Inhibitors: An Evolving Treatment for Type 2 Diabetes from
the Incretin Concept, Recent Patents on Endocrine, Metabolic &
Immune Drug Discovery Vol. 1 hal. 15-24.
[6.] Drucker, D. J., 2007, Dipeptidyl Peptidase-4 Inhibition and the
Treatment of Type 2 Diabetes, Diabetes Care Vol. 30 no. 6 hal.
1335-1343.
[7.] Hadanu, R., Idris, S., dan Sutapa, I W., QSAR Analysis of
Benzothiazole Derivatives of Antimalarial Compounds Based on
AM1 Semi-Empirical Method, Indones. J. Chem., 2015, 15 (1),
86 – 92.
[8.] Harun, M., 2002, Analisis Hubungan Kuantitatif Struktur dan
Aktivitas Fungisida Turunan 1,2,4-Thiadiazolin Berdasarkan
Muatan Bersih Atom, Skripsi, Fakultas MIPA UGM, Yogyakarta.
[9.] Hansch, C., Kiehs, K., dan Lawrence, G., 1965, Quantitative
Structure-Activity Relationship (QSAR) Study on Phenol
Derivatives Series, J. Am. Chem. Soc. Vol. 87 hal. 5770.
[10.] Jensen, F., 1999, Introduction for Computational Chemistry,
second edition, John Willey and Sons, Inc, Ney York.
[11.] Kim, D., Wang, L., Beconi, M., Eiermann, G. J., Fisher, M. H.,
He, H., Hickey, G. J., Kowalchick, J. E., Leiting, B., Lyons, K.,
Marsilio, F., McCann, M. E., Patel, R. A., Petrov, A., Scapin, G.,
Patel, S. B., Roy, R. S., Wu, J. K., Wyvratt, M. J., Zhang, B. B.,
Zhu, L., Thornberry, N. A., dan Weber, A. E., 2005, (2R)-4-Oxo-
4-[3-(Trifluoromethyl)-5,6-dihydro [1,2,4]triazolo [4,3-a]pyrazin-
7(8H)-yl]-1-(2,4,5-trifluorophenyl) butan-2-amine: A Potent,
28| Elkawnie: Journal of Islamic Science and Technology Vol. 1, No.1, Juni 2015
(www.jurnal.ar-raniry.com/index.php/elkawnie)
Anjar Purba Asmara: Penentuan Metode Komputasi Untuk Analisis Hubungan Kuantitatif
Struktur Dan Aktivitas Senyawa Turunan Triazolopiperazin Amida
Elkawnie: Journal of Islamic Science and Technology Vol. 1, No.1, Juni 2015 |29
(www.jurnal.ar-raniry.com/index.php/elkawnie)
Anjar Purba Asmara: Penentuan Metode Komputasi Untuk Analisis Hubungan Kuantitatif
Struktur Dan Aktivitas Senyawa Turunan Triazolopiperazin Amida
30| Elkawnie: Journal of Islamic Science and Technology Vol. 1, No.1, Juni 2015
(www.jurnal.ar-raniry.com/index.php/elkawnie)